Помните была заметка о химии вкусов, в ней я упоминал вещество зизифин из китайского финика? А потом при рассмотрении ханибуш и ройбос, упоминалось вещество эриодиктол, модификатор вкуса маскирующий горечь. Сегодня у нас на повестке миракулин.

Это вещество растения Путерия сладковатая. В обычном состоянии миракулин попадая в рот просто блокирует рецепторы сладкого вкуса. Но стоит съесть что-то кислое (4,8<рН<6,5) как пептид начинает выступать уже в роли активатора рецепторов. И вот активированные рецепторы теперь реагируют только на кислое. Миракулиновый watchdog: в мозг посылается сигнал “сладкое!” только когда в ротовую полость попадает что-то кислое

Самое известное применение вещества - это т.н. flavor-tripping parties. Посетители съедают ягоду путерии, а потом пробуют на вкус кислые продукты блюда (лимоны, лаймы, соленые огурцы, кислые соусы) и оценивают как меняется их вкус.

Углублено про физиологию рецепторов сладкого вкуса T1R2/T1R3 разобрано здесь или здесь

#вкусмод

Уходит эпоха?

Почти два года тому назад в одной из заметок я фантазировал по поводу рисков, которые несет "публичный" разбор ДНК с помощью компаний вроде 23andMe. Эта компания стала гентех-пионером, благодаря ей миллионы людей заинтересовались темой генетики/геномики. Миллионы отправили свой генетический материал (слюну в пробирках) на исследования. Миллионы нашли новых родственников.

И вот вчера я увидел новость о том, что компания подала заявление на банкротство. На пике в 2021 году компания, которой до вчерашнего дня руководила Энн Воджицки, бывшая жена основателя Google Сергея Брина, оценивалась в 6 миллиардов долларов. Сейчас её стоимость -11 миллионов долларов (за столько СЕО ее предлагает выкупить). И стороннего покупателя, вроде не предвидится. Может владелица сама и выкупит сбросившую долги и ненужных акционеров компанию 🤷‍♀️

Давайте вспомним что это за проект, один из ярчайших на небосклоне гентеха, отработавший почти 20 лет. И почему он пришел к банкротству.

Первая причина - это️...23andMe - это генетическая панель, анализ примерно 1,5 миллиона однонуклеотидных вариантов (Single Nucleotide Variants, SNV) - мелких изменений в ДНК, которые связаны с наследственными заболеваниями, чертами внешности, нашим происхождением etc. Хотя если смотреть отстраненно, наш геном - это 3 млрд. позиций и все-все-все SNV это лишь капля в океане. Метод конечно позволяет находить у клиента уже изученные генетические ассоциации, но не годится для открытия новых. Т.е. один раз проверить свою ДНК можно, а дальше уже никакого смысла во взаимодействии с компанией нет. Никто в компании, судя по всему, просто не представлял на чем им зарабатывать после того, как все желающие сделают тест.

Вторая причина - это...В попытке найти источники финансирования компания решила использовать все накопленные пользовательские данные и заключила сделку с фармкомпанией GSK, продав ей доступ к генетическим данным клиентов. Притом не спрашивая, хотели ли сами пользователи, чтобы информация об их ДНК использовалась бизнесом. В итоге акции компании на бирже за пару лет от 6 млрд. до 150 млн. долларов, т.е. почти 99%!

Третья причина - это...Неуправляемые утечки данных из-за хакерских атак. Во время самой крупной в сеть попали данные почти 7 млн пользователей, компанию завалили судебными исками и требованиями выплат компенсаций. Про доверие клиентов и говорить как-то совестно. Про утечки было здесь

Гентех-мастодонт прошлого не смог адаптироваться к реалиям нового мира, ни технологически, ни коммерчески. Он, конечно, навсегда останется в нашем сердце, но...

