#зоопарк_одобряет #дорогая_редакция
Есть такие бактериальные белки - инкапсулины. Название уже намекает - они самопроизвольно собираются в капсулы, по типу капсида.
Если такие белки генетически закодировать и засунуть в эукариотическую клетку, то они будут там синтезироваться и самопроизвольно собираться в эти капсулы. Один из инкапсулинов из бактерии Quasibacillus thermotolerans (Qt) также несёт белок, который умеет не просто накачивать внутрь такой капсулы железо, но и минерализовать его, превращая в магнитные наночастицы. В результате становится управлять возможным эукариотическими клетками с помощью магнитного поля, просто-напросто двигая их туда или сюда. Об этом - свежая работа большого международного коллектива из Германии, США, Нидерландов и России (наши соотечественники - из МИСИС @nust_misis, Пироговки @daily_2med и НИИ ФХБ МГУ).
Статья вышла в Advanced Functional Materials (IF = 18.5). Кстати, эта работа тоже была поддержана РНФ, причем международным грантом
https://advanced.onlinelibrary.wiley.com/doi/10.1002/adfm.202418013
Есть такие бактериальные белки - инкапсулины. Название уже намекает - они самопроизвольно собираются в капсулы, по типу капсида.
Если такие белки генетически закодировать и засунуть в эукариотическую клетку, то они будут там синтезироваться и самопроизвольно собираться в эти капсулы. Один из инкапсулинов из бактерии Quasibacillus thermotolerans (Qt) также несёт белок, который умеет не просто накачивать внутрь такой капсулы железо, но и минерализовать его, превращая в магнитные наночастицы. В результате становится управлять возможным эукариотическими клетками с помощью магнитного поля, просто-напросто двигая их туда или сюда. Об этом - свежая работа большого международного коллектива из Германии, США, Нидерландов и России (наши соотечественники - из МИСИС @nust_misis, Пироговки @daily_2med и НИИ ФХБ МГУ).
Статья вышла в Advanced Functional Materials (IF = 18.5). Кстати, эта работа тоже была поддержана РНФ, причем международным грантом
https://advanced.onlinelibrary.wiley.com/doi/10.1002/adfm.202418013
The Advanced Portfolio
Genetically Controlled Iron Oxide Biomineralization in Encapsulin Nanocompartments for Magnetic Manipulation of a Mammalian Cell…
Genetically expressed encapsulin nanocompartments from Q. thermotolerans in mammalian cells enable the compartmentalization of Fe biomineralization and formation of ≈30 nm iron-oxide cores containing...
#дорогая_редакция #зоопарк_одобряет
Из растительной биомассы можно получить целый ряд соединений фурана (например, фурфурол) - ценное сырье для химпрома, которое можно превращать в нужные продукты в сравнительно небольшое число стадий. Часто один из первых этапов - разложение сильной кислотой, и здесь важно грамотно подобрать растворитель, потому что и выход, и состав продуктов от этого зависят напрямую, а для промышленности это многие и многие тонны.
Свежая работа химиков школы Ананикова @ananikovlab - ТулГУ @tulauniversity и ИОХ #РАН @ziocras - большое исследование того, насколько разные производные фурана стабильны в широком диапазоне условий, по сути, своего рода набор правил выбора растворителей для лабораторных синтезов и, в перспективе, не только.
Статья вышла в ChemSusChem (IF = 7.5) и попала на обложку свежего выпуска журнала
Из растительной биомассы можно получить целый ряд соединений фурана (например, фурфурол) - ценное сырье для химпрома, которое можно превращать в нужные продукты в сравнительно небольшое число стадий. Часто один из первых этапов - разложение сильной кислотой, и здесь важно грамотно подобрать растворитель, потому что и выход, и состав продуктов от этого зависят напрямую, а для промышленности это многие и многие тонны.
Свежая работа химиков школы Ананикова @ananikovlab - ТулГУ @tulauniversity и ИОХ #РАН @ziocras - большое исследование того, насколько разные производные фурана стабильны в широком диапазоне условий, по сути, своего рода набор правил выбора растворителей для лабораторных синтезов и, в перспективе, не только.
Статья вышла в ChemSusChem (IF = 7.5) и попала на обложку свежего выпуска журнала
#дорогая_редакция
Смотрите и не говорите, что не видели - так выглядит упаковка для сыпучих реактивов из Китая.
Интересно, нужно ли ее декларировать как товар двойного назначения?
Хотя можно же просто написать "для подготовки грантового отчета", и это тоже будет правда
Смотрите и не говорите, что не видели - так выглядит упаковка для сыпучих реактивов из Китая.
