#методичка

Моё исследование - это не жалкая пародия, а неповторимый оригинал!

Привет, коллега!

Один из подписчиков намекнул, что я пишу тут про воспроизводимость и упоминаю повторности, но совершенно не рассказала, что повторность повторности рознь. Штош, исправляю это упущение. Сами нижеперечисленные термины известны в контексте молекулярной биологии и применяются в анализе экспрессии генов, но они прекрасно ложатся практически на любую экспериментальную область.

🟣 Технические повторности/реплики - это когда измеряется один и тот же объект несколько раз. Например, для полимеразной цепной реакции ДНК с одного образца всегда раскапывается в три лунки и в каждой происходит реакция. Если в какой-то из лунок дрогнула рука и, например, ДНК осталась в носике пипетки, то это будет видно по выбивающимся результатам. В идеале, конечно, все три повторности более менее совпадают. Точно также я, например, измеряла длину ноги крысы штангенциркулем три раза, чтобы определить погрешность такого измерения. В целом, для любого метода это применимо и я настоятельно рекомендую не пренебрегать техническими проворностями. Иногда разброс данных из-за ошибки измерения оказывается большим, чем наблюдаемый эффект 🙁

🟣 Биологические повторности/реплики - это измерение на разных объектах исследования. Например, образцы ДНК от разных пациентов или разные крысы, у которых я измеряла ноги 🤔И это будет та самая выборка, которую мы потом будем анализировать на статистике. Я знаю, что некоторые исследователи подменяют технические и биологические повторности, искусственно увеличивая выборку, но это не очень корректно, поскольку разброс в технических репликах в идеале должен быть минимальным, а в биологических - как придётся и данные получаются неоднородными.

🟣Независимые эксперименты - это когда один и тот же эксперимент повторяется несколько раз (в идеале ещё и в другой лаборатории и другими исследователями, но будем реалистами, такое не всегда возможно). Если в каждом независимом эксперименте получается один и тот же результат, то скорее всего эти данные воспроизводимы. У меня несколько раз было так, что я ставила пилотный эксперимент на маленькой выборке, получала данные ну практические статью в Nature, а потом повторяла тоже самое на выборке побольше - и всё, дай б-г в вестник какого-нибудь университета подать 😭 И это даже с учётом того, что повторение эксперимента не такое уж и независимое. А вот для этой статьи так сложилось, что одни и те же эксперименты делали три разных человека в разных условиях (даже в разных странах и на разных реактивах), так что за результаты я ручаюсь.

〰️〰️
В идеальном мире для уверенности в воспроизводимости данных и в том, что ты не публикуешь какую-то лажу, нужно делать все три вида повторности. В реальном это не всегда возможно, но к этому нужно стремиться. Как мне говорили на ирландских танцах: если ты будешь стараться прыгнуть до потолка, то поднимешься на полметра, а если поставишь планку в полметра, то еле оторвёшься от земли ☝🏻🐺

Привет, коллега!

Сегодня пятница, а это значит, что настало время ✨ традиционного пятничного интерактива ✨ И сегодня пробую новый формат викторины. Впереди ждёт 5 вопросов из разных наук, ответы на которые не так очевидны, как кажутся на первый взгляд. Но уверена, читателей этого канала не так легко одурачить 😁

Я так и не придумала хештег для этой рубрики, так что можно покреативить в комментариях

#сдохни_или_умри

Одного мудреца спросили:
- Как вам удается все время оставаться таким спокойным, умиротворенным и счастливым?
- Все просто, - ответил мудрец, - я никогда ни с кем не спорю
- Но это же невозможно!
- Ну невозможно, так невозможно

Привет, коллега!

Сегодня хочу немного рассказать про способы разрешения конфликтов. Многие делают это интуитивно и счастливо живут, но возможно кому-то поможет более формализованная инструкция. К сожалению, конфликтов избежать нельзя, если только ты не ведёшь затворническую жизнь без взаимодействия с другими людьми. Итак, что же делать, если конфликт возник?

🔹Для начала определить для себя важность предмета конфликта. Очень часто люди начинают конфликтовать из-за каких-то мелочей, которые на самом деле не имеют значения. За этим часто стоят более глубокие проблемы, но оставим эти рассуждения психологам. Я видела как человек поругался с кучей людей из-за порядка работы на приборе, которым сам и не планировал пользоваться. Спрашивается, зачем? Так вот, если предмет конфликта не важен, то можно просто избежать конфликта, не участвуя в нём (как стоило бы сделать коллеге из моего примера) или же пойти на уступку. Лично я согласна не со всеми правилами работы на приборах, но быстрее сделать требуемое, чем ругаться🕊

🔹Если предмет конфликта всё таки важен, то тут важно остановиться и подумать над стратегией разрешения. Иногда люди на эмоциях просто орут друг на друга и тогда никакой стратегии выявить не получится. У нас, например, отдельные начальники любят сначала вылить ушат дерьма на сотрудника и объявить тупым и некомпетентным и, если он выстоял, приступить в разрешению проблемы👍 Так что тактика на первый эмоциональный период - это избегание.

