Зоопарк из слоновой кости
20.2K subscribers
1.11K photos
60 videos
19 files
3.49K links
Руководство по выживанию в науке, полезные советы начинающим, новости из научной жизни и просто околонаучный треп
Версия VK: https://vk.com/ivory_zoo

Вопросы? Предложения? @ivory_zoo
Download Telegram
#зоопарк_одобряет #дорогая_редакция

Разработка новых контрастируюших агентов для МРТ продолжается во многих группах по всему миру. Казанские химики из ИОФХ #РАН @IOPCArbuzov, КФУ @kznuniversity и КНИТУ-КХТУ совместно с биологами из КИББ РАН и ИЦиГ СО РАН @icgsoran (Новосибирск) создали бимодальные контрастеры, способные эффективно работать в режимах T1- и Т2-взвешенной МРТ. В основе - наночастицы оксида железа и ионы марганца (эта комбинация и дает эффект бимодальности), вокруг - силикатная оболочка, которую можно модицифировать под накопление в разных тканях - например, под кишечник, печень или и почки (на мышах, по крайней мере, это работает ок).

Работа опубликована в Journal of Alloys and Compounds (IF = 5.8)

https://www.sciencedirect.com/science/article/abs/pii/S0925838824031682
#зоопарк_одобряет #дорогая_редакция

Надоели боты, постящие в комментах ссылки на ресурсы о кетогенной диете? Ловите кое-что новенькое на эту тему от ученых.

Коллеги из МГУ, ИФАВ #РАН (Черноголовка) и Воронежского госуниверситета @vsumain изучили влияние кетогенной диеты (для непосвященных: это когда в еде преобладают жиры и белки и содержится минимальное количество углеводов) на транскриптом головного мозга крыс, микрофлору кишечника и всякие интересные параметры крови. Причем все эти изменения были изучены не только при самой диете, но и при экспериментально вызванном инсульте (сравнения ради).

Изучив экспрессию нескольких тысяч генов и сотен видов бактерий кишечника, исследователи показали, что такая диета, действительно, влияет на метаболизм клеток мозга, работу митохондрий и процесс воспаления. Сам инсульт изменял функционирование куда большего числа генов, что неудивительно для такой тяжелой патологии. К сожалению, направление изменений в экспрессии генов при диете во многих случаях совпадало с эффектами инсульта, поэтому неврологические проблемы, вызванные поражением мозга, при диете проявлялись еще сильнее. Хотя такая диета давно и довольно успешно применяется для лечения эпилепсии, при инсульте ее применять, очевидно, не стоит.

Статья опубликована в Brain, Behavior, and Immunity (IF = 8.8)

https://www.sciencedirect.com/science/article/abs/pii/S0889159124006457

(вот пока еще активная ссылка для бесплатного скачивания: https://authors.elsevier.com/a/1jvxO3AAzzl3Ov)
#зоопарк_одобряет #дорогая_редакция

Расшифровка механизмов, регулирующих активность генов - одна из ключевых проблем современных молбиологии и генетики. Как показывают последние работы, геномных данных может быть недостаточно, и для решения задачи необходимы данные о экспрессии миллионов случайных регуляторных последовательностей, получаемые в ходе массовых экспериментов. В поисках способа, как работать с этой информацией, появился конкурс DREAM-2022.

Первое место заняла полносверточная нейросеть от российской команды autosome.ru с участниками из МГУ и двух институтов #РАН - белка (Пущино) и общей генетики (Москва). Они и вошли в число ключевых авторов работы, на днях опубликованной в Nature Biotechnology (IF = 33.1)

В работе организаторы конкурса вместе с авторами победившей архитектуры провели анализ решений, представленных в конкурсе, и показали, что метод на основе комбинации этих решений не только позволяет решать задачи наподобие исходных, но и в других задачах, связанных с эпигенетикой и регуляторной геномикой, показывает state-of-the-art результаты.

https://www.nature.com/articles/s41587-024-02414-w
#зоопарк_одобряет #дорогая_редакция

Диаман или "двумерный алмаз" - новый углеродный материал, который имеет довольно любопытную структуру. Ее можно представить как два листа графена, которые под действием давления и температуры объединились ковалентными связями в алмазную решетку. Как и у графена, у него есть два основных направления решетки - зигзаг и кресло, а также промежуточные хиральные направления. Важнейшее же его отличие от графена - у него есть запрещенная зона.

