ПРОСТЕЙШИЙ ИНДЕКС ОТКРЫТОЙ ПОЧВЫ
В видимой области спектра отражательная способность почвы выше, чем у растительности. Напротив, в NIR отражательная способность выше у растительности. На этом различии основан новый индекс, предназначенный для разделения этих классов поверхности. Индекс назван NDVISI (Normalized Difference VISible Index) и записывается как
NDVISI = (VIS − NIR)/(VIS + NIR),
где VIS = (Blue + Green + Red), а Blue, Green, Red и NIR – каналы Landsat или Sentinel-2.
Открытая почва имеет отрицательные или очень небольшие положительные значения NDVISI. Классы Urban и Water также имеют более низкие значения NDVISI, чем растительность, но их можно замаскировать при помощью других индексов (MNDWI – для воды, границы городов из OpenStreetMap – для Urban).
Ershov et al. (2022). Natural Afforestation on Abandoned Agricultural Lands during Post-Soviet Period: A Comparative Landsat Data Analysis of Bordering Regions in Russia and Belarus. Remote Sensing, 14(2), 322. https://doi.org/10.3390/rs14020322
#индексы
В видимой области спектра отражательная способность почвы выше, чем у растительности. Напротив, в NIR отражательная способность выше у растительности. На этом различии основан новый индекс, предназначенный для разделения этих классов поверхности. Индекс назван NDVISI (Normalized Difference VISible Index) и записывается как
NDVISI = (VIS − NIR)/(VIS + NIR),
где VIS = (Blue + Green + Red), а Blue, Green, Red и NIR – каналы Landsat или Sentinel-2.
Открытая почва имеет отрицательные или очень небольшие положительные значения NDVISI. Классы Urban и Water также имеют более низкие значения NDVISI, чем растительность, но их можно замаскировать при помощью других индексов (MNDWI – для воды, границы городов из OpenStreetMap – для Urban).
Ershov et al. (2022). Natural Afforestation on Abandoned Agricultural Lands during Post-Soviet Period: A Comparative Landsat Data Analysis of Bordering Regions in Russia and Belarus. Remote Sensing, 14(2), 322. https://doi.org/10.3390/rs14020322
#индексы
Дистанционное зондирование Земли (ДЗЗ)
Термины и сокращения, #термины
Организации: NASA, NOAA, DARPA и другие
Спектральные каналы Landsat 8/9 и Sentinel-2, MODIS
Спектральные сигнатуры
📚Основы дистанционного зондирования Земли, #основы
#индексы (спектральные, вегетационные, ...)
#комбинация каналов
#история ДЗЗ
Научно-популярные лекции по ДЗЗ
Лекции школы молодых учёных (ИКИ РАН): 2015-2017, 2018-2019, 2020-2021, 2022-2023
Рекомендованные практики мониторинга ЧС (UN-SPIDER)
Космическое образование в России: раз, два.
Поиск / Справочная информация
Общий каталог искусственных космических объектов (GCAT)
Спутники и съемочная аппаратура
Российские спутники ДЗЗ, #МВК
Информация о запусках
Орбиты спутников
#наблюдение за спутниками
Где взять научную литературу #книга
ИИ-поиск, патентный поиск, поиск наборов данных
#справка
Google Earth Engine
📚Учебник по Google Earth Engine
Проекты и примеры кода
Учебные ресурсы
Полезные ссылки
#GEE
📚🖥 Работа с пространственными данными в R
Спутниковые и другие данные — #данные
Бесплатные спутниковые снимки, в т.ч. высокого разрешения
🛰 Sentinel-1, Радары на GEE
🛰 Sentinel-2
🛰 Landsat Collection 2, снимки Landsat
🛰 CBERS
#LULC — Land Use & Land Cover
#DEM
#границы
#nrt — Земля из космоса в реальном времени
Международная хартия по космосу и крупным катастрофам: список активаций
Погода: фактическая, реанализ, прогнозы
#ЧС
Тематические задачи
#лес, #AGB (надземная биомасса)
#пожары
#вода — водные объекты, наводнения, качество воды
#лед
#погода, #климат
#атмосфера
#археология
#сельхоз
#LST — температура земной поверхности
Типы данных
#гиперспектр
#SAR #InSAR
#лидар
#LST
#GNSSR
#ro
#SIF
Конференции, школы, семинары
#конференции
Конкурсы и чемпионаты
#конкурс
Новости военного ДЗЗ
#война #sigint #SSA
⭐️Все хештеги
Термины и сокращения, #термины
Организации: NASA, NOAA, DARPA и другие
Спектральные каналы Landsat 8/9 и Sentinel-2, MODIS
Спектральные сигнатуры
📚Основы дистанционного зондирования Земли, #основы
#индексы (спектральные, вегетационные, ...)
#комбинация каналов
#история ДЗЗ
Научно-популярные лекции по ДЗЗ
Лекции школы молодых учёных (ИКИ РАН): 2015-2017, 2018-2019, 2020-2021, 2022-2023
Рекомендованные практики мониторинга ЧС (UN-SPIDER)
Космическое образование в России: раз, два.
Поиск / Справочная информация
Общий каталог искусственных космических объектов (GCAT)
Спутники и съемочная аппаратура
Российские спутники ДЗЗ, #МВК
Информация о запусках
Орбиты спутников
#наблюдение за спутниками
Где взять научную литературу #книга
ИИ-поиск, патентный поиск, поиск наборов данных
#справка
Google Earth Engine
📚Учебник по Google Earth Engine
Проекты и примеры кода
Учебные ресурсы
Полезные ссылки
#GEE
📚🖥 Работа с пространственными данными в R
Спутниковые и другие данные — #данные
Бесплатные спутниковые снимки, в т.ч. высокого разрешения
🛰 Sentinel-1, Радары на GEE
🛰 Sentinel-2
🛰 Landsat Collection 2, снимки Landsat
🛰 CBERS
#LULC — Land Use & Land Cover
#DEM
#границы
#nrt — Земля из космоса в реальном времени
Международная хартия по космосу и крупным катастрофам: список активаций
Погода: фактическая, реанализ, прогнозы
#ЧС
Тематические задачи
#лес, #AGB (надземная биомасса)
#пожары
#вода — водные объекты, наводнения, качество воды
#лед
#погода, #климат
#атмосфера
#археология
#сельхоз
#LST — температура земной поверхности
Типы данных
#гиперспектр
#SAR #InSAR
#лидар
#LST
#GNSSR
#ro
#SIF
Конференции, школы, семинары
#конференции
Конкурсы и чемпионаты
#конкурс
Новости военного ДЗЗ
#война #sigint #SSA
⭐️Все хештеги
ИНДЕКС ПОЖАРНОЙ ОПАСНОСТИ FWI
Индекс пожароопасной погоды Fire Weather Index (FWI) основан на погодных переменных и учитывает влияние влажности топлива и скорости ветра на возникновение и распространение лесного пожара. Чем выше FWI, тем более благоприятны метеорологические условия для возникновения пожара.
Всего в мире существует около полутора десятков погодных индексов пожарной опасности (в России принят индекс Нестерова). FWI разработан в Канаде и получил широкое распространение во всем мире. Так, его используют европейские системы информации о лесных пожарах EFFIS и GWIS .
Для оперативного мониторинга пожарной опасности можно применить:
* GEOS-5 (температура, влажность, скорость ветра) + GPM IMERG Late (осадки)
* GEOS-5 (температура, влажность, скорость ветра, осадки)
Первый продукт имеет самое высокое пространственное разрешение среди ему подобных (0.1°) и подходит для оценки текущей ситуации. Во втором продукте реализован прогноз FWI на 7 суток (при разрешении 0.25°). Продукты поставляются в файлах netCDF, FWI является одним из датасетов.
#данные #пожары #индексы
Индекс пожароопасной погоды Fire Weather Index (FWI) основан на погодных переменных и учитывает влияние влажности топлива и скорости ветра на возникновение и распространение лесного пожара. Чем выше FWI, тем более благоприятны метеорологические условия для возникновения пожара.
Всего в мире существует около полутора десятков погодных индексов пожарной опасности (в России принят индекс Нестерова). FWI разработан в Канаде и получил широкое распространение во всем мире. Так, его используют европейские системы информации о лесных пожарах EFFIS и GWIS .
Для оперативного мониторинга пожарной опасности можно применить:
* GEOS-5 (температура, влажность, скорость ветра) + GPM IMERG Late (осадки)
* GEOS-5 (температура, влажность, скорость ветра, осадки)
Первый продукт имеет самое высокое пространственное разрешение среди ему подобных (0.1°) и подходит для оценки текущей ситуации. Во втором продукте реализован прогноз FWI на 7 суток (при разрешении 0.25°). Продукты поставляются в файлах netCDF, FWI является одним из датасетов.
#данные #пожары #индексы
Вегетационные индексы
Вегетационный индекс — это число, рассчитываемое в результате операций со спектральными каналами снимка, которое характеризует интересующий исследователя параметр растительности.
