У привитых от гриппа вероятность развития тяжёлой COVID-19 на 89% ниже в краткосрочной перспективе, чем у непривитых от вируса гриппа и от SARS-СoV-2
Подробности исследования в Катаре [1, 2]:
— Выборка: изучались данные 30.774 медицинских работников до начала вакцинации от COVID-19. Далее исследователи сопоставили данные 518 заражённых SARS-СoV-2 средним возрастом 36 лет с данными более 2.000 незаражённых средним возрастом 35 лет.
— Вакцина: инактивированная четырёхвалентная вакцина против гриппа «Abbott Influvac Tetra».
— Результаты: привитые от гриппа и не привитые от COVID-19 на 29,7% реже заражались COVID-19, а при заражении SARS-СoV-2 и госпитализации у них на 88,9% реже развивалась тяжёлая или критическая COVID-19, чем у не привитых от гриппа и от COVID-19. Но неизвестно, как долго длится этот защитный эффект, скорее всего, он недолгий, не более нескольких месяцев или даже нескольких недель.
Почему такие результаты?
1. «Эффект здорового человека». На первый взгляд может показаться, что причина может быть именно в лучшей заботе о собственном здоровье у привитых от гриппа по сравнению с непривитыми. Например, первые могли лучше заботиться о профилактике в повседневной жизни, носить маски и респираторы, реже посещать людные места и закрытые помещения с плохой вентиляцией и т.д., в итоге получать меньше вирусной нагрузки при заражении. Чтобы избежать «эффекта здорового человека», команда исследователя включила в выборку только медицинских работников, у которых меньше различий в поведении, связанных с собственным здоровьем, чем у любых молодых людей. Но это не решает проблемы предвзятости полностью.
2. Случайность и статистическая погрешность. Однако к подобным выводам о защитном эффекте вакцины от гриппа от COVID-10 приходили и в большинстве других исследований (ссылки от 3 до 12 в источнике 1), изучавших этот же вопрос. Например, в рандомизированном плацебо-контролируемом исследовании (РКИ) в Бразилии, где старались полностью исключить «эффект здорового человека» [3].
3. Широкая иммунная реакция у вакцинированных от гриппа, которая помогает снизить риск развития тяжёлой COVID-19. Вакцина от гриппа положительно влияет на способность организма формировать цитокиновый ответ на инфекцию. Это было установлено как раз в том бразильском РКИ, которое я разбирал выше. А как известно, SARS-СoV-2 сбивает цитокиновый ответ организма, чем может спровоцировать осложнения и тяжёлую форму COVID-19 [3, 4].
Ограничение исследования: нельзя предсказать, как сильно изменится влияние вакцины от гриппа при распространении омикрон-варианта SARS-CoV-2, поскольку сравнивались данные медицинских работников до распространения вакцин от COVID-19 и до распространения многих опасных вариантов SARS-СoV-2.
Тем не менее не стоит спешить с выводами и исключать вариант предвзятости из-за какой-то переменной, которую могли не учесть и которая очень сильно повлияла на результаты. Однако сам факт огромной разницы в развитии тяжёлой формы COVID-19 между привитыми и не привитыми от гриппа делает это исследование очень интересным. Поэтому после рассказа про него в новостном отделе журнала Nature я решил разобрать его для вас. Если окажется хотя бы частично верна гипотеза, что вакцина от гриппа, положительно влияя на цитокиновый ответ, сильно защищает от тяжёлой COVID-19, то в перспективе это может спасти сотни тысяч жизней по всему миру.
Источники:
1. MedRxiv (10.05.22, исследование в Катаре)
2. Nature News (16.05.22, разбор исследования в Катаре)
3. PLOS Pathogens (25.10.21, исследование в Бразилии)
4. https://t.iss.one/eugenes_notes/124 (SARS-CoV-2 сбивает иммунную реакцию, что объясняет некоторые важные особенности COVID-19)
Поблагодарить за интересный разбор: 5536 9138 3126 6560
Подробности исследования в Катаре [1, 2]:
— Выборка: изучались данные 30.774 медицинских работников до начала вакцинации от COVID-19. Далее исследователи сопоставили данные 518 заражённых SARS-СoV-2 средним возрастом 36 лет с данными более 2.000 незаражённых средним возрастом 35 лет.
— Вакцина: инактивированная четырёхвалентная вакцина против гриппа «Abbott Influvac Tetra».
— Результаты: привитые от гриппа и не привитые от COVID-19 на 29,7% реже заражались COVID-19, а при заражении SARS-СoV-2 и госпитализации у них на 88,9% реже развивалась тяжёлая или критическая COVID-19, чем у не привитых от гриппа и от COVID-19. Но неизвестно, как долго длится этот защитный эффект, скорее всего, он недолгий, не более нескольких месяцев или даже нескольких недель.
Почему такие результаты?
1. «Эффект здорового человека». На первый взгляд может показаться, что причина может быть именно в лучшей заботе о собственном здоровье у привитых от гриппа по сравнению с непривитыми. Например, первые могли лучше заботиться о профилактике в повседневной жизни, носить маски и респираторы, реже посещать людные места и закрытые помещения с плохой вентиляцией и т.д., в итоге получать меньше вирусной нагрузки при заражении. Чтобы избежать «эффекта здорового человека», команда исследователя включила в выборку только медицинских работников, у которых меньше различий в поведении, связанных с собственным здоровьем, чем у любых молодых людей. Но это не решает проблемы предвзятости полностью.
2. Случайность и статистическая погрешность. Однако к подобным выводам о защитном эффекте вакцины от гриппа от COVID-10 приходили и в большинстве других исследований (ссылки от 3 до 12 в источнике 1), изучавших этот же вопрос. Например, в рандомизированном плацебо-контролируемом исследовании (РКИ) в Бразилии, где старались полностью исключить «эффект здорового человека» [3].
3. Широкая иммунная реакция у вакцинированных от гриппа, которая помогает снизить риск развития тяжёлой COVID-19. Вакцина от гриппа положительно влияет на способность организма формировать цитокиновый ответ на инфекцию. Это было установлено как раз в том бразильском РКИ, которое я разбирал выше. А как известно, SARS-СoV-2 сбивает цитокиновый ответ организма, чем может спровоцировать осложнения и тяжёлую форму COVID-19 [3, 4].
Ограничение исследования: нельзя предсказать, как сильно изменится влияние вакцины от гриппа при распространении омикрон-варианта SARS-CoV-2, поскольку сравнивались данные медицинских работников до распространения вакцин от COVID-19 и до распространения многих опасных вариантов SARS-СoV-2.
Тем не менее не стоит спешить с выводами и исключать вариант предвзятости из-за какой-то переменной, которую могли не учесть и которая очень сильно повлияла на результаты. Однако сам факт огромной разницы в развитии тяжёлой формы COVID-19 между привитыми и не привитыми от гриппа делает это исследование очень интересным. Поэтому после рассказа про него в новостном отделе журнала Nature я решил разобрать его для вас. Если окажется хотя бы частично верна гипотеза, что вакцина от гриппа, положительно влияя на цитокиновый ответ, сильно защищает от тяжёлой COVID-19, то в перспективе это может спасти сотни тысяч жизней по всему миру.
