#дед_инсайд

Во времена аспирантской юности я весьма неодобрительно относилась к разному околобиологическому научпопу. Имея неплохое образование за спиной, я понимала, что большинство популяризаторов упрощают материал аж до того, что говорят в целом не совсем корректные вещи. И ведь эти люди несут науку в массы! 🤬 Получается, какой-нибудь Вася их наслушается и будет транслировать вот эти ошибочные знания дальше, преподносить их как истину в последней инстанции? Ведь ему об этом рассказали кандидаты и доктора наук, да и в целом известные личности.

При этом меня абсолютно не смущало, что я читаю ровно такой же научпоп по астрофизике. Хотя думаю, что учёным в этой области осточертела история со сложенным листком бумаги, который протыкают карандашом, объясняя как работают кротовые норы. Но я-то понимаю, что данные книги это упрощение и на самом деле за этим листком стоят очень сложные модели, которые я постичь вряд ли смогу. Но хотя бы прикоснуться к этому знанию хотелось.

И вот я нахожусь в моменте, когда сама веду канал, который был охарактеризован кем-то как "простенький научпоп и нытьё про образование". Добро пожаловать 😊 Создавала я его с единственной целью: дать общую информацию о том, как начать свою жизнь в науке, тем, кто только в неё попал. Мне в своё время повезло с преподавателями, которые объяснили как пользоваться разным софтом, как спланировать эксперимент и так далее. Но будучи преподавателем я вижу, скольким студентам/аспирантам повезло гораздо меньше и на методологии науки им рассказывали про Венский кружок и Карла Поппера, но никак не про то, где найти статьи для своего диплома или как сделать презентацию. Философия науки - очень интересная вещь, но только после того, как ты этой наукой хоть сколько-то позанимался.

Для того, чтобы дать максимально общую информацию и не отпугнуть читателя множеством подробностей, я, признаюсь, часто упрощаю материал. И то, иногда мне кажется, что всё равно получается слишком перегружено 🤔 Что-то я пишу, основываясь на своём личном опыте, который вообще может быть нерелевантен для другой области. Поэтому для меня огромную ценность имеют комментарии, в которых читатели могут не соглашаться, рассказывать, как всё устроено у них, приводить ссылки на внешние ресурсы, в том числе и свои собственные. Я ни в коем случае не заявляю, что знаю абсолютно всё и посты из этого канала должны стать пошаговым руководством, от которого нельзя отступать. Хотя и то, что я пишу вымышленные вещи, не подкреплённые разными литературными источниками, тоже утверждать не буду. Тем не менее, я призываю читателей заглядывать в комментарии, кусочек паззла "Истина" может лежать и там.

Так вот, возвращаясь к научпопу, я пересмотрела своё мнение и сейчас считаю, что его первостепенная роль заключается не в том, чтобы дать какие-то истинные знания о предмете. Для этого есть серьёзные учебники (информация в которых может устаревать) и актуальные научные статьи (информация в которых может быть сфальсифицирована или сфабрикована). Для меня научпоп - это способ развлечь людей чем-то более полезным, чем тренды в нельзяграме или тиктоке. И очень здорово, что научпоп может вовлекать юные умы в науку, я лично знаю несколько таких примеров. Но для того, чтобы развлечь и вовлечь, наука сначала должна быть упрощена до листка бумаги, протыкаемого карандашом. А далее материал может усложняться и усложняться.

Проблема, конечно, может скрываться в слушателях такого контента. Бывает, что вышеупомянутый Вася наслушается популяризаторов и теперь считает, что он теперь самый умный и охренительно разбирается в предмете 😌 Но на мой взгляд это проблема Васи и эффекта Даннинга-Крюгера, но никак не тех, кто пытается принести хоть что-то из мира науки. Мракобесы будут строить свои бредовые теории и разносить их, независимо от наличия популяризаторов. Вон сколько журналов РИНЦ публикует их опусы. Поэтому никогда нельзя отключать критическое мышление, даже если речь идёт о самых топовых журналах и самых авторитетных учёных.

Коллеги, а как вы относитесь к научпопу? Смотрите ли, читаете ли? Приводите в комментариях своих любимок

#шпаргалка

Привет, коллега!

Незаметно настала середина января, а это значит, что я подготовила подборку конференций с дедлайном подачи тезисов в феврале. Найти её можно по ссылке.

〰️〰️〰️

А ещё сегодня у меня есть анонс вебинара, который может быть интересен всем, кто занимается доклиническими испытаниями или хочет соблюдать правило 3R в своей работе.

