#РМЖ #метастазы #микроРНК #news
Ученые выявили клеточные взаимодействия, ответственные за метастазы при раке молочной железы.
Сотрудники факультета биологии и биотехнологии ВШЭ идентифицировали гены, которые играют ключевую роль в метастазировании рака молочной железы. Результаты этого исследования опубликованы в журнале PLOS ONE.
В каждой человеческой клетке находится огромное количество молекул: ДНК, РНК, белков и пр. МикроРНК – один из существенных классов внутриклеточных молекул, они взаимодействуют друг с другом, а также со своими генами-мишенями и факторами транскрипции. МикроРНК – это небольшие молекулы, которые напрямую снижают экспрессию генов-мишеней, тогда как транскрипционные факторы способны как повышать, так и понижать экспрессию микроРНК и генов. В здоровых клетках такие взаимодействия необходимы для нормальной жизнедеятельности, но в раковых клетках определенные взаимодействия «ломаются», что позволяет опухолям распространяться и избегать лечения.
Декан факультета биологии и биотехнологии Александр Тоневицкий вместе со своим коллегой Степаном Нерсисяном и исследователями из МГУ Алексеем и Владимиром Галатенко разработали алгоритм, который воссоздает сеть межклеточных взаимодействий раковых клеток. Они использовали эту программу для выявления ключевых молекул, ответственных за метастазирование рака молочной железы.
Для моделирования сети взаимодействий микроРНК между собой, а также их мишенями и транскрипционными факторами они применили метод машинного обучения. Главная особенность программы заключается в ее способности интегрировать разные источники данных, включая разнообразные базы данных по взаимодействиям и профилям экспрессии изучаемых молекул в наборах образцов.
Для определения наиболее важных для процесса метастазирования рака молочной железы молекул авторы использовали сеть взаимодействий рака молочной железы. Ключевым регулятором для многих маркерных генов, чья экспрессия позволяет ученым предсказывать с высокой точностью возникновение метастазов, оказался фактор транскрипции E2F1.
«Мы предложили гипотезу, согласно которой прогностическую информацию могут содержать наиболее активные молекулы в устоявшейся сети: если с ними что-то случается после образования первичной опухоли, большое количество нарушенных взаимодействий может увеличить вероятность метастазирования. Предварительные результаты подтверждают эту гипотезу. Более того, большая доля выявленных прогностических генов оказалась непосредственно связанной с активностью одной единственной молекулы – E2F1», цитирует Степана Нерсисяна из Международной лаборатории микрофизиологических систем ВШЭ MedicalXpress.
Ученые выявили клеточные взаимодействия, ответственные за метастазы при раке молочной железы.
Сотрудники факультета биологии и биотехнологии ВШЭ идентифицировали гены, которые играют ключевую роль в метастазировании рака молочной железы. Результаты этого исследования опубликованы в журнале PLOS ONE.
В каждой человеческой клетке находится огромное количество молекул: ДНК, РНК, белков и пр. МикроРНК – один из существенных классов внутриклеточных молекул, они взаимодействуют друг с другом, а также со своими генами-мишенями и факторами транскрипции. МикроРНК – это небольшие молекулы, которые напрямую снижают экспрессию генов-мишеней, тогда как транскрипционные факторы способны как повышать, так и понижать экспрессию микроРНК и генов. В здоровых клетках такие взаимодействия необходимы для нормальной жизнедеятельности, но в раковых клетках определенные взаимодействия «ломаются», что позволяет опухолям распространяться и избегать лечения.
Декан факультета биологии и биотехнологии Александр Тоневицкий вместе со своим коллегой Степаном Нерсисяном и исследователями из МГУ Алексеем и Владимиром Галатенко разработали алгоритм, который воссоздает сеть межклеточных взаимодействий раковых клеток. Они использовали эту программу для выявления ключевых молекул, ответственных за метастазирование рака молочной железы.
Для моделирования сети взаимодействий микроРНК между собой, а также их мишенями и транскрипционными факторами они применили метод машинного обучения. Главная особенность программы заключается в ее способности интегрировать разные источники данных, включая разнообразные базы данных по взаимодействиям и профилям экспрессии изучаемых молекул в наборах образцов.
