Я обожаю канал Лены и постоянно беру из него на заметку научпоп книги. Но сегодняшний пост вообще пушка! Обязательно прочтите. И обязательно подпишитесь на канал Лены!

​​Метагеном чайного пакетика

Обычно я если и пишу в этом блоге о каких-нибудь исследованиях или научных новостях, то только в привязке к книгам. Но на этой неделе мне попались два настолько прекрасных исследования биоразнообразия, что можно я с вами просто поделюсь, а с книжками мы что-нибудь потом придумаем?)

Исследование раз: ученые из Трирского университета изучают видовое разнообразие растительноядных членистоногих (насекомых и паукообразных) в динамике, т.е. смотрят, как это разнообразие меняется от года к году. Сделать это можно несколькими способами: можно, например, очень много лет подряд ставить ловушки, собирать всех жучков-паучков, определять их виды и так далее. А можно взять, скажем, образец растения, на котором эти членистоногие сидели, ходили по нему или кусали — и обнаружить, что они уронили на поверхность растения немного своей ДНК. Эту ДНК можно выделить, прочитать ее последовательности — и определить, каким животным она пренадлежит. Принадлежала. Очень похоже на то, что делают криминалисты, определяя преступника по оставленной на месте преступления ДНК.

Хорошо, а что там с долгосрочной динамикой? Опять, что ли, собирать листья растений много лет подряд? Можно, да. А можно сделать хитрее: взять уже собранные, высушенные листья растений, произраставших на изучаемой территории много лет назад. Где их взять? В гербариях! Они хранятся годами и десятилетиями, и информация о месте находки в них приводится подробно.

Вопрос был в том, каковы шансы на гербарных растениях найти ДНК насекомых и паучков, гулявших по ним много лет назад, — это авторы исследования и хотели выяснить, чтобы отработать методику. Но потрошить гербарии только для пробных экспериментов как-то жалко. А где еще взять засушенные листья растения, которые долго хранились в комнатной температуре без соблюдения каких-либо специальных условий? Ну вы уже из названия поста догадались, конечно.

В общем, взяли они этот чайный пакетик, выделили ДНК, отсеквенировали (прочитали последовательность) и определили, чья она. И насчитали почти 400 видов членистоногих!

Я надеюсь, вы не подавились сейчас своим чаем, но на всякий случай уточним еще раз: это вовсе не значит, что все эти насекомые, клещи и пауки присутствовали в чайном пакетике)) Там присутствовала только их ДНК, оброненная так или иначе при жизни чайного куста. И только вообразите: какая-нибудь гусеница один раз проползла по листу, возможно, годы назад — а ученые могут узнать об этом сегодня. Красиво. Но и грустно тоже: для многих видов может оказаться (и оказывается), что 10 лет назад они там ползали, а сегодня уже нет. Вот здесь — интервью с автором исследования.

Вообще эта тема с ДНК из окружающей среды (environmental DNA, eDNA) для изучения биоразнообразия, похоже, набирает популярность в последние годы, хотя многие исследования все еще находятся на этапе оптимизации методов. Вторая статья, которая мне попалась буквально сразу за первой, похожа по целям: группа ученых из Копенгагенского университета изучает биоразнообразие наземных позвоночных. И чтобы посмотреть, как метод чтения eDNA работает на самых разных видах, в том числе тропических, они собирали образцы воздуха на территории копенгагенского зоопарка — с помощью специального приборчика, по сути вентилятора с фильтром для улавливания ДНК. И насобирали много разного: в воздухе трех локаций летала ДНК аж 49 видов позвоночных — в том числе определили даже 4 вида рыб, но почему-то ни одной черепахи (автор заметки в Nature шутит: видно, черепахи предпочитают держать свою ДНК при себе).

Чудесное фото из той же заметки — тоже хочу, когда вырасту, махать вентилятором под носом у жирафа!

Вот в этом выпуске для радио рассказывала о подобных удивительных методах обнаружения ДНК кита в тех водах, где он проплывал некоторое время назад

https://smotrim.ru/audio/2557623

Песьи новости.

1. Мы простерилизовали Твигги.
Оказалось, что сделали это очень вовремя -- по словам оперировавшей доктора Нарэ, Твигги снова была беременна. Срок около двух недель. Да, нам тоже в это очень сложно поверить. Мы уже поговорили с более опытными, чем мы, людьми. Возможно, это все-таки были кисты. Мы не знаем, а доктор уверена, что все-таки эмбрионы, целых 8 потенциальных новых щенков🙈. Так или иначе, сейчас все удалено, вместе с маткой. Теперь молоко должно прекратиться (ранее лактостоп его так и не остановил, возможно в силу все того же гормонального сбоя, который привел к повторной беременности).

