Заметки лабораторного кота
347 subscribers
380 photos
26 videos
491 links
Заметки дилетанта широкого профиля.
Download Telegram
Forwarded from EvgBiotch 🧬
Дети от трех родителей? Не фантастика, а работа с митохондриями.

Почему эта технология существует и зачем она нужна?

Митохондрии не просто «энергостанции» клетки. Это потомки древних бактерий, которые миллиарды лет назад вступили в симбиоз с предками наших клеток. У них сохранилась собственная маленькая кольцевая ДНК (мтДНК) — всего 37 генов, но жизненно важных.

Ключевой факт: мтДНК наследуется исключительно от матери. Яйцеклетка содержит сотни тысяч копий мтДНК, а сперматозоид — почти нет. Поэтому все наши митохондрии — материнские.

🧬 Что происходит при мутациях в мтДНК?
Мутации в мтДНК случаются чаще, если мутантных копий >60-80% — развивается митохондриальная болезнь (1 случай на 6000 - 8000 рожденных детей).

В результате мутаций может возникнуть поражение органов с высоким энергопотреблением - мозг, сердце, мышцы. Например фатальные синдромы, прогрессирующая мышечная слабость, нейродегенерация, инсультоподобные эпизоды у детей.

Нет лекарства. Существует лишь поддерживающая терапия.

Технология спасения: митохондриальная заместительная терапия (MRT) с целью дать матери с патогенной мутацией мтДНК шанс родить генетически родного ребенка без этой мутации.

Как это работает (метод переноса пронуклеусов):

1️⃣Берут яйцеклетку матери (с дефектными митохондриями) и яйцеклетку донора (со здоровыми митохондриями).

2️⃣Удаляют ядра из обеих: от донорской — выбрасывают, от материнской — извлекают.

3️⃣Ядерный генетический материал матери (в виде пронуклеусов после оплодотворения спермой отца или ее собственное ядро до оплодотворения) переносят в цитоплазму донорской яйцеклетки, из которой удалено собственное ядро.

Получается эмбрион с:
99.9% ДНК от родителей (ядерный геном)
Здоровой мтДНК от донора-женщины (0.1% генома)

❗️Важно: ребенок будет иметь генетический материал от трех человек, но донор мтДНК не является «третьим родителем» в социальном или физиологическом смысле. Это донор жизненно важного клеточного компонента.

Где и кому это доступно?

Показания строгие и медицинские:
-Высокий риск передачи тяжелого митохондриального заболевания.
-Невынашивание беременности из-за митохондриальных нарушений.
-Многократные неудачи ЭКО по этой причине.

Правовой статус:

🤩 Разрешено и регулируется: Великобритания (первая в мире, с 2015 года) и Австралия. В Великобритании за 10 лет наблюдений родилось 8 здоровых детей по этой технологии.

👊 Запрещено: США (мораторий FDA), многие другие страны.

Важные научные оговорки:
Не 100% эффективность. При переносе может случайно попасть небольшое количество дефектных митохондрий матери («эффект переноса»). Но их доля, как правило, слишком мала для развития болезни.

🕝 Необходим долгосрочный мониторинг. Первое поколение таких детей еще растет. Ученые внимательно следят за их здоровьем, хотя риски оцениваются как низкие.

Итог:
это не технология для «улучшения» детей (пока?), а шанс для семей родить здорового ребенка. Это пример того, как глубокая работа с фундаментальной клеточной биологией дает решение для медицинских проблем. Работа с причинами, а не со следствиями.
Please open Telegram to view this post
VIEW IN TELEGRAM
1👍1🔥1
EvgBiotch 🧬
Дети от трех родителей? Не фантастика, а работа с митохондриями. Почему эта технология существует и зачем она нужна? Митохондрии не просто «энергостанции» клетки. Это потомки древних бактерий, которые миллиарды лет назад вступили в симбиоз с предками…
Эта новость интереснейшим образом перекликается с проектом американской компании Mitrix Bio.

