#SARSCoV2 #дельта #invitro #вирусоподобныечастицы #news
Причину быстрого распространения варианта дельта установили в экспериментах со светящимися вирусоподобными частицами.
Известно, что вариант вызвавшего пандемию коронавируса, обозначенный как дельта, более заразный, чем предшествующие штаммы, однако причина, по которой дельта распространяется особенно быстро, неясна. Новый экспериментальный подход сделал возможным изучение эффекта мутаций, возникающих в вирусе SARS-CoV-2, и позволил получить ответ на вопрос об особенностях опасного варианта.
Авторы исследования, опубликованного в Science, лауреат Нобелевской премии Дженнифер Дудна (Jennifer Doudna) с коллегами из Калифорнийского университета Беркли (University of California, Berkeley), установили, что мутация, возникшая у дельты, способствует проникновению в клетку большего количества вирусного геномного материала, а это резко повышает вероятность передачи инфекции от зараженной клетки другим клеткам.
Изучая эффект возникающих в геноме вируса мутаций, ученые, как правило, сосредотачиваются на спайк-белке, который находится на поверхности вирусной частицы и способствует ее проникновению в человеческие клетки. Для этого они конструируют так называемые псевдовирусы с различными мутациями по спайк-белку и смотрят, как та или иная из них влияет на способность экспериментальных частиц заражать клетки в лаборатории. Но Дудна с соавторами придумали другой способ: они создали вирусоподобные частицы, содержащие все вирусные белки, но не имеющие его генома.
Внешне вирусоподобная частица SARS-CoV-2 выглядит как полноценный вирус, и она способна связываться с клеткой и проникать в нее в лабораторных условиях. Но поскольку такая частица лишена генома, она не может использовать аппарат клетки для размножения в ней. Дудна с коллегами вносили в вирусоподобные частицы фрагменты информационной РНК, благодаря которым клетки с такими частицами начинали светиться. Чем ярче светится клетка, тем больше РНК в нее попало вместе с вирусоподобной частицей. Наполняя такие частицы РНК с информацией о разных мутациях SARS-CoV-2, ученые по свечению клеток с проникшими в них частицами обнаружили, что выявленная у дельты мутация по нуклеокапсидному, или N -белку (R203M), приводит к тому, что в клетки попадает в 10 раз больше генетического материала, то есть информационной РНК, чем при инфицировании первоначальным вариантом коронавируса. Когда эту же мутацию дельты внесли в настоящий вирус и заразили им клетки легких, в них образовалось в 51 раз больше инфекционных частиц, чем при заражении оригинальным штаммом.
Причину быстрого распространения варианта дельта установили в экспериментах со светящимися вирусоподобными частицами.
Известно, что вариант вызвавшего пандемию коронавируса, обозначенный как дельта, более заразный, чем предшествующие штаммы, однако причина, по которой дельта распространяется особенно быстро, неясна. Новый экспериментальный подход сделал возможным изучение эффекта мутаций, возникающих в вирусе SARS-CoV-2, и позволил получить ответ на вопрос об особенностях опасного варианта.
Авторы исследования, опубликованного в Science, лауреат Нобелевской премии Дженнифер Дудна (Jennifer Doudna) с коллегами из Калифорнийского университета Беркли (University of California, Berkeley), установили, что мутация, возникшая у дельты, способствует проникновению в клетку большего количества вирусного геномного материала, а это резко повышает вероятность передачи инфекции от зараженной клетки другим клеткам.
Изучая эффект возникающих в геноме вируса мутаций, ученые, как правило, сосредотачиваются на спайк-белке, который находится на поверхности вирусной частицы и способствует ее проникновению в человеческие клетки. Для этого они конструируют так называемые псевдовирусы с различными мутациями по спайк-белку и смотрят, как та или иная из них влияет на способность экспериментальных частиц заражать клетки в лаборатории. Но Дудна с соавторами придумали другой способ: они создали вирусоподобные частицы, содержащие все вирусные белки, но не имеющие его генома.
