Glob (science news, новости науки)
1.46K subscribers
454 photos
6 videos
40 files
899 links
Избранные статьи, видео и подкасты о физике, биологии, космосе
@globchan

По всем вопросам писать @twentydraft

P.S.
Часть тегов честно сжижена отсюда vk.com/advanced_biologist
Download Telegram
Меланома представляет собой злокачественное новообразование из пигментных клеток и наиболее опасную форму рака кожи. Ежегодно меланома поражает более 200 тысяч человек, свыше 50 тысяч из которых умирают. При этом основным способом ее диагностики является визуальный осмотр. Биопсия подозрительных новообразований подтверждает меланому лишь в 10 процентах случаев.

Чтобы восполнить пробел, ученые из Рокфеллеровского университета и других учреждений проанализировали базу данных из 120 фотоснимков новообразований (60 доброкачественных пигментных пятен и 60 меланом). С помощью компьютерных программ авторы отобрали 50 диагностических критериев, отличающих меланому, в том числе форму, размер, симметричность, соотношение цветов и другие.

Наиболее значимые параметры вошли в набор визуальных биомаркеров меланомы, который ученые использовали для обучения 13 различных алгоритмов. Их задачей было определить тип новообразования по соотношению критериев. Результат совместной работы алгоритмов выражался в количественной оценке Q от 0 до 1. Чем выше было значение, тем выше вероятность того, что на снимке меланома.

В ходе испытаний система сумела верно определить меланому в 98 процентах случаев. Однако специфичность оказалась невысокой: диагностика доброкачественных новообразований была проведена только в 36 процентах случаев. По словам исследователей, подобные значения чувствительности сопоставимы с показателем квалифицированного эксперта-дерматолога.

#ml #медицина
https://naked-science.ru/article/sci/neyroset-nauchili-ranney-diagnostike
Glob (science news, новости науки)
Меланома представляет собой злокачественное новообразование из пигментных клеток и наиболее опасную форму рака кожи. Ежегодно меланома поражает более 200 тысяч человек, свыше 50 тысяч из которых умирают. При этом основным способом ее диагностики является визуальный…
 По словам исследователей, подобные значения чувствительности сопоставимы с показателем квалифицированного эксперта-дерматолога.


Меня конечно несказанно радует любой прогресс в медицине (на мой взгляд врачевание - одна из самых важных, если не важнейшая естественная наука), особенно связанный с машинным обучением, однако тут надо понимать, что для обучения алгоритму нужна готовый набор "историй болезни" и диагнозов, которые составляются врачами-людьми. Которые совершают ошибки. А в силу того, что мы вряд ли сможем в ближайшее время позволить обучаться ИИ на живых людях, пробуя разный подходы, то следует ожидать того, что машинное обучение в медицине в ближайший десяток лет будет давать результаты в среднем не лучшие, чем дают хорошие врачи.


P.S.
Что меня ещё удивило, так это довольно высокие результаты работы экспертной системы после обучения на очень маленьком количестве примеров - всего 120 штук, хотя тут наверняка сыграло роль то, что основные признаки меланомы были известны заранее.
Ученые исследовали средиземноморских муравьев A.subterranea и A.senilis. Они собрали по несколько колоний каждого вида и поместили их в пластиковые коробки. Поотдаль от муравейников авторы работы устроили площадку, на которой поставили емкость с жидкостью (водой, медом или медом, разведенным с водой). На небольшом расстоянии от нее исследователи разложили потенциальные орудия для сбора и транспортировки пищи. Среди них были не только природные — хвоинки, кусочки листьев, песчинки или комочки земли, но и сделанные человеком, такие как кусочки губки, искусственной пены, бумаги или полиэтиленовой пленки. В ходе экспериментов ученые сравнивали, какие предметы муравьи «тестировали», то есть обмакивали в жидкость, а какие — транспортировали в муравейник.