Они уже давно пытаются шаманить с митохондриями. В июле прошлого года компания объявила о старте испытаний митохондриальной трансплантации. Первым добровольцем вызвался 90-летний квантовый физик Джон Крамер, который посчитал, что тепловая смерть Вселенной произойдёт быстрее, чем FDA одобрит эту процедуру это первый метод "лечения" старости, который кажется ему и потенциально безопасным, и достаточно действенным. 

Как вы все знаете, митохондрии — одни из самых важных клеточных органелл, чья основная функция – синтез АТФ, но кроме этого они участвуют во множестве других процессов: ядерная регуляция, эпигенетика, протеостаз, лизосомы, воспалительный фон, механика матрикса, синтез жирных кислот, аминокислот, гемовых и железо-серных белков и гормонов. Митохондрии контролируют количество доступной в клетке энергии, и если она в дефиците — запускается апоптоз или аутофагия — самоубийство и самопереваривание клеток.

Большой перечень функций митохондрий означает, что если что-то в их работе идет не так, это влечет за собой ворох проблем. Из-за врожденных мутаций в митохондриальной ДНК развиваются наследственные болезни у детей. При этих нарушениях клеткам ни на что не хватает энергии: они повреждаются и гибнут, а организм перестает нормально работать и развиваться. Приобретенные мутации или ошибки в работе митохондрий у взрослых приводят к развитию острых заболеваний, вроде инфаркта и инсульта, и хронических: диабета, депрессии, болезни Паркинсона и болезни Альцгеймера.

Мутации в митохондриях накапливаются и просто в процессе старения — их последствия особенно заметны в энергетически требовательных органах: мозге, скелетных мышцах, сетчатке, яичниках, печени и сердце. Эти мутации влекут за собой снижение качества и эффективности синтеза энергии, а также избыточное образование активных форм кислорода. При этом с возрастом дефектные митохондрии не отбраковываются, как это происходит в норме, а накапливаются. Некоторые исследователи полагают, что пересадка "свежих" митохондрий, юных или специально выращенных в биореакторе, потенциально способна обеспечить человеку здоровое долголетие без сопутствующих возрастных заболеваний.

Но дьявол, как всегда, таится в деталях. Как обеспечить приживаемость? Как избежать иммунного ответа на митохондрии с чужой mtDNA? Как они распределятся по тканям, и не застрянут ли они просто в печени как очередной нано‑фейл? И главное — кто сказал, что стареет только митохондрия, а не вся клеточная система вокруг неё? Что если не "митохондрия стареет, и в результате стареет клетка", а "стареет клетки, и в результате стареет митохондрия"?

Потенциальной пользы от митохондриальной трансплантации для борьбы со старением человека ученые пока не подтверждали, хотя уже были некоторые обнадеживающие результаты в экспериментах на клеточных культурах. Часть научного сообщества считает полученные данные недостоверными, Джон Крамер, как мы видим, придерживается другой точки зрения (да и что ему терять).

Впрочем, мы не узнаем, работает ли эта терапия, пока не попробуем.
5🔥1
Заметки лабораторного кота
Эта новость интереснейшим образом перекликается с проектом американской компании Mitrix Bio. Они уже давно пытаются шаманить с митохондриями. В июле прошлого года компания объявила о старте испытаний митохондриальной трансплантации. Первым добровольцем вызвался…
Внимательные комментаторы обратили внимание, что для 90 лет господин Крамер выглядит очень хорошо. Высокий уровень образования и дохода, спокойная профессия, жизнь без стрессов, здоровый образ жизни, мотивация к жизни (научная работа)...

Что сразу ставит неудобные вопросы по интерпретации полученных результатов. Допустим, он доживёт до 100-110 лет. Можем ли мы быть уверены, что тому способствовало пересаживание ему свежих митохондрий, или он бы и сам прожил столько лет?

