Lab Mouse
2.13K subscribers
793 photos
258 videos
6 files
371 links
Генетика 🧬 Биоинформатика 💻 Data Science
Лекции: https://gitazone.org/
Инста: https://www.instagram.com/lab.mouse
TikTok: https://www.tiktok.com/@labmousetalks
YouTube: https://www.youtube.com/@GitaZone
Download Telegram
Привет. Мы делаем фестиваль в Ереване: «Вперёд в прошлое»

Да! Будет трансляция (бесплатная и открытая). Но если можете, приходите.

История — наука, смотрящая в прошлое. Такой стереотип прочно прививается еще в школе. Оставляя за кадром самое интересное — безумную гонку самых современных инструментов, технологий и подходов, которые используют современные ученые, чтобы заглянуть в прошлое как можно глубже и точнее. Как менялись привычные нам науки с течением времени и как изучение прошлого помогает науке в настоящем?

- биоинформатик Анна Иванова прочитает лекцию, как читать новости о древней ДНК;
- герпетолог Леонид Неймарк расскажет о змеиной революции;
- историк и социальный антрополог Анна Гребенникова докажет, что история — это наука;
- археолог Иван Семьян поделится секретами роскошной жизни царей бронзового века;
- научный журналист Александр Соколов проверит последние новости из мира археологии.

Место проведения: Коворкинг Letters & Numbers
Ереван, Туманяна 35Г
Сбор с 14:00
Начало в 15:00
💰 Стоимость билета — 8 000 ֏

Оплата наличными на месте.

‼️ Количество мест ограничено, поэтому регистрация обязательна!
https://taplink.cc/lan_yerevan?eventId=99778550-b1f4-488b-8c49-6ab93b792d1a
👍16🔥1
Некоторое время назад давала комментарий порталу Антропогенез по поводу нашумевшей истории с древним кирпичом. Когда меня попросили прокомментировать, и я села писать ответ, что же такого нового и важного в казалось бы давно ординарной и рутинной процедуре, меня озарило.

(очевидной штукой озарило, только не смейтесь. Но почему-то раньше эта штука в голову не приходила).

Важно, конечно, уметь читать научные новости, но вообще-то было бы хорошо, если лежащие в их основе исследования ученые умели нормально писать. Чтоб не только “для своих” была понятна суть. Об этом последние годы довольно много говорится и в научных кругах. Но воз и ныне там — авторы работы про кирпич, написали про кирпич. А должны были совсем не про кирпич.

В фестивале науки, на который мы ждем вас в Ереване завтра (а кто не может прийти к нам ногами, ждем вас на прямой трансляции), я постаралась сосредоточиться именно на этом — показать, КАК нужно читать новости о древней ДНК
(угу, а как популяризатору науки, а не только ученому, иногда очень хочется устроить для некоторых семинар “как писать не для своих”). Вспоминаю, какой совет мне выдала комиссия после моей защиты магистерской диссертации: не писать научные работы “как блогер”.

Нет уж, уважаемые взрослые бородатые дяденьки. Я, пожалуй, останусь тут при своем мнении 😂️️️️️️

(мой коммент к новости можно прочесть ниже. Но на фестиваль все равно приходите! Про кирпич этот окаянный там тоже расскажу😂️️️️️️)
👍17👏61
Учёные выделяют ДНК из всего – даже из кирпича. Но зачем?

Образцы для исследования взяли из недавно найденного глиняного кирпича, доставленного из дворца царя Ашшурнацирапала II (883–859 гг. до н.э.) в древнем городе Калху (Нимруд, Ирак). Британские исследователи ещё в 50-е годы прошлого века подарили находку Национальному музею Дании. Этот сырцовый кирпич развалился на две части при передаче – может быть, не выдержал транспортировки. При заборе образца в 2020 году раскололась и нижняя половинка. Как ни странно, это послужило отличным поводом использовать его для исследования образцов ДНК – на изломе не было современного загрязнения.

Так что свежая поверхность на изломе послужила для забора проб (фото 1, внизу), и после анализа учёные обнаружили в образце 34 группы растений. Откуда они взялись в глиняном кирпиче? Сырец делался из глины, в данном случае – собранной в окрестностях реки Тигр. Для крепости его смешивали с мякиной, соломой или навозом животных. Затем его помещали в форму, подписывали на аккадском и сушили на солнце.

Какие растения удалось обнаружить? Это представители отряда Laurales (лаврообразные, цветковые растения, обитающие в тропиках и субтропиках), а также семь семейств из других отрядов: зонтичные, березовые, капустные, вересковые, злаки, буковые, ивовые.

