Заметки лабораторного кота
366 subscribers
383 photos
26 videos
500 links
Заметки дилетанта широкого профиля.
Download Telegram
Неизбежные столкновения систем репликации ДНК и транскрипции способствуют геномной нестабильности, свойственной опухолевым клеткам. Согласно исследованию в Nature Cancer, в результате таких столкновений образуются в том числе большие тандемные повторы, наличие которых ассоциировано с неблагоприятным прогнозом у онкологических больных. Однако содержащие эти повторы клетки обладают повышенной чувствительностью к ряду противоопухолевых препаратов.

Оказалось, что линии раковых клеток, содержащие много больших тандемных повторов, обладают повышенной чувствительностью к двум типам реагентов. Первый из них — ингибиторы ядерной тирозинкиназы WEE1 (например, адавосертиб), которая распознает повреждения ДНК в S фазе и регулирует переход G2/M, обеспечивая завершение репарации ДНК до начала митоза. Вторыой разновидностью оказались ингибиторы поли(АДФ-рибоза)-полимеразы PARP. Кроме того, клетки с нокаутом CDK12 были более чувствительны к нескольким ингибиторам киназ CHK1 и ATR, находящихся выше WEE1 по каскаду сигналов о повреждении ДНК. При этом они были устойчивы к трем ингибиторам синтеза ДНК —бендамустину (алкилирующий агент), неларабину и фамцикловиру (аналоги гуанина).
Таким образом, большие тандемные повторы в опухолевых клетках образуются в результате столкновения систем репликации и транскрипции. Их наличие может быть полезным прогностическим биомаркером, а также влиять на чувствительность опухолевых клеток к определенным препаратам — понимание этого имеет ценное значение в клинике.
👍1
Российская компания Бетувакс, разработчик вакцин, проводит размещение на инвестиционных площадках и планирует привлечь инвестиции в разработку современных вакцин. Компания входит в экосистему Артген биотех.

Бетувакс специализируется на рациональном дизайне антигенов для субъединичных вакцин, направленных на терапию аллергических и профилактику инфекционных и онкологических заболеваний.

Компания планирует привлечь от 100 до 150 млн рублей. Средства будут направлены на проведение доклинических и клинических исследований препарата против аллергии на кошку, а также на разработку вакцин от вируса папилломы человека и ротавируса.
👍1
Исследователи из Каролинского института в Стокгольме разработали нанобот на основе ДНК (т.н. ДНК-оригами), который уничтожает раковые клетки у мышей. Конструкция остается неактивной, пока не достигнет микроокружения опухоли, где под воздействием низкого рН высвобождает «оружие» — пептиды, запускающие апоптоз за счёт взаимодействия с рецепторами фактора некроза опухоли (TNFRSF). При этом здоровые клетки, вокруг которых рН не снижается, остаются неповрежденными.

TNFRSF давно привлекали внимание ученых и врачей как перспективные противоопухолевые мишени, однако разработка эффективной терапии затрудняется тем, что эти рецепторы экспрессируются и на здоровых клетках.
Ранее исследования показали, что определенные члены TNFRSF можно эффективно олигомеризовать путем связывания с лигандами, регулярно расположенными на каркасе, тем самым индуцируя апоптоз. Чтобы точно настроить расстояние между лигандами, несколько научных групп разработало плоские листоподобные ДНК-оригами для крепления лигандов рецептора смерти 5 (DR5) или рецепторов Fas. Гексагонально расположенные лиганды значительно усиливали апоптоз, однако они взаимодействовали и со здоровыми клетками, вызывая нейротоксичность, повышенную восприимчивость к инфекциям и иммунные нарушения.

Тогда учёные решили использовать то, что опухоли переключают свой метаболизм на анаэробный гликолиз, вызывая закисление микросреды вокруг опухоли. Исследователи из Каролинского института (Швеция), ранее предложившие одну из плоских конструкций для кластеризации рецепторов, теперь разработали трехмерный ДНК-оригами-переключатель (контейнер вместо открытого листа), который может чувствовать высокую кислотность твердых опухолей. В кислой среде устройство автоматически выводит на поверхность структуры, состоящие из шести полипептидных цепочек, которые собирают в кластеры рецепторы смерти на поверхности клеток, приводя к их гибели.
👍1
И не поспоришь.
🙈1
Исследователи из Нанкинского университета почты и телекоммуникаций разработали наноробота с помощью технологии ДНК-оригами для точного тромболиза.

Молекулярное устройство может точно определить наличие тромбов по концентрации фермента, вызывающего тромбоз, и доставить лекарство в проблемные зоны, предотвращая образование бляшек в сосудах.

