Исследователи из Института молекулярной биологии им. В.А. Энгельгардта РАН выявили около 50 новых мутаций, связанных с развитием параганглиом головы и шеи — редких опухолей нейроэндокринной системы.

Исследование охватило 152 образца от 140 пациентов, и в 30% случаев обнаружены 53 потенциально опасные мутации в 36 генах. Выявленные мутации связаны с обменом веществ и онкогенезом. Учёные планируют изучить влияние этих мутаций на клеточные процессы и прогрессирование болезни.

Новые данные помогут улучшить диагностику и разработку молекулярной таргетной терапии, нацеленной на специфические биомаркеры раковых клеток.

С праздником!

По прогнозам экспертов, в России в 2025 году появятся новые виды 3D-микросистем органов, которые смогут моделировать взаимодействие человеческих органов и связанные с ними патологии.

Устройства, имитирующие структуры тканей, помогут в тестировании лекарств и моделировании заболеваний, а также позволят отказаться от использования лабораторных животных. В частности, в Сибирском государственном медицинском университете (СибГМУ) разрабатывают модель опухолевого узла для тестирования противораковых препаратов.

«Можно ожидать, что в 2025 году мы сможем увидеть новый уровень технологии «орган-на-чипе», когда можно будет изучать физиологические и патологические взаимодействия между системами органов за счет интеграции сразу нескольких таких биочипов», — предполагают учёные.

Также предполагается создание биоматериалов с сенсорными свойствами для выращивания тканей и органов, что поможет решить проблему нехватки донорских органов и ускорить трансплантацию.

AstraZeneca наконец признала тромбоз побочным эффектом своей векторной вакцины от COVID-19. С мая 2024 года вакцину Vaxzevria больше нельзя применять в ЕС и Великобритании. Компания настаивала на том, что отзыв препарата вызван его коммерческой невыгодностью.

В судебных документах AstraZeneca впервые признает связь между вакцинацией Vaxzevria и тромбозом с синдромом тромбоцитопении — состоянием, которое характеризуется формированием тромбов (тромбоз) при низким уровне тромбоцитов в крови (тромбоцитопения).

Европейский регулятор ЕМА называл подобные осложнения крайне редкими, а значит, преимущества от применения вакцины весомее рисков. Однако из-за широкого освещения в СМИ и по ряду других причин компания провела ребрендинг вакцины: с Covishield на Vaxzevria.

В Великобритании против AstraZeneca возбудила коллективный иск юридическая фирма Leigh Day от имени 51 истца. Заявители жаловались на индуцированный вакцинацией тромбоз с тромбоцитопенией и требовали компенсаций на общую сумму около $125 млн.

Всего около 14 тысяч человек в Великобритании обратились в суд из-за проблем со здоровьем, возникших, по их мнению, из-за вакцинации от коронавируса препаратами AstraZeneca и Moderna.

Исследователи из Университетов Тафтса и Оксфорда выявили, сотрясение мозга может пробуждать вирус герпеса (ВПГ-1), приводя к воспалению, амилоидным бляшкам и гибели нейронов — симптомам болезни Альцгеймера.

Моделирование в лаборатории показало, что даже лёгкие удары по голове могут инициировать реактивацию вируса, что усиливает симптомы нейродегенеративных заболеваний. Повторные удары усиливают этот эффект.

Учёные предполагают, что результаты исследования могут привести к разработке стратегий профилактики таких заболеваний, как болезнь Альцгеймера, с помощью противовирусных препаратов.

В этом году прозвучало несколько впечатляющих заявлений об инновационных отечественных противораковых средствах — персонализированных мРНК-вакцинах и препарате «ЭнтероМикс» на основе онколитических вирусов (информация о них на сайте НМИЦ радиологии МЗ России).

Над персонализированной противоопухолевой мРНК-вакциной работают сотрудники НМИЦ радиологии, НИЦЭМ им. Н.Ф. Гамалеи, Московского научно-исследовательского онкологического института им. П.А. Герцена и НМИЦ онкологии им. Н.Н. Блохина. Для создания вакцины выполняется генетический анализ опухоли пациента, определяется индивидуальный мутационный профиль. Затем создается вакцина — матричная РНК, кодирующая опухолевые неоантигены, которые должны научить иммунную систему распознавать раковые клетки.

Онколитическая вакцина «ЭнтероМикс», разработанная в НМИЦ радиологии совместно с Институтом молекулярной биологии им. В.А. Энгельгардта, содержит четыре непатогенных энтеровируса, которые способны уничтожать раковые клетки.

После обнадеживающих результатов доклинических исследований «ЭнтероМикса» ведущие онкоцентры страны должны начать КИ. В фазе 1 примут участие 48 человек с меланомой и мелкоклеточным раком легких. Этот этап планируют завершить в октябре 2026 года, указано в реестре разрешений на проведение КИ.

