#Омикрон #SARSCoV2 #COVID19 #news
Коронавирусный вариант с множеством замен получил название Омикрон, и он вызывает сильное беспокойство у специалистов.
Исследователи в Южной Африке отмечают рост числа заражений новым вариантом вируса SARS-CoV-2. Вариант Омикрон, по-видимому, распространяется очень быстро. Впервые его выявили в Ботсване в начале ноября, а потом он обнаружился у путешественника, прибывшего в Гонконг из ЮАР. Наряду с отслеживанием распространения Омикрона ученые пытаются понять, каковы особенности этого варианта, и, в первую очередь, способен ли он избежать иммунного ответа, опосредованного вакцинами, и вызывает ли он более тяжелую или более легкую форму заболевания COVID-19, чем другие варианты, пишет Nature News.
По словам Пенни Мур (Penny Moor), вирусолога из Университета Уитвотерсренда (University of the Witwatersrand) в Йоханнесбурге, в чьей лаборатории определяют способность вирусов обходить иммунный ответ, сформировавшийся после вакцинации или перенесенных инфекций, «есть передающиеся из уст в уста сообщения о повторных инфекциях и случаях заражения вакцинированных новым вариантом, но на этой стадии исследований слишком рано что-либо утверждать». «Профиль мутаций вызывает беспокойство, но нужно проделать определенную работу, чтобы понять значимость этого варианта для хода пандемии», сказал на пресс-брифинге Минздрава ЮАР в конце прошлой недели Ричард Лесселс (Richard Lessells), врач-инфекционист из Университета КваЗулу-Натал (University of KwaZulu-Natal).
На экстренном совещании, которое Всемирная организация здравоохранения (WHO) созвала 26 ноября, новый штамм B.1.1.529 получил определение «вариант, вызывающий обеспокоенность» и название Омикрон. Он дополнил составленный ВОЗ список вариантов, вызывающих обеспокоенность, в котором находятся варианты Дельта, Альфа, Бета и Гамма. Для ученых сейчас очень важно определить способность варианта Омикрон распространяться в глобальном масштабе, если он окажется как Дельта, это может вызвать новую волну заражений. Штамм B.1.1.529 выявили при анализе геномов циркулирующих штаммов, этот вариант бросился в глаза тем, что в нем больше 30 замен в белке шипа вируса, который распознает клетки организма-хозяина и представляет собой главную мишень иммунного ответа. Многие из этих замен обнаружены в вариантах Дельта и Альфа, и они связаны с повышенной инфекционностью и способностью избегать нейтрализующих инфекцию антител. По словам Мур, компьютерное моделирование показало, что новоявленный вариант B.1.1.529 может обойти иммунный ответ, обусловленный другим компонентом иммунной системы, Т-клетками. Первые результаты, подтверждающие или опровергающие это, должны появиться в течение двух недель.
Коронавирусный вариант с множеством замен получил название Омикрон, и он вызывает сильное беспокойство у специалистов.
Исследователи в Южной Африке отмечают рост числа заражений новым вариантом вируса SARS-CoV-2. Вариант Омикрон, по-видимому, распространяется очень быстро. Впервые его выявили в Ботсване в начале ноября, а потом он обнаружился у путешественника, прибывшего в Гонконг из ЮАР. Наряду с отслеживанием распространения Омикрона ученые пытаются понять, каковы особенности этого варианта, и, в первую очередь, способен ли он избежать иммунного ответа, опосредованного вакцинами, и вызывает ли он более тяжелую или более легкую форму заболевания COVID-19, чем другие варианты, пишет Nature News.
По словам Пенни Мур (Penny Moor), вирусолога из Университета Уитвотерсренда (University of the Witwatersrand) в Йоханнесбурге, в чьей лаборатории определяют способность вирусов обходить иммунный ответ, сформировавшийся после вакцинации или перенесенных инфекций, «есть передающиеся из уст в уста сообщения о повторных инфекциях и случаях заражения вакцинированных новым вариантом, но на этой стадии исследований слишком рано что-либо утверждать». «Профиль мутаций вызывает беспокойство, но нужно проделать определенную работу, чтобы понять значимость этого варианта для хода пандемии», сказал на пресс-брифинге Минздрава ЮАР в конце прошлой недели Ричард Лесселс (Richard Lessells), врач-инфекционист из Университета КваЗулу-Натал (University of KwaZulu-Natal).
На экстренном совещании, которое Всемирная организация здравоохранения (WHO) созвала 26 ноября, новый штамм B.1.1.529 получил определение «вариант, вызывающий обеспокоенность» и название Омикрон. Он дополнил составленный ВОЗ список вариантов, вызывающих обеспокоенность, в котором находятся варианты Дельта, Альфа, Бета и Гамма. Для ученых сейчас очень важно определить способность варианта Омикрон распространяться в глобальном масштабе, если он окажется как Дельта, это может вызвать новую волну заражений. Штамм B.1.1.529 выявили при анализе геномов циркулирующих штаммов, этот вариант бросился в глаза тем, что в нем больше 30 замен в белке шипа вируса, который распознает клетки организма-хозяина и представляет собой главную мишень иммунного ответа. Многие из этих замен обнаружены в вариантах Дельта и Альфа, и они связаны с повышенной инфекционностью и способностью избегать нейтрализующих инфекцию антител. По словам Мур, компьютерное моделирование показало, что новоявленный вариант B.1.1.529 может обойти иммунный ответ, обусловленный другим компонентом иммунной системы, Т-клетками. Первые результаты, подтверждающие или опровергающие это, должны появиться в течение двух недель.
Nature
Heavily mutated Omicron variant puts scientists on alert
Nature - Researchers are racing to determine whether a fast-spreading coronavirus variant poses a threat to COVID vaccines’ effectiveness.
#омикрон #COVID19 #news
Новый вариант коронавируса омикрон может вытеснить дельту.
Генетические изменения, обнаруженные в новом варианте под названием омикрон, указывают на то, что он может распространяться среди людей быстрее, чем вариант дельта, сообщает Агентство по санитарно-эпидемиологической безопасности Великобритании (United Kingdom’s Health Security Agency), которое провело оценку риска, связанного с новым штаммом коронавируса. Это предположение подтверждает доклад, опубликованный Сетью геномного надзора Южной Африки (Network for Genomic Surveillance in South Africa), пишет издание WebMD.
В нем приведены данные об опережении омикроном дельты в Южной Африке: в октябре 80% всех образцов коронавируса с установленной генетической последовательностью относились к варианту дельта, омикрона среди них не было вообще, но уже в ноябре омикрон составил 75%, а дельта 22%. В британском докладе ученые пишут, что генетические изменения омикрона способствуют более быстрому размножению вируса в человеческом организме и, возможно, более прочному связыванию с рецептором ACE2 на клетках человека. «Структурное моделирование предполагает, что присутствующие в этом варианте мутации могут повышать способность к связыванию с человеческим ACE2 рецептором в значительно большей степени, чем это наблюдается в любом другом варианте», отмечают авторы доклада. Исследование генетических связей варианта омикрон с другими вариантами предполагает, что в людях он возник недавно.
Структурное моделирование генетических изменений вируса показало также, что появившиеся у омикрона мутации меняют форму всех четырех его сайтов, которые блокируются антителами. Это означает, что, с большой вероятностью, вирус может избегать ранее приобретенного естественного иммунитета. И действительно, первые же исследования, проведенные в Южной Африке, показали, что люди, уже перенесшие коронавирусную инфекцию, могут заразиться повторно именно вариантом омикрон. Из 2,8 миллиона положительных тестов на коронавирус, выявленных здесь в конце прошлой недели, 35 670 случаев оказались реинфекцией переболевших, и это было заражение омикроном. На основании моделирования ученые считают, что вероятность того, что омикрон избежит по крайней мере некоторой защиты, которую дают вакцины от COVID-19, очень высока. Хотя для доказательства этого положения нужны лабораторные эксперименты и эпидемиологические исследования. Но и одно из проведенных сейчас исследований не может предсказать силу патогенности варианта омикрон: будет ли он вызывать более тяжелую форму заболевания, чем остальные штаммы, или менее – пока неясно. В Африке заразились в основном люди молодого возраста.
Новый вариант коронавируса омикрон может вытеснить дельту.
Генетические изменения, обнаруженные в новом варианте под названием омикрон, указывают на то, что он может распространяться среди людей быстрее, чем вариант дельта, сообщает Агентство по санитарно-эпидемиологической безопасности Великобритании (United Kingdom’s Health Security Agency), которое провело оценку риска, связанного с новым штаммом коронавируса. Это предположение подтверждает доклад, опубликованный Сетью геномного надзора Южной Африки (Network for Genomic Surveillance in South Africa), пишет издание WebMD.
В нем приведены данные об опережении омикроном дельты в Южной Африке: в октябре 80% всех образцов коронавируса с установленной генетической последовательностью относились к варианту дельта, омикрона среди них не было вообще, но уже в ноябре омикрон составил 75%, а дельта 22%. В британском докладе ученые пишут, что генетические изменения омикрона способствуют более быстрому размножению вируса в человеческом организме и, возможно, более прочному связыванию с рецептором ACE2 на клетках человека. «Структурное моделирование предполагает, что присутствующие в этом варианте мутации могут повышать способность к связыванию с человеческим ACE2 рецептором в значительно большей степени, чем это наблюдается в любом другом варианте», отмечают авторы доклада. Исследование генетических связей варианта омикрон с другими вариантами предполагает, что в людях он возник недавно.
Структурное моделирование генетических изменений вируса показало также, что появившиеся у омикрона мутации меняют форму всех четырех его сайтов, которые блокируются антителами. Это означает, что, с большой вероятностью, вирус может избегать ранее приобретенного естественного иммунитета. И действительно, первые же исследования, проведенные в Южной Африке, показали, что люди, уже перенесшие коронавирусную инфекцию, могут заразиться повторно именно вариантом омикрон. Из 2,8 миллиона положительных тестов на коронавирус, выявленных здесь в конце прошлой недели, 35 670 случаев оказались реинфекцией переболевших, и это было заражение омикроном. На основании моделирования ученые считают, что вероятность того, что омикрон избежит по крайней мере некоторой защиты, которую дают вакцины от COVID-19, очень высока. Хотя для доказательства этого положения нужны лабораторные эксперименты и эпидемиологические исследования. Но и одно из проведенных сейчас исследований не может предсказать силу патогенности варианта омикрон: будет ли он вызывать более тяжелую форму заболевания, чем остальные штаммы, или менее – пока неясно. В Африке заразились в основном люди молодого возраста.
#омикрон #иммунитет #invitro #news
Опубликованы предварительные результаты лабораторных экспериментов по оценке эффективности существующих вакцин против нового штамма омикрон.
Первые лабораторные данные предполагают, что вакцины против нового быстро распространяющегося коронавирусного варианта могут оказаться недостаточно эффективны, но ревакцинация должна усилить иммунитет, пишет Nature News. Предварительные результаты были обнародованы на прошлой неделе группами ученых в Южной Африке, Германии и Швеции, а также коллаборацией Pfizer-BioNtech, и они показывают, что иммунная защита, придаваемая существующими противоковидными вакцинами, в отношении омикрона полностью не исчезает.