Ученые отмечают, что биоразлагаемое наноустройство безопасно выводится из организма. Разработка может помочь в эффективном лечении инфаркта миокарда и инсульта.
🔥2👍1
Сначала общество воспитывает тебя на русской литературе, а потом требует, лицемерное, чтобы ты в срок сдавал дипломы и диссеры.

«Я решил – как почувствую естественную погибель, так примусь за все дела и тогда все закончу и соображу – в какие-нибудь одни сутки, мне больше не надо. Даже в час можно справиться со всеми житейскими задачами!.. В жизни ничего особенного нету – я специально думал о ней и правильно это заметил. Ведь это только так кажется, что нужно жить лет сто, и едва лишь тебе хватит такого времени на все задачи! Отнюдь неверно! Можно прожить попусту лет сорок, а потом сразу как приняться за час до гроба, так все исполнить в порядочке, зачем родился!..»

Платонов, «Счастливая Москва».

«Что я теперь? Zéro. Чем могу быть завтра? Я завтра могу из мертвых воскреснуть и вновь начать жить! Человека могу обрести в себе, пока еще он не пропал! <…> Неужели я не понимаю, что я сам погибший человек. Но – почему же я не могу воскреснуть. Да! стоит только хоть раз в жизни быть расчетливым и терпеливым и – вот и всё! Стоит только хоть раз выдержать характер, и я в один час могу всю судьбу изменить!»

Достоевский, «Игрок».
😁3👏1
Очарование университетских лабораторий.
Российские учёные из Казанского (Приволжского) федерального университета разработали новый способ хранения ДНК, заключив её в оболочку из древовидного полимера.

Новый метод позволяет эффективно защищать молекулы ДНК от разрушения в воде при комнатной температуре, при этом оболочка безопасна для клеток. Процесс синтеза полимера прост и дёшев, а также позволяет создавать оболочки с различными свойствами.

Разработка имеет потенциал для создания новых ДНК-вакцин, сенсоров и лекарств, например, для профилактики герпеса и COVID-19. Метод также способствует улучшению систем доставки и хранения ДНК в лабораториях.
🔥2
Ученые из Китая и США задались целью оптимизировать липидные наночастицы, применяемые для доставки терапевтических генов и мРНК-вакцин. Они воспользовались методом направленной химической эволюции, чтобы сконструировать один из четырех ключевых компонентов наночастиц — ионизируемые липиды, отвечающие за высвобождение груза в клетке и биосовместимость. Новая структура повысила эффективность доставки по сравнению с коммерческими вариантами (например, входящими в состав мРНК-вакцины от SARS-CoV-2, производимой компанией Moderna).
👍1
Рядом с МГУ на Воробьевых горах строят звезду смерти, сообщают наши подписчики.
Forwarded from АРХЭ
Контрасты Москвы.

#архэ
🔥1
Недавно вышло исследование, посвященное тому, насколько лучше комбинация человек и искусственный интеллект, программа для предсказания структуры белка Al, справляется с различными задачами по сравнению с человеком и с AI по одиночке.

Авторы изучили 106 публикаций, для которых исследователи определили 370 эффектов, и обнаружили, что в среднем человек+AI работает лучше, чем просто человек (они называют это human augmentation), однако нет свидетельств, что человек+AI работает лучше, чем либо человек, либо AI (это они называют синергией).

Выяснилось, что синергия наблюдается в случае задач, связанных с порождением нового, а вот в задачах, связанных с принятием решения, наоборот, сочетание человек+AI справляется хуже.

Интересно, что в задачах, где AI превосходил человека, добавление человека всё портило, а вот там, где человек превосходил AI, наблюдалась синергия в паре человек-AI.
Гематоэнцефалический барьер (ГЭБ) препятствует проникновению в мозг из крови не только патогенов и токсинов, но и лекарств. Ученые из США получили конъюгаты малых молекул с антисмысловыми олигонуклеотидами (АСО), которые могут проникать через ГЭБ и доставлять АСО во все основные типы клеток мозга. Успешную доставку АСО для терапии рака и бокового амиотрофического склероза продемонстрировали на мышах и на изолированной ткани мозга человека.

