#зоопарк_одобряет
Давно уже хотели рассказать посетителям нашего Зоопарка о хорошем научпоп-проекте ФизХимФест @fizkhimfest, который делают коллеги из ИФХЭ #РАН, но нас опередили товарищи из Индикатора, так что просто дадим ссылку на интервью с создателем и "мотором" проекта.
Зоопарк это дело однозначно одобряет, ибо это и есть популяризация здорового человека - с одной стороны, от профессионалов, а не недоучек-с-ютубом, как это часто бывает, с другой - без духоты. Проект, кстати, ищет новых партнеров в регионах и не только, так что если кто хочет устроить у себя настоящий праздник химии - это ваш шанс
https://t.iss.one/indicator_news/16321
Давно уже хотели рассказать посетителям нашего Зоопарка о хорошем научпоп-проекте ФизХимФест @fizkhimfest, который делают коллеги из ИФХЭ #РАН, но нас опередили товарищи из Индикатора, так что просто дадим ссылку на интервью с создателем и "мотором" проекта.
Зоопарк это дело однозначно одобряет, ибо это и есть популяризация здорового человека - с одной стороны, от профессионалов, а не недоучек-с-ютубом, как это часто бывает, с другой - без духоты. Проект, кстати, ищет новых партнеров в регионах и не только, так что если кто хочет устроить у себя настоящий праздник химии - это ваш шанс
https://t.iss.one/indicator_news/16321
Telegram
Indicator.Ru
Популяризация здорового человека. Выпуск 1. ФизХимФест, «Живая Волга» и «золотая миля» Ленинского проспекта
Объединенная редакция порталов Indicator.Ru и Inscience.News в рамках Десятилетия науки и технологий запускает цикл бесед с руководителями научно…
Объединенная редакция порталов Indicator.Ru и Inscience.News в рамках Десятилетия науки и технологий запускает цикл бесед с руководителями научно…
#зоопарк_одобряет #дорогая_редакция
CP-TADF люминофоры, одновременно обладающие свойствами циркулярно-поляризованной люминесценции (CPL) и термо-активированной замедленной флюоресценции (TADF), очень привлекательны для создания материалов, но получать их нелегко.
Свежая работа химиков из ИНХ СО #РАН, НИОХ СО РАН @nioch_sb_ras (Новосибирск) и Китая - о том, как просто и эффективно решать эту проблему. Вводя фрагменты ментола (сравнительно дешевого хирального "строительного блока") в в дииминовые лиганды, они получили дифосфин-дииминовые комплексы меди -
недорогие и эффективные CP-TADF люминофоры с очень высоким квантовым выходом TADF. Высокая эффективность новых эмиттеров продемонстрирована в CP-TADF OLED устройствах: они испускают ярко-желтую CP-электролюминесценцию c рекордно-высоким |gEL| фактором (среди известных CP-OLEDs на основе меди).
Статья вышла в Angewandte Chemie (IF = 16.1) - это один из самых крутых химических журналов в мире
https://onlinelibrary.wiley.com/doi/10.1002/anie.202412437
CP-TADF люминофоры, одновременно обладающие свойствами циркулярно-поляризованной люминесценции (CPL) и термо-активированной замедленной флюоресценции (TADF), очень привлекательны для создания материалов, но получать их нелегко.
Свежая работа химиков из ИНХ СО #РАН, НИОХ СО РАН @nioch_sb_ras (Новосибирск) и Китая - о том, как просто и эффективно решать эту проблему. Вводя фрагменты ментола (сравнительно дешевого хирального "строительного блока") в в дииминовые лиганды, они получили дифосфин-дииминовые комплексы меди -
недорогие и эффективные CP-TADF люминофоры с очень высоким квантовым выходом TADF. Высокая эффективность новых эмиттеров продемонстрирована в CP-TADF OLED устройствах: они испускают ярко-желтую CP-электролюминесценцию c рекордно-высоким |gEL| фактором (среди известных CP-OLEDs на основе меди).
Статья вышла в Angewandte Chemie (IF = 16.1) - это один из самых крутых химических журналов в мире
https://onlinelibrary.wiley.com/doi/10.1002/anie.202412437
Wiley Online Library
Outstanding Circularly Polarized TADF in Chiral Cu(I) Emitters: From Design to Application in CP‐TADF OLEDs
Low-cost molecular emitters that merge circularly polarized luminescence (CPL) and thermally activated delayed fluorescence (TADF) properties are attractive for many high-tech applications. However, ...