PS: будут пытаться отслеживать по биомаркерам (IL‑6, TNF‑α, CRP,
CD4/CD8 и пр.).
👍71
Forwarded from Michael Koksharov
Скорее он тут будет в качестве добровольца по безопасности: «Дедушка старый — ему всё равно.» 😁 Если проблем не будет, можно и на более молодых попробовать, и посмотреть, замедлится ли старение.
🔥4
Заметки лабораторного кота
Внимательные комментаторы обратили внимание, что для 90 лет господин Крамер выглядит очень хорошо. Высокий уровень образования и дохода, спокойная профессия, жизнь без стрессов, здоровый образ жизни, мотивация к жизни (научная работа)... Что сразу ставит…
Как знать? дни наши сочтены не нами;
Цвел юноша вечор, а нынче умер,
И вот его четыре старика
Несут на сгорбленных плечах в могилу.
Барон здоров. Бог даст — лет десять, двадцать
И двадцать пять и тридцать проживет он.
🔥3
Заметки лабораторного кота
Любая достаточно развитая технология неотличима от магии, и, наверное, нигде это не проявлятся так ярко как в области биотехнологий и ИИ. Попробую составить свою подборку из 12 наиболее впечатливших меня достижений в области биохимии, молекулярной и клеточной…
Кстати, забыл упомянуть ещё одно значимое событие года: лютоволков, которые создала компания Colossal Biosciences.

Да, по сути они получили просто генетически модифицированного волка. Ужасные волки и серые волки – два разных биологических вида, которые не были даже способны скрещиваться друг с другом. От того, что серому волку вставили 20 генов волка ужасного, он ужасным волком не станет, к сожалению.

Геном ужасного волка не извлекали, не пересаживали, и не планируется (пока). Его геном расшифровали, взяли оттуда несколько генов, а остальные сделали, "чтоб было похоже", из C. Lupus, который с эноционом только в одну подсемью входит.

В общем, что из себя этот эксперимент (если он действительно состоялся) представляет? Старый анекдот:

- Господа гусары, выкупаем коня в шампанском!
- Ржевский, у нас ни шампанского, ни коня, все пропили.
- Ну тогда кошку пивом обольем.


И всё же, это значимое событие (ну, как паровая машина Герона), даже если генно-отредактированные волки страшно далеки от своего древнего прототипа. Во-первых, отработка методов многократного, точного и безопасного редактирования десятков генов одновременно в живом организме является дорогой к терапии полигенных заболеваний человека. Во-вторых, клонирование вымерших и вымирающих животных, на мой взгляд, само по себе очень интересно и будоражуще.

https://t.iss.one/liza_loves_biology/915
🤣5
Forwarded from BioScience notes
Топ одобренных молекул: за чем следим в 2026 году?!

Иногда кажется, что фарма постоянно буксует. Это вечное «фаза 3», «скоро подадим», «ждём FDA»… А давайте посмотрим на уже одобренные звездные молекулы, которые вот вот в 2026 году будут выходить на рынок⚡️

➡️Первое, мой фаворит! Астма. 2 укола в год.
Exdensur (GSK)
Биологическая терапия от тяжёлой астмы — два раза в год. Это огромный шаг для пациентов и для приверженности терапии. Прямо game-changer

➡️Рак мочевого пузыря. Когда стандарт не сработал
Inlexzo (Johnson & Johnson)
Для пациентов с раком мочевого пузыря, у которых не сработала стандартная терапия. Тут долгое время вариантов почти не было
Теперь есть:
• имплант в мочевой пузырь
• локальное высвобождение гемцитабина
. Без системной токсичности

🟠Voyxact (Otsuka)
Первый ингибитор APRIL для лечения IgA-нефропатии.
Ежемесячное введение и выраженное снижение протеинурии. Редкий случай, когда таргетная терапия чётко попадает в патогенез болезни

А завтра давайте про топ препаратов, которые пока «на подлёте», но могут выстрелить уже в 2026 году. Препараты которые очень скоро одобрят
Please open Telegram to view this post
VIEW IN TELEGRAM
👍4🔥21
⬆️ Вот в тему большая обзорная статья (2026) "Вакцинация от COVID и риск развития рака после заражения: оценка закономерностей и потенциальных биологических механизмов" - 69 публикаций, 333 пациента (2020-2025) - обзоры, эксперименты, случаи из самых разных стран, включая РФ. Среди этих случаев описаны саркомы, меланомы, глиобластомы - новые диагнозы и рецидивы, от 7 дней (вам не смешно?) до 6 месяцев после вакцинации (для справки - порой проходят годы), разные скорости роста опухолей, конечно. Включены 2 ретроспективных популяционных исследования (Италия и Ю.Корея).