Для определения наиболее важных для процесса метастазирования рака молочной железы молекул авторы использовали сеть взаимодействий рака молочной железы. Ключевым регулятором для многих маркерных генов, чья экспрессия позволяет ученым предсказывать с высокой точностью возникновение метастазов, оказался фактор транскрипции E2F1.
«Мы предложили гипотезу, согласно которой прогностическую информацию могут содержать наиболее активные молекулы в устоявшейся сети: если с ними что-то случается после образования первичной опухоли, большое количество нарушенных взаимодействий может увеличить вероятность метастазирования. Предварительные результаты подтверждают эту гипотезу. Более того, большая доля выявленных прогностических генов оказалась непосредственно связанной с активностью одной единственной молекулы – E2F1», цитирует Степана Нерсисяна из Международной лаборатории микрофизиологических систем ВШЭ MedicalXpress.
journals.plos.org
miRGTF-net: Integrative miRNA-gene-TF network analysis reveals key drivers of breast cancer recurrence
Analysis of regulatory networks is a powerful framework for identification and quantification of intracellular interactions. We introduce miRGTF-net, a novel tool for construction of miRNA-gene-TF networks. We consider multiple transcriptional and post-transcriptional…
#синдромтакоцубо #микроРНК #кардиология #news
Найдено возможное объяснение загадочному синдрому такоцубо.
Синдром такоцубо, также известный как синдром разбитого сердца, это редкое и обратимое состояние с симптомами как у неострого сердечного приступа и протекающее без блокировки коронарных артерий. Поражающий в большей степени женщин синдром такоцубо провоцируют стрессовые события, например, тяжелая утрата, а результатом реакции организма становится ослабление левого желудочка сердца вплоть до его временной дисфункции.
Ученые из Имперского колледжа Лондона установили, что вероятность развития синдрома такоцубо повышается при повышении уровня определенных микроРНК, малых молекул, которые регулируют активность генов. Это исследование, проведенное под эгидой Британского кардиологического фонда и опубликованное в журнале Cardiovascular Research, поможет лучше понять природу заболевания, а следовательно, укажет новые пути выявления пациентов с риском развития синдрома такоцубо и его лечения.
«Синдром такоцубо – серьезный недуг, но до сих пор механизм его возникновения оставался загадкой. Мы не понимаем, почему одни люди реагируют на внезапный эмоциональный шок таким образом, а другие – нет», цитирует издание The Tribune профессора Шан Хардинг из Имперского колледжа Лондона. «Это исследование подтверждает, что предшествующий стресс и ассоциированные с ним микроРНК могут быть предпосылками для развития синдрома такоцубо в ситуации будущего стресса. Стресс многообразен, и нужно продолжить исследования, чтобы понять процессы, связанные с хроническим стрессом», говорит Хардинг.
Две микроРНК, они называются микроРНК-16 и -26а, ранее были обнаружены в крови пациентов с синдромом такоцубо, но до сих пор было неизвестно, вовлечены ли они в развитие заболевания. Известно, что сердечная недостаточность может быть следствием нарушения работы какого-то участка сердечной мышцы из-за резкого подъема уровня адреналина, который вызывает внезапный стресс. В публикуемом исследовании авторы измеряли ответ клеток сердца человека и крысы на адреналин после воздействия двумя микроРНК. Клетки сердца, культивированные с микроРНК, были более чувствительны к адреналину, и это было сопряжено с большей вероятностью того, что они утратят способность сокращаться. Это значит, что изменения, подобные наблюдаемым при синдроме такоцубо, происходят и при низких дозах адреналина.
По словам авторов исследования, в будущем может быть разработан метод анализа крови на содержание микроРНК, позволяющий выявлять людей, подверженных риску развития синдрома такоцубо.
Найдено возможное объяснение загадочному синдрому такоцубо.
