#SARSCOV2 #COVID19 #селинексор #news
Лекарство от рака уменьшает токсичность белка, вырабатываемого ковидным вирусом.
Исследователи из Мэрилендского университета (University of Maryland) выявили наиболее токсичные белки, производимые вирусом SARS-COV-2, а затем использовали одобренные Управлением по контролю за пищевыми продуктами и лекарственными средствами (FDA) противораковые препараты для снижения вредного воздействия вирусных белков. В экспериментах на плодовых мушках и культурах человеческих клеток они открыли клеточный процесс, который использует в своих целях вирус, а это указывает на новые потенциально применимые лекарства для лечения тяжелых форм COVID-19. Результаты этих исследований опубликованы в двух статьях, появившихся одновременно в журнале Cell & Bioscience.
«Наша работа предполагает существование пути предупреждения поражений тканей и существенного вреда организму, причиняемого SARS-COV-2», цитирует руководителя исследований Чжэ «Цион» Ханя (Zhe «Zion» Han) MedicalXpress. Ученый отметил при этом, что самое эффективное на сегодняшний день лекарство от COVID-19, ремдесивир, только предотвращает размножение вируса, но не защищает уже инфицированные клетки от вреда, вызываемого вирусными белками. SARS-COV-2 вирус проникает в клетки и использует их для производства белков, контролируемых всеми своими 27 генами. Хань с коллегами вносили каждый из 27 генов коронавируса в культивируемые клетки человека, где изучали токсичность синтезируемых вирусных белков. Также они получили 12 линий плодовых мушек, в которых производились белки коронавируса, чтобы посмотреть на токсические эффекты, ожидаемые исходя из структуры и предсказанных функций этих белков.
Авторы установили, что наиболее токсичным, убившим половину человеческих клеток в культуре, оказался вирусный белок, который называется Orf6. Два других белка (Nsp6 and Orf7a) также были токсичными и погубили около 30-40 процентов популяции человеческих клеток. Плодовые мушки, производящие один из этих трех токсичных белков в своем организме, редко доживали до взрослого состояния. В легких таких плодовых мушек образовывалось меньше ветвей, а в клетках их мышц было меньше митохондрий, структур, ответственных за выработку энергии.
В других экспериментах ученые обнаружили, что самый токсичный из вирусных белков, Orf6, прикрепляется к белкам, способствующим движению различных молекул из клеточного ядра наружу. Далее им удалось установить, что один из этих белков блокируется онкологическим препаратом селинексор. После добавления селинексора к культуре человеческих клеток, инфицированных вирусом, выживаемость последних повысилась на 12 процентов, а плодовых мушек – производителей вирусных белков – на 15 процентов.
Лекарство от рака уменьшает токсичность белка, вырабатываемого ковидным вирусом.
Исследователи из Мэрилендского университета (University of Maryland) выявили наиболее токсичные белки, производимые вирусом SARS-COV-2, а затем использовали одобренные Управлением по контролю за пищевыми продуктами и лекарственными средствами (FDA) противораковые препараты для снижения вредного воздействия вирусных белков. В экспериментах на плодовых мушках и культурах человеческих клеток они открыли клеточный процесс, который использует в своих целях вирус, а это указывает на новые потенциально применимые лекарства для лечения тяжелых форм COVID-19. Результаты этих исследований опубликованы в двух статьях, появившихся одновременно в журнале Cell & Bioscience.
«Наша работа предполагает существование пути предупреждения поражений тканей и существенного вреда организму, причиняемого SARS-COV-2», цитирует руководителя исследований Чжэ «Цион» Ханя (Zhe «Zion» Han) MedicalXpress. Ученый отметил при этом, что самое эффективное на сегодняшний день лекарство от COVID-19, ремдесивир, только предотвращает размножение вируса, но не защищает уже инфицированные клетки от вреда, вызываемого вирусными белками. SARS-COV-2 вирус проникает в клетки и использует их для производства белков, контролируемых всеми своими 27 генами. Хань с коллегами вносили каждый из 27 генов коронавируса в культивируемые клетки человека, где изучали токсичность синтезируемых вирусных белков. Также они получили 12 линий плодовых мушек, в которых производились белки коронавируса, чтобы посмотреть на токсические эффекты, ожидаемые исходя из структуры и предсказанных функций этих белков.
Авторы установили, что наиболее токсичным, убившим половину человеческих клеток в культуре, оказался вирусный белок, который называется Orf6. Два других белка (Nsp6 and Orf7a) также были токсичными и погубили около 30-40 процентов популяции человеческих клеток. Плодовые мушки, производящие один из этих трех токсичных белков в своем организме, редко доживали до взрослого состояния. В легких таких плодовых мушек образовывалось меньше ветвей, а в клетках их мышц было меньше митохондрий, структур, ответственных за выработку энергии.
В других экспериментах ученые обнаружили, что самый токсичный из вирусных белков, Orf6, прикрепляется к белкам, способствующим движению различных молекул из клеточного ядра наружу. Далее им удалось установить, что один из этих белков блокируется онкологическим препаратом селинексор. После добавления селинексора к культуре человеческих клеток, инфицированных вирусом, выживаемость последних повысилась на 12 процентов, а плодовых мушек – производителей вирусных белков – на 15 процентов.
BioMed Central
Characterization of SARS-CoV-2 proteins reveals Orf6 pathogenicity, subcellular localization, host interactions and attenuation…
Background SARS-CoV-2 causes COVID-19 which has a widely diverse disease profile. The mechanisms underlying its pathogenicity remain unclear. We set out to identify the SARS-CoV-2 pathogenic proteins that through host interactions cause the cellular damages…
#SARSCoV2 #происхождениекоронавируса #news
Издание Science News опубликовало ответы на три главных вопроса о происхождении нового коронавируса.
По всему миру поднялась новая волна дискуссий относительно происхождения вируса, вызвавшего пандемию COVID-19. Общество ждет однозначного ответа на вопрос об источнике коронавируса: природа или лаборатория? Третьего не дано.
Президент США Байден в конце мая обратился к разведывательным службам с призывом «удвоить усилия по сбору и анализу информации, которая может приблизить нас к окончательному выводу». Он потребовал отчета в течение 90 дней. К открытому и прозрачному расследованию и серьезному отношению ко всем гипотезам призывают и ведущие вирусологи мира, авторы письма, опубликованного в Science 14 мая.
Идея утечки вируса из лаборатории возродилась после публикации в одном из майских выпусков Wall Street Journal истории о трех исследователях из Уханьского института вирусологии, которые заболели с ковидными симптомами в ноябре 2019 года. Хотя до сих пор неизвестно, какое именно респираторное заболевание было у этих людей.
Ранее, в конце апреля, Всемирная организация здравоохранения обнародовала предварительное заключение своей комиссии, которое склоняется к версии попадания вируса к человеку от животных. Издание Science News рассматривает три главных вопроса, касающихся происхождения пандемического вируса.
Первый вопрос: почему гипотеза лабораторной утечки так живуча? Основная причина этого в неизвестности. Пробелы в знаниях заполняются мириадами гипотез, пишет Science News. Анализ генома вируса дает основания ученым быть уверенными в том, что он не продукт генной инженерии. Однако один из вероятных сценариев предполагает, что кто-то в лаборатории мог случайно заразиться этим коронавирусом в ходе исследований и стать источником распространения среди людей. Подобные случайности происходили ранее, но были локализованы в пределах лаборатории. И коронавирусы переходили от животных к людям за последние два десятилетия многократно.
Второй вопрос: какие доказательства укажут на точное происхождение вируса? На обнаружение вируса почти идентичного вирусу SARS-CoV-2 у диких животных уйдут годы, и такой вирус может никогда и не найтись. Для поиска доказательств лабораторного происхождения необходимо, чтобы исследовательские лаборатории сделали свои записи полностью открытыми.
Третий вопрос: почему нас вообще волнует происхождение вируса? Потому что, узнав, откуда он взялся, можно будет принять меры, предупреждающие возникновение новых вспышек подобных заболеваний. Но даже если вирус лабораторный, изначальное его происхождение животное, в лаборатории его только исследовали, подчеркивает Science News.
Издание Science News опубликовало ответы на три главных вопроса о происхождении нового коронавируса.
По всему миру поднялась новая волна дискуссий относительно происхождения вируса, вызвавшего пандемию COVID-19. Общество ждет однозначного ответа на вопрос об источнике коронавируса: природа или лаборатория? Третьего не дано.
Президент США Байден в конце мая обратился к разведывательным службам с призывом «удвоить усилия по сбору и анализу информации, которая может приблизить нас к окончательному выводу». Он потребовал отчета в течение 90 дней. К открытому и прозрачному расследованию и серьезному отношению ко всем гипотезам призывают и ведущие вирусологи мира, авторы письма, опубликованного в Science 14 мая.
Идея утечки вируса из лаборатории возродилась после публикации в одном из майских выпусков Wall Street Journal истории о трех исследователях из Уханьского института вирусологии, которые заболели с ковидными симптомами в ноябре 2019 года. Хотя до сих пор неизвестно, какое именно респираторное заболевание было у этих людей.
Ранее, в конце апреля, Всемирная организация здравоохранения обнародовала предварительное заключение своей комиссии, которое склоняется к версии попадания вируса к человеку от животных. Издание Science News рассматривает три главных вопроса, касающихся происхождения пандемического вируса.
Первый вопрос: почему гипотеза лабораторной утечки так живуча? Основная причина этого в неизвестности. Пробелы в знаниях заполняются мириадами гипотез, пишет Science News. Анализ генома вируса дает основания ученым быть уверенными в том, что он не продукт генной инженерии. Однако один из вероятных сценариев предполагает, что кто-то в лаборатории мог случайно заразиться этим коронавирусом в ходе исследований и стать источником распространения среди людей. Подобные случайности происходили ранее, но были локализованы в пределах лаборатории. И коронавирусы переходили от животных к людям за последние два десятилетия многократно.
Второй вопрос: какие доказательства укажут на точное происхождение вируса? На обнаружение вируса почти идентичного вирусу SARS-CoV-2 у диких животных уйдут годы, и такой вирус может никогда и не найтись. Для поиска доказательств лабораторного происхождения необходимо, чтобы исследовательские лаборатории сделали свои записи полностью открытыми.
Третий вопрос: почему нас вообще волнует происхождение вируса? Потому что, узнав, откуда он взялся, можно будет принять меры, предупреждающие возникновение новых вспышек подобных заболеваний. Но даже если вирус лабораторный, изначальное его происхождение животное, в лаборатории его только исследовали, подчеркивает Science News.
Science News
Here are answers to 3 persistent questions about the coronavirus’s origins
Calls to double down on investigations into where SARS-CoV-2 came from — nature or a lab accident — are rising as answers remain scarce.
#SARSCoV2 #врожденныйиммунитет #diABZI #news
Новый лекарственный препарат эффективно предотвращает тяжелую форму COVID-19 у мышей, зараженных SARS-CoV-2.
Препарат diABZI, активирующий врожденный иммунный ответ организма, оказался высоко эффективным в предупреждении развития тяжелого течения COVID-19 у мышей, которых инфицировали SARS-CoV-2, сообщает издание News-medical.net.
Исследование провели ученые медицинского факультета Перельмана Пенсильванского университета, результаты опубликованы в майском номере журнала Science Immunology и свидетельствуют также о способности diABZI нейтрализовать и другие респираторные коронавирусы.
«Не так много лекарств, которые радикально блокируют инфекцию SARS-CoV-2. Эта статья – первая, в которой показано, что терапевтическая активация раннего иммунного ответа единственной дозой препарата может быть многообещающей стратегией для контролирования вируса, включая вызывающий обеспокоенность во всем мире южноафриканский вариант B.1.351. Разработка эффективных противовирусных средств остро необходима, чтобы контролировать инфекцию SARS-CoV-2 и вызываемое ею заболевание, особенно по мере появления все более опасных вариантов вируса», – говорит ведущий автор исследования Сара Черри, профессор Пенсильванского университета.