Источники:
1. MedRxiv (10.05.22, исследование в Катаре)
2. Nature News (16.05.22, разбор исследования в Катаре)
3. PLOS Pathogens (25.10.21, исследование в Бразилии)
4. https://t.iss.one/eugenes_notes/124 (SARS-CoV-2 сбивает иммунную реакцию, что объясняет некоторые важные особенности COVID-19)
Поблагодарить за интересный разбор: 5536 9138 3126 6560
Nature
Flu vaccine could cut COVID risk
Nature - Health-care workers who got the influenza vaccine were also protected from COVID-19 — but the effect might not last long.
👍48🔥7❤4
Небольшая заметка для читающих на английском.
• Сборник про оспу постоянно обновляется, уже внесены изменения за 27 мая. Сперва они появляются в английской версии на моей страничке на медиуме: Monkeypox outbreak outside of Africa — up to date updates, в течение следующих нескольких часов добавляю их в русскую версию.
• Начал разбор про патогены, которые могут считаться потенциальным биооружием и про критерии определения этих патогенов. Если интересно, можете прочитать работу в оригинале: Beyond the Dirty Dozen: A Proposed Methodology for Assessing Future Bioweapon Threats (Military Medicine / Oxford Academic).
• Сборник про оспу постоянно обновляется, уже внесены изменения за 27 мая. Сперва они появляются в английской версии на моей страничке на медиуме: Monkeypox outbreak outside of Africa — up to date updates, в течение следующих нескольких часов добавляю их в русскую версию.
• Начал разбор про патогены, которые могут считаться потенциальным биооружием и про критерии определения этих патогенов. Если интересно, можете прочитать работу в оригинале: Beyond the Dirty Dozen: A Proposed Methodology for Assessing Future Bioweapon Threats (Military Medicine / Oxford Academic).
👍40
Какие патогены подходят на роль биологического оружия и какие критерии их оценки?
Как и просили, разбираю эту тему. Знали про омский вирус? Точнее, про вирус омской геморрагической лихорадки. А про вирус Конго-крымской геморрагической лихорадки? Ниже вы найдёте два различных списка патогенов, которые гипотетически могут подойти на роль биооружия. Но главная главная цель статьи вовсе не в этом!
Моя цель — за небольшое количество символов показать, что тема биологического оружия сложнее, чем может показаться. И тем самым понизить восприимчивость к разного рода мифам вокруг темы биооружия, лабораторных утечек и подобного.
Сперва мы возьмём открытую рецензированную научную работу на тему биологического оружия из Oxford University Press. Разберем 12 критериев оценки патогенов, которые потенциально подходят на роль биооружия. Увидим оценку опасных патогенов по этим критериям. И по ним же — оценку SARS-СoV-2 на роль потенциального биологического оружия. А затем я введу ещё всего 2 важных критерия и мы увидим, как сильно их учёт меняет картину вокруг биооружия…
Читать: https://telegra.ph/Kakie-patogeny-podhodyat-na-rol-biologicheskogo-oruzhiya-05-31
Благодарю за помощь Андрея, Ксению и трёх людей, чьё имя не отобразилось при пересылке донатов за 26–31 мая. Ваша помощью помогает мне делать больше материалов или браться за разбор сложных тем. Поблагодарить за проделанную работу: 5536 9138 3126 6560
Как и просили, разбираю эту тему. Знали про омский вирус? Точнее, про вирус омской геморрагической лихорадки. А про вирус Конго-крымской геморрагической лихорадки? Ниже вы найдёте два различных списка патогенов, которые гипотетически могут подойти на роль биооружия. Но главная главная цель статьи вовсе не в этом!
Моя цель — за небольшое количество символов показать, что тема биологического оружия сложнее, чем может показаться. И тем самым понизить восприимчивость к разного рода мифам вокруг темы биооружия, лабораторных утечек и подобного.
Сперва мы возьмём открытую рецензированную научную работу на тему биологического оружия из Oxford University Press. Разберем 12 критериев оценки патогенов, которые потенциально подходят на роль биооружия. Увидим оценку опасных патогенов по этим критериям. И по ним же — оценку SARS-СoV-2 на роль потенциального биологического оружия. А затем я введу ещё всего 2 важных критерия и мы увидим, как сильно их учёт меняет картину вокруг биооружия…
Читать: https://telegra.ph/Kakie-patogeny-podhodyat-na-rol-biologicheskogo-oruzhiya-05-31
Благодарю за помощь Андрея, Ксению и трёх людей, чьё имя не отобразилось при пересылке донатов за 26–31 мая. Ваша помощью помогает мне делать больше материалов или браться за разбор сложных тем. Поблагодарить за проделанную работу: 5536 9138 3126 6560
Telegraph
Какие патогены подходят на роль биологического оружия?
Знали про омский вирус? Точнее, про вирус омской геморрагической лихорадки. А про вирус Конго-крымской геморрагической лихорадки? Ниже вы найдёте два различных списка патогенов, которые гипотетически могут подойти на роль биооружия. Но главная главная цель…
👍39🔥8❤3
Конспекты Юджина 📗 pinned «Вспышка оспы обезьян за пределами Африки [сборник] Уже зафиксировано порядка 200 около 2000 случаев заражения обезьяньей оспы в Европе, Азии, Америке и Австралии. Примерно половина случаев подтверждена, оставшаяся половина требует подтверждения. Причем вирус…»
Младенцы привитых от COVID-19 матерей в полтора раза реже заражаются омикроном, чем у непривитых. Исследование в Норвегии
Антитела против SARS-CoV-2 могут передаваться от матери к ребёнку как через кровь во время беременности, так и через молоко во время грудного вскармливания. А поскольку антитела могут быть первым барьером приобретённого иммунитета на пути вируса, то у людей с антителами к SARS-СoV-2 ожидается меньшее количество заражений. Исследователи из Норвегии решили отследить влияние вакцины от COVID-19 у беременных матерей на количество заражений SARS-СoV-2 у рождённых ими детей.
— Время исследования: с 1 сентября 2021 г. по 28 февраля 2022 года (во время распространения дельта, а затем омикрона).
— Выборка: 21.643 младенцев, при этом 9.739 младенцев (45,0%) рождены от привитых во время беременности женщинами двумя или тремя дозами вакцины на основе мРНК от COVID-19. Из них 906 детей (4,1%) заразились SARS-CoV-2 в течение первых 4 месяцев жизни.
— Вакцина: на основе мРНК, беременные прививались во втором и третьем триместрах беременности.
Результаты
Дельта и омикрон. Насколько реже дети вакцинированных матерей заражались SARS-CoV-2 по сравнению с детьми невакцинированных матерей:
— во время дельта: в ~3 раза (HR 0,29) реже;
— во время омикрона: в ~1,5 раза (HR 0,67) реже.
Одна, две и три дозы вакцины. А теперь сравним распространённость SARS-СoV-2 среди детей беременных матерей, получавших одну, две и три дозы вакцины во время распространения омикрона и сравним с ситуацией у невакцинированных матерей:
— 1 доза: на 1/3 (28%, HR 0,72) реже, чем у невакцинированных матерей;
— 2 дозы: в ~1,5 раза (HR 0,67) реже;
— 3 дозы: в ~5 раз (HR 0,22) реже.
Источник: JAMA Internal Medicine (01.06.22)
Поблагодарить: 5536 9138 3126 6560
Антитела против SARS-CoV-2 могут передаваться от матери к ребёнку как через кровь во время беременности, так и через молоко во время грудного вскармливания. А поскольку антитела могут быть первым барьером приобретённого иммунитета на пути вируса, то у людей с антителами к SARS-СoV-2 ожидается меньшее количество заражений. Исследователи из Норвегии решили отследить влияние вакцины от COVID-19 у беременных матерей на количество заражений SARS-СoV-2 у рождённых ими детей.