Расчет многих вегетационных индексов базируется на двух наиболее стабильных участках кривой спектральной отражательной способности растений: на красную область спектра (0.62–0.75 мкм) приходится максимум поглощения солнечной радиации хлорофиллом, а на ближнюю инфракрасную область (0.75–1.3 мкм) — максимальное отражение энергии клеточной структурой листа. Таким образом, высокая фотосинтетическая активность, связанная, как правило, с большой фитомассой растительности, ведет к более низким значениям коэффициентов отражения в красной области и большим высоким — в ближней инфракрасной.
Оценить фотосинтетическую активность мы можем, сравнивая отражение в красном (Red) и в ближнем инфракрасном (NIR) каналах. Например, можно построить простое отношение каналов
SR = Red/NIR,
то есть значение каждого пикселя канала Red делится на значение соответствующего пикселя канала NIR. При больших объемах фотосинтезирующей биомассы SR будет иметь низкие значения, а при малых — высокие.
Вегетационный индекс создается так, чтобы он был связан с выбранным биофизическим параметром растительности (например, биомассой) и обеспечивал максимальную чувствительность к изменениям этого параметра. Например, можно оценивать объем фотосинтезирующей (то есть зеленой) биомассы, сравнивая отражение в красном и в зеленом каналах. Однако разница между коэффициентами отражения в этих каналах гораздо меньше, чем между красным и инфракрасным каналами, а значит чувствительность такого индекса будет ниже. Связь между индексом и биофизическим параметром в идеале должна быть линейной.
Вместо отношения каналов, для оценки фотосинтетической активности можно использовать разность: NIR - Red. Она будет тем больше, чем выше фотосинтетическая активность. Однако значения такого индекса от участка к участку будут сильно отличаться. Удобно, поэтому нормализовать эти значения, то есть разделить разность на сумму NIR + Red:
NDVI = (NIR - Red) / (NIR + Red).
Значения NDVI всегда находятся в диапазоне [-1; 1], что очень удобно для сравнения разных участков. Оказалось, что использование нормализованной разности между минимумом и максимумом отражений позволяет также уменьшить влияние различий в освещенности снимка, облачности, дымки, поглощение радиации атмосферой и пр.
NDVI расшифровывается как Normalized Difference Vegetation Index — нормализованный разностный вегетационный индекс. На сегодня, это самый популярный вегетационный индекс.
За десятилетия наблюдений создано множество индексов, для оценки различных параметров растительности. Поэтому, если нужно оценить что-либо, проще не выдумывать индекс самому, а поискать среди готовых. Вот два каталога индексов:
* Index DataBase: A database for remote sensing indices
* Alphabetical List of Spectral Indices
В первом содержатся все-все-все индексы, во втором — только самые популярные.
Примеры применения NDVI: https://www.geol.vsu.ru/ecology/ForStudents/4Graduate/RemoteSensing/Lection06.pdf
Индексы применяются не только для оценки параметров растительности, но и при анализе других явлений. В этом случае они называются не вегетационными, а спектральными.
#основы #индексы
Вегетационный индекс — это число, рассчитываемое в результате операций со спектральными каналами снимка, которое характеризует интересующий исследователя параметр растительности.
Расчет многих вегетационных индексов базируется на двух наиболее стабильных участках кривой спектральной отражательной способности растений: на красную область спектра (0.62–0.75 мкм) приходится максимум поглощения солнечной радиации хлорофиллом, а на ближнюю инфракрасную область (0.75–1.3 мкм) — максимальное отражение энергии клеточной структурой листа. Таким образом, высокая фотосинтетическая активность, связанная, как правило, с большой фитомассой растительности, ведет к более низким значениям коэффициентов отражения в красной области и большим высоким — в ближней инфракрасной.
Оценить фотосинтетическую активность мы можем, сравнивая отражение в красном (Red) и в ближнем инфракрасном (NIR) каналах. Например, можно построить простое отношение каналов
SR = Red/NIR,
то есть значение каждого пикселя канала Red делится на значение соответствующего пикселя канала NIR. При больших объемах фотосинтезирующей биомассы SR будет иметь низкие значения, а при малых — высокие.
Вегетационный индекс создается так, чтобы он был связан с выбранным биофизическим параметром растительности (например, биомассой) и обеспечивал максимальную чувствительность к изменениям этого параметра. Например, можно оценивать объем фотосинтезирующей (то есть зеленой) биомассы, сравнивая отражение в красном и в зеленом каналах. Однако разница между коэффициентами отражения в этих каналах гораздо меньше, чем между красным и инфракрасным каналами, а значит чувствительность такого индекса будет ниже. Связь между индексом и биофизическим параметром в идеале должна быть линейной.
Вместо отношения каналов, для оценки фотосинтетической активности можно использовать разность: NIR - Red. Она будет тем больше, чем выше фотосинтетическая активность. Однако значения такого индекса от участка к участку будут сильно отличаться. Удобно, поэтому нормализовать эти значения, то есть разделить разность на сумму NIR + Red:
NDVI = (NIR - Red) / (NIR + Red).
Значения NDVI всегда находятся в диапазоне [-1; 1], что очень удобно для сравнения разных участков. Оказалось, что использование нормализованной разности между минимумом и максимумом отражений позволяет также уменьшить влияние различий в освещенности снимка, облачности, дымки, поглощение радиации атмосферой и пр.
NDVI расшифровывается как Normalized Difference Vegetation Index — нормализованный разностный вегетационный индекс. На сегодня, это самый популярный вегетационный индекс.
За десятилетия наблюдений создано множество индексов, для оценки различных параметров растительности. Поэтому, если нужно оценить что-либо, проще не выдумывать индекс самому, а поискать среди готовых. Вот два каталога индексов:
* Index DataBase: A database for remote sensing indices
* Alphabetical List of Spectral Indices
В первом содержатся все-все-все индексы, во втором — только самые популярные.
Примеры применения NDVI: https://www.geol.vsu.ru/ecology/ForStudents/4Graduate/RemoteSensing/Lection06.pdf
Индексы применяются не только для оценки параметров растительности, но и при анализе других явлений. В этом случае они называются не вегетационными, а спектральными.
#основы #индексы
GEE-9. Индексы. Арифметика каналов
Код примера
“Работа, работа — иди в штат Дакота. Оттуда — в Небраску, с Небраски — на Аляску“. Если что, мы находимся в Небраске. Загрузим два снимка этого штата:
А теперь рассчитаем один из “водных” индексов — Normalized Difference Water Index (NDWI). Вычисляют его по формуле:
NDWI = (Green - NIR) / (Green + NIR).
По сути, это перевернутый NDVI. Вода в нем имеет высокие значения, а растительность — низкие (отрицательные). Вычислить его можно аналогично NDVI:
Добавим индексы к одному из снимков:
А теперь рассчитаем индекс EVI. Он использует сразу три канала, так что
Можно выполнять математические операции над разными снимками. Например, вычислим разность значений каналов B8 (NIR):
Код примера
#GEE #индексы
Код примера
“Работа, работа — иди в штат Дакота. Оттуда — в Небраску, с Небраски — на Аляску“. Если что, мы находимся в Небраске. Загрузим два снимка этого штата:
var image = ee.Image("COPERNICUS/S2_SR/20220711T171859_20220711T172712_T14TNL");Вычислим нормализованный разностный вегетационный индекс NDVI*ссылка*. Для этого есть специальная функция
var image2 = ee.Image("COPERNICUS/S2_SR/20220721T171859_20220721T172912_T14TNL");
normalizedDifference()
var ndvi = image.normalizedDifference(['B8', 'B4']);Чем выше NDVI, тем больше в пикселе здоровой (фотосинтезирующей) растительности. Водные объекты имеют отрицательный NDVI.
А теперь рассчитаем один из “водных” индексов — Normalized Difference Water Index (NDWI). Вычисляют его по формуле:
NDWI = (Green - NIR) / (Green + NIR).
По сути, это перевернутый NDVI. Вода в нем имеет высокие значения, а растительность — низкие (отрицательные). Вычислить его можно аналогично NDVI:
var ndwi = image.normalizedDifference(['B3', 'B8']);Но мы не ищем легких путей, а рассчитаем NDWI так, будто не знаем о существовании
normalizedDifference()
: var ndwi = (image.select('B3').subtract(image.select('B8'))Математические операции с каналами задаются функциями:
.divide(image.select('B3').add(image.select('B8'))));
add
(+
), subtract
(-
), divide
(/
). Нетрудно догадаться, что есть еще multiply
(*
). Полный список операций здесь.Добавим индексы к одному из снимков:
function addInd(image) {Обратите внимание на переименование каналов с помощью
var ndvi = image.normalizedDifference(['B8', 'B4']).rename('NDVI');
var ndwi = image.normalizedDifference(['B8', 'B4']).rename('NDWI');
return image.addBands([ndvi, ndwi], null, true);
}
image = addInd(image);
rename()
. Без этого, каналы будут иметь ничего не говорящие имена nd
, nd_1
, …А теперь рассчитаем индекс EVI. Он использует сразу три канала, так что
normalizedDifference()
не поможет. Запись через add/subtract и т. п. будет слишком длинной. К счастью, в Earth Engine можно записать операции над каналами в виде математических выраженийvar evi = image.expression(То есть, сначала записали выражение, а потом описали обозначения входящих в него каналов.
