⬆️⬆️A knockout mouse, or knock-out mouse, is a genetically modified mouse (Mus musculus) in which researchers have inactivated, or "knocked out", an existing gene.

📌۴ روز مانده تا وبینار تحولی نو در صنعت سلامت و بیوتکنولوژی با هوش مصنوعی و بیوانفورماتیک

🎯محورهای وبینار:

• آشنایی با کاربردهای بیوانفورماتیک از تشخیص تا طراحی درمان‌های نوین

• نقش بیوانفورماتیک و هوش مصنوعی در طراحی و کشف دارو

با حضور برجسته‌ترین اساتید داخل و خارج کشور

👤رئیس وبینار: جناب دکتر کاوه کاووسی
•دکترای هوش مصنوعی از دانشگاه تهران
•عضو هیئت علمی دانشگاه تهران


📃 همراه با ارائه گواهی معتبر

✅ هزینه شرکت در وبینار: رایگان (بدون گواهی)

دریافت گواهی معتبر: با هزینه‌ای اندک

⏰ زمان برگزاری: دوشنبه ۸ دی ماه ۱۴۰۴ | ساعت ۱۹ تا ۲۱

📥 لینک مستقیم ثبت‌نام

اینستاگرام | تلگرام | لینکدین | درباره ما

┏━━━━━━ 
     🆔 @UIBiologists🌱💡 
┗━━━━━━

DNA replication in prokaryotes

Polymerase chain reaction

🔎🧬What is "Mutation"?

⬆️⬆️⬆️رسوب‌گذاری ایمنی کروماتین و به دنبال آن تعیین توالی (ChIP-seq) تکنیکی برای پروفایلینگ ژنومی پروتئین‌های متصل شونده به DNA، تغییرات هیستونی یا نوکلئوزوم‌ها است

🧬تمایز میان اپی ژنتیک و اپی ژنومیک:
یکی از سو تفاهم های رایج در ژنتیک مولکولی❗️

سالهاست که به دلایل تاریخی و کاربردی این دو اصطلاح اشتباهاً به جای یکدیگر استفاده شده و یا حتی یکی در نظر گرفته می شوند. این در حالی است که در زمینه های علمی تفاوت آن ها بسیار حائز اهمیت است. بیایید برای درک بهتر، ابتدا به تعریف هرکدام از آن ها بطور مستقل بپردازیم.

💬اپی ژنومیک چیست؟

اپی ژنومیک به تمامی نهادهای فیزیکی و عملکردی مرتبط با DNA اطلاق می شود. در اصل خود الگو ها و مواردی که به DNA متصل اند و از سلولی به سلول دیگر می توانند متفاوت باشند. اپی ژنوم تمام نشانه های شیمیایی و تغییرات ساختاری که روی DNA و هیستون ها موجود است را شامل می شود. در بیوتکنولوژی نیز اپی ژنومیک یک دیسیپلین خاص است که به شما اجازه می دهد تا همزمان کل ژن ها را همچون یک نقشه و در یک نگاه وارسی کنید بجای اینکه فقط یک یا چند ژن خاص را مورد بررسی قرار بدهید. اپی ژنومیک یک لایه تنظیمی پویا و برگشت پذیر فراهم می کند که امکان تشخیص زود هنگام بیماری ها و توسعه درمان های هدفمند و شخصی سازی شده را فراتر از تفاوت های توالی DNA فراهم می سازد.

💬و اما اپی ژنتیک چیست؟

اصل این واژه ریشه در واژه Genetics دارد که به مفاهیم وراثت ویژگی های ژنتیکی میپردازد. اپی ژنتیک به مکانیسمی اطلاق شده که در آن یک "حالت سلولی" یا "نوع خاص سلول" از طریق چند تقسیم سلولی حفظ خواهند شد. در این اصطلاح موردی که شایان توجه است مفهوم وراثت "حالات سلولی" است نه "تغییرات مولکولی". در یک خصلت اپی ژنتیکی یک فنوتیپ معین به شکل ارثی منتقل شده بدون اینکه تغییری در توالی های اصلی DNA ایجاد شود و تغییرات نسل به نسل صرفاً می تواند در کروماتین پیش آید.


