🧬آغاز به کار کانال انجمن علمی ژنومیک و اپی‌ژنومیک

📌انجمن ژنومیک و اپی‌ژنومیک با هدف توسعه دانش و ترویج نگاه علمی در حوزه ژنومیک و اپی‌ژنومیک شکل گرفته است. این انجمن با رویکردی بین‌رشته‌ای، زمینه تعامل و تبادل دانش میان دانشجویان و پژوهشگران رشته‌های مختلف از جمله ژنتیک، بیوتکنولوژی، بیوانفورماتیک و علوم داده و کامپیوتر را فراهم می‌کند.

🔖در این کانال، محتوای علمی منتخب شامل معرفی مفاهیم پایه، بررسی مقالات علمی، و پرداختن به موضوعات نوین و کاربردی مرتبط با ژنومیک و اپی‌ژنومیک منتشر خواهد شد.

↙️هدف از ایجاد این فضا، ارتقای سطح آگاهی علمی، تسهیل یادگیری و ایجاد بستری برای مشارکت علمی علاقه‌مندان، به‌ویژه دانشجویان، در یک محیط پویا و تعاملی است.

🔸از همراهی شما در این مسیر خرسند خواهیم شد.🌱

Genomics and Epigenomics Association
🔻🧬🔻🧬🔻
🆔https://t.iss.one/epigenomicASMU

🔸an introduction to "Epigenomics"🧬

مروری بر مکانیسم‌های اپی‌ژنتیکی کلیدی در تنظیم ژن. (1) متیلاسیون و دمتیلاسیون DNA: افزودن یا حذف آنزیمی گروه‌های متیل (–CH3) در سیتوزین (معمولاً در دی‌نوکلئوتیدهای CpG). متیلاسیون DNA معمولاً با سرکوب رونویسی همراه است، در حالی که دمتیلاسیون می‌تواند فعال‌سازی رونویسی را فعال کند. (2) مکانیسم‌های مبتنی بر RNA: ncRNAهای تنظیمی، شامل ncRNAهای کوتاه (miRNAها، piRNAها، siRNAها) و ncRNAهای بلند (lncRNAها، RNAهای حلقوی)، واسطه بازسازی کروماتین، خاموش‌سازی رونویسی و تخریب mRNA هستند. (3) اصلاحات هیستون: اصلاحات پس از ترجمه (استیلاسیون، متیلاسیون، یوبیکوئیتیناسیون، SUMOylation) به پروتئین‌های هیستون اضافه می‌شوند و فشردگی کروماتین و بیان ژن را تعدیل می‌کنند. این اصلاحات یک "کد هیستون" پویا ایجاد می‌کنند که می‌تواند رونویسی را به روشی وابسته به زمینه فعال یا سرکوب کند. (4) سازماندهی ژنوم سه‌بعدی (3D): سازماندهی فضایی کروماتین درون هسته، شامل حلقه‌های کروماتین و دامنه‌های مرتبط با توپولوژی (TADs)، که تعاملات بین عناصر تنظیمی و پروموترهای ژن را تسهیل یا مهار می‌کنند و در نتیجه رونویسی را تنظیم می‌کنند.

🔴 اولین همایش ملی کاربرد روش‌های نوین در میکروبیولوژی، بیوتکنولوژی و بیوانفورماتیک

🏛 برگزارکننده: دانشگاه شهید اشرفی اصفهانی
📍 محل برگزاری: سالن همایش های دانشگاه علوم پزشکی اصفهان

📅 زمان برگزاری: پنج‌شنبه ۳۰ بهمن ۱۴۰۴

⏳ آخرین مهلت ثبت‌نام و دریافت مقالات: ۱ بهمن ۱۴۰۴

📌 زمان شروع داوری مقالات: دوشنبه ۲۴ آذر ۱۴۰۴

🔗 ثبت‌نام و اطلاعات تکمیلی:
https://biu.ashrafi.ac.ir

📧 ایمیل دبیرخانه: [email protected]
📞 تماس:  36502820-031 (داخلی205-268)

💥نشر دهید💥

✅🔬به ما بپیوندید👇
💟Microbiology🦠News💟
🔻✨🔻✨🔻✨🔻✨🔻✨
https://www.instagram.com/microbiologynews
Telegram👇👆Instagram
https://t.iss.one/joinchat/AAAAADuxVULOQVCjsGMvWA

⬆️⬆️A knockout mouse, or knock-out mouse, is a genetically modified mouse (Mus musculus) in which researchers have inactivated, or "knocked out", an existing gene.