'2.5 * ((NIR - RED) / (NIR + 6 * RED - 7.5 * BLUE + 1))', {
'NIR': image.select('B5'),
'RED': image.select('B4'),
'BLUE': image.select('B2')
});
Можно выполнять математические операции над разными снимками. Например, вычислим разность значений каналов B8 (NIR):
var difB8 = (image2.select('B8')).subtract(image.select('B8'));Создадим новый снимок из подготовленных нами индексов.
var newBands = [ndvi, ndwi, evi, difB8];Теперь у нас будет снимок, состоящий из каналов NDVI, NDWI, EVI и DIF.
var image3 = ee.Image(newBands).rename(['NDVI','NDWI','EVI','DIF']);
Код примера
#GEE #индексы
GEE-10. Библиотека Awesome Spectral Indices
Код примера
В прошлый раз мы вычисляли вегетационные индексы. Есть способ сделать это еще проще — с помощью библиотеки Awesome Spectral Indices (документация).
Создадим коллекцию снимков Sentinel-2 L2A, покрывающих интересующий район (ROI — region of interest):
Зададим параметры для расчета индексов. Мы хотим рассчитать NDVI, NDWI и EVI. Для этого понадобится несколько каналов и числовых констант.
Список спектральных индексов можно посмотреть здесь. В списке приведена формула, каждой букве которой мы сопоставим канал или число.
2.5 * ((NIR - RED) / (NIR + 6 * RED - 7.5 * BLUE + 1))
А вот как она выглядит в списке:
g * ((N - R) / (N + C1 * R - C2 * B + L))
Думаю, принцип понятен. Зеленый канал нужен нам для расчета NDWI.
#GEE #индексы
Код примера
В прошлый раз мы вычисляли вегетационные индексы. Есть способ сделать это еще проще — с помощью библиотеки Awesome Spectral Indices (документация).
Создадим коллекцию снимков Sentinel-2 L2A, покрывающих интересующий район (ROI — region of interest):
var col = ee.ImageCollection('COPERNICUS/S2_SR')Вычислим медиану коллекции и обрежем ее по границам ROI. Медиана коллекции — снимок, каналы которого являются медианами соответствующих каналов коллекции (вычисления в каждом канале происходят попиксельно). В итоге получим некий типичный летний снимок Небраски.
.filterDate('2021-06-01', '2021-09-01')
.filter(ee.Filter.lt('CLOUDY_PIXEL_PERCENTAGE',10))
.filter(ee.Filter.bounds(ROI))
.select('B.*');
var image = col.median().clip(ROI);Загружаем библиотеку Awesome Spectral Indices. Путь к ней указан в параметре функции
require
.var spectral = require("users/dmlmont/spectral:spectral");Awesome Spectral Indices — сторонняя библиотека. Она создана не разработчиками Earth Engine, а пользователем с ником
dmlmont
. Вы можете создать свою библиотеку и загрузить ее на GEE, но об этом поговорим позже. Сейчас же масштабируем значения пикселей.var image = spectral.scale(image, "COPERNICUS/S2_SR");Помните, у нас была функция
applyScaleFactors
для масштабирования значений пикселей? scale
из библиотеки spectral
делает то же самое.Зададим параметры для расчета индексов. Мы хотим рассчитать NDVI, NDWI и EVI. Для этого понадобится несколько каналов и числовых констант.
Список спектральных индексов можно посмотреть здесь. В списке приведена формула, каждой букве которой мы сопоставим канал или число.
var parameters = {Вот формула для расчета EVI:
"N": image.select("B8"),
"R": image.select("B4"),
"G": image.select("B3"),
"B": image.select("B2"),
"L": 1,
"g": 2.5,
"C1": 6,
"C2": 7.5
};
2.5 * ((NIR - RED) / (NIR + 6 * RED - 7.5 * BLUE + 1))
А вот как она выглядит в списке:
g * ((N - R) / (N + C1 * R - C2 * B + L))
Думаю, принцип понятен. Зеленый канал нужен нам для расчета NDWI.
spectral.computeIndex
вычисляет индексы по списку и добавляет к снимку.var image = spectral.computeIndex(image, ["NDVI","NDWI","EVI"], parameters);Для GEE Python API есть несколько библиотек, реализующих расчет спектральных индексов.
#GEE #индексы
Vegetation Condition Index
Normalized Difference Vegetation Index (NDVI) является хорошим показателем объема зеленой (фотосинтезирующей) биомассы — чем он больше, тем больше объем зеленой биомассы.* Мы уже обсуждали и использовали этот индекс. Так что здесь просто напомним о нем.
NDVI вычисляется по формуле:
NDVI = (NIR – RED) / (NIR + RED).
Когда солнечный свет попадает на растение, излучение в красной области спектра (0.4-0.7 мкм) поглощается хлорофиллом листьев, тогда как клеточные образования в листьях отражают большую часть излучения в ближней инфракрасной области спектра (NIR) (0.7-1.1 мкм). Таким образом, здоровая растительность поглощает красный свет (RED) и отражает NIR-излучение.
Значения NDVI варьируется в диапазоне от -1 до +1, при этом значения ниже нуля означают отсутствие зеленой растительности. На участках сельскохозяйственных культур NDVI в течение года меняется примерно в диапазоне от 0.3 до 0.9.
С помощью NDVI удобно следить за состоянием растений в течение сезона. Однако, он ничего не скажет о том, нормально ли такое состояние растений в данной местности. Представление о норме будем изменяться в зависимости от климата, почвы, типа растительности и рельефа. Например, значения NDVI, нормальные для высокогорья, будут слишком низкими для тропического леса.
Состояние растений в данной местности можно оценить, сравнивая его с результатами многолетних наблюдений в этой местности. Один их способов такого сравнения дает Vegetation Condition Index (VCI):
VCI_t = (NDVI_t - NDVI_min) / (NDVI_max - NDVI_min ) × 100.
Он сравнивает состояние растительности в данный момент времени (NDVI_t) с максимальным и минимальным значениями NDVI, которые достигались в том же пикселе поверхности и в ту же дату за все предыдущие годы наблюдений.
VCI, как и NDVI, является нормализованным разностным индексом. Обычно он изменяется в диапазоне от 0 (NDVI_t = NDVI_min) до 100 (NDVI_t = NDVI_max), но в рекордные годы может принимать значения за пределами этого диапазона.
Чтобы получить качественные значения VCI нужны многолетние наблюдения. В нашем примере использованы данные MODIS за 18 лет. Феликс Коган, предложивший VCI, использовал данные радиометра AVHRR, временной ряд которых начинается в 1978 году. Не углубляясь в вопросы статистики, примем, что 10 лет достаточно, чтобы оценить норму состояния растительности в данной местности.
Можно считать, что высокие значения VCI соответствуют хорошему состоянию растительности и отсутствию действия на нее стрессовых факторов. Развивая тему стрессовых факторов, можно построить Temperature Condition Index (TCI)
TCI_t = (T_t - TCI_min) / (TCI_max - TCI_min) × 100.
Высокий TCI говорит о том, что на участке необычно жарко. В сочетании с пониженным VCI, это может свидетельствовать о наступлении засухи.
Рассчитывается TCI совершенно аналогично VCI. В качестве исходных данных можно взять коллекцию MOD11A2.
Мониторинг сельскохозяйственной засухи и ее последствий подробнее описаны здесь. Выявлять засуху по индексам VCI и TCI — это тоже идея Когана и его коллег.
Код примера: https://code.earthengine.google.com/8fc468a7ca7ee9e893fa2ec741948312
*NDVI — хороший и простой показатель зеленой биомассы, но не идеальный. Он, как и все нормализованные индексы, входит в насыщение в области пиковых значений. Он зависит от почвы. Например, светлая и сухая почва вполне может дать NDVI > 0.3 в отсутствии растений. Но сейчас нам важно, что NDVI — это показатель состояния растений.
#GEE #индексы
Normalized Difference Vegetation Index (NDVI) является хорошим показателем объема зеленой (фотосинтезирующей) биомассы — чем он больше, тем больше объем зеленой биомассы.* Мы уже обсуждали и использовали этот индекс. Так что здесь просто напомним о нем.
NDVI вычисляется по формуле:
NDVI = (NIR – RED) / (NIR + RED).
Когда солнечный свет попадает на растение, излучение в красной области спектра (0.4-0.7 мкм) поглощается хлорофиллом листьев, тогда как клеточные образования в листьях отражают большую часть излучения в ближней инфракрасной области спектра (NIR) (0.7-1.1 мкм). Таким образом, здоровая растительность поглощает красный свет (RED) и отражает NIR-излучение.
Значения NDVI варьируется в диапазоне от -1 до +1, при этом значения ниже нуля означают отсутствие зеленой растительности. На участках сельскохозяйственных культур NDVI в течение года меняется примерно в диапазоне от 0.3 до 0.9.
С помощью NDVI удобно следить за состоянием растений в течение сезона. Однако, он ничего не скажет о том, нормально ли такое состояние растений в данной местности. Представление о норме будем изменяться в зависимости от климата, почвы, типа растительности и рельефа. Например, значения NDVI, нормальные для высокогорья, будут слишком низкими для тропического леса.
