Котиковый посмотрел на этот график внимательнее и вынужден откорректировать тейк Дорогого БРАТА Смоллфармы. Этот график не показывает, что псевдотрады не правы. Он показывает, что женщины с высшим образованием ИЛИ лучше следят за своим здоровьем, ИЛИ просто здоровее (например из-за генетического конфаундера).

Коллеги, привет!
А что, если я скажу, что почти всё, на чём строилась идеология персональных противоопухолевых вакцин последние 10 лет, оказалось лишь верхушкой айсберга? И что главные мишени для иммунной системы всё это время прятались, в той части генома, которую раньше считали «мусорной»?/или как сейчас говорят темной
Честно говоря, давно чувствовалось, что в догме «высокая мутационная нагрузка = много неоантигенов = хороший ответ на терапию» что-то не сходится. Мы все видели в клинике пациентов с низкой TMB, которые отвечали на ингибиторы контрольных точек, и, наоборот, пациентов с горячими опухолями, которые оставались резистентными.
И вот, практически одновременно, в мае выходят две статьи в Science и Nature Cancer, которые, по сути, эту догму переворачивают с ног на голову. Одна работа сфокусирована на иммунологически холодной карциноме поджелудочной железы, другая на чемпионах по мутациям: меланоме и НМРЛ.

🔬Давайте по порядку. В исследовании Nature Cancer (меланома и НМРЛ) авторы провели глубокий протеогеномный анализ и выяснили, я бы сказал, довольно интересное: лишь 1% (!) реально презентируемых на поверхности опухолевых антигенов происходил из мутировавших последовательностей. Остальные 99% это немутированные белки, которые появляются из-за ошибок в работе генома опухолевой клетки.
Команда из Science подтвердила это на карциноме поджелудочной железы, идентифицировав более тысячи ранее неизвестных «криптидных/cryptic » пептидов, которые происходят из неканонических участков генома (интронов, UTR и т.д.).

🔬Ключевые выводы из этих работ:

Новый класс антигенов: Основной пул мишеней — это так называемые aeTSAs (aberrantly expressed tumor-specific antigens). Они не несут мутаций, но экспрессируются исключительно в опухоли из-за эпигенетических сбоев.
Они общие для многих: В отличие от уникальных неоантигенов, эти криптидные пептиды являются общими для многих пациентов. Это открывает дорогу к созданию универсальных, (off-the-shelf вакцин.
В работе Science Т-клетки, нацеленные на эти новые антигены, эффективно уничтожали пациент-специфичные органоиды карциномы поджелудочной железы in vivo.
Справедливый вопрос: почему мы не видели этого раньше?
И на это есть ответ. Мутировавшие пептиды плохие кандидаты для презентации на MHC, потому что РНК большинства мутаций экспрессируется очень слабо. Они расположены вне геномных (MAP hotspots), откуда клетка эффективно нарезает пептиды для иммунной системы.
Я бы сказал, что гонка за универсальными вакцинами официально началась. Некоторые компании уже давно работают в этом направлении, например, UbiVac, которые, по сути, предвосхитили эти открытия и уже много лет работают с вакциной DPV-001, нацеленной как раз на эту темную материю. Их впечатляющие данные в недавнем КИ при рецидивирующем/метастатическом раке головы и шеи комбинация DPV-001 с анти-PD-1 утроила частоту объективного ответа, полного ответа и выживаемость без прогрессирования.
А знаете, что самое интересное во всей этой истории с точки зрения патолога? Мы так глубоко копаем в геномную темную материю, а в конечном счете возвращаемся к простой и элегантной истине. Не так уж важно, на какой именно антиген классический мутировавший или новомодный криптидный пришел Т-лимфоцит в опухоль. Важно, что он пришел.
Поэтому оценка TILs на старом добром гематоксилин-эозине или красивая карта Т-клеток, полученная с помощью any омики, были и остаются мощнейшими биомаркерами ответа на терапию. Новые публикации просто блестяще объясняет нам как это происходит, но не отменяют важности того, что мы видим в микроскоп (монитор).

https://boosty.to/smallpharm/posts/0f512c3d-27d5-4482-82b4-99ee3ad5ae63

ВЫШЛО ВЫШЛО ВЫШЛО!

Если у вас нету мотивации заняться зарядкой и пойти отжиматься - включайте We walked in line.

Das ist eine kriegserklarung an das fett!

Всё, поэтов можно закрывать - нейросети начали писать тексты в стиле Ordo Rosarius Equilibrio абсолютно неотличимые от оригинала.

Иногда на гугл.картах я рассматриваю места, в которых не бывал несколько лет.
И, о ужас, моя любимая пражская наливайка закрылась(((
Причём ребята молодцы, держались более 10 лет на плаву.

Александра Сергеевича с днём рождения!
Спасибо за русский язык, каждый день пользуемся.

С днём России! :3

С мест сообщают

Сегодня на биологическом факультете, в нЕкоТороМ известном вузе северной столицы, проходила предзащита дипломов... Где студенту сделали замечание, что in vitro это англицизм (!) и такого надо избегать (!!), так как англицизмы не соответствуют понятию "академический стиль" (!!!)

Так и живем)) Компания In Vitro срочно свяжитесь со мной для рекламной интеграции

https://boosty.to/smallpharm/posts/b3216a6b-4038-47bd-a5b1-e2ab429229ca

ВЫШЛО ВЫШЛО ВЫШЛО!

Уважаемые бустированные папищеки!
У бусти долгое время был баг - при прикреплении картинок в PNG, если у них имелась прозрачность, то при просмотре с телефона картинки иногда "плыли".
Недавно у бусти сменился дизайн, не могли бы вы посмотреть - остался ли этот баг?
https://boosty.to/smallpharm/posts/f984f7ee-ea67-4b1f-a980-6dd0790a08d2
https://boosty.to/smallpharm/posts/c3807011-0b17-49b0-a7de-818944ec5f49
Вот на картинки в этих статьях папищеки некоторые очень жаловались.

Подъехала занятная статья:
"Your Brain on ChatGPT: Accumulation of Cognitive Debt when Using an AI Assistant for Essay Writing Task"

TLDR: у пользователей LLM агентов снижается уровень умения критически мыслить, и они начинают жить в эхо-камере, которую наполняет алгоритмическая выдача. В статье в качестве подтверждения деградации мыслительной деятеьности приводятся электроэнцефалограммы из MIT.

Хозяюшке на заметку: в русском языке алкоголиков иногда называют синяками, а для обозначения бесконтрольного запойного употребления используют глагол "синячить".
Но мало кто знает этимологию этого слова. В околоперестроечные времена спиртосодержащие морилки, которые широко употреблялись пролетариями из-за недоступности нормальных напитков, содержали нигрозин. Он, при приёме больших количеств такого пойла, иногда придавал коже синеватый оттенок.

Сегодня в курилке обсуждали побочки метформина.
Пришли к выводу, что сочетание лактоацидоза и диареи можно назвать КИСЛЫЕ ДРИЩИ.