И при этом доказать что-то до сих пор невозможно:

а) невакцинированных кратно меньше, получается что вакцинированные болеют чаще
б) дебют опухоли может провоцироваться любой депрессией и инфекцией
в) никто не видит динамику, просто выявляют опухоль, поэтому статья про интеграцию генома так любопытна (но она одна и это пока тоже не доказательство).

Мне понравилась статья про военных в США (~1,3 млн человек), которые по приказу к середине 2020 года почти все прошли вакцинацию.

🖼 Сравнили 2 периода - 2017-2020 (до вакцинации) и 2021-2023 (ситуация после вакцинации и во время пандемии)

Рост числа зрелых Т- и NK-клеточных лимфом начался в период с 2020 по 2021 год, который охватывает время распространения COVID-19 и начала массовой вакцинации военнослужащих.

Начиная с 2021 года наблюдался ~50% рост числа Неходжкинских лимфом, а также стабильно высокая частота зрелых Т- и NK-клеточных лимфом по сравнению с допандемийными годами.

Но причинно-следственная связь из этого анализа временных тенденций не доказана: куча других факторов, от самого вируса, до снижения диагностики - известный факт, что из-за ковида выросло число тяжёлых форм опухолей - обвиняют позднюю диагностику.

* * *
Между прочим, пристальное внимание к раку и ковиду обнаружило ещё один любопытный факт - несколько случаев регрессии опухолей на фоне ковида. Предполагается влияние вируса - активация рецепторов NOD2 так перенастроила моноциты, что они стали активно призывать NK -известных убийц опухолевых клеток.

#вакцинация #инфекции #covid19 #рак
👍4
Forever and BioMed
подскажет эволюционная биология, ведь благодаря ей мы обнаруживаем эффективные решения, к которым за миллиарды лет кропотливых проб и ошибок пришла сама Жизнь
– Это было прекрасно, – сказал Шерлок Холмс, садясь за стол. – Помните, что говорит Дарвин о музыке? Он утверждает, что человечество научилось создавать музыку и наслаждаться ею гораздо раньше, чем обрело способность говорить. Быть может, оттого-то нас так глубоко волнует музыка, В наших душах сохранилась смутная память о тех туманных веках, когда мир переживал свое раннее детство.
– Смелая теория, – заметил я.
Все теории, объясняющие явления природы, должны быть смелы, как сама природа, – ответил Холмс.
💯6
Forwarded from Solid State Humanity
Аналог AlphaFold от китайских исследователей

ИИ-платформа DrugCLIP ускоряет виртуальный поиск лекарственных молекул примерно в миллион раз по сравнению с классическими методами молекулярного докинга.

Проблема, которую решает DrugCLIP, заключается в масштабе. Геном человека кодирует более 20 тысяч белков, но в фармакологии используется лишь малая их часть. Полноценный перебор потенциальных лекарств для тысяч белковых мишеней с помощью традиционных инструментов занял бы сотни лет вычислений на одном компьютере. DrugCLIP сокращает это время до одного дня на одном вычислительном узле.

Ключевая идея платформы - переосмысление молекулярного докинга как задачи семантического поиска. Белковые карманы и малые молекулы переводятся в векторное пространство, где их совместимость оценивается чрезвычайно быстро. На системе с 128-ядерным CPU и 8 GPU платформа способна ежедневно оценивать триллионы пар "белок-молекула".

В первом в мире проекте виртуального скрининга на масштабе генома команда проанализировала около 10 000 белковых мишеней, 20 000 белковых карманов и более 500 миллионов лекарственно-подобных молекул. Результатом стали свыше 2 миллионов потенциально активных соединений и крупнейшая на сегодняшний день база данных белок-лигандных взаимодействий. Эта база открыта для мирового научного сообщества.

DrugCLIP дополняет достижения AlphaFold: если AlphaFold решил задачу предсказания структуры белков, то DrugCLIP закрывает следующий критический этап - переход от структуры белка к реальному поиску лекарств. Платформа уже доступна как сервис, за полгода её использовали более 1400 исследователей, выполнивших свыше 13 500 задач скрининга.