#зоопарк_одобряет #дорогая_редакция
В молекулярной биологии широко используются флуоресцентные метки - это своего рода "трекеры", которые "навешивают" на разные объекты, чтобы следить за их поведением (например, как они распределяются в живых организмах). Один из многих вариантов - метки хромофора GFP, хороши они тем, что дают очень разные окраски и их легко "дорабатывать" - модифицировать под разные задачи.
Введение 1,4-диэтил-1,2,3,4-тетрагидрохиноксалинового фрагмента совместно с фиксирующей дифторборильной группой в арильную часть молекулы позволило получить pH-переключаемые флуорофоры с pKb в области биологических значений pH, что позволило использовать их в качестве селективных меток для окрашивания лизосом. А поскольку от полярности среды меняется и квантовый выход флуоресценции, это можно для использовать визуализации мембранных органелл в живой клетке.
Свежая работа биологов и химиков из ИБХ #РАН, сделанная совместно с американскими коллегами, опубликована в International Journal of Molecular Sciences (IF = 4.9)
https://www.mdpi.com/1422-0067/25/19/10448
В молекулярной биологии широко используются флуоресцентные метки - это своего рода "трекеры", которые "навешивают" на разные объекты, чтобы следить за их поведением (например, как они распределяются в живых организмах). Один из многих вариантов - метки хромофора GFP, хороши они тем, что дают очень разные окраски и их легко "дорабатывать" - модифицировать под разные задачи.
Введение 1,4-диэтил-1,2,3,4-тетрагидрохиноксалинового фрагмента совместно с фиксирующей дифторборильной группой в арильную часть молекулы позволило получить pH-переключаемые флуорофоры с pKb в области биологических значений pH, что позволило использовать их в качестве селективных меток для окрашивания лизосом. А поскольку от полярности среды меняется и квантовый выход флуоресценции, это можно для использовать визуализации мембранных органелл в живой клетке.
Свежая работа биологов и химиков из ИБХ #РАН, сделанная совместно с американскими коллегами, опубликована в International Journal of Molecular Sciences (IF = 4.9)
https://www.mdpi.com/1422-0067/25/19/10448
MDPI
Developing 1,4-Diethyl-1,2,3,4-tetrahydroquinoxalin-substituted Fluorogens Based on GFP Chromophore for Endoplasmic Reticulum and…
In the present study, we demonstrated that the introduction of a 1,4-diethyl-1,2,3,4-tetrahydroquinoxalin moiety into the arylidene part of GFP chromophore-derived compounds results in the formation of environment-sensitive fluorogens. The rationally designed…
#зоопарк_одобряет #дорогая_редакция
Разработка новых контрастируюших агентов для МРТ продолжается во многих группах по всему миру. Казанские химики из ИОФХ #РАН @IOPCArbuzov, КФУ @kznuniversity и КНИТУ-КХТУ совместно с биологами из КИББ РАН и ИЦиГ СО РАН @icgsoran (Новосибирск) создали бимодальные контрастеры, способные эффективно работать в режимах T1- и Т2-взвешенной МРТ. В основе - наночастицы оксида железа и ионы марганца (эта комбинация и дает эффект бимодальности), вокруг - силикатная оболочка, которую можно модицифировать под накопление в разных тканях - например, под кишечник, печень или и почки (на мышах, по крайней мере, это работает ок).
Работа опубликована в Journal of Alloys and Compounds (IF = 5.8)
https://www.sciencedirect.com/science/article/abs/pii/S0925838824031682
Разработка новых контрастируюших агентов для МРТ продолжается во многих группах по всему миру. Казанские химики из ИОФХ #РАН @IOPCArbuzov, КФУ @kznuniversity и КНИТУ-КХТУ совместно с биологами из КИББ РАН и ИЦиГ СО РАН @icgsoran (Новосибирск) создали бимодальные контрастеры, способные эффективно работать в режимах T1- и Т2-взвешенной МРТ. В основе - наночастицы оксида железа и ионы марганца (эта комбинация и дает эффект бимодальности), вокруг - силикатная оболочка, которую можно модицифировать под накопление в разных тканях - например, под кишечник, печень или и почки (на мышах, по крайней мере, это работает ок).
Работа опубликована в Journal of Alloys and Compounds (IF = 5.8)
https://www.sciencedirect.com/science/article/abs/pii/S0925838824031682
#зоопарк_одобряет #дорогая_редакция
Надоели боты, постящие в комментах ссылки на ресурсы о кетогенной диете? Ловите кое-что новенькое на эту тему от ученых.