📌۴ روز مانده تا وبینار تحولی نو در صنعت سلامت و بیوتکنولوژی با هوش مصنوعی و بیوانفورماتیک

🎯محورهای وبینار:

• آشنایی با کاربردهای بیوانفورماتیک از تشخیص تا طراحی درمان‌های نوین

• نقش بیوانفورماتیک و هوش مصنوعی در طراحی و کشف دارو

با حضور برجسته‌ترین اساتید داخل و خارج کشور

👤رئیس وبینار: جناب دکتر کاوه کاووسی
•دکترای هوش مصنوعی از دانشگاه تهران
•عضو هیئت علمی دانشگاه تهران


📃 همراه با ارائه گواهی معتبر

✅ هزینه شرکت در وبینار: رایگان (بدون گواهی)

دریافت گواهی معتبر: با هزینه‌ای اندک

⏰ زمان برگزاری: دوشنبه ۸ دی ماه ۱۴۰۴ | ساعت ۱۹ تا ۲۱

📥 لینک مستقیم ثبت‌نام

اینستاگرام | تلگرام | لینکدین | درباره ما

┏━━━━━━ 
     🆔 @UIBiologists🌱💡 
┗━━━━━━

DNA replication in prokaryotes

Polymerase chain reaction

🔎🧬What is "Mutation"?

⬆️⬆️⬆️رسوب‌گذاری ایمنی کروماتین و به دنبال آن تعیین توالی (ChIP-seq) تکنیکی برای پروفایلینگ ژنومی پروتئین‌های متصل شونده به DNA، تغییرات هیستونی یا نوکلئوزوم‌ها است

🧬تمایز میان اپی ژنتیک و اپی ژنومیک:
یکی از سو تفاهم های رایج در ژنتیک مولکولی❗️

سالهاست که به دلایل تاریخی و کاربردی این دو اصطلاح اشتباهاً به جای یکدیگر استفاده شده و یا حتی یکی در نظر گرفته می شوند. این در حالی است که در زمینه های علمی تفاوت آن ها بسیار حائز اهمیت است. بیایید برای درک بهتر، ابتدا به تعریف هرکدام از آن ها بطور مستقل بپردازیم.

💬اپی ژنومیک چیست؟

اپی ژنومیک به تمامی نهادهای فیزیکی و عملکردی مرتبط با DNA اطلاق می شود. در اصل خود الگو ها و مواردی که به DNA متصل اند و از سلولی به سلول دیگر می توانند متفاوت باشند. اپی ژنوم تمام نشانه های شیمیایی و تغییرات ساختاری که روی DNA و هیستون ها موجود است را شامل می شود. در بیوتکنولوژی نیز اپی ژنومیک یک دیسیپلین خاص است که به شما اجازه می دهد تا همزمان کل ژن ها را همچون یک نقشه و در یک نگاه وارسی کنید بجای اینکه فقط یک یا چند ژن خاص را مورد بررسی قرار بدهید. اپی ژنومیک یک لایه تنظیمی پویا و برگشت پذیر فراهم می کند که امکان تشخیص زود هنگام بیماری ها و توسعه درمان های هدفمند و شخصی سازی شده را فراتر از تفاوت های توالی DNA فراهم می سازد.

💬و اما اپی ژنتیک چیست؟

اصل این واژه ریشه در واژه Genetics دارد که به مفاهیم وراثت ویژگی های ژنتیکی میپردازد. اپی ژنتیک به مکانیسمی اطلاق شده که در آن یک "حالت سلولی" یا "نوع خاص سلول" از طریق چند تقسیم سلولی حفظ خواهند شد. در این اصطلاح موردی که شایان توجه است مفهوم وراثت "حالات سلولی" است نه "تغییرات مولکولی". در یک خصلت اپی ژنتیکی یک فنوتیپ معین به شکل ارثی منتقل شده بدون اینکه تغییری در توالی های اصلی DNA ایجاد شود و تغییرات نسل به نسل صرفاً می تواند در کروماتین پیش آید.


📢اما چه چیزی این دو اصطلاح را از هم تمایز می دهد؟
در واقع امر این دو مفهوم به هم مرتبط، اما بسیار متفاوت اند. اپی ژنومیک به ماهیت مولکولی کروماتین و DNA می پردازد در حالی که اپی ژنتیک به وراثت وضعیت سلولی توجه دارد. در اصل سوال کلیدی که هنگام بررسی اپی ژنتیک از خود میپرسیم این است که: "چگونه یک حالت سلولی حفظ می شود؟"
در حالی که این سوال در اپی ژنومیک این است که: "چه الگو ها و نشانه هایی در سطح کل ژنوم وجود دارند؟"
اپی ژنومیک الزامی بر وراثت ندارد بلکه فقط نشانه تغییرات مولکولی است. درک درست این تمایز به تفسیر صحیح نتایج زیستی کمک می کند.
بیایید با چند مثال ملموس به درک عمیق تری از این تفاوت برسیم:

