Заключительная часть истории о том, как информатики делают свой вклад в решение проблемы диагностирования сложных заболеваний.

https://zen.yandex.ru/media/id/5adcc7d90422b4aedfbb4ba2/vich-tuberkulez-i-mashinnoe-obuchenie-5b404e1127773000a9992639

Сегодняшний наш пост на первый взгляд кажется чистым сюрреализмом:) Но в нем чистая правда (а ссылки на материалы, лежащие в его основе, как всегда внизу текста)

Приятного чтения:)
https://goo.gl/9BBgBs

Трям. Сегодня Говорящая мышка притащила вам на хвостике отличный способ приятно и продуктивно провести вечер. Нет-нет, мышка не зовет вас на свидание, вы не подумайте:) Она лишь предлагает встречу с отличными рассказами о том, как устроено живое.
Попался ей этот курс совершенно случайно, но пройти мимо эта жадинка не смогла:)
.
Итак, "Введение в молекулярную биологию и биомедицину" от МФТИ.
.
Курс очень простой и коротенький, смотреть его почти не нужно, достаточно слушать. Вопросы после блоков корректные и несложные, но позволяют лучше закрепить и понять сказанное в видео.
Уровень слушателя: можно совсем ничего не помнить о биологии со школы.

Особенно Мышке понравилась манера изложения лектора. Располагающая, ненавязчивая и в чем-то приятно-неторопливая. Не лекция в классическом понимании этого слова, а скорее разговор за чашкой чая. Да, чая себе под них налить не забудьте:) Приятного просмотра:)
.
#ГоворящаяМышкаОчень_рекомендует
https://stepik.org/course/549

❓ГМО вредно для здоровья и никто не знает, как скажется на детях питание родителей ГМ-продуктами.
✅Весной 2016 года был опубликован доклад, работа над которым шла два года. В его основе - исследования, длившиеся 30 лет. 50 ученых, специалистов от сельского хозяйства и от биотехнологий проанализировали более 900 научных работ. Их целью было выявить влияния ГМ-культур на организм человека и окружающую среду. Получившийся документ рецензировали 26 независимых экспертов. И вердикт таков:
💬По итогам исследования не найдено никаких признаков негативного влияния продуктов из ГМ-культур на здоровье человека. Употребление продуктов из ГМ-культур никак не коррелирует с заболеваниями раком, ожирением, диабетом, болезнями ЖКТ, заболеваниями почек, аутизмом и аллергиями. Не установлено долговременного повышения заболеваемости после массового распространения продуктов питания из ГМ-культур в США и Канаде в 90-е годы. Более того, обнаружены определённые свидетельства положительного влияния ГМО на здоровье людей из-за сокращения количества инсектицидных отравлений и повышения уровня витаминов у населения развивающихся стран.[1]💬

❓Если у меня аллергия на клубнику, ее ген добавили в помидор, будет ли опасен мне этот помидор?
✅Аллергия - это реакция на конкретный белок. Белок кодируется в соответствующих генах. Если в ГМ-продукт добавили именно те гены, которые кодируют аллергенный для вас белок, то аллергия может быть. Подчеркиваю, МОЖЕТ, но не ОБЯЗАТЕЛЬНА в силу многих факторов. Именно поэтому надпись на упаковке “не содержит ГМО” совершенно бессмысленна, а вот надпись на ГМ-продукте, предупреждающая, какой белок добавлен - хороший вариант. ВАЖНО: Все ГМ-продукты тщательно тестируются на аллергенность.

❓А если последствия употребления ГМО проявятся через 30 поколений?
✅Нет таких последствий, которые, ни разу не проявились бы уже в первом поколении. А еще вы сами посчитайте, сколько поколений мышей, евших ГМО, сменилось за эти 30 с лишним лет. А помимо мышек были еще куры, кролики и прочие звери.

❓Если я съем ГМ-морковку, могут ли гены морковки встроиться в мой геном?
✅Не могут. Обычная же морковка в вас не встраивается:)

❓Есть ли риск бесплодия у тех, кто ел ГМ-продукты? Ведь ГМ-растения не способны давать семена.
✅Нет. Растения делают такими специально, чтобы успокоить людей, которые боятся, что растения “убегут” в дикую природу. (Но они, кстати, и не могут убежать. Но это другая история). Существуют тысячи разных ГМ-линий мышей. И размножаются они прекрасно:)🐁🐁🐁

💬Цитата [1] источник https://geektimes.ru/post/276000/

#ГоворящаяМышкаОдобряет

Что это у меня на столе? Нет-нет, не книжка. Рядом. Скажете, блогерский реквизит для красивой картинки? Не угадали! Это наглядные примеры историй из книги, о которой я сейчас прожужжу вам все уши:)
Конечно, параллельно используя реквизит по прямому назначению:)
Итак, слушайте!