📅 21 января 2025 года в 11:00 пройдет первый ВЕБИНАР:
«Зебрафиш (Danio rerio) в доклинических исследованиях: "дешёвая мышь" или биомодель нового поколения» , который проведет к.б.н., старший научный сотрудник ФГБУ «НМИЦ онкологии им. Н.Н. Петрова» Минздрава России Мизгирев Игорь Викторович.

Ссылка на регистрацию: https://my.mts-link.ru/j/2963331/1853424749

На вебинаре будут рассмотрены следующие вопросы:

⏩Зебрафиш как альтернативная модель и ее место в системе биомедицинских исследований.

⏩Общие принципы содержания рыб в лабораторных условиях.

⏩Использование модели зебрафиш в доклинических исследованиях для изучения токсичности, канцерогенности, поведенческих реакций, иммунного ответа, сердечно-сосудистой патологиии терапии злокачественных опухолей.

⏩Основные преимущества использования рыб в доклинических исследованиях.

📖 Более подробную информацию можно прочитать здесь

ПыСы: наконец-то дошла до исполнения обещания использовать картинки из комментариев к посту.

#лабжурнал

Налево пойдёшь - белок найдёшь, прямо пойдёшь - РНК получишь

Привет, коллега!

Сегодня решила рассказать тебе о нескольких методах, применяемых в молекулярной биологии для обнаружения специфических молекул в образце. Все они объединяются термином блоттинг и делятся на несколько этапов, каждый из которых имеет свою специфику в зависимости от типа блота. Ниже я опишу лишь общую схему, но для тех, кому интересно, приведу ссылку на протокол для каждого из них.

Исторически первым был изобретён метод Southern blot, который позволял находить определённые последовательности ДНК в образцах. Назван он в честь первооткрывателя Эдвина Саузерна. Далее другой группой учёных метод был быстро модифицирован под другую нуклеиновую кислоту - РНК. Они весьма креативно подошли к названию и так у нас появился Northern blot

Помимо определения нуклеиновых кислот, технология была адаптирована и под детекцию белков. Такой метод называется Western blot. Существуют и модификации вышеперечисленных методов, например, Far-Western blot, необходимый для детекции белок-белковых взаимодействий, Southwestern и Northwestern blot, фокусирующиеся на белках, связанных с ДНК и РНК, соответственно 🐿🧬

Возможно ты уже догадался, что последний метод в нашем путешествии во все стороны света - это Eastern blot. Вообще с этим термином самая большая путаница и есть мнение, что его не существует, на я чаще встречаю, что Eastern blot используют для посттрансляционных модификаций белков, а именно навешивание на них фосфатной группы, углеводов или жиров. Кстати, отдельно для детекции только липидов существует Far-eastern blot, названный так самими учёными из Японии.

Теперь, когда мы разобрались с компасом блоттингов, опишу очень общий протокол для этих методов

Первым делом нужно выделить все молекулы нужного типа из образца, иначе будет грязь. К счастью есть протоколы отдельно для выделения только РНК, ДНК, белков и так далее. Затем эти молекулы помещаются в лунки специального геля, а сам этот гель - в электрическое поле. Белки обладают положительным зарядом и двигаются от плюса к минусу, а нуклеиновые кислоты заряжены отрицательно и двигаются от минуса к плюсу. При этом плотность геля не позволят молекулам перемещаться свободно, поэтому скорость движения будет зависеть от размера молекулы и её заряда. Этот процесс называется электрофорезом и если визуализировать молекулы с помощью специальных красителей, то можно увидеть как они разделяются, формируя отдельные полоски (как на картинке). А вот для разделения жиров и малых молекул используют высокоэффективную тонкослойную хроматографию. Там нет электрического поля, но результат выглядит похожим образом.

Только разделением блоттинг не заканчивается. Используя смесь молекул с известными размерами в качестве референса (это называют маркеры), мы, конечно, сможем посчитать параметры всех выявленных полос, но мы не можем быть уверены, что, например, вот эта полоска с массой 65 кДа - это альбумин, а вот эта полоска в 2 тысячи пар нуклеотидов - нужный нам фрагмент ДНК. Поэтому нужно что-то, что будет более специфично реагировать только с нашей молекулой.