Интересно, нужно ли ее декларировать как товар двойного назначения?
Хотя можно же просто написать "для подготовки грантового отчета", и это тоже будет правда
#зоопарк_одобряет #дорогая_редакция
Гомологичная рекомбинация - это безошибочный способ устранения двуцепочечных разрывов в геноме. В случае нарушения этого механизма (состояние, называемое дефицитом гомологичной рекомбинации - HRD), например, из-за мутаций в генах, кодирующих соответствующие белки, в геноме накапливается большое число крупных перестроек.
В начале 2000х годов было показано, что опухоли с HRD хорошо и прицельно убиваются соединениями-ингибиторами фермента PARP1, который участвует во всех механизмах репарации ДНК. И тогда встал вопрос о том, как выявлять опухоли с таким нарушением. Изначально для этого выявляли мутации в двух генах, которые регулируют многие процессы при гомологичной рекомбинации - BRCA1 и BRCA2, но стало понятно, что это только около 20% всех пациентов, которым эти препараты помогают. Тогда нашли, что в клетках с HRD есть особые паттерны крупных перестроек, по которым можно достаточно надежно предсказывать, будет ли препарат эффективен.
Свежий обзор коллег из ИХБФМ СО #РАН (Новосибирск) - о выявлении этих паттернов, объяснении механизмов их возникновения, проблемах у текущих подходов и возможных новых направлениях развития этих подходов.
Статья опубликована в Cancer and Metastasis Reviews (IF = 7.7)
https://link.springer.com/article/10.1007/s10555-024-10238-y
Гомологичная рекомбинация - это безошибочный способ устранения двуцепочечных разрывов в геноме. В случае нарушения этого механизма (состояние, называемое дефицитом гомологичной рекомбинации - HRD), например, из-за мутаций в генах, кодирующих соответствующие белки, в геноме накапливается большое число крупных перестроек.
В начале 2000х годов было показано, что опухоли с HRD хорошо и прицельно убиваются соединениями-ингибиторами фермента PARP1, который участвует во всех механизмах репарации ДНК. И тогда встал вопрос о том, как выявлять опухоли с таким нарушением. Изначально для этого выявляли мутации в двух генах, которые регулируют многие процессы при гомологичной рекомбинации - BRCA1 и BRCA2, но стало понятно, что это только около 20% всех пациентов, которым эти препараты помогают. Тогда нашли, что в клетках с HRD есть особые паттерны крупных перестроек, по которым можно достаточно надежно предсказывать, будет ли препарат эффективен.
Свежий обзор коллег из ИХБФМ СО #РАН (Новосибирск) - о выявлении этих паттернов, объяснении механизмов их возникновения, проблемах у текущих подходов и возможных новых направлениях развития этих подходов.
Статья опубликована в Cancer and Metastasis Reviews (IF = 7.7)
https://link.springer.com/article/10.1007/s10555-024-10238-y
SpringerLink
Homologous recombination deficiency (HRD) diagnostics: underlying mechanisms and new perspectives
Cancer and Metastasis Reviews - Homologous recombination deficiency (HRD) is considered a universal and effective sign of a tumor’s sensitivity to poly(ADP-ribose) polymerase (PARP)...
#зоопарк_одобряет #дорогая_редакция
Новые люминесцентные метки против подделок: ФИАНовцы @lpi_ras совместно с коллегами из Института спектроскопии #РАН предложили оригинальный подход, основанный на различии в скорости фотовыцветания люминесцентных меток. Они получили серию комплексов Eu3+ с галогенированными дикетонами, обладающих идентичным спектром люминесценции, но различной скоростью фотовыцветания при УФ-
облучении. На их основе была создана печатная защитная метка, невидимая при обычном освещении, но и люминесцирующая в УФ-лучах. При малой мощности излучения метка люминесцирует равномерно, однако при повышении мощности часть метки быстро выцветает, и становится видна зашифрованная информация.
Практическое применение тут вполне очевидно: контроль качества товаров, требующих защиты от света, а также новый подход к идентификации подлинности документов и ценных бумаг.
Статья опубликована в журнале Materials Chemistry Frontiers (IF 6.0)
https://pubs.rsc.org/en/content/articlelanding/2025/qm/d4qm00933a
Новые люминесцентные метки против подделок: ФИАНовцы @lpi_ras совместно с коллегами из Института спектроскопии #РАН предложили оригинальный подход, основанный на различии в скорости фотовыцветания люминесцентных меток. Они получили серию комплексов Eu3+ с галогенированными дикетонами, обладающих идентичным спектром люминесценции, но различной скоростью фотовыцветания при УФ-
облучении. На их основе была создана печатная защитная метка, невидимая при обычном освещении, но и люминесцирующая в УФ-лучах. При малой мощности излучения метка люминесцирует равномерно, однако при повышении мощности часть метки быстро выцветает, и становится видна зашифрованная информация.