Что плохо, вернули нам ее без попоны. И, кажется, тут никто про существование и необходимость попоны не знает совсем. Надеемся, ночь проведет нормально, а к утру я уже планирую сшить ей попону из кухонных полотенец. Пока соорудили на скорую руку "шорты" из детской майки, но она быстро от них избавилась.

2. Мы думали, что после стерилизации она уже не увидится со щенками -- отвезем сразу в загородный частный приют. Но вольер в нем еще недостроен, а наша золотая передержка смогла подержать их еще всех вместе. Так что сегодня Твигги снова ночует рядом с детьми.
Возвращению мамы дети обрадовались, но обращали на нее внимание недолго. Скоро убежали играть в людей. Сама Твигги отнеслась к детям уже достаточно равнодушно, хотя и положительно. Их связь с каждым днем будет становиться все слабее. Таков закон песьей природы.

3. Малыши растут с какой-то бешеной скоростью🙈 И едят как два настоящих медвежонка. Докупила им еще влажного корма сегодня. Хотя в клинике сказали уже переводить на только сухой, хочется еще немного побаловать, отлучая от молока. Комбинируем сухой и влажный. Завтра пора пересчитать дозы на новый вес.

Вот и все песьи новости на сегодня:) Ах да! Твигги, хитрюга, отлично начала ходить на поводке. Но притворяется, чтобы носили на ручках😤

Песьи новости🐶

1. Троглодиты растут 🙈 И их мама тоже. Становятся крупнее, тяжелее, серьёзнее. Вчера Твигги поселяла ошейник, который я ей купила в день поимки. Принесла ей на замену старый Булкин. А его даже на максимуме на неё не хватает! Такая шея стала!
Пока есть возможность держать их на старой передержке близко ко мне, чтобы проводить процедуры. Скорее всего переезд за город у Твигги будет в субботу. Нужно, но так не хочется 😞

А ласковые они все до жути 😍

2. Шов после стерилизации заживает, но из-за жары не очень хорошо. Висим на связи с моим доктором, обрабатываем все, как назначает Катя. (@dr_lady_evil, если ещё не читаете, обязательно!) Купила все нужное для обработки.

3. Вчера ночью маленький Люк уехал на временную передержку в квартиру. В ближайшее время у него будет личный человек для воспитания и приучения к миру.

У щенков все ещё карантин по вакцинам.

В дорогу Люка снабдили на первое время пелёнками и едой (чеки все собираю, чуть позже выложу отчёт по приходам и расходам). Часть расходов уже взяла на себя его семья опекунов.

Люк шлёт видео и фото приветы. Скучает по маме и сестричке. Но хорошо кушает, играет, гуляет. И просится на улицу!

Большое спасибо всем, что помогаете и делаете возможным готовить их в счастливую жизнь💚

Книга «Кто подставил ГМО» только что улетела в издательство!!!🥳🥳🥳

Песьи новости.

1. С главного. Твигги сбежала ночью с новой передержки. Сейчас ее ищут.

Мы знали о ее дикой склонности к побегам🤦‍♀️ Каждый день она сбегала и со старой передержки, что бы мы не делали там. На второй день тогда она залезла на стоящий у стены обогреватель и вылезла в окошко над ним, затем вскочила на высокую ограду и сиганула с неё ещё более вниз. Сделала свои дела за домом и просто вернулась обратно ПО КРЫШАМ. Мы заделали окошко. Через пару дней она окрепла и стала выпрыгивать в другое — выше и куда нет «подставки». Потом также через забор и гулять.
Каждый раз через полчаса-час возвращалась сама, нагулявшись. Мы пробовали ее привязывать во дворе — отказались от идеи скоро, побоявшись, что задушит себя же. Просто смирились: там не было проезжей части, безопасный частный сектор, нормальные соседи.

Последние дни ее побеги стали с новой проблемой: пару раз она нашла и принесла во двор хозяйки трупы давно мертвых кошек, на ужин… Добытчица🙈 Стала выбираться из сарая ночами, залезать на крышу дома и выть на луну. Соседи начали жаловаться. Это было ещё одной причиной, почему мы перевели ее на новое место.

В новом месте под неё построили вольер с ВЫСОЧЕННЫМИ стенами и фундаментом, чтобы она не сделала подкоп. Сегодня ночью она перемахнула стену вольера и сбежала… Сейчас ситуация совсем иная, мы боимся, что туда сама она не вернётся. Там ее ничего не держит.

Сейчас на связи с приютом. Они пока сказали, что ищут сами. Я готова выехать туда сразу. Если вы в Ереване и хотите присоединиться к поискам, пишите. Поедем вместе.

2. Коротко, что у щенков все хорошо. Пока нет морально сил рассказать про них подробнее.