Полученные результаты пока не прошли рецензирование, они получены на малых выборках и ничего не говорят ученым о степени защиты от ковида, вызванного штаммом омикрон, которую могут обеспечить вакцины, особенно о способности защитить от тяжелой формы заболевания. «Нам все еще следует ждать более качественных данных и четких сигналов с мест, где омикрон впервые проявил себя», говорит Бен Мёррелл (Ben Murrell), вирусолог и иммунолог из Каролинского института (Karolinska Institute) в Стокгольме, соавтор одного из исследований. Ученые из Ботсваны и ЮАР выявили омикрон в конце ноября. Первые данные из Южной Африки и других мест показали, что этот вариант распространяется в несколько раз быстрее, чем дельта, и может инфицировать людей, имеющих иммунитет к другим вариантам.
Омикрон несет большое количество замен в спайк-белке, главной мишени иммунного ответа, и некоторые из этих замен, известные по другим вариантам, влияют на способность антител распознавать вирус и блокировать инфекцию. Ученые применяют два типа лабораторных проб, чтобы узнать, избежит ли омикрон нейтрализации антителами, которые выработались в результате вакцинации или инфекции. Все происходит «в пробирке». В одном случае используют частицы вируса, выделенные у заразившихся омикроном, в другом случае частицы псевдовируса, генетически модифицированной версии другого вируса со спайк-белком коронавируса.
Результаты, полученные четырьмя независимыми группами исследователей, показали, что омикрон снижает нейтрализующую способность антител больше, чем остальные циркулирующие в настоящее время варианты SARS-CoV-2. Несмотря на различия в лабораторных данных, связанные с разными историями вакцинации и инфекции людей, чьи антитела испытывались в экспериментах, влияние омикрона, по словам Мёррела, «это не полный нокаут». Ученые считают, что бустерная доза вакцины может существенно усилить скомпрометированную омикроном иммунную защиту.
Опубликованы предварительные результаты лабораторных экспериментов по оценке эффективности существующих вакцин против нового штамма омикрон.
Первые лабораторные данные предполагают, что вакцины против нового быстро распространяющегося коронавирусного варианта могут оказаться недостаточно эффективны, но ревакцинация должна усилить иммунитет, пишет Nature News. Предварительные результаты были обнародованы на прошлой неделе группами ученых в Южной Африке, Германии и Швеции, а также коллаборацией Pfizer-BioNtech, и они показывают, что иммунная защита, придаваемая существующими противоковидными вакцинами, в отношении омикрона полностью не исчезает.
Полученные результаты пока не прошли рецензирование, они получены на малых выборках и ничего не говорят ученым о степени защиты от ковида, вызванного штаммом омикрон, которую могут обеспечить вакцины, особенно о способности защитить от тяжелой формы заболевания. «Нам все еще следует ждать более качественных данных и четких сигналов с мест, где омикрон впервые проявил себя», говорит Бен Мёррелл (Ben Murrell), вирусолог и иммунолог из Каролинского института (Karolinska Institute) в Стокгольме, соавтор одного из исследований. Ученые из Ботсваны и ЮАР выявили омикрон в конце ноября. Первые данные из Южной Африки и других мест показали, что этот вариант распространяется в несколько раз быстрее, чем дельта, и может инфицировать людей, имеющих иммунитет к другим вариантам.
Омикрон несет большое количество замен в спайк-белке, главной мишени иммунного ответа, и некоторые из этих замен, известные по другим вариантам, влияют на способность антител распознавать вирус и блокировать инфекцию. Ученые применяют два типа лабораторных проб, чтобы узнать, избежит ли омикрон нейтрализации антителами, которые выработались в результате вакцинации или инфекции. Все происходит «в пробирке». В одном случае используют частицы вируса, выделенные у заразившихся омикроном, в другом случае частицы псевдовируса, генетически модифицированной версии другого вируса со спайк-белком коронавируса.
Результаты, полученные четырьмя независимыми группами исследователей, показали, что омикрон снижает нейтрализующую способность антител больше, чем остальные циркулирующие в настоящее время варианты SARS-CoV-2. Несмотря на различия в лабораторных данных, связанные с разными историями вакцинации и инфекции людей, чьи антитела испытывались в экспериментах, влияние омикрона, по словам Мёррела, «это не полный нокаут». Ученые считают, что бустерная доза вакцины может существенно усилить скомпрометированную омикроном иммунную защиту.
Nature
Omicron likely to weaken COVID vaccine protection
Nature - Early lab results suggest that existing vaccines could be less effective against the fast-spreading coronavirus variant, but boosters should improve immunity.
#омикрон #COVID19 #Великобритания #news
По данным ограниченного британского исследования омикрон не менее опасен, чем дельта.
Исследование, проведенное в Великобритании, показывает, что нет никаких доказательств того, что вариант коронавируса SARS-CoV-2 омикрон вызывает менее серьезные реакции, чем вариант дельта, сообщает WebMD.
«Исследование не обнаруживает доказательств того, что омикрон вызывает менее тяжелое заболевание, чем дельта, если судить либо по доле людей с положительным тестом, сообщающих о симптомах, либо по доле пациентов, нуждающихся в госпитализации после заражения», пишут исследователи в блоге Имперского колледжа Лондона. «Однако данные о госпитализации в настоящее время остаются очень ограниченными», отмечают они.
Исследователи изучили данные, собранные Агентством безопасности здравоохранения Великобритании и Службой здравоохранения Великобритании в отношении случаев COVID, подтвержденных тестами ПЦР в период с 29 ноября по 11 декабря.
По оценкам исследователей, риск повторного заражения вариантом омикрон в 5,4 раза выше, чем дельтой. «Это означает, что защита от повторного заражения омикроном, обеспечиваемая прошлой инфекцией, может составлять всего 19%», говорится в блоге. По данным исследования, защита после двух доз вакцины составляла от 0 до 20%, а после ревакцинации - от 55 до 80%.
«Это исследование является дополнительным доказательством того, что омикрон может избегать прежнего иммунитета, сформированного как инфекцией, так и вакцинацией. Такой уровень уклонения от иммунитета означает, что омикрон представляет собой серьезную неминуемую угрозу общественному здоровью», написал профессор Нил Фергюсон, руководитель исследовательской группы.
«Количественная оценка риска повторного заражения и эффективности вакцины против омикрона имеет важное значение для моделирования вероятной будущей траектории волны заболеваемости и потенциального эффекта вакцинации и других мер общественного здравоохранения», написала в своем блоге профессор Азра Гани из Имперского колледжа Лондона.
В исследовании говорится, что известно всего 24 случая госпитализации, вызванной омикроном, а это означает, что в этой области потребуются дополнительные исследования.
Органы здравоохранения Соединенного Королевства обеспокоены тем, что случаи заболевания омикроном перегрузят больницы, потому что этот вариант распространяется настолько быстро, что количество случаев заражения омикроном удваивается каждые два дня.
«Каким бы ни был конечный процент людей, инфицированных омикроном, которые будут нуждаться в помощи службы здравоохранения, абсолютное число обращающихся за помощью также будет удваиваться каждые два дня», написала Кристина Пагель, директор подразделения клинических операционных исследований Университетского колледжа Лондона в статье для The Guardian.
«Так что вопрос не в том, будет ли это плохо для службы здравоохранения, а в том, будет ли это просто ужасным или катастрофическим», добавила она.
По данным ограниченного британского исследования омикрон не менее опасен, чем дельта.
Исследование, проведенное в Великобритании, показывает, что нет никаких доказательств того, что вариант коронавируса SARS-CoV-2 омикрон вызывает менее серьезные реакции, чем вариант дельта, сообщает WebMD.
«Исследование не обнаруживает доказательств того, что омикрон вызывает менее тяжелое заболевание, чем дельта, если судить либо по доле людей с положительным тестом, сообщающих о симптомах, либо по доле пациентов, нуждающихся в госпитализации после заражения», пишут исследователи в блоге Имперского колледжа Лондона. «Однако данные о госпитализации в настоящее время остаются очень ограниченными», отмечают они.
Исследователи изучили данные, собранные Агентством безопасности здравоохранения Великобритании и Службой здравоохранения Великобритании в отношении случаев COVID, подтвержденных тестами ПЦР в период с 29 ноября по 11 декабря.
По оценкам исследователей, риск повторного заражения вариантом омикрон в 5,4 раза выше, чем дельтой. «Это означает, что защита от повторного заражения омикроном, обеспечиваемая прошлой инфекцией, может составлять всего 19%», говорится в блоге. По данным исследования, защита после двух доз вакцины составляла от 0 до 20%, а после ревакцинации - от 55 до 80%.
«Это исследование является дополнительным доказательством того, что омикрон может избегать прежнего иммунитета, сформированного как инфекцией, так и вакцинацией. Такой уровень уклонения от иммунитета означает, что омикрон представляет собой серьезную неминуемую угрозу общественному здоровью», написал профессор Нил Фергюсон, руководитель исследовательской группы.
«Количественная оценка риска повторного заражения и эффективности вакцины против омикрона имеет важное значение для моделирования вероятной будущей траектории волны заболеваемости и потенциального эффекта вакцинации и других мер общественного здравоохранения», написала в своем блоге профессор Азра Гани из Имперского колледжа Лондона.
В исследовании говорится, что известно всего 24 случая госпитализации, вызванной омикроном, а это означает, что в этой области потребуются дополнительные исследования.
Органы здравоохранения Соединенного Королевства обеспокоены тем, что случаи заболевания омикроном перегрузят больницы, потому что этот вариант распространяется настолько быстро, что количество случаев заражения омикроном удваивается каждые два дня.
«Каким бы ни был конечный процент людей, инфицированных омикроном, которые будут нуждаться в помощи службы здравоохранения, абсолютное число обращающихся за помощью также будет удваиваться каждые два дня», написала Кристина Пагель, директор подразделения клинических операционных исследований Университетского колледжа Лондона в статье для The Guardian.
«Так что вопрос не в том, будет ли это плохо для службы здравоохранения, а в том, будет ли это просто ужасным или катастрофическим», добавила она.
WebMD
Omicron Not Less Severe Than Delta, UK Study Says
A study conducted in the United Kingdom says there’s no evidence the Omicron variant causes less severe reactions than the Delta variant.
#омикрон #эксперименты #news
Коронавирусный штамм омикрон, в отличие от других вариантов, щадит легкие – об этом свидетельствуют эксперименты на животных.
Массив новых исследований на лабораторных животных и культурах тканей человека предоставил первые данные, указывающие на причину более легкого течения заболевания, вызванного омикроном, по сравнению с прежними вариантами, пишет New York Times. В экспериментах на мышах и хомячках инфицирование омикроном часто ограничивалось верхними дыхательными путями: носоглоткой и трахеями. Предыдущие версии вируса вызывали поражение легких, которые покрывались рубцами и не могли выполнять свою функцию, в результате чего возникали опасные затруднения дыхания. По словам Роланда Эйлса (Roland Eils) из Берлинского института здравоохранения (Berlin Institute of Health), «появилась форма ковида, которая манифестирует в верхних дыхательных путях». В ноябре прошлого года, когда из Южной Африки стали поступать первые сообщения о новом варианте, ученые лишь строили догадки о, возможно, ином поведении омикрона, отличном от проявления прежних вариантов, потому что у него обнаружили особенную и вызывающую опасение комбинацию из 50 с лишним генетических мутаций. В экспериментах выяснилось, что некоторые из этих замен способствуют более прочному связыванию вируса с заражаемыми клетками, а другие позволяют ему избегать сформировавшихся ранее защитных антител. Но как именно новый вариант может вести себя внутри организма оставалось тайной.
