Lab Mouse
2.15K subscribers
775 photos
251 videos
6 files
365 links
Генетика 🧬 Биоинформатика 💻 Data Science
Лекции: https://gitazone.org/
Инста: https://www.instagram.com/lab.mouse
TikTok: https://www.tiktok.com/@labmousetalks
YouTube: https://www.youtube.com/@GitaZone
Download Telegram
1. Последний раз возни под шкафом от малышей
2. Первое фото Люка на новом месте
3. Аня не может нанюхаться Леечки вчера вечером
4. Все трое одновременно требуют ласки
44👍5
This media is not supported in your browser
VIEW IN TELEGRAM
Книга «Кто подставил ГМО» только что улетела в издательство!!!🥳🥳🥳
🎉9314👏4👍1🔥1🥰1
Песьи новости.

1. С главного. Твигги сбежала ночью с новой передержки. Сейчас ее ищут.

Мы знали о ее дикой склонности к побегам🤦‍♀️ Каждый день она сбегала и со старой передержки, что бы мы не делали там. На второй день тогда она залезла на стоящий у стены обогреватель и вылезла в окошко над ним, затем вскочила на высокую ограду и сиганула с неё ещё более вниз. Сделала свои дела за домом и просто вернулась обратно ПО КРЫШАМ. Мы заделали окошко. Через пару дней она окрепла и стала выпрыгивать в другое — выше и куда нет «подставки». Потом также через забор и гулять.
Каждый раз через полчаса-час возвращалась сама, нагулявшись. Мы пробовали ее привязывать во дворе — отказались от идеи скоро, побоявшись, что задушит себя же. Просто смирились: там не было проезжей части, безопасный частный сектор, нормальные соседи.

Последние дни ее побеги стали с новой проблемой: пару раз она нашла и принесла во двор хозяйки трупы давно мертвых кошек, на ужин… Добытчица🙈 Стала выбираться из сарая ночами, залезать на крышу дома и выть на луну. Соседи начали жаловаться. Это было ещё одной причиной, почему мы перевели ее на новое место.

В новом месте под неё построили вольер с ВЫСОЧЕННЫМИ стенами и фундаментом, чтобы она не сделала подкоп. Сегодня ночью она перемахнула стену вольера и сбежала… Сейчас ситуация совсем иная, мы боимся, что туда сама она не вернётся. Там ее ничего не держит.

Сейчас на связи с приютом. Они пока сказали, что ищут сами. Я готова выехать туда сразу. Если вы в Ереване и хотите присоединиться к поискам, пишите. Поедем вместе.

2. Коротко, что у щенков все хорошо. Пока нет морально сил рассказать про них подробнее.
😢44
А кого мы тут нашли?:)) Задница меховая. Моя последняя нервная клетка хлопнула дверью🙈
61👏9🤩6🥰1
Поделюсь молотой:) мы сегодня носили Леечку впервые «в город». Социализировать ребёнка. Большей частью на руках. Но эмоции-эмоции 😅 Умаялась малышка
🥰57👍4
Любимые котики Blastim сделали штуку, которая точно будет очень полезна всем биоинформатикам. Особенно еще только начинающим, у которых пока нет ресурсов компаний или университетов, при которых они работают.

Подробности вот какие:

Проект нацелен на
📍биологов,
📍врачей,
📍биоинформатиков,
📍программистов
📍и всех желающих самостоятельно обрабатывать свои или опубликованные медицинские и биологические данные.

BlastimCloud - это готовое рабочее пространство для обработки и анализа биологических данных с доступом 24/7 из любого уголка земли.