В перспективе разработчики планируют использовать DrugCLIP для ускорения поиска новых мишеней и first-in-class препаратов, в том числе в онкологии, инфекционных и редких заболеваниях

https://www.science.org/doi/10.1126/science.ads9530

#искусственный_интеллект
🔥4🤔2
Forwarded from LIFT feed
После трёх раундов направленной эволюции биоинженеры UC Irvine превратили ДНК-полимеразу в фермент, способный на: синтез РНК; обратную транскрипцию; синтез «неестественных» нуклеотидов и синтез ДНК-РНК химер. Получилась универсальная полимераза, которая может действовать на ДНК, РНК или модифицированные нуклеотиды, создавая практически что угодно.

✍️ В разработке лекарств все большую роль играют РНК и др. генетические конструкции, так что данный подход имеет хорошие перспективы в персонализированной медицине и таргетной терапии. См. также пресс-релиз.

#bioengineering | #molbiol
👍4🤔1
Forwarded from LIFT feed
Что касается ГЭБ, есть идея лечить нейродегенерацию, не пробивая его, а наоборот, укрепляя. Авторы свежей статьи применили препарат, который блокирует фермент 15-PGDH, которого особенно много в воспаленном ГЭБ. В мышиных моделях БА и ЧМТ это затормозило нейродегенерацию в мозге и сохранило их когнитивные функции на уровне здоровых контролей.

«Примечательно, что препарат не изменил количество амилоида в мозге. Это важно, поскольку самые последние одобренные препараты от болезни Альцгеймера сосредоточены только на удалении амилоида и, к сожалению, не очень хорошо работают и имеют рискованные побочные эффекты. Таким образом, ингибирование 15-PGDH предлагает совершенно новый подход к лечению болезни Альцгеймера». — пресс-релиз.


#brain | #therapy | #molbiol
👍4
Forwarded from BioScience notes
Топ молекул которые одобрят в 2026 году

Это не просто прогнозы, а препараты, которые уже стоят одной ногой у регулятора. Да, эти молекулы пока не одобрены, но решения по ним ожидаются в течение 2026 года

Ну что, поехали?

Прощай, нарколепсия?
Oveporexton (Takeda)

Представьте: люди с нарколепсией физически не могут оставаться бодрыми. До сих пор мы лечили только симптомы. А тут — предлагают воздействовать на причину. Этот препарат помогает мозгу «включить» бодрствование. Неврологи ждали такого десятилетиями, надеюсь 🤞


Холестерин, подвинься!
🌱Enlicitide (Merck)

Тот самый PCSK9, но теперь в удобной таблетке! Снижение «плохого» холестерина до 60% — и никаких ежемесячных уколов. Если одобрят, это будет огромный прорыв для кардиологии. И пациенты, и врачи скажут спасибо 🙏

Псориаз без шприцев
👉Icotrokinra (Johnson & Johnson)

Обычно эффективны только «уколы» (биология). А здесь нам обещают таблетку, которая по эффективности не уступает. Звучит смело, ну, посмотрим

Онкология, хитрый удар
🎯Ivonescimab (Summit / Akeso)

Рак становится умнее, и мы тоже. Это антитело «два в одном»: блокирует «иммунный тормоз» опухоли (PD-1). Одновременно перекрывает ей кислород, не давая расти сосудам (VEGF). Шанс для пациентов с раком легкого, кому стандартная иммунотерапия уже не помогла

♥️ Тихий, но важный герой против редкого рака
Relacorilant (Corcept)

Редкий, но критически важный случай. Для пациенток с платинорезистентным раком яичников, когда вариантов почти нет. Препарат дает шанс на увеличение выживаемости и, что важно, без тяжелой токсичности

Новый фронт против рака груди
🎀Gedatolisib (Celcuity)

Рак молочной железы, когда стандартное лечение заходит в тупик. Двойной удар по ключевым сигнальным путям (PI3K и mTOR) после провала предыдущих терапий. Тяжелая онкология, но с четкой логикой и, как показали исследования, реальным эффектом

Забытый фактор риска инфаркта под прицелом
🤩Pelacarsen (Novartis)