В качестве основы для конъюгатов авторы изначально рассматривали несколько малых молекул: производные коричной кислоты, триптамина, MK-0752 и SR-57227. Коричная кислота способна пересекать ГЭБ, триптамин проникает в мозг с помощью ионов магния и АТФ, MK-0752 является ингибитором γ-секретазы, а SR-57227 проникает в мозг за счет связывания с 5-HT3 серотониновыми рецепторами. Для первых тестов ученые присоединили две или три копии малых молекул к флуорофору Cy5 через алкановый или этиленгликолевый спейсер.
Полученную панель конъюгатов малых молекул с Cy5 ввели внутривенно мышам. По сравнению со свободным флуорофором все конъюгаты лучше попадали в мозг. Так, уровни конъюгатов с тремя копиями производных коричной кислоты, триптамина и SR-57227 в мозге были в 62,5, 97 и 141,8 раз выше, чем уровень свободного Cy5. Но наилучший результат показал конъюгат с тремя копиями MK-0752: его в мозге было в 220,5 раз больше, чем свободного флуорофора. Этот конъюгат обозначили BCC10 и использовали в последующих экспериментах.

Далее исследователи получили конъюгаты с биомолекулами — олигонуклеотидами. При внутривенном введении препаратов мышам конъюгат BCC10-олигонуклеотид накапливался в мозге в 66 и 7,3 раз интенсивнее, чем свободный олигонуклеотид и его конъюгат с холестерином. После инъекции конъюгатов практически не изменялся цитокиновый профиль крови. Исследователи заключили, что конъюгаты, способные пересекать ГЭБ, имеют терапевтический потенциал.
Вы наверняка видели множество снеговиков, но вы когда-либо видели снеговика-трицератопса?! Именно такой слепили рядом с биологическим факультетом МГУ студенты.
👍4
Как мало на самом деле мы знаем ещё о биохимии человека.

Три года назад ученые из Германии открыли рецептор, который играет важную роль в сигнальном пути инсулина. Теперь они обнаружили, что воздействие на этот рецептор может защитить бета-клетки поджелудочной железы от повреждения, а также усилить выработку инсулина.

Открытие может обеспечить не только более эффективное лечение диабета, но и полное излечение, надеются авторы.

Открытие инцептора — рецептора ингибитора инсулина, расположенного на поверхности бета-клеток — в 2021 году показало ученым новое направление в изучении механизмов развития сахарного диабета.

С тех пор им удалось получить много важных данных. Теперь они раскрыли новую важную функцию инцептора: оказалось, что он связывает избыток инсулина в бета-клетках поджелудочной железы и направляет его к распаду, сообщается на сайте Университета Гельмгольца в Мюнхене.

Эксперименты показали, что блокировка инцептора защищает бета-клетки поджелудочной от повреждения, а также усиливает выработку инсулина. "Такое целевое воздействие на инцептор очень перспективно для лечения диабета. Мы можем улучить функцию инсулин-продуцирующих клеток, особенно уже поврежденных болезнью", — заявил автор работы Хайко Ликерт.
Авторы статьи в Science Advances обнаружили, что белок PDAP1 играет решающую роль в репликации вируса гепатита A (HAV). Этот небольшой фосфопротеин взаимодействует с эукариотическим белком eIF4E, который необходим для трансляции РНК HAV. В то же время PDAP1 по-видимому, способствует адаптации клеток к стрессу эндоплазматического ретикулума (ЭПР), как при вирусной инфекции, так и при других состояниях.

Вирус гепатита А существенно отличается от других пикорнавирусов и все еще недостаточно изучен, несмотря на его широкое распространение. В частности, его трансляция требует участия эукариотического кэп-связывающего белка eIF4E, хотя его геном кэпа не имеет; трансляция других пикорнавирусов от этого белка не зависит.

Геномные CRISPR-скрининги выявили и другие белки человека, необходимые для репликации HAV. Авторы нового исследования в одной из своих предыдущих работ провели CRISPR скрининг более 19000 генов и установили, что белок PDAP1, ранее неизвестный в контексте репликации вируса, критически важен для жизненного цикла HAV.

Другая исследовательская группа показала, что PDAP1 имеет решающее значение для защиты В-клеток от гибели, индуцированной стрессом.

Можно было предположить, что экспрессия этого белка в клетках печени растет на фоне стресса, вызванного инфекцией, и это облегчает вирусу его использование.