О том, почему это настолько важное открытие, мы поговорили с Анной Ивановой (канал @lab.mouse), биоинформатиком и специалистом по анализу биомедицинских данных, автором книги «Как ГМО спасает планету и почему люди этому мешают»:

«Сам факт того, что выделенной ДНК 2900 лет, совсем не удивителен. На сегодня ДНК уже выделяли из останков возрастом более миллиона лет (https://www.science.org/content/article/mammoth-molars-yield-oldest-dna-ever-sequenced), а рекордсменом и вовсе является образцы ДНК, которые провели под поверхностью ледника последние два миллиона лет (https://www.nature.com/articles/s41586-022-05453-y). Образцов же возрастом до 10 000 лет у нас тысячи. Так что в этой новости интересен вовсе не возраст. Определение состава древнего биома в «салате» из ДНК множества разных организмов тоже процедура достаточно обычная.
Что здесь нового так это сама идея, что штуку с выделением ДНК можно попробовать провернуть с древним кирпичом (древние кирпичи другие ученые уже исследовали методами химии https://www.nature.com/articles/s41598-022-27071-4, но не генетики). И проблема тут такая — все эти методы работы деструктивны. Чтобы исследовать древнее чего-нибудь — от кости или волоса, до янтаря или кирпича — нужно взять пробу с такой поверхности, которая не соприкасалась с окружающей средой и не была загрязнена более свежей ДНК. Особенно сложно это с пористыми материалами — через поры загрязнение проникает глубоко внутрь. Когда исследователи работают с костями (это тоже пористый материал), им нужно просверлить глубокую дырочку, из которой и забирают образец. С пористым кирпичом все еще сложнее. В идеале его нужно бы разломать и взять пробу с поверхности свежего разлома. Но ломать исторические артефакты идея не очень хорошая. И вот тут авторам работы повезло – кирпич развалился сразу два раза, а при изготовлении он не был обожжён. Именно с такой поверхности разлома и получилось взять пробы, содержащие ДНК растений, попавших в глину при изготовлении кирпича почти 3000 лет назад.

ДНК лучше всего сохраняется при заморозке, быстром сильном высыхании, высоком содержании соли и других методах консервации, которые мы привыкли использовать для заготовки продуктов питания с древних времен, но известны работы, когда ДНК удавалось выделить из древних останков людей, погибших при извержении вулкана (https://www.newscientist.com/article/2322010-an-ancient-roman-who-died-in-pompeii-has-had-their-genome-sequenced), и даже из специально сожженных для сокрытия преступления костей (https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/20832378).
👍198
Так что, возможно, в будущем нас ждут новые работы и на обожженных кирпичах. Вообще же история с этим кирпичом — это потенциально новый путь для исследований. До нее мы не знали, стоит ли подвергать артефакты (например, глиняные таблички) разрушению ради непонятных шансов найти внутри биологические молекулы. Теперь знаем, шансы есть. А значит, впереди у нас еще больше интересных открытий о прошлом человечества – о питании, древней медицине и так далее».

Текст подготовила Анна Гребенникова.

Источник:
https://www.nature.com/articles/s41598-023-38191-w

=======================
Нравятся наши посты? Подпишитесь на наш Sponsr: https://sponsr.ru/antropogenezru
👍211
Трансляция начнется через несколько минут!
Новое видео на канале ScienceVideoLab(@ScienceVideoLab)
Фестиваль «Вперёд в прошлое»

🎬 https://youtu.be/c7d0QmdhFqk
Описание: История — наука, смотрящая в прошлое. Такой стереотип прочно прививается еще в школе. Оставляя за кадром самое ...
👍74
This media is not supported in your browser
VIEW IN TELEGRAM
Моя лекция все, буду слушать коллег😉
🔥17👍5
Ереван! Нужны волонтеры. Буду рада, если распространите по группам 💚

Привет!

24-25 октября с 12:00 по 17:00 на территории филиала Музея-заповедника “Эребуни” -"Кармир-Блур" мы проводим масштабный археологический эксперимент по технологии бронзового и раннего железного веков. На эксперимент требуются волонтёры — нам нужна физическая помощь. Эксперимент проводится совместно с Научно-просветительским порталом АНТРОПОГЕНЕЗ.РУ при участии Александра и Георгия Соколовых. Приглашаем к участию!

Контакты:
Иван Семьян @ivansemyan
Анна Гребенникова @matras_na_bolote

Адрес: г. Ереван, напротив школы на ул. Ширака 74, музей Кармир Блур, пост охранника около шлагбаума
👍182
This media is not supported in your browser
VIEW IN TELEGRAM
У нашей ереванской котобанды новый подопечный — спасенный от собак в Дилижане малыш по имени Оладушек. Малыш с пылу с жару 😎 Можно начинать влюбляться и присматриваться для укотовления. И обязательно рассказывать про него вашим друзьям!
31😍6👍5
Вчера записали с Александром Соколовым (@antropogenez_ru) новый выпуск #подкаст_Мышь_Погрызла 😎

А сегодня бежала с работы на лекцию и отслушивала уже смонтированный Павлом Хамидуллиным эпизод. Был Александр в одном ухе, а теперь в обоих ухах😂 И в 3D😎
👍254
До меня все еще доходит смысл. Сегодня были с Севой в клинике. Сейчас мне позвонили. Готовы результаты анализов.

Ей диагностировали 4-ю стадию болезни почек. По прогнозам это несколько месяцев жизни.

Спросили нас, будем ли пытаться лечить. Ответила, что будем бороться за нее до момента, пока качество ее жизни не станет плохим.

За еще одним мнением не вижу смысла идти, это лучшая клиника Еревана. И по сути, это и было второе мнение после лечения в августе без диагноза в другой клинике.

Сева больше не пристраивается, мы будем с ней до конца.
😢63💔1814👍1