Состояние растений в данной местности можно оценить, сравнивая его с результатами многолетних наблюдений в этой местности. Один их способов такого сравнения дает Vegetation Condition Index (VCI):
VCI_t = (NDVI_t - NDVI_min) / (NDVI_max - NDVI_min ) × 100.
Он сравнивает состояние растительности в данный момент времени (NDVI_t) с максимальным и минимальным значениями NDVI, которые достигались в том же пикселе поверхности и в ту же дату за все предыдущие годы наблюдений.
VCI, как и NDVI, является нормализованным разностным индексом. Обычно он изменяется в диапазоне от 0 (NDVI_t = NDVI_min) до 100 (NDVI_t = NDVI_max), но в рекордные годы может принимать значения за пределами этого диапазона.
Чтобы получить качественные значения VCI нужны многолетние наблюдения. В нашем примере использованы данные MODIS за 18 лет. Феликс Коган, предложивший VCI, использовал данные радиометра AVHRR, временной ряд которых начинается в 1978 году. Не углубляясь в вопросы статистики, примем, что 10 лет достаточно, чтобы оценить норму состояния растительности в данной местности.
Можно считать, что высокие значения VCI соответствуют хорошему состоянию растительности и отсутствию действия на нее стрессовых факторов. Развивая тему стрессовых факторов, можно построить Temperature Condition Index (TCI)
TCI_t = (T_t - TCI_min) / (TCI_max - TCI_min) × 100.
Высокий TCI говорит о том, что на участке необычно жарко. В сочетании с пониженным VCI, это может свидетельствовать о наступлении засухи.
Рассчитывается TCI совершенно аналогично VCI. В качестве исходных данных можно взять коллекцию MOD11A2.
Мониторинг сельскохозяйственной засухи и ее последствий подробнее описаны здесь. Выявлять засуху по индексам VCI и TCI — это тоже идея Когана и его коллег.
Код примера: https://code.earthengine.google.com/8fc468a7ca7ee9e893fa2ec741948312
*NDVI — хороший и простой показатель зеленой биомассы, но не идеальный. Он, как и все нормализованные индексы, входит в насыщение в области пиковых значений. Он зависит от почвы. Например, светлая и сухая почва вполне может дать NDVI > 0.3 в отсутствии растений. Но сейчас нам важно, что NDVI — это показатель состояния растений.
#GEE #индексы
Vegetation Health Index
1. VCI
Сегодня мы научимся рассчитывать индекс здоровья растительности — Vegetation Health Index (VHI) — на основе индексов температурного режима (Temperature Condition Index, TCI) и состояния растительности (Vegetation Condition Index, VCI), используя Google Earth Engine.
Все три индекса — VCI, TCI и VHI — служат косвенными показателями засухи, изменения климата и общего состояния растительности. Они показывают, насколько текущие показатели отличаются от типичных для данной местности в это время года.
Код скрипта
Начнем с указания области интереса и периода наблюдений: Смоленская и Брянская области России, а также сопредельная территория Республики Беларусь, июнь 2023 года. Область интереса можно создать в GEE при помощи Инспектора (Inspector) или построить в geojson.io и скопировать координаты в свой код.
Индекс состояния растительности VCI (мы уже касались его здесь) оценивает текущее значение NDVI в сравнении с диапазоном значений NDVI, наблюдавшихся в тот же период в предыдущие годы. VCI показывает, где находится текущее значение между минимальным и максимальным значениями NDVI прошлых лет:
VCI = (NDVI – NDVI_min) / (NDVI_max – NDVI_min)
Чем выше VCI, тем лучше состояние растительности. Как правило, VCI изменяется в пределах от 0 до 1, но если текущий NDVI окажется меньше минимального или больше максимального, то мы получим значения ниже 0 и выше 1 соответственно.
Для значений NDVI возьмем коллекцию MOD13Q1.061 Terra Vegetation Indices 16-Day Global 250m и выберем из нее канал NDVI
Пройдем по коллекции, рассчитывая VCI с помощью функции:
#GEE #индексы
1. VCI
Сегодня мы научимся рассчитывать индекс здоровья растительности — Vegetation Health Index (VHI) — на основе индексов температурного режима (Temperature Condition Index, TCI) и состояния растительности (Vegetation Condition Index, VCI), используя Google Earth Engine.
Все три индекса — VCI, TCI и VHI — служат косвенными показателями засухи, изменения климата и общего состояния растительности. Они показывают, насколько текущие показатели отличаются от типичных для данной местности в это время года.
Код скрипта
Начнем с указания области интереса и периода наблюдений: Смоленская и Брянская области России, а также сопредельная территория Республики Беларусь, июнь 2023 года. Область интереса можно создать в GEE при помощи Инспектора (Inspector) или построить в geojson.io и скопировать координаты в свой код.
Индекс состояния растительности VCI (мы уже касались его здесь) оценивает текущее значение NDVI в сравнении с диапазоном значений NDVI, наблюдавшихся в тот же период в предыдущие годы. VCI показывает, где находится текущее значение между минимальным и максимальным значениями NDVI прошлых лет:
VCI = (NDVI – NDVI_min) / (NDVI_max – NDVI_min)
Чем выше VCI, тем лучше состояние растительности. Как правило, VCI изменяется в пределах от 0 до 1, но если текущий NDVI окажется меньше минимального или больше максимального, то мы получим значения ниже 0 и выше 1 соответственно.
Для значений NDVI возьмем коллекцию MOD13Q1.061 Terra Vegetation Indices 16-Day Global 250m и выберем из нее канал NDVI
var NDVI = ee.ImageCollection('MODIS/061/MOD13Q1').select('NDVI');
Пройдем по коллекции, рассчитывая VCI с помощью функции:
function calcVCI(image) {
var date = image.date();
var history = NDVI.filterDate('2000-01-01', ee.Date.fromYMD(date.get('year').subtract(1), 1, 1));
var min = history.min();
var max = history.max();
var vci = image.subtract(min).divide(max.subtract(min));
return vci.rename('VCI').copyProperties(image, ['system:time_start','system:time_end']);
}
#GEE #индексы
Vegetation Health Index
2. TCI
Индекс температурного режима TCI позволяет сравнить текущее значение температуры поверхности суши (land surface temperature, LST) с диапазоном значений, наблюдавшихся в тот же период в предыдущие годы. Индекс показывает, где находится наблюдаемое значение температуры поверхности относительно крайних значений (минимума и максимума) в предыдущие годы:
TCI = (LST_max – LST) / (LST_max – LST_min)
Низкие значения TCI показывают, что температура поверхности близка к максимальной для данной местности, а высокие — что к минимальной. Диапазон изменений TCI — от 0 до 1, с теми же оговорками, что и для VCI.
Температуру берем из коллекции MOD11A2.061 Terra Land Surface Temperature and Emissivity 8-Day Global 1km
Периодичность данных в коллекциях отличается: NDVI вычисляется каждые 16 суток, а LST — каждые 8 суток. Нам нужно получать данные LST каждые 16 суток. Для этого мы перебираем снимки MOD11A2, сделанные за период создания одного композита NDVI (16 суток) и вычисляем среднее значение LST с помощью
После этого, рассчитываем TCI аналогично VCI.
Как видно из рисунка, июнь выдался жарким, хотя и не рекордным.
#GEE #индексы
2. TCI
Индекс температурного режима TCI позволяет сравнить текущее значение температуры поверхности суши (land surface temperature, LST) с диапазоном значений, наблюдавшихся в тот же период в предыдущие годы. Индекс показывает, где находится наблюдаемое значение температуры поверхности относительно крайних значений (минимума и максимума) в предыдущие годы:
TCI = (LST_max – LST) / (LST_max – LST_min)
Низкие значения TCI показывают, что температура поверхности близка к максимальной для данной местности, а высокие — что к минимальной. Диапазон изменений TCI — от 0 до 1, с теми же оговорками, что и для VCI.
Температуру берем из коллекции MOD11A2.061 Terra Land Surface Temperature and Emissivity 8-Day Global 1km
var LST = ee.ImageCollection('MODIS/061/MOD11A2').select('LST_Day_1km');
Периодичность данных в коллекциях отличается: NDVI вычисляется каждые 16 суток, а LST — каждые 8 суток. Нам нужно получать данные LST каждые 16 суток. Для этого мы перебираем снимки MOD11A2, сделанные за период создания одного композита NDVI (16 суток) и вычисляем среднее значение LST с помощью
ee.ImageCollection.mean()
.function convert_lst_dates_to_modis_dates(ndvimg) {
var start = ndvimg.get('system:time_start');
var end = ndvimg.get('system:time_end');
var composite = LST.filterDate(start, end).mean();
return composite
.set('system:time_start', start)
.set('date', ee.Date(start).format())
.set('system:time_end', end)
.set('empty', composite.bandNames().size().eq(0));
}
После этого, рассчитываем TCI аналогично VCI.
Как видно из рисунка, июнь выдался жарким, хотя и не рекордным.
#GEE #индексы
Vegetation Health Index
3. Объединение коллекций и вычисление VHI
Теперь, зная VCI и TCI, мы можем объединить эти коллекции для расчета VHI. Последний вычисляется по формуле:
VHI = α * VCI + (1 - α) * TCI,
то есть является взвешенным средним значений VCI и TCI. Повышенная температура и плохое состояние растительности (низкий NDVI) являются признаками наступившей засухи, что вполне логично.