В фазу 2 включат большее число добровольцев, в том числе с другими видами рака, в фазе 3 будут изучать возможности сочетаний препарата с другими методами лечения. Все этапы КИ могут занять не менее девяти лет.

Для контроля сборки структур из капсидных белков вируса можно использовать ДНК-оригами — этому посвящена недавняя работа в Nature Nanotechnology. Таким способом можно получать белковые конструкции разной конфигурации; также капсидная оболочка защищает ДНК от воздействия ферментов. Предложенный подход может найти применение в разработке новых систем доставки препаратов.

Группа учёных из Финляндии опубликовала работу, в которой описана конструкция из белков капсида вируса хлоротичной крапчатости коровьего гороха (CCMV), полученная при помощи «шаблона» ДНК-оригами.

Процесс сборки капсида хорошо описан, и ранее ученые уже получали листы, полые сферы и трубки, контролируя условия среды в ходе сборки. Однако более точного контроля за сборкой пока достигнуть не удавалось.

В новой работе исследователи применили ДНК-оригами — технику, позволяющую «складывать» из ДНК структуры различной формы. Полученную таким образом цилиндрическую трубку (обозначенную как 6HB) они помещали в физиологические условия (pH 7.3, 150 мМ NaCl) в присутствии капсидного белка (CP) CCMV.

При помощи электрофореза ученые зафиксировали возникновение комплекса между 6HB и CP — выраженность полосы 6HB в геле снижалась, и возникала новая полоса, обладающая значительно меньшей мобильностью. Более того, при достаточной концентрации CP на комплексе образовывался второй слой белка, что было зафиксировано по изменению толщины полученной структуры.

Криоэлектронная микроскопия показала, что CP образует вокруг ДНК-оригами спиральную структуру. При этом спирали первого и второго слоя отличаются по геометрии. Авторы не обнаружили специфических точек контакта между CP и ДНК. Это свидетельствует о том, что сборка комплекса происходит исключительно за счет электронстатических взаимодействий между отрицательно заряженными участками ДНК и положительно заряженными фрагментами CP. При этом в процессе сборки на внешней поверхности структуры также образуется отрицательный заряд, что, вероятно, обеспечивает возможность формирования второго белкового слоя.

Исследователи протестировали возможность «упаковки» в капсид различных структур ДНК: трубок большего диаметра, блокообразных конструкций и колец. Во всех случаях они добились формирования капсида вокруг ДНК.

>>Эх, развивая науку, мы, да и не только мы, потеряли учёных как людей знания и приобрели научных работников как людей навыка.

Тут даже совок не обвинить, т.к. явление общемировое.

Редколлегия престижного научного журнала уволилась из-за внедрения AI, которое привело к увеличению ручного труда.

Осенью 2023 года издательство научного журнало включило в процесс редактирования машинного ассистента на основе AI для предпечатного оформления научных статей, принятых к публикации. При обработке текстов этим ассистентом все заглавные буквы в именах собственных, исторических эпохах, географических названиях, и т.п. переводились в нижний регистр. Также автоматически исправлялся текст с курсивом, который общепринято использовался для биологических родов и видов.

Изменения, внесенные AI, привели к приостановке уже одобренных публикаций и ручному исправлению затронутых текстов редакторами в течении последующих шести месяцев.

Несмотря на многочисленные жалобы со стороны редакционной коллегии, издатель продолжил использование AI-ассистента, который продолжает вносить правки, меняющие не только оформление, но и смысл. Редакторам приходится проводить утомительную и избыточную работу по детальной сверке и вычитке препринтов. При этом издатель заявил, что «редактора не должны обращать внимание на язык, грамматику, читабельность, согласованность или аккуратность используемых в публикациях номенклатуры и форматирования».

Больше искусственного интеллекта — больше ручного труда. 😄

Антикоагулянты используются для лечения многих состояний, включая сердечные приступы и COVID-19. Широко применяемый для профилактики тромбоза гепарин несет риски побочных эффектов в виде гепарин-индуцированной тромбоцитопении, поэтому ученые из Токийского университета работали над созданием безопасного антикоагулянта без рисков кровотечения или тромбоза.

Исследователи разработали ингибитор тромбина нового поколения, который состоит из молекул ДНК и включает блокирующий кровотечение механизм. Главная молекула препарата, способная связываться с несколькими целями одновременно, называется биспецифическим аптамером. Важно отметить, что молекулы ДНК в препарате достаточно велики, поэтому не могут преодолеть защитный барьер плаценты, что делает лекарство потенциально безопасным для плода.

Благодаря использованию более коротких участков ДНК эффективность нового препарата оказалась примерно в 10 раз выше существующих сегодня аналогов.