— Время исследования: с 1 сентября 2021 г. по 28 февраля 2022 года (во время распространения дельта, а затем омикрона).
— Выборка: 21.643 младенцев, при этом 9.739 младенцев (45,0%) рождены от привитых во время беременности женщинами двумя или тремя дозами вакцины на основе мРНК от COVID-19. Из них 906 детей (4,1%) заразились SARS-CoV-2 в течение первых 4 месяцев жизни.
— Вакцина: на основе мРНК, беременные прививались во втором и третьем триместрах беременности.
Результаты
Дельта и омикрон. Насколько реже дети вакцинированных матерей заражались SARS-CoV-2 по сравнению с детьми невакцинированных матерей:
— во время дельта: в ~3 раза (HR 0,29) реже;
— во время омикрона: в ~1,5 раза (HR 0,67) реже.
Одна, две и три дозы вакцины. А теперь сравним распространённость SARS-СoV-2 среди детей беременных матерей, получавших одну, две и три дозы вакцины во время распространения омикрона и сравним с ситуацией у невакцинированных матерей:
— 1 доза: на 1/3 (28%, HR 0,72) реже, чем у невакцинированных матерей;
— 2 дозы: в ~1,5 раза (HR 0,67) реже;
— 3 дозы: в ~5 раз (HR 0,22) реже.
Источник: JAMA Internal Medicine (01.06.22)
Поблагодарить: 5536 9138 3126 6560
👍37❤6
Почему нельзя просто так взять и обновить вакцину под новый вариант SARS-СoV-2 как в случае с гриппом?
Создатели «Спутника», скорее всего, не планируют в ближайшее время обновлять вакцину для более эффективной защиты от омикрона. Компании Pfizer и Moderna готовят обновления своих вакцин под омикрон BA.1, но и там есть свои сложности. Рассказ будет состоять из двух частей. Сперва расскажу, как обновляют вакцины от гриппа, сравню ситуацию с вакцинами от COVID-19. А затем расскажу про способы решения ситуации с обновлением вакцин.
Читать: https://telegra.ph/Pochemu-nelzya-prosto-tak-vzyat-i-obnovit-vakcinu-pod-novyj-variant-SARS-SoV-2-kak-v-sluchae-s-grippom-06-05
Особенное спасибо за донат Виктору! А также спасибо ещё четырём людям, чьё имя не отобразилось при пересылке, благодаря вам я могу делать публикации чаще. Напоминаю, что если вы помогаете каналу, то можете написать мне в личку @eugene_time, попросить указать ваше имя при благодарности или по мере возможности персонально для вас разобрать какую-то тему. Поблагодарить за разбор: 5536 9138 3126 6560
Создатели «Спутника», скорее всего, не планируют в ближайшее время обновлять вакцину для более эффективной защиты от омикрона. Компании Pfizer и Moderna готовят обновления своих вакцин под омикрон BA.1, но и там есть свои сложности. Рассказ будет состоять из двух частей. Сперва расскажу, как обновляют вакцины от гриппа, сравню ситуацию с вакцинами от COVID-19. А затем расскажу про способы решения ситуации с обновлением вакцин.
Читать: https://telegra.ph/Pochemu-nelzya-prosto-tak-vzyat-i-obnovit-vakcinu-pod-novyj-variant-SARS-SoV-2-kak-v-sluchae-s-grippom-06-05
Особенное спасибо за донат Виктору! А также спасибо ещё четырём людям, чьё имя не отобразилось при пересылке, благодаря вам я могу делать публикации чаще. Напоминаю, что если вы помогаете каналу, то можете написать мне в личку @eugene_time, попросить указать ваше имя при благодарности или по мере возможности персонально для вас разобрать какую-то тему. Поблагодарить за разбор: 5536 9138 3126 6560
Telegraph
Почему нельзя просто так взять и обновить вакцину под новый вариант SARS-СoV-2 как в случае с гриппом?
Создатели «Спутника», скорее всего, не планируют в ближайшее время обновлять вакцину для более эффективной защиты от омикрона. Компании Pfizer и Moderna готовят обновления своих вакцин под омикрон BA.1, но и там есть свои сложности. Рассказ будет состоять…
🔥27👍17❤4😁1
Омикрон мог произойти от мышей
Точнее, предложенный исследователями эволюционный путь SARS-СoV-2 следующий: человек → кошка → мышь → человек [1, 2].
Омикрон и животные
Как уже давно известно, омикрон эволюционировал отдельно от многих других вариантов SARS-СoV-2. Вирус долгое время развивался в каких-то популяциях, накопил в себе большое количество мутаций, после чего начал очень быстро распространяться среди людей. Ещё в начале распространения омикрона одна из гипотез происхождения была следующей: вирус передался от человека к животному, мутировал в животной среде, а затем животное передало изменённый вирус человеку (о ней я писал ранее [3]). Новые исследования предоставляют интересные данные, которые подкрепляют это гипотезу.
Связывание омикрона с АСE2 у мышей
S-белок омикрона BA.1 и BA.2 может с высокой аффинностью (силой связи) связываться с рецептором ACE2 на клетках человека. При этом омикрон хорошо связывается с ACE2 кошек и с ACE2 мышей. Тот факт, что мы можем заражать коронавирусом кошек и собак, известен ещё в первые месяцы пандемии, при уханьском SARS-CoV-2 [4, 5]. Однако способность заражать мышей у омикрона значительно улучшилась по сравнению с уханьским вариантом. Вирус приобрёл мутации Q493R, Q498R и N501Y, которые помогают ему связываться с мышиным ACE2. Что ещё интересно, именно эти же мутации обнаружены в адаптированном к мышам SARS-СoV-2.
Происхождение омикрона
На основании полученных данных исследователи предложили следующую гипотезу: SARS-CoV-2 передался от человека кошке (такая передача происходила очень много раз, поскольку хозяева нередко заражают своих животных [4]). После этого вирус от кошки передался мыши, в организме которой он какое-то время развивался. Затем мышь заразила эволюционирующим вирусом человека, в результате чего появился омикрон, успевший накопить в себе множество мутаций.
Трансмиссивность омикрона BA.1 и BA.2
Кроме того, исследователи определили, что у омикрона BА.2 аффинность S-белка с человеческим АСE2 в 2 раза выше, чем у омикрона BА.1 и в 11 раз выше, чем у уханьского SARS-СoV-2. А рецептор-связывающий домен (RBD) у BА.2 более стабилен, чем у омикрона BА.1, что ещё сильнее увеличивает вероятность связывания S-белка с АСЕ2 на поверхности клеток. За счёт улучшенной способности омикрон BА.2 лучше передаётся между людьми (более трансмиссивен), чаще заражает их клетки и чаще приводит к возникновению инфекции.
Источники:
1. Cell Research / Nature (31.05.22, основное исследование)
2. Cell Research / Nature (31.05.22, краткое обсуждение исследования)
3. https://t.iss.one/eugenes_notes/401 (как и где мог возникнуть омикрон)
4. Nature Communications (04.12.20, про частое заражение SARS-СoV-2 домашних кошек и собак).
5. Science (14.08.20, про заражение SARS-СoV-2 и симптомы у кошек и собак).
Поблагодарить за работу: 5536 9138 3126 6560
Точнее, предложенный исследователями эволюционный путь SARS-СoV-2 следующий: человек → кошка → мышь → человек [1, 2].