Авторы исследования считают, что PDAP1 может быть перспективной мишенью для разработки новых противовирусных препаратов, например, на основе моноклональных антител. Более того, экспрессия PDAP1 повышается и в опухолевых клетках; понимание его роли в реакции на стресс может быть важным и для молекулярной онкологии.
Илон Маск согласился, что целые книги по психологии и близко не стоят рядом с отрывком из "Братьев Карамазовых":

"Главное, самому себе не лгите. Лгущий самому себе и собственную ложь свою слушающий до того доходит, что уж никакой правды ни в себе, ни кругом не различает, а стало быть входит в неуважение и к себе и к другим. Не уважая же никого, перестает любить, а чтобы, не имея любви, занять себя и развлечь, предается страстям и грубым сладостям, и доходит совсем до скотства в пороках своих, а все от беспрерывной лжи и людям и себе самому. Лгущий себе самому прежде всех и обидеться может. Ведь обидеться иногда очень приятно, не так ли? И ведь знает человек, что никто не обидел его, а что он сам себе обиду навыдумал и налгал для красы, сам преувеличил, чтобы картину создать, к слову привязался и из горошинки сделал гору, - знает сам это, а все-таки самый первый обижается, обижается до приятности, до ощущения большего удовольствия, а тем самым доходит и до вражды истинной...".
🔥3😁1
Forwarded from Сколтех
📝 Позади первый день Конгресса молодых учёных. Собрали яркие моменты и фотографии с выступлений спикеров Сколтеха.

Ректор Сколтеха Александр Кулешов на сессии о привлечении учёных в Россию отметил, что единственно верный способ создать положительной образ страны в международном академическом сообществе и развеять мифы о ней — через личное общение, а также подчеркнул, что страхи о полном отказе публиковать работы российских учёных преувеличены:
«Есть ощущение, что российских учёных перестали печатать в журналах и пускать на конференции, но страхи преувеличены. Например, совсем недавно нашему коллективу учёных под овации вручили награду за лучшую статью на конференции по языковому моделированию в США».


Старший вице-президент по развитию Александр Сафонов принял участие в сессии о законодательстве и его применении в вопросах привлечения иностранных учёных в Россию:
«Наше миграционное законодательство должно быть семейно-центричным, чтобы иностранные учёные захотели остаться в России. Но одним миграционным законодательством ограничиваться не следует. Необходимы долгосрочные продукты для высококвалифицированных специалистов — специальные ипотечные продукты, изменения в пенсионной системе, то, что будет работать вдолгую».


Начальник лаборатории «Искусственный интеллект для автономных систем» Центра прикладного ИИ Александр Меньщиков поделился своим видением трендов в области автономных беспилотников, отметив необходимость развивать такие направления, как бортовой ИИ, визуальную навигацию, роевое взаимодействие и связь со спутниками:
«Одно из ключевых направлений в мире в области визуальной навигации, которое мы развиваем и в Сколтехе — это использование мультимодальных данных. Например, навигация в полёте с помощью тепловизора. Также мы работаем над адаптивными системами управления — нам одним из первых в России удалось запустить автономный дрон, который полностью управляется RL-алгоритмами».


Заслуженный профессор и руководитель Лаборатории дизайна материалов Артём Оганов, затрагивая тему технологического лидерства, отметил важную составляющую, которую должен помнить человек:
«Технологии, продукты должны в конечном счете сделать человека счастливее. Эту цель очень важно не упускать из виду. Плохо, когда девайсы делают нас рабами технологий».


Старший преподаватель Центра технологий ИИ Екатерина Муравлева поделилась своим мнением о перспективах ИИ в науке:
«Области, в которых искусственный интеллект имеет высокий потенциал для применения — это, в первую очередь, науки о науки о земле, физика, химия. А вот недооценённый сегмент — это гуманитарные науки, нам еще предстоит понять, как должен работать с ними искусственный интеллект».


Старший вице-президент по связям с промышленностью Алексей Пономарёв ответил на вопрос, почему научпоп нужен даже промышленности: «Десятки раз, входя в контакт с индустриальной компанией, первое, что нам приходилось делать, — организовывать серию научпоп лекций для сотрудников и руководства компании, приглашая тех, кто умеет рассказать суть дела. Две-три такие лекции, и мы можем о чём-то говорить».

Наталья Подсосонная, заместитель директора по развитию Центра нейробиологии и нейрореабилитации им. Владимира Зельмана участвовала в дискуссии о нейротехнологиях и рассказала об одной из разработок Сколтеха:
«В современном мире психические и когнитивные расстройства становятся превалирующими среди всех диагнозов и могут повлечь существенный рост экономических издержек, если их вовремя не диагностировать. Как раз недавно в Сколтехе разработана и успешно протестирована технология, позволяющая оценивать риск развития психических заболеваний по липидным маркерам крови».


Руководитель направления инкубации и акселерации Анна Старкова в дискуссии о развитии гибких навыков для успешной карьеры в науке поделилась своими принципами сильного лидера, отметив важность эмпатии:
«Каждый раз, когда мы погружаемся в какой-то процесс, нужно понимать — это наша проблема. Часто, когда мы занимаемся наукой, пишем статью или доклад, мы это не воспринимаем как свою личную проблему. А стоило бы».


Фото — Росконгресс