В свежей работе из Уфы (Институт проблем сверхпластичности металлов #РАН, группа проф. Баимовой @budni_professora) впервые была исследована зависимость прочности диамана от направления растяжения.
При изменении направления от зигзага к креслу, происходит немонотонное увеличение прочности (максимум - при угле растяжения 10 градусов). Еще более интересно фазовое превращение, которое может происходить в процессе растяжения: например, диаман с хиральностью 5 градусов трансформируется в диаман с хиральностью 10. Скорее всего, этот параметр должен сказываться и на параметрах запрещенной зоны - а это уже интересно для применения этого материала в микроэлектронике.

Статья опубликована в Applied Surface Science (IF = 6.3)

https://www.sciencedirect.com/science/article/abs/pii/S0169433224021561
#зоопарк_одобряет #дорогая_редакция

Металлическое стекло обладает уникальным набором свойств: прочностью, эластичностью, высоким пределом текучести, большими упругими деформациями, высокой твердостью. Проблема с получением новых вариантов этого типа материалов (то есть аморфных сплавов) заключается в том, что они образуются в: 1) многокомпонентных системах и 2) очень узком диапазоне концентраций, так что искать их обычным перебором - "скринингом" очень и очень трудно, а то и вовсе невозможно.

Ученые из Института металлургии УрО #РАН (Екатеринбург) создали новую теоретическую модель, которая позволяет предсказывать составы четырехкомпонентных стекол в системе Gd-Sc-Co-Al. Один из таких теоретически смоделированных вариантов стекла (Sc33Gd32Co19Al16) был впервые получен экспериментально - и он явно не последний, ибо модель позволяет найти множество новых материалов.

Результаты опубликованы в Intermetallics (IF = 4.3)

https://www.sciencedirect.com/science/article/abs/pii/S0966979524003418
#зоопарк_одобряет #дорогая_редакция

Новая экспресс-методика биохимического анализа крови на основе ИК-спектроскопии и машинного обучения, не требующая реагентов? Нет, это не фантастика, это новая разработка Института спектроскопии #РАН (Троицк), ИТМО и их китайских коллег. Разработанный ими подход позволяет оценивать активность ферментов печени, уровень кальция, железа, холестерина и много чего еще. Для анализа нужно всего 2 мкл (микролитра) крови. Метод вполне может стать отличной альтернативой традиционным анализам, особенно в мобильных условиях, тем более что он занимает очень мало времени.

В настоящий момент успешные испытания прошли в 67ой ГКБ (Москва), идет подготовка к совместным исследованиям с Сеченовским Университетом и НИИ Склифосовского.

Статья опубликована в Spectrochimica Acta Part A: Molecular and Biomolecular Spectroscopy (IF = 4.3)

https://www.sciencedirect.com/science/article/abs/pii/S1386142524014495
#зоопарк_одобряет #дорогая_редакция

Коллеги из Института глазных болезней им. Краснова (Москва), КФУ @kznuniversity и Уфы (Институт биохимии и генетики #РАН) разработали клеточный краситель на основе неодима и с его помощью визуализировали в клетках ранее не описанные зоны накопления неорганического фосфата (Pi).

Pi играет ключевую роль в энергетическом обмене между клетками. Оригинальный метод визуализации Pi позволил исследователям описать особенности межклеточного энергетического транспорта, в том числе показав, что при апоптозе Pi через филоподии активнее передается от умирающих клеток к соседним здоровым. Возможность "подсветки" зон обмена Pi потенциально может помочь в создании методов точечного терапевтического воздействия на зоны с нарушенным энергетическим обменом, что актуально для лечения, например, таких заболеваний, как сердечная недостаточность и миопатии.

Статья вышла в International Journal of Molecular Sciences (IF = 4.9)

https://www.mdpi.com/1422-0067/25/20/11076
#зоопарк_одобряет #дорогая_редакция

Разработка новых сенсоров, позволяющих быстро и надежно определять концентрацию глюкозы в крови, важна по вполне понятным причинам (диабет никуда не девался). Особенно интересны малоинвазивные системы, и здесь соревнование идет за несколько параметров - стабильность, чувствительность и биосовместимость.