Оказалось, что муравьи выбирали для транспортировки жидкостей подручные средства с лучшими впитывающими свойствами. Их выбор зависел и от вязкости жидкости. Интересно, что насекомые выбирали как предметы, встречающиеся в природе, так и артефакты, с которыми они раньше не сталкивались. Так, муравьи A.subterranea для чаще всего выбирали для «тестирования» маленькие комочки земли и хвойные иголки, а в муравейник они чаще тащили кусочки губки, если нужно было собрать мед, и комочки земли в случае, если транспортировали мед с водой. Особи A.senilis предпочитали относить в гнездо кусочки бумаги и губки, пропитанные сладким раствором. При этом сначала для «тестирования» они выбирали известные им природные объекты, и только после нескольких попыток «переключались» на куски бумаги и губки.

#биология #муравьи
https://nplus1.ru/news/2016/12/30/Aphaenogaster
С новым годом!
Среди разнообразных итогов года, которые появлялись в конце декабря в научных и научно-популярных СМИ, наше внимание привлёк один коротенький список на портале LiveScience, состоящий всего из пяти пунктов. Дело в том, что список этот касается очень интересной, но при том малоизвестной стороны науки – не в том смысле, что о ней никому не дают узнать, просто обычно подобные вещи проходят мимо нашего внимания.

Речь идёт об отозванных научных публикациях. Что имеется в виду? Как известно, любая научная статья проходит перед публикацией через целый ряд проверок: её рассматривают редакторы журнала и сторонние рецензенты, выискивают ошибки везде, где только можно, от оформления до логики рассуждений, сообщают о них авторам, авторы их исправляют, дальше цикл повторяется. Но вот, наконец, статья опубликована – результаты работы исследователей представлены всему научному сообществу. И дальше уже сообщество само решает, что делать с новой информацией, считать ли её важной, или второстепенной, или какой-то ещё; однако в научности того, что написано в статье, сомневаться не принято.

Но это в идеале. Бывает, что в публикацию закрадывается ошибка, пусть и непреднамеренная, но довольно крупная, из-за которой всё изложенное в статье просто не соответствует действительности – рассуждения и интерпретации экспериментов можно выбросить на помойку. Ошибку может заметить сам автор или же кто-то из внимательных читателей (или же кто-то, кто решил воспроизвести результаты) – в таком случае тот, кто писал статью, заявляет о её отзыве, и журнал сообщает об этом своей аудитории. Образно говоря, бывшее становится небывшим – публикация перестаёт существовать, на неё не ссылаются, её никто не используют в собственной работе.

И бывает второй случай, к сожалению, намного более распространённый – обычный подлог. Исследователь или группа исследователей просто-напросто врут ради броского результата, ради того, чтобы заявить о феноменальном открытии. И тут авторы, понятно, сами уже ничего не отзывают, вся надежда остаётся на внимательных читателей, которые сообщают в редакцию журналу, что? они опубликовали, и журнал сам принимает решение объявить статью несуществующей.

В одном из исследований, посвящённых проблеме научного мошенничества, говорится, что только 20% подобных работ оказываются отозванным из-за «честной ошибки», в то время как 70% – это именно что натуральное враньё. Специальный ресурс под названием Retraction Watch, существующий с 2010 года, как раз ведёт учёт всех случаев отзыва статей, среди которых порой можно найти настолько удивительные примеры беспардонной наглости и глупости, что чувство неловкости за тех, кто идёт на такое, уступает место смеху.

#публикации #журналистика #псевдонаука
https://telegra.ph/Распубликуйте-это-01-07
Очередная замечательная статья от Русского Доктора В Тропиках

В крещенские морозы ничто не согревает так, как воспоминания о тропиках. Сегодня решил поностальгировать по Латинской Америке, в которую частенько наведываюсь со своим давним компаньоном проф. Ю. Н. Сидельниковым. Неотропики потрясают своим биоразнообразием, всего одним постом не объять. Так что остановлюсь, пожалуй, на бабочках и на явлении мимикрии.