Такие штуки есть, но они не будут взаимодействовать с целью, пока она находятся в геле, так что наши молекулы необходимо перенести оттуда на специальную мембрану, где реакция состоится. Делается это также с помощью электрического поля в специальных камерах. После этого уже может осуществляться детекция. Для белков используют антитела, совсем как в иммуногистохимии, а для нуклеиновых кислот - специальный зонд, комплементарный искомой последовательности и несущий флуоресцентную или изотопную метку. И вот если наша молекула-детектор связалась с полоской в нужном месте - мы можем быть уверены, что в образце присутствует искомая молекула. Ура! 🥳

Кажущаяся простота метода скрывает за собой множество нюансов. На каждом этапе что-то может пойти не так и моё большое уважение тем, кто ставит такие протоколы с нуля или на новых китайских реактивах 🎩

А вообще, коллеги, как вам эта рубрика? Ставьте реакты, для меня она пока наименее понятна с точки зрения востребованности.

#методичка

Привет, коллега!

Многие учёные мало задумываются о юридических аспектах своей работы, кто-то небось даже не читал свой трудовой договор. Я, конечно, не юрист и не знаю многих нюансов, но попробую в общих чертах рассказывать и про какие-то интересные нормативные правовые акты, чтобы немного предупредить и вооружить. И начну я с авторского права.

Авторское право - это совокупность норм, регулирующих права на творческие произведения и защищающее авторов от незаконного использования их трудов. В России они прописаны в главе 70 части 4 ГК РФ

Защите подлежат произведения науки, литературы и искусства, например статьи, книги, сценарии, музыка, фильмы, видео, картины, комиксы (да, да и мемы тоже), графика, фотографии, хореографические постановки, географические карты, программное обеспечение и тд. То есть любое материальное выражение интеллектуального труда.

Но обрати внимание на то, что законом НЕ защищаются:
🔘Идеи и концепции - если тебе пришла в голову идея исследования на нобелевскую премию - держи её при себе, кто-то может услышать и воплотить её раньше.
🔘Законы и официальные документы
🔘Факты и новости, но только их суть, а не дословный текст откуда-то
🔘Народное творчество – пословицы, легенды, мифы. Иногда мемы относят и в эту категорию, тут уж как в суде решат.

В целом, для фиксации авторского права ничего делать не нужно, оно возникает как только произведение создано. Однако, для пущей уверенности можно: официально зарегистрировать произведение (например, в Роспатенте), зафиксировать авторство через нотариуса или отправить себе копию письмом с датой.

Для публикации в большинстве научных журналов требуется подписание лицензионного договора, который подразумевает переход части прав к издателю. Без этого договора издательство не имеет права публиковать, использовать и распространять статью (это называется исключительное право). При этом авторство всегда остаётся за создателями, а вот возможность где-то размещать свою же статью зависит от договора. Для Open Access чаще всего используется лицензия Creative Commons, по которой все могут свободно распространять статью и использовать при соблюдении определённых условий. Но некоторые издательства прямо запрещают авторам размещать в открытом доступе полный текст статьи. Я с таким пунктом сталкивалась в русскоязычных журналах и для этой статьи в зарубежном. Поэтому внимательно ознакомься с договором, прежде чем выкладывать свою статью где-то в интернете.

Кстати, отдельно хочется отметить, что переработанное произведение также является объектом авторского права. То есть, если ты перевёл чью-то статью без разрешения - ты не имеешь права публиковать и распространять её. Если разрешение правообладателя было получено, то исключительное право всё равно остаётся у него, а ты будешь указан как автор перевода. Выход один - изменить произведение до неузнаваемости или сделать пародию.

Что ещё интересного стоит знать. Если ты работаешь в вузе и написал учебник или методичку, то исключительные права на него могут принадлежать вовсе не тебе, а работодателю. Это возможно если:
✅произведение создано в рамках выполнения трудовых обязанностей, прописанных в трудовом договоре
✅в договоре есть пункт, о том, что права принадлежат работодателю.

За сотрудником всегда остаётся право называться автором и работодатель не может поставить на обложку методички другого человека. При этом есть лазейка: если работодатель не использует служебное произведение в течение трёх лет, автор может потребовать исключительное право себе. Но и для работодателя есть своя: если написание методичек не стоит у тебя в обязанностях, а ты сделал её и для этого использовал служебный компьютер и фотки ваших приборов - работодатель не имеет права на произведение, но может потребовать компенсацию. Так что поаккуратнее 😅

〰️〰️
В общем, тема авторского права весьма интересная и мне кажется тут можно подорваться на каждом шагу. Этот канал небось на приличную сумму насобирал, хотя его спасают некоммерческие цели. Лучше всего, конечно, всегда спрашивать разрешения автора на публикацию или хотя бы указывать источник.