Аптамеры на основе ДНК обладают рядом преимуществ по сравнению с традиционными моноклональными антителами: они более стабильны, менее токсичны и иммунногенны, а за счёт меньшего размера обладают большей проникающей способностью в органы и ткани.

>>Иллюстрация двух порочных подходов: учить всё подряд как науки, хотя бы и в этом нет практического смысла (как делали в СССР и продолжают делать в РФ), либо учить всё подряд как ремесла, хотя бы и от этого страдала глубина понимания (как делают в США и Великобритании).

Порочность обоих подходов в этом самом "всё подряд", когда в итоге прагматизируются науки и онаучиваются ремесла там, где это не нужно.

Может ли существовать кремниевая жизнь?

Научные фантасты очень любили кремний. Он находится в таблице Менделеева под углеродом, тоже имеет валентность 4, широко распространен в природе, более того, на Земле его даже гораздо больше, чем углерода. Но у меня большие сомнения в возможности существования кремниевой жизни где-то в природе. И вот почему.

Хотя на основе кремния, созданном химиками, есть множество кремнийорганических соединений, содержащих цепочки и кольца из атомов кремния (в том числе с включением углерода, азота, серы и других гетероатомов), для синтеза почти всех этих сложных химических соединений кремния нужны безводные среды.

В присутствии воды и в присутствии кислорода наиболее устойчивая, с большим отрывом, термодинамически устойчивая форма кремния — это оксиды кремния и силикаты. Это те горные породы, которые мы видим вокруг себя на Земле: как в природе, так и в городе в виде всякого гравия в составе бетона.

Соединения кремния с кислородом очень прочные, очень стабильные. Это трехмерные кристаллы. Более того, не только на Земле, но и в метеоритах и даже в наблюдаемых методами радиоастрономии туманностях кремний существует в основном именно в этой форме. Для углерода радиоастрономы нашли более сотни органических молекул в межзвездной среде, в том числе таких достаточно сложных, как глицин, этанол и уксусная кислота, а вот для кремния аналогичным образом обнаруживаются в основном простые двухатомные молекулы, соединения кремния с углеродом, с кислородом, с азотом, с серой и т. д., которые при повышении концентрации будут образовывать устойчивые кристаллы — карбид кремния, нитрид кремния, оксид кремния. Прочные тугоплавкие соединения.

А можно ли избежать кислорода и воды в нашей Вселенной? Это очень-очень сложно, потому что кислород — третий по распространенности элемент во Вселенной после водорода и гелия.

И вода, образуемая первым по распространенности водородом и третьим по распространенности кислородом, тоже есть в космосе практически везде. В лаборатории можно, в принципе, наверное, организовать какую-то безводную среду и искусственную жизнь на кремнийорганических полимерах, но естественную нишу, где не будет воды, не будет кислорода и каких-то других активных кислородосодержащих соединений вроде диоксида углерода СО2, — уже сложно. Ну и при сверхнизких температурах, когда вода и кислород вымораживаются, прочность связей кремния и кислорода будет такая, что эти связи будут существовать вечно.

Пустить оксиды кремния в какую-то химическую реакцию, в какой-то обмен веществ будет невозможно. Получается, кремний подводит его слишком большая «любовь» к кислороду. Связь кремний-кислород слишком прочна, прочнее, чем все связи, образуемые углеродом с другими атомами, и практически нет реального способа вовлечь эти связи в какие-то химические реакции в мягких условиях.

Исследователи из Университета Штутгарта Института исследований твердого тела Общества Макса Планка (MPI-FKF) разработали инновационную систему на основе ДНК-нанороботов, которые могут изменять структуру и проницаемость мембран искусственных клеток. Это открывает новые возможности для целенаправленной доставки лекарств и других терапевтических веществ.

Используя ДНК-оригами, учёные создали нанороботов, которые могут программируемо изменять форму мембран, образуя каналы для прохождения молекул. Эти каналы могут быть запечатаны при необходимости, что позволяет контролировать транспортировку веществ в клетку.

Новый подход имеет потенциал для лечения и изучения заболеваний, имитируя функции живых клеток.

Учёные из Вашингтонского Университета и Технического университета Дании с помощью глубокого машинного обучения создали белки, нейтрализующие смертельные токсины змеиного яда.

Используя технологии рекомбинантной ДНК, исследователи синтезировали белки, которые предотвращают паралич и гибель, связываясь с нейротоксичными трехпалыми токсинами. Эти белки малы, что улучшает проникновение в ткани и скорость действия.

Новый метод обещает создать более безопасные, доступные и дешёвые противоядия по сравнению с традиционными антителами из плазмы животных, которые дороги, менее эффективны и вызывают серьёзные побочные эффекты.

