Сегодня отличный день, чтобы опубликовать подборку смешных названий научных программ. Начнём с легкого: совсем недавно вышла статья о предсказании взаимодействий белков при помощи инструмента LazyAF. AF – это популярное в письменном английском сокращение фразы as fuck. То есть, инструмент не просто Lazy, а прям ну очень ленивый
Следующий в подборке – MEME suite. Публикуя статью о поиске последовательностей в ДНК или белках в далёком 1994 году, авторы и не подозревали, что слово “мем” вскоре станет таким популярным в интернете. Теперь если вы хотите загуглить мемы про костюм, вам почему-то будет выдаваться биоинформатика. Ну или наоборот, в поиске инструмента можно случайно получить подборку мемов
Самое сладкое напоследок. Группа учёных из Италии решила важную задачу и разработала лёгкую в использовании программу для исследования бактерий, вызывающих вспышки инфекций. Не имея русскоговорящих авторов в команде, они назвали своё творение P-DOR. Первая буква в английском читается как “пи”, ну а дальше разберётесь. Очень бы хотелось использовать этот инструмент в дипломной работе, чтобы посмотреть на лица аттестационной комиссии при перечислении методов
Кстати, если вы тоже исследуете инфекционные заболевания, имейте в виду фонд Global research collaboration for infectious disease preparedness (GloPID-R). А если ваше исследование не профинансируют, вы точно знаете как назвать членов комиссии!
А также общая рекомендация от моего бывшего преподавателя. Если вы занимаетесь онкологическими заболеваниями, не называйте это борьбой с раком. Это вызывает улыбки у слушающих вас людей, да и сражаться гораздо удобнее другими частями тела
#юмор #байки
Следующий в подборке – MEME suite. Публикуя статью о поиске последовательностей в ДНК или белках в далёком 1994 году, авторы и не подозревали, что слово “мем” вскоре станет таким популярным в интернете. Теперь если вы хотите загуглить мемы про костюм, вам почему-то будет выдаваться биоинформатика. Ну или наоборот, в поиске инструмента можно случайно получить подборку мемов
Самое сладкое напоследок. Группа учёных из Италии решила важную задачу и разработала лёгкую в использовании программу для исследования бактерий, вызывающих вспышки инфекций. Не имея русскоговорящих авторов в команде, они назвали своё творение P-DOR. Первая буква в английском читается как “пи”, ну а дальше разберётесь. Очень бы хотелось использовать этот инструмент в дипломной работе, чтобы посмотреть на лица аттестационной комиссии при перечислении методов
Кстати, если вы тоже исследуете инфекционные заболевания, имейте в виду фонд Global research collaboration for infectious disease preparedness (GloPID-R). А если ваше исследование не профинансируют, вы точно знаете как назвать членов комиссии!
А также общая рекомендация от моего бывшего преподавателя. Если вы занимаетесь онкологическими заболеваниями, не называйте это борьбой с раком. Это вызывает улыбки у слушающих вас людей, да и сражаться гораздо удобнее другими частями тела
#юмор #байки
bioRxiv
LazyAF, a pipeline for accessible medium-scale in silico prediction of protein-protein interactions
Artificial intelligence has revolutionized the field of protein structure prediction. However, with more powerful and complex software being developed, it is accessibility and ease of use rather than capability that is quickly becoming a limiting factor to…
А вот как выглядит связь потребления кофе и часов сфокусированной работы. До 2 чашек чем больше я пью кофе, тем больше обычно работаю, но на 3 зависимость внезапно ломается и лишь самый продуктивный день дотягивает до медианного с двумя чашками кофе