В неотропиках всюду сталкиваешься с двумя формами мимикрии у бабочек — бейтсовской и мюллеровской.

Бейтсовская мимикрия — феномен эволюционного развития внешнего сходства (мимикрии) у съедобных форм в подражание ядовитым видам. Впервые эту мимикрию описал в 1852 году Генри Уолтер Бейтс. Смысл такой мимикрии понятен, но когда наблюдаешь её воочию — удивлению нет предела: настолько велико кажущееся сходство!

#botalex #биология #бабочки #мимикрия
https://telegra.ph/О-мимикрии-01-09
В казино Rivers, которое находится в Питтсбурге (США), стартовал 20-дневный покерный турнир «Brains Vs. Artificial Intelligence: Upping the Ante». В турнире принимает участие программа Libratus, разработанная в Университете Карнеги — Меллона, а также четыре профессиональных игрока в покер. Игры будут проходить с 19:00 до 03:00 по московскому времени, прямая трансляция через Twitch доступна на сайте казино.

В последнее время наработки в области машинного обучения позволили компьютерам значительно продвинуться вперед и обыграть людей в играх, в которых это традиционно считалось невозможным. Например, в прошлом году программа AlphaGo «победила человечество в го», выиграв у одного из сильнейших игроков в мире. Однако го, в отличие от покера, представляет категорию игр с полной информацией. В играх с неполной информацией люди по-прежнему лидируют, поэтому однозначно предсказать результат назначенного турнира по техасскому холдему нельзя — в 2015 году программа Claudico играла с четырьмя профессиональными игроками и заняла третье место. На протяжении двух недель было сыграно 80000 раздач и из четырех хайроллеров только один набрал меньше фишек, чем компьютер.

Новую программу Libratus разработали Туомас Сэндхолм и Ноам Браун. В пресс-релизе университета не раскрывается подробностей создания компьютерного игрока в покер, однако, судя по всему, разработчики использовали методы машинного обучения — они отмечают, что при создании Libratus вычисления заняли 15 миллионов ядро-часов, в то время как на Claudico ушло два-три миллиона. Кроме предварительной подготовки у Libratus также будет доступ к суперкомпьютеру во время игры — для этого будет использован Bridges из Питтсбургского суперкомпьютерного центра.

#ии #ml #покер
https://telegra.ph/Nachalsya-turnir-po-pokeru-mezhdu-lyudmi-i-II-01-11
Океан таит в себе немало крайне странных созданий, но обычно они живут на большой глубине, где огромное давление и экстремальные условия создают настоящих монстров. Но герой этого ролика не таков. Он живет на глубине 10−40 метров, но встречается и на 6 метрах.

Этого хищного многощетинкового червя зовут Eunice aphroditois. На ранних стадиях развития это червяк длиной всего 100 мм, но растет он быстро и часто достигает размера 2−3 метров (хотя в среднем размеры Eunice aphroditois примерно 1 метр в длину). Червь прячется на дне, и атакует проплывающих мимо рыб с такой силой и скоростью, что иногда сразу разрезает жертву пополам. Вдобавок, он еще и ядовитый, его токсин парализует или сразу убивает рыбу.

Известные случаи, когда Eunice aphroditois случайно попадал в аквариумы вместе с гравием или камнями. Так в 2009 году в океанариуме Корнуолла кто-то начал уничтожать морских рыб, и пришлось разобрать всю выставку, прежде чем червя нашли. На него не действовали ловушки, он легко перекусывал рыбные лески и глотал крючки. Червь получил кличку Барри, и отправился в отдельный аквариум.

Неофициально Eunice aphroditois получил название червь Боббита по фамилии Лорены Боббит, главной фигурантки нашумевшего дела 1996 года, которая отрезала пенис своему мужу. Eunice aphroditois получил такую кличку из-за своих острых и мощных челюстей, но никаких свидетельств о том, что представители его вида когда-либо нападали на проплывающих над ним людей нет.