В стартовой версии рабочее окружение настроено для решения таких задач:
- Контроль качества входных данных (FastQC, QUAST, Trimmomatic, Cutadapt)
- Сборка генома (Spades) и картирования прочтений (BWA, Bowtie2, Hisat2)
- Поиск и аннотация структурных вариаций (BCFtools, GATK, Annovar, vep)
- Анализ метагеномных данных (QIIME2, DADA2, Deblur)
- Анализ дифференциальной экспрессии (DESeq2)
- Построение филогенетических деревьев (IQTree)
- Обработка и визуализация результатов (Jupyter Notebook, RStudio)

https://agency.blastim.ru/blastimcloud
11👍7
Наткнулась просто на чудесное видео и интереснейший канал. Скорее спешу поделиться. Это история о том, как нашли первый целый скелет мамонта больше 200 лет назад. А еще о том, откуда появился вот этот рисунок, который в Интернете оброс настоящими байками с подтруниванием над "глупыми учеными" (нет).

https://www.youtube.com/watch?v=goi2KKYdHvc
👍25
А вот еще вам забавного про то, что "ничто не ново под луною".

На безумном (и безумно прекрасном) фрик-ринге с УПМ-16 Алексей Бондарев — палеозоолог, член Омского отделения Русского географического общества, выдвигал убедительную "гипотезу", что все современные слоны произошли от мышей. Помню, как возмутился этой гипотезе Михаил Родин (автор радио-передачи "Родина слонов", название которой тоже, кстати, произошло из-за исторического мема. Знаете этот мем?)