Оставлю вам на подумать, почему это так, а пока расскажу историю. Во время учёбы нам давали набор данных пациентов с сердечно-сосудистыми заболеваниями. В нём наблюдалась интересная закономерность: некурящие люди чаще страдали тяжёлыми стадиями, а курящие чаще оказывались здоровыми
Что же получается, надо курить и болезни обойдут вас стороной? Нет, дело в другом. Люди с тяжёлыми состояниями получают больше рекомендаций от докторов: в том числе бросить курить. А здоровые могут вдоволь покупать сигареты, пока у них нет серьёзных заболеваний
Не забывайте: статистическая связь не означает причинную
#статистика #байки
Оставлю вам на подумать, почему это так, а пока расскажу историю. Во время учёбы нам давали набор данных пациентов с сердечно-сосудистыми заболеваниями. В нём наблюдалась интересная закономерность: некурящие люди чаще страдали тяжёлыми стадиями, а курящие чаще оказывались здоровыми
Что же получается, надо курить и болезни обойдут вас стороной? Нет, дело в другом. Люди с тяжёлыми состояниями получают больше рекомендаций от докторов: в том числе бросить курить. А здоровые могут вдоволь покупать сигареты, пока у них нет серьёзных заболеваний
Не забывайте: статистическая связь не означает причинную
#статистика #байки
В пятницу 13 попугаю вас страшными историями из мира науки
🦇 Дело было в одной из стран Азии с особенной рабочей культурой и любовью всё превращать в соревнование. Заведующий лабораторией нанял к себе двух PhD-студентов. А проект им дал один. Кто делает его быстрее – получает научную степень, второй – потерянные годы и комплекс неполноценности в подарок
🎃 У другой PhD-студентки в Европе всё на первый взгляд складывалось лучше: ей нужно было продолжить работу над уже опубликованным в её лаборатории методом. Спустя год и огромное количество усилий, стало ясно, что метод не работает, а в исходной статье была ошибка. Но научный руководитель не согласился её признать, сказал, что у студентки кривые руки, и приказал получить результаты. В конце концов он отказался продлевать ей контракт в середине PhD
👻 Ещё одна студентка находилась в интересной среде: её научная руководительница и более старший в иерархии заведующий институтом были женой и мужем. Всё было бы замечательно, но однажды возник конфликт с руководительницей. За его разрешением и жизненным советом студентка пошла к заведующему, но вместо помощи получила очередную волну критики, заранее переданной за супружеским столом
💀 У студента-биоинформатика главный проект был в коллаборации с компанией. Планы были в получении от партнёров уникального набора данных огромного размера и отличного качества – нужно только проанализировать. Не проект, а мечта! Но экономическая ситуация в области складывалась не лучшим образом, поэтому в один день траты на исследования решили сократить вместе со всем отделом, сотрудничавшим со студентом. Дело происходило в США, поэтому это было буквально в один день: людям просто сказали, что больше они в компании не работают. Времени закончить проект или хоть как-то передать имеющиеся данные у них, конечно, не было
🕷️ В одном институте решили провести исследование генов, связанных с болезнью сердца. Студентка должна была провести биоинформатический анализ данных, чтобы выделить гены интереса, а другие люди провели бы эксперименты на клеточных культурах где эти гены сломаны, чтобы валидировать результаты. Но работать с клетками долго, поэтому для экономии времени было принято решение выбрать ген для эксперимента по методу Тинькова«я так чувствую» и работать параллельно. Биоинформатический анализ показал, что этот ген связан с интересующей болезнью, но далеко не сильнее других неизученных генов. Но так как эксперимент уже проведён и деньги потрачены, студентке было дано задание «сделай анализ как-нибудь так, чтобы этот ген был на первом месте»
А с какими страшными историями сталкивались вы?