#биология #челюсти
https://telegra.ph/Ataka-trehmetrovogo-chervya-samyj-zhutkij-podvodnyj-hishchnik-01-14
Инженеры Европейского лазера на свободных электронах запустили (European-XFEL) первые электроны в охлажденный основной ускорительный комплекс прибора. На протяжении следующих недель и месяцев прибор секция-за-секцией будет вводиться в эксплуатацию. По своим характеристикам XFEL должен превзойти синхротронные источники излучения. Основными его применениями станут исследования сверхбыстрых химических реакций, анализ структуры белков и других наноразмерных объектов. Проект реализуется 11 странами, основной вклад среди которых принадлежит Германии и России. Об этом сообщает пресс-релиз организации.

Лазеры на свободных электронах — сверхъяркие источники рентгеновского излучения, использующиеся для анализа атомарной структуры вещества. Это возможно благодаря очень малой длине волны рентгеновскго излучения — сопоставимой или меньшей размера атомов. Из-за этого кристалл с упорядоченно расположенными атомами выступает для рентгеновского луча в роли дифракционной решетки: по характерной «пятнистой» картине рассеяния рентгена можно с большой точностью восстановить расположение атомов в веществе.

#физика #лазер
https://telegra.ph/V-krupnejshem-lazere-na-svobodnyh-ehlektronah-zapustili-pervye-puchki-01-20
Инъекция кисспептина усиливает активность «любовных» отделов головного мозга в ответ на сексуальные стимулы, сообщают ученые из Имперского колледжа в Лондоне. В будущем это открытие может быть использовано для лечения людей с психосексуальными расстройствами. Работа исследователей опубликована в журнале Journal of Clinical Investigation.

Белок кисспептин, который кодируется геном KISS-1, был открыт учеными в 1996 году. Изначально исследователи рассматривали его как супрессор роста метастазов при меланоме и раке груди, однако позднее выяснилось, что он играет важную роль в «запуске» процесса полового созревания и в дальнейшем регулирует работу репродуктивной системы человека. Кисспептин стимулирует работу клеток гипоталамуса, которые вырабатывают рилизинг-гормонгонадолиберин. Он, в свою очередь, влияет на выработку лютеинизирующего и фолликулостимулирующего гормонов, регулирующих работу половых желез и процесс созревания половых клеток.

Магнитно-резонансная томография показала, что кисспептин усилил реакцию лимбических структур мозга в ответ на эротические изображения и фотографии счастливых пар. В частности, повышенная активность наблюдалась в областях, связанных с сексуальным возбуждением и романтическими переживаниями, — в передней и задней поясной извилине, а также левой миндалине. При просмотре несексуальных изображений подобный эффект не наблюдался.Добровольцы также дополнительно проходили опрос, который исследует отношение к сексу и сексуальное возбуждение человека как с психологической, так и с физиологической точки зрения. Тест показал, что чем больше кисспептин повышал активность некоторых лимбических структур, тем меньше отвращения испытуемые испытывали к сексу. Стоит отметить, что «отвращение» — это лишь одна из переменных анкеты, которая вовсе не подразумевает, что все добровольцы изначально страдали психосексуальным расстройством и ощущали неприязнь к сексу

Таким образом, работа ученых показывает, что кисспептин может играть определенную роль в стимулировании эмоций и реакций, заставляющих людей заниматься сексом и размножаться. Тем не менее, исследование находится только на начальном этапе: в будущем ученые планируют проанализировать эффекты, вызываемые кисспептином, на более крупной группе людей, которая будет включать не только мужчин, но и женщин. Особенно нейрофизиологов интересует, может ли этот белок помочь с психосексуальными расстройствами и проблемами, связанными с зачатием ребенка.