Внешне вирусоподобная частица SARS-CoV-2 выглядит как полноценный вирус, и она способна связываться с клеткой и проникать в нее в лабораторных условиях. Но поскольку такая частица лишена генома, она не может использовать аппарат клетки для размножения в ней. Дудна с коллегами вносили в вирусоподобные частицы фрагменты информационной РНК, благодаря которым клетки с такими частицами начинали светиться. Чем ярче светится клетка, тем больше РНК в нее попало вместе с вирусоподобной частицей. Наполняя такие частицы РНК с информацией о разных мутациях SARS-CoV-2, ученые по свечению клеток с проникшими в них частицами обнаружили, что выявленная у дельты мутация по нуклеокапсидному, или N -белку (R203M), приводит к тому, что в клетки попадает в 10 раз больше генетического материала, то есть информационной РНК, чем при инфицировании первоначальным вариантом коронавируса. Когда эту же мутацию дельты внесли в настоящий вирус и заразили им клетки легких, в них образовалось в 51 раз больше инфекционных частиц, чем при заражении оригинальным штаммом.
www.science.org
Why is Delta so infectious? New lab tool spotlights little noticed mutation that speeds viral spread
“Viruslike particles” open the way to safely study nucleocapsid and other viral proteins
#омикрон #иммунитет #invitro #news
Опубликованы предварительные результаты лабораторных экспериментов по оценке эффективности существующих вакцин против нового штамма омикрон.
Первые лабораторные данные предполагают, что вакцины против нового быстро распространяющегося коронавирусного варианта могут оказаться недостаточно эффективны, но ревакцинация должна усилить иммунитет, пишет Nature News. Предварительные результаты были обнародованы на прошлой неделе группами ученых в Южной Африке, Германии и Швеции, а также коллаборацией Pfizer-BioNtech, и они показывают, что иммунная защита, придаваемая существующими противоковидными вакцинами, в отношении омикрона полностью не исчезает.
Полученные результаты пока не прошли рецензирование, они получены на малых выборках и ничего не говорят ученым о степени защиты от ковида, вызванного штаммом омикрон, которую могут обеспечить вакцины, особенно о способности защитить от тяжелой формы заболевания. «Нам все еще следует ждать более качественных данных и четких сигналов с мест, где омикрон впервые проявил себя», говорит Бен Мёррелл (Ben Murrell), вирусолог и иммунолог из Каролинского института (Karolinska Institute) в Стокгольме, соавтор одного из исследований. Ученые из Ботсваны и ЮАР выявили омикрон в конце ноября. Первые данные из Южной Африки и других мест показали, что этот вариант распространяется в несколько раз быстрее, чем дельта, и может инфицировать людей, имеющих иммунитет к другим вариантам.
Омикрон несет большое количество замен в спайк-белке, главной мишени иммунного ответа, и некоторые из этих замен, известные по другим вариантам, влияют на способность антител распознавать вирус и блокировать инфекцию. Ученые применяют два типа лабораторных проб, чтобы узнать, избежит ли омикрон нейтрализации антителами, которые выработались в результате вакцинации или инфекции. Все происходит «в пробирке». В одном случае используют частицы вируса, выделенные у заразившихся омикроном, в другом случае частицы псевдовируса, генетически модифицированной версии другого вируса со спайк-белком коронавируса.
Результаты, полученные четырьмя независимыми группами исследователей, показали, что омикрон снижает нейтрализующую способность антител больше, чем остальные циркулирующие в настоящее время варианты SARS-CoV-2. Несмотря на различия в лабораторных данных, связанные с разными историями вакцинации и инфекции людей, чьи антитела испытывались в экспериментах, влияние омикрона, по словам Мёррела, «это не полный нокаут». Ученые считают, что бустерная доза вакцины может существенно усилить скомпрометированную омикроном иммунную защиту.
Опубликованы предварительные результаты лабораторных экспериментов по оценке эффективности существующих вакцин против нового штамма омикрон.
Первые лабораторные данные предполагают, что вакцины против нового быстро распространяющегося коронавирусного варианта могут оказаться недостаточно эффективны, но ревакцинация должна усилить иммунитет, пишет Nature News. Предварительные результаты были обнародованы на прошлой неделе группами ученых в Южной Африке, Германии и Швеции, а также коллаборацией Pfizer-BioNtech, и они показывают, что иммунная защита, придаваемая существующими противоковидными вакцинами, в отношении омикрона полностью не исчезает.