За последний месяц более 10 исследовательских групп по всему миру наблюдали новый патоген в лаборатории, инфицируя омикроном клетки в чашках Петри и впрыскивая его в носовые ходы животных. А новый вариант вируса тем временем стремительно распространялся по планете, инфицируя даже вакцинированных и переболевших людей. Но несмотря на резкий рост числа зараженных, количество госпитализаций увеличилось незначительно. Первые наблюдения за пациентами с омикроном показали, что он гораздо реже вызывает тяжелую форму заболевания, чем другие варианты, особенно среди вакцинированных. Но это утверждение со многими оговорками. В частности, основная масса первых инфицированных были молодыми людьми, которые болеют тяжелым ковидом реже, чем пожилые, и у многих из них уже был иммунитет. Сейчас крупный японско-американский консорциум ученых выпустил сообщение о результатах экспериментов на хомячках и мышах, которых заражали омикроном или каким-то одним или несколькими более ранними вариантами. У животных-носителей омикрона были меньше поражены легкие, меньшей была потеря веса и смертность среди них была значительно ниже.
Коронавирусный штамм омикрон, в отличие от других вариантов, щадит легкие – об этом свидетельствуют эксперименты на животных.
Массив новых исследований на лабораторных животных и культурах тканей человека предоставил первые данные, указывающие на причину более легкого течения заболевания, вызванного омикроном, по сравнению с прежними вариантами, пишет New York Times. В экспериментах на мышах и хомячках инфицирование омикроном часто ограничивалось верхними дыхательными путями: носоглоткой и трахеями. Предыдущие версии вируса вызывали поражение легких, которые покрывались рубцами и не могли выполнять свою функцию, в результате чего возникали опасные затруднения дыхания. По словам Роланда Эйлса (Roland Eils) из Берлинского института здравоохранения (Berlin Institute of Health), «появилась форма ковида, которая манифестирует в верхних дыхательных путях». В ноябре прошлого года, когда из Южной Африки стали поступать первые сообщения о новом варианте, ученые лишь строили догадки о, возможно, ином поведении омикрона, отличном от проявления прежних вариантов, потому что у него обнаружили особенную и вызывающую опасение комбинацию из 50 с лишним генетических мутаций. В экспериментах выяснилось, что некоторые из этих замен способствуют более прочному связыванию вируса с заражаемыми клетками, а другие позволяют ему избегать сформировавшихся ранее защитных антител. Но как именно новый вариант может вести себя внутри организма оставалось тайной.
За последний месяц более 10 исследовательских групп по всему миру наблюдали новый патоген в лаборатории, инфицируя омикроном клетки в чашках Петри и впрыскивая его в носовые ходы животных. А новый вариант вируса тем временем стремительно распространялся по планете, инфицируя даже вакцинированных и переболевших людей. Но несмотря на резкий рост числа зараженных, количество госпитализаций увеличилось незначительно. Первые наблюдения за пациентами с омикроном показали, что он гораздо реже вызывает тяжелую форму заболевания, чем другие варианты, особенно среди вакцинированных. Но это утверждение со многими оговорками. В частности, основная масса первых инфицированных были молодыми людьми, которые болеют тяжелым ковидом реже, чем пожилые, и у многих из них уже был иммунитет. Сейчас крупный японско-американский консорциум ученых выпустил сообщение о результатах экспериментов на хомячках и мышах, которых заражали омикроном или каким-то одним или несколькими более ранними вариантами. У животных-носителей омикрона были меньше поражены легкие, меньшей была потеря веса и смертность среди них была значительно ниже.
NY Times
Studies Suggest Why Omicron Is Less Severe: It Spares the Lungs
Compared with earlier variants, Omicron may cause less damage to the lungs, new animal research suggests.
#омикрон #Ткиллеры #news
Клетки-киллеры сохраняют способность распознавать омикрон.
На фоне обеспокоенности потерей антителами защитных свойств в отношении коронавирусного варианта омикрон некоторые ученые утверждают, что не следует упускать из виду потенциал Т-клеток иммунной системы, пишет Nature News. Геном омикрона полон мутаций, в одном только участке, кодирующем белок шипа вируса, на который направлены существующие противоковидные вакцины, их больше 30. Это означает, что эффективность антител, выработанных на предыдущие варианты, может быть снижена.
Венди Бергерс (Wendy Burgers) и Кэтрин Риу (Catherine Riou), работающие в Университете Кейптауна (University of Cape Town) в Южной Африке, изучали предшествующие варианты и обнаружили, что, хотя возникающие варианты коронавирусов и ослабляют антительную защиту, другая составляющая иммунной системы, специализированные клетки, которые называются Т-клетками, все еще могут распознавать патогены. Но в омикроне значительно больше замен, чем в изученных ранее вариантах. Главный вопрос состоял в том, сохранится ли иммунность, приобретенная благодаря вакцинации или перенесенной инфекции, на которую полагались люди в случае новой волны ковида. Все ответы, поступающие из лабораторий, которые находятся в разных странах, сходятся на одном и том же: новые варианты вируса, включая омикрон, чувствительны к Т-клеточному иммунитету», цитирует Дэна Баруха (Dan Barouch), директора Центра вирусологии и вакцинных исследований при Гарвардской медицинской школе (Center for Virology and Vaccine Research at Harvard Medical School) в Бостоне, Nature News.
При обсуждении иммунитета к коронавирусу Т-клетки остаются в тени антител. Но они выполняют разнообразные иммунные функции, в том числе «киллерные», убивая пораженные вирусом клетки. Таким образом они ограничивают распространение инфекции и потенциально снижают риск заболевания в тяжелой форме. Уровень Т-клеток после перенесенной инфекции или вакцинации не падает так стремительно, как уровень антител, и они лучше распознают мутировавшие варианты. До сих пор результаты компьютерного и лабораторного анализа предполагали, что именно так и обстоят дела в случае омикрона. Но были проведены также исследования, в которых способность Т-клеток, выделенных у вакцинированных или переболевших предыдущими вариантами людей реагировать на омикрон изучалась напрямую. «Т-клеточный ответ остался неизменным, и это хорошая новость», говорит Корин Гёртс ван Кессел, клинический вирусолог из Медицинского центра Университета Эразмус (Erasmus Medical Centre) в Роттердаме, Нидерланды.
Клетки-киллеры сохраняют способность распознавать омикрон.
На фоне обеспокоенности потерей антителами защитных свойств в отношении коронавирусного варианта омикрон некоторые ученые утверждают, что не следует упускать из виду потенциал Т-клеток иммунной системы, пишет Nature News. Геном омикрона полон мутаций, в одном только участке, кодирующем белок шипа вируса, на который направлены существующие противоковидные вакцины, их больше 30. Это означает, что эффективность антител, выработанных на предыдущие варианты, может быть снижена.
Венди Бергерс (Wendy Burgers) и Кэтрин Риу (Catherine Riou), работающие в Университете Кейптауна (University of Cape Town) в Южной Африке, изучали предшествующие варианты и обнаружили, что, хотя возникающие варианты коронавирусов и ослабляют антительную защиту, другая составляющая иммунной системы, специализированные клетки, которые называются Т-клетками, все еще могут распознавать патогены. Но в омикроне значительно больше замен, чем в изученных ранее вариантах. Главный вопрос состоял в том, сохранится ли иммунность, приобретенная благодаря вакцинации или перенесенной инфекции, на которую полагались люди в случае новой волны ковида. Все ответы, поступающие из лабораторий, которые находятся в разных странах, сходятся на одном и том же: новые варианты вируса, включая омикрон, чувствительны к Т-клеточному иммунитету», цитирует Дэна Баруха (Dan Barouch), директора Центра вирусологии и вакцинных исследований при Гарвардской медицинской школе (Center for Virology and Vaccine Research at Harvard Medical School) в Бостоне, Nature News.
При обсуждении иммунитета к коронавирусу Т-клетки остаются в тени антител. Но они выполняют разнообразные иммунные функции, в том числе «киллерные», убивая пораженные вирусом клетки. Таким образом они ограничивают распространение инфекции и потенциально снижают риск заболевания в тяжелой форме. Уровень Т-клеток после перенесенной инфекции или вакцинации не падает так стремительно, как уровень антител, и они лучше распознают мутировавшие варианты. До сих пор результаты компьютерного и лабораторного анализа предполагали, что именно так и обстоят дела в случае омикрона. Но были проведены также исследования, в которых способность Т-клеток, выделенных у вакцинированных или переболевших предыдущими вариантами людей реагировать на омикрон изучалась напрямую. «Т-клеточный ответ остался неизменным, и это хорошая новость», говорит Корин Гёртс ван Кессел, клинический вирусолог из Медицинского центра Университета Эразмус (Erasmus Medical Centre) в Роттердаме, Нидерланды.
Nature
‘Killer’ immune cells still recognize Omicron variant
Nature - Amid concerns over lost antibody defences, some researchers argue that more attention should be paid to T cells.
#COVID19 #омикрон #прогноз #news
«Период затишья» пандемии после омикрона предвидят некоторые ученые, этому посвящен обзор сетевой версии Science.
Спустя два месяца после своего начала волна пандемии COVID-19, вызванная коронавирусным вариантом омикрон, в некоторых странах пошла на убыль. И хотя она захлестнула огромное количество людей, у экспертов возникло ощущение оптимизма в отношении траектории пандемии. В странах, где вакцинированы или переболели многие, худшее, наконец-то, может оказаться позади. «Мы ожидаем, что до возможного возвращения COVID-19 к концу года нас ждет спокойный период», цитирует Science.org Ханса Клуге (Hans Kluge), директора Европейского регионального бюро Всемирной организации здравоохранения (ВОЗ). В своем оптимизме он не одинок, хотя и с оговорками, но его разделяют некоторые ученые, а также специалисты в области общественного здоровья, которые с самого начала указывали на пик пандемии и призывали политиков принять жесткие меры. «Мы достигли некой поворотной точки», считает Деви Сридхар (Devi Sridhar), эксперт по глобальному здравоохранению из Эдинбургского университета (University of Edinburgh) и критик прежней – не слишком жесткой – политики британского правительства, в отношении пандемии. Как отмечает Science.org, волна омикрона в некоторых странах меньше ожидаемой, а кроме того, она формирует иммунитет на популяционном уровне, что означает меньшую угрозу при появлении новых волн коронавирусной инфекции. Между тем ученые призывают не терять бдительности, потому что, как показал омикрон, даже относительно умеренная волна может создать огромную нагрузку на систему здравоохранения и общество в целом, а кроме того, неясно, как долго продержится сформированный омикроном иммунитет, как будет эволюционировать вирус дальше и как часто вспышки инфекций будут приводит к долговременным проблемам со здоровьем.
В настоящее время омикрон все еще распространяется по миру, и его действие в разных странах неодинаково. Первые надежды на существенно более слабую волну в США быстро угасли, отчасти из-за относительно низкого уровня вакцинации населения. В странах с высоким уровнем вакцинации, таких как Дания, число инфицированных постоянно колеблется, но там гораздо меньше случаев заболевания в тяжелой форме и смертей. В Южной Африке, где омикрон был выявлен впервые, количество заражений достигло пике в середине декабря. И хотя число смертей все еще растет, в среднем заболеваемость более легкая. По словам вакцинолога из Университета Уитвотерсренда (University of the Witwatersrand) в Йоханнесбурге Шабира Мадхи (Shabir Madhi), около 50% смертей от COVID-19 приходится на вариант дельта, тогда как вклад омикрона составляет всего 5%.
«Период затишья» пандемии после омикрона предвидят некоторые ученые, этому посвящен обзор сетевой версии Science.