Lp(a) — генетический фактор риска инфаркта и инсульта, который до сих пор вообще не лечился! Сейчас идут финальные исследования. Если все получится, профилактическая кардиология изменится до неузнаваемости

Прочитав все это, как думаешь, что звучит по-настоящему революционно? 🤔
Please open Telegram to view this post
VIEW IN TELEGRAM
👍6🔥3👏3
Forwarded from Forever and BioMed
биомед-итоги года
подводит Илья Колмановский в интервью Ирине Шихман

Хороший разговор - а то и вовсе лучший, на русскоязычных просторах Инета:
https://www.youtube.com/watch?v=W8FAN0Q_Q4g ⬅️

С некоторыми тезисами и акцентами я не соглашусь - с позиций суровой Науки и из-за нелюбви к упрощениям - но для широкой публики это must see 🤓 искренняя рекомендация!

#интервью
#люди
👍4
Forwarded from EvgBiotch 🧬
Наше «я всё сделаю завтра» может быть не ленью, а встроенным тормозом в мозге.

Исследование в Current Biology показало: есть цепь, которая буквально отделяет мысль от действия, если впереди дискомфорт или усилие, даже при приятной награде.

Что нашли учёные
Нейронный контур в мозге, который срабатывает как внутренний «стоп‑кран» перед неприятной работой.​
У макак этот контур блокировал старт действия, когда вместе с наградой ожидался лёгкий «наказующий» стимул, например воздушная струя в лицо

🙀Как это работает
При ожидании неприятных усилий активность этой нейронной цепи изменялась, что переводило систему в режим «паралича действия».​
Мозг не отменял ценность цели, он застревал на первом шаге, где ожидал страдание, и экономил ресурсы на задачах с высоким «входным билетом».

🕺 Что будет, если контур «выключить»
В эксперименте учёные временно «глушили» эту связь хемогенетикой, и обезьяны становились заметно более активными и охотно брались за задания.​ Полное отключение такого тормоза в человеке может быть опасным: риск импульсивности, переработки и истощения резко возрастает (а минусы будут?).

Причём тут прокрастинация и психика
Этот механизм помогает понять апатию и абулию при депрессии, шизофрении и болезни Паркинсона, когда человек понимает важность дела, но не может его начать.​
Авторы предлагают смещать фокус: не только усиливать награды, а уменьшать мозговые «сигналы отключения» перед стартом — делать первый шаг максимально дешёвым по усилию.

🏌️Так как это применить к себе?
Дробите задачи до абсурда: первый шаг должен казаться смешно лёгким — так вы обходим внутренний тормоз.​
Снижайте ожидаемый дискомфорт: меняйте обстановку, время, формат, чтобы мозг меньше «ждал боли» от начала дела.
Please open Telegram to view this post
VIEW IN TELEGRAM
🔥6🤔3👍1
Forwarded from LIFT feed
Отличный новый обзор по "механомедицине", как физические силы регулируют биологические функции и как их изменения выступают в качестве индикаторов патологии. Сжатия, деформации, напряжения и т.п., от уровня органов и тканей до клеток и молекул, в контексте диагностики и терапии. — Еще одно поле для разработки новых материалов, сенсоров и модуляторов. PDF см. в комменте.

📄 На ту же тему: “Mechanomedicine: Present state and future promise” | PNAS (2025)

#therapy | #physics
🔥1
Forwarded from LIFT feed
Ровно в продолжение предыдущего, но уже чистая практика: показано механическое омоложение стареющих стволовых клеток и костной ткани [PDF]. Это может быть актуально и в противодействии старению (скелета), и в остеоинтеграции протезов, например.
“Умеренная механическая стимуляция в культуре клеток и у мышей восстанавливает клеточную силу, увеличивает доступность хроматина в локусе FOXO1, активирует его экспрессию и обращает вспять клеточное старение и старение костной ткани”.


✍️ На нашем канале не раз упоминалась тема механических воздействий: здесь или здесь или здесь или здесь, навскидку.