#биология #весна #гормоны
https://telegra.ph/Uchenye-usilili-aktivnost-lyubovnyh-otdelov-mozga-inekciej-01-25
"Квантовая неопределенность" от ПостНауки
Физик Алексей Акимов о преобразовании Фурье, перепутанных частицах и измерениях в квантовой механике .

#квантмех #физика #аудио #подкаст
Как всегда прекрасная статья от #batrachospermum

Многим известна чудесная способность мимозы стыдливой (Mimosa pudica) складывать листики в ответ на вторжение в ее личное пространство. Конечно, реакция эта вовсе не означает, что ей стыдно, скорее таким образом она «группируется» для защиты. А маньяк, который преследует растения в видеоролике, довольно изобретателен в своих атаках: то он нежен, то агрессивен, то дружески щипает мимозу, то вражески поджигает. Только пусть не думает, что это все сойдет ему с рук. Мимоза его запомнит и отомстит, насмерть завоняв.


По-научному движения органов растения в ответ на прикосновение называются тигмонастией. То же слово используется, когда заходит речь об обвивании какой-нибудь лозой предмета, который попадается ей на пути. Механизм этих настических движений основан на изменении тургорного давления в растительных клетках, а вот как возникла тигмонастия и зачем – тут можно строить разные догадки. То ли таким образом растение привыкло защищаться от дождя, то ли сбрасывать насекомых-вредителей. А может, своими движениями оно хочет напугать травоядную тварь, посмевшую к ней прикоснуться? Хочешь листик слопать – а он движется, будто животное! Больше не хочешь.

Различают и другие настии в зависимости от стимула – так, стыдливой мимозе свойственны сейсмонастия (ответ на сотрясение и вибрации) и термонастия (ответ на изменение температуры). Однажды биолог Моника Гальяно из Университета Западной Австралии настолько измотала 56 мимоз сейсмонастиями, что некоторые из них продемонстрировали то, что применительно к животным мы назвали бы памятью. Горшки с мимозами устанавливались в специальный девайс, позволявший быстро опускать растения на 15 см вдоль вертикальной рейки, приземляя в мягкий пенистый субстрат, смягчающий посадку и предотвращающий подпрыгивания. Каждое из них опускалось 60 раз с интервалами в 5 секунд. Скорость опусканий была достаточной, чтобы вызвать защитную реакцию, и все растения стабильно ее демонстрировали. Но в какой-то момент – некоторые уже после четырех, пяти и шести падений – мимозы вдруг перестали складывать листики, словно поняли, что никакой угрозы в данных упражнениях нет.

#биология #мимоза #растения
https://telegra.ph/Stydlivaya-mimoza-zapominaet-opuskaniya-i-besstydno-bzdit-01-28
Небольшой перевод специально для канала

Бактерия, вызывающая пищевое отравление, пытается влиять на поведение мыши

Во время пищевого отравления последнее, о чём мы думаем — это еда. Однако последние исследования показали, что те же бактерии, что вызывают недомогание, также повышают аппетит подопытных мышей. Исследователи утверждают, что они могли бы использовать этот эффект для нормализации пищевого поведения больных раком и пожилых людей, которые часто теряют тягу к еде.

Имунномикробиолог Жанель Айрес (Janelle Ayres) с коллегами из Института Биологических Исследований Сан Диего попытались выяснить как недоедание влияет на штамм сальмонеллы, часто вызывающей смерть у грызунов и пищевое отравление у людей. После заражения мышей микробами, команда Айрес обнаружила влияние бактериального белка SlrP на степень опасности заболевания. Чем меньше бактерии производили этот белок, тем чаще умирали подопытные мыши. Также, при заражении бактериями, не продуцирующими SlrP, зафиксировано существенное снижение аппетита по сравнению с сородичами, заражёнными обычными бактериями.

#биология #медицина #бактерия #перевод
https://telegra.ph/Bakteriya-vyzyvayushchaya-pishchevoe-otravlenie-pytaetsya-vliyat-na-povedenie-myshi-01-29