Но SNP - это уже атавизм. Сегодня все внимание приковано к полному сексенированию генома. То самое, которое в 2000х стоило миллиарды долларов и требовало годы времени, а сейчас можно уложится в 1000 долларов и месяц работы. И самое главное, полное секвенирование позволяет не только единоразово узнать хорошо аннотированные предрасположенности, но и, что самое главное, пересматривать результаты и предсказания по мере появления новых научных данных.

***
Если посылал данные в 23andMe → ставь 🥴
Если посылал данные в другие компании (MyHeritage, Living DNA, Genotek и др)→ ставь 🌚
Если "берег честь ДНК с молоду" и никому пробу не посылал → ставь 🎉

Попрощаться с PCR

Ох какая красивая работа недавно подъехала от биомед инженеров Ульсанского национального института науки и технологий в Южной Корее. Опубликована в мартовском номере Biosensors and Bioelectronics

Исследователи сделали серию синтетических аналогов нуклеиновых кислот, т.н. peptide nucleic acid (PNA). По сути это обычная нуклеиновая кислота (как ДНК или РНК), но в ней фосфорная база заменена на пептидоподобный полимер, состоящий из повторяющихся N-(2-аминоэтил)глициновых звеньев. Такой исскуственный гибрид способен связываться с основаниями ДНК/РНК по принципу комплементарности и самое главное, намного устойчивее к деградации эндогенными ферментами (нуклеазами и протеазами).

Затем две PNA были использованы в качестве диагностических зондов на замену PCR. Соединения одновременно связываются с рибосомной РНК бактерий. Если последовательность искомая, то молекулы зондов гибридизуются друг с другом на расстоянии 1-10 нм, что позволяет реализовать т.н. Förster Resonance Energy Transfer - это безизлучательный перенос энергии между двумя флуорофорами: донором и акцептором. При этом донор возбуждается, передавая энергию акцептору через диполь-дипольное взаимодействие. Наблюдаем свечение. Если последовательность "пустая" (т.е. бактерия НЕ искомая, нуклеотиды НЕ совпадают), то зонды разнесены в пространстве более чем на 10 нм, энергия не сможет передаваться методом Förster Resonance Energy Transfer. Светится нечему

Это открытие может перевернуть всю индустрию диагностики инфекций, особенно emergency инфекций, когда необходимо мгновенное реагирование (вроде сепсиса или пневмоний). Быстро, точно, дешево, лаконично и красиво. В перспективе это сможет позволить полностью отказаться от "слепого" использования антибиотиков широкого спектра, когда не понятно, какую инфекцию надо лечить и пытаются лечить все сразу.

Вот так, незаметно, и наступает будущее. Корейцы - просто красавцы 😍

Персональные Карловы Вары - в каждый дом

- Слушай, как это вообще? Я зашел к тебе в гости, а у тебя нет премиальной минеральной воды в холодильнике? (С) один ядерный физик

Стало припекать (Klimaatnood же), а значит самое время задуматься про водно-солевой баланс, как каждый год к лету (тыц!). Поэтому на местах к поискам ароматного кофе/чая/тизана добавились еще и поиски правильной минеральной воды. Всё ведь начинается с воды

Что есть правильная минеральная вода? Имхо это что-то высокоминерализованное и обязательно щелочное. Последнее предпочтение у меня оформилась после того, как были перепробованы все #минводы Карловых Вар

В общем решил я пройтись с рН-метром (+TDS-метром) и проверить что там за минеральные воды продаются в разных массовых гипермаркетах и насколько они целесообразны под техзадачу борьбы с метаболическим ацидозом (от похмелья, от физнагрузок, от _вписать_нужное_). Ищем премиальность среди обыденности, а обыденность среди премиальности. Не переключайтесь

Основной тред здесь

Продолжаем про #минводы

Чтобы было проще оперировать ТТХ разных розничных минеральных вод, предлагаю ввести “паспорт минералки” с краткой формулой. Так как классификаций существует миллион, то мы сделаем собственную, по @lab66.

