Lab Mouse
2.14K subscribers
788 photos
256 videos
6 files
367 links
Генетика 🧬 Биоинформатика 💻 Data Science
Лекции: https://gitazone.org/
Инста: https://www.instagram.com/lab.mouse
TikTok: https://www.tiktok.com/@labmousetalks
YouTube: https://www.youtube.com/@GitaZone
Download Telegram
Как так получается?
Нужно вспомнить вот что:
👉как «упакован» наш геном в ядре клетки
👉на что похож его текст
👉как этот текст нужно «читать»

Вспомним на слайдах 👆👆
(и возвращайтесь сюда)
Но вот вам загадка: если референсный геном основан на усредненных данных по всем прочитанным и уложенным в базу данных человеческим геномам, то какие у такого подхода слабые места?

Приглашаю вас порассуждать в комментариях. А в одном из следующих постов я расскажу о том, как ученые придумали решать эти проблемы.
🔥233👍1
Шлю мышиный утренний привет из Батуми:) Вчера отвела лекцию «Как раскрасить кошку» для просто замечательной публики. Была куча людей и вопросов🥰 И как всегда, ни один взрослый не придумал вопросов интереснее детских 😂 Простите уж, взрослые 😜

Фото с лекции не будет (мне фотать некогда, а люди постят в сторисы инсты, там можно посмотреть). Успели вчера погулять у моря и по прекрасным улочкам Батуми. Красота 😍 Чтоб как-то выразить чувства в слова мозг выдал «как бы выглядели Карловы Вары, будь в них море».

Сегодня снова только гулять и отдыхать. А завтра в обратный путь и уже работу. (И у меня почти готов новый пост. А новый выпуск подкаста Мышь погрызла появится утром среды 😉)
👍272
Аааааа!!!! АААААААА!!!! АааааАаа!!!11
🎉68👍7
🎙Эпизод 2. Как прожить без головы. Беседа с нейробиологом Еленой Беловой
🔥13
🎙Эпизод 2. Как прожить без головы. Беседа с нейробиологом Еленой Беловой

Квантовый нейро-нано-выпуск подкаста, в котором Вселенная не поскупилась на Знаки: моя собака сожрала книгу гостьи, гром и ливень ответили на мой вопрос о противоречии концепциям разумного замысла, а молния попросту выбила пробки и отрубила электричество во всем доме. Но мы не растерялись и у нас все равно все получилось! А (возможно) все это потому, что сегодня у меня в гостях автор книги «Автостопом по мозгу. Когда вся вселенная у тебя в голове» нейробиолог Елена Белова. И говорим мы о том, как устроен рынок внимания и почему так быстро устаревают мемы, правда ли, что операции на мозге безопаснее производить на пациентах в сознании (и почему при этом им не больно), где находится доступ к душе и как много нужно для жизни, если ты курица. А еще я узнаю у Лены нейробиологические лайфхаки для запоминания сложных вещей и пойму, стоит ли мне ругать себя за привычку не давать мозгу отдохнуть.

Бонус-загадка для самых ушастых: услышать специально не убранные звуки урагана и выбитых пробок. А бонус для читателей этого канала — несчастная Булка и ее преступление (в первом комменте).

Каналы Лены:
https://t.iss.one/hippopocampus
https://teletype.in/@hippopocampus

Интересное по теме от Лены:
📒Гэри Маркус «Несовершенный человек» — прикольная книга про несовершенство мышления
💻«Ральф против интернета» — клевый и смешной мультик про то, как устроен интернет

В выпуске упоминается:
🧬Любимый научно-популярный портал Биомолекула

Каналы автора этого подкаста:
📌Телеграм
📌Инста
📌TikTok
📌Ваши вопросы, замечания, комментарии и предложения жду на почту 📬 [email protected]

Слушайте "Мышь погрызла" на:
💡Apple Podcasts
💡YouTube
💡CastBox
💡Spotify
💡Yandex.Подкастах
💡Теперь и на Google Podcasts 🥳🥳
Как всегда огромная благодарность Павлу Хамидулину за всю техническую сторону работы над подкастом, его (в самом прямом смысле) молниеносную реакцию и надежную систему бесперебойных источников питания 💚

upd_tag: #подкаст_Мышь_Погрызла
6👍2
Очень вкусная книжка.
17😁6😱1
Я допиваю свой последний (за этот визит) грузинский кофе и жду одного очень классного человека, чтобы наконец развиртуализироваться. А пока редактор шлет мне фоточки и дразнит, что книга уже у них😍 Пока не потрогаю сама, до конца не осознаю😅

А вот тут уже можно сделать предзаказ «Как ГМО спасают планету».