📢اما چه چیزی این دو اصطلاح را از هم تمایز می دهد؟
در واقع امر این دو مفهوم به هم مرتبط، اما بسیار متفاوت اند. اپی ژنومیک به ماهیت مولکولی کروماتین و DNA می پردازد در حالی که اپی ژنتیک به وراثت وضعیت سلولی توجه دارد. در اصل سوال کلیدی که هنگام بررسی اپی ژنتیک از خود میپرسیم این است که: "چگونه یک حالت سلولی حفظ می شود؟"
در حالی که این سوال در اپی ژنومیک این است که: "چه الگو ها و نشانه هایی در سطح کل ژنوم وجود دارند؟"
اپی ژنومیک الزامی بر وراثت ندارد بلکه فقط نشانه تغییرات مولکولی است. درک درست این تمایز به تفسیر صحیح نتایج زیستی کمک می کند.
بیایید با چند مثال ملموس به درک عمیق تری از این تفاوت برسیم:

1⃣: در یک مثال خیلی کلاسیک می توانیم به تمایز بین نر و ماده در زنبور عسل اشاره کنیم. لارو ها یا ژله سلطنتی میخورند و به ملکه تبدیل می شوند و یا نمی خورند و کارگر خواهند شد. در هر دو نوع لارو، DNA یکی است، اما الگوهای متیلاسیون تفاوت داشته و این الگوها در طول عمرشان حفظ می گردند. پس الگو های متیلاسیون اپی ژنومیک بوده و حفظ نقش ملکه یا کارگر اپی ژنتیک.
2⃣: در مثال مهم تر و دقیق تری می توان به سلول های سرطانی پرداخت. ما در یک تومور سرطانی می توانیم مشاهده کنیم که پروموتر ژن Tumor suppressor متیله شده و این ژن خاموش و DNA دچار Hypermethylarion می شود. این تنها یک وضعیت مولکولی کروماتین است که یعنی⬅️اپی ژنومیک.
اما در ادامه، زمانی که سلول های سرطانی تقسیم شوند و سلول های دختر را بسازند ( بدون اینکه در DNA تغییر توالی رخ دهد)
این ویژگی های سرطانی را به وراثت می رسانند. پس اینجا دیگر خاموشی ژن یک مارکر نیست و به حافظه سلولی تبدیل شده! و این یعنی⬅️ اپی ژنتیک.

📝نتیجه گیری:

به طور کلی می توان تفسیر کرد که:
اپی ژنتیک🟰 حافظه و وراثت وضعیت سلول
و
اپی ژنومیک🟰 مشاهده و تحلیل گسترده تغییرات مولکولی روی DNA و کروماتین(یک نقشه کلی)

پس همه تغییرات اپی ژنومیک، اپی ژنتیک نیستند اما همه پدیده های اپی ژنتیک پایه ای در اپی ژنوم دارند.

منبع اصلی
منبع ۲
منبع ۳

⬆️⬆️⬆️Single nucleotide polymorphisms, frequently called SNPs (pronounced “snips”), are the most common type of genetic variation among people. Each SNP represents a difference in a single DNA building block, called a nucleotide.

اختلال افسردگی اساسی (MDD) یک بیماری مزمن، عموماً اپیزودیک و ناتوان‌کننده است که تقریباً 300 میلیون نفر را در سراسر جهان تحت تأثیر قرار می‌دهد، اما پاتوژنز آن به خوبی شناخته نشده است. تخمین وراثت‌پذیری MMD سی تا چهل درصد است که نشان می‌دهد ژنتیک به تنهایی عامل اصلی خطر افسردگی اساسی نیست. یکی دیگر از عواملی که با MDD مرتبط است، عوامل استرس‌زای محیطی مانند سختی‌های دوران کودکی و استرس‌های اخیر زندگی است. مطالعات اخیر نشان داده‌اند که تأثیر بیولوژیکی عوامل محیطی در MDD و سایر اختلالات مرتبط با استرس توسط انواع تغییرات اپی‌ژنتیکی واسطه‌گری می‌شود. این تغییرات تغییرات اپی‌ژنتیکی در پاسخ‌های غیرطبیعی نورواندوکرین، اختلال در انعطاف‌پذیری عصبی، انتقال عصبی و اختلال عملکرد نوروگلیا نقش دارند که در پاتوفیزیولوژی MDD دخیل هستند. علاوه بر این، علائم اپی‌ژنتیکی با تشخیص و درمان MDD مرتبط بوده‌اند. ارزیابی تغییرات اپی‌ژنتیکی نویدبخش درک بیشتر علت ناهمگن و فنوتیپ‌های پیچیده MDD است و ممکن است اهداف درمانی جدیدی را شناسایی کند.