Вначале пишем название (бренд), затем общую минерализацию (мг/л), затем дробь, в числителе которой значимые анионы (все что более 50 мг/л), название по первым двум позициям. В знаменателе-значимые катионы (все что больше 50 мг/л), название по первому катиону. За дробью, в фигурных скобках - биологически активные микроэлементы, если вода их содержит, то она может считаться _специфичной_, вроде какого-то специального инструмента. Так сравнивать будет проще.

В качестве пояснения к методологии составления паспорта приведу несколько примеров с описанием знакомым многим минеральных вод:

💧 BORJOMI_5757_[HCO3_3625,Cl_320]/[Na_1450,Ca_63] - вода гидрокарбонатно-хлоридная натриевая (тыц!)

💧 ESSENTUKI-17_12000_ [HCO3_5700, Cl_4500]/[Na+K_3350, Mg_150, Ca_125]*{Бор_65} - вода гидрокарбонатно-хлоридная калий-натриевая специфичная (бор)

💧 ESSENTUKI-4_8500_[HCO3_4125, Cl_1650]/[Na+K_2500, Ca_80]*{Бор_45, Кремний_30} - вода гидрокарбонатно-хлоридная калий натриевая специфичная (бор, кремний)

Основные вводные. Во-первых доказательств того, что минеральная вода может выступать в качестве хоть какого-то лекарства - нет. Бальнеотерапия - это особый вид магии симптоматического ухода. Но! Но необычные комбинации микроэлементов в своей синергии могут выступать в роли этакой биологически активной добавки так или иначе сдвигающий равновесия внутри организма в нужную сторону. Меняя микроэлементный состав крови кое-чего добиться да можно.

Во-вторых. Все минеральные воды оцениваются в первую очередь по уровню общей минерализации. Здесь есть следующее деление:

🚰Воды с минерализацией меньше 1000 мг/л - это столовые воды.

Мы их даже рассматривать не будем, потому что особой разницы с kranówka нет, не интересно. Фактически это обычная газированная вода, такие воды составляют превалирующую группу в большинстве магазинов, пить их можно как обычную воду.

🚰 Воды с минерализацией 2000-5000 мг/л и воды (специфичные) с минерализацией менее 2000 мг/л, но содержащие биологически активные микроэлементы.

Такая вода называется лечебно-столовой и обладает выраженным физиологическим действием. Такие воды могут использоваться как столовый напиток, но только при НЕ систематическом употреблении. Полностью заменять ими всю жидкость выпиваемую за день не стоит. Эффекты в основном диуретические

🚰 Воды с минерализацией 5000-10000 мг/л (или меньше 5000 мг/л, но с биологически активными микроэлементами). Это уже питьевые-лечебные. Они, условно говоря, должны применяться как лекарственное средство, по согласованию с врачем, в сторого дозированных количествах. Редко, но метко. Отлично идут для промывания желудка, как слабительное, для ингаляции etc

***
Нужна такая классификация, потому что сейчас наряду с водами, имеющими интересные физиологические свойства разливается немало «местных» вод, наводняющих рынок. Рекламируются они широко, активно, но не имеют сколь-либо значимого эффекта даже теоретически, чистый плацебо-эффект.

И да, важное. Подходящие для конкретной цели (или на замену) минеральные воды десятилетиями подбирают опираясь в основном на схожесть составов, действуя сугубо методом аналогий. Причем используются специальные таблицы из 1960х годов (т.н. таблица Александрова, или Александрова-Невраева). Никаких панацей и абсолютно уникальных свойств ни у одной отдельной минеральной воды нет. Только химия и геология, а они универсальны для разных мест планеты. Так что гонятся за "уникальной водой гор Шамбалы" не всегда целесообразно, целесообразно смотреть на геологические фармации своей местности и оценивать состав того, что из них вытекает.