Я очень переживаю из-за высокой цены😞 Процесс книгоиздания сейчас стал безумно дорогим. А мне так хочется, чтобы книга была доступна большинству людей… Походила по сайтам, сравнила на нее цены. Пока тут выходит дешевле всего.
🔥33👍42
Развиртуализировались в Тбилиси мы с Полиной Кривых. Полина была моим куратором много лет назад на школе лекторов фонда Эволюция. Полина психофизиолог и, как вы уже поняли, тоже популяризатор науки.

В телеграмме можно читать ее канал Что-то на нейронаучном (а я еще люблю ее видео и тиктоки😉)

Если вы в Тбилиси, не упустите возможность попасть на ее лекцию Почему мы тревожимся и выгораем. Лекция пройдет 5 июня в 19:00

(Ереван, я попробую заманить Полину и к нам😉 Не переключайтесь 😂)
👍146
"В моей работе биоинформатика и специалиста по анализу биологических и медицинских данных мне постоянно приходится смотреть на вещи под разными углами. Так я вижу их как математик, чтобы учитывать статистические процессы и математические модели, лежащие в их основе. Так я изучаю их глазами биолога, чтобы понять причины и следствия, определить механизмы и уложить их на фундамент научных знаний о мире. А затем трогаю их руками программиста, чтобы соединить результаты работы первого и второго. Затем в гости к этой шайке обязательно заглядывает популяризатор и неизменно пытается устроить еще больший балаган, где раскрашивает выводы глупыми (и не очень) аналогиями и травит байки из истории науки. Вся эта банда (в лице уставшего от их постоянного гвалта автора) искренне надеется, что у нее получится достичь этой светлой цели и в интересной для читателя форме."

Меня сегодня много, простите:)) Но только что мне сообщили, что с этой минуты официально открыты продажи!!
Вот эта ссылка должна уже давать положить в корзину.

Я увижу свой бумажный экземпляр еще непонятно когда😞 Но скоро я доберусь до Еревана и попробую найти способ заказать книгу для своих родителей.

А если физически увидите в магазине, пожалуйста-пожалуйста, присылайте фото/тегайте/пишите! Не знаю, доведется ли мне увидеть ее однажды на полке в магазине, но хотя бы через ваши фото. Скорее всего сначала она появится в столицах в сети Читай-Город.
👍17🔥115
Шок-контент: пока мы с Андреем Борзенко готовим (уже совсем совсем скоро) четвертый сезон подкаста Голый Землекоп, пришли новости из Университета Рочестер в NY из лаборатории Веры Горбуновой. Нам пора переименовать проект в “Гренландский кит”.

Профессор Горбунова - одна из главных исследовательниц долгожительства голого землекопа, у нее есть колония землекопов и много публикаций про старение, например посмотрите ее лекцию тут.

Но тут у нее вышел препринт, где она поставила планку еще выше: сделать человека не каким-то землекопом, а немножко гренландским китом. Не в смысле весить 80 тонн, а в смысле жить дольше всех: судя по датировкам гарпунов, которые из них вытаскивают, гренландские киты живут по 200 лет, это рекорд среди млекопитающих.

А вообще-то киты должны жить очень мало или вообще не жить: помните выпуск про парадокс Пето, который доказал, что киты невозможны? Чтобы вырастить такую тушу, надо столько клеточных делений, что обязательно наступят раковые мутации, просто по статистике.

В новой работе Вера Горбунова установила, что ключевая суперспособность гренландских китов - чинить двухцепочечные разрывы ДНК, одна из возможных поломок при делении клеток.

В эксперименте ученые нарочно повреждали ДНК в клетках мышей, людей и китов, и следили за тем, как клетки чинят разрывы. В клетках китов гораздо сильнее работал особый белок (СRIBP), и разрывы чинились с совершенно особой эффективностью. И белок несколько отличается по структуре.

Дальше все как мы любим: клетки человека и мышей заставили производить китовый CRIBP в китовых количествах, и те стали чинить разрывы не хуже китовых.

Мы не станем создавать химеру человека и кита, но вероятно придумаем лекарство для профилактике рака на основе этого механизма.

Пока мы ждем этого лекарства, а также нового сезона, послушайте несколько прошлых выпусков: о парадоксе Пето и почему киты существуют, о голом землекопе, и самый грустный подкаст, в котором есть гренландские киты: киты и ракеты.
🔥38👍6