Вирус SARS-CoV-2 изначально нацелен на эпителиальные клетки дыхательных путей. Первой линией защиты против инфекции служит система врожденного иммунитета дыхательных путей, распознающая вирусные патогены по их молекулярным особенностям. Изучая это явление, Черри с коллегами рассматривали под микроскопом инфицированные SARS-CoV-2 линии клеток легких человека и обнаружили, что вирус способен прятаться, задерживая таким образом его раннее распознавание иммунной системой и, следовательно, иммунный ответ. Ученые предположили, что можно найти препарат или малые молекулы с лекарственными свойствами, которые запустят иммунный ответ в клетках дыхательных путей раньше и предупредят тяжелое поражение SARS-CoV-2.
Для выявления антивирусных агонистов, которые будут блокировать SARS-CoV-2, авторы провели высокопроизводительный скрининг 75 препаратов, которые воздействуют на сенсорные структуры в легких. Проанализировав эффект, оказываемый ими на вирусную инфекцию, они идентифицировали девять кандидатных соединений, включая два циклических динуклеотида (CDNs), в значительной степени супрессирующих инфекцию путем активирования стимулятора интерфероновых генов, который называется STING (the stimulation of interferon genes).
Поскольку CDNs не обладают сильным действием, Черри с соавторами решили также протестировать недавно созданную молекулу – не-нуклеотидного агониста STING, который называется diABZI. Этот препарат не одобрен FDA, но в настоящее время проходит испытания для лечения некоторых видов рака. Ученые установили, что diABZI является мощным ингибитором инфекции SARS-CoV-2 разных штаммов, включая угрожающий вариант B.1.351. Это соединение стимулирует сигнальные пути выработки интерферона.
Эффективность diABZI оценивали на трансгенных мышах, зараженных SARS-CoV-2. Препарат попадал в легкие через слизистую оболочку носа. Мыши, получившие этот препарат, меньше теряли в весе, чем контрольные инфицированные мыши, у них была значительно меньшая вирусная нагрузка в легких и носовой полости и повышенная продукция цитокинов. Все это свидетельствовало о том, что diABZI стимулирует выработку интерферона для защитного иммунитета.
Новый лекарственный препарат эффективно предотвращает тяжелую форму COVID-19 у мышей, зараженных SARS-CoV-2.
Препарат diABZI, активирующий врожденный иммунный ответ организма, оказался высоко эффективным в предупреждении развития тяжелого течения COVID-19 у мышей, которых инфицировали SARS-CoV-2, сообщает издание News-medical.net.
Исследование провели ученые медицинского факультета Перельмана Пенсильванского университета, результаты опубликованы в майском номере журнала Science Immunology и свидетельствуют также о способности diABZI нейтрализовать и другие респираторные коронавирусы.
«Не так много лекарств, которые радикально блокируют инфекцию SARS-CoV-2. Эта статья – первая, в которой показано, что терапевтическая активация раннего иммунного ответа единственной дозой препарата может быть многообещающей стратегией для контролирования вируса, включая вызывающий обеспокоенность во всем мире южноафриканский вариант B.1.351. Разработка эффективных противовирусных средств остро необходима, чтобы контролировать инфекцию SARS-CoV-2 и вызываемое ею заболевание, особенно по мере появления все более опасных вариантов вируса», – говорит ведущий автор исследования Сара Черри, профессор Пенсильванского университета.
Вирус SARS-CoV-2 изначально нацелен на эпителиальные клетки дыхательных путей. Первой линией защиты против инфекции служит система врожденного иммунитета дыхательных путей, распознающая вирусные патогены по их молекулярным особенностям. Изучая это явление, Черри с коллегами рассматривали под микроскопом инфицированные SARS-CoV-2 линии клеток легких человека и обнаружили, что вирус способен прятаться, задерживая таким образом его раннее распознавание иммунной системой и, следовательно, иммунный ответ. Ученые предположили, что можно найти препарат или малые молекулы с лекарственными свойствами, которые запустят иммунный ответ в клетках дыхательных путей раньше и предупредят тяжелое поражение SARS-CoV-2.
Для выявления антивирусных агонистов, которые будут блокировать SARS-CoV-2, авторы провели высокопроизводительный скрининг 75 препаратов, которые воздействуют на сенсорные структуры в легких. Проанализировав эффект, оказываемый ими на вирусную инфекцию, они идентифицировали девять кандидатных соединений, включая два циклических динуклеотида (CDNs), в значительной степени супрессирующих инфекцию путем активирования стимулятора интерфероновых генов, который называется STING (the stimulation of interferon genes).
Поскольку CDNs не обладают сильным действием, Черри с соавторами решили также протестировать недавно созданную молекулу – не-нуклеотидного агониста STING, который называется diABZI. Этот препарат не одобрен FDA, но в настоящее время проходит испытания для лечения некоторых видов рака. Ученые установили, что diABZI является мощным ингибитором инфекции SARS-CoV-2 разных штаммов, включая угрожающий вариант B.1.351. Это соединение стимулирует сигнальные пути выработки интерферона.
Эффективность diABZI оценивали на трансгенных мышах, зараженных SARS-CoV-2. Препарат попадал в легкие через слизистую оболочку носа. Мыши, получившие этот препарат, меньше теряли в весе, чем контрольные инфицированные мыши, у них была значительно меньшая вирусная нагрузка в легких и носовой полости и повышенная продукция цитокинов. Все это свидетельствовало о том, что diABZI стимулирует выработку интерферона для защитного иммунитета.
News-Medical.net
New drug effectively prevents severe COVID-19 in mice infected with SARS-CoV-2
The drug diABZI which activates the body's innate immune response -- was highly effective in preventing severe COVID-19 in mice that were infected with SARS-CoV-2, according to scientists in the Perelman School of Medicine at the University of Pennsylvania
#SARSCoV2 #IgG #IgM #назальныйспрей #news
Назальный спрей с антителами может защитить от коронавируса и даже вылечить ковид.
Пульверизатор с гибридными антителами существенно снижал количество частиц вируса SARS-CoV-2 в легких инфицированных мышей, сообщает Nature News. С самого начала пандемии ученые задумались о создании антител для лечения COVID-19. Сегодня некоторые из таких антител проходят последние стадии клинических испытаний, а несколько одобрены для использования в чрезвычайных ситуациях.
Среди врачей, однако, лечение антителами не очень популярно, сказал в комментарии Nature News Чжицянь Ань (Zhiqiang An), конструктор антител из Центра медицинских наук при Техасском университете (University of Texas Health Science Center) в Хьюстоне. Отчасти это связано с тем, что доступные для использования антитела вводятся внутривенно, а не непосредственно в дыхательные пути, где в основном находится вирус, и при такой доставке для достижения эффекта требуются высокие дозы антительных препаратов.
Ань с коллегами задались целью сконструировать антитела, которые можно было бы доставлять непосредственно в носовую полость. Они просканировали библиотеку антител от здоровых людей и сосредоточили внимание на тех антителах, которые были способны распознавать компоненты SARS-CoV-2, используемые вирусом для прикрепления к клеткам и проникновения в них. Среди перспективных кандидатов были антитела IgG, которые после инфекции появляются относительно поздно, но довольно точно подогнаны под вторгающийся патоген. Фрагменты таких антител ученые сшили с молекулой другого типа, антителами IgM, которые действуют как агенты быстрого реагирования на широкий спектр инфекций.
Сконструированные антитела IgM обладали более сильным нейтрализующим эффектом против более 20 вариантов SARS-CoV-2, чем одни только IgG. После впрыскивания в носы мышей либо за шесть часов до инфицирования, либо через шесть часов после, сконструированные IgM быстро снижали количество вируса в легких грызунов спустя два дня после инфицирования, сообщают исследователи в журнале Nature.
Эта работа – «большое достижение в биоинженерии», считает Гай Горохов (Guy Gorochov), иммунолог из Парижского университета Сорбонна (Sorbonne University), но пока неизвестно как долго эти антитела продержатся в организме человека. Чжицянь Ань представляет себе сконструированные антитела как своего рода химическую маску для тех, кто сталкивается с SARS-CoV-2, а также как дополнительную защиту для не полностью вакцинированных людей. Поскольку молекулы IgM относительно стабильны, они подходят для создания из них назального спрея, который можно купить в аптеке и держать при себе на всякий случай, добавляет Ань.
Назальный спрей с антителами может защитить от коронавируса и даже вылечить ковид.
Пульверизатор с гибридными антителами существенно снижал количество частиц вируса SARS-CoV-2 в легких инфицированных мышей, сообщает Nature News. С самого начала пандемии ученые задумались о создании антител для лечения COVID-19. Сегодня некоторые из таких антител проходят последние стадии клинических испытаний, а несколько одобрены для использования в чрезвычайных ситуациях.
Среди врачей, однако, лечение антителами не очень популярно, сказал в комментарии Nature News Чжицянь Ань (Zhiqiang An), конструктор антител из Центра медицинских наук при Техасском университете (University of Texas Health Science Center) в Хьюстоне. Отчасти это связано с тем, что доступные для использования антитела вводятся внутривенно, а не непосредственно в дыхательные пути, где в основном находится вирус, и при такой доставке для достижения эффекта требуются высокие дозы антительных препаратов.
Ань с коллегами задались целью сконструировать антитела, которые можно было бы доставлять непосредственно в носовую полость. Они просканировали библиотеку антител от здоровых людей и сосредоточили внимание на тех антителах, которые были способны распознавать компоненты SARS-CoV-2, используемые вирусом для прикрепления к клеткам и проникновения в них. Среди перспективных кандидатов были антитела IgG, которые после инфекции появляются относительно поздно, но довольно точно подогнаны под вторгающийся патоген. Фрагменты таких антител ученые сшили с молекулой другого типа, антителами IgM, которые действуют как агенты быстрого реагирования на широкий спектр инфекций.
Сконструированные антитела IgM обладали более сильным нейтрализующим эффектом против более 20 вариантов SARS-CoV-2, чем одни только IgG. После впрыскивания в носы мышей либо за шесть часов до инфицирования, либо через шесть часов после, сконструированные IgM быстро снижали количество вируса в легких грызунов спустя два дня после инфицирования, сообщают исследователи в журнале Nature.
Эта работа – «большое достижение в биоинженерии», считает Гай Горохов (Guy Gorochov), иммунолог из Парижского университета Сорбонна (Sorbonne University), но пока неизвестно как долго эти антитела продержатся в организме человека. Чжицянь Ань представляет себе сконструированные антитела как своего рода химическую маску для тех, кто сталкивается с SARS-CoV-2, а также как дополнительную защиту для не полностью вакцинированных людей. Поскольку молекулы IgM относительно стабильны, они подходят для создания из них назального спрея, который можно купить в аптеке и держать при себе на всякий случай, добавляет Ань.
Nature
Antibody-laden nasal spray could provide COVID protection — and treatment
Scientists create a hybrid antibody that can sharply cut the amount of SARS-CoV-2 in the lungs of infected mice.
#SARSCoV2 #ингибиторыРНК #news
Ученые нацелились на ахиллесову пяту РНК вируса SARS-CoV-2.
Когда SARS-CoV-2 инфицирует клетку, он внедряет свою РНК и репрограммирует клетку таким образом, что она начинает производить вирусные белки, а после и целые вирусные частицы. В поисках активных соединений против этого коронавируса ученые в основном фокусировались на вирусных белках и способах их блокирования, видя в этом путь к предупреждению или хотя бы замедлению репликации вирусных частиц. Но оказалось, что привести к остановке или замедлению репликации может также атака на вирусный геном, длинную молекулу РНК.