❗️Если в школе вы также ненавидели и не понимали химию, как я, - то вам нужна эта книга.
❗️Если любили и понимали, - нужна ещё больше.
❗️Если ваша жизнь посвящена химии, - вы будете в восторге от нее.
❗️Если же «химии» предпочитаете в жизни избегать, то нужна эта книга вам совершенно безоговорочно!
Человек любой профессии найдёт в ней свою, особенную главу. Эту книгу я читала друзьям вслух и забрасывала их фактами оттуда. (И меня даже никто не поколотил, ведь было интересно:))

Хотите:
📌узнать химические секреты варки джемов и почему бронежилет держит пули,
📌погрузиться в химию чайной церемонии и разобраться в многообразии видов чая,
📌узнать, почему листья на деревьях зеленые и как они меняют цвет,
📌перестать бояться кучи всего на свете, что распространяют необразованные люди,
📌удивиться тому, как загорают бегемоты и как вампиры сохраняют свои жертвы пригодными к употреблению (и почему это полезно учёным!!)
📌разобраться в том, что такое цвет и красители,
📌(как я) быть ошарашенной историей о молекулярных машинах,
📌и много ещё всего?
Короче, «Жизнь замечательных веществ» должна стоять на вашей полке! (Полка может быть и электронной😉)

Аркадий Курамшин - химик, преподаватель химии в Казанском университете и научный журналист. В общем, он знает, о чем пишет:) Читать его книгу легко и приятно. Местами встречаются сложные места, но их не избежать, ведь эта книга не просто сыплет фактами, а старается ОБЪЯСНИТЬ все физические и химические процессы и движение мысли ученых.

Из минусов:
- иногда странные картинки, не относящиеся к книге;
- Много опечаток. Это большой камень в огород издательства АСТ.
Итог: книгу #жизньзамечательныхвеществ читать, однозначно #ГоворящаяМышкаРекрмендует!

Обычно рассказ об этом сопровождает фото слепой девушки.
По данным на 2004 год 667 771 детей в возрасте до 5 лет умерли или навсегда остались инвалидами в результате нехватки витамина А[1]. Реальная картина еще страшнее. Некоторые источники называют цифру в 2 миллиона жертв в год.

На нашем земном шарике для 70% населения #рис - это главное и часто единственное блюдо на столе. Их гречка-картошка-хлеб в одном. Но дело в том, что в этом продукте, нет витамина А. При его нехватке человек сначала начинает терять зрение при переходах между светом и полумраком, его слезные каналы забиваются и перестают работать. Потом он необратимо теряет зрение. А потом все, смерть.

Эти же 70% живут в "странах третьего" мира. Об аптеке с рядами витаминов на соседней улице мечтать не будем. Гуманитарные организации с проблемой такого масштаба справиться тоже не могут. А вот генетики смогли! Они создали “золотой рис”!

Разберемся.
Предшественником витамина А является вещество бета-каротин. В обычном рисе он тоже есть, так как нужен растениям для фотосинтеза. Но фотосинтез - он где? В листьях. Вот и бета-каротин растение рис производит только в листьях. А листья-то у него мы не едим…
Упс.
Поэтому задача перед учеными стояла такая: добиться синтеза бета-каротина в съедобной части растения!

В первых экспериментах в геном риса добавили ген psy из нарцисса и ген crt1, взятый у почвенной бактерии Erwinia uredovora. Эти гены были помещены под управление промотора (забыли, что такое промотор? Смотрите предыдущий пост про “паучье” молоко и гм-коз), специфического только для съедобной части риса - эндосперма. Напомним: это значит, что такие внедренные гены могут работать только в эндосперме.

Эксперименты показали, что концентрация бета-каротина в получившихся зернышках риса была довольно малой: в сутки человеку потребовалось бы 10 кг золотого риса, чтобы покрыть норму.

Тогда ученые пошли другим путем: в золотой рис первой модификации (куда добавляли ген crt1) добавили ген из кукурузы. “Золотой рис 2” производил в 23 раза больше каротиноидов, чем первый!

Всего 100-150гр такого риса покрывали 60% суточной потребности организма в витамине А. Экспериментально установлено, что каротин «золотого риса» эффективно перерабатывается в витамин А организмом человека, и что бета-каротин из золотого риса усваивается с той же эффективностью, что и чистый бета-каротин, растворённый в масле. И даже с большей эффективностью, чем каротин из шпината![2]
Но на этом ученые не останавливаются. Исследования продолжаются.