Спустя два месяца после своего начала волна пандемии COVID-19, вызванная коронавирусным вариантом омикрон, в некоторых странах пошла на убыль. И хотя она захлестнула огромное количество людей, у экспертов возникло ощущение оптимизма в отношении траектории пандемии. В странах, где вакцинированы или переболели многие, худшее, наконец-то, может оказаться позади. «Мы ожидаем, что до возможного возвращения COVID-19 к концу года нас ждет спокойный период», цитирует Science.org Ханса Клуге (Hans Kluge), директора Европейского регионального бюро Всемирной организации здравоохранения (ВОЗ). В своем оптимизме он не одинок, хотя и с оговорками, но его разделяют некоторые ученые, а также специалисты в области общественного здоровья, которые с самого начала указывали на пик пандемии и призывали политиков принять жесткие меры. «Мы достигли некой поворотной точки», считает Деви Сридхар (Devi Sridhar), эксперт по глобальному здравоохранению из Эдинбургского университета (University of Edinburgh) и критик прежней – не слишком жесткой – политики британского правительства, в отношении пандемии. Как отмечает Science.org, волна омикрона в некоторых странах меньше ожидаемой, а кроме того, она формирует иммунитет на популяционном уровне, что означает меньшую угрозу при появлении новых волн коронавирусной инфекции. Между тем ученые призывают не терять бдительности, потому что, как показал омикрон, даже относительно умеренная волна может создать огромную нагрузку на систему здравоохранения и общество в целом, а кроме того, неясно, как долго продержится сформированный омикроном иммунитет, как будет эволюционировать вирус дальше и как часто вспышки инфекций будут приводит к долговременным проблемам со здоровьем.
В настоящее время омикрон все еще распространяется по миру, и его действие в разных странах неодинаково. Первые надежды на существенно более слабую волну в США быстро угасли, отчасти из-за относительно низкого уровня вакцинации населения. В странах с высоким уровнем вакцинации, таких как Дания, число инфицированных постоянно колеблется, но там гораздо меньше случаев заболевания в тяжелой форме и смертей. В Южной Африке, где омикрон был выявлен впервые, количество заражений достигло пике в середине декабря. И хотя число смертей все еще растет, в среднем заболеваемость более легкая. По словам вакцинолога из Университета Уитвотерсренда (University of the Witwatersrand) в Йоханнесбурге Шабира Мадхи (Shabir Madhi), около 50% смертей от COVID-19 приходится на вариант дельта, тогда как вклад омикрона составляет всего 5%.
Science
After Omicron, some scientists foresee ‘a period of quiet’
The variant’s modest toll in many countries has led to a sense of optimism. But new surprises are likely
#омикрон #омикронспецифическиевакцины #бустеры #news
Клинические испытания омикрон-специфических бустерных мРНК-овых вакцин начались на прошлой неделе.
Первые дозы противоковидных вакцин, нацеленных на штамм омикрон, уже вводятся участникам испытаний, и это происходит на подъеме волны распространения сверхтрансмиссивного коронавирусного варианта в США, однако определенности по поводу будущего этого штамма у экспертов нет, пишет издание Ars Technica. Ведущие производители вакцин на основе мРНК, компании Moderna и Pfizer со своим партнером BioNTech, объявили на прошлой неделе о введении обновленных препаратов первым добровольцам. Направленные на омикрон вакцины созданы с учетом мутаций, обнаруженных в белке шипа нового штамма вируса SARS-CoV-2. Компании подчеркивают, что три дозы вакцин – две дозы первых серий, за которыми последует бустерная доза обновленной вакцины – удержат от заболевания, вызванного омикроном. Эти дозы дадут сильную защиту от тяжелого течения заболевания, госпитализации и смерти, заявляют разработчики. Ранее Центры по контролю и профилактике заболеваний (Centers for Disease Control and Prevention) США, CDC, опубликовали данные, свидетельствующие о том, что три дозы снижают вероятность госпитализации на 90%. Однако иммунная защита от инфекции, сформировавшаяся предыдущими версиями вакцин, пробивается сильно мутировавшим вирусным вариантом. Новые омикрон-специфические вакцины должны не только обеспечить защиту от нового штамма на том же уровне, на каком прежние вакцины защищали от предшествующих вариантов, но и сделать эту защиту более продолжительной, отмечает в заявлении компании BioNTech ее исполнительный директор Угур Сахин (Ugur Sahin).
В испытаниях омикрон-специфической вакцины Pfizer/BioNTech принимают участие 1 420 человек, которые разделены на три группы. В одной группе из 615 человек те, кто получил две дозы существующих вакцин. Им введут одну или две дозы омикрон-специфического бустера. Во второй группе 600 человек, уже получивших три дозы существующих вакцин и согласившихся на омикрон-специфический бустер. В третьей небольшой группе из 205 участников совершенно не вакцинирован никто, и этим людям предстоит получить три дозы омикрон-специфической вакцины. Moderna начала менее масштабное испытание своей такой же вакцины, в нем участвуют лишь 600 человек, разделенные на две группы. В одной группе люди, ранее получившие две дозы вакцины, в другой – три. Обе компании надеются, что бустерные вакцины для широкого применения будут готовы в марте. Эксперты же разделились на тех, кто предсказывает скорое падение заболеваемости и тех, кто не исключает возникновения вариантов вируса, которые превзойдут омикрон и снизят эффективность всех наших вакцин.
Клинические испытания омикрон-специфических бустерных мРНК-овых вакцин начались на прошлой неделе.
Первые дозы противоковидных вакцин, нацеленных на штамм омикрон, уже вводятся участникам испытаний, и это происходит на подъеме волны распространения сверхтрансмиссивного коронавирусного варианта в США, однако определенности по поводу будущего этого штамма у экспертов нет, пишет издание Ars Technica. Ведущие производители вакцин на основе мРНК, компании Moderna и Pfizer со своим партнером BioNTech, объявили на прошлой неделе о введении обновленных препаратов первым добровольцам. Направленные на омикрон вакцины созданы с учетом мутаций, обнаруженных в белке шипа нового штамма вируса SARS-CoV-2. Компании подчеркивают, что три дозы вакцин – две дозы первых серий, за которыми последует бустерная доза обновленной вакцины – удержат от заболевания, вызванного омикроном. Эти дозы дадут сильную защиту от тяжелого течения заболевания, госпитализации и смерти, заявляют разработчики. Ранее Центры по контролю и профилактике заболеваний (Centers for Disease Control and Prevention) США, CDC, опубликовали данные, свидетельствующие о том, что три дозы снижают вероятность госпитализации на 90%. Однако иммунная защита от инфекции, сформировавшаяся предыдущими версиями вакцин, пробивается сильно мутировавшим вирусным вариантом. Новые омикрон-специфические вакцины должны не только обеспечить защиту от нового штамма на том же уровне, на каком прежние вакцины защищали от предшествующих вариантов, но и сделать эту защиту более продолжительной, отмечает в заявлении компании BioNTech ее исполнительный директор Угур Сахин (Ugur Sahin).
В испытаниях омикрон-специфической вакцины Pfizer/BioNTech принимают участие 1 420 человек, которые разделены на три группы. В одной группе из 615 человек те, кто получил две дозы существующих вакцин. Им введут одну или две дозы омикрон-специфического бустера. Во второй группе 600 человек, уже получивших три дозы существующих вакцин и согласившихся на омикрон-специфический бустер. В третьей небольшой группе из 205 участников совершенно не вакцинирован никто, и этим людям предстоит получить три дозы омикрон-специфической вакцины. Moderna начала менее масштабное испытание своей такой же вакцины, в нем участвуют лишь 600 человек, разделенные на две группы. В одной группе люди, ранее получившие две дозы вакцины, в другой – три. Обе компании надеются, что бустерные вакцины для широкого применения будут готовы в марте. Эксперты же разделились на тех, кто предсказывает скорое падение заболеваемости и тех, кто не исключает возникновения вариантов вируса, которые превзойдут омикрон и снизят эффективность всех наших вакцин.
Ars Technica
Omicron-specific vaccine boosters are now in humans as trials begin
The boosters may be ready in March, but what comes next is anyone's guess.
#омикрон #коронавирус #news
Новый мутантный Омикрон угрожает стать самым заразным вариантом из известных до сих пор.
На прошлой неделе в нескольких странах снова начался рост случаев заболевания COVID-19, и некоторые эксперты считают, что причиной этого является неуловимая форма Омикрона, так называемая сублиния BA.2. Если это так, и BA.2 окажется даже более трансмиссивным, чем базовый Омикрон – сублиния BA.1 – тогда нам следует готовиться к трудной весне, пишет издание Daily Beast. BA.2 уже проникает в США.
Ученые знают о BA.2 уже несколько недель. Впервые они обнаружили его в начале декабря в образцах из Южной Африки, Австралии и Канады. Это произошло всего через несколько недель после того, как официальные лица из Южной Африки объявили о первых случаях BA.1. BA.1 - базовый Омикрон, который имеет десятки уникальных мутаций по сравнению с более ранними линиями SARS-CoV-2 - быстро стал доминирующим во всем мире, почти уничтожив ранее доминирующую линию Дельта во многих странах. Омикрон повлиял на пандемию. Это наиболее трансмиссивная линия, хотя она часто приводит к менее серьезным последствиям, чем Дельта, отчасти из-за ее склонности оставаться в верхних дыхательных путях, а не поражать легкие.
BA.2 трудно отличить от BA.1 во многих ПЦР-тестах. Различение двух подлиний иногда требует секвенирования в лаборатории, что может замедлить усилия по отслеживанию их по отдельности. «Недавние тенденции в Индии, Южной Африке, Великобритании и Дании свидетельствуют о том, что BA.2 увеличивается пропорционально», объявила Всемирная организация здравоохранения в пятницу.
«Подлиния BA.2 была замечена здесь, в Вашингтоне, сказал Кейт Джером, вирусолог из Вашингтонского университета, и опыт других частей мира показывает, что она может быть даже более заразной, чем BA.1. и, кажется, превосходит его». Это может быть связано с тем, что BA.2 на самом деле сильно отличается от BA.1 на генетическом уровне, и эти различия могут сделать BA.2 более трансмиссивным. Обе подлинии имеют около 50 уникальных мутаций по сравнению, скажем, с дельтой. Но это не те же самые 50 уникальных мутаций. Фактически, не менее 16 мутаций BA.2 уникальны для сублинии. Эти изменения в основном затрагивают белок шипа вируса, который помогает ему захватывать и заражать наши клетки. Мутированный шиповидный белок связан с более высокой трансмиссивностью.
Новый мутантный Омикрон угрожает стать самым заразным вариантом из известных до сих пор.
На прошлой неделе в нескольких странах снова начался рост случаев заболевания COVID-19, и некоторые эксперты считают, что причиной этого является неуловимая форма Омикрона, так называемая сублиния BA.2. Если это так, и BA.2 окажется даже более трансмиссивным, чем базовый Омикрон – сублиния BA.1 – тогда нам следует готовиться к трудной весне, пишет издание Daily Beast. BA.2 уже проникает в США.
Ученые знают о BA.2 уже несколько недель. Впервые они обнаружили его в начале декабря в образцах из Южной Африки, Австралии и Канады. Это произошло всего через несколько недель после того, как официальные лица из Южной Африки объявили о первых случаях BA.1. BA.1 - базовый Омикрон, который имеет десятки уникальных мутаций по сравнению с более ранними линиями SARS-CoV-2 - быстро стал доминирующим во всем мире, почти уничтожив ранее доминирующую линию Дельта во многих странах. Омикрон повлиял на пандемию. Это наиболее трансмиссивная линия, хотя она часто приводит к менее серьезным последствиям, чем Дельта, отчасти из-за ее склонности оставаться в верхних дыхательных путях, а не поражать легкие.