Коллеги из МГУ, ИФАВ #РАН (Черноголовка) и Воронежского госуниверситета @vsumain изучили влияние кетогенной диеты (для непосвященных: это когда в еде преобладают жиры и белки и содержится минимальное количество углеводов) на транскриптом головного мозга крыс, микрофлору кишечника и всякие интересные параметры крови. Причем все эти изменения были изучены не только при самой диете, но и при экспериментально вызванном инсульте (сравнения ради).
Изучив экспрессию нескольких тысяч генов и сотен видов бактерий кишечника, исследователи показали, что такая диета, действительно, влияет на метаболизм клеток мозга, работу митохондрий и процесс воспаления. Сам инсульт изменял функционирование куда большего числа генов, что неудивительно для такой тяжелой патологии. К сожалению, направление изменений в экспрессии генов при диете во многих случаях совпадало с эффектами инсульта, поэтому неврологические проблемы, вызванные поражением мозга, при диете проявлялись еще сильнее. Хотя такая диета давно и довольно успешно применяется для лечения эпилепсии, при инсульте ее применять, очевидно, не стоит.
Статья опубликована в Brain, Behavior, and Immunity (IF = 8.8)
https://www.sciencedirect.com/science/article/abs/pii/S0889159124006457
(вот пока еще активная ссылка для бесплатного скачивания: https://authors.elsevier.com/a/1jvxO3AAzzl3Ov)
Надоели боты, постящие в комментах ссылки на ресурсы о кетогенной диете? Ловите кое-что новенькое на эту тему от ученых.
Коллеги из МГУ, ИФАВ #РАН (Черноголовка) и Воронежского госуниверситета @vsumain изучили влияние кетогенной диеты (для непосвященных: это когда в еде преобладают жиры и белки и содержится минимальное количество углеводов) на транскриптом головного мозга крыс, микрофлору кишечника и всякие интересные параметры крови. Причем все эти изменения были изучены не только при самой диете, но и при экспериментально вызванном инсульте (сравнения ради).
Изучив экспрессию нескольких тысяч генов и сотен видов бактерий кишечника, исследователи показали, что такая диета, действительно, влияет на метаболизм клеток мозга, работу митохондрий и процесс воспаления. Сам инсульт изменял функционирование куда большего числа генов, что неудивительно для такой тяжелой патологии. К сожалению, направление изменений в экспрессии генов при диете во многих случаях совпадало с эффектами инсульта, поэтому неврологические проблемы, вызванные поражением мозга, при диете проявлялись еще сильнее. Хотя такая диета давно и довольно успешно применяется для лечения эпилепсии, при инсульте ее применять, очевидно, не стоит.
Статья опубликована в Brain, Behavior, and Immunity (IF = 8.8)
https://www.sciencedirect.com/science/article/abs/pii/S0889159124006457
(вот пока еще активная ссылка для бесплатного скачивания: https://authors.elsevier.com/a/1jvxO3AAzzl3Ov)
#зоопарк_одобряет #дорогая_редакция
Расшифровка механизмов, регулирующих активность генов - одна из ключевых проблем современных молбиологии и генетики. Как показывают последние работы, геномных данных может быть недостаточно, и для решения задачи необходимы данные о экспрессии миллионов случайных регуляторных последовательностей, получаемые в ходе массовых экспериментов. В поисках способа, как работать с этой информацией, появился конкурс DREAM-2022.
Первое место заняла полносверточная нейросеть от российской команды autosome.ru с участниками из МГУ и двух институтов #РАН - белка (Пущино) и общей генетики (Москва). Они и вошли в число ключевых авторов работы, на днях опубликованной в Nature Biotechnology (IF = 33.1)
В работе организаторы конкурса вместе с авторами победившей архитектуры провели анализ решений, представленных в конкурсе, и показали, что метод на основе комбинации этих решений не только позволяет решать задачи наподобие исходных, но и в других задачах, связанных с эпигенетикой и регуляторной геномикой, показывает state-of-the-art результаты.
https://www.nature.com/articles/s41587-024-02414-w
Расшифровка механизмов, регулирующих активность генов - одна из ключевых проблем современных молбиологии и генетики. Как показывают последние работы, геномных данных может быть недостаточно, и для решения задачи необходимы данные о экспрессии миллионов случайных регуляторных последовательностей, получаемые в ходе массовых экспериментов. В поисках способа, как работать с этой информацией, появился конкурс DREAM-2022.