Синдром такоцубо, также известный как синдром разбитого сердца, это редкое и обратимое состояние с симптомами как у неострого сердечного приступа и протекающее без блокировки коронарных артерий. Поражающий в большей степени женщин синдром такоцубо провоцируют стрессовые события, например, тяжелая утрата, а результатом реакции организма становится ослабление левого желудочка сердца вплоть до его временной дисфункции.
Ученые из Имперского колледжа Лондона установили, что вероятность развития синдрома такоцубо повышается при повышении уровня определенных микроРНК, малых молекул, которые регулируют активность генов. Это исследование, проведенное под эгидой Британского кардиологического фонда и опубликованное в журнале Cardiovascular Research, поможет лучше понять природу заболевания, а следовательно, укажет новые пути выявления пациентов с риском развития синдрома такоцубо и его лечения.
«Синдром такоцубо – серьезный недуг, но до сих пор механизм его возникновения оставался загадкой. Мы не понимаем, почему одни люди реагируют на внезапный эмоциональный шок таким образом, а другие – нет», цитирует издание The Tribune профессора Шан Хардинг из Имперского колледжа Лондона. «Это исследование подтверждает, что предшествующий стресс и ассоциированные с ним микроРНК могут быть предпосылками для развития синдрома такоцубо в ситуации будущего стресса. Стресс многообразен, и нужно продолжить исследования, чтобы понять процессы, связанные с хроническим стрессом», говорит Хардинг.
Две микроРНК, они называются микроРНК-16 и -26а, ранее были обнаружены в крови пациентов с синдромом такоцубо, но до сих пор было неизвестно, вовлечены ли они в развитие заболевания. Известно, что сердечная недостаточность может быть следствием нарушения работы какого-то участка сердечной мышцы из-за резкого подъема уровня адреналина, который вызывает внезапный стресс. В публикуемом исследовании авторы измеряли ответ клеток сердца человека и крысы на адреналин после воздействия двумя микроРНК. Клетки сердца, культивированные с микроРНК, были более чувствительны к адреналину, и это было сопряжено с большей вероятностью того, что они утратят способность сокращаться. Это значит, что изменения, подобные наблюдаемым при синдроме такоцубо, происходят и при низких дозах адреналина.
По словам авторов исследования, в будущем может быть разработан метод анализа крови на содержание микроРНК, позволяющий выявлять людей, подверженных риску развития синдрома такоцубо.
OUP Academic
Circulating microRNAs predispose to takotsubo syndrome following high-dose adrenaline exposure
AbstractAims . Takotsubo syndrome (TTS) is an acute heart failure, typically triggered by high adrenaline during physical or emotional stress. It is distinguish
#РМЖ #микроРНК #рмж #news
Использование в качестве биомаркера микроРНК может повысить точность предсказания рецидива рака молочной железы
Специфическая микроРНК, miR-145, может идентифицировать пациентов с раком молочной железы, которым потребуется дополнительная терапия и мониторинг для улучшения послеоперационных результатов, сообщает Newswise.
Исследователи из Университета Голуэй в Ирландской Республике, авторы публикации в Journal of the American College of Surgeons, обнаружили, что у пациентов с повышенной экспрессией определенного типа миРНК, miR-145, рецидив рака молочной железы маловероятен. По словам ведущего автора Мэтью Г. Дэйви, miR-145 ингибирует развитие и прогрессирование рака молочной железы. «Мы показали, что повышенная экспрессия этого биомаркера, которая была измерена в образцах крови пациентов во время химиотерапии, на самом деле предсказывала их долгосрочный онкологический исход», сказал Дэйви. «Мы можем предсказать тех, кто, вероятно, будет страдать от рецидива, и тех, кто не будет рецидивировать», добавил он.
Авторы считают, что miR-145 может помочь выявить пациентов, которым необходимо более тщательное отслеживание онкологического процесса и индивидуальная стратегия лечения на послеоперационном этапе. Точно так же это может также выявить пациентов с меньшим риском рецидива и, возможно, не нуждающихся в системном лечении, которое часто может иметь вредные побочные эффекты.