Для простоты, примем α = 0.5.
Объединяем коллекции изображений VCI и TCI, и вычисляем VHI, как показано здесь
Код выполняет левое внешнее объединение коллекций VCI и TCI с помощью функции
К полученной коллекции применяется функция
После этого выполняем еще один
В итоге, получим коллекцию изображений, каждое из которых содержит каналы VCI, TCI и VHI.
Код скрипта
Индексы VCI и TCI предложены Феликсом Коганом в работе: Kogan, F. N. (1995). Application of vegetation index and brightness temperature for drought detection. Advances in Space Research, 15(11), 91–100. https://doi.org/10.1016/0273-1177(95)00079-t Там же была предложена формула для вычисления VHI, хотя название индекса Коган придумал позже.
Первоначально, индексы использовались для наблюдений, сделанных прибором AVHRR — Advance Very High Resolution Radiometer, летавшим на спутниках семейств GOES, METEOSAT, MTSAT и DMSP. Сейчас эти данные находятся на странице STAR - Global Vegetation Health Products. Они являются глобальными, начинаются с 1981 года, имеют пространственное разрешение 4 км (Very High Resolution того времени!) и используются в виде 7-суточного композита.
#GEE #индексы
3. Объединение коллекций и вычисление VHI
Теперь, зная VCI и TCI, мы можем объединить эти коллекции для расчета VHI. Последний вычисляется по формуле:
VHI = α * VCI + (1 - α) * TCI,
то есть является взвешенным средним значений VCI и TCI. Повышенная температура и плохое состояние растительности (низкий NDVI) являются признаками наступившей засухи, что вполне логично.
Для простоты, примем α = 0.5.
Объединяем коллекции изображений VCI и TCI, и вычисляем VHI, как показано здесь
var filter = ee.Filter.equals({leftField:'system:time_start', rightField:'system:time_start'});
var join = ee.Join.saveFirst('match');
var bothCol = ee.ImageCollection(join.apply({primary: VCI,
secondary: TCI,
condition: filter}))
.map(function(img) { return img.addBands(img.get('match')).set('date', img.date().format('YYYY_MM_dd')) });
var VHI = bothCol.map(function(img){
return img.addBands(
img.expression('a/2 + b/2', {
'a': img.select('VCI'),
'b': img.select('TCI'),
}).rename('VHI'));
}
);
Код выполняет левое внешнее объединение коллекций VCI и TCI с помощью функции
ee.Join.saveFirst()
. В результате создается коллекция, содержащая пары изображений VCI и TCI, у которых совпадают свойства 'system:time_start'
.К полученной коллекции применяется функция
map()
. Она используется для добавления к каждому изображению нового канала (ee.Image.addBands()
), содержащего совпадающее изображение из другой коллекции. Используем ee.Image.get()
для получения совпадающего изображения.После этого выполняем еще один
map()
, чтобы вычислить VHI с помощью ee.Image.expression()
. В итоге, получим коллекцию изображений, каждое из которых содержит каналы VCI, TCI и VHI.
Код скрипта
Индексы VCI и TCI предложены Феликсом Коганом в работе: Kogan, F. N. (1995). Application of vegetation index and brightness temperature for drought detection. Advances in Space Research, 15(11), 91–100. https://doi.org/10.1016/0273-1177(95)00079-t Там же была предложена формула для вычисления VHI, хотя название индекса Коган придумал позже.
Первоначально, индексы использовались для наблюдений, сделанных прибором AVHRR — Advance Very High Resolution Radiometer, летавшим на спутниках семейств GOES, METEOSAT, MTSAT и DMSP. Сейчас эти данные находятся на странице STAR - Global Vegetation Health Products. Они являются глобальными, начинаются с 1981 года, имеют пространственное разрешение 4 км (Very High Resolution того времени!) и используются в виде 7-суточного композита.
#GEE #индексы
Soil-Adjusted Vegetation Index (SAVI)
Нормализованный разностный вегетационный индекс NDVI — это удобная и универсальная мера оценки состояния растительности, но — не идеальная. Когда поле покрыто редкой растительностью, NDVI может колебаться, даже если состояние растительности не меняется. Это происходит потому что почва на поле меняет яркость в зависимости от того, насколько она влажная или сухая.
Напомним формулу NDVI
NDVI = (NIR – Red) / (NIR + Red),
где NIR и Red обозначают отражательную способность в ближнем инфракрасном и в красном диапазонах соответственно.
Предположим, что 20% поля покрыто растительностью, а остальные 80% представляют собой открытую почву 1️⃣. После дождя эта почва станет влажной и, как следствие, более темной. При этом отражение в ближнем инфракрасном и красном диапазонах снизится примерно на одну и ту же величину 2️⃣. В результате NDVI поля увеличится. Напротив, сухая почва становится светлее, и это приводит к уменьшению NDVI 3️⃣.
Итак, исходный NDVI поля равнялся 0,21. После дождя он увеличился до 0,25, а для высохшей почвы упал до 0,17. И все это — без изменения состояния растительности!
Посмотрим, как “исправить” NDVI.
Изменение отражательной способности поля при изменении цвета почвы приводит к тому, что отражение в инфракрасном и в красном диапазонах увеличиваются или уменьшаются примерно на одинаковые величины. Предположим, что эти изменения действительно одинаковы, и обозначим величину изменения через ε. Тогда, с изменением отражательной способности почвы, NDVI будет равен
NDVI = ((NIR + ε) – (Red + ε)) / ((NIR + ε) + (Red + ε))
или
NDVI = (NIR – Red) / (NIR + Red + 2ε).
ε зависит от доли открытой почвы на поле и от цвета почвы. Если поле в основном покрыто растительностью и почвы не видно, то ε будет мало по сравнению с (NIR+RED), так что им можно пренебречь и мы получим обычную формулу NDVI. То есть, когда почвы не видно, NDVI не чувствителен к изменениям ее цвета.
Нас же интересует ситуация, когда почву видно хорошо...
#индексы #сельхоз #основы
Нормализованный разностный вегетационный индекс NDVI — это удобная и универсальная мера оценки состояния растительности, но — не идеальная. Когда поле покрыто редкой растительностью, NDVI может колебаться, даже если состояние растительности не меняется. Это происходит потому что почва на поле меняет яркость в зависимости от того, насколько она влажная или сухая.
Напомним формулу NDVI
NDVI = (NIR – Red) / (NIR + Red),
где NIR и Red обозначают отражательную способность в ближнем инфракрасном и в красном диапазонах соответственно.
Предположим, что 20% поля покрыто растительностью, а остальные 80% представляют собой открытую почву 1️⃣. После дождя эта почва станет влажной и, как следствие, более темной. При этом отражение в ближнем инфракрасном и красном диапазонах снизится примерно на одну и ту же величину 2️⃣. В результате NDVI поля увеличится. Напротив, сухая почва становится светлее, и это приводит к уменьшению NDVI 3️⃣.
Итак, исходный NDVI поля равнялся 0,21. После дождя он увеличился до 0,25, а для высохшей почвы упал до 0,17. И все это — без изменения состояния растительности!
Посмотрим, как “исправить” NDVI.
Изменение отражательной способности поля при изменении цвета почвы приводит к тому, что отражение в инфракрасном и в красном диапазонах увеличиваются или уменьшаются примерно на одинаковые величины. Предположим, что эти изменения действительно одинаковы, и обозначим величину изменения через ε. Тогда, с изменением отражательной способности почвы, NDVI будет равен
NDVI = ((NIR + ε) – (Red + ε)) / ((NIR + ε) + (Red + ε))
или
NDVI = (NIR – Red) / (NIR + Red + 2ε).
ε зависит от доли открытой почвы на поле и от цвета почвы. Если поле в основном покрыто растительностью и почвы не видно, то ε будет мало по сравнению с (NIR+RED), так что им можно пренебречь и мы получим обычную формулу NDVI. То есть, когда почвы не видно, NDVI не чувствителен к изменениям ее цвета.
Нас же интересует ситуация, когда почву видно хорошо...
#индексы #сельхоз #основы
SAVI. Часть 2
Вернемся к формуле
NDVI = (NIR – Red) / (NIR + Red + 2ε).
Обратите внимание, что ε не влияет на числитель NDVI. Если бы мы использовали в качестве индекса разность (NIR – RED), у нас бы не было проблем с изменением цвета почвы. Однако, возникла бы другая сложность: новый вегетационный индекс будет меняться в зависимости от освещенности. Когда общая интенсивность света составляет 50% от нормы (например, из-за умеренной облачности), (NIR – RED) тоже будет на 50% меньше. Отсюда и необходимость нормализации индекса путем деления на общую интенсивность (NIR + RED).
Чтобы уменьшить чувствительность формулы к ε, добавим в знаменатель константу L:
Стабилизированный NDVI = (NIR – Red) / (NIR + Red + 2ε + L).