Полученные результаты пока не прошли рецензирование, они получены на малых выборках и ничего не говорят ученым о степени защиты от ковида, вызванного штаммом омикрон, которую могут обеспечить вакцины, особенно о способности защитить от тяжелой формы заболевания. «Нам все еще следует ждать более качественных данных и четких сигналов с мест, где омикрон впервые проявил себя», говорит Бен Мёррелл (Ben Murrell), вирусолог и иммунолог из Каролинского института (Karolinska Institute) в Стокгольме, соавтор одного из исследований. Ученые из Ботсваны и ЮАР выявили омикрон в конце ноября. Первые данные из Южной Африки и других мест показали, что этот вариант распространяется в несколько раз быстрее, чем дельта, и может инфицировать людей, имеющих иммунитет к другим вариантам.
Омикрон несет большое количество замен в спайк-белке, главной мишени иммунного ответа, и некоторые из этих замен, известные по другим вариантам, влияют на способность антител распознавать вирус и блокировать инфекцию. Ученые применяют два типа лабораторных проб, чтобы узнать, избежит ли омикрон нейтрализации антителами, которые выработались в результате вакцинации или инфекции. Все происходит «в пробирке». В одном случае используют частицы вируса, выделенные у заразившихся омикроном, в другом случае частицы псевдовируса, генетически модифицированной версии другого вируса со спайк-белком коронавируса.
Результаты, полученные четырьмя независимыми группами исследователей, показали, что омикрон снижает нейтрализующую способность антител больше, чем остальные циркулирующие в настоящее время варианты SARS-CoV-2. Несмотря на различия в лабораторных данных, связанные с разными историями вакцинации и инфекции людей, чьи антитела испытывались в экспериментах, влияние омикрона, по словам Мёррела, «это не полный нокаут». Ученые считают, что бустерная доза вакцины может существенно усилить скомпрометированную омикроном иммунную защиту.
Nature
Omicron likely to weaken COVID vaccine protection
Nature - Early lab results suggest that existing vaccines could be less effective against the fast-spreading coronavirus variant, but boosters should improve immunity.
#BA2 #омикрон #invitro #news
По мере распространения подварианта омикрона BA.2 появляются лабораторные исследования, указывающие на признаки серьезности вызываемого им заболевания.
Вирус BA.2 – подвариант варианта коронавируса омикрон – не только распространяется быстрее, чем его дальний родственник, он также может вызывать более тяжелое заболевание и, по-видимому, способен разрушить имеющиеся у нас ключевые виды противоковидной защиты, сообщает CNN.
Проведенные в Японии лабораторные эксперименты показывают, что BA.2 может иметь особенности, которые делают его способным вызывать столь же серьезные заболевания, как и более старые варианты SARS-CoV-29, включая вариант дельта. И, подобно омикрону, он, похоже, в значительной степени избегает иммунитета, сформированного вакцинами. Бустерная прививка восстанавливает защиту, снижая вероятность заболевания после заражения примерно на 74%. BA.2 также устойчив к некоторым видам лечения, включая сотровимаб, моноклональное антитело, которое в настоящее время используется против омикрона. Результаты этих исследований предварительны и опубликованы на сервере препринтов bioRxiv.