در  مقاله ای که لینک آن ارسال میشود، یافته‌های اپی‌ژنتیک پیش‌بالینی و بالینی، از جمله متیلاسیون DNA، اصلاح هیستون، RNA غیرکدکننده، اصلاح RNA و فاکتور بازسازی کروماتین در اختلال افسردگی اساسی (MDD) بررسی شده اند. علاوه بر این،  سهم این مکانیسم‌های اپی‌ژنتیکی  در تغییرپذیری صفات پاتولوژیک در افسردگی شرح داده شده اند و در مورد چگونگی بهره‌برداری از چنین مکانیسم‌هایی برای اهداف درمانی بحث شده است:
Yuan, M., Yang, B., Rothschild, G. et al. Epigenetic regulation in major depression and other stress-related disorders: molecular mechanisms, clinical relevance and therapeutic potential. Sig Transduct Target Ther 8, 309 (2023). https://doi.org/10.1038/s41392-023-01519-z

🍀زنگ تفریح🍀: در راستای پژوهش بالا و به دلیل استرس بالای ایام امتحانات، برای جلوگیری از تغییرات اپی ژنتیکی بدنتان 😉کارهای بالا را انجام دهید

⬆️⬆️Pharmacogenomics, often abbreviated "PGx", is the study of the role of the genome in drug response. Its name reflects its combining of pharmacology and genomics. Pharmacogenomics analyzes how the genetic makeup of a patient affects their response to drugs

🔇میسوفونیا یا صدابیزاری؛ وراثت ژنتیکی یا عوامل اپی ژنتیک؟

بررسی سندرومی تازه توصیف شده و پیچیده و ارتباط آن با ژنتیک:🔬

📝معرفی:
این بیماری در فرد واکنش‌های منفی متوسط تا شدیدی را به اشکال خشم، نفرت و عصبانیت در مواجهه با صداهای تکراری و انتخابی به وجود می آورد. این اصوات ممکن است برای افراد نرمال آزاردهنده و شاید حتی قابل‌توجه نباشند، درحالی‌که می‌توانند در شدت‌های بالای بیماری، زندگی روزمره فرد را مختل کنند.

🚀محرک ها:

رایج‌ترین محرک‌ها در این بیماران معمولاً صداهای تولید شده توسط دهان مثل جوییدن و قورت‌دادن و همچنین صداهای بینی همانند بوکشیدن و یا حتی تنفس عادی (به‌خصوص توسط نزدیکان و اطرافیان صمیمی فرد) گزارش شده است. در درصد نادری از افراد صرفاً حرکات تکرارشونده‌ای که صدادار هم نیستند (visual triggers) مانند تکان‌دادن پشت‌سرهم پا یا حرکات تکراری دست و بدن نیز باعث واکنش‌های میسوفونیک می‌شوند. (به عبارت دیگر misokinesia; visual version of misophonia). نکته حائز اهمیتی که در بعضی مقالات قبلی مربوط به میسوفونیا نادیده گرفته شده، فرضیه ژنتیکی بودن آن است. به‌طوری‌که درصد بالایی از این افراد معمولاً یک خویشاوند نزدیک با علائم مشابه را می‌شناسند.