Разберемся с тем, как выбрать L. Если L будет очень велико по сравнению с NIR и RED, то формула для вычисления стабилизированного NDVI превратится в
(NIR – Red) / (NIR + Red + 2ε + L) ≈ (NIR – Red) / L
Таким образом, для больших L чувствительность к ε исчезает. Зато формула сводится к масштабированной версии (NIR – RED), которая, как мы знаем, не работает.
Напротив, при L=0, мы вернемся к формуле NDVI, которая слишком чувствительна к ε.
Существует компромисс: выберем L достаточно большим, чтобы знаменатель был чувствителен к ε, но не слишком большим, чтобы не исчез эффект нормализации от деления на (NIR + RED).
Для конкретного региона можно определить свое значение L, откалибровав его на основе реальных данных. Однако в целом исследователи пришли к выводу, что L=0,5 создает вегетационный индекс, значительно менее чувствительный к цвету почвы, чем NDVI, и при этом достаточно нормализованный, чтобы общие изменения в интенсивности света не привели к существенному изменению индекса.
Осталось сделать последний шаг, чтобы сделать новый индекс удобным. Мы хотим, чтобы его значения находилась в интервале между –1 и 1. Увеличив знаменатель на L, мы добились того, что максимальное значение индекса (теоретически встречающееся при NIR=1, RED=0) стало равно 1/1+L. Если мы хотим, чтобы максимальное значение было равно 1, нам нужно умножить числитель на (1+L):
SAVI = (1 + L)(NIR – Red) / (NIR + Red + L), где L = 0,5
Новый индекс называется Soil-Adjusted Vegetation Index или SAVI. Он предложен в работе: Huete, A. R. (1988). A soil-adjusted vegetation index (SAVI). Remote Sensing of Environment, 25(3), 295–309. https://doi.org/10.1016/0034-4257(88)90106-x
SAVI варьируется в пределах от –1 до 1, малочувствителен к цвету почвы, нечувствителен к общей интенсивности света и увеличивается пропорционально состоянию и плотности растительности. Он лучше NDVI подходит для районов с разреженной растительностью, где цвет почвы может меняться.
#индексы #сельхоз #основы
Вернемся к формуле
NDVI = (NIR – Red) / (NIR + Red + 2ε).
Обратите внимание, что ε не влияет на числитель NDVI. Если бы мы использовали в качестве индекса разность (NIR – RED), у нас бы не было проблем с изменением цвета почвы. Однако, возникла бы другая сложность: новый вегетационный индекс будет меняться в зависимости от освещенности. Когда общая интенсивность света составляет 50% от нормы (например, из-за умеренной облачности), (NIR – RED) тоже будет на 50% меньше. Отсюда и необходимость нормализации индекса путем деления на общую интенсивность (NIR + RED).
Чтобы уменьшить чувствительность формулы к ε, добавим в знаменатель константу L:
Стабилизированный NDVI = (NIR – Red) / (NIR + Red + 2ε + L).
Разберемся с тем, как выбрать L. Если L будет очень велико по сравнению с NIR и RED, то формула для вычисления стабилизированного NDVI превратится в
(NIR – Red) / (NIR + Red + 2ε + L) ≈ (NIR – Red) / L
Таким образом, для больших L чувствительность к ε исчезает. Зато формула сводится к масштабированной версии (NIR – RED), которая, как мы знаем, не работает.
Напротив, при L=0, мы вернемся к формуле NDVI, которая слишком чувствительна к ε.
Существует компромисс: выберем L достаточно большим, чтобы знаменатель был чувствителен к ε, но не слишком большим, чтобы не исчез эффект нормализации от деления на (NIR + RED).
Для конкретного региона можно определить свое значение L, откалибровав его на основе реальных данных. Однако в целом исследователи пришли к выводу, что L=0,5 создает вегетационный индекс, значительно менее чувствительный к цвету почвы, чем NDVI, и при этом достаточно нормализованный, чтобы общие изменения в интенсивности света не привели к существенному изменению индекса.
Осталось сделать последний шаг, чтобы сделать новый индекс удобным. Мы хотим, чтобы его значения находилась в интервале между –1 и 1. Увеличив знаменатель на L, мы добились того, что максимальное значение индекса (теоретически встречающееся при NIR=1, RED=0) стало равно 1/1+L. Если мы хотим, чтобы максимальное значение было равно 1, нам нужно умножить числитель на (1+L):
SAVI = (1 + L)(NIR – Red) / (NIR + Red + L), где L = 0,5
Новый индекс называется Soil-Adjusted Vegetation Index или SAVI. Он предложен в работе: Huete, A. R. (1988). A soil-adjusted vegetation index (SAVI). Remote Sensing of Environment, 25(3), 295–309. https://doi.org/10.1016/0034-4257(88)90106-x
SAVI варьируется в пределах от –1 до 1, малочувствителен к цвету почвы, нечувствителен к общей интенсивности света и увеличивается пропорционально состоянию и плотности растительности. Он лучше NDVI подходит для районов с разреженной растительностью, где цвет почвы может меняться.
#индексы #сельхоз #основы
SAVI. Часть 3
Сравним NDVI и SAVI.
На рисунке 1️⃣ показана разница между NDVI и SAVI при различной плотности растительности. При редкой и умеренной растительности NDVI имеет значительный разброс значений из-за чувствительности к цвету почвы. SAVI имеет гораздо меньший разброс. Разброс NDVI уменьшается, когда плотность растительности высока и почва закрыта растительным покровом.
Кроме малой чувствительности к цвету почвы, существует еще одно преимущество, которое SAVI приобретает благодаря дополнительному члену L: порог насыщения SAVI выше, чем NDVI.
Вспомним формулу NDVI
NDVI = (NIR – Red) / (NIR + Red),
Когда Red приближается к нулю, NDVI будет расти вместе с NIR, асимптотически приближаясь к единице. Все большее увеличение NIR оказывает все меньшее влияние на NDVI, то есть происходит насыщение.
Рассмотрим эффект от добавления L к знаменателю
SAVI = (1 + L)(NIR – Red) / (NIR + Red + L)
SAVI тоже достигнет насыщения, но это произойдет при большем значении NIR. Чтобы понять как это работает, зададим RED = 0 и сделаем L гораздо больше, чем NIR. В таком случае, в знаменателе формулы будет преобладать L, а вся формула сводится к (1+L)NIR/L. Она линейно возрастает с увеличением NIR, выпуклости графика нет, а значит, нет и насыщения 2️⃣. Таким образом, точка насыщения увеличивается вместе с увеличением L.
Таким образом, дополнительный член в знаменателе позволяет SAVI регистрировать увеличение плотности растительности даже после того, как NDVI вошел в насыщение.
Подведем итоги:
1. SAVI, как правило, используется вместо NDVI в ситуации, когда видна значительная часть почвы и возможны изменения ее яркости.
2. SAVI не имеет однозначного превосходства перед NDVI: смягчая эффекты яркости почвы, в нем нарушается нечувствительность индекса к общей интенсивности света (за счет добавления L).
3. Меньшая чувствительность SAVI к насыщению позволяет использовать этот индекс для оценки состояния густой растительности.
#индексы #сельхоз #основы
Сравним NDVI и SAVI.
На рисунке 1️⃣ показана разница между NDVI и SAVI при различной плотности растительности. При редкой и умеренной растительности NDVI имеет значительный разброс значений из-за чувствительности к цвету почвы. SAVI имеет гораздо меньший разброс. Разброс NDVI уменьшается, когда плотность растительности высока и почва закрыта растительным покровом.
Кроме малой чувствительности к цвету почвы, существует еще одно преимущество, которое SAVI приобретает благодаря дополнительному члену L: порог насыщения SAVI выше, чем NDVI.
Вспомним формулу NDVI
NDVI = (NIR – Red) / (NIR + Red),
Когда Red приближается к нулю, NDVI будет расти вместе с NIR, асимптотически приближаясь к единице. Все большее увеличение NIR оказывает все меньшее влияние на NDVI, то есть происходит насыщение.
Рассмотрим эффект от добавления L к знаменателю
SAVI = (1 + L)(NIR – Red) / (NIR + Red + L)
SAVI тоже достигнет насыщения, но это произойдет при большем значении NIR. Чтобы понять как это работает, зададим RED = 0 и сделаем L гораздо больше, чем NIR. В таком случае, в знаменателе формулы будет преобладать L, а вся формула сводится к (1+L)NIR/L. Она линейно возрастает с увеличением NIR, выпуклости графика нет, а значит, нет и насыщения 2️⃣. Таким образом, точка насыщения увеличивается вместе с увеличением L.
Таким образом, дополнительный член в знаменателе позволяет SAVI регистрировать увеличение плотности растительности даже после того, как NDVI вошел в насыщение.
Подведем итоги:
1. SAVI, как правило, используется вместо NDVI в ситуации, когда видна значительная часть почвы и возможны изменения ее яркости.
2. SAVI не имеет однозначного превосходства перед NDVI: смягчая эффекты яркости почвы, в нем нарушается нечувствительность индекса к общей интенсивности света (за счет добавления L).
3. Меньшая чувствительность SAVI к насыщению позволяет использовать этот индекс для оценки состояния густой растительности.