#байки
🦇 Дело было в одной из стран Азии с особенной рабочей культурой и любовью всё превращать в соревнование. Заведующий лабораторией нанял к себе двух PhD-студентов. А проект им дал один. Кто делает его быстрее – получает научную степень, второй – потерянные годы и комплекс неполноценности в подарок
🎃 У другой PhD-студентки в Европе всё на первый взгляд складывалось лучше: ей нужно было продолжить работу над уже опубликованным в её лаборатории методом. Спустя год и огромное количество усилий, стало ясно, что метод не работает, а в исходной статье была ошибка. Но научный руководитель не согласился её признать, сказал, что у студентки кривые руки, и приказал получить результаты. В конце концов он отказался продлевать ей контракт в середине PhD
👻 Ещё одна студентка находилась в интересной среде: её научная руководительница и более старший в иерархии заведующий институтом были женой и мужем. Всё было бы замечательно, но однажды возник конфликт с руководительницей. За его разрешением и жизненным советом студентка пошла к заведующему, но вместо помощи получила очередную волну критики, заранее переданной за супружеским столом
💀 У студента-биоинформатика главный проект был в коллаборации с компанией. Планы были в получении от партнёров уникального набора данных огромного размера и отличного качества – нужно только проанализировать. Не проект, а мечта! Но экономическая ситуация в области складывалась не лучшим образом, поэтому в один день траты на исследования решили сократить вместе со всем отделом, сотрудничавшим со студентом. Дело происходило в США, поэтому это было буквально в один день: людям просто сказали, что больше они в компании не работают. Времени закончить проект или хоть как-то передать имеющиеся данные у них, конечно, не было
🕷️ В одном институте решили провести исследование генов, связанных с болезнью сердца. Студентка должна была провести биоинформатический анализ данных, чтобы выделить гены интереса, а другие люди провели бы эксперименты на клеточных культурах где эти гены сломаны, чтобы валидировать результаты. Но работать с клетками долго, поэтому для экономии времени было принято решение выбрать ген для эксперимента по методу Тинькова
А с какими страшными историями сталкивались вы?
#байки
человек наук
В пятницу 13 попугаю вас страшными историями из мира науки 🦇 Дело было в одной из стран Азии с особенной рабочей культурой и любовью всё превращать в соревнование. Заведующий лабораторией нанял к себе двух PhD-студентов. А проект им дал один. Кто делает его…
Please open Telegram to view this post
VIEW IN TELEGRAM
человек наук
В пятницу 13 попугаю вас страшными историями из мира науки 🦇 Дело было в одной из стран Азии с особенной рабочей культурой и любовью всё превращать в соревнование. Заведующий лабораторией нанял к себе двух PhD-студентов. А проект им дал один. Кто делает его…
Ещё подборка страшных историй из мира науки к Хэллоуину
🪦 Одна аспирантка не ладила с руководителем. До драк, как в историях из комментариев к прошлому посту, дело не доходило, но работать вместе было уже невыносимо. Грела только одна мысль: скоро конец аспирантуры и можно перейти в более приятную атмосферу на постдока. Но вот загвоздка: для этого нужно попросить руководителя написать рекомендательное письмо. Собрав волю в кулак, девушка улыбнулась и попросила отправить письмо в лабораторию мечты в благодарность за годы её работы. Руководитель написал в письме три слова: «Не берите её»
⚰️ Другой студент, с ужасом вспоминающий прошлую лабораторию, рассказал, что даже этому руководителю есть куда стремиться. Злопамятный заведующий из его лаборатории очень не любил „студентов-предателей“, не готовых работать в одном месте до пенсии. Он выслеживал своих бывших сотрудников, находил контакты их новых руководителей и писал им письма с просьбой уволить человека или как минимум ему не доверять