«С точки зрения человека это может быть худший вирус, чем BA.1, и он может лучше передаваться и вызывать более тяжелые заболевания», говорит эксперт CNN Дэниел Роудс, заведующий отделением микробиологии в Кливлендской клинике в Огайо. Центры по контролю и профилактике заболеваний США (CDC) внимательно следят за BA.2, заявила директор CDC Рошель Валенски на брифинге для журналистов. «Нет никаких доказательств того, что линия BA.2 является более серьезной, чем линия BA.1. CDC продолжает отслеживать варианты, которые циркулируют как внутри страны, так и за рубежом», добавила она. BA.2 сильно мутирован по сравнению с исходным вирусом, вызывающим Covid, который появился в Ухане в 2019 году. Он также имеет десятки генных изменений, которые отличаются от исходного штамма омикрон, что делает его таким же отличным от самого последнего пандемического вируса, как варианты альфа, бета, гамма и дельта отличались друг от друга. Кей Сато, исследователь из Токийского университета, проводивший исследование, утверждает, что эти результаты доказывают, что BA.2 не следует считать типом омикрона и что за ним нужно более внимательно следить. «Как вы, возможно, знаете, BA.2 называют "невидимым омикроном", сказал Сато CNN. Это потому, что в тестах ПЦР он не проявляется как сбой мишени S-гена, как это делает омикрон. Поэтому лаборатории должны сделать дополнительный шаг и секвенировать вирус, чтобы найти этот вариант. «Первое, что нужно сделать многим странам, – это разработать метод обнаружения BA.2», считает он. «Похоже, мы можем видеть здесь новую греческую букву», согласилась Дебора Фуллер, вирусолог из Медицинской школы Вашингтонского университета, которая проанализировала исследование, но не участвовала в нем.
По мере распространения подварианта омикрона BA.2 появляются лабораторные исследования, указывающие на признаки серьезности вызываемого им заболевания.
Вирус BA.2 – подвариант варианта коронавируса омикрон – не только распространяется быстрее, чем его дальний родственник, он также может вызывать более тяжелое заболевание и, по-видимому, способен разрушить имеющиеся у нас ключевые виды противоковидной защиты, сообщает CNN.
Проведенные в Японии лабораторные эксперименты показывают, что BA.2 может иметь особенности, которые делают его способным вызывать столь же серьезные заболевания, как и более старые варианты SARS-CoV-29, включая вариант дельта. И, подобно омикрону, он, похоже, в значительной степени избегает иммунитета, сформированного вакцинами. Бустерная прививка восстанавливает защиту, снижая вероятность заболевания после заражения примерно на 74%. BA.2 также устойчив к некоторым видам лечения, включая сотровимаб, моноклональное антитело, которое в настоящее время используется против омикрона. Результаты этих исследований предварительны и опубликованы на сервере препринтов bioRxiv.
«С точки зрения человека это может быть худший вирус, чем BA.1, и он может лучше передаваться и вызывать более тяжелые заболевания», говорит эксперт CNN Дэниел Роудс, заведующий отделением микробиологии в Кливлендской клинике в Огайо. Центры по контролю и профилактике заболеваний США (CDC) внимательно следят за BA.2, заявила директор CDC Рошель Валенски на брифинге для журналистов. «Нет никаких доказательств того, что линия BA.2 является более серьезной, чем линия BA.1. CDC продолжает отслеживать варианты, которые циркулируют как внутри страны, так и за рубежом», добавила она. BA.2 сильно мутирован по сравнению с исходным вирусом, вызывающим Covid, который появился в Ухане в 2019 году. Он также имеет десятки генных изменений, которые отличаются от исходного штамма омикрон, что делает его таким же отличным от самого последнего пандемического вируса, как варианты альфа, бета, гамма и дельта отличались друг от друга. Кей Сато, исследователь из Токийского университета, проводивший исследование, утверждает, что эти результаты доказывают, что BA.2 не следует считать типом омикрона и что за ним нужно более внимательно следить. «Как вы, возможно, знаете, BA.2 называют "невидимым омикроном", сказал Сато CNN. Это потому, что в тестах ПЦР он не проявляется как сбой мишени S-гена, как это делает омикрон. Поэтому лаборатории должны сделать дополнительный шаг и секвенировать вирус, чтобы найти этот вариант. «Первое, что нужно сделать многим странам, – это разработать метод обнаружения BA.2», считает он. «Похоже, мы можем видеть здесь новую греческую букву», согласилась Дебора Фуллер, вирусолог из Медицинской школы Вашингтонского университета, которая проанализировала исследование, но не участвовала в нем.
CNN
As BA.2 subvariant of Omicron rises, lab studies point to signs of severity | CNN
The BA.2 virus – a subvariant of the Omicron coronavirus variant – isn’t just spreading faster than its distant cousin, it may also cause more severe disease and appears capable of thwarting some of the key weapons we have against Covid-19, new research suggests.