политические #минводы №1

Вчера в приканальном чате всплыли примеры минеральной воды, мелькавшие в сочетании с политиками. Посмотрим что за они

На первом месте Обама и саммит G20 в апреле 2009. И "реклама" компании Buxton Water 👇🏻

💧Buxton_280_[HCO3_248]/[Ca_55, Na_24, Mg_19]. Гидрокарбонатно-кальциевая, нейтральная (рН 7.2)

На втором месте Трамп в ноябре 2017, когда он отпил из бутылки воду Fiji Water. Артезианская вода, которая поставляется в США из водоносного горизонта Viti Levu 👇🏻

💧Fiji Water_222_[HCO3_152]/[Ca_18, Na_17, Mg_15]*{кремний_93, фтор_0.24]. Гидрокарбонатно-кальциевая специфичная по кремнию и фтору, слабощелочная (рН 7.7)

На третьем месте у нас лукашенко + С. Сигал в августе 2016. Пили они итальянскую Acqua Panna 👇🏻

💧Acqua Panna_141_[HCO3_106]/[Ca_32, Na_6, Mg_6]*{кремний_7}. Гидрокарбонатно-кальциевая специфичная по кремнию, cлабощелочная (рН 8)

На политиков ориентироваться смысла нет. Все воды очень низкой минерализации, ничего интересного. Маркетинг + обычная kranówka 🥱

#минводы Rzeczpospolita Polska. Бюллетень №1

💧 Slotwinka_3482_[HCO3_2658]/[Na_270, Mg_226, Ca_219]. Вода высокой минерализации, гидрокарбонатно-натрий-магний-кальциевая. pH 8.3 Вкус 3 из 5
EC = 2.92 mS, ppm (442) = 2100

💧 Wielka Pieniawa_1382_[HCO3_917]/[Ca_256]*{фтор_0.28}. Вода гидрокарбонатно кальциевая низкой минерализации (в списке из-за специфичности по фтору). рН 7.92 Вкус 2 из 5
EC = 1.26 mS, ppm (442) = 880

💧 Piwniczanka_1701_[HCO3_1267]/[Ca_168, Na_119]*{фтор_<0.4}. Вода гидрокарбонатно кальций-натриевая низкой минерализации (в списке из-за специфичности по фтору). рН 7.6 Вкус 2 из 5
EC = 1.48 mS, ppm (442) = 1040

***
Slotwinka ~ в 4 раза дороже остальных и вода рыжего цвета, мутная. Две остальные - прозрачные, но вкусом не выделяются относительно kranówka, т.е. могут выступать в качестве повседневных столовых (не лечебно-столовых). Все щелочные (в порядке убывания рН: Slotwinka→Pieniawa→Piwniczanka). Вкус/состав не запоминающийся. Едем дальше!

Полностью разборы здесь

И все "личиподобное"

Недавно возник терминологический спор, связанный с личи. Фрукт этот (рис. №1) непростой, не зря ему была даже посвящена даже отдельная аудио-заметка фитохимика, выпущенная в эфир беларусского радио

Но под личи, особенно сушеные, мимикрирует много продуктов 👇🏻

№1 "классические" личи - это плоды Litchi chinensis,сем. Сапиндовые. На борту 82% воды, в 100 г продукта 79% дневной дозы (ДД) вит. С
№2 лонган - это плоды Dimocarpus longan, род Dimocarpus сем. Сапиндовые. Внутри 83% воды, 93% ДД вит. С, 11% ДД вит B2
№3 лангсат - это плоды Lansium parasiticum сем Мелиевые (как Азадирахта индийская она же ним). Внутри 90% воды, 15% крахмала, 10% ДД калия
№4 рамбутан - это плоды Nephelium lappaceum, сем. Сапиндовые. Внутри 78% воды, 8% ДД вит. B3, 15% ДД магния

Теперь вопрос к коллективному разуму комьюнити. На ваш взгляд, что ближе всего к личи по вкусу/аромату?

Ближе лонган→ставь 😐
Ближе лангсат→🫡
Ближе рамбутан→🎉
Личи ни с чем не сравнить→🥴
Ничего не пробовал→🌚
Пробовал только личи→🤝