Так вот! В видео выше я наткнулась на упоминание манчжурской легенды о мамонтах и полезла искать ее текст. А там совершенно удивительное:

```В Монголии все еще можно встретить в местных преданиях призрак мохнатого слона по имени Тай-Шу. В книге «Се-чу», или «Четыре тома по философии морали и политики Китая», упоминается о лохматом чудовище с крохотными глазками и коротким хвостом, которое роет клыками в снегу ходы.

В энциклопедическом трактате «Мир животных», авторство которого приписывают Куанг Чи, первому императору династии маньчжуров (1662 — 1723), также можно обнаружить эхо сибирских легенд: «На севере живет подземная крыса «феншу», то есть «скрывающаяся мышь», или «иеншу», или «мышь-мать». В книге «Зеркало маньчжурского языка» ее называют «крысой льдов». Это огромное, подобное слону животное, которое живет только под землей и умирает, как только покажется наверх и ее коснутся солнечные лучи».

К этим сведениям писатель-император добавляет несколько прозаических деталей: «Попадаются «феншу», которые весят до 10 тысяч фунтов. Их зубы похожи на слоновьи бивни: северные народы делают из них посуду, гребни, рукоятки для ножей и т.д. Я видел своими глазами эти зубы и изделия из них. Поэтому я верю рассказам о «феншу», встречающимся в наших старых книгах».

«Зеркало маньчжурского языка» сообщает о мамонтах удивительно точные сведения: «Крыса льдов и ледников живет глубоко на севере, под вечными снегами. Ее мясо можно есть. Шерсть ее имеет длину в несколько ступней. Из нее можно ткать ковры, не пропускающие сырой воздух».»```
Выдержка из «Журнал «Вокруг света» / Декабрь 1992 / Они... существуют?»
Больше про легенды о мыше-мамонтах тут.


Вот так-то. "Все уже придумано за нас".

https://youtu.be/cnTdkqbwav4?t=1617
👍20🔥4😁31
🔥15👍1
Твигги и щенки. Доходы-Расходы.pdf
51.1 KB
Небольшой отчет по песьему вопросу.

1. Твигги пока больше не сбегала. Сегодня заплатила за нее там до начала сентября (у ребят не хватало денег на оплату строительных работ, так что вышел аванс)
2. Щенки по передержкам. На этой неделе будут изменения по их содержанию, я про все расскажу. Очень активно ищем дом и будем очень признательны за распространение информации.
3. Твигги получила свою первую вакцину, вторую получит 25 июля
4. Щенки тоже уже с первой вакциной, завтра записываю их на вторую (должны были поставить 8 июля, но я не смогла выгрестись из-под дел)

Во вложении финансовый отчет по доходам и тратам. Пока денег хватает на все. Спасибо всем вам за это💚
28👍3
Картофельные чипсы убийцы😱

Кликабельно вышло? Ну вполне как и вся эта история:))
Утверждения, что «природа знает лучше» и «натуральное лучше искусственного», мне всегда безумно нравились (нет). Любимый пример от моих читателей на это почти всегда борщевик😂 Но мы поговорим о вкусненьком. О картофельных чипсах.
35👍1
У @chemistry_by_olga можно почитать о том, почему вкусную картошечку фри из МакДака не так-то просто импортозаменить. А я расскажу вам про историю получения таких специальных сортов как для картошки фри и о том, что селекция — это лишь еще один инструмент вмешатльства в гены. И выстрелить им себе в ногу довольно просто (ну а мой посыл как всегда: ГМО — рулят. В частности из-за строжайших проверок безопасности, которые такие продукты проходят).

Итак, для приготовления таких блюд как чипсы или картошка фри нужны совершенно отдельные сорта картофеля. Хрусткость, вкус, способность держать форму, крахмалистось — все это должно быть не просто унифицировано, но идеально подходить под процесс изготовления конкретного блюда в (прямо смысле) промышленных масштабах. С вопросами про сам процесс приготовления тех или иных блюд отправляю вас к @chemistry_by_olga, а мы с вами в это время отправляемся в прошлое. В штат Мерилэнд.

Именно здесь в 1959 году в теплицах селекционеры вырастили новый гибридный сорт картофеля. За его основу взяли:
популярный сорт картофеля Дельта Голд — он известен большой урожайностью,
дикий южноамериканский картофель (Solanum chacoense) — обладает хорошей устойчивостью к вредителям.

И гибрид оказался чудо как хорош! По всем характеристикам он просто идеально подходил для изготовления картофельных чипсов, но и выращивать его было одно удовольствие: фитофтора (еще та головная боль агронома) его не брала, к вирусу мозаики обыкновенной у него был иммунитет (и еще несколько типичных картофельных болячек ему были нипочем)[1].



Назвали новый сорт Lenape (Ленапе). Вскоре начались его испытания, а спустя 8 лет, когда сорт получил разрешение на продажу, его выращивали уже во множестве штатов.

Успех у компаний производителей чипсов был огромен!

Но в один (наверное, не очень прекрасный) день некий селекционер из Онтарио решил приготовить себе ужин — картофель с горошком 😋 — после тяжелого трудового дня на поле[2]. Вдруг после еды он неожиданно почувствовал сильную тошноту. Через неделю он решил повторить эксперимент и снова в результате получил приступ тошноты. Заподозрив, что что-то с картофелем не так, он взял сырые клубни и отправился в гости к знакомому биохимику. Там в лабораториии быстро стало ясно, что кожура картофеля содержала слишком большое количество гликоалкалоидов — ядовитых органических соединений. В мякоти их было поменьше, но тоже значительно.