Омикрон и животные
Как уже давно известно, омикрон эволюционировал отдельно от многих других вариантов SARS-СoV-2. Вирус долгое время развивался в каких-то популяциях, накопил в себе большое количество мутаций, после чего начал очень быстро распространяться среди людей. Ещё в начале распространения омикрона одна из гипотез происхождения была следующей: вирус передался от человека к животному, мутировал в животной среде, а затем животное передало изменённый вирус человеку (о ней я писал ранее [3]). Новые исследования предоставляют интересные данные, которые подкрепляют это гипотезу.
Связывание омикрона с АСE2 у мышей
S-белок омикрона BA.1 и BA.2 может с высокой аффинностью (силой связи) связываться с рецептором ACE2 на клетках человека. При этом омикрон хорошо связывается с ACE2 кошек и с ACE2 мышей. Тот факт, что мы можем заражать коронавирусом кошек и собак, известен ещё в первые месяцы пандемии, при уханьском SARS-CoV-2 [4, 5]. Однако способность заражать мышей у омикрона значительно улучшилась по сравнению с уханьским вариантом. Вирус приобрёл мутации Q493R, Q498R и N501Y, которые помогают ему связываться с мышиным ACE2. Что ещё интересно, именно эти же мутации обнаружены в адаптированном к мышам SARS-СoV-2.
Происхождение омикрона
На основании полученных данных исследователи предложили следующую гипотезу: SARS-CoV-2 передался от человека кошке (такая передача происходила очень много раз, поскольку хозяева нередко заражают своих животных [4]). После этого вирус от кошки передался мыши, в организме которой он какое-то время развивался. Затем мышь заразила эволюционирующим вирусом человека, в результате чего появился омикрон, успевший накопить в себе множество мутаций.
Трансмиссивность омикрона BA.1 и BA.2
Кроме того, исследователи определили, что у омикрона BА.2 аффинность S-белка с человеческим АСE2 в 2 раза выше, чем у омикрона BА.1 и в 11 раз выше, чем у уханьского SARS-СoV-2. А рецептор-связывающий домен (RBD) у BА.2 более стабилен, чем у омикрона BА.1, что ещё сильнее увеличивает вероятность связывания S-белка с АСЕ2 на поверхности клеток. За счёт улучшенной способности омикрон BА.2 лучше передаётся между людьми (более трансмиссивен), чаще заражает их клетки и чаще приводит к возникновению инфекции.
Источники:
1. Cell Research / Nature (31.05.22, основное исследование)
2. Cell Research / Nature (31.05.22, краткое обсуждение исследования)
3. https://t.iss.one/eugenes_notes/401 (как и где мог возникнуть омикрон)
4. Nature Communications (04.12.20, про частое заражение SARS-СoV-2 домашних кошек и собак).
5. Science (14.08.20, про заражение SARS-СoV-2 и симптомы у кошек и собак).
Поблагодарить за работу: 5536 9138 3126 6560
Nature
Structural and biochemical mechanism for increased infectivity and immune evasion of Omicron BA.2 variant compared to BA.1 and…
Cell Research - Structural and biochemical mechanism for increased infectivity and immune evasion of Omicron BA.2 variant compared to BA.1 and their possible mouse origins
👍28😱8❤2
А ещё мне сегодня исполнилось 28 лет.
Приятно осознавать, что я могу не только самостоятельно развиваться, но и приносить пользу всем вам, рассказывая о чём-то важном из мира науки. Один из элементов счастья — это быть кому-то полезным.
Поздравить с днём рождения: 5536 9138 3126 6560
Если вы не из России, то можете прислать Юре, он перешлёт донаты мне: https://www.paypal.me/erofeevyury
Кроме донатов, лучшая помощь для канала — это распространение моих конспектов и статей, которые показались вам полезными, среди других источников информации и среди своего окружения. Или любая помощь с публикациями. Например, вчера мне помогли оформить иллюстрации к этой интересной публикации про иммунитет мозга. Это уже значимая помощь. Чуть позже разберу эту публикацию здесь. В том числе полезна и критика. Даже если вы исправляете описки у меня в тексте, это уже делает канал лучше.
За последнюю неделю вышло много интересных публикаций, вот некоторые из них.
Омикрон:
— Omicron BA.1 breakthrough infection drives cross-variant neutralization and memory B cell formation against conserved epitopes https://www.science.org/doi/10.1126/sciimmunol.abq2427 (02.06.22)
— Immune memory to SARS-CoV-2 Omicron BA.1 breakthrough infections: To change the vaccine or not? https://www.science.org/doi/10.1126/sciimmunol.abq5901 (02.06.22)
Постковидный синдром:
— A systematic review and meta-analysis of long term physical and mental sequelae of COVID-19 pandemic: call for research priority and action https://www.nature.com/articles/s41380-022-01614-7 (06.06.22)
— A systematic review and meta-analysis on prevalence of and risk factors associated with depression, anxiety and insomnia in infectious diseases, including COVID-19: a call to action https://www.nature.com/articles/s41380-022-01638-z (06.06.22)
— Long term implications of covid-19 in pregnancy https://www.bmj.com/content/377/bmj-2022-071296 (31.06.22)
Препараты:
— Covid-19: Doctor who sold hydroxychloroquine as “magic bullet” treatment is jailed https://www.bmj.com/content/377/bmj.o1395 (06.06.22)
— The black market for covid-19 antiviral drugs https://www.bmj.com/content/377/bmj.o1282 (31.06.22)
Опыт разных стран в борьбе с COVID-19:
— Population-level implications of the Israeli booster campaign to curtail COVID-19 resurgence https://www.science.org/doi/10.1126/scitranslmed.abn9836 (01.06.22, Израиль)
— Zeroing out on zero-COVID https://www.science.org/doi/10.1126/science.add1891 (02.06.22, Китай)
А ещё в роговице глаза нашли иммунные клетки, хотя раньше считалось, что там нет иммунных клеток:
https://www.nature.com/articles/d41586-022-01578-2 (03.06.22)
Если вам что-то из этого интересно и хотите, чтобы я разобрал эту публикацию здесь — дайте знать.
Приятно осознавать, что я могу не только самостоятельно развиваться, но и приносить пользу всем вам, рассказывая о чём-то важном из мира науки. Один из элементов счастья — это быть кому-то полезным.
Поздравить с днём рождения: 5536 9138 3126 6560
Если вы не из России, то можете прислать Юре, он перешлёт донаты мне: https://www.paypal.me/erofeevyury
Кроме донатов, лучшая помощь для канала — это распространение моих конспектов и статей, которые показались вам полезными, среди других источников информации и среди своего окружения. Или любая помощь с публикациями. Например, вчера мне помогли оформить иллюстрации к этой интересной публикации про иммунитет мозга. Это уже значимая помощь. Чуть позже разберу эту публикацию здесь. В том числе полезна и критика. Даже если вы исправляете описки у меня в тексте, это уже делает канал лучше.
За последнюю неделю вышло много интересных публикаций, вот некоторые из них.