1⃣: در یک مثال خیلی کلاسیک می توانیم به تمایز بین نر و ماده در زنبور عسل اشاره کنیم. لارو ها یا ژله سلطنتی میخورند و به ملکه تبدیل می شوند و یا نمی خورند و کارگر خواهند شد. در هر دو نوع لارو، DNA یکی است، اما الگوهای متیلاسیون تفاوت داشته و این الگوها در طول عمرشان حفظ می گردند. پس الگو های متیلاسیون اپی ژنومیک بوده و حفظ نقش ملکه یا کارگر اپی ژنتیک.
2⃣: در مثال مهم تر و دقیق تری می توان به سلول های سرطانی پرداخت. ما در یک تومور سرطانی می توانیم مشاهده کنیم که پروموتر ژن Tumor suppressor متیله شده و این ژن خاموش و DNA دچار Hypermethylarion می شود. این تنها یک وضعیت مولکولی کروماتین است که یعنی⬅️اپی ژنومیک.
اما در ادامه، زمانی که سلول های سرطانی تقسیم شوند و سلول های دختر را بسازند ( بدون اینکه در DNA تغییر توالی رخ دهد)
این ویژگی های سرطانی را به وراثت می رسانند. پس اینجا دیگر خاموشی ژن یک مارکر نیست و به حافظه سلولی تبدیل شده! و این یعنی⬅️ اپی ژنتیک.

📝نتیجه گیری:

به طور کلی می توان تفسیر کرد که:
اپی ژنتیک🟰 حافظه و وراثت وضعیت سلول
و
اپی ژنومیک🟰 مشاهده و تحلیل گسترده تغییرات مولکولی روی DNA و کروماتین(یک نقشه کلی)

پس همه تغییرات اپی ژنومیک، اپی ژنتیک نیستند اما همه پدیده های اپی ژنتیک پایه ای در اپی ژنوم دارند.

منبع اصلی
منبع ۲
منبع ۳

⬆️⬆️⬆️Single nucleotide polymorphisms, frequently called SNPs (pronounced “snips”), are the most common type of genetic variation among people. Each SNP represents a difference in a single DNA building block, called a nucleotide.

اختلال افسردگی اساسی (MDD) یک بیماری مزمن، عموماً اپیزودیک و ناتوان‌کننده است که تقریباً 300 میلیون نفر را در سراسر جهان تحت تأثیر قرار می‌دهد، اما پاتوژنز آن به خوبی شناخته نشده است. تخمین وراثت‌پذیری MMD سی تا چهل درصد است که نشان می‌دهد ژنتیک به تنهایی عامل اصلی خطر افسردگی اساسی نیست. یکی دیگر از عواملی که با MDD مرتبط است، عوامل استرس‌زای محیطی مانند سختی‌های دوران کودکی و استرس‌های اخیر زندگی است. مطالعات اخیر نشان داده‌اند که تأثیر بیولوژیکی عوامل محیطی در MDD و سایر اختلالات مرتبط با استرس توسط انواع تغییرات اپی‌ژنتیکی واسطه‌گری می‌شود. این تغییرات تغییرات اپی‌ژنتیکی در پاسخ‌های غیرطبیعی نورواندوکرین، اختلال در انعطاف‌پذیری عصبی، انتقال عصبی و اختلال عملکرد نوروگلیا نقش دارند که در پاتوفیزیولوژی MDD دخیل هستند. علاوه بر این، علائم اپی‌ژنتیکی با تشخیص و درمان MDD مرتبط بوده‌اند. ارزیابی تغییرات اپی‌ژنتیکی نویدبخش درک بیشتر علت ناهمگن و فنوتیپ‌های پیچیده MDD است و ممکن است اهداف درمانی جدیدی را شناسایی کند.

در  مقاله ای که لینک آن ارسال میشود، یافته‌های اپی‌ژنتیک پیش‌بالینی و بالینی، از جمله متیلاسیون DNA، اصلاح هیستون، RNA غیرکدکننده، اصلاح RNA و فاکتور بازسازی کروماتین در اختلال افسردگی اساسی (MDD) بررسی شده اند. علاوه بر این،  سهم این مکانیسم‌های اپی‌ژنتیکی  در تغییرپذیری صفات پاتولوژیک در افسردگی شرح داده شده اند و در مورد چگونگی بهره‌برداری از چنین مکانیسم‌هایی برای اهداف درمانی بحث شده است:
Yuan, M., Yang, B., Rothschild, G. et al. Epigenetic regulation in major depression and other stress-related disorders: molecular mechanisms, clinical relevance and therapeutic potential. Sig Transduct Target Ther 8, 309 (2023). https://doi.org/10.1038/s41392-023-01519-z

🍀زنگ تفریح🍀: در راستای پژوهش بالا و به دلیل استرس بالای ایام امتحانات، برای جلوگیری از تغییرات اپی ژنتیکی بدنتان 😉کارهای بالا را انجام دهید