Исследователи из германского консорциума COVID-19-NMR, работу которого координирует профессор Харальд Швальбе из Института органической химии и химической биологии при Франкфуртском университете имени Иоганна Вольфганга Гёте завершили важный первый этап в создании нового класса таких лекарств против SARS-CoV-2. Они выявили в геноме SARS-CoV-2 15 коротких сегментов, очень сходных у разных коронавирусов и, насколько известно, выполняющих важные регуляторные функции. В течение всего 2020 года эти сегменты почти не затрагивались мутациями.
Имея библиотеку из 768 малых, химически простых молекул, они решили запустить их во взаимодействие с 15 сегментами РНК и проанализировать результаты возможных реакций с помощью ЯМР-спектроскопии. При таком анализе молекулы сначала метят стабильными изотопами и затем помещают в сильное магнитное поле. Атомное ядро возбуждается импульсами коротких радиочастот и излучает частотный спектр, благодаря которому можно определить структуру РНК и белка, а также способ и место прикрепления к ним малых молекул.
Таким образом, профессор Швальбе с коллегами идентифицировали 69 малых молекул, которые связываются с 13 из 15 сегментов РНК, и продемонстрировали, что РНК вируса SARS-CoV-2 очень подходит для того, чтобы быть потенциальной структурой-мишенью для лекарств. Учитывая большое количество мутаций в SARS-CoV-2, консервативные сегменты РНК, подобные идентифицированным франкфуртскими учеными, представляют особый интерес для создателей потенциальных ингибиторов вируса.
«Поскольку вирусная РНК составляет около двух третей всей РНК в пораженной клетке, используя подходящие молекулы мы сможем прервать репликацию вируса в значительной степени», говорит Швальбе. В сообщении Университета Гете он также отмечает, что его группа уже начала испытания с доступными соединениями, которые химически близки к тем из библиотеки соединений, что связываются с консервативными сегментами РНК.
Ученые нацелились на ахиллесову пяту РНК вируса SARS-CoV-2.
Когда SARS-CoV-2 инфицирует клетку, он внедряет свою РНК и репрограммирует клетку таким образом, что она начинает производить вирусные белки, а после и целые вирусные частицы. В поисках активных соединений против этого коронавируса ученые в основном фокусировались на вирусных белках и способах их блокирования, видя в этом путь к предупреждению или хотя бы замедлению репликации вирусных частиц. Но оказалось, что привести к остановке или замедлению репликации может также атака на вирусный геном, длинную молекулу РНК.
Исследователи из германского консорциума COVID-19-NMR, работу которого координирует профессор Харальд Швальбе из Института органической химии и химической биологии при Франкфуртском университете имени Иоганна Вольфганга Гёте завершили важный первый этап в создании нового класса таких лекарств против SARS-CoV-2. Они выявили в геноме SARS-CoV-2 15 коротких сегментов, очень сходных у разных коронавирусов и, насколько известно, выполняющих важные регуляторные функции. В течение всего 2020 года эти сегменты почти не затрагивались мутациями.
Имея библиотеку из 768 малых, химически простых молекул, они решили запустить их во взаимодействие с 15 сегментами РНК и проанализировать результаты возможных реакций с помощью ЯМР-спектроскопии. При таком анализе молекулы сначала метят стабильными изотопами и затем помещают в сильное магнитное поле. Атомное ядро возбуждается импульсами коротких радиочастот и излучает частотный спектр, благодаря которому можно определить структуру РНК и белка, а также способ и место прикрепления к ним малых молекул.
Таким образом, профессор Швальбе с коллегами идентифицировали 69 малых молекул, которые связываются с 13 из 15 сегментов РНК, и продемонстрировали, что РНК вируса SARS-CoV-2 очень подходит для того, чтобы быть потенциальной структурой-мишенью для лекарств. Учитывая большое количество мутаций в SARS-CoV-2, консервативные сегменты РНК, подобные идентифицированным франкфуртскими учеными, представляют особый интерес для создателей потенциальных ингибиторов вируса.
«Поскольку вирусная РНК составляет около двух третей всей РНК в пораженной клетке, используя подходящие молекулы мы сможем прервать репликацию вируса в значительной степени», говорит Швальбе. В сообщении Университета Гете он также отмечает, что его группа уже начала испытания с доступными соединениями, которые химически близки к тем из библиотеки соединений, что связываются с консервативными сегментами РНК.
Aktuelles aus der Goethe-Universität Frankfurt
SARS-CoV-2: Achillesfersen im Viren-Erbgut
Potenzielle Wirkstoffe gegen SARS-CoV-2 könnten nicht nur Virenproteine wie das Spike-Protein (rot) angreifen, sondern auch direkt das RNA-Erbgut des Virus (gelb, im Virusinnern). Bild Orpheus FX/Shutterstock
Bestimmte Regionen im SARS-CoV-2-Erbgut…
Bestimmte Regionen im SARS-CoV-2-Erbgut…
#SARS #SARSCoV2 #происхождениекоронавируса #news
SARS-подобные вирусы могут переходить от животных к людям сотни тысяч раз в году, исследование проводилось в Азии, которая представляется потенциальным очагом следующей коронавирусной пандемии.
За последние 20 лет по земному шару распространились лишь два новых коронавируса, SARS-CoV, вызвавший вспышку атипичной пневмонии в 2003 году, и SARS-CoV-2, вызывающий COVID-19. Но это может быть лишь верхушкой айсберга скрытых вирусных инфекций, возникших у летучих мышей, пишут авторы новой статьи, размещенной на сервере препринтов medRxiv.
По их подсчетам родственными SARS коронавирусами ежегодно должны заражаться в среднем 400 000 человек, но это никогда не перерастает в регистрируемые вспышки. Хотя число представлено с большими оговорками, «оно должно открыть глаза всему научному сообществу на то, что о частоте распространения зооонозов, то есть инфекционных заболеваний, передающихся от животных, мы знаем не очень много», говорит эксперт Sciencemag.org вирусолог из Саскачеванского университета (University of Saskatchewan) Анджела Расмуссен (Angela Rasmussen). Это нужно осознать, «потому что иначе мы сильно недооценим это явление», добавляет она.
Авторы исследования, среди которых зоолог Питер Дашак (Peter Daszak) из EcoHealth Alliance и Льнь-Фа Ван (Linfa Wang) с факультета медицины Университета Дьюка в Сингапуре (Duke-NUS Medical School in Singapore), создали детальную карту областей обитания 23 видов летучих мышей, несущих родственные SARS коронавирусы, и наложили эти данные на места, где живут люди, чтобы получить карту потенциальных инфекционных «горячих точек». Ученые установили, что в областях, которые могут стать центром распространения зоонозов, живет около 500 миллионов человек. Эти области – север Индии, Непал, Мьянма и большая часть юго-восточной Азии. Риск наиболее высок в Китае, Вьетнаме, Камбодже и на Яве, а также других индонезийских островах.
Авторы считают, что созданная ими карта может уменьшить вероятность распространения зооноза путем изменения поведения населения в областях высокого риска и направленного контроля для раннего выявления вспышек. По словам Дашека, известного сторонника гипотезы природного, а не лабораторного происхождения нового коронавируса, эта карта также может служить руководством для обнаружения природного очага SARS-CoV-2. Хотя 400 000 ежегодно инфицируемых представляются большим числом, для региона с сотнями миллионов особей летучих мышей и полумиллиардным населением это не так много, считает Анджела Расмуссен.
SARS-подобные вирусы могут переходить от животных к людям сотни тысяч раз в году, исследование проводилось в Азии, которая представляется потенциальным очагом следующей коронавирусной пандемии.
За последние 20 лет по земному шару распространились лишь два новых коронавируса, SARS-CoV, вызвавший вспышку атипичной пневмонии в 2003 году, и SARS-CoV-2, вызывающий COVID-19. Но это может быть лишь верхушкой айсберга скрытых вирусных инфекций, возникших у летучих мышей, пишут авторы новой статьи, размещенной на сервере препринтов medRxiv.
По их подсчетам родственными SARS коронавирусами ежегодно должны заражаться в среднем 400 000 человек, но это никогда не перерастает в регистрируемые вспышки. Хотя число представлено с большими оговорками, «оно должно открыть глаза всему научному сообществу на то, что о частоте распространения зооонозов, то есть инфекционных заболеваний, передающихся от животных, мы знаем не очень много», говорит эксперт Sciencemag.org вирусолог из Саскачеванского университета (University of Saskatchewan) Анджела Расмуссен (Angela Rasmussen). Это нужно осознать, «потому что иначе мы сильно недооценим это явление», добавляет она.
Авторы исследования, среди которых зоолог Питер Дашак (Peter Daszak) из EcoHealth Alliance и Льнь-Фа Ван (Linfa Wang) с факультета медицины Университета Дьюка в Сингапуре (Duke-NUS Medical School in Singapore), создали детальную карту областей обитания 23 видов летучих мышей, несущих родственные SARS коронавирусы, и наложили эти данные на места, где живут люди, чтобы получить карту потенциальных инфекционных «горячих точек». Ученые установили, что в областях, которые могут стать центром распространения зоонозов, живет около 500 миллионов человек. Эти области – север Индии, Непал, Мьянма и большая часть юго-восточной Азии. Риск наиболее высок в Китае, Вьетнаме, Камбодже и на Яве, а также других индонезийских островах.
Авторы считают, что созданная ими карта может уменьшить вероятность распространения зооноза путем изменения поведения населения в областях высокого риска и направленного контроля для раннего выявления вспышек. По словам Дашека, известного сторонника гипотезы природного, а не лабораторного происхождения нового коронавируса, эта карта также может служить руководством для обнаружения природного очага SARS-CoV-2. Хотя 400 000 ежегодно инфицируемых представляются большим числом, для региона с сотнями миллионов особей летучих мышей и полумиллиардным населением это не так много, считает Анджела Расмуссен.
medRxiv
A strategy to assess spillover risk of bat SARS-related coronaviruses in Southeast Asia
Emerging diseases caused by coronaviruses of likely bat origin (e.g. SARS, MERS, SADS and COVID-19) have disrupted global health and economies for two decades.
Evidence suggests that some bat SARS-related coronaviruses (SARSr-CoVs) could infect people directly…
Evidence suggests that some bat SARS-related coronaviruses (SARSr-CoVs) could infect people directly…
#SARSCoV2 #дельта #вакцинированныеносители #news
Вакцины против COVID эффективны, но распространение варианта дельта в пределах домохозяйств представляет собой риск для каждого четвертого.
Полностью вакцинированные люди могут заразиться и передать COVID-19 своим домочадцам, но с более низкой частотой, чем непривитые люди, сообщает Imperial College London. Это результаты масштабного исследования передачи COVID-19 внутри домохозяйств, проведенного Имперским колледжем Лондона и Агентством санитарно-эпидемиологической безопасности Великобритании (HSA) и опубликованного в The Lancet Infectious Diseases.
Было обнаружено, что люди, получившие две дозы вакцины, имеют более низкий, но все же заметный риск заражения дельта-вариантом в домашних условиях по сравнению с людьми, которые не были вакцинированы. Авторы подчеркивают, что вакцинация также снижает риск тяжелого заболевания, госпитализации и смерти от COVID-19. Анализ показал, что около 25% вакцинированных домашних контактов дали положительный результат на COVID-19 по сравнению с примерно 38% невакцинированных домашних контактов.
Полностью вакцинированные люди избавлялись от инфекции быстрее, чем непривитые, но их пиковая вирусная нагрузка – наибольшее количество вируса SARS-CoV-2, обнаруживаемое в носу и горле – была аналогична той, которая наблюдалась у невакцинированных людей, что может объяснить, почему они все еще могут легко передать вирус в домашних условиях. По словам авторов, это исследование – одно из немногих, проведенных на сегодняшний день с использованием подробных данных, полученных из домашних хозяйств, и предлагает важную информацию о том, как вакцинированные люди все еще могут быть инфицированы дельта-вариантом и передать его другим.
В исследовании участвовал 621 инфицированный, выявленный британской системой отслеживания контактов, в период с сентября 2020 года по сентябрь 2021 года – до того, как бустерные вакцины стали широко доступны в Великобритании. Все участники болели COVID-19 в легкой или бессимптомной форме, мазки из носа и горла у них брали ежедневно в течение двух-трех недель. Из 621 участника 163 дали положительный результат на COVID-19. Полногеномное секвенирование подтвердило, что 71 человек был инфицирован дельта-вариантом вируса SARS-CoV-2, 42 - альфа и 50 – исходным штаммом SARS-CoV-2. Из 71 участника, инфицированного дельта-вариантом, 23 (32%) не были вакцинированы, 10 (14%) получили одну дозу вакцины и 38 (54%) получили две дозы вакцины. В общей сложности было выявлено 205 семейных контактов с пациентами- источниками дельта-варианта, 53 из которых дали положительный результат на COVID-19. Из 205 контактов 126 (62%) получили две дозы вакцины, 39 (19%) получили одну дозу вакцины и 40 (19%) не были вакцинированы.
Среди семейных контактов, получивших две дозы вакцины, 25% (31 из 126 контактов) заразились дельта-вариантом по сравнению с 38% (15 из 40) невакцинированных домашних контактов.
Вакцины против COVID эффективны, но распространение варианта дельта в пределах домохозяйств представляет собой риск для каждого четвертого.
Полностью вакцинированные люди могут заразиться и передать COVID-19 своим домочадцам, но с более низкой частотой, чем непривитые люди, сообщает Imperial College London. Это результаты масштабного исследования передачи COVID-19 внутри домохозяйств, проведенного Имперским колледжем Лондона и Агентством санитарно-эпидемиологической безопасности Великобритании (HSA) и опубликованного в The Lancet Infectious Diseases.
Было обнаружено, что люди, получившие две дозы вакцины, имеют более низкий, но все же заметный риск заражения дельта-вариантом в домашних условиях по сравнению с людьми, которые не были вакцинированы. Авторы подчеркивают, что вакцинация также снижает риск тяжелого заболевания, госпитализации и смерти от COVID-19. Анализ показал, что около 25% вакцинированных домашних контактов дали положительный результат на COVID-19 по сравнению с примерно 38% невакцинированных домашних контактов.
Полностью вакцинированные люди избавлялись от инфекции быстрее, чем непривитые, но их пиковая вирусная нагрузка – наибольшее количество вируса SARS-CoV-2, обнаруживаемое в носу и горле – была аналогична той, которая наблюдалась у невакцинированных людей, что может объяснить, почему они все еще могут легко передать вирус в домашних условиях. По словам авторов, это исследование – одно из немногих, проведенных на сегодняшний день с использованием подробных данных, полученных из домашних хозяйств, и предлагает важную информацию о том, как вакцинированные люди все еще могут быть инфицированы дельта-вариантом и передать его другим.
В исследовании участвовал 621 инфицированный, выявленный британской системой отслеживания контактов, в период с сентября 2020 года по сентябрь 2021 года – до того, как бустерные вакцины стали широко доступны в Великобритании. Все участники болели COVID-19 в легкой или бессимптомной форме, мазки из носа и горла у них брали ежедневно в течение двух-трех недель. Из 621 участника 163 дали положительный результат на COVID-19. Полногеномное секвенирование подтвердило, что 71 человек был инфицирован дельта-вариантом вируса SARS-CoV-2, 42 - альфа и 50 – исходным штаммом SARS-CoV-2. Из 71 участника, инфицированного дельта-вариантом, 23 (32%) не были вакцинированы, 10 (14%) получили одну дозу вакцины и 38 (54%) получили две дозы вакцины. В общей сложности было выявлено 205 семейных контактов с пациентами- источниками дельта-варианта, 53 из которых дали положительный результат на COVID-19. Из 205 контактов 126 (62%) получили две дозы вакцины, 39 (19%) получили одну дозу вакцины и 40 (19%) не были вакцинированы.
Среди семейных контактов, получивших две дозы вакцины, 25% (31 из 126 контактов) заразились дельта-вариантом по сравнению с 38% (15 из 40) невакцинированных домашних контактов.
Imperial College London
COVID vaccines effective but household transmission of delta a risk for 1 in 4
HOUSEHOLD TRANSMISSION - Fully vaccinated people can contract and pass on COVID-19 in the home, but at lower rates than unvaccinated people.
#SARSCoV2 #дельта #invitro #вирусоподобныечастицы #news
Причину быстрого распространения варианта дельта установили в экспериментах со светящимися вирусоподобными частицами.
Известно, что вариант вызвавшего пандемию коронавируса, обозначенный как дельта, более заразный, чем предшествующие штаммы, однако причина, по которой дельта распространяется особенно быстро, неясна. Новый экспериментальный подход сделал возможным изучение эффекта мутаций, возникающих в вирусе SARS-CoV-2, и позволил получить ответ на вопрос об особенностях опасного варианта.
Авторы исследования, опубликованного в Science, лауреат Нобелевской премии Дженнифер Дудна (Jennifer Doudna) с коллегами из Калифорнийского университета Беркли (University of California, Berkeley), установили, что мутация, возникшая у дельты, способствует проникновению в клетку большего количества вирусного геномного материала, а это резко повышает вероятность передачи инфекции от зараженной клетки другим клеткам.
Изучая эффект возникающих в геноме вируса мутаций, ученые, как правило, сосредотачиваются на спайк-белке, который находится на поверхности вирусной частицы и способствует ее проникновению в человеческие клетки. Для этого они конструируют так называемые псевдовирусы с различными мутациями по спайк-белку и смотрят, как та или иная из них влияет на способность экспериментальных частиц заражать клетки в лаборатории. Но Дудна с соавторами придумали другой способ: они создали вирусоподобные частицы, содержащие все вирусные белки, но не имеющие его генома.
Внешне вирусоподобная частица SARS-CoV-2 выглядит как полноценный вирус, и она способна связываться с клеткой и проникать в нее в лабораторных условиях. Но поскольку такая частица лишена генома, она не может использовать аппарат клетки для размножения в ней. Дудна с коллегами вносили в вирусоподобные частицы фрагменты информационной РНК, благодаря которым клетки с такими частицами начинали светиться. Чем ярче светится клетка, тем больше РНК в нее попало вместе с вирусоподобной частицей. Наполняя такие частицы РНК с информацией о разных мутациях SARS-CoV-2, ученые по свечению клеток с проникшими в них частицами обнаружили, что выявленная у дельты мутация по нуклеокапсидному, или N -белку (R203M), приводит к тому, что в клетки попадает в 10 раз больше генетического материала, то есть информационной РНК, чем при инфицировании первоначальным вариантом коронавируса. Когда эту же мутацию дельты внесли в настоящий вирус и заразили им клетки легких, в них образовалось в 51 раз больше инфекционных частиц, чем при заражении оригинальным штаммом.
Причину быстрого распространения варианта дельта установили в экспериментах со светящимися вирусоподобными частицами.
Известно, что вариант вызвавшего пандемию коронавируса, обозначенный как дельта, более заразный, чем предшествующие штаммы, однако причина, по которой дельта распространяется особенно быстро, неясна. Новый экспериментальный подход сделал возможным изучение эффекта мутаций, возникающих в вирусе SARS-CoV-2, и позволил получить ответ на вопрос об особенностях опасного варианта.
Авторы исследования, опубликованного в Science, лауреат Нобелевской премии Дженнифер Дудна (Jennifer Doudna) с коллегами из Калифорнийского университета Беркли (University of California, Berkeley), установили, что мутация, возникшая у дельты, способствует проникновению в клетку большего количества вирусного геномного материала, а это резко повышает вероятность передачи инфекции от зараженной клетки другим клеткам.
Изучая эффект возникающих в геноме вируса мутаций, ученые, как правило, сосредотачиваются на спайк-белке, который находится на поверхности вирусной частицы и способствует ее проникновению в человеческие клетки. Для этого они конструируют так называемые псевдовирусы с различными мутациями по спайк-белку и смотрят, как та или иная из них влияет на способность экспериментальных частиц заражать клетки в лаборатории. Но Дудна с соавторами придумали другой способ: они создали вирусоподобные частицы, содержащие все вирусные белки, но не имеющие его генома.
Внешне вирусоподобная частица SARS-CoV-2 выглядит как полноценный вирус, и она способна связываться с клеткой и проникать в нее в лабораторных условиях. Но поскольку такая частица лишена генома, она не может использовать аппарат клетки для размножения в ней. Дудна с коллегами вносили в вирусоподобные частицы фрагменты информационной РНК, благодаря которым клетки с такими частицами начинали светиться. Чем ярче светится клетка, тем больше РНК в нее попало вместе с вирусоподобной частицей. Наполняя такие частицы РНК с информацией о разных мутациях SARS-CoV-2, ученые по свечению клеток с проникшими в них частицами обнаружили, что выявленная у дельты мутация по нуклеокапсидному, или N -белку (R203M), приводит к тому, что в клетки попадает в 10 раз больше генетического материала, то есть информационной РНК, чем при инфицировании первоначальным вариантом коронавируса. Когда эту же мутацию дельты внесли в настоящий вирус и заразили им клетки легких, в них образовалось в 51 раз больше инфекционных частиц, чем при заражении оригинальным штаммом.
www.science.org
Why is Delta so infectious? New lab tool spotlights little noticed mutation that speeds viral spread
“Viruslike particles” open the way to safely study nucleocapsid and other viral proteins
#SARSCoV2 #зоонозы #news
Биоинформатики определили виды животных – наиболее вероятных резервуаров коронавируса SARS-CoV-2.
Опасения по поводу того, что новый коронавирус может найти других хозяев, став таким образом постоянно угрозой человечеству, с ходом пандемии только возрастают, пишет издание The Scientist.
Биоинформатики из Института экосистемных исследований Кэри (Cary Institute of Ecosystem Studies) в Нью-Йорке создали модель машинного обучения, которая использует признаки животного для предсказания структуры его рецепторов ангиостатин-превращающего фермента 2, рецепторов ACE2, главных «ворот» проникновения SARS-CoV-2 в клетки.
На основании этих белковых структур авторы исследования идентифицировали виды, наиболее восприимчивые к вирусу и способные его распространять. Результаты моделирования опубликованы в Proceedings of the Royal Society B. Из 5 400 видов животных ученые в результате анализа выделили как потенциально уязвимых коронавирусом некоторых домашних питомцев, сельскохозяйственных и диких животных. Кошки и обезьяны были ожидаемы, особенно в свете уже задокументированных случаев. Другие животные, например, сахарский орикс, или саблерогая антилопа, оказались более неожиданными, хотя, несмотря на контакты людей с ними в зоопарках и в рамках природоохранных программ, случаи инфицирования этих животных SARS-CoV-2 пока неизвестны.
По словам авторов, полученные ими результаты способствуют расстановке приоритетов в тестировании и наблюдении разных видов. «Недавнее открытие широкого распространения инфекции SARS-CoV-2 среди белохвостых оленей показало, насколько срочно нужно приступать к активному наблюдению за животными – потенциальными резервуарами вируса. Использованный авторами подход поможет выявить виды животных, которым угрожает заражение, чтобы приступить к реализации более целенаправленных программ наблюдения», сказал Суреш Кучипуди (Suresh Kuchipudi), специалист по природно-очаговым вирусам из Университета штата Пенсильвания (Pennsylvania State University).
Авторы публикации Барбара Хан (Barbara Han) и ее группа в Институте Кэри начали свое исследование больше года назад, задолго до того, как стало известно о том, что прошлой зимой коронавирусом заразились более 80% белохвостых оленей штата Айова. Хан с соавторами отмечают, что наиболее подверженные заражению виды с большей вероятностью контактируют с людьми, потому что редко контактирующие животные, даже если у них подходящие для вируса рецепторы ACE2, вряд ли заразятся от людей. Среди тех, кто требует пристального внимания инфекционистов и эпидемиологов, собаки и кошки, гималайский медведь, серые волки, горные гориллы и 35 видов летучих мышей.
Биоинформатики определили виды животных – наиболее вероятных резервуаров коронавируса SARS-CoV-2.
Опасения по поводу того, что новый коронавирус может найти других хозяев, став таким образом постоянно угрозой человечеству, с ходом пандемии только возрастают, пишет издание The Scientist.
Биоинформатики из Института экосистемных исследований Кэри (Cary Institute of Ecosystem Studies) в Нью-Йорке создали модель машинного обучения, которая использует признаки животного для предсказания структуры его рецепторов ангиостатин-превращающего фермента 2, рецепторов ACE2, главных «ворот» проникновения SARS-CoV-2 в клетки.
На основании этих белковых структур авторы исследования идентифицировали виды, наиболее восприимчивые к вирусу и способные его распространять. Результаты моделирования опубликованы в Proceedings of the Royal Society B. Из 5 400 видов животных ученые в результате анализа выделили как потенциально уязвимых коронавирусом некоторых домашних питомцев, сельскохозяйственных и диких животных. Кошки и обезьяны были ожидаемы, особенно в свете уже задокументированных случаев. Другие животные, например, сахарский орикс, или саблерогая антилопа, оказались более неожиданными, хотя, несмотря на контакты людей с ними в зоопарках и в рамках природоохранных программ, случаи инфицирования этих животных SARS-CoV-2 пока неизвестны.
По словам авторов, полученные ими результаты способствуют расстановке приоритетов в тестировании и наблюдении разных видов. «Недавнее открытие широкого распространения инфекции SARS-CoV-2 среди белохвостых оленей показало, насколько срочно нужно приступать к активному наблюдению за животными – потенциальными резервуарами вируса. Использованный авторами подход поможет выявить виды животных, которым угрожает заражение, чтобы приступить к реализации более целенаправленных программ наблюдения», сказал Суреш Кучипуди (Suresh Kuchipudi), специалист по природно-очаговым вирусам из Университета штата Пенсильвания (Pennsylvania State University).
Авторы публикации Барбара Хан (Barbara Han) и ее группа в Институте Кэри начали свое исследование больше года назад, задолго до того, как стало известно о том, что прошлой зимой коронавирусом заразились более 80% белохвостых оленей штата Айова. Хан с соавторами отмечают, что наиболее подверженные заражению виды с большей вероятностью контактируют с людьми, потому что редко контактирующие животные, даже если у них подходящие для вируса рецепторы ACE2, вряд ли заразятся от людей. Среди тех, кто требует пристального внимания инфекционистов и эпидемиологов, собаки и кошки, гималайский медведь, серые волки, горные гориллы и 35 видов летучих мышей.
The Scientist Magazine®
Tool Identifies Likely Reservoir Species for SARS-CoV-2
Researchers used sequencing data and phenotypic traits to predict which of 5,400 species were most likely to be susceptible to contracting and spreading the virus back to humans.
#Омикрон #SARSCoV2 #COVID19 #news
Коронавирусный вариант с множеством замен получил название Омикрон, и он вызывает сильное беспокойство у специалистов.
Исследователи в Южной Африке отмечают рост числа заражений новым вариантом вируса SARS-CoV-2. Вариант Омикрон, по-видимому, распространяется очень быстро. Впервые его выявили в Ботсване в начале ноября, а потом он обнаружился у путешественника, прибывшего в Гонконг из ЮАР. Наряду с отслеживанием распространения Омикрона ученые пытаются понять, каковы особенности этого варианта, и, в первую очередь, способен ли он избежать иммунного ответа, опосредованного вакцинами, и вызывает ли он более тяжелую или более легкую форму заболевания COVID-19, чем другие варианты, пишет Nature News.
По словам Пенни Мур (Penny Moor), вирусолога из Университета Уитвотерсренда (University of the Witwatersrand) в Йоханнесбурге, в чьей лаборатории определяют способность вирусов обходить иммунный ответ, сформировавшийся после вакцинации или перенесенных инфекций, «есть передающиеся из уст в уста сообщения о повторных инфекциях и случаях заражения вакцинированных новым вариантом, но на этой стадии исследований слишком рано что-либо утверждать». «Профиль мутаций вызывает беспокойство, но нужно проделать определенную работу, чтобы понять значимость этого варианта для хода пандемии», сказал на пресс-брифинге Минздрава ЮАР в конце прошлой недели Ричард Лесселс (Richard Lessells), врач-инфекционист из Университета КваЗулу-Натал (University of KwaZulu-Natal).
На экстренном совещании, которое Всемирная организация здравоохранения (WHO) созвала 26 ноября, новый штамм B.1.1.529 получил определение «вариант, вызывающий обеспокоенность» и название Омикрон. Он дополнил составленный ВОЗ список вариантов, вызывающих обеспокоенность, в котором находятся варианты Дельта, Альфа, Бета и Гамма. Для ученых сейчас очень важно определить способность варианта Омикрон распространяться в глобальном масштабе, если он окажется как Дельта, это может вызвать новую волну заражений. Штамм B.1.1.529 выявили при анализе геномов циркулирующих штаммов, этот вариант бросился в глаза тем, что в нем больше 30 замен в белке шипа вируса, который распознает клетки организма-хозяина и представляет собой главную мишень иммунного ответа. Многие из этих замен обнаружены в вариантах Дельта и Альфа, и они связаны с повышенной инфекционностью и способностью избегать нейтрализующих инфекцию антител. По словам Мур, компьютерное моделирование показало, что новоявленный вариант B.1.1.529 может обойти иммунный ответ, обусловленный другим компонентом иммунной системы, Т-клетками. Первые результаты, подтверждающие или опровергающие это, должны появиться в течение двух недель.
Коронавирусный вариант с множеством замен получил название Омикрон, и он вызывает сильное беспокойство у специалистов.
Исследователи в Южной Африке отмечают рост числа заражений новым вариантом вируса SARS-CoV-2. Вариант Омикрон, по-видимому, распространяется очень быстро. Впервые его выявили в Ботсване в начале ноября, а потом он обнаружился у путешественника, прибывшего в Гонконг из ЮАР. Наряду с отслеживанием распространения Омикрона ученые пытаются понять, каковы особенности этого варианта, и, в первую очередь, способен ли он избежать иммунного ответа, опосредованного вакцинами, и вызывает ли он более тяжелую или более легкую форму заболевания COVID-19, чем другие варианты, пишет Nature News.
По словам Пенни Мур (Penny Moor), вирусолога из Университета Уитвотерсренда (University of the Witwatersrand) в Йоханнесбурге, в чьей лаборатории определяют способность вирусов обходить иммунный ответ, сформировавшийся после вакцинации или перенесенных инфекций, «есть передающиеся из уст в уста сообщения о повторных инфекциях и случаях заражения вакцинированных новым вариантом, но на этой стадии исследований слишком рано что-либо утверждать». «Профиль мутаций вызывает беспокойство, но нужно проделать определенную работу, чтобы понять значимость этого варианта для хода пандемии», сказал на пресс-брифинге Минздрава ЮАР в конце прошлой недели Ричард Лесселс (Richard Lessells), врач-инфекционист из Университета КваЗулу-Натал (University of KwaZulu-Natal).
На экстренном совещании, которое Всемирная организация здравоохранения (WHO) созвала 26 ноября, новый штамм B.1.1.529 получил определение «вариант, вызывающий обеспокоенность» и название Омикрон. Он дополнил составленный ВОЗ список вариантов, вызывающих обеспокоенность, в котором находятся варианты Дельта, Альфа, Бета и Гамма. Для ученых сейчас очень важно определить способность варианта Омикрон распространяться в глобальном масштабе, если он окажется как Дельта, это может вызвать новую волну заражений. Штамм B.1.1.529 выявили при анализе геномов циркулирующих штаммов, этот вариант бросился в глаза тем, что в нем больше 30 замен в белке шипа вируса, который распознает клетки организма-хозяина и представляет собой главную мишень иммунного ответа. Многие из этих замен обнаружены в вариантах Дельта и Альфа, и они связаны с повышенной инфекционностью и способностью избегать нейтрализующих инфекцию антител. По словам Мур, компьютерное моделирование показало, что новоявленный вариант B.1.1.529 может обойти иммунный ответ, обусловленный другим компонентом иммунной системы, Т-клетками. Первые результаты, подтверждающие или опровергающие это, должны появиться в течение двух недель.
Nature
Heavily mutated Omicron variant puts scientists on alert
Nature - Researchers are racing to determine whether a fast-spreading coronavirus variant poses a threat to COVID vaccines’ effectiveness.
#SARSCoV2 #CoronaTtest #НМИЦгематологии #news
Российские ученые установили фрагменты коронавируса, вызывающие клеточный иммунитет, и разработали тест-систему для его оценки.
Ученые из лаборатории трансплантационной иммунологии НМИЦ гематологии Минздрава России под руководством Григория Ефимова нашли 75 фрагментов вируса SARS-CoV-2, которые распознаются Т-клетками иммунной системы чаще всего. Т-клетки, или Т-лимфоциты – важная составляющая иммунной защиты от инфекции, наряду с антителами. Но в отличие от антител, Т-лимфоциты распознают не сам вирус, а его фрагменты, представленные на поверхности зараженных клеток. Из-за генетических различий Т-лимфоциты разных людей узнают разные фрагменты вируса. Благодаря широкому спектру распознаваемых вирусных участков Т-клеточный иммунитет менее зависим от мутаций вируса.
Для выявления узнаваемых Т-клетками фрагментов коронавируса исследователи из Центра гематологии изучили иммунный ответ более 400 добровольцев, среди которых были вакцинированные, переболевшие, неболевшие и невакцинированные.
Отдельную группу составили те, кто был в тесном контакте с больным, но сам не заболел. Ученые отобрали 118 небольших пептидных фрагментов из разных белков коронавируса, а из крови добровольцев выделяли Т-клетки и изучали реакцию на каждый из 118-ти фрагментов. 75 из них вызвали активацию специфичных Т-лимфоцитов, то есть указали на иммунный ответ испытуемых на коронавирус в результате перенесённого COVID-19 или вакцинации.
Определение иммунологически значимых участков вируса важно для разработки новых вакцин и диагностических средств. На основе проведенного исследования в Центре гематологии уже создана и успешно используется тест-система для оценки Т-клеточного ответа на коронавирус Corona-T-test. Клинические испытания этой тест-системы проведены НМИЦ ДГОИ им. Дмитрия Рогачева, а набор добровольцев проводила лабораторная сеть ДНКОМ. Результаты клинических испытаний показали, что Corona-T-test способен определять, знакома ли иммунная система пациента с фрагментами коронавируса SARS-CoV-2 с 95-процентной точностью. Для того, чтобы исключить возможное влияние перекрестного иммунного ответа, выработанного на другие коронавирусы, разработчики теста использовали только уникальные для SARS-CoV-2 фрагменты. Таким образом, перенесенные ранее простудные заболевания результаты не искажают.
Исследование опубликовано на сервере препринтов medRxiv.org. Авторы отмечают, что мутации в новом штамме «омикрон» потенциально затронули лишь 2 из 75 иммуногенных вирусных фрагментов, то есть они не могут существенно повлиять на Т-клеточный иммунитет.
Российские ученые установили фрагменты коронавируса, вызывающие клеточный иммунитет, и разработали тест-систему для его оценки.
Ученые из лаборатории трансплантационной иммунологии НМИЦ гематологии Минздрава России под руководством Григория Ефимова нашли 75 фрагментов вируса SARS-CoV-2, которые распознаются Т-клетками иммунной системы чаще всего. Т-клетки, или Т-лимфоциты – важная составляющая иммунной защиты от инфекции, наряду с антителами. Но в отличие от антител, Т-лимфоциты распознают не сам вирус, а его фрагменты, представленные на поверхности зараженных клеток. Из-за генетических различий Т-лимфоциты разных людей узнают разные фрагменты вируса. Благодаря широкому спектру распознаваемых вирусных участков Т-клеточный иммунитет менее зависим от мутаций вируса.
Для выявления узнаваемых Т-клетками фрагментов коронавируса исследователи из Центра гематологии изучили иммунный ответ более 400 добровольцев, среди которых были вакцинированные, переболевшие, неболевшие и невакцинированные.
Отдельную группу составили те, кто был в тесном контакте с больным, но сам не заболел. Ученые отобрали 118 небольших пептидных фрагментов из разных белков коронавируса, а из крови добровольцев выделяли Т-клетки и изучали реакцию на каждый из 118-ти фрагментов. 75 из них вызвали активацию специфичных Т-лимфоцитов, то есть указали на иммунный ответ испытуемых на коронавирус в результате перенесённого COVID-19 или вакцинации.
Определение иммунологически значимых участков вируса важно для разработки новых вакцин и диагностических средств. На основе проведенного исследования в Центре гематологии уже создана и успешно используется тест-система для оценки Т-клеточного ответа на коронавирус Corona-T-test. Клинические испытания этой тест-системы проведены НМИЦ ДГОИ им. Дмитрия Рогачева, а набор добровольцев проводила лабораторная сеть ДНКОМ. Результаты клинических испытаний показали, что Corona-T-test способен определять, знакома ли иммунная система пациента с фрагментами коронавируса SARS-CoV-2 с 95-процентной точностью. Для того, чтобы исключить возможное влияние перекрестного иммунного ответа, выработанного на другие коронавирусы, разработчики теста использовали только уникальные для SARS-CoV-2 фрагменты. Таким образом, перенесенные ранее простудные заболевания результаты не искажают.
Исследование опубликовано на сервере препринтов medRxiv.org. Авторы отмечают, что мутации в новом штамме «омикрон» потенциально затронули лишь 2 из 75 иммуногенных вирусных фрагментов, то есть они не могут существенно повлиять на Т-клеточный иммунитет.
medRxiv
Immunogenic epitope panel for accurate detection of non-cross-reactive T cell response to SARS-CoV-2
The ongoing COVID-19 pandemic calls for more effective diagnostic tools, and T cell response assessment can serve as an independent indicator of prior COVID-19 exposure while also contributing to a more comprehensive characterization of SARS-CoV-2 immunity.…
#SARSCoV2 #персистентность #лонгковид #news
Коронавирус, сохраняющийся в фекалиях, может быть причиной постковидного синдрома.
В крупнейшем исследовании, отслеживающем РНК SARS-CoV-2 в фекалиях наряду с симптомами COVID, ученые из Стэнфордского университета обнаружили присутствие следов вируса в испражнениях почти у половины пациентов в течение недели после заражения и спустя семь месяцев у 4% пациентов. Поскольку РНК коронавируса в фекалиях была ассоциирована с расстройствами желудка, авторы исследования пришли к выводу, что SARS-CoV-2, вероятно, напрямую заражает желудочно-кишечный тракт, где он может скрываться. «Это поднимает вопрос о том, что продолжающиеся инфекции в скрытых частях тела могут быть важны для понимания природы затяжного, или лонг- COVID», цитирует руководителя исследования Ами Бхатт агентство Bloomberg. По ее мнению, задержавшийся в организме вирус может напрямую проникать в клетки и повреждать ткани или производить белки, которые провоцируют иммунную систему. Пока никто не знает, что вызывает совокупность пост-ковидных симптомов, часто называемых длительным, или лонг- ковидом. Постковидные симптомы имеют от 5% до 80% людей, перенесших заражение SARS-CoV-2. По мнению Акико Ивасаки, профессора иммунобиологии и молекулярной, клеточной биологии и биологии развития в Йельском университете, к различным состояниям или подтипам длительного COVID могут привести по меньшей мере четыре различных биологических механизма. Ивасаки считает, что в одной из этих форм стойкий SARS-CoV-2 может вызвать повреждающий иммунный ответ, который приводит к заболеваниям, которые можно подавить с помощью лекарств, нацеленных на вирус.
Пищеварительный тракт является основным местом за пределами дыхательной системы для персистенции SARS-CoV-2 и периодического выделения вируса, как показали китайские исследователи в 2020 году. Следы вируса были обнаружены в фекалиях в течение нескольких недель после появления COVID, что побудило использовать для оценки распространения пандемии сточные воды. Другие сообщают о наличии персистенции в лимфатических тканях, головном мозге и других органах, в основном в результате вскрытий, проведенных на людях, которые скончались от тяжелого острого COVID-19. По словам Бхатт из Стэнфорда, сколь-либо значимых данных о частоте и продолжительности присутствия коронавируса в стуле людей с легкой и средней степенью тяжести COVID нет. В мае 2020 года в рамках отдельного исследования она и ее коллеги начали отслеживать пост-ковидные симптомы, а также количество и местонахождение выделяемого вируса. Когда исследователи проанализировали образцы кала 113 участников в определенные моменты времени после заражения, около 13% все еще выделяли вирусную РНК четыре месяца спустя, после того как они очистили свои дыхательные пути от вируса. У двух участников были обнаружены следы вируса в стуле примерно через 210 дней после заражения. Исследователи не смогли выделить достаточно вирусной РНК, чтобы определить, какой вариант заразил участников, или убедительно показать, что образцы, выделенные от любого конкретного человека в ранние и более поздние моменты времени, были одним и тем же штаммом. Тем не менее, образцы были собраны в первый год пандемии, когда повторное заражение вторым штаммом или вариантом в течение периода исследования было менее вероятным. Результаты этого исследования публикует онлайн журнал Med.
Коронавирус, сохраняющийся в фекалиях, может быть причиной постковидного синдрома.
В крупнейшем исследовании, отслеживающем РНК SARS-CoV-2 в фекалиях наряду с симптомами COVID, ученые из Стэнфордского университета обнаружили присутствие следов вируса в испражнениях почти у половины пациентов в течение недели после заражения и спустя семь месяцев у 4% пациентов. Поскольку РНК коронавируса в фекалиях была ассоциирована с расстройствами желудка, авторы исследования пришли к выводу, что SARS-CoV-2, вероятно, напрямую заражает желудочно-кишечный тракт, где он может скрываться. «Это поднимает вопрос о том, что продолжающиеся инфекции в скрытых частях тела могут быть важны для понимания природы затяжного, или лонг- COVID», цитирует руководителя исследования Ами Бхатт агентство Bloomberg. По ее мнению, задержавшийся в организме вирус может напрямую проникать в клетки и повреждать ткани или производить белки, которые провоцируют иммунную систему. Пока никто не знает, что вызывает совокупность пост-ковидных симптомов, часто называемых длительным, или лонг- ковидом. Постковидные симптомы имеют от 5% до 80% людей, перенесших заражение SARS-CoV-2. По мнению Акико Ивасаки, профессора иммунобиологии и молекулярной, клеточной биологии и биологии развития в Йельском университете, к различным состояниям или подтипам длительного COVID могут привести по меньшей мере четыре различных биологических механизма. Ивасаки считает, что в одной из этих форм стойкий SARS-CoV-2 может вызвать повреждающий иммунный ответ, который приводит к заболеваниям, которые можно подавить с помощью лекарств, нацеленных на вирус.
Пищеварительный тракт является основным местом за пределами дыхательной системы для персистенции SARS-CoV-2 и периодического выделения вируса, как показали китайские исследователи в 2020 году. Следы вируса были обнаружены в фекалиях в течение нескольких недель после появления COVID, что побудило использовать для оценки распространения пандемии сточные воды. Другие сообщают о наличии персистенции в лимфатических тканях, головном мозге и других органах, в основном в результате вскрытий, проведенных на людях, которые скончались от тяжелого острого COVID-19. По словам Бхатт из Стэнфорда, сколь-либо значимых данных о частоте и продолжительности присутствия коронавируса в стуле людей с легкой и средней степенью тяжести COVID нет. В мае 2020 года в рамках отдельного исследования она и ее коллеги начали отслеживать пост-ковидные симптомы, а также количество и местонахождение выделяемого вируса. Когда исследователи проанализировали образцы кала 113 участников в определенные моменты времени после заражения, около 13% все еще выделяли вирусную РНК четыре месяца спустя, после того как они очистили свои дыхательные пути от вируса. У двух участников были обнаружены следы вируса в стуле примерно через 210 дней после заражения. Исследователи не смогли выделить достаточно вирусной РНК, чтобы определить, какой вариант заразил участников, или убедительно показать, что образцы, выделенные от любого конкретного человека в ранние и более поздние моменты времени, были одним и тем же штаммом. Тем не менее, образцы были собраны в первый год пандемии, когда повторное заражение вторым штаммом или вариантом в течение периода исследования было менее вероятным. Результаты этого исследования публикует онлайн журнал Med.
Bloomberg.com
Coronavirus Persisting in Feces Offers Clues to Long Covid Cause
Covid-19 patients can harbor the coronavirus in their feces for months after infection, researchers found, stoking concern that its persistence can aggravate the immune system and cause long Covid symptoms.
#ВОЗ #SARSCoV2 #news
Эксперты ВОЗ уже не считают утечку коронавируса из китайской лаборатории маловероятной.
В отличие от первого доклада о возможных причинах пандемии COVID-19 новое заявление экспертов, привлеченных Всемирной организацией здравоохранения,
содержит замечание о том, что игнорировать теорию «утечки из китайской лаборатории» нельзя, сообщает Medicine Net.
На основании первоначальной оценки, проведенной в 2021 году, эксперты высказали уверенность в том, что происшествие в лаборатории, которое могло бы привести к выходу коронавируса наружу, «крайне маловероятно».
В последнем докладе, опубликованном 9 июня, эксперты отметили, что их попытки выяснить, как началась пандемия, по-прежнему сталкиваются с отсутствием «ключевых фрагментов данных», но они «остаются открытыми для любых научных данных, которые станут доступны в будущем, чтобы обеспечить всестороннее исследование и проверку всех разумных гипотез». Как напоминают эксперты, лабораторные происшествия уже вызывали вспышки инфекционных заболеваний, поэтому теорию утечки нельзя сбрасывать со счетов.
В феврале глава ВОЗ Тедрос Аданом Гебреисус запросил у высокопоставленных чиновников китайского правительства дополнительную информацию, в том числе подробности о первых случаях заболевания людей COVID-19 в городе Ухань. Но эксперты ВОЗ заявили, что Китай не предоставил никаких результатов исследований, в которых оценивалась бы возможность того, что COVID-19 является лабораторной утечкой, а также отметили, что не все исследования китайских ученых о вирусе были опубликованы.
Эксперты ВОЗ подчеркивают необходимость многостороннего расследования происхождения COVID-19, включая выяснение возможной роли животных в местах, откуда вирус мог впервые распространиться, в частности, с рынка морепродуктов Хуанань в Ухане.
Эксперты ВОЗ уже не считают утечку коронавируса из китайской лаборатории маловероятной.
В отличие от первого доклада о возможных причинах пандемии COVID-19 новое заявление экспертов, привлеченных Всемирной организацией здравоохранения,
содержит замечание о том, что игнорировать теорию «утечки из китайской лаборатории» нельзя, сообщает Medicine Net.
На основании первоначальной оценки, проведенной в 2021 году, эксперты высказали уверенность в том, что происшествие в лаборатории, которое могло бы привести к выходу коронавируса наружу, «крайне маловероятно».
В последнем докладе, опубликованном 9 июня, эксперты отметили, что их попытки выяснить, как началась пандемия, по-прежнему сталкиваются с отсутствием «ключевых фрагментов данных», но они «остаются открытыми для любых научных данных, которые станут доступны в будущем, чтобы обеспечить всестороннее исследование и проверку всех разумных гипотез». Как напоминают эксперты, лабораторные происшествия уже вызывали вспышки инфекционных заболеваний, поэтому теорию утечки нельзя сбрасывать со счетов.
В феврале глава ВОЗ Тедрос Аданом Гебреисус запросил у высокопоставленных чиновников китайского правительства дополнительную информацию, в том числе подробности о первых случаях заболевания людей COVID-19 в городе Ухань. Но эксперты ВОЗ заявили, что Китай не предоставил никаких результатов исследований, в которых оценивалась бы возможность того, что COVID-19 является лабораторной утечкой, а также отметили, что не все исследования китайских ученых о вирусе были опубликованы.
Эксперты ВОЗ подчеркивают необходимость многостороннего расследования происхождения COVID-19, включая выяснение возможной роли животных в местах, откуда вирус мог впервые распространиться, в частности, с рынка морепродуктов Хуанань в Ухане.
MedicineNet
WHO Experts Open to Notion That China Lab Leak Spurred COVID
In an about-face from an original report on what might have caused the COVID-19 pandemic, experts enlisted by the World Health Organization said Thursday that they could not discount the China lab leak theory.
#инфильтрирующиемоноциты #SARSCoV2 #иммунология #news
Иммунологи определили критически важные иммунные клетки-мишени для лечения осложнений COVID-19.
Используя лабораторную модель, адаптированную из модели, ранее разработанной для изучения муковисцидоза, генетического заболевания, поражающего легкие, исследователи из Университета Эмори смогли воспроизвести сложный и труднодоступный для изучения переход от ранней стадии инфекции SARS-CoV-2, когда пациенты в основном бессимптомны, к более поздней стадии, на которой люди могут испытывать опасное для жизни воспаление в легких, сообщает MedicalXpress.
Авторы исследования определили ключевой тип иммунных клеток, который управляет переходом от раннего к позднему COVID-19, и смогли протестировать лекарства-кандидаты на этих клетках, продемонстрировав их влияние на клиренс вируса и воспаление. Результаты опубликованы в онлайн-версии журнала Cell Reports. В работе делается вывод о том, что моноциты, инфильтрирующие в легкие, вызывают развитие воспалительных осложнений при COVID-19 и являются важной мишенью для лечения. Кроме того, в исследовании подробно описано, как противовирусный препарат ремдесивир и иммуномодулятор барицитиниб можно использовать отдельно или в комбинации для воздействия на эти моноциты. Также исследование документально подтверждает, что данные, полученные на лабораторной модели, отражают данные in vivo, полученные от госпитализированных пациентов с COVID-19. Использованная модель имитирует последовательность событий, происходящих при заражении человека вирусом COVID-19. В основе подхода выращивание эпителиальных клеток легких человека, верхняя часть которых открыта для воздуха. Эти клетки затем инфицируются SARS-CoV-2, и модель позволяет моноцитам крови трансмигрировать через инфицированный эпителий, где они приобретают вирус. Препараты против COVID-19 могут быть добавлены в любой момент, чтобы измерить, как они влияют на инфекцию и иммунный ответ в эпителиальных клетках и инфильтрирующих легкие моноцитах на разных стадиях.
На ранней стадии инфекции SARS-CoV-2 вирус быстро размножается, но активно избегает привлечения иммунных клеток «первого ответчика», называемых «нейтрофилами», которые могут инициировать раннее воспаление и элиминацию вируса. У инфицированного человека симптомы не проявляются, и фактически он может воспроизвести вирус, а затем избавиться от него, не испытывая при этом никаких симптомов. Но в конце концов реагируют и моноциты; эти иммунные клетки живут дольше, чем нейтрофилы, а также могут трансмигрировать в легкие, чтобы заразиться вирусом и скопировать его генетический шаблон, который заставляет организм усиливать свой иммунный ответ. Именно эта эскалация может спровоцировать избыточное воспаление.
Исследование показало, что комбинированное использование двух одобренных FDA препаратов для лечения COVID-19 — ремдесивира и барицитиниба — усиливает противовирусную сигнализацию и вирусный клиренс моноцитов, инфицированных SARS-CoV-2. Авторы подчеркивают, что время терапевтического лечения имеет решающее значение для предотвращения сильного воспаления, которое может привести к опасному для жизни состоянию, известному как острый респираторный дистресс-синдром.
Иммунологи определили критически важные иммунные клетки-мишени для лечения осложнений COVID-19.
Используя лабораторную модель, адаптированную из модели, ранее разработанной для изучения муковисцидоза, генетического заболевания, поражающего легкие, исследователи из Университета Эмори смогли воспроизвести сложный и труднодоступный для изучения переход от ранней стадии инфекции SARS-CoV-2, когда пациенты в основном бессимптомны, к более поздней стадии, на которой люди могут испытывать опасное для жизни воспаление в легких, сообщает MedicalXpress.
Авторы исследования определили ключевой тип иммунных клеток, который управляет переходом от раннего к позднему COVID-19, и смогли протестировать лекарства-кандидаты на этих клетках, продемонстрировав их влияние на клиренс вируса и воспаление. Результаты опубликованы в онлайн-версии журнала Cell Reports. В работе делается вывод о том, что моноциты, инфильтрирующие в легкие, вызывают развитие воспалительных осложнений при COVID-19 и являются важной мишенью для лечения. Кроме того, в исследовании подробно описано, как противовирусный препарат ремдесивир и иммуномодулятор барицитиниб можно использовать отдельно или в комбинации для воздействия на эти моноциты. Также исследование документально подтверждает, что данные, полученные на лабораторной модели, отражают данные in vivo, полученные от госпитализированных пациентов с COVID-19. Использованная модель имитирует последовательность событий, происходящих при заражении человека вирусом COVID-19. В основе подхода выращивание эпителиальных клеток легких человека, верхняя часть которых открыта для воздуха. Эти клетки затем инфицируются SARS-CoV-2, и модель позволяет моноцитам крови трансмигрировать через инфицированный эпителий, где они приобретают вирус. Препараты против COVID-19 могут быть добавлены в любой момент, чтобы измерить, как они влияют на инфекцию и иммунный ответ в эпителиальных клетках и инфильтрирующих легкие моноцитах на разных стадиях.
На ранней стадии инфекции SARS-CoV-2 вирус быстро размножается, но активно избегает привлечения иммунных клеток «первого ответчика», называемых «нейтрофилами», которые могут инициировать раннее воспаление и элиминацию вируса. У инфицированного человека симптомы не проявляются, и фактически он может воспроизвести вирус, а затем избавиться от него, не испытывая при этом никаких симптомов. Но в конце концов реагируют и моноциты; эти иммунные клетки живут дольше, чем нейтрофилы, а также могут трансмигрировать в легкие, чтобы заразиться вирусом и скопировать его генетический шаблон, который заставляет организм усиливать свой иммунный ответ. Именно эта эскалация может спровоцировать избыточное воспаление.
Исследование показало, что комбинированное использование двух одобренных FDA препаратов для лечения COVID-19 — ремдесивира и барицитиниба — усиливает противовирусную сигнализацию и вирусный клиренс моноцитов, инфицированных SARS-CoV-2. Авторы подчеркивают, что время терапевтического лечения имеет решающее значение для предотвращения сильного воспаления, которое может привести к опасному для жизни состоянию, известному как острый респираторный дистресс-синдром.
Medicalxpress
Immunologists identify critical immune cell target to treat COVID-19 complications
Determining how SARS-CoV-2, the virus causing COVID-19, moves from an early stage of infection, when patients are largely asymptomatic, into a later stage in which people may experience life-threatening ...
#постковидныйсиндром #SARSCoV2 #дельта #омикрон #news
Риск развития постковидного синдрома после заражения омикроном почти вдвое ниже, чем после дельты.
Данные, полученные от почти 100 000 человек в Великобритании, показывают, что случаи COVID-19, вызванные коронавирусным вариантом дельта, в 2,4 раза чаще приводят к постковидному синдрому, или лонг-ковиду, чем случаи, вызванные вариантом омикрон, сообщает The Scientist. Исследование, опубликованное в The Lancet, представляет собой первое крупномасштабное исследование, в котором изучается риск развития лонг-ковида от инфицирования омикроном. Данные собраны с использованием приложения COVID Symptom Study, которым управляют исследователи из Королевского колледжа Лондона и которое позволяет людям сообщать о симптомах и результатах тестов. Авторы исследования получили данные от 56 003 человек с положительным результатом на COVID-19 во время волны омикрона, определяемой исследователями как период с 20 декабря 2021 по 9 марта 2022, и 41 361 человека с положительным результатом теста на COVID-19 во время волны дельта, отсчитываемой с 27 ноября 2021 до 1 июня 2022. Считалось, что у участников исследования лонг-ковид, если они сообщали о таких симптомах как усталость, затуманенное сознание или проблемы с сердцем спустя более чем через четыре недели после начала острого COVID-19. В исследование не включены данные о непривитых людях или детях. Но среди привитых взрослых пользователей приложения стойкие симптомы COVID имели место в 4,5 процента случаев заражения омикроном и в 10,8 процента случаев дельты. Разница в риске развития постковидного синдрома между двумя вариантами была наибольшей среди людей, которые были вакцинированы по крайней мере за шесть месяцев до заражения, при этом риск лонг-ковида после заражения омикроном был в четыре раза ниже, чем после дельты.
Полученные результаты довольно хорошо согласуются с данными из бюллетеня Управления национальной статистики Великобритании, опубликованного 6 мая, хотя в этом небольшом исследовании риск лонг-ковида для обоих вариантов у людей с иммунизацией был сопоставим. Как отмечает The Scientist, хотя снижение вероятности затяжного COVID всегда является хорошей новостью, Акико Ивасаки, иммунобиолог из Йельского университета, не участвовавшая в новом исследовании, считает, что 5 процентов случаев, приводящих к длительному COVID, все еще «страшны». Как объясняет изданию соавтор исследования Клэр Стивс из Королевского колледжа Лондона, обратила внимание на быстрое распространение варианта омикрон среди населения, «и поэтому было затронуто гораздо большее количество людей. Так что, к сожалению, общее абсолютное число людей, которые могут заболеть COVID-19, будет расти», заключила она.
Риск развития постковидного синдрома после заражения омикроном почти вдвое ниже, чем после дельты.
Данные, полученные от почти 100 000 человек в Великобритании, показывают, что случаи COVID-19, вызванные коронавирусным вариантом дельта, в 2,4 раза чаще приводят к постковидному синдрому, или лонг-ковиду, чем случаи, вызванные вариантом омикрон, сообщает The Scientist. Исследование, опубликованное в The Lancet, представляет собой первое крупномасштабное исследование, в котором изучается риск развития лонг-ковида от инфицирования омикроном. Данные собраны с использованием приложения COVID Symptom Study, которым управляют исследователи из Королевского колледжа Лондона и которое позволяет людям сообщать о симптомах и результатах тестов. Авторы исследования получили данные от 56 003 человек с положительным результатом на COVID-19 во время волны омикрона, определяемой исследователями как период с 20 декабря 2021 по 9 марта 2022, и 41 361 человека с положительным результатом теста на COVID-19 во время волны дельта, отсчитываемой с 27 ноября 2021 до 1 июня 2022. Считалось, что у участников исследования лонг-ковид, если они сообщали о таких симптомах как усталость, затуманенное сознание или проблемы с сердцем спустя более чем через четыре недели после начала острого COVID-19. В исследование не включены данные о непривитых людях или детях. Но среди привитых взрослых пользователей приложения стойкие симптомы COVID имели место в 4,5 процента случаев заражения омикроном и в 10,8 процента случаев дельты. Разница в риске развития постковидного синдрома между двумя вариантами была наибольшей среди людей, которые были вакцинированы по крайней мере за шесть месяцев до заражения, при этом риск лонг-ковида после заражения омикроном был в четыре раза ниже, чем после дельты.
Полученные результаты довольно хорошо согласуются с данными из бюллетеня Управления национальной статистики Великобритании, опубликованного 6 мая, хотя в этом небольшом исследовании риск лонг-ковида для обоих вариантов у людей с иммунизацией был сопоставим. Как отмечает The Scientist, хотя снижение вероятности затяжного COVID всегда является хорошей новостью, Акико Ивасаки, иммунобиолог из Йельского университета, не участвовавшая в новом исследовании, считает, что 5 процентов случаев, приводящих к длительному COVID, все еще «страшны». Как объясняет изданию соавтор исследования Клэр Стивс из Королевского колледжа Лондона, обратила внимание на быстрое распространение варианта омикрон среди населения, «и поэтому было затронуто гораздо большее количество людей. Так что, к сожалению, общее абсолютное число людей, которые могут заболеть COVID-19, будет расти», заключила она.
The Scientist Magazine®
Omicron Half as Likely as Delta to Lead to Long COVID: Study
People who were vaccinated at least six months prior to infection had the lowest risk of lasting symptoms in a UK study.
#SARSCoV2 #IgM/IgG #ИСЖ #news
Предложен бескровный метод обнаружения антител против коронавируса.
Поскольку глобальная пандемия COVID-19 еще не закончилась, выявление инфицированных лиц остается ключевой проблемой в ограничении распространения коронавируса тяжелого острого респираторного синдрома 2 (SARS-CoV-2). Для быстрого и надежного обнаружения SARS-CoV-2 исследователи Токийского университета в Японии разработали новый метод на основе антител, не требующий забора образца крови, сообщает агрегатор новостей EurekAlert!.
На сегодняшний день преобладающим методом выявления инфицированных коронавирусом является сбор образцов путем взятия мазков из носа и горла. Однако применение этого метода связано с длительным временем обнаружения вирусной РНК (4–6 часов), высокой стоимостью и потребностью в специализированном оборудовании и медицинском персонале, особенно в странах с ограниченными ресурсами. Альтернативным и дополнительным методом подтверждения инфекции COVID-19 является обнаружение антител, специфичных для SARS-CoV-2. Тест-полоски на основе наночастиц золота в настоящее время широко используются для тестирования в пунктах оказания медицинской помощи во многих странах. Они дают чувствительные и надежные результаты в течение 10–20 минут, но для них требуются образцы крови, взятые путем прокола пальца с помощью устройства для прокалывания. Это болезненно и увеличивает риск инфекции или перекрестного заражения, а используемые компоненты набора представляют потенциальную биологическую опасность.
Как поясняет руководитель работ по созданию нового метода Лейлей Бао из Института промышленных наук Токийского университета, чтобы разработать минимально инвазивный метод обнаружения, который позволил бы избежать этих недостатков, была предложена идея отбора проб и тестирования интерстициальной жидкости (ИСЖ), которая находится в слоях эпидермиса и дермы кожи человека. Хотя уровни антител в ИСФ составляют примерно 15–25 % от уровней в крови, антитела IgM/IgG к SARS-CoV-2 все-таки обнаруживались. По словам ученого ИСФ может быть прямой заменой забору крови. После демонстрации того, что ИСФ может быть пригодна для обнаружения антител, исследователи разработали инновационный подход как к образцам, так и к тестированию ИСФ. «Во-первых, мы разработали биоразлагаемые пористые микроиглы из полимолочной кислоты, которые вытягивают ИСФ из кожи человека… а затем мы сконструировали биосенсор для иммуноанализа на бумажной основе, который позволяет обнаруживать специфические антитела к SARS-CoV-2», – говорит один из авторов Бомджун Ким. Объединив эти два элемента, исследователи создали компактный пластырь, способный обнаруживать антитела на месте в течение 3 минут. Новый метод и устройство для его применения описаны в журнале Scientific Reports.
Предложен бескровный метод обнаружения антител против коронавируса.
Поскольку глобальная пандемия COVID-19 еще не закончилась, выявление инфицированных лиц остается ключевой проблемой в ограничении распространения коронавируса тяжелого острого респираторного синдрома 2 (SARS-CoV-2). Для быстрого и надежного обнаружения SARS-CoV-2 исследователи Токийского университета в Японии разработали новый метод на основе антител, не требующий забора образца крови, сообщает агрегатор новостей EurekAlert!.
На сегодняшний день преобладающим методом выявления инфицированных коронавирусом является сбор образцов путем взятия мазков из носа и горла. Однако применение этого метода связано с длительным временем обнаружения вирусной РНК (4–6 часов), высокой стоимостью и потребностью в специализированном оборудовании и медицинском персонале, особенно в странах с ограниченными ресурсами. Альтернативным и дополнительным методом подтверждения инфекции COVID-19 является обнаружение антител, специфичных для SARS-CoV-2. Тест-полоски на основе наночастиц золота в настоящее время широко используются для тестирования в пунктах оказания медицинской помощи во многих странах. Они дают чувствительные и надежные результаты в течение 10–20 минут, но для них требуются образцы крови, взятые путем прокола пальца с помощью устройства для прокалывания. Это болезненно и увеличивает риск инфекции или перекрестного заражения, а используемые компоненты набора представляют потенциальную биологическую опасность.
Как поясняет руководитель работ по созданию нового метода Лейлей Бао из Института промышленных наук Токийского университета, чтобы разработать минимально инвазивный метод обнаружения, который позволил бы избежать этих недостатков, была предложена идея отбора проб и тестирования интерстициальной жидкости (ИСЖ), которая находится в слоях эпидермиса и дермы кожи человека. Хотя уровни антител в ИСФ составляют примерно 15–25 % от уровней в крови, антитела IgM/IgG к SARS-CoV-2 все-таки обнаруживались. По словам ученого ИСФ может быть прямой заменой забору крови. После демонстрации того, что ИСФ может быть пригодна для обнаружения антител, исследователи разработали инновационный подход как к образцам, так и к тестированию ИСФ. «Во-первых, мы разработали биоразлагаемые пористые микроиглы из полимолочной кислоты, которые вытягивают ИСФ из кожи человека… а затем мы сконструировали биосенсор для иммуноанализа на бумажной основе, который позволяет обнаруживать специфические антитела к SARS-CoV-2», – говорит один из авторов Бомджун Ким. Объединив эти два элемента, исследователи создали компактный пластырь, способный обнаруживать антитела на месте в течение 3 минут. Новый метод и устройство для его применения описаны в журнале Scientific Reports.
EurekAlert!
New antibody detection method for coronavirus that does not require a blood sample
Researchers from the Institute of Industrial Science, The University of Tokyo, have developed a rapid and effective antibody detection method for SARS-CoV-2 that is minimally invasive and applicable in resource-limited settings. Their methodology, which uses…
#SARSCoV2 #ACE2 #эластазанейтрофилов #гистонH2A #слюна #врожденныйиммунитет #news
Исследователи обнаружили новый элемент природной защиты от COVID-19 в слюне.
Группа японских исследователей под руководством Мисако Мацубара из Столичного университета Осаки и Кацутоси Йосизато из Университета Осаки опубликовали в Journal of Biochemistry статью, в которой высказывается ряд предположений, в частности, о том, что врожденный иммунитет может предотвратить инфекцию SARS-CoV-2, а начало и тяжесть новой коронавирусной (COVID-19) инфекции зависят от возраста, как и объем и качество слюны, которые значительно снижены у пожилых людей.
Передача вируса SARS-CoV-2 происходит при связывании спайкового белка S1 вирусной оболочки с рецептором ангиотензинпревращающего фермента 2 (ACE2) на мембране клеток человека. Слюна и клетки полости рта являются важными путями передачи инфекции COVID-19. Авторы показали, что слюна неинфицированных (здоровых) людей, инфицированных SARS-CoV-2, препятствует связыванию S1 и ACE2 в зависимости от концентрации. Они идентифицировали четыре белка в слюне, которые связываются с ACE2, и среди этих белков эластаза нейтрофилов и гистон H2A заметно ингибируют связывание S1 и ACE2. Нейтрофильная эластаза и H2A представляют собой положительно заряженные белки, которые действуют как барьер против связывания SARS-CoV-2, покрывая отрицательно заряженный сайт связывания S1 ACE2. Исследовательская группа также показала, что катионные полипептиды, такие как ε-поли-L-лизин, одинаково эффективны в предотвращении связывания S1 с ACE2.
По словам Кацутоси Йосизато, которые приводит издание news-medical.net, это исследование показывает, что нейтрофилы слюны умеренно активируются местными микроорганизмами и постоянно выделяют различные белки, среди которых эластаза и гистон H2A, способствующие самозащите от инфекции SARS-CoV-2 благодаря тому, что они маскируют рецептор ACE2 на клетках-хозяевах. «Мы считаем, что наши результаты будут способствовать разработке методов не только предотвращения или лечения инфекции COVID-19, но и предотвращения заражения людей неизвестными вирусами в будущем на уровне врожденного иммунитета», говорит профессор Йосизато.
Исследователи обнаружили новый элемент природной защиты от COVID-19 в слюне.
Группа японских исследователей под руководством Мисако Мацубара из Столичного университета Осаки и Кацутоси Йосизато из Университета Осаки опубликовали в Journal of Biochemistry статью, в которой высказывается ряд предположений, в частности, о том, что врожденный иммунитет может предотвратить инфекцию SARS-CoV-2, а начало и тяжесть новой коронавирусной (COVID-19) инфекции зависят от возраста, как и объем и качество слюны, которые значительно снижены у пожилых людей.
Передача вируса SARS-CoV-2 происходит при связывании спайкового белка S1 вирусной оболочки с рецептором ангиотензинпревращающего фермента 2 (ACE2) на мембране клеток человека. Слюна и клетки полости рта являются важными путями передачи инфекции COVID-19. Авторы показали, что слюна неинфицированных (здоровых) людей, инфицированных SARS-CoV-2, препятствует связыванию S1 и ACE2 в зависимости от концентрации. Они идентифицировали четыре белка в слюне, которые связываются с ACE2, и среди этих белков эластаза нейтрофилов и гистон H2A заметно ингибируют связывание S1 и ACE2. Нейтрофильная эластаза и H2A представляют собой положительно заряженные белки, которые действуют как барьер против связывания SARS-CoV-2, покрывая отрицательно заряженный сайт связывания S1 ACE2. Исследовательская группа также показала, что катионные полипептиды, такие как ε-поли-L-лизин, одинаково эффективны в предотвращении связывания S1 с ACE2.
По словам Кацутоси Йосизато, которые приводит издание news-medical.net, это исследование показывает, что нейтрофилы слюны умеренно активируются местными микроорганизмами и постоянно выделяют различные белки, среди которых эластаза и гистон H2A, способствующие самозащите от инфекции SARS-CoV-2 благодаря тому, что они маскируют рецептор ACE2 на клетках-хозяевах. «Мы считаем, что наши результаты будут способствовать разработке методов не только предотвращения или лечения инфекции COVID-19, но и предотвращения заражения людей неизвестными вирусами в будущем на уровне врожденного иммунитета», говорит профессор Йосизато.
OUP Academic
Cloaking the ACE2 receptor with salivary cationic proteins inhibits SARS-CoV-2 entry
Abstract. Saliva contributes to the innate immune system, which suggests that it can prevent SARS-CoV-2 entry. We studied the ability of healthy salivary protei