#therapy | #physics
🤔1
Forwarded from Solid State Humanity
Компания Illumina начала проект Billion Cell Atlas - первую часть программы по созданию атласа из 5 миллиардов человеческих клеток в течение трёх лет. Цель - получить максимально подробную карту того, как гены управляют болезнями на уровне отдельных клеток

В основе атласа лежат эксперименты с CRISPR. Учёные последовательно включают и выключают все ~20 000 человеческих генов и смотрят, как на это реагируют отдельные клетки. В первой фазе будет проанализирован 1 миллиард клеток из более чем 200 клеточных линий, подобранных под конкретные заболевания. Среди них рак, иммунные патологии, кардиометаболические болезни, неврологические расстройства и редкие генетические синдромы - именно те области, где биология до сих пор плохо поддаётся расшифровке.

Ключевая ценность проекта в масштабе. Раньше такие эксперименты проводились на тысячах или миллионах клеток, теперь речь идёт о миллиарде. Это позволяет видеть не усреднённые эффекты, а редкие и сложные клеточные состояния, которые часто и определяют развитие болезни или отклик на лекарство. Эти данные используются для проверки лекарственных мишеней, поиска новых показаний для уже известных препаратов и построения так называемых виртуальных клеток.

Проект создаётся совместно с AstraZeneca, Merck и Eli Lilly. Фармацевтические компании будут использовать атлас для обучения собственных фундаментальных ИИ-моделей, которые работают не на текстах и публикациях, а на реальных биологических данных. Это должно повысить точность предсказаний: какие гены действительно связаны с заболеванием, в каких тканях и при каких условиях, и какие вмешательства с наибольшей вероятностью приведут к терапевтическому эффекту.

С технической точки зрения это один из самых тяжёлых биологических проектов в истории. Illumina ожидает до 20 петабайт данных одноклеточной транскриптомики в год. Для этого используются их платформа Single Cell 3’ RNA, ускоренный пайплайн обработки DRAGEN и облачная аналитическая система Illumina Connected Analytics. Именно сочетание лабораторной автоматизации, вычислительного железа и облаков делает такой масштаб вообще возможным.

Важно, что это не академический атлас "ради науки", а продукт нового бизнес-направления BioInsight. Illumina фактически продаёт фундаментальную биологическую реальность как инфраструктуру для ИИ-фармацевтики. В долгосрочной перспективе такие атласы могут стать базой для точной медицины, где лекарства проектируются не под "среднего пациента", а под конкретные клеточные и генетические сценарии болезни

https://www.illumina.com/company/news-center/press-releases/press-release-details.html?newsid=fda84c92-b4b3-4691-a402-35555abe8605

#генетическое_редактирование #искусственный_интеллект
7
Девиз канала.
👍7😁5🤔2
Довольно интересный способ визуализировать важные процессы в организме разработали японские молекулярные биологи.

Авторы исследования, опубликованного в журнале Nature Communications, превратили живые клетки в источники флуоресценции. Ученые взяли стволовые клетки эпидермиса (кератиноциты) и внедрили в их ДНК ген флуоресцентного белка.

Учёные научились превращать стволовые клетки кожи в живые биосенсоры, вырабатывающие свечение при появлении воспалений или в ответ на другие сигналы. Это позволяет наблюдать за многими процессами в организме без инвазивного вмешательства.

Сейчас для проведения замеров биомаркеров стресса, воспалений или индикаторов развития заболеваний у пациента берут кровь или на время встраивают в его кровоток сенсоры. А долгосрочные наблюдения вне лабораторий невозможны.

Проблема элегантно решена благодаря кератиноцитовым стволовым клеткам, очень чувствительным к внешним стимулам и сигналам. На мышах уже сработало: у них извлекли эти стволовые клетки, модифицировали их геном,м размножили и ввели обратно. В итоге кожа мышей светилась даже при малых концентрациях связанного с воспалением сигнального вещества.

На очереди клинические испытания на людях. А в перспективе подход позволит отслеживать появление очагов хронических воспалений и замерять концентрации других важных для здоровья биомаркеров.

Впрочем, не до конца понятно, не нарушает ли постоянная экспрессия чужеродного флуоресцентного белка нормальные функции клеток? И не будет ли иммунная система атаковать флуоресциирующие стволовые клетки?
3👍2🤔2