BA.2 трудно отличить от BA.1 во многих ПЦР-тестах. Различение двух подлиний иногда требует секвенирования в лаборатории, что может замедлить усилия по отслеживанию их по отдельности. «Недавние тенденции в Индии, Южной Африке, Великобритании и Дании свидетельствуют о том, что BA.2 увеличивается пропорционально», объявила Всемирная организация здравоохранения в пятницу.
«Подлиния BA.2 была замечена здесь, в Вашингтоне, сказал Кейт Джером, вирусолог из Вашингтонского университета, и опыт других частей мира показывает, что она может быть даже более заразной, чем BA.1. и, кажется, превосходит его». Это может быть связано с тем, что BA.2 на самом деле сильно отличается от BA.1 на генетическом уровне, и эти различия могут сделать BA.2 более трансмиссивным. Обе подлинии имеют около 50 уникальных мутаций по сравнению, скажем, с дельтой. Но это не те же самые 50 уникальных мутаций. Фактически, не менее 16 мутаций BA.2 уникальны для сублинии. Эти изменения в основном затрагивают белок шипа вируса, который помогает ему захватывать и заражать наши клетки. Мутированный шиповидный белок связан с более высокой трансмиссивностью.
Yahoo
Experts Fear New Mutant Omicron Is Most Contagious COVID Variant Yet
Photo Illustration by Elizabeth Brockway/The Daily Beast/GettyJust a couple weeks ago it seemed like the worst was behind us and the wave of COVID-19 infections driven by the new Omicron variant was beginning to ebb in many of the worst-hit places.But epidemiologists…
#омикрон #происхождение #версии #news
Для объяснения происхождения омикрона ученые выдвинули три альтернативные версии.
Чрезвычайно быстро распространяющийся вариант коронавируса SARS-CoV-2 под названием омикрон снабжен непредвиденным набором мутаций, и у специалистов нет ясного представления о предшественниках этого варианта. По оценкам эволюционных вирусологов его ближайший из известных генетический предок мог возникнуть приблизительно в середине 2020-го. Происхождению омикрона была посвящена январская встреча созданной недавно Всемирной организацией здравоохранения (ВОЗ) Научной консультативной группы по изучению происхождения новых патогенов (Scientific Advisory Group for the Origins of Novel Pathogens), SAGO, которая должна опубликовать свой доклад в начале февраля.
В ожидании этого Nature News публикует мнения ученых о трех основных теориях природы омикрона. Вопрос о происхождении омикрона представляет не только научный интерес. Выяснение условий, породивших этот высокозаразный вариант, позволит оценить риск возникновения новых подобных вариантов и предложить меры для его минимизации. Одна из рассматриваемых версий предполагает, что, несмотря на миллионы прочитанных геномов вируса SARS-CoV-2, серии мутаций, приведшие к омикрону, могли быть просто упущены, причем то, что его выявили в Южной Африке, еще не означает, что возник он именно там, считают специалисты. В этом варианте по сравнению с оригинальным уханьским SARS-CoV-2 более 50 новых мутаций, 30 из которых – в белке шипа. Более десятка мутаций чрезвычайно редкие и некоторые из них быстро исчезли, очевидно, из-за своей вредности для вируса.
Еще одна генетическая особенность омикрона – он состоит из трех подлиний, BA.1, BA.2 и BA.3, возникших приблизительно одновременно. По мнению одних ученых накопление большого количества омикронных мутаций всего за полтора года не могло произойти так же постепенно, при передаче от человека к человеку, как накапливались немногочисленные мутации в прежних вариантах. Другие считают, что накопление происходило незаметно в отдаленном уголке мира, где плохо с генетическим секвенированием и людей тестировали мало, возможно, потому что они болели бессимптомно. Альтернативное объяснение заключается в накоплении мутаций у одного человека с долговременной инфекцией коронавирусом на фоне ослабленной иммунной системы. По выражению биоинформатика Сергея Понда (Sergei Pond) из Университета Темпл (Temple University) в Пенсильвании, такой организм позволяет вирусу «играть с иммунной системой в кошки-мышки». Или же омикрон возник незаметно в организме каких-то животных, таких как мыши или крысы.
Для объяснения происхождения омикрона ученые выдвинули три альтернативные версии.
Чрезвычайно быстро распространяющийся вариант коронавируса SARS-CoV-2 под названием омикрон снабжен непредвиденным набором мутаций, и у специалистов нет ясного представления о предшественниках этого варианта. По оценкам эволюционных вирусологов его ближайший из известных генетический предок мог возникнуть приблизительно в середине 2020-го. Происхождению омикрона была посвящена январская встреча созданной недавно Всемирной организацией здравоохранения (ВОЗ) Научной консультативной группы по изучению происхождения новых патогенов (Scientific Advisory Group for the Origins of Novel Pathogens), SAGO, которая должна опубликовать свой доклад в начале февраля.
В ожидании этого Nature News публикует мнения ученых о трех основных теориях природы омикрона. Вопрос о происхождении омикрона представляет не только научный интерес. Выяснение условий, породивших этот высокозаразный вариант, позволит оценить риск возникновения новых подобных вариантов и предложить меры для его минимизации. Одна из рассматриваемых версий предполагает, что, несмотря на миллионы прочитанных геномов вируса SARS-CoV-2, серии мутаций, приведшие к омикрону, могли быть просто упущены, причем то, что его выявили в Южной Африке, еще не означает, что возник он именно там, считают специалисты. В этом варианте по сравнению с оригинальным уханьским SARS-CoV-2 более 50 новых мутаций, 30 из которых – в белке шипа. Более десятка мутаций чрезвычайно редкие и некоторые из них быстро исчезли, очевидно, из-за своей вредности для вируса.
Еще одна генетическая особенность омикрона – он состоит из трех подлиний, BA.1, BA.2 и BA.3, возникших приблизительно одновременно. По мнению одних ученых накопление большого количества омикронных мутаций всего за полтора года не могло произойти так же постепенно, при передаче от человека к человеку, как накапливались немногочисленные мутации в прежних вариантах. Другие считают, что накопление происходило незаметно в отдаленном уголке мира, где плохо с генетическим секвенированием и людей тестировали мало, возможно, потому что они болели бессимптомно. Альтернативное объяснение заключается в накоплении мутаций у одного человека с долговременной инфекцией коронавирусом на фоне ослабленной иммунной системы. По выражению биоинформатика Сергея Понда (Sergei Pond) из Университета Темпл (Temple University) в Пенсильвании, такой организм позволяет вирусу «играть с иммунной системой в кошки-мышки». Или же омикрон возник незаметно в организме каких-то животных, таких как мыши или крысы.
Nature
Where did Omicron come from? Three key theories
Nature - The highly transmissible variant emerged with a host of unusual mutations. Now scientists are trying to work out how it evolved.
#омикрон #животные #эволюцияSARSCoV2 #news
Обнаружение Омикрона у белохвостого оленя в штате Нью-Йорк вызывает опасения по поводу возможных новых вариантов.
Обнаружение варианта Omicron у белохвостого оленя в Нью-Йорке вызвало у ученых опасения, что этот вид, насчитывающий 30 миллионов в США, может стать носителем нового штамма коронавируса SARS-C0V-2, сообщает Reuters.
Кровь и некоторые образцы мазков из носа 131 оленя, пойманного на Статен-Айленде в Нью-Йорке, показали, что почти 15% из них имели антитела против вируса. Эти данные свидетельствуют о том, что у животных ранее были коронавирусные инфекции и они подвергались повторным заражениям новыми вариантами. По словам руководителя исследования Суреша Кучипуди, ветеринарного микробиолога из Университета штата Пенсильвания, «циркуляция вируса в популяции животных всегда повышает вероятность его возвращения к людям, но, что более важно, она предоставляет вирусу больше возможностей для эволюционирования в новые варианты». «Когда вирус полностью мутирует, он может выйти из-под защиты нынешней вакцины. Поэтому нам придется снова менять вакцину», считает Кучипуди.
Омикрон обнаружен у диких животных впервые, а произошло это на фоне снижения заболеваемости COVID-19, вызванного этим вариантом, в США.
По данным Министерства сельского хозяйства США, хотя нет никаких доказательств того, что животные передают вирус людям, большинство случаев заражения коронавирусом было зарегистрировано у видов, имевших тесный контакт с человеком с COVID-19.
В августе правительство США заявило об обнаружении первых в мире случаев заражения SARS-CoV-2 у диких оленей в штате Огайо, расширив тем самым список животных, у которых был получен положительный результат теста на эту инфекцию. Образцы были собраны у оленей за несколько месяцев до появления сильно мутировавшего варианта омикрон, пришедшего на смену ранее доминирующему среди людей по всему миру варианту дельта.
Ранее Министерство сельского хозяйства США сообщало о COVID-19 у собак, кошек, тигров, львов, снежных барсов, выдр, горилл и норок.
Обнаружение Омикрона у белохвостого оленя в штате Нью-Йорк вызывает опасения по поводу возможных новых вариантов.
Обнаружение варианта Omicron у белохвостого оленя в Нью-Йорке вызвало у ученых опасения, что этот вид, насчитывающий 30 миллионов в США, может стать носителем нового штамма коронавируса SARS-C0V-2, сообщает Reuters.
Кровь и некоторые образцы мазков из носа 131 оленя, пойманного на Статен-Айленде в Нью-Йорке, показали, что почти 15% из них имели антитела против вируса. Эти данные свидетельствуют о том, что у животных ранее были коронавирусные инфекции и они подвергались повторным заражениям новыми вариантами. По словам руководителя исследования Суреша Кучипуди, ветеринарного микробиолога из Университета штата Пенсильвания, «циркуляция вируса в популяции животных всегда повышает вероятность его возвращения к людям, но, что более важно, она предоставляет вирусу больше возможностей для эволюционирования в новые варианты». «Когда вирус полностью мутирует, он может выйти из-под защиты нынешней вакцины. Поэтому нам придется снова менять вакцину», считает Кучипуди.
Омикрон обнаружен у диких животных впервые, а произошло это на фоне снижения заболеваемости COVID-19, вызванного этим вариантом, в США.
По данным Министерства сельского хозяйства США, хотя нет никаких доказательств того, что животные передают вирус людям, большинство случаев заражения коронавирусом было зарегистрировано у видов, имевших тесный контакт с человеком с COVID-19.
В августе правительство США заявило об обнаружении первых в мире случаев заражения SARS-CoV-2 у диких оленей в штате Огайо, расширив тем самым список животных, у которых был получен положительный результат теста на эту инфекцию. Образцы были собраны у оленей за несколько месяцев до появления сильно мутировавшего варианта омикрон, пришедшего на смену ранее доминирующему среди людей по всему миру варианту дельта.
Ранее Министерство сельского хозяйства США сообщало о COVID-19 у собак, кошек, тигров, львов, снежных барсов, выдр, горилл и норок.
Reuters
Discovery of Omicron in New York deer raises concern over possible new variants
The discovery of the Omicron variant in white-tailed deer in New York has raised concerns that the species, numbering 30 million in the United States, could become hosts of a new coronavirus strain, a lead researcher said on Tuesday.
#BA2 #омикрон #invitro #news
По мере распространения подварианта омикрона BA.2 появляются лабораторные исследования, указывающие на признаки серьезности вызываемого им заболевания.
Вирус BA.2 – подвариант варианта коронавируса омикрон – не только распространяется быстрее, чем его дальний родственник, он также может вызывать более тяжелое заболевание и, по-видимому, способен разрушить имеющиеся у нас ключевые виды противоковидной защиты, сообщает CNN.