Омикрон:
— Omicron BA.1 breakthrough infection drives cross-variant neutralization and memory B cell formation against conserved epitopes https://www.science.org/doi/10.1126/sciimmunol.abq2427 (02.06.22)
— Immune memory to SARS-CoV-2 Omicron BA.1 breakthrough infections: To change the vaccine or not? https://www.science.org/doi/10.1126/sciimmunol.abq5901 (02.06.22)
Постковидный синдром:
— A systematic review and meta-analysis of long term physical and mental sequelae of COVID-19 pandemic: call for research priority and action https://www.nature.com/articles/s41380-022-01614-7 (06.06.22)
— A systematic review and meta-analysis on prevalence of and risk factors associated with depression, anxiety and insomnia in infectious diseases, including COVID-19: a call to action https://www.nature.com/articles/s41380-022-01638-z (06.06.22)
— Long term implications of covid-19 in pregnancy https://www.bmj.com/content/377/bmj-2022-071296 (31.06.22)
Препараты:
— Covid-19: Doctor who sold hydroxychloroquine as “magic bullet” treatment is jailed https://www.bmj.com/content/377/bmj.o1395 (06.06.22)
— The black market for covid-19 antiviral drugs https://www.bmj.com/content/377/bmj.o1282 (31.06.22)
Опыт разных стран в борьбе с COVID-19:
— Population-level implications of the Israeli booster campaign to curtail COVID-19 resurgence https://www.science.org/doi/10.1126/scitranslmed.abn9836 (01.06.22, Израиль)
— Zeroing out on zero-COVID https://www.science.org/doi/10.1126/science.add1891 (02.06.22, Китай)
А ещё в роговице глаза нашли иммунные клетки, хотя раньше считалось, что там нет иммунных клеток:
https://www.nature.com/articles/d41586-022-01578-2 (03.06.22)
Если вам что-то из этого интересно и хотите, чтобы я разобрал эту публикацию здесь — дайте знать.
❤101👍38👏19🔥8🥰3
Оспа обезьян: обновление сборника
Вспышка оспы обезьян продолжает распространяться. Сейчас число заражённых приближается к 2000 человек. Официальных сообщений о заражённых в России ещё не было, но есть заражённые в странах рядом: в Финляндии, Польше и Латвии. Напоминаю, что количество заражённых можно отслеживать в Google Документах или в GitHub. За последние две недели добавил ещё 16 новых источников с полезной новой информацией в постоянно обновляющийся сборник про оспу обезьян. Туда же добавил несколько новых иллюстраций.
Основные новости следующие:
1. У распространяющейся оспы обезьян за пределами Африки есть как минимум 2 штамма. Эти последние данные за июнь показывают, что оспа обезьян начала распространяться за пределами Африки заметно раньше, чем предполагалось.
2. Не у всех заражённых оспой обезьян проявляются гриппоподобные симптомы. А ещё важно учитывать, что инкубационный период у вируса оспы обезьян довольно большой и может достигать трёх недель. Все это понижает шансы на обнаружение вируса до заражения других людей.
3. Начинает медленно внедряться вакцинация от оспы среди узких групп. Например, в канадской провинции Квебек уже стали предлагать вакцину от оспы мужчинам, у которых был половой контакт с другими мужчинами за последние 2 недели. Но есть и ряд проблем с вакцинацией, их разобрал ниже.
На данный момент любой желающий не сможет вакцинироваться от оспы. Сейчас применяется метод кольцевой вакцинации — это вакцинация контактирующих с заражённым. Такую практику уже стали применять ряд стран, включая США, Канаду и Великобританию. Но успех стратегии кольцевой вакцинации зависит как от качества отслеживаемых контактов первого уровня (людей, контактирующих с заражённым), так и от принятия вакцины людьми.
4. Учёные опасаются, что сильное распространение оспы обезьян может создать животный резервуар с вирусом за пределами Африки. Опыт прошлых эпидемий чумы и жёлтой лихорадки показал, что люди заражали в том числе животных, создавая резервуар для патогена. Из этих резервуаров опасные патогены через время снова перекидывались на людей, приводя к новым вспышкам и эпидемиям. Вирус натуральной оспы, скорее всего, не имел животных резервуаров, поэтому его удалось полностью искоренить. Однако коровья оспа или оспа обезьян передаются различным животным, поэтому их распространение особенно опасно.
Мелкие животные (хомяки, морские свинки, белки, землеройки, крысы) в первую очередь могут заражаться оспой обезьян от людей, это может создать резервуары с заразными животными в странах за пределами Африки. Заражение диких грызунов особенно вероятно, потому что они часто приходят к мусоркам, в которых могут быть вещи инфицированных людей. Если это произойдёт, бороться с распространением вируса станет ещё тяжелее. К тому же у заражённых животных не проявляются такие видимые симптомы, как у человека, что сильно усложняет обнаружение оспы у животных.
Поблагодарить за проделанную работу: 5536 9138 3126 6560
Вспышка оспы обезьян продолжает распространяться. Сейчас число заражённых приближается к 2000 человек. Официальных сообщений о заражённых в России ещё не было, но есть заражённые в странах рядом: в Финляндии, Польше и Латвии. Напоминаю, что количество заражённых можно отслеживать в Google Документах или в GitHub. За последние две недели добавил ещё 16 новых источников с полезной новой информацией в постоянно обновляющийся сборник про оспу обезьян. Туда же добавил несколько новых иллюстраций.
Основные новости следующие:
1. У распространяющейся оспы обезьян за пределами Африки есть как минимум 2 штамма. Эти последние данные за июнь показывают, что оспа обезьян начала распространяться за пределами Африки заметно раньше, чем предполагалось.
2. Не у всех заражённых оспой обезьян проявляются гриппоподобные симптомы. А ещё важно учитывать, что инкубационный период у вируса оспы обезьян довольно большой и может достигать трёх недель. Все это понижает шансы на обнаружение вируса до заражения других людей.
3. Начинает медленно внедряться вакцинация от оспы среди узких групп. Например, в канадской провинции Квебек уже стали предлагать вакцину от оспы мужчинам, у которых был половой контакт с другими мужчинами за последние 2 недели. Но есть и ряд проблем с вакцинацией, их разобрал ниже.
На данный момент любой желающий не сможет вакцинироваться от оспы. Сейчас применяется метод кольцевой вакцинации — это вакцинация контактирующих с заражённым. Такую практику уже стали применять ряд стран, включая США, Канаду и Великобританию. Но успех стратегии кольцевой вакцинации зависит как от качества отслеживаемых контактов первого уровня (людей, контактирующих с заражённым), так и от принятия вакцины людьми.
4. Учёные опасаются, что сильное распространение оспы обезьян может создать животный резервуар с вирусом за пределами Африки. Опыт прошлых эпидемий чумы и жёлтой лихорадки показал, что люди заражали в том числе животных, создавая резервуар для патогена. Из этих резервуаров опасные патогены через время снова перекидывались на людей, приводя к новым вспышкам и эпидемиям. Вирус натуральной оспы, скорее всего, не имел животных резервуаров, поэтому его удалось полностью искоренить. Однако коровья оспа или оспа обезьян передаются различным животным, поэтому их распространение особенно опасно.
Мелкие животные (хомяки, морские свинки, белки, землеройки, крысы) в первую очередь могут заражаться оспой обезьян от людей, это может создать резервуары с заразными животными в странах за пределами Африки. Заражение диких грызунов особенно вероятно, потому что они часто приходят к мусоркам, в которых могут быть вещи инфицированных людей. Если это произойдёт, бороться с распространением вируса станет ещё тяжелее. К тому же у заражённых животных не проявляются такие видимые симптомы, как у человека, что сильно усложняет обнаружение оспы у животных.