Первое место заняла полносверточная нейросеть от российской команды autosome.ru с участниками из МГУ и двух институтов #РАН - белка (Пущино) и общей генетики (Москва). Они и вошли в число ключевых авторов работы, на днях опубликованной в Nature Biotechnology (IF = 33.1)
В работе организаторы конкурса вместе с авторами победившей архитектуры провели анализ решений, представленных в конкурсе, и показали, что метод на основе комбинации этих решений не только позволяет решать задачи наподобие исходных, но и в других задачах, связанных с эпигенетикой и регуляторной геномикой, показывает state-of-the-art результаты.
https://www.nature.com/articles/s41587-024-02414-w
Nature
A community effort to optimize sequence-based deep learning models of gene regulation
Nature Biotechnology - A benchmarking competition improves tools that predict how regulatory regions control gene expression.
#зоопарк_одобряет #дорогая_редакция
Диаман или "двумерный алмаз" - новый углеродный материал, который имеет довольно любопытную структуру. Ее можно представить как два листа графена, которые под действием давления и температуры объединились ковалентными связями в алмазную решетку. Как и у графена, у него есть два основных направления решетки - зигзаг и кресло, а также промежуточные хиральные направления. Важнейшее же его отличие от графена - у него есть запрещенная зона.
В свежей работе из Уфы (Институт проблем сверхпластичности металлов #РАН, группа проф. Баимовой @budni_professora) впервые была исследована зависимость прочности диамана от направления растяжения.
При изменении направления от зигзага к креслу, происходит немонотонное увеличение прочности (максимум - при угле растяжения 10 градусов). Еще более интересно фазовое превращение, которое может происходить в процессе растяжения: например, диаман с хиральностью 5 градусов трансформируется в диаман с хиральностью 10. Скорее всего, этот параметр должен сказываться и на параметрах запрещенной зоны - а это уже интересно для применения этого материала в микроэлектронике.
Статья опубликована в Applied Surface Science (IF = 6.3)
https://www.sciencedirect.com/science/article/abs/pii/S0169433224021561
Диаман или "двумерный алмаз" - новый углеродный материал, который имеет довольно любопытную структуру. Ее можно представить как два листа графена, которые под действием давления и температуры объединились ковалентными связями в алмазную решетку. Как и у графена, у него есть два основных направления решетки - зигзаг и кресло, а также промежуточные хиральные направления. Важнейшее же его отличие от графена - у него есть запрещенная зона.
В свежей работе из Уфы (Институт проблем сверхпластичности металлов #РАН, группа проф. Баимовой @budni_professora) впервые была исследована зависимость прочности диамана от направления растяжения.
При изменении направления от зигзага к креслу, происходит немонотонное увеличение прочности (максимум - при угле растяжения 10 градусов). Еще более интересно фазовое превращение, которое может происходить в процессе растяжения: например, диаман с хиральностью 5 градусов трансформируется в диаман с хиральностью 10. Скорее всего, этот параметр должен сказываться и на параметрах запрещенной зоны - а это уже интересно для применения этого материала в микроэлектронике.
Статья опубликована в Applied Surface Science (IF = 6.3)
https://www.sciencedirect.com/science/article/abs/pii/S0169433224021561
#зоопарк_одобряет #дорогая_редакция
Металлическое стекло обладает уникальным набором свойств: прочностью, эластичностью, высоким пределом текучести, большими упругими деформациями, высокой твердостью. Проблема с получением новых вариантов этого типа материалов (то есть аморфных сплавов) заключается в том, что они образуются в: 1) многокомпонентных системах и 2) очень узком диапазоне концентраций, так что искать их обычным перебором - "скринингом" очень и очень трудно, а то и вовсе невозможно.
Ученые из Института металлургии УрО #РАН (Екатеринбург) создали новую теоретическую модель, которая позволяет предсказывать составы четырехкомпонентных стекол в системе Gd-Sc-Co-Al. Один из таких теоретически смоделированных вариантов стекла (Sc33Gd32Co19Al16) был впервые получен экспериментально - и он явно не последний, ибо модель позволяет найти множество новых материалов.
Результаты опубликованы в Intermetallics (IF = 4.3)
https://www.sciencedirect.com/science/article/abs/pii/S0966979524003418
Металлическое стекло обладает уникальным набором свойств: прочностью, эластичностью, высоким пределом текучести, большими упругими деформациями, высокой твердостью. Проблема с получением новых вариантов этого типа материалов (то есть аморфных сплавов) заключается в том, что они образуются в: 1) многокомпонентных системах и 2) очень узком диапазоне концентраций, так что искать их обычным перебором - "скринингом" очень и очень трудно, а то и вовсе невозможно.
Ученые из Института металлургии УрО #РАН (Екатеринбург) создали новую теоретическую модель, которая позволяет предсказывать составы четырехкомпонентных стекол в системе Gd-Sc-Co-Al. Один из таких теоретически смоделированных вариантов стекла (Sc33Gd32Co19Al16) был впервые получен экспериментально - и он явно не последний, ибо модель позволяет найти множество новых материалов.