Проведенные в Японии лабораторные эксперименты показывают, что BA.2 может иметь особенности, которые делают его способным вызывать столь же серьезные заболевания, как и более старые варианты SARS-CoV-29, включая вариант дельта. И, подобно омикрону, он, похоже, в значительной степени избегает иммунитета, сформированного вакцинами. Бустерная прививка восстанавливает защиту, снижая вероятность заболевания после заражения примерно на 74%. BA.2 также устойчив к некоторым видам лечения, включая сотровимаб, моноклональное антитело, которое в настоящее время используется против омикрона. Результаты этих исследований предварительны и опубликованы на сервере препринтов bioRxiv.
«С точки зрения человека это может быть худший вирус, чем BA.1, и он может лучше передаваться и вызывать более тяжелые заболевания», говорит эксперт CNN Дэниел Роудс, заведующий отделением микробиологии в Кливлендской клинике в Огайо. Центры по контролю и профилактике заболеваний США (CDC) внимательно следят за BA.2, заявила директор CDC Рошель Валенски на брифинге для журналистов. «Нет никаких доказательств того, что линия BA.2 является более серьезной, чем линия BA.1. CDC продолжает отслеживать варианты, которые циркулируют как внутри страны, так и за рубежом», добавила она. BA.2 сильно мутирован по сравнению с исходным вирусом, вызывающим Covid, который появился в Ухане в 2019 году. Он также имеет десятки генных изменений, которые отличаются от исходного штамма омикрон, что делает его таким же отличным от самого последнего пандемического вируса, как варианты альфа, бета, гамма и дельта отличались друг от друга. Кей Сато, исследователь из Токийского университета, проводивший исследование, утверждает, что эти результаты доказывают, что BA.2 не следует считать типом омикрона и что за ним нужно более внимательно следить. «Как вы, возможно, знаете, BA.2 называют "невидимым омикроном", сказал Сато CNN. Это потому, что в тестах ПЦР он не проявляется как сбой мишени S-гена, как это делает омикрон. Поэтому лаборатории должны сделать дополнительный шаг и секвенировать вирус, чтобы найти этот вариант. «Первое, что нужно сделать многим странам, – это разработать метод обнаружения BA.2», считает он. «Похоже, мы можем видеть здесь новую греческую букву», согласилась Дебора Фуллер, вирусолог из Медицинской школы Вашингтонского университета, которая проанализировала исследование, но не участвовала в нем.
По мере распространения подварианта омикрона BA.2 появляются лабораторные исследования, указывающие на признаки серьезности вызываемого им заболевания.
Вирус BA.2 – подвариант варианта коронавируса омикрон – не только распространяется быстрее, чем его дальний родственник, он также может вызывать более тяжелое заболевание и, по-видимому, способен разрушить имеющиеся у нас ключевые виды противоковидной защиты, сообщает CNN.
Проведенные в Японии лабораторные эксперименты показывают, что BA.2 может иметь особенности, которые делают его способным вызывать столь же серьезные заболевания, как и более старые варианты SARS-CoV-29, включая вариант дельта. И, подобно омикрону, он, похоже, в значительной степени избегает иммунитета, сформированного вакцинами. Бустерная прививка восстанавливает защиту, снижая вероятность заболевания после заражения примерно на 74%. BA.2 также устойчив к некоторым видам лечения, включая сотровимаб, моноклональное антитело, которое в настоящее время используется против омикрона. Результаты этих исследований предварительны и опубликованы на сервере препринтов bioRxiv.
«С точки зрения человека это может быть худший вирус, чем BA.1, и он может лучше передаваться и вызывать более тяжелые заболевания», говорит эксперт CNN Дэниел Роудс, заведующий отделением микробиологии в Кливлендской клинике в Огайо. Центры по контролю и профилактике заболеваний США (CDC) внимательно следят за BA.2, заявила директор CDC Рошель Валенски на брифинге для журналистов. «Нет никаких доказательств того, что линия BA.2 является более серьезной, чем линия BA.1. CDC продолжает отслеживать варианты, которые циркулируют как внутри страны, так и за рубежом», добавила она. BA.2 сильно мутирован по сравнению с исходным вирусом, вызывающим Covid, который появился в Ухане в 2019 году. Он также имеет десятки генных изменений, которые отличаются от исходного штамма омикрон, что делает его таким же отличным от самого последнего пандемического вируса, как варианты альфа, бета, гамма и дельта отличались друг от друга. Кей Сато, исследователь из Токийского университета, проводивший исследование, утверждает, что эти результаты доказывают, что BA.2 не следует считать типом омикрона и что за ним нужно более внимательно следить. «Как вы, возможно, знаете, BA.2 называют "невидимым омикроном", сказал Сато CNN. Это потому, что в тестах ПЦР он не проявляется как сбой мишени S-гена, как это делает омикрон. Поэтому лаборатории должны сделать дополнительный шаг и секвенировать вирус, чтобы найти этот вариант. «Первое, что нужно сделать многим странам, – это разработать метод обнаружения BA.2», считает он. «Похоже, мы можем видеть здесь новую греческую букву», согласилась Дебора Фуллер, вирусолог из Медицинской школы Вашингтонского университета, которая проанализировала исследование, но не участвовала в нем.
CNN
As BA.2 subvariant of Omicron rises, lab studies point to signs of severity | CNN
The BA.2 virus – a subvariant of the Omicron coronavirus variant – isn’t just spreading faster than its distant cousin, it may also cause more severe disease and appears capable of thwarting some of the key weapons we have against Covid-19, new research suggests.
#моноклональныеантитела #COVID #омикрон #news
Эффективность препаратов антител против COVID возрастает при введении на ранней стадии заболевания.
Первый в своем роде анализ, проведенный австралийскими учеными, дает четкое представление о том, когда следует назначать лечение COVID-19 моноклональными антителами: чем раньше люди получают этот вид лечения, тем лучше они себя чувствуют, сообщают авторы статьи на сервере препринтов medRxiv. Исследование, основанное на десятках клинических испытаний, также предполагает, что многие методы лечения антителами могут работать в дозах, намного меньших, чем обычно применяемые. Это открытие может иметь далеко идущие последствия, учитывая необычайно высокую стоимость моноклональных антител и их способность предотвращать госпитализацию людей с COVID-19, пишет Nature News. «Мы давали огромные дозы антител, но можно обойтись гораздо, гораздо меньшими дозами»», говорит один из руководителей исследования Майлз Давенпорт, иммунолог из Университета Нового Южного Уэльса в Сиднее, Австралия.
Моноклональные антитела представляют собой синтетические версии природных иммунных молекул, которые могут связываться с патогенами и таким образом предотвращать заражение клеток. Применение моноклональных антител - один из немногих успешных методов лечения COVID-19, хотя сильно мутировавший вариант коронавируса омикрон лишил многих из них способности защищать от тяжелой болезни.
Чтобы изучить влияние времени введения препарата антител и его дозы на эффективность лечения, Давенпорт, Дэвид Хури, исследователь инфекционных заболеваний в Университете Нового Южного Уэльса, и их коллеги проанализировали данные 37 рандомизированных контролируемых испытаний как моноклональных антител, так и антител из крови людей, выздоровевших от COVID-19. Авторы исследования обнаружили, что чем раньше вводились моноклональные антитела после заражения SARS-CoV-2, тем более эффективными они оказывались. Кроме того, они подсчитали, что раннее начало лечения может снизить риск госпитализации примерно на 70%. Давенпорт с соавторами также установили, что дозы препаратов антител в 7-1000 раз меньшие, чем обычно вводимые, могут обеспечивать почти такую же эффективность.
Появление наполненного мутациями варианта Омикрон сделало многие антитела неэффективными. Из шести препаратов, проанализированных исследователями, только два, по прогнозам, сохранят какую-либо эффективность против быстро распространяющегося омикрона подварианта BA.2. Один из них, имдевимаб, по прогнозам, будет на 60% эффективен против госпитализации, вызванной ВА.2, если его вводить в очень высоких дозах. Но авторы прогнозируют, что сотровимаб, который на 63% эффективен в предотвращении госпитализации у людей, инфицированных версией омикрона BA.1, менее чем на 20% эффективен в предотвращении госпитализаций, связанных с BA.2. По словам Джона Мура, исследователь вакцин из Weill Cornell Medicine в Нью-Йорке, открытие того, что препараты на основе антител могут быть эффективными в гораздо меньших дозах, может позволить терапии охватить гораздо больше людей. Но он опасается, что консервативные тенденции врачей и регулирующих органов могут ограничить влияние исследования на реальный мир. «Я не могу себе представить, чтобы врач прочитал этот препринт и сказал: «Давайте уменьшим дозу в три раза и будем лечить трех пациентов вместо одного», добавил Мур.
Эффективность препаратов антител против COVID возрастает при введении на ранней стадии заболевания.
Первый в своем роде анализ, проведенный австралийскими учеными, дает четкое представление о том, когда следует назначать лечение COVID-19 моноклональными антителами: чем раньше люди получают этот вид лечения, тем лучше они себя чувствуют, сообщают авторы статьи на сервере препринтов medRxiv. Исследование, основанное на десятках клинических испытаний, также предполагает, что многие методы лечения антителами могут работать в дозах, намного меньших, чем обычно применяемые. Это открытие может иметь далеко идущие последствия, учитывая необычайно высокую стоимость моноклональных антител и их способность предотвращать госпитализацию людей с COVID-19, пишет Nature News. «Мы давали огромные дозы антител, но можно обойтись гораздо, гораздо меньшими дозами»», говорит один из руководителей исследования Майлз Давенпорт, иммунолог из Университета Нового Южного Уэльса в Сиднее, Австралия.
Моноклональные антитела представляют собой синтетические версии природных иммунных молекул, которые могут связываться с патогенами и таким образом предотвращать заражение клеток. Применение моноклональных антител - один из немногих успешных методов лечения COVID-19, хотя сильно мутировавший вариант коронавируса омикрон лишил многих из них способности защищать от тяжелой болезни.
Чтобы изучить влияние времени введения препарата антител и его дозы на эффективность лечения, Давенпорт, Дэвид Хури, исследователь инфекционных заболеваний в Университете Нового Южного Уэльса, и их коллеги проанализировали данные 37 рандомизированных контролируемых испытаний как моноклональных антител, так и антител из крови людей, выздоровевших от COVID-19. Авторы исследования обнаружили, что чем раньше вводились моноклональные антитела после заражения SARS-CoV-2, тем более эффективными они оказывались. Кроме того, они подсчитали, что раннее начало лечения может снизить риск госпитализации примерно на 70%. Давенпорт с соавторами также установили, что дозы препаратов антител в 7-1000 раз меньшие, чем обычно вводимые, могут обеспечивать почти такую же эффективность.
Появление наполненного мутациями варианта Омикрон сделало многие антитела неэффективными. Из шести препаратов, проанализированных исследователями, только два, по прогнозам, сохранят какую-либо эффективность против быстро распространяющегося омикрона подварианта BA.2. Один из них, имдевимаб, по прогнозам, будет на 60% эффективен против госпитализации, вызванной ВА.2, если его вводить в очень высоких дозах. Но авторы прогнозируют, что сотровимаб, который на 63% эффективен в предотвращении госпитализации у людей, инфицированных версией омикрона BA.1, менее чем на 20% эффективен в предотвращении госпитализаций, связанных с BA.2. По словам Джона Мура, исследователь вакцин из Weill Cornell Medicine в Нью-Йорке, открытие того, что препараты на основе антител могут быть эффективными в гораздо меньших дозах, может позволить терапии охватить гораздо больше людей. Но он опасается, что консервативные тенденции врачей и регулирующих органов могут ограничить влияние исследования на реальный мир. «Я не могу себе представить, чтобы врач прочитал этот препринт и сказал: «Давайте уменьшим дозу в три раза и будем лечить трех пациентов вместо одного», добавил Мур.
medRxiv
Determinants of passive antibody effectiveness in SARS-CoV-2 infection
Neutralising antibodies are an important correlate of protection from SARS-CoV-2 infection. Multiple studies have investigated the effectiveness of passively administered antibodies (either monoclonal antibodies, convalescent plasma or hyperimmune immunoglobulin)…
#омикрон #новыеварианты #COVID19 #news
Новые варианты омикрона эффективно обходят иммунную защиту.