В описываемом перспективном многоцентровом исследовании приняли участие 124 пациентки, получавшие стандартную неоадъювантную химиотерапию по поводу локализованного рака молочной железы в восьми независимых центрах лечения по всей Ирландии. Тип химиотерапии варьировал в зависимости от решения лечащего врача. Образцы крови пациентов забирали в течение трехлетнего периода (май 2011 г. — апрель 2014 г.) в двух временных точках — при постановке диагноза и на середине химиотерапевтического лечения. Уровни экспрессии микроРНК оценивали в каждый момент времени. Исследование показало, что повышенная экспрессия miR-145 коррелирует с улучшением результатов почти через девять лет наблюдения. Увеличение количества miR-145 статистически достоверно предсказывало улучшение безрецидивной выживаемости. Повышенные уровни экспрессии miR-145 не предсказывали общую выживаемость.
Авторы изучили пациентов с любым из пяти подтипов рака молочной железы, хотя исследование не было разработано или рассчитано на определение того, насколько эффективна miR-145 в прогнозировании результатов для любого конкретного подтипа рака молочной железы. Они планируют дальнейшие клинические испытания, чтобы помочь ответить на этот вопрос. Также проводятся исследования с целью выяснения, может ли быть увеличена экспрессия микроРНК у пациентов с раком молочной железы.
Использование в качестве биомаркера микроРНК может повысить точность предсказания рецидива рака молочной железы
Специфическая микроРНК, miR-145, может идентифицировать пациентов с раком молочной железы, которым потребуется дополнительная терапия и мониторинг для улучшения послеоперационных результатов, сообщает Newswise.
Исследователи из Университета Голуэй в Ирландской Республике, авторы публикации в Journal of the American College of Surgeons, обнаружили, что у пациентов с повышенной экспрессией определенного типа миРНК, miR-145, рецидив рака молочной железы маловероятен. По словам ведущего автора Мэтью Г. Дэйви, miR-145 ингибирует развитие и прогрессирование рака молочной железы. «Мы показали, что повышенная экспрессия этого биомаркера, которая была измерена в образцах крови пациентов во время химиотерапии, на самом деле предсказывала их долгосрочный онкологический исход», сказал Дэйви. «Мы можем предсказать тех, кто, вероятно, будет страдать от рецидива, и тех, кто не будет рецидивировать», добавил он.
Авторы считают, что miR-145 может помочь выявить пациентов, которым необходимо более тщательное отслеживание онкологического процесса и индивидуальная стратегия лечения на послеоперационном этапе. Точно так же это может также выявить пациентов с меньшим риском рецидива и, возможно, не нуждающихся в системном лечении, которое часто может иметь вредные побочные эффекты.
В описываемом перспективном многоцентровом исследовании приняли участие 124 пациентки, получавшие стандартную неоадъювантную химиотерапию по поводу локализованного рака молочной железы в восьми независимых центрах лечения по всей Ирландии. Тип химиотерапии варьировал в зависимости от решения лечащего врача. Образцы крови пациентов забирали в течение трехлетнего периода (май 2011 г. — апрель 2014 г.) в двух временных точках — при постановке диагноза и на середине химиотерапевтического лечения. Уровни экспрессии микроРНК оценивали в каждый момент времени. Исследование показало, что повышенная экспрессия miR-145 коррелирует с улучшением результатов почти через девять лет наблюдения. Увеличение количества miR-145 статистически достоверно предсказывало улучшение безрецидивной выживаемости. Повышенные уровни экспрессии miR-145 не предсказывали общую выживаемость.
Авторы изучили пациентов с любым из пяти подтипов рака молочной железы, хотя исследование не было разработано или рассчитано на определение того, насколько эффективна miR-145 в прогнозировании результатов для любого конкретного подтипа рака молочной железы. Они планируют дальнейшие клинические испытания, чтобы помочь ответить на этот вопрос. Также проводятся исследования с целью выяснения, может ли быть увеличена экспрессия микроРНК у пациентов с раком молочной железы.
Newswise
When Used as a Biomarker, MicroRNA Can Help Predict Which Breast Cancer Patients Are More Likely to See Their Cancer Come Back
MicroRNA (miRNA) can be used as a biomarker to predict which patients are likely to face breast cancer recurrence and mortality, according to study results publ