🩸شکل احتمالی وراثت:

در مقاله تازه منتشر شده‌ای که در این متن بررسی می‌شود، خانواده‌ای موردمطالعه قرار داده شده است که ۱۵ عضو از سه نسل آن درگیر میسوفونیا بوده و الگوهای رفتاری مشابه مقابل محرک‌های خاص داشته‌اند. با اطلاعات اپیدمیولوژی اخذ شده از این افراد نتایج جالبی به دست آمد. با این‌حال متأسفانه تاکنون مطالعات اپی‌ژنتیکی در این زمینه انجام نشده و حتی احتمال وراثت نیز به‌طورقطع قابل‌اثبات نیست؛ اما باتوجه‌ به تحقیقات انجام شده و دیده‌شدن این سندروم در ۳ نسل از یک خانواده و در هر دو جنس، این الگوها تماماً به نفع وراثت به شکل اتوزومال غالب هستند.

⛓وراثت اتوزومال غالب:

در این شکل از وراثت، صفت یا بیماری فقط باوجود یکی از دو نسخه ژن معیوب روی کروموزوم‌های غیرجنسی (اتوزوم‌ها) بروز پیدا می‌کند. به صورتی که حتی اگر یکی از والدین مبتلا باشند احتمال انتقال به فرزند ۵۰ درصد خواهد بود و معمولاً بیماری در چند نسل متوالی مشاهده می‌شود.

🧬ژن های مربوطه:

به گونه ای نتیجه گرفته شده که ژن‌های مرتبط با سندروم میسوفونیا به‌احتمال بالا با ژن‌های مرتبط با سازوکارهای روانی و عاطفی مشترک است و نه با ژن‌های شنوایی. یکی از ژن‌های نامزد اصلی (candidate Genes) مرتبط با این سندروم، TENM2 است که مرتبط با چسبندگی سلولی و توسعه مغز بوده و در داده‌های GWAS، به ژنی مربوط به "خشم نسبت به صداهای جوییدن" شناخته می شود.

☑️جمع‌بندی نهایی:

میسوفونیا احتمالاً یک اختلال تاثیر پذیر از چندین عامل است که به احتمال قوی در آن عوامل ژنتیکی نقش گسترده ای دارند. ظن تأثیر عوامل محیطی و اپی ژنتیک نیز تا حدودی در آن مطرح است اما با بیشترین احتمال، الگو وراثتی آن به سمت اتوزومال غالب می باشد.


✍🏻آوا مرادی

منبع

⬆️⬆️The genotype of an organism is defined as the sum of all its genes. The phenotype of an organism is the observable physical or biochemical characteristics of an organism, determined by both genetic make-up and environmental influences.

⬆️⬆️⬆️The exposome is a concept used to describe environmental exposures that an individual encounters throughout life, and how these exposures impact biology and health. It encompasses both external and internal factors, including chemical, physical, biological, and social factors that may influence human health.

تعامل اپی‌ژنتیکی میکروب‌ها با سلول میزبان. شکلی که روش‌های متعددی را نشان می‌دهد که از طریق آنها تعامل میکروب-سلول میزبان می‌تواند بر مدار اپی‌ژنتیکی میزبان تأثیر بگذارد. (i) تعدیل سازماندهی کروماتین از طریق تعامل میکروب (خارج سلولی) با گیرنده میزبان که آبشار(های) سیگنالینگ را فعال می‌کند. (ii) آزادسازی عوامل توسط میکروب خارج سلولی یا درون سلولی در سلول‌های میزبان می‌تواند با عوامل میزبان که قابلیت تعدیل ترکیب کروماتین را دارند، تعامل داشته باشد. (iii) ترشح عوامل میکروبی در محیط خارج سلولی یا درون سلولی که پس از ورود به هسته سلول میزبان مستقیماً با کروماتین تعامل دارند. همه این مسیرها به صورت جداگانه یا به صورت هماهنگ می‌توانند هم تغییرات هیستون و هم متیلاسیون DNA را تغییر دهند که منجر به تغییر در ترکیب کروماتین می‌شود.

Topoisomerase is defined as a nuclear enzyme that relaxes supercoiled DNA, facilitating DNA replication and transcription by removing topological tension through the insertion of a nick in one DNA strand, allowing the other strand to pass through, and then re-sealing the nick.