Немного о грустном: бедные страны нуждаются в этом рисе больше всего. И именно там происходит вандализм в отношении ГМ-культур. В августе 2013 группа протестующих, представляющихся как организация фермеров, уничтожила опытное поле на Филиппинах. Знаете, что самое дикое в этой истории? Среди них не было фермеров!
История золотого риса столкнулась с нападками Гринписа, радикалов, экстремистов. Они обвиняли ученых в пособничестве корпорациям и давили на то, что фермеры будут вынуждены платить за гм-сорта огромные деньги. Вот только “корпорации” постановили бесплатное распространение семян золотого риса для фермеров, чей доход не превышает 10 000$ в год (для бедных стран это очень много).

А сейчас я закончу этот пост на внезапно радостной ноте. Еще год назад, в первой редакции этого текста, ничего подобного не могло быть, а сегодня я узнала… Ребята, в мае 2018 года FDA дало разрешение на производство золотого риса! Вся бюрократия пройдена, все разрешения получены. Это победа разума над мракобесием. Официально золотой рис можно выращивать в Австралии, Канаде, Новой Зеландии и теперь в США! И я пошла это отмечать, не обессудьте:))

#ГоворящаяМышкаОдобряет
#золотойрис #генетика

[1] Black R. E., Allen L. H., Bhutta Z. A., Caulfield L. E., de Onis M., Ezzati M., Mathers C., Rivera J. Maternal and child undernutrition: global and regional exposures and health consequences (англ.) // The Lancet. — 2008. — Vol. 371, no. 9608. — P. 243—260. — DOI:10.

1016/S0140-6736(07)61690-0. — PMID 18207566.
[2] Norton, Amy (15 August 2012) Genetically modified rice a good vitamin A source Reuters, Retrieved 20 August 2012

Привет, друзья. К сожалению, на этот канал пока у нас не остается времени и вся активность Lab mouse происходит в инстраграм.

Хотим сообщить вам, что в эту субботу будет живая лекция от нашего проекта. Афиша мероприятия:

Привет! Как проходит ваш карантин? Наш — очень продуктивно. Мы стараемся максимально использовать его так, чтобы «выйти на волю» с новыми знаниями и умениями. Сегодня хотим поделиться с вами подборкой видео о биоинформатике, которые помогут вам сначала понять, что это такое, потом по уши влюбиться в эту науку (кстати, безумно актуальную именно сейчас), ну а потом, возможно, тоже «отправиться во все тяжкие» и связать с нею свою жизнь 😉
Сохраняйте в закладки, ставьте 💚и спешите смотреть:)
Ссылки можно получить в директ или на нашем (временно оживленном) телеграмм канале (ссылка в био).
.
1️⃣Очень короткий, но ОООЧЕНЬ классный рисованный "мультик" о том, что такое биоинформатика, от ФКН ВШЭ
https://www.youtube.com/watch?v=nsYS47jFF8o
.
2️⃣Классная лекция о том, как делается моделирование и зачем это все нужно. Разработка лекарств и борьба с химическим оружием, понимание болезней и создание молекулярных машин.

С этой лекцией биоинформатика становится ближе, а желание связать с ней жизнь острее 😉
"Хватит медитировать — пора моделировать"
https://www.youtube.com/watch?v=WSLZBD04N5k&feature=youtu.be&t=1016
.
3️⃣Набор небольших интервью от человека, вдохновившего когда-то Аню удариться в биоинфу. Михаил Сергеевич Гельфанд рассказывает о том, какие задачи стоят перед современной биоинформатикой и как она пытается их решать.
https://postnauka.ru/courses/42433
Вообще на странице курсов ПостНауки я дрожу от восторга! Я хочу там все от "Биоэтики" до "Краткой истории жизни"! И чтоб все сразу!
.
4️⃣Хорошая лекция о том, куда можно пойти работать, если выбрал путь самурая (зачеркнуто) биоинформатика, какие направления, компании и стартапы существуют и что предлагают миру — "Как устроен рынок биоинформатики"
https://www.youtube.com/watch?v=KSqnm3oZbG8
Эта лекция — часть всего, что устраивает Институт Биоинформатики. С огромным уважением отношусь к ним и их проектам. У них же много классных (и бесплатных) курсов на платформе Stepik.
.
5️⃣Итак, вы перешли на темную сторону и решили, что биоинформатика — это ваше?:) Тогда рекомендую лекции Виктории Коржовой о том, как попасть на учебу/стажировку/работу, как писать резюме и какие документы вам понадобятся, какие soft и hard skills будут полезны.
Начать можно с лекции "Карьера в биоинформатике, часть 1"
https://www.youtube.com/watch?v=tosBbeImaS8
.
Пока все, ффух!:)


Текст: @annie_thornni
Иллюстрация: @mariya_ivolga
#ГоворящаяМышкаРекомендует
#биоинформатика