Поблагодарить за проделанную работу: 5536 9138 3126 6560
Google Docs
Monkeypox_Public_www.global.health
Confirmed/Suspected Cases
ID,Status,Location,City,Country,Age,Gender,Date_onset,Date_confirmation,Symptoms,Hospitalised (Y/N/NA),Date_hospitalisation,Isolated (Y/N/NA),Date_isolation,Outcome,Date_death,Contact_comment,Contact_ID,Contact_location,Travel_history…
ID,Status,Location,City,Country,Age,Gender,Date_onset,Date_confirmation,Symptoms,Hospitalised (Y/N/NA),Date_hospitalisation,Isolated (Y/N/NA),Date_isolation,Outcome,Date_death,Contact_comment,Contact_ID,Contact_location,Travel_history…
👍40🔥5❤4😁1
Три поколения вакцин от оспы
Для оценки существующих вакцин от оспы важно знать про три поколения вакцин. В мире сейчас имеются вакцины второго и третьего поколений.
• Первое поколение: содержат «живой» вирус коровьей оспы, который может реплицироваться в клетках. Применялись с 1966 по 1977 года до полного исчезновения натуральной оспы. Могли приводить к серьёзным побочным эффектам. Однако это не самая первая вакцина против оспы. Вообще самая первая в истории вакцина как раз и была первой вакциной от оспы, разработанной Эдвардом Дженнером в 1796 году.
• Второе поколение: как и первое поколение, содержат тот же штамм «живого» вируса коровьей оспы, способный реплицироваться в клетках. Они произведены с использованием современных методов культивирования в клетках. Поскольку вирус коровьей оспы обычно не наносит серьёзного ущерба организму и это родственный вирус, такие вакцины могут применяться против натуральной оспы или оспы обезьян. Но эти вакцины могут вызвать редкие побочные эффекты, как и вакцины первого поколения.
• Третье поколение, MVA (Modified Vaccinia Ankara): аттенуированные вакцины, то есть содержащие ослабленный вирус коровьей оспы. Они разрабатывались специально для того, чтобы вызывать минимум побочных эффектов.
Какие есть сложности при вакцинации от оспы обезьян?
• Вакцин третьего поколения пока мало. Массовая вакцинация от оспы обезьян пока не планируется, потому что основные запасы сейчас приходятся на вакцины второго поколения. Из-за побочных эффектов вакцины второго поколения не рекомендуется вводить детям, беременным, людям с ослабленным иммунитетом и людям с некоторыми кожными заболеваниями. Вакцины третьего поколения есть у меньшего количества стран и в меньших объёмах [35].
• Низкое желание вакцинироваться. К сожалению, пока даже в богатых странах с высоком уровнем образования многие контактирующие люди не считают нужным привиться от оспы. Например, в Великобритании привились только 15 из 107 контактирующих с заражёнными и 169 из 245 медицинских работников [35].
• Вакцины проверялись против натуральной оспы, но не против оспы обезьян. Пока нет данных на людях об эффективности вакцин от оспы обезьян, а не только от натуральной оспы. Поскольку вакцины были высокоэффективными у людей во время борьбы с натуральной оспой, ожидается, что они будут высокоэффективными и против оспы обезьян, однако нужны данные, чтобы показать, что это действительно так [35].
• Как минимум два штамма оспы обезьян и сложность отслеживания контактов.
Эти обновления уже добавлены в постоянно обновляющийся сборник о натуральной оспе: https://telegra.ph/Vspyshka-ospy-obezyan-za-predelami-Afriki-sbornik-05-23
Поблагодарить за проделанную работу: 5536 9138 3126 6560
Для оценки существующих вакцин от оспы важно знать про три поколения вакцин. В мире сейчас имеются вакцины второго и третьего поколений.
• Первое поколение: содержат «живой» вирус коровьей оспы, который может реплицироваться в клетках. Применялись с 1966 по 1977 года до полного исчезновения натуральной оспы. Могли приводить к серьёзным побочным эффектам. Однако это не самая первая вакцина против оспы. Вообще самая первая в истории вакцина как раз и была первой вакциной от оспы, разработанной Эдвардом Дженнером в 1796 году.
• Второе поколение: как и первое поколение, содержат тот же штамм «живого» вируса коровьей оспы, способный реплицироваться в клетках. Они произведены с использованием современных методов культивирования в клетках. Поскольку вирус коровьей оспы обычно не наносит серьёзного ущерба организму и это родственный вирус, такие вакцины могут применяться против натуральной оспы или оспы обезьян. Но эти вакцины могут вызвать редкие побочные эффекты, как и вакцины первого поколения.
• Третье поколение, MVA (Modified Vaccinia Ankara): аттенуированные вакцины, то есть содержащие ослабленный вирус коровьей оспы. Они разрабатывались специально для того, чтобы вызывать минимум побочных эффектов.
Какие есть сложности при вакцинации от оспы обезьян?
• Вакцин третьего поколения пока мало. Массовая вакцинация от оспы обезьян пока не планируется, потому что основные запасы сейчас приходятся на вакцины второго поколения. Из-за побочных эффектов вакцины второго поколения не рекомендуется вводить детям, беременным, людям с ослабленным иммунитетом и людям с некоторыми кожными заболеваниями. Вакцины третьего поколения есть у меньшего количества стран и в меньших объёмах [35].
• Низкое желание вакцинироваться. К сожалению, пока даже в богатых странах с высоком уровнем образования многие контактирующие люди не считают нужным привиться от оспы. Например, в Великобритании привились только 15 из 107 контактирующих с заражёнными и 169 из 245 медицинских работников [35].
• Вакцины проверялись против натуральной оспы, но не против оспы обезьян. Пока нет данных на людях об эффективности вакцин от оспы обезьян, а не только от натуральной оспы. Поскольку вакцины были высокоэффективными у людей во время борьбы с натуральной оспой, ожидается, что они будут высокоэффективными и против оспы обезьян, однако нужны данные, чтобы показать, что это действительно так [35].
• Как минимум два штамма оспы обезьян и сложность отслеживания контактов.
Эти обновления уже добавлены в постоянно обновляющийся сборник о натуральной оспе: https://telegra.ph/Vspyshka-ospy-obezyan-za-predelami-Afriki-sbornik-05-23
Поблагодарить за проделанную работу: 5536 9138 3126 6560
Telegraph
Вспышка оспы обезьян [сборник, обновление: 11.06.22]
Уже зафиксировано около 2000 случаев заражения оспой обезьян в Европе, Азии, Америке и Австралии. Примерно половина случаев подтверждена, оставшаяся половина требует подтверждения [1]. Причем вирус часто обнаруживается у не связанных друг с другом людей.…
👍43❤7
This media is not supported in your browser
VIEW IN TELEGRAM
Вот такие мутации накопились в S-белке SARS-СoV-2 всего у одной женщины с иммунопатологией, которая болела COVID-19 более 7 месяцев. За это время пребывания в её организме SARS-СoV-2 приобрёл 22 различных изменения. Что ещё интересно, часть из этих мутаций есть в омикроне. Подробнее про случай, если успею, расскажу сегодня вечером.