Ученые из университетов Портсмута и Лестера в Великобритании разработали новый метод построения структур ДНК на микроскопическом уровне. ДНК-оригами — это техника, позволяющая создавать сложные трехмерные структуры, используя нити ДНК в качестве строительных блоков. Новый метод, основанный на процессе триплет-направленного сшивания, делает эти структуры более прочными и универсальными.

Исследователи модифицировали нити ДНК, внедрив дополнительные последовательности нуклеотидов, которые служат точками крепления для функциональных молекул. Сшивка структуры происходит с помощью триплексобразующих олигонуклеотидов, что делает структуру более стойкой к воздействию температурных изменений и ферментов.

Авторы утверждают, что эта техника может быть использована для доставки лекарств, генетической терапии и создания высокочувствительных диагностических инструментов.

Очень интересное и полезное видео.

Российский инвестор Илья Ясный рассказывает о том, как работает Big Pharma: кто определяет, сколько будет стоить новые лекарства; почему препараты создаются так долго, и можно ли ускорить этот процесс; кто зарабатывает на лекарствах, и не слишком ли этот кто-то жадный; почему государства так плохо регулируют расценки в этой сфере; как вышло, что фармкомпании сегодня практически не занимаются новыми антибиотиками, хотя проблема массовой антибиотикорезистентности набирает обороты; как часто фармкомпании ловят на нарушениях, и несут ли они ответственность за такое.

«Генериум» зарегистрировал первый российский анализатор для автоматизированной диагностики туберкулеза, об этом компания сообщила вчера на сайте.

Медизделие «Скринспот» — анализатор микропланшетов для автоматизированного считывания и анализа результатов тестов на туберкулез. Он работает на основе Elispot — метода иммуноферментных пятен, который используют для количественного определения клеток, секретирующих под воздействием специфического активирующего агента определенные продукты (цитокины, иммуноглобулины и другие целевые белки). Тесты на основе этого метода включены в клинические рекомендации Минздрава России.

Прибор, который могут использовать не только врачи клинической лабораторной диагностики, но и медицинские лабораторные техники и фельдшеры-лаборанты, однозначно ускорит работу лабораторий: раньше там обрабатывали результаты тестов вручную. А еще повысит точность диагностики: на результат не влияет уровень иммунитета (например, у людей с иммунодефицитными состояниями) и наличие вакцинации БЦЖ. Определение туберкулеза — главная, но не единственная задача прибора: его можно использовать и для диагностики на цитомегаловирус, энцефалит и боррелиоз.

Первые пациенты Центра генных дерматозов Московскои‌ области с дистрофическои‌ формои‌ буллезного эпидермолиза 16 января начали получать терапию инновационным препаратом Vyjuvek (beremagene geperpavec). Лекарство вошло в список закупаемых госфондом «Круг добра», которым руководит протоиерей Александр Ткаченко.

Препарат привносит в организм функциональную копию неработающего у пациента гена. В месте нанесения лекарства клетки кожи, не способные до этого нормально вырабатывать коллаген из- за генетическои‌ поломки, на определенное время обретут способность функционировать как здоровые.

До недавнего времени для буллезного эпидермолиза существовала лишь симптоматическая терапия, направленная на заживление ран, профилактику инфекции‌ и коррекцию осложнении‌.

Город контрастов.

Помните историю про мРНК вакцины и миокардиты? Редкие, но всё же.

Ученые из Мюнхена разобрались. Мышкам вводили мРНК вакцину со Спайком от SARS-СoV-2, запакованную в LNP частицы (коммерческий препарат), и на уровне отдельных клеток разбирались, куда пошла вакцина и где появился спайк.

Статья в Nature Biotechnology, в качестве проведенной научной работы сомневаться не приходится.

Выяснилось: вакцинные частицы правда попадают в сердце и ближайшие к нему сосуды, а вовсе не остаются исключительно в месте укола.

Там, уже не на том, где хотелось бы месте, происходит локальная экспрессия спайк-белка. Эта экспрессия происходит в эндотелии сосудов, а вовсе не в кардиомиоцитах.

Масштаб попадания частиц «не туда» по-видимому зависит от того, попал ли укол в сосуд или нет, ну и от проницаемости капилляров, конечно.

В отдельных случаях это и приводит к миокардитам, обнаруженным в качестве «побочного» эффекта.

Внимание: проблемы не из-за РНК вакцины как таковой, а из-за того полноразмерный спайк-белок, токсичный для человеческих тканей, оказался ровно там, где ему совсем быть не надо.

Главный вывод, что надо больше внимания обращать на свойства вакцинного антигена (а на это во время острой фазы пандемииу ученых не было времени).

Кстати, в статье исследовали биораспределение и свойства других средств доставки вакцин и генотерапевтических конструкций. Оказалось, что адено-ассоциированные вирусы AAV2 идут в жировые клетки. Тоже, кстати, новость и нежданчик.

https://tinyurl.com/2tbu5naf