#индексы #сельхоз #основы
⭐️ СТРАНЫ / КОМПАНИИ / СПУТНИКИ
Страны: #австралия #германия #индия #иран #испания #канада #китай #португалия #россия #США #япония и т. п.
Но:
#корея обозначает Северную и Южную Кореи
#РБ — Республика Беларусь
#UK — Великобритания
Компании: #planet #maxar
Спутники: #landsat #sentinel1 #sentinel2
⭐️ ДЗЗ
Методы и приборы
#альтиметр
#гиперспектр — гиперспектральная оптическая съемка
#лидар
#оптика — мультиспектральная оптическая съемка
#радиометр — микроволновой радиометр
#dnb — ночная съёмка (day / night band)
#SIF — солнечно-индуцированная флуоресценция хлорофилла
#ro — радиозатменный метод
#SAR — радарная съемка
#InSAR — радарная интерферометрия
#LST — съемка в тепловом инфракрасном диапазоне
#GNSSR — ГНСС-рефлектометрия
#sigint — радиоэлектронная разведка
Виды орбит: #ГСО — геостационарная, #VLEO — сверхнизкая
#основы — обучающие материалы по ДЗЗ
#обучение курсы, обучающие сервисы и т. п.
#история — в основном, история ДЗЗ
#индексы — спектральные индексы
#комбинация — комбинации каналов
Данные
#данные — коллекции данных ДЗЗ, наземных данных, карты и т.п.
#датасет — набор данных для машинного обучения
Дополнительные хештеги, описывающие данные:
#LULC — Land Use & Land Cover
#осадки
#SST — Sea Surface Temperature
#nrt — (near real time) изображения, получаемые в режиме, близком к реальном времени
#debris — космический мусор
#границы — административные границы
#DEM — цифровая модель рельефа (ЦМР)
#keyhole — рассекреченные снимки разведспутников
Литература, справочная информация
#справка — спектральные каналы, орбиты спутников, поиск данных и т.п.
#обзор
#книга — текст книги прикреплён к сообщению.
Дополнительные хештеги:
#наблюдение — ресурсы для наблюдения спутников и орбиты спутников
#космодромы
#конференции — анонс конференций/семинаров/школ, посвященных ДЗЗ и анализ их материалов.
#конкурсы — анонс конкурсов/чемпионатов/олимпиад.
#МВК — материалы заседаний Межведомственной комиссии (МВК) по использованию результатов космической деятельности.
#снимки — поучительные (хоть в чем-то интересные) снимки, первые снимки
Программные инструменты / Языки
#нейронки #софт #GEE #R #tool #python
#ИИ #FM — Foundation Model (Remote Sensing Foundation Model)
⭐️ ОТРАСЛИ / ТЕМАТИЧЕСКИЕ ЗАДАЧИ
#археология #атмосфера #вода #война #засуха #климат #лед #лес #нефть #океан #оползни #наводнение #пожары #почва #растительность #севморпуть #сельхоз #снег
#AGB — надземная биомасса
#ЧС — мониторинг стихийных бедствий и катастроф
#GHG — парниковые газы
Отдельные газы: #CO2 #NO2
#энергетика — космическая энергетика
#SSA — Space Situational Awareness
Страны: #австралия #германия #индия #иран #испания #канада #китай #португалия #россия #США #япония и т. п.
Но:
#корея обозначает Северную и Южную Кореи
#РБ — Республика Беларусь
#UK — Великобритания
Компании: #planet #maxar
Спутники: #landsat #sentinel1 #sentinel2
⭐️ ДЗЗ
Методы и приборы
#альтиметр
#гиперспектр — гиперспектральная оптическая съемка
#лидар
#оптика — мультиспектральная оптическая съемка
#радиометр — микроволновой радиометр
#dnb — ночная съёмка (day / night band)
#SIF — солнечно-индуцированная флуоресценция хлорофилла
#ro — радиозатменный метод
#SAR — радарная съемка
#InSAR — радарная интерферометрия
#LST — съемка в тепловом инфракрасном диапазоне
#GNSSR — ГНСС-рефлектометрия
#sigint — радиоэлектронная разведка
Виды орбит: #ГСО — геостационарная, #VLEO — сверхнизкая
#основы — обучающие материалы по ДЗЗ
#обучение курсы, обучающие сервисы и т. п.
#история — в основном, история ДЗЗ
#индексы — спектральные индексы
#комбинация — комбинации каналов
Данные
#данные — коллекции данных ДЗЗ, наземных данных, карты и т.п.
#датасет — набор данных для машинного обучения
Дополнительные хештеги, описывающие данные:
#LULC — Land Use & Land Cover
#осадки
#SST — Sea Surface Temperature
#nrt — (near real time) изображения, получаемые в режиме, близком к реальном времени
#debris — космический мусор
#границы — административные границы
#DEM — цифровая модель рельефа (ЦМР)
#keyhole — рассекреченные снимки разведспутников
Литература, справочная информация
#справка — спектральные каналы, орбиты спутников, поиск данных и т.п.
#обзор
#книга — текст книги прикреплён к сообщению.
Дополнительные хештеги:
#наблюдение — ресурсы для наблюдения спутников и орбиты спутников
#космодромы
#конференции — анонс конференций/семинаров/школ, посвященных ДЗЗ и анализ их материалов.
#конкурсы — анонс конкурсов/чемпионатов/олимпиад.
#МВК — материалы заседаний Межведомственной комиссии (МВК) по использованию результатов космической деятельности.
#снимки — поучительные (хоть в чем-то интересные) снимки, первые снимки
Программные инструменты / Языки
#нейронки #софт #GEE #R #tool #python
#ИИ #FM — Foundation Model (Remote Sensing Foundation Model)
⭐️ ОТРАСЛИ / ТЕМАТИЧЕСКИЕ ЗАДАЧИ
#археология #атмосфера #вода #война #засуха #климат #лед #лес #нефть #океан #оползни #наводнение #пожары #почва #растительность #севморпуть #сельхоз #снег
#AGB — надземная биомасса
#ЧС — мониторинг стихийных бедствий и катастроф
#GHG — парниковые газы
Отдельные газы: #CO2 #NO2
#энергетика — космическая энергетика
#SSA — Space Situational Awareness
Метод картографирования цветения рапса
(d’Andrimont et al., 2020) предложили метод картографирования цветения масличного рапса на основе временных рядов оптических данных Sentinel-2 (S2) и радарных данных Sentinel-1 (S1). Район исследования включал в себя северные регионы Германии (N) и южную Баварию (S). Метод использует нормализованный разностный индекс жёлтого цвета (Normalized Difference Yellow Index, NDYI) для S2 (помните, как выглядит цветущий рапс на снимках из космоса?) и локальный минимум коэффициентов обратного рассеяния в поляризации VV для S1. Пик цветения определялся с точностью от 1 до 4 суток. При определении цветения по данным S1 наблюдалась систематическая задержка на 1 сутки, по сравнению с результатами по S2.
📸 Пространственно-усредненные временные ряды S2 NDYI для всех участков на севере и юге Германии с медианными датами начала, пика и конца цветения, полученными по наземным наблюдениям. Пунктирная красная линия соответствует медианной дате начала цветения (BBCH61), пунктирная синяя линия — медианной дате пика цветения (BBCH65), а пунктирная розовая линия — медианной дате окончания цветения (BBCH69).
#сельхоз #индексы
(d’Andrimont et al., 2020) предложили метод картографирования цветения масличного рапса на основе временных рядов оптических данных Sentinel-2 (S2) и радарных данных Sentinel-1 (S1). Район исследования включал в себя северные регионы Германии (N) и южную Баварию (S). Метод использует нормализованный разностный индекс жёлтого цвета (Normalized Difference Yellow Index, NDYI) для S2 (помните, как выглядит цветущий рапс на снимках из космоса?) и локальный минимум коэффициентов обратного рассеяния в поляризации VV для S1. Пик цветения определялся с точностью от 1 до 4 суток. При определении цветения по данным S1 наблюдалась систематическая задержка на 1 сутки, по сравнению с результатами по S2.
📸 Пространственно-усредненные временные ряды S2 NDYI для всех участков на севере и юге Германии с медианными датами начала, пика и конца цветения, полученными по наземным наблюдениям. Пунктирная красная линия соответствует медианной дате начала цветения (BBCH61), пунктирная синяя линия — медианной дате пика цветения (BBCH65), а пунктирная розовая линия — медианной дате окончания цветения (BBCH69).
#сельхоз #индексы
GEE-44. qualityMosaic или самый зелёный пиксель Беларуси
Самым зелёным будем считать пиксель с максимальным значением вегетационного индекса NDVI, который используется как показатель количества зелёной растительности. Необходимо найти максимальное значение NDVI в заданной области в течение календарного года, установить день года, в который оно достигается, и, наконец, построить карту.
Областью исследований стала Республика Беларусь. Выбор спутниковых данных в задаче не важен. Мы используем снимки Landsat 8.
Основная работа заключается в: 1) создании коллекции изображений
Функция
При этом
1️⃣ RGB-мозаика в естественных цветах, 2️⃣ Максимумы NDVI, 3️⃣ Дни года, когда достигается максимум NDVI.