👍31😱25🤯10
Женщина болела COVID-19 более 7 месяцев, за это время SARS-CoV-2 успел накопить 22 мутации, примерно половина из них есть в омикроне
Выделение SARS-СoV-2 у людей с ослабленным и нормальным иммунитетом, сравнение
Как уже давно известно, SARS-СoV-2 в организме людей с ослабленным иммунитетом может сохраняться намного дольше, чем у людей с нормальным иммунитетом. В большинстве случаев заражённые люди с нормальным иммунитетом выделяют инфицирующие вирусные частицы через дыхательные пути до 9 дней после начала симптомов инфекции [2]. Но в редких случаях даже люди с нормальным иммунитетом могут передавать вирус в течение нескольких недель [1]. Ещё какое-то относительно недолгое время заражённые могут выделять части вируса (а не цельный вирус, способный заражать клетки), в том числе вирусную РНК. Из-за этого тесты по методу ПЦР могут показывать положительный результат на SARS-СoV-2 у выздоровевших, которые никого не заразят. В то же время люди с ослабленным иммунитетом иногда могут выделять инфицирующие вирусные частицы многие недели после заражения, а порой даже месяцы.
Про один из первых зафиксированных случаев долгого выделения SARS-CoV-2 я писал ещё в 2020 году. Тогда я рассказывал, что женщина с иммунопатологией выделяла инфицирующие вирусные частицы до 70 дней, а РНК SARS-CoV-2 — до 105 дней после постановки диагноза [3]. Сегодня расскажу про ещё более интересный случай…
Женщина, болевшая COVID-19 более 7 месяцев
Пожилая женщина в Австрии принимала иммунодепрессанты при рецидиве лимфомы. Она заразилась SARS-СoV-2 в конце 2020 года. Симптомы инфекции и положительный результат на SARS-СoV-2 у неё сохранялись более 7 месяцев. Симптомы были лёгкими, включая утомляемость и кашель. За время инфекции у неё собирали образцы SARS-СoV-2 более 20 раз.
В результате за время болезни SARS-СoV-2 в организме женщины накопил 22 изменения. Что интересно, примерно половина этих изменений есть в субвариантах омикрона, которые распространились намного позже того времени, когда она переболела COVID-19. Как отмечают авторы, омикрон возник не из-за заражения COVID-19 у этой женщины! То есть через время вирус пошёл по тому же эволюционному пути. Этот случай демонстрирует, что заражённые с иммунопаталогиями могли быть важным звеном в возникновении омикрона [1].
Не все случаи долгого заражения SARS-CoV-2 протекают легко или бессимптомно. Долгая инфекция на протяжении нескольких недель или месяцев может закончиться летальным исходом.
Другой интересный момент заключается в том, что женщина выздоровела после 7-месячной инфекции после вакцинации от COVID-19. Это уже не первый случай, когда после вакцинации исчезали симптомы «хронической COVID-19» у людей с ослабленным иммунитетом [1].
Происхождение омикрона
Итого, сейчас у нас есть две наиболее вероятных гипотезы возникновения омикрона и есть данные, подкрепляющие оба варианта:
— Животный резервуар для SARS-СoV-2, в котором предок омикрона мог набрать много мутаций. Об этом я недавно писал [4].
— Заражённые люди с ослабленным иммунитетом, в организме которых предок омикрона мог накопить ещё значительную часть изменений. Только с ВИЧ-инфекцией в мире насчитывается около 140 млн человек.
Чем больше заражённых SARS-СoV-2, тем выше шанс, что вирусом могут заразиться животные или же люди с ослабленным иммунитетом.
Источники:
1. Nature News (свежайшая публикация за 15.06.22, про случай с женщиной, которая болела COVID-19 более 7 месяцев)
2. https://t.iss.one/eugenes_notes/108 (как долго в течение болезни выделяется SARS-CoV-2)
3. https://t.iss.one/eugenes_notes/71 (бессимптомная носительница SARS-CoV-2 выделяла инфицирующие вирусные частицы до 70 дней с момента постановки диагноза)
4. https://t.iss.one/eugenes_notes/629 (омикрон мог произойти от мышей)
Благодарю всех, кто поздравил меня с днём рождения в личных сообщениях или в комментариях. И особенное спасибо Денису и ещё 10 людям, чьё имя не отобразилось при пересылке, за донаты 8 июня! 😊 И, конечно же, спасибо всем тем, кто делится моими материалами с другими. Поблагодарить за разбор: 5536 9138 3126 6560
Выделение SARS-СoV-2 у людей с ослабленным и нормальным иммунитетом, сравнение
Как уже давно известно, SARS-СoV-2 в организме людей с ослабленным иммунитетом может сохраняться намного дольше, чем у людей с нормальным иммунитетом. В большинстве случаев заражённые люди с нормальным иммунитетом выделяют инфицирующие вирусные частицы через дыхательные пути до 9 дней после начала симптомов инфекции [2]. Но в редких случаях даже люди с нормальным иммунитетом могут передавать вирус в течение нескольких недель [1]. Ещё какое-то относительно недолгое время заражённые могут выделять части вируса (а не цельный вирус, способный заражать клетки), в том числе вирусную РНК. Из-за этого тесты по методу ПЦР могут показывать положительный результат на SARS-СoV-2 у выздоровевших, которые никого не заразят. В то же время люди с ослабленным иммунитетом иногда могут выделять инфицирующие вирусные частицы многие недели после заражения, а порой даже месяцы.
Про один из первых зафиксированных случаев долгого выделения SARS-CoV-2 я писал ещё в 2020 году. Тогда я рассказывал, что женщина с иммунопатологией выделяла инфицирующие вирусные частицы до 70 дней, а РНК SARS-CoV-2 — до 105 дней после постановки диагноза [3]. Сегодня расскажу про ещё более интересный случай…
Женщина, болевшая COVID-19 более 7 месяцев
Пожилая женщина в Австрии принимала иммунодепрессанты при рецидиве лимфомы. Она заразилась SARS-СoV-2 в конце 2020 года. Симптомы инфекции и положительный результат на SARS-СoV-2 у неё сохранялись более 7 месяцев. Симптомы были лёгкими, включая утомляемость и кашель. За время инфекции у неё собирали образцы SARS-СoV-2 более 20 раз.
В результате за время болезни SARS-СoV-2 в организме женщины накопил 22 изменения. Что интересно, примерно половина этих изменений есть в субвариантах омикрона, которые распространились намного позже того времени, когда она переболела COVID-19. Как отмечают авторы, омикрон возник не из-за заражения COVID-19 у этой женщины! То есть через время вирус пошёл по тому же эволюционному пути. Этот случай демонстрирует, что заражённые с иммунопаталогиями могли быть важным звеном в возникновении омикрона [1].
Не все случаи долгого заражения SARS-CoV-2 протекают легко или бессимптомно. Долгая инфекция на протяжении нескольких недель или месяцев может закончиться летальным исходом.
Другой интересный момент заключается в том, что женщина выздоровела после 7-месячной инфекции после вакцинации от COVID-19. Это уже не первый случай, когда после вакцинации исчезали симптомы «хронической COVID-19» у людей с ослабленным иммунитетом [1].
Происхождение омикрона
Итого, сейчас у нас есть две наиболее вероятных гипотезы возникновения омикрона и есть данные, подкрепляющие оба варианта:
— Животный резервуар для SARS-СoV-2, в котором предок омикрона мог набрать много мутаций. Об этом я недавно писал [4].
— Заражённые люди с ослабленным иммунитетом, в организме которых предок омикрона мог накопить ещё значительную часть изменений. Только с ВИЧ-инфекцией в мире насчитывается около 140 млн человек.