🔹Далее наконец-то может начаться эффективная коммуникация, в которой вы определите цели и потребности друг друга. Иногда, конечно, может и не начаться и тогда будет самый негативный сценарий из всех - это соперничество🖕 В данном случае обе стороны не получат никакой пользы, но вреда будет предостаточно, так что по возможности лучше не доводить до этого исхода и всё-таки нормально поговорить. В эффективной коммуникации очень важно донести до оппонента свою цель и иногда может оказаться, что в одном конфликте ваши цели на самом деле не взаимоисключающие. Например, ты не хочешь вставать в 7 утра и в час пик ехать на работу, а твой начальник хочет, чтобы у тебя был восьмичасовой рабочий день. Одно другому не противоречит и твой рабочий день может начинаться в 10-11 и просто позже заканчиваться. И это сотрудничество - самый эффективный способ разрешения конфликтов🦞

🔹Но часто бывает и так, что ваши цели исключают друг друга, например, ты с коллегой регулярно пользуешься одним прибором. Тогда в качестве компромисса вы составляете расписание с определёнными условиями записи и подстраиваете свои эксперименты под это расписание. Компромисс не считается самым лучшим способом разрешения конфликтов, сотрудничество куда более выгодно обеим сторонам, но зачастую худой мир лучше доброй ссоры.

➖➖
🔗К посту прикрепляю алгоритм выбора стратегии поведения при конфликте, надеюсь, что кому-то он поможет конструктивно решать возникающие споры.

#лабжурнал

Проверим материал на абьюзивность токсичность

Привет, коллега!

При разработке новых препаратов для лечения человека, будь то лекарственные препараты или медицинские изделия, часто встаёт вопрос токсического воздействия на организм. Раньше всё тестировали на животных (а ещё раньше сразу на людях 😈), но с развитием принципов биоэтики и методов культивирования клеток эукариот, способность препаратов влиять на метаболизм или вообще убивать оценивается на клетках. И сегодня кратко перечислю самые популярные методы оценки. Кто хочет подробнее посмотреть протоколы, то они доступны здесь, здесь и здесь. Пойдём по очерёдности исходов: клетке стало плохо и она замедлила метаболизм (тесты на жизнеспособность), клетка встала на путь запрограммированной гибели (апоптоза) и клетка так или иначе умерла.

Получилось много, но я помню, что читатели не боятся длинных текстов, так что продолжение читай в телеграфе.

TW: рисунок содержит сцену насилия

#дед_инсайд

Мы с коллегами преподавателями достаточно много дискутируем на тему всех образовательных фишек и иногда я пишу про них и тут в рамках рубрики #педсовет. Но знаете, со многими из них я сталкивалась в своём обучении, просто тогда не было трансформации университетов и они не назывались какими-то модными словами. Собственно сегодняшний пост - это такой ретроспективный анализ моего собственного образовательного опыта с позиции разработчика программ.

❤️ Начнём с того, что я заканчивала биологический факультет МГУ и у меня был прекрасный пятилетний специалитет, ещё до введения всех этих бакалавров и магистров. Я кстати настаиваю, что 5 лет обучения биологии достаточно, но нынешние образовательные стандарты почему-то против. В конце первого курса нас распределяли по трём отделениям (условно мокрая лаба, полевики и сухая биология), в середине второго курса мы выбирали кафедру, где на третьем делали теоретическую курсовую, на четвёртом экспериментальную и на пятом собственно диплом. Естественно, программа для каждого отделения и каждой кафедры отличалась и сейчас такой формат называют групповыми образовательными траекториями.

✨ В самом начале нам давали знания по огромному количеству предметов, углубление в специальность пошло где-то после 3 курса. Большая часть этих знаний благополучно забылась, но какой-то их след остался. Так что по крайней мере я теперь могу понимать мемы из разных областей наук. Ещё могу общаться с очень разными специалистами, но конечно же главное мемы. Это конечно не новое для МГУ, но вот она: широкая фундаментальная подготовка.

🦯 Во время обучения на биофаке практика занимала огромное количество времени, для меня больше половины, поскольку лекции я почти всегда прогуливала. Мы делали всё: хроматографию, ПЦР, нервно-мышечные препараты, нас учили паять, копать нереисов и даже свежевать тушу кролика. Я приобрела просто огромное количество навыков, а правильно оформленные лабжурналы позволяют вспомнить самое главное много лет спустя. Нынче это зовётся практико-ориентированное обучение.

🏃‍♂️ Ещё пока мы учились, в МГУ ввели классную штуку - межфакультетские учебные курсы. Тогда они зашли не всем, возможно сейчас тоже не пользуются большой популярностью, но на мой взгляд это отличная возможность узнать то, что интересно лично тебе. Некоторые мои однокурсники ходили на занятия по литературе, экономике или даже брали новые иностранные языки, то есть то, что не могли получить в основной программе по биологии. Лично я ходила на язык R, астрофизику и методологию науки. И это между прочим индивидуализация образования.

⌨️ Ну и конечно же диплом. Факультет и наша кафедра устанавливала достаточно высокие требования к уровню дипломных, так что все так или иначе освоили и прочувствовали на своей шкуре полный цикл выполнения научных работ. Некоторые выбирали элективы под диплом, ходили на кафедры вольными слушателями или доучивались самостоятельно. Многие уже догадались, что это то самое проектно-ориентированное обучение.


Может сложиться впечатление, что я считаю образование на биофаке образца 10-15летней давности супер крутым и прогрессивным, но это не так. Очень много преподаваемой информации устарело ещё тогда (зачастую вместе с преподавателями), не хватало современных методов и работы на современном оборудовании. Также не было сбора обратной связи и какой-то работы над улучшением курсов, а если что-то и проскакивало - то это была полностью инициатива преподавателей, за что им огромное спасибо. Но в общем и целом, я считаю программу скорее хорошей, чем плохой и то, как были сделаны многие вещи, я таки забрала в копилочку, чтобы реализовать в собственных проектах ✨