🌍Код скрипта GEE
Мы уже рассказывали о создании мозаик здесь и здесь. Вот ещё немного полезной информации:
🔗 Создание мозаики из коллекции изображений Sentinel-2, где качество пикселя основано на оценке вероятности облаков
🔗 Пример использования qualityMosaic для PythonAPI от Q. Wu
#GEE #индексы
Самым зелёным будем считать пиксель с максимальным значением вегетационного индекса NDVI, который используется как показатель количества зелёной растительности. Необходимо найти максимальное значение NDVI в заданной области в течение календарного года, установить день года, в который оно достигается, и, наконец, построить карту.
Областью исследований стала Республика Беларусь. Выбор спутниковых данных в задаче не важен. Мы используем снимки Landsat 8.
Основная работа заключается в: 1) создании коллекции изображений
l8
, 2) добавлении к снимкам коллекции слоя NDVI, а также слоя, содержащего номер дня года (doy
), в который получен снимок. Самую важную работу выполняет функция qualityMosaic
:var l8 = ee.ImageCollection('LANDSAT/LC08/C02/T1_L2')
.filterBounds(AOI)
.filterDate(start_date, end_date);
function addNDVI(image) {
var ndvi = image.normalizedDifference(['SR_B5', 'SR_B4']).rename('NDVI');
return image.addBands(ndvi);
}
function addDOY(image) {
var img_date = ee.Date(image.date());
var img_doy = ee.Number.parse(img_date.format('D'));
return image.addBands(ee.Image(img_doy).rename('doy').toInt());
}
var greenest = l8.map(addNDVI).map(addDOY).qualityMosaic('NDVI');
Функция
ImageCollection.qualityMosaic(qualityBand)
формирует из коллекции изображений мозаику (итоговое изображение), состоящую из пикселей с наивысшей оценкой качества, то есть с максимальными значениями слоя qualityBand
. У нас в качестве такого слоя выступает 'NDVI'
, а значит мозаика будет состоять из максимальных (за год) значений NDVI в данном пикселе.При этом
qualityMosaic
включает в мозаику не только значения канала qualityBand
, но и значения всех остальных каналов снимка с наивысшей оценкой качества. Таким образом, в итоговое изображение попадет и канал 'doy'
— день года, в который достигается максимум NDVI.1️⃣ RGB-мозаика в естественных цветах, 2️⃣ Максимумы NDVI, 3️⃣ Дни года, когда достигается максимум NDVI.
🌍Код скрипта GEE
Мы уже рассказывали о создании мозаик здесь и здесь. Вот ещё немного полезной информации:
🔗 Создание мозаики из коллекции изображений Sentinel-2, где качество пикселя основано на оценке вероятности облаков
🔗 Пример использования qualityMosaic для PythonAPI от Q. Wu
#GEE #индексы
This media is not supported in your browser
VIEW IN TELEGRAM
rsi — загрузка данных из STAC и расчет спектральных индексов [ссылка]
Пакет rsi (от repeated spatial infelicities) предоставляет пользователю:
- Интерфейс к проекту Awesome Spectral Indices project, который содержит список спектральных индексов в виде таблицы tibble.
- Метод эффективного вычисления этих спектральных индексов.
- Метод загрузки данных с любого сервера STAC, с дополнительными настройками для загрузки популярных данных Landsat, Sentinel-1 и Sentinel-2 с бесплатных и публичных серверов STAC.
- Метод объединения нескольких растров, содержащих различные наборы данных, в единый растровый стек.
Функция
Функция
Для популярных данных, например для снимков Landsat, есть отдельные функции, где большинство параметров настроено по умолчанию:
По умолчанию, данные загружаются из Microsoft's Planetary Computer API.
Теперь на основе полученных каналов снимков Landsat рассчитаем спектральные индексы при помощи
Наконец, в rsi есть утилита для эффективного объединения растров, содержащих различные данные об одном и том же месте, в VRT, что позволяет программам типа GDAL рассматривать эти отдельные источники данных как единый файл.
Например, мы можем объединить наши снимки Landsat с полученными индексами:
#R #индексы
Пакет rsi (от repeated spatial infelicities) предоставляет пользователю:
- Интерфейс к проекту Awesome Spectral Indices project, который содержит список спектральных индексов в виде таблицы tibble.
- Метод эффективного вычисления этих спектральных индексов.
- Метод загрузки данных с любого сервера STAC, с дополнительными настройками для загрузки популярных данных Landsat, Sentinel-1 и Sentinel-2 с бесплатных и публичных серверов STAC.
- Метод объединения нескольких растров, содержащих различные наборы данных, в единый растровый стек.
Функция
spectral_indices()
возвращает таблицу спектральных индексов.Функция
get_stac_data()
позволяет загружать изображения из любого доступного каталога STAC. Например, можно загрузить композит каналов Landsat с маской облачности:aoi <- sf::st_point(c(-74.912131, 44.080410))
aoi <- sf::st_set_crs(sf::st_sfc(aoi), 4326)
aoi <- sf::st_buffer(sf::st_transform(aoi, 5070), 1000)
landsat_image <- get_stac_data(
aoi,
start_date = "2022-06-01",
end_date = "2022-06-30",
pixel_x_size = 30,
pixel_y_size = 30,
asset_names = c("red", "blue", "green"),
stac_source = "https://planetarycomputer.microsoft.com/api/stac/v1/",
collection = "landsat-c2-l2",
mask_band = "qa_pixel",
mask_function = landsat_mask_function,
output_filename = tempfile(fileext = ".tif"),
item_filter_function = landsat_platform_filter,
platforms = c("landsat-9", "landsat-8")
)
Для популярных данных, например для снимков Landsat, есть отдельные функции, где большинство параметров настроено по умолчанию:
landsat_image <- get_landsat_imagery(
aoi,
start_date = "2022-06-01",
end_date = "2022-06-30",
output_filename = tempfile(fileext = ".tif")
)
По умолчанию, данные загружаются из Microsoft's Planetary Computer API.
Теперь на основе полученных каналов снимков Landsat рассчитаем спектральные индексы при помощи
calculate_indices()
:indices <- calculate_indices(
landsat_image,
available_indices,
output_filename = tempfile(fileext = ".tif")
)
Наконец, в rsi есть утилита для эффективного объединения растров, содержащих различные данные об одном и том же месте, в VRT, что позволяет программам типа GDAL рассматривать эти отдельные источники данных как единый файл.
Например, мы можем объединить наши снимки Landsat с полученными индексами:
raster_stack <- stack_rasters(
c(landsat_image, indices),
tempfile(fileext = ".vrt")
)
#R #индексы
Новый индекс для обнаружения пластика на суше
Коллектив исследователей под руководством Дженны Гуффогг (Jenna Guffogg) из Royal Melbourne Institute of Technology University предложил спектральный индекс для обнаружения пластика на пляжах.
Индекс пластикового мусора на пляжах, Beached Plastic Debris Index (BPDI), опирается на данные каналов коротковолнового ИК-излучения (SWIR) спутника WorldView-3 компании Maxar.
Beached Plastic Debris Index = SWIR3 * (SWIR2 - SWIR4) / (SWIR2 + SWIR4)
Чтобы обосновать преимущества нового индекса перед существующими, на пляже в южной части Гипсленда (шт. Виктория, Австралия) разместили 14 пластиковых мишеней площадью около двух квадратных метров каждая. Мишени были сделаны из пластика разных типов и имели размер меньше, чем пиксель спутника (около 3 м²).
Спутниковые изображения, полученные с помощью BPDI, сравнивали с тремя существующими индексами, два из которых были разработаны для обнаружения пластика на суше, а один —на воде. BPDI превзошел все три индекса, которые либо с трудом различали загрязнённые пластиком пиксели на пляже, либо ошибочно классифицировали тень и воду как пластик.
1️⃣ Спектральные каналы VNIR и SWIR WorldView-3.
2️⃣ Спектральные сигнатуры пластиковых мишеней.
#индексы
Коллектив исследователей под руководством Дженны Гуффогг (Jenna Guffogg) из Royal Melbourne Institute of Technology University предложил спектральный индекс для обнаружения пластика на пляжах.
Индекс пластикового мусора на пляжах, Beached Plastic Debris Index (BPDI), опирается на данные каналов коротковолнового ИК-излучения (SWIR) спутника WorldView-3 компании Maxar.
Beached Plastic Debris Index = SWIR3 * (SWIR2 - SWIR4) / (SWIR2 + SWIR4)
Чтобы обосновать преимущества нового индекса перед существующими, на пляже в южной части Гипсленда (шт. Виктория, Австралия) разместили 14 пластиковых мишеней площадью около двух квадратных метров каждая. Мишени были сделаны из пластика разных типов и имели размер меньше, чем пиксель спутника (около 3 м²).
Спутниковые изображения, полученные с помощью BPDI, сравнивали с тремя существующими индексами, два из которых были разработаны для обнаружения пластика на суше, а один —на воде. BPDI превзошел все три индекса, которые либо с трудом различали загрязнённые пластиком пиксели на пляже, либо ошибочно классифицировали тень и воду как пластик.
1️⃣ Спектральные каналы VNIR и SWIR WorldView-3.
2️⃣ Спектральные сигнатуры пластиковых мишеней.
#индексы