Тут надо заметить, что гликоалкалоиды — а в частности соланин — содержатся в любой картошке, но в небольших количествах. Под воздействием света на клубни соланина становится больше. Мы видим это обычно по зеленым бокам картошки, которую хранили неправильно. Растению соланин нужен для защиты от насекомых и других вредителей, а о безопасности тех, кто решит полакомиться им, оно уж точно не думает. Видимо, из-за скрещивания с диким картофелем у гибридного сорта и получилось такое неприятное побочное свойство.

Заметить его было непросто, ведь для приготовления чипсов использовали только мякоть клубней (а там соланина было меньше, чем в кожуре). Для иных блюд производители продавать его не планировали. Но селекционер, в распоряжении которого оказались клубни, излишки которых можно было приготовить, оказался не единственным — из Европы также начали поступать сообщения о расстройстве кишечника после употребления вареного картофеля Ленапе[3].

Настоящее отравление соланином в больших дозах довольно плохая штука — оно проявляется от тошноты, рвоты, болей в животе до угнетения сердечно-сосудистой, нервной, дыхательной, мочевыделительной системы. При чрезвычайно высоких концентрациях может наступить паралич и даже смерть. FDA предостерегает не употреблять позеленевшие части картофеля во избежание отравления[4].
41👍10
Ленапе отозвали через 11 лет после его создания. Кстати, после этой истории он вовсе не исчез с лица Земли. Его семена применяются в селекции, а гибридные потомки используются в разных сферах и также участвуют в получении новых сортов картофеля[5].
Только контроль за продуктами с тех пор стал намного строже. И когда меня спрашивают, каких продуктов в магазине я опасаюсь, я могу честно отвечать, что только испорченных.😉

Любите чипсы?


[1] Akeley, R. V., Mills, W. R., Cunningham, C. E., & Watts, J. (1968). Lenape: A new potato variety high in solids and chipping quality. American Potato Journal, 45(4), 142–145. doi:10.1007/bf02863068 https://www.ask-force.org/web/Potato/Akeley-Lenape-New-Potato-Variety-1968.pdf
[2] Mendel in the Kitchen: A Scientist's View of Genetically Modified Foods, 2004. Nancy Marie Brown, Nina V. Fedoroff
[3] Name of potato variety Lenape withdrawn. (1970). American Potato Journal, 47(3), 103–103. doi:10.1007/bf02864812
[4] Are green potatoes dangerous? https://ask.usda.gov/s/article/Are-green-potatoes-dangerous
[5] Potato Pedigree Database https://www.plantbreeding.wur.nl/PotatoPedigree/reverselookup.php?name=LENAPE
54👍5🔥2
Вчера малыш Люк уехал жить в семью. В собственный двор в доме за городом. Нам понравились люди, которым мы его отдали. Будем держать связь (уже держим, мне сегодня написали, что у него все нормально), ездить в гости. И увидимся 2 августа на вакцинации.

Держим дружно пальчики 🤞, чтобы все у него было хорошо!
👍75🥰2611
Про то, что есть такая штука как дальтонизм, знают, наверное, все. Вокруг этой генетической особенности достаточно сложилось и мифов.

Напримр, многие просто уверены, что дальтонизмом могут страдать только мужчины (миф). Также в популярной культуре устоялось "пояснение", что дальтонизм -- это неспособность видеть красный цвет. При этом мало кто представляет себе, что же тогда видит человек, если он не видит красный. Может серый? или зеленый?

На самом деле все (как всегда) намного сложнее. Начать с того, что женщины тоже могут иметь проблемы с восприятием некоторых цветов или их оттенков (но да, это встречается реже, чем у мужчин, и связано (часто, но не всегда) с "дополнительной"/"запасной", как не назови, но второй X-хромосомой).
Так что вместо привычных большинству людей цветов видит человек с такой особенностью? А вот редко угадаешь, пока не спросишь! Но даже удивительнее того: многие люди могут годами не знать о том, что имеют проблемы с цветовым зрением!

Вопреки (также устоявшемуся) мнению, мир перед глазами людей с этой генетической особенностью не представляет из себя множество серых пятен на месте, где другие люди видят красный цвет и его оттенки. Проявление может быть, например, в том, что разные оттенки коричневого цвета для человека сливаются в единый вариант коричневого. Или спектр от фиолетовых и розовых до алых выглядит просто как некий усредненный красный. Или красные цвета смещены к зеленым и плохо отличимы от них. Или... Множество вариантов, которые дарит нам наше непростое физиологическое устройство воспряития цветов.

Человек может прожить всю жизнь и не узнать, что видит мир иначе, чем его соседи. Среди моих знакомых есть люди, которые о такой своей особнности вообще узнали, только пройдя цветовой тест в ГИБДД!
(Попробуйте и вы. Расскажите о результатах и впечатлениях в комментариях. Например, мне тест говорит, что у меня проблемы с цветовосприятием есть! Правильно я ответила только на 12 из 13 вопросов)
https://excimerclinic.ru/eye-tests/daltonism_test/

Но удивительнее всего то, что иногда генетика "играет в другую сторону"! И тогда человек может видеть не меньше, а даже больше оттенков, чем другие люди! Такая генетическая особенность называется тетрахроматия и обладают ей чаще женщины. Здорово, если кто-то из них решает связать свою жизнь с рисованием, ведь тогда и мы можем ненадолго посмотреть на их мир своими глазами.

А за подробностями вот сюда: https://elementy.ru/kartinka_dnya/609/Tetrakhromatiya_mir_v_chetyrekh_tsvetakh
👍31🔥9
картинка из статьи
👍32🔥11