Чем больше заражённых SARS-СoV-2, тем выше шанс, что вирусом могут заразиться животные или же люди с ослабленным иммунитетом.
Источники:
1. Nature News (свежайшая публикация за 15.06.22, про случай с женщиной, которая болела COVID-19 более 7 месяцев)
2. https://t.iss.one/eugenes_notes/108 (как долго в течение болезни выделяется SARS-CoV-2)
3. https://t.iss.one/eugenes_notes/71 (бессимптомная носительница SARS-CoV-2 выделяла инфицирующие вирусные частицы до 70 дней с момента постановки диагноза)
4. https://t.iss.one/eugenes_notes/629 (омикрон мог произойти от мышей)
Благодарю всех, кто поздравил меня с днём рождения в личных сообщениях или в комментариях. И особенное спасибо Денису и ещё 10 людям, чьё имя не отобразилось при пересылке, за донаты 8 июня! 😊 И, конечно же, спасибо всем тем, кто делится моими материалами с другими. Поблагодарить за разбор: 5536 9138 3126 6560
Nature
How months-long COVID infections could seed dangerous new variants
Nature - Tracking SARS-CoV-2 evolution during persistent cases provides insight into the origins of Omicron and other global variants. What can scientists do with this knowledge?
👍44🔥7❤6
Оспа обезьян: краткая заметка для практикующих врачей
Как показал свежий систематический обзор, опубликованный 14 июня в качестве препринта в medRxiv, на данный момент вовсе отсутствуют научно обоснованные клинические рекомендации по ведению пациентов с оспой обезьян. Похожий вопрос поднимался в заметке в The Lancet, опубликованной буквально вчера, 15 июня. Авторы показали, что даже на английском языке на данный момент доступно очень мало практически полезной научной литературы на тему оспы обезьян. Между тем, как отмечается в этой же заметке, кожные проявление оспы обезьян легко спутать с другими заболеваниями (ветряной оспой, простым герпесом, сифилитическим шанкром, гонореей, контагиозным моллюском). Учения в США показали, что примерно в половине случаев заражённым оспой обезьян ставится изначально неверный диагноз. Поэтому я решил отдельно упомянуть, чтобы информация не затерялась в массе другой информации по теме, что в одном из лучших научных журналов, в The New England Journal of Medicine, вчера, 15 июня, опубликовано подробное описание оспы обезьян у 31-летнего мужчины. Кстати, изначально ему также не диагностировали оспу обезьян. Кроме того, 13 июня в JAMA Network опубликована информация для практикующих клиницистов, которые в будущем могут столкнуться к заражёнными оспой обезьян, в том числе по симптомам, профилактике, диагностике и уходу за пациентами с оспой обезьян. Сказать спасибо: 5536 9138 3126 6560
Как показал свежий систематический обзор, опубликованный 14 июня в качестве препринта в medRxiv, на данный момент вовсе отсутствуют научно обоснованные клинические рекомендации по ведению пациентов с оспой обезьян. Похожий вопрос поднимался в заметке в The Lancet, опубликованной буквально вчера, 15 июня. Авторы показали, что даже на английском языке на данный момент доступно очень мало практически полезной научной литературы на тему оспы обезьян. Между тем, как отмечается в этой же заметке, кожные проявление оспы обезьян легко спутать с другими заболеваниями (ветряной оспой, простым герпесом, сифилитическим шанкром, гонореей, контагиозным моллюском). Учения в США показали, что примерно в половине случаев заражённым оспой обезьян ставится изначально неверный диагноз. Поэтому я решил отдельно упомянуть, чтобы информация не затерялась в массе другой информации по теме, что в одном из лучших научных журналов, в The New England Journal of Medicine, вчера, 15 июня, опубликовано подробное описание оспы обезьян у 31-летнего мужчины. Кстати, изначально ему также не диагностировали оспу обезьян. Кроме того, 13 июня в JAMA Network опубликована информация для практикующих клиницистов, которые в будущем могут столкнуться к заражёнными оспой обезьян, в том числе по симптомам, профилактике, диагностике и уходу за пациентами с оспой обезьян. Сказать спасибо: 5536 9138 3126 6560
👍49❤6
Оспа обезьян: большое обновление.
Ещё в середине июля, когда я начинал делать большое обновление по оспе обезьян, количество заражённых вирусом было порядка 10 тысяч. К 1 августа количество заражённых оспой обезьян перевалило за 23 тысячи человек. 23 июля ВОЗ наконец-то признала распространение вируса чрезвычайной ситуацией. Наконец-то — это потому что уже больше месяца множество эпидемиологов, вирусологов и других специалистов критиковали организацию за её медлительность и говорили, что уже пора бы объявить чрезвычайное положение. Ещё 12 июля было стало известно о первом случае заражения оспой обезьян в России. Нет сомнений, что распространение оспы обезьян — эта очень важная тема, пока не настолько важная, как COVID-19, но уже давно требующая пристального внимания.
За то время, пока я не вёл конспекты, вышла масса интересных публикаций по теме. Я, как всегда, подробно подбираю материалы: сперва ищу публикации по теме в лучших мировых научных журналах, таких как NEJM, The Lancet, JAMA, Nature, Science, Cell, BMJ, Oxford University Press, PNAS и др., затем выписываю себе вообще все ссылки, которые нашёл по теме, после чего отмечаю практически полезные публикации, читаю от начала и до конца каждую из них и конспектирую наиболее значимые моменты. Таким образом можно охватить большинство наиболее качественной и полезной информации из имеющейся по теме.
При описанном выше подходе у меня собралось примерно полсотни интересных публикаций по теме оспы обезьян, которые стоит разобрать. Думаю, что лучше всего разобрать каждую тему в отдельном материале, а затем подвести итог всего обновления. Информации по теме оспы обезьян всё больше, но пока мало конкретных данных, на которые можно опереться. Например, какие есть исследования, на основании которых можно сказать, что вакцины от натуральной оспы будут работать и против оспы обезьян? Какие есть данные о том, что для защиты от оспы обезьян достаточно одной прививки вместо плановых двух? Какие исследования показывают риск заражения оспой обезьян для беременных? В каких исследованиях показано в процентном соотношении, кто именно заражается оспой обезьян? И т.д. Обо всём этом я расскажу в следующих материалах. А сейчас начну с тем про текущую статистику заражений и вакцинацию…
Ещё в середине июля, когда я начинал делать большое обновление по оспе обезьян, количество заражённых вирусом было порядка 10 тысяч. К 1 августа количество заражённых оспой обезьян перевалило за 23 тысячи человек. 23 июля ВОЗ наконец-то признала распространение вируса чрезвычайной ситуацией. Наконец-то — это потому что уже больше месяца множество эпидемиологов, вирусологов и других специалистов критиковали организацию за её медлительность и говорили, что уже пора бы объявить чрезвычайное положение. Ещё 12 июля было стало известно о первом случае заражения оспой обезьян в России. Нет сомнений, что распространение оспы обезьян — эта очень важная тема, пока не настолько важная, как COVID-19, но уже давно требующая пристального внимания.
За то время, пока я не вёл конспекты, вышла масса интересных публикаций по теме. Я, как всегда, подробно подбираю материалы: сперва ищу публикации по теме в лучших мировых научных журналах, таких как NEJM, The Lancet, JAMA, Nature, Science, Cell, BMJ, Oxford University