Ученые из ТулГУ @tulauniversity совместно с коллегами из ИОХ РАН @ziocras (если точнее, то это команда академика Ананикова @ananikovlab), ЮРГПУ @urgpunpi_official (Ростов-на-Дону) и ИФХЭ #РАН разработали новый гибридный нанокомпозитный материал на основе кремнийорганического полимера с параметрами, делающими его прекрасным кандидатом для создания таких сенсоров. А использование методов машинного обучения позволяет существенно повысить селективность анализа глюкозы в сложных многокомпонентных пробах.

Статья вышла в ACS Applied Polymer Materials (IF = 4.5)

https://pubs.acs.org/doi/10.1021/acsapm.4c01394
#зоопарк_одобряет #дорогая_редакция

Невозможность нормальной работы мышц, например при постельном режиме или в условиях невесомости, достаточно быстро вызывает серьезные проблемы с мышечными функциями и атрофию. Почему это происходит и как этого избежать, пока еще не совсем понятно.

Ученые из Института медико-биологических проблем #РАН (Москва) на модели имитации эффектов невесомости на мышцах задних конечностей крыс показали, что в данных условиях в митохондриях мышечных волокон происходит избыточное накопление кальция и возрастает активность некоторых дыхательных ферментов – такая же ситуация характерна для серьезных заболеваний мышц, например для миодистрофии Дюшенна. Введение антиоксиданта mito-TEMPO предотвращает как избыток кальция в митохондриях, так и атрофию, но вот повышение утомляемости и снижение силы мышц не предотвращает.

Статья опубликована в журнале Free radical biology and medicine (IF=7.1)

https://www.sciencedirect.com/science/article/abs/pii/S0891584924009870
#зоопарк_одобряет #дорогая_редакция

Свежая статья в том самом "большом" Nature (мы о научной составляющей этого издания, конечно же) от международного коллектива, значительную часть которого составили наши соотечественники из МГУ, Института археологии #РАН, Эрмитажа, Калмыцкого научного центра РАН, Института истории, археологии и этнографии ДФИЦ РАН (Махачкала) и сразу нескольких региональных музеев.

Кавказ и прилегающие территории были очень важным местом в истории Европы и Азии, особенно в период бронзового века благодаря запасам металлов.

В работе показаны наиболее вероятные модели нескольких миграций в регион: до неолитической революции – на основе нескольких популяций охотников-собирателей, и после неолита – земледельцев и скотоводов. Исходными данными стали геномы 131 человека из 38 археологических памятников с территории южного и северного Кавказа и Предкавказья. в периоды мезолита-неолита до позднего бронзового века (7-2 тыс. до н.э.) - отслеживая их динамику, можно было понять и "маршруты" представителей разных археологических культур. По сути, впервые были созданы модели формирования некоторых археологических культур на основе предшествующих - раньше эту эволюцию изучали по изменению материальной культуры и данным антропологии.

https://www.nature.com/articles/s41586-024-08113-5
#дорогая_редакция #зоопарк_одобряет

Термогенетика - это процесс, при котором нейроны мозга управляются с помощью термочувствительных ионных каналов. Так можно стимулировать мозг (человека в том числе) без оперативного вмешательства. Коллектив из Пироговки @daily_2med, ИБХ #РАН и МГУ показал, что термочувствительный ионный канал TRPV1 у человека может служить безопасным и эффективным т инструментом для хронической нейромодуляции.

Более ранние исследования сталкивались с трудностями ответа иммунной системы, токсического воздействия на клетку и безопасностью при постоянном использовании. Новая технология полностью решила эти проблемы - коллеги смогли активировать нейроны с помощью инфракрасного лазера через оптоволоконный нейроинтерфейс (аккуратно выдерживая температурный диапазон). В перспективе это может стать основой для лечения многих нейропатологий.

Статья вышла в Cellular and Molecular Life Sciences (IF = 6.2)

https://link.springer.com/article/10.1007/s00018-024-05475-x
#зоопарк_одобряет

Несколько часов назад с "Восточного" успешно стартовала ракета "Союз-2.1б" с более чем полусотней спутников, в том числе и научных. И это не только два аппарата "Ионосфера-М" (привет, ИКИ #РАН) - там много всякого интересного. Читатели Зоопарка уже пишут нам про свое оборудование, сегодня отправившееся в космос, и про запланированные эксперименты, но боятся сглазить, так что просили пока что без подробностей (но они, надеемся, скоро появятся).

Неделя начинается не скучно.
Доброе утро, страна!