Внимание эпидемиологов приковано к новым субвариантам коронавируса омикрон, которые обозначены как BA.4 и BA.5. Впервые они были выявлены сетью геномного эпиднадзора в Южной Африке (Network for Genomic Surveillance in South Africa, NGS-SA) в январе этого года.
Поначалу новые штаммы не оказали существенного влияния на заболеваемость COVID-19, но за последние недели число зараженных в Южной Африке возросло с 1000 в сутки по данным на 17 апреля до 10 000 7 мая. Третий субвариант под названием BA.2.12.1 в настоящее время распространяется по США, а особенно стремительно по их восточному побережью, сообщает Science.org. Вызовет ли появление новых высоко заразных субвариантов новую глобальную волну COVID-19, в настоящее время неясно. Но, подобно недавним вариантам омикрона, BA.4 и BA.5 проявили незаурядную способность избегать иммунитета, сформированного вакцинами, перенесенной инфекцией или и тем и другим. И это вызывает опасения по поводу возможной будущей пандемии и может создать серьезные проблемы производителям вакцин. При этом в настоящее время совершенно ясно, что вакцинация или перенесенная инфекция все еще защищают от тяжелой формы заболевания. Количество пациентов в отделениях реанимации в ЮАР на том же невысоком уровне, как было в начале пандемии. Однако скорость распространения новых штаммов указывает на поразительную способность вируса находить пути обхода иммунных барьеров, выстроенных за последние два года, и продолжать циркулировать в популяции на высоком уровне.
Все три новых штамма – BA.4, BA.5 и BA.2.12.1 – несут мутации, отмеченные у штамма омикрона BA.2, которые, как BA.1, возникли в Южной Африке в октябре 2021 года. Самые первые исследования южноафриканских ученых позволили предположить, что BA.4 и BA.5 могли избежать иммунитета у пациентов, инфицированных штаммом BA.1, который был в Южной Африке распространен больше, чем BA.2. Это могло произойти отчасти из-за ослабления иммунитета, потому что гребень волны BA.1 пришелся на декабрь. Но как сообщают южноафриканские ученые в статье на сервере препринтов medRxiv, люди вакцинированные и при этом переболевшие защищены лучше других. Во всех трех новых вариантах есть мутации, изменяющие аминокислоту аргинин на лейцин в 452 положении в последовательности спайк-белка вируса, с помощью которого вирус проникает в клетку. Это мутация L452. Она находится в участке белка, который связывается с рецептором на заражаемой клетке (RBD). И этот участок – мишень для защитных антител. Убийственный вариант дельта, который бушевал в 2021 году, тоже имел мутации в положении L452. Эта позиция – «горячая точка», объект особого внимания иммунологов и вирусологов.
Новые варианты омикрона эффективно обходят иммунную защиту.
Внимание эпидемиологов приковано к новым субвариантам коронавируса омикрон, которые обозначены как BA.4 и BA.5. Впервые они были выявлены сетью геномного эпиднадзора в Южной Африке (Network for Genomic Surveillance in South Africa, NGS-SA) в январе этого года.
Поначалу новые штаммы не оказали существенного влияния на заболеваемость COVID-19, но за последние недели число зараженных в Южной Африке возросло с 1000 в сутки по данным на 17 апреля до 10 000 7 мая. Третий субвариант под названием BA.2.12.1 в настоящее время распространяется по США, а особенно стремительно по их восточному побережью, сообщает Science.org. Вызовет ли появление новых высоко заразных субвариантов новую глобальную волну COVID-19, в настоящее время неясно. Но, подобно недавним вариантам омикрона, BA.4 и BA.5 проявили незаурядную способность избегать иммунитета, сформированного вакцинами, перенесенной инфекцией или и тем и другим. И это вызывает опасения по поводу возможной будущей пандемии и может создать серьезные проблемы производителям вакцин. При этом в настоящее время совершенно ясно, что вакцинация или перенесенная инфекция все еще защищают от тяжелой формы заболевания. Количество пациентов в отделениях реанимации в ЮАР на том же невысоком уровне, как было в начале пандемии. Однако скорость распространения новых штаммов указывает на поразительную способность вируса находить пути обхода иммунных барьеров, выстроенных за последние два года, и продолжать циркулировать в популяции на высоком уровне.
Все три новых штамма – BA.4, BA.5 и BA.2.12.1 – несут мутации, отмеченные у штамма омикрона BA.2, которые, как BA.1, возникли в Южной Африке в октябре 2021 года. Самые первые исследования южноафриканских ученых позволили предположить, что BA.4 и BA.5 могли избежать иммунитета у пациентов, инфицированных штаммом BA.1, который был в Южной Африке распространен больше, чем BA.2. Это могло произойти отчасти из-за ослабления иммунитета, потому что гребень волны BA.1 пришелся на декабрь. Но как сообщают южноафриканские ученые в статье на сервере препринтов medRxiv, люди вакцинированные и при этом переболевшие защищены лучше других. Во всех трех новых вариантах есть мутации, изменяющие аминокислоту аргинин на лейцин в 452 положении в последовательности спайк-белка вируса, с помощью которого вирус проникает в клетку. Это мутация L452. Она находится в участке белка, который связывается с рецептором на заражаемой клетке (RBD). И этот участок – мишень для защитных антител. Убийственный вариант дельта, который бушевал в 2021 году, тоже имел мутации в положении L452. Эта позиция – «горячая точка», объект особого внимания иммунологов и вирусологов.
Science
New versions of Omicron are masters of immune evasion
Vaccines and prior infection still prevent severe disease from new SARS-CoV-2 strains
#постковидныйсиндром #SARSCoV2 #дельта #омикрон #news
Риск развития постковидного синдрома после заражения омикроном почти вдвое ниже, чем после дельты.
Данные, полученные от почти 100 000 человек в Великобритании, показывают, что случаи COVID-19, вызванные коронавирусным вариантом дельта, в 2,4 раза чаще приводят к постковидному синдрому, или лонг-ковиду, чем случаи, вызванные вариантом омикрон, сообщает The Scientist. Исследование, опубликованное в The Lancet, представляет собой первое крупномасштабное исследование, в котором изучается риск развития лонг-ковида от инфицирования омикроном. Данные собраны с использованием приложения COVID Symptom Study, которым управляют исследователи из Королевского колледжа Лондона и которое позволяет людям сообщать о симптомах и результатах тестов. Авторы исследования получили данные от 56 003 человек с положительным результатом на COVID-19 во время волны омикрона, определяемой исследователями как период с 20 декабря 2021 по 9 марта 2022, и 41 361 человека с положительным результатом теста на COVID-19 во время волны дельта, отсчитываемой с 27 ноября 2021 до 1 июня 2022. Считалось, что у участников исследования лонг-ковид, если они сообщали о таких симптомах как усталость, затуманенное сознание или проблемы с сердцем спустя более чем через четыре недели после начала острого COVID-19. В исследование не включены данные о непривитых людях или детях. Но среди привитых взрослых пользователей приложения стойкие симптомы COVID имели место в 4,5 процента случаев заражения омикроном и в 10,8 процента случаев дельты. Разница в риске развития постковидного синдрома между двумя вариантами была наибольшей среди людей, которые были вакцинированы по крайней мере за шесть месяцев до заражения, при этом риск лонг-ковида после заражения омикроном был в четыре раза ниже, чем после дельты.
Полученные результаты довольно хорошо согласуются с данными из бюллетеня Управления национальной статистики Великобритании, опубликованного 6 мая, хотя в этом небольшом исследовании риск лонг-ковида для обоих вариантов у людей с иммунизацией был сопоставим. Как отмечает The Scientist, хотя снижение вероятности затяжного COVID всегда является хорошей новостью, Акико Ивасаки, иммунобиолог из Йельского университета, не участвовавшая в новом исследовании, считает, что 5 процентов случаев, приводящих к длительному COVID, все еще «страшны». Как объясняет изданию соавтор исследования Клэр Стивс из Королевского колледжа Лондона, обратила внимание на быстрое распространение варианта омикрон среди населения, «и поэтому было затронуто гораздо большее количество людей. Так что, к сожалению, общее абсолютное число людей, которые могут заболеть COVID-19, будет расти», заключила она.
Риск развития постковидного синдрома после заражения омикроном почти вдвое ниже, чем после дельты.
Данные, полученные от почти 100 000 человек в Великобритании, показывают, что случаи COVID-19, вызванные коронавирусным вариантом дельта, в 2,4 раза чаще приводят к постковидному синдрому, или лонг-ковиду, чем случаи, вызванные вариантом омикрон, сообщает The Scientist. Исследование, опубликованное в The Lancet, представляет собой первое крупномасштабное исследование, в котором изучается риск развития лонг-ковида от инфицирования омикроном. Данные собраны с использованием приложения COVID Symptom Study, которым управляют исследователи из Королевского колледжа Лондона и которое позволяет людям сообщать о симптомах и результатах тестов. Авторы исследования получили данные от 56 003 человек с положительным результатом на COVID-19 во время волны омикрона, определяемой исследователями как период с 20 декабря 2021 по 9 марта 2022, и 41 361 человека с положительным результатом теста на COVID-19 во время волны дельта, отсчитываемой с 27 ноября 2021 до 1 июня 2022. Считалось, что у участников исследования лонг-ковид, если они сообщали о таких симптомах как усталость, затуманенное сознание или проблемы с сердцем спустя более чем через четыре недели после начала острого COVID-19. В исследование не включены данные о непривитых людях или детях. Но среди привитых взрослых пользователей приложения стойкие симптомы COVID имели место в 4,5 процента случаев заражения омикроном и в 10,8 процента случаев дельты. Разница в риске развития постковидного синдрома между двумя вариантами была наибольшей среди людей, которые были вакцинированы по крайней мере за шесть месяцев до заражения, при этом риск лонг-ковида после заражения омикроном был в четыре раза ниже, чем после дельты.
Полученные результаты довольно хорошо согласуются с данными из бюллетеня Управления национальной статистики Великобритании, опубликованного 6 мая, хотя в этом небольшом исследовании риск лонг-ковида для обоих вариантов у людей с иммунизацией был сопоставим. Как отмечает The Scientist, хотя снижение вероятности затяжного COVID всегда является хорошей новостью, Акико Ивасаки, иммунобиолог из Йельского университета, не участвовавшая в новом исследовании, считает, что 5 процентов случаев, приводящих к длительному COVID, все еще «страшны». Как объясняет изданию соавтор исследования Клэр Стивс из Королевского колледжа Лондона, обратила внимание на быстрое распространение варианта омикрон среди населения, «и поэтому было затронуто гораздо большее количество людей. Так что, к сожалению, общее абсолютное число людей, которые могут заболеть COVID-19, будет расти», заключила она.
The Scientist Magazine®
Omicron Half as Likely as Delta to Lead to Long COVID: Study
People who were vaccinated at least six months prior to infection had the lowest risk of lasting symptoms in a UK study.