Результаты опубликованы в Intermetallics (IF = 4.3)
https://www.sciencedirect.com/science/article/abs/pii/S0966979524003418
#зоопарк_одобряет #дорогая_редакция
Новая экспресс-методика биохимического анализа крови на основе ИК-спектроскопии и машинного обучения, не требующая реагентов? Нет, это не фантастика, это новая разработка Института спектроскопии #РАН (Троицк), ИТМО и их китайских коллег. Разработанный ими подход позволяет оценивать активность ферментов печени, уровень кальция, железа, холестерина и много чего еще. Для анализа нужно всего 2 мкл (микролитра) крови. Метод вполне может стать отличной альтернативой традиционным анализам, особенно в мобильных условиях, тем более что он занимает очень мало времени.
В настоящий момент успешные испытания прошли в 67ой ГКБ (Москва), идет подготовка к совместным исследованиям с Сеченовским Университетом и НИИ Склифосовского.
Статья опубликована в Spectrochimica Acta Part A: Molecular and Biomolecular Spectroscopy (IF = 4.3)
https://www.sciencedirect.com/science/article/abs/pii/S1386142524014495
Новая экспресс-методика биохимического анализа крови на основе ИК-спектроскопии и машинного обучения, не требующая реагентов? Нет, это не фантастика, это новая разработка Института спектроскопии #РАН (Троицк), ИТМО и их китайских коллег. Разработанный ими подход позволяет оценивать активность ферментов печени, уровень кальция, железа, холестерина и много чего еще. Для анализа нужно всего 2 мкл (микролитра) крови. Метод вполне может стать отличной альтернативой традиционным анализам, особенно в мобильных условиях, тем более что он занимает очень мало времени.
В настоящий момент успешные испытания прошли в 67ой ГКБ (Москва), идет подготовка к совместным исследованиям с Сеченовским Университетом и НИИ Склифосовского.
Статья опубликована в Spectrochimica Acta Part A: Molecular and Biomolecular Spectroscopy (IF = 4.3)
https://www.sciencedirect.com/science/article/abs/pii/S1386142524014495
#зоопарк_одобряет #дорогая_редакция
Коллеги из Института глазных болезней им. Краснова (Москва), КФУ @kznuniversity и Уфы (Институт биохимии и генетики #РАН) разработали клеточный краситель на основе неодима и с его помощью визуализировали в клетках ранее не описанные зоны накопления неорганического фосфата (Pi).
Pi играет ключевую роль в энергетическом обмене между клетками. Оригинальный метод визуализации Pi позволил исследователям описать особенности межклеточного энергетического транспорта, в том числе показав, что при апоптозе Pi через филоподии активнее передается от умирающих клеток к соседним здоровым. Возможность "подсветки" зон обмена Pi потенциально может помочь в создании методов точечного терапевтического воздействия на зоны с нарушенным энергетическим обменом, что актуально для лечения, например, таких заболеваний, как сердечная недостаточность и миопатии.
Статья вышла в International Journal of Molecular Sciences (IF = 4.9)
https://www.mdpi.com/1422-0067/25/20/11076
Коллеги из Института глазных болезней им. Краснова (Москва), КФУ @kznuniversity и Уфы (Институт биохимии и генетики #РАН) разработали клеточный краситель на основе неодима и с его помощью визуализировали в клетках ранее не описанные зоны накопления неорганического фосфата (Pi).
Pi играет ключевую роль в энергетическом обмене между клетками. Оригинальный метод визуализации Pi позволил исследователям описать особенности межклеточного энергетического транспорта, в том числе показав, что при апоптозе Pi через филоподии активнее передается от умирающих клеток к соседним здоровым. Возможность "подсветки" зон обмена Pi потенциально может помочь в создании методов точечного терапевтического воздействия на зоны с нарушенным энергетическим обменом, что актуально для лечения, например, таких заболеваний, как сердечная недостаточность и миопатии.
Статья вышла в International Journal of Molecular Sciences (IF = 4.9)
https://www.mdpi.com/1422-0067/25/20/11076
MDPI
Neodymium-Facilitated Visualization of Extreme Phosphate Accumulation in Fibroblast Filopodia: Implications for Intercellular and…
A comprehensive understanding of intercellular and cell–matrix interactions is essential for advancing our knowledge of cell biology. Existing techniques, such as fluorescence microscopy and electron microscopy, face limitations in resolution and sample preparation.…