Практическое применение тут вполне очевидно: контроль качества товаров, требующих защиты от света, а также новый подход к идентификации подлинности документов и ценных бумаг.
Статья опубликована в журнале Materials Chemistry Frontiers (IF 6.0)
https://pubs.rsc.org/en/content/articlelanding/2025/qm/d4qm00933a
pubs.rsc.org
Halogenated Dibenzoylmethane Eu3+ Complexes as Spectroscopic Markers: Pioneering Photobleaching Strategy for Counterfeit Applications…
A novel method for identifying counterfeit goods based on the difference between photobleaching rates of spectroscopic marker components is proposed. Controlled photobleaching of the dye is achieved via introduction of halogens (I, Cl, Br, F) into the aromatic…
#зоопарк_одобряет #дорогая_редакция
Всякие разные металл-графеновые наночастицы активно изучаются материаловедами, поскольку там часто возникают необычные свойства (типа аномалий теплопроводности, что может быть полезно для теплообменников в наноэлектронике).
В совместной работе экспериментаторов из ОИВТ РАН и "модельеров" из Уфы (ИПСМ РАН, группа проф. Баимовой @budni_professora) изучен синтез композитных частиц графен/медь достаточно простым плазменно-химическим методом.
Полученные в плазме частицы выглядят как наночастицы меди, завернутые в чешуйки графена, однако из эксперимента не удавалось достоверно установить, от чего зависит структура разных композитных частиц и как именно они формируются. С помощью моделирования было показано, что наночастицы меди, двигаясь с разной скоростью в потоке плазмы, сталкиваются с чешуйками графена, и конечная структура композитной частицы зависит от скорости движения. Наночастицы меди могут прилипать к графену, отталкиваться от него или проходить сквозь графеновую чешуйку, разрушая ковалентные связи. Во всех трех случаях структура частиц будет отличаться, создавая многообразие композитных наночастиц в полученном порошке (и, соответственно, влиять на его свойства).
Статья опубликована в Applied Surface Science (IF = 6.3)
https://www.sciencedirect.com/science/article/abs/pii/S0169433225002375
Всякие разные металл-графеновые наночастицы активно изучаются материаловедами, поскольку там часто возникают необычные свойства (типа аномалий теплопроводности, что может быть полезно для теплообменников в наноэлектронике).
В совместной работе экспериментаторов из ОИВТ РАН и "модельеров" из Уфы (ИПСМ РАН, группа проф. Баимовой @budni_professora) изучен синтез композитных частиц графен/медь достаточно простым плазменно-химическим методом.
Полученные в плазме частицы выглядят как наночастицы меди, завернутые в чешуйки графена, однако из эксперимента не удавалось достоверно установить, от чего зависит структура разных композитных частиц и как именно они формируются. С помощью моделирования было показано, что наночастицы меди, двигаясь с разной скоростью в потоке плазмы, сталкиваются с чешуйками графена, и конечная структура композитной частицы зависит от скорости движения. Наночастицы меди могут прилипать к графену, отталкиваться от него или проходить сквозь графеновую чешуйку, разрушая ковалентные связи. Во всех трех случаях структура частиц будет отличаться, создавая многообразие композитных наночастиц в полученном порошке (и, соответственно, влиять на его свойства).
Статья опубликована в Applied Surface Science (IF = 6.3)
https://www.sciencedirect.com/science/article/abs/pii/S0169433225002375
#зоопарк_одобряет #дорогая_редакция
При плавлении большинство веществ поглощают тепло и изменяются в объёме. Попытки связать эти два эффекта для молекулярных соединений предпринимались ещё с середины прошлого века, но так и не увенчались успехом. В свежей статье коллегами из @kznuniversity было установлено, что отношение между изменениями энтальпии и молярного объёма при плавлении зависит от формы молекулы. Оно принимает минимальное значение в случае сферических молекул и повышается до определенного предела для длинноцепочечных алифатических объектов. С помощью структурной характеристики, названной «параметром сферичности», можно рассчитать отношение энтальпии плавления к изменению молярного объёма в ходе этого процесса, не прибегая к экспериментальным измерениям.