#COVID19 #омикрон #новыештаммы #news
Новые штаммы омикрона предвещают новые большие волны COVID-19
На исходе третьего года пандемии коронавирус SARS-CoV-2 столкнулся с масштабной задачей поиска новых путей обхода иммунитета, выработанного людьми в результате вакцинации и неоднократно перенесенных инфекций. В последние недели внимание ученых привлекли несколько новых и успешно избегающих иммунитета штаммов вируса, и один или больше таких субвариантов, вероятно, вызовут большой подъем заболеваемости COVID-19 этой осенью и зимой, пишет Science.org.
«Мы можем сказать определенно, что что-то надвигается. Возможно, надвигается множество вещей», говорит Корнеилус Рёмер (Cornelius Roemer), исследователь эволюции вирусов в Базельском университете (University of Basel). Приведет ли это ко многим госпитализациям и смертям – большой вопрос, добавляет он. «Это не удивительно, что мы видим изменения, которые помогают вирусу преодолеть иммунные ответы», отмечает молекулярный эпидемиолог Эмма Ходкрофт из Бернского университета (University of Bern), поясняя, что SARS-CoV-2 сталкивается «с теми же самыми вызовами, что и вирусы ежегодно возвращающихся ОРВИ и гриппа». Все штаммы, вызвавшие недавние волны заболеваемости, были субвариантами омикрона, который распространялся по земному шару в этом году. Некоторые произошли от BA.2, штамма, который сменил первоначальный штамм омикрона BA.1, но после сам был вытеснен во многих местах BA.5, доминирующим все последние месяцы. Один из них, BA.2.75.2, быстро распространяется в Индии, Сингапуре и кое-где в Европе. Другие новые невидимые для нашей иммунной системы штаммы эволюционировали от BA.5, в их числе – BQ.1.1, замеченный во многих странах мира.
Несмотря на разное происхождение, несколько новых штаммов приобрели сходную комбинацию мутаций, которая помогает им обойти иммунитет, и это яркий пример конвергентной эволюции, отмечает Science.org. Конвергентная эволюция – процесс, при котором между организмами разных систематических групп, находящихся в сходных условиях, возникает сходство. Все новые штаммы омикрона приобрели в нескольких ключевых позициях своего генома изменения, которые влияют на их способность связываться с нейтрализующими антителами. Для того чтобы оценить, насколько эффективно субварианты могут избегать иммунности, ученые воспроизводят копии белка шипа, или спайк-белка, вируса и воздействуют на них моноклональными антителами или сывороткой с антителами, полученной от людей, что позволяет измерять способность антител блокировать попадание вируса в клетки. Таким образом исследователи в Китае и Швеции обнаружили, в частности, что спайк-белок субварианта BA.2.75.2 успешно избегает связывания почти со всеми моноклональными антителами, используемыми для лечения COVID-19, и это делает такое лечение в случае заражения этим новым штаммом бесполезным.
Новые штаммы омикрона предвещают новые большие волны COVID-19
На исходе третьего года пандемии коронавирус SARS-CoV-2 столкнулся с масштабной задачей поиска новых путей обхода иммунитета, выработанного людьми в результате вакцинации и неоднократно перенесенных инфекций. В последние недели внимание ученых привлекли несколько новых и успешно избегающих иммунитета штаммов вируса, и один или больше таких субвариантов, вероятно, вызовут большой подъем заболеваемости COVID-19 этой осенью и зимой, пишет Science.org.
«Мы можем сказать определенно, что что-то надвигается. Возможно, надвигается множество вещей», говорит Корнеилус Рёмер (Cornelius Roemer), исследователь эволюции вирусов в Базельском университете (University of Basel). Приведет ли это ко многим госпитализациям и смертям – большой вопрос, добавляет он. «Это не удивительно, что мы видим изменения, которые помогают вирусу преодолеть иммунные ответы», отмечает молекулярный эпидемиолог Эмма Ходкрофт из Бернского университета (University of Bern), поясняя, что SARS-CoV-2 сталкивается «с теми же самыми вызовами, что и вирусы ежегодно возвращающихся ОРВИ и гриппа». Все штаммы, вызвавшие недавние волны заболеваемости, были субвариантами омикрона, который распространялся по земному шару в этом году. Некоторые произошли от BA.2, штамма, который сменил первоначальный штамм омикрона BA.1, но после сам был вытеснен во многих местах BA.5, доминирующим все последние месяцы. Один из них, BA.2.75.2, быстро распространяется в Индии, Сингапуре и кое-где в Европе. Другие новые невидимые для нашей иммунной системы штаммы эволюционировали от BA.5, в их числе – BQ.1.1, замеченный во многих странах мира.
Несмотря на разное происхождение, несколько новых штаммов приобрели сходную комбинацию мутаций, которая помогает им обойти иммунитет, и это яркий пример конвергентной эволюции, отмечает Science.org. Конвергентная эволюция – процесс, при котором между организмами разных систематических групп, находящихся в сходных условиях, возникает сходство. Все новые штаммы омикрона приобрели в нескольких ключевых позициях своего генома изменения, которые влияют на их способность связываться с нейтрализующими антителами. Для того чтобы оценить, насколько эффективно субварианты могут избегать иммунности, ученые воспроизводят копии белка шипа, или спайк-белка, вируса и воздействуют на них моноклональными антителами или сывороткой с антителами, полученной от людей, что позволяет измерять способность антител блокировать попадание вируса в клетки. Таким образом исследователи в Китае и Швеции обнаружили, в частности, что спайк-белок субварианта BA.2.75.2 успешно избегает связывания почти со всеми моноклональными антителами, используемыми для лечения COVID-19, и это делает такое лечение в случае заражения этим новым штаммом бесполезным.
Science
Big COVID-19 waves may be coming, new Omicron strains suggest
Emerging subvariants have hit on a combination of mutations that makes them more immune evasive than ever
#омикрон #шиповыйбелок #химерныйвирус #news
Исследование по созданию химерного вируса SARS-CoV-2 привлекло внимание правительственных экспертов
Проект Бостонского университета по созданию и изучению химерной версии SARS-CoV-2, не был полностью согласован с Национальным институтом аллергии и инфекционных заболеваний (NIAID), хотя агентство частично профинансировало работу, пишет The Scientist.
Само исследование, опубликованное на прошлой неделе на сервере препринтов bioRxiv, заключалось в выяснении того, насколько вредоносность того или иного варианта вируса зависит от структуры его шиповидного белка. Для этого ученые из исследовательской лаборатории биобезопасности 4 Бостонского университета прикрепили шиповидный белок варианта омикрон, более устойчивого к иммунитету, к «основе» исходного вируса SARS-CoV-2, циркулирующего с самого начала пандемии.
Заражение химерным вирусом вызывало у мышей тяжелое заболевание с уровнем смертности 80%. Эти результаты вызвали широкий резонанс в прессе, газетные заголовки гласили, что ученые сделали вирус более опасным. Университет выступил с заявлением, в котором отклоняет эти утверждения как «ложные и неточные». Как сообщает издание STAT, хотя нет никаких доказательств того, что исследование было небезопасным или проводилось ненадлежащим образом, официальные лица NIAID были удивлены, узнав о точном характере проекта через СМИ, а не от самих исследователей.
«Что мы хотели бы сделать, так это заранее поговорить о том, что именно они хотели сделать», говорит Эмили Эрбельдинг, директор отдела микробиологии и инфекционных заболеваний NIAID. Она добавляет, что в заявке на получение гранта от команды Бостонского университета отсутствовали конкретные подробности о проекте и что агентство могло бы созвать комитет для оценки рисков и выгод, если бы знало, что работа будет включать разработку химерного вируса.
Как показало исследование Бостонского университета, повышенная способность подвариантов уклоняться от иммунитета — ключевой фактор быстрого распространения омикрона по Европе, США и многим другим регионам прошлой зимой.
Выводы ученых, которые еще не прошли рецензирование, позволяют предположить, что это действительно так. Они также предоставляют доказательства, опровергающие другую гипотезу, а именно, что изменения шипового белка также были ответственны за снижение тяжести инфекций омикроном. Хотя химерный вирус при введении мышам не был таким смертельным, как исходный штамм, он также не был таким мягким, как немодифицированный омикрон. По словам Эрбельдинга, именно это последнее открытие было искажено в новостях.
«Это исследование отражает и подкрепляет результаты других аналогичных исследований, проведенных другими организациями, включая FDA», говорится в заявлении авторов. «В соответствии с исследованиями, опубликованными другими, эта работа показывает, что патогенность омикрона определяется не шиповым белком, а другими вирусными белками», подчеркивают они.
Исследование по созданию химерного вируса SARS-CoV-2 привлекло внимание правительственных экспертов
Проект Бостонского университета по созданию и изучению химерной версии SARS-CoV-2, не был полностью согласован с Национальным институтом аллергии и инфекционных заболеваний (NIAID), хотя агентство частично профинансировало работу, пишет The Scientist.
Само исследование, опубликованное на прошлой неделе на сервере препринтов bioRxiv, заключалось в выяснении того, насколько вредоносность того или иного варианта вируса зависит от структуры его шиповидного белка. Для этого ученые из исследовательской лаборатории биобезопасности 4 Бостонского университета прикрепили шиповидный белок варианта омикрон, более устойчивого к иммунитету, к «основе» исходного вируса SARS-CoV-2, циркулирующего с самого начала пандемии.
Заражение химерным вирусом вызывало у мышей тяжелое заболевание с уровнем смертности 80%. Эти результаты вызвали широкий резонанс в прессе, газетные заголовки гласили, что ученые сделали вирус более опасным. Университет выступил с заявлением, в котором отклоняет эти утверждения как «ложные и неточные». Как сообщает издание STAT, хотя нет никаких доказательств того, что исследование было небезопасным или проводилось ненадлежащим образом, официальные лица NIAID были удивлены, узнав о точном характере проекта через СМИ, а не от самих исследователей.
«Что мы хотели бы сделать, так это заранее поговорить о том, что именно они хотели сделать», говорит Эмили Эрбельдинг, директор отдела микробиологии и инфекционных заболеваний NIAID. Она добавляет, что в заявке на получение гранта от команды Бостонского университета отсутствовали конкретные подробности о проекте и что агентство могло бы созвать комитет для оценки рисков и выгод, если бы знало, что работа будет включать разработку химерного вируса.
Как показало исследование Бостонского университета, повышенная способность подвариантов уклоняться от иммунитета — ключевой фактор быстрого распространения омикрона по Европе, США и многим другим регионам прошлой зимой.
Выводы ученых, которые еще не прошли рецензирование, позволяют предположить, что это действительно так. Они также предоставляют доказательства, опровергающие другую гипотезу, а именно, что изменения шипового белка также были ответственны за снижение тяжести инфекций омикроном. Хотя химерный вирус при введении мышам не был таким смертельным, как исходный штамм, он также не был таким мягким, как немодифицированный омикрон. По словам Эрбельдинга, именно это последнее открытие было искажено в новостях.
«Это исследование отражает и подкрепляет результаты других аналогичных исследований, проведенных другими организациями, включая FDA», говорится в заявлении авторов. «В соответствии с исследованиями, опубликованными другими, эта работа показывает, что патогенность омикрона определяется не шиповым белком, а другими вирусными белками», подчеркивают они.
The Scientist Magazine®
US Agency to Look into Project on Modified Coronavirus
The National Institute of Allergy and Infectious Diseases was not aware that the work involved a chimeric strain of SARS-CoV-2, STAT reports.