📑 Неизведанные области знания не пугают, а порой и восхищают учёных. Но даже лучших из них доводит до ужаса другой зверь – бюрократия. PhD-студентке из России в одном из университетов Германии почему-то не хотели давать контракт на весь период работы. Вместо этого его приходилось обновлять каждые пол года. Из-за этого право на нахождение в стране тоже приходилось каждый раз обновлять, а это время, куча бумаг и оплата процедур – около 100 евро. Из-за такого отношения и других проблем студентка решила уйти в другое место. Это тоже требовало времени на поиск работы и, вероятно, переезда. В Германии этот период обычно оплачивается государством, для этого нужно только проработать хотя бы год. Студентка работала дольше, но бюрократия нанесла новый удар: в контракте было прописано время на две недели меньше полного года, и страховку по безработице платить отказались. Впрочем, после таскания пачек бумаг девушка стала натренирована, обратилась в суд и доказала своё право на страховку, а также получила компенсацию от университета в добавок
⌛️Эти истории – скорее исключение, большинство лабораторий всё же вполне нормальные. Но в некоторых странах „нормальная“ рабочая культура – совершенно нечеловеческая. Девушка, стажировавшаяся в Японии, рассказывала, что у её руководителя был 18-часовой рабочий день. Он вставал, ехал на работу, завтракал, обедал и ужинал прямо на рабочем месте у экрана компьютера, вечером принимал душ, ехал спать около 5 часов и по новой. Без выходных и праздников
🙏Тогда эта девушка тоже была сфокусирована на работе, хоть и не по 18 часов в день. Времени учить язык или исследовать страну почти не было. Каждое утро она приходила на работу и приветствовала коллег-японцев фразой „Оригато“. Лишь спустя несколько недель она осознала, что это „Спасибо“, а не приветствие и поняла, почему коллеги так удивлялись. А японский этикет не позволял им поправить ошибку
А какие страшные истории знаете вы? 🎃
#байки
🪦 Одна аспирантка не ладила с руководителем. До драк, как в историях из комментариев к прошлому посту, дело не доходило, но работать вместе было уже невыносимо. Грела только одна мысль: скоро конец аспирантуры и можно перейти в более приятную атмосферу на постдока. Но вот загвоздка: для этого нужно попросить руководителя написать рекомендательное письмо. Собрав волю в кулак, девушка улыбнулась и попросила отправить письмо в лабораторию мечты в благодарность за годы её работы. Руководитель написал в письме три слова: «Не берите её»
⚰️ Другой студент, с ужасом вспоминающий прошлую лабораторию, рассказал, что даже этому руководителю есть куда стремиться. Злопамятный заведующий из его лаборатории очень не любил „студентов-предателей“, не готовых работать в одном месте до пенсии. Он выслеживал своих бывших сотрудников, находил контакты их новых руководителей и писал им письма с просьбой уволить человека или как минимум ему не доверять
📑 Неизведанные области знания не пугают, а порой и восхищают учёных. Но даже лучших из них доводит до ужаса другой зверь – бюрократия. PhD-студентке из России в одном из университетов Германии почему-то не хотели давать контракт на весь период работы. Вместо этого его приходилось обновлять каждые пол года. Из-за этого право на нахождение в стране тоже приходилось каждый раз обновлять, а это время, куча бумаг и оплата процедур – около 100 евро. Из-за такого отношения и других проблем студентка решила уйти в другое место. Это тоже требовало времени на поиск работы и, вероятно, переезда. В Германии этот период обычно оплачивается государством, для этого нужно только проработать хотя бы год. Студентка работала дольше, но бюрократия нанесла новый удар: в контракте было прописано время на две недели меньше полного года, и страховку по безработице платить отказались. Впрочем, после таскания пачек бумаг девушка стала натренирована, обратилась в суд и доказала своё право на страховку, а также получила компенсацию от университета в добавок
⌛️Эти истории – скорее исключение, большинство лабораторий всё же вполне нормальные. Но в некоторых странах „нормальная“ рабочая культура – совершенно нечеловеческая. Девушка, стажировавшаяся в Японии, рассказывала, что у её руководителя был 18-часовой рабочий день. Он вставал, ехал на работу, завтракал, обедал и ужинал прямо на рабочем месте у экрана компьютера, вечером принимал душ, ехал спать около 5 часов и по новой. Без выходных и праздников
🙏Тогда эта девушка тоже была сфокусирована на работе, хоть и не по 18 часов в день. Времени учить язык или исследовать страну почти не было. Каждое утро она приходила на работу и приветствовала коллег-японцев фразой „Оригато“. Лишь спустя несколько недель она осознала, что это „Спасибо“, а не приветствие и поняла, почему коллеги так удивлялись. А японский этикет не позволял им поправить ошибку
А какие страшные истории знаете вы? 🎃
#байки