Найденная взаимосвязь между двумя фундаментальными величинами может углубить представления о термодинамике процесса плавления и о том, какие физико-химические и структурные параметры вещества влияют на энтальпию плавления. С практической точки зрения это уравнение интересно прежде всего тем, что оно открывает возможность предсказывать наклоны линий плавления на фазовых диаграммах по молекулярной структуре.
Статья вышла в Journal of Molecular Liquids (IF = 5.3).
https://www.sciencedirect.com/science/article/abs/pii/S0167732225002338
При плавлении большинство веществ поглощают тепло и изменяются в объёме. Попытки связать эти два эффекта для молекулярных соединений предпринимались ещё с середины прошлого века, но так и не увенчались успехом. В свежей статье коллегами из @kznuniversity было установлено, что отношение между изменениями энтальпии и молярного объёма при плавлении зависит от формы молекулы. Оно принимает минимальное значение в случае сферических молекул и повышается до определенного предела для длинноцепочечных алифатических объектов. С помощью структурной характеристики, названной «параметром сферичности», можно рассчитать отношение энтальпии плавления к изменению молярного объёма в ходе этого процесса, не прибегая к экспериментальным измерениям.
Найденная взаимосвязь между двумя фундаментальными величинами может углубить представления о термодинамике процесса плавления и о том, какие физико-химические и структурные параметры вещества влияют на энтальпию плавления. С практической точки зрения это уравнение интересно прежде всего тем, что оно открывает возможность предсказывать наклоны линий плавления на фазовых диаграммах по молекулярной структуре.
Статья вышла в Journal of Molecular Liquids (IF = 5.3).
https://www.sciencedirect.com/science/article/abs/pii/S0167732225002338
#дорогая_редакция #зоопарк_одобряет
Дельта-15 или Омега-3: коллеги из Института физиологии растений РАН решили давний спор биохимиков
Полиненасыщенные жирные кислоты из семейства «омега-3» — незаменимый элемент питания теплокровных организмов, в том числе и человека. За их биосинтез отвечает целое семейство ферментов - десатуразы жирных кислот, которые вводят в структуру жирной кислоты ненасыщенные (двойные) связи. От того, в какое положение углеродной цепи десатураза вводит –С=С– связь, зависит не только геометрия молекулы, но и её физико-химические (например, окислительная стабильность) и функциональные, нутрицевтические свойства.
В середине 70-х годов прошлого века было предложено две классификации жирных кислот, основанных на том, от какого конца молекулы десатураза «отсчитывает» атомы углерода: если от карбоксильного конца — то такие жирные кислоты классифицировали как дельта-X (Δ-Х), если же от метильного — то как омега (ω-Х). Наибольшее количество вопросов вызывала десатураза, вводящая третью двойную связь в молекулу линолевой кислоты (18:2Δ9,12), в результате чего образовывалась α-линоленовая (18:3Δ9,12,15) кислота, которая могла быть классифицирована и как дельта-15, и как омега-3. Учитывая важность этой кислоты для питания человека, вопрос о том, как именно фермент работает, активно исследовался разными группами ученых по всему миру, однако, получаемые ими результаты в силу разных причин не позволяли сделать вывод о том, как фермент «считает» углеродные атомы в молекуле-субстрате — линолевой кислоте.
В свежей работе коллектив исследователей из Института физиологии растений РАН (Москва) поставил точку в многолетней дискуссии биохимиков. Для этого они получали ряд генетически-модифицированных штаммов цианобактерий с разным набором десатураз. Например, один из них содержал десатуразы, отвечающие за введение связей только в положение дельта-9 и дельта-15(или омега-3?). Эти штаммы выращивали в присутствии ненасыщенных жирных кислот с различным положением двойных связей, после чего методом масс-спектрометрии устанавливали структуру и положение связей в синтезированных ими жирных кислотах.
Оказалось, что в отсутствие двух двойных связей в структуре ацила, исследуемая десатураза, которая должна была отвечать за введение связи в дельта-15 или омега-3 положение вела себя "подобно пьянице, пытающемуся попасть ключом в замочную скважину" (с) один из авторов работы — в результате её действия образовывались 16:2Δ9,14, 18:2Δ9,13, 18:2Δ9,14 и 18:2Δ9,15 кислоты. Такой результат не позволял сделать однозначные выводы о том, как именно фермент «считает» углеродные атомы в жирной кислоте, но он позволил сформулировать предположение о том, что для корректной работы фермента, по-видимому, необходимо наличие двух двойных связей.
В серии дополнительных экспериментов удалось убедительно показать, что фермент проявлял высокую «чувствительность» к геометрии диненасыщенной жирной кислоты, используемой им в качестве субстрата. Оказалось, что для успешной его работы нужно, чтобы длина фрагмента от углеродного атома карбоксильной группы составляла 12,17 ангстрем (А), а длина фрагмента от метильного конца до второй связи должна быть не меньше 4,5, но не длиннее 7,6А, что характерно для диненасыщенных С16-С18 жирных кислот с двойными связями в дельта-9 и дельта-12(13) положениях. Значит, десатураза, отвечающая за биосинтез α-линоленовой кислоты работает скорее как дельта-15, но только при соблюдении точной геометрии ацила-субстрата.
Статья опубликована в Biochimie - несмотря на скромный IF (3.3), это честный хороший первый квартиль. Вот обычная ссылка, а вот авторская, где еще почти два месяца будет бесплатный доступ.
Дельта-15 или Омега-3: коллеги из Института физиологии растений РАН решили давний спор биохимиков
Полиненасыщенные жирные кислоты из семейства «омега-3» — незаменимый элемент питания теплокровных организмов, в том числе и человека. За их биосинтез отвечает целое семейство ферментов - десатуразы жирных кислот, которые вводят в структуру жирной кислоты ненасыщенные (двойные) связи. От того, в какое положение углеродной цепи десатураза вводит –С=С– связь, зависит не только геометрия молекулы, но и её физико-химические (например, окислительная стабильность) и функциональные, нутрицевтические свойства.
В середине 70-х годов прошлого века было предложено две классификации жирных кислот, основанных на том, от какого конца молекулы десатураза «отсчитывает» атомы углерода: если от карбоксильного конца — то такие жирные кислоты классифицировали как дельта-X (Δ-Х), если же от метильного — то как омега (ω-Х). Наибольшее количество вопросов вызывала десатураза, вводящая третью двойную связь в молекулу линолевой кислоты (18:2Δ9,12), в результате чего образовывалась α-линоленовая (18:3Δ9,12,15) кислота, которая могла быть классифицирована и как дельта-15, и как омега-3. Учитывая важность этой кислоты для питания человека, вопрос о том, как именно фермент работает, активно исследовался разными группами ученых по всему миру, однако, получаемые ими результаты в силу разных причин не позволяли сделать вывод о том, как фермент «считает» углеродные атомы в молекуле-субстрате — линолевой кислоте.
В свежей работе коллектив исследователей из Института физиологии растений РАН (Москва) поставил точку в многолетней дискуссии биохимиков. Для этого они получали ряд генетически-модифицированных штаммов цианобактерий с разным набором десатураз. Например, один из них содержал десатуразы, отвечающие за введение связей только в положение дельта-9 и дельта-15(или омега-3?). Эти штаммы выращивали в присутствии ненасыщенных жирных кислот с различным положением двойных связей, после чего методом масс-спектрометрии устанавливали структуру и положение связей в синтезированных ими жирных кислотах.
Оказалось, что в отсутствие двух двойных связей в структуре ацила, исследуемая десатураза, которая должна была отвечать за введение связи в дельта-15 или омега-3 положение вела себя "подобно пьянице, пытающемуся попасть ключом в замочную скважину" (с) один из авторов работы — в результате её действия образовывались 16:2Δ9,14, 18:2Δ9,13, 18:2Δ9,14 и 18:2Δ9,15 кислоты. Такой результат не позволял сделать однозначные выводы о том, как именно фермент «считает» углеродные атомы в жирной кислоте, но он позволил сформулировать предположение о том, что для корректной работы фермента, по-видимому, необходимо наличие двух двойных связей.
В серии дополнительных экспериментов удалось убедительно показать, что фермент проявлял высокую «чувствительность» к геометрии диненасыщенной жирной кислоты, используемой им в качестве субстрата. Оказалось, что для успешной его работы нужно, чтобы длина фрагмента от углеродного атома карбоксильной группы составляла 12,17 ангстрем (А), а длина фрагмента от метильного конца до второй связи должна быть не меньше 4,5, но не длиннее 7,6А, что характерно для диненасыщенных С16-С18 жирных кислот с двойными связями в дельта-9 и дельта-12(13) положениях. Значит, десатураза, отвечающая за биосинтез α-линоленовой кислоты работает скорее как дельта-15, но только при соблюдении точной геометрии ацила-субстрата.
Статья опубликована в Biochimie - несмотря на скромный IF (3.3), это честный хороший первый квартиль. Вот обычная ссылка, а вот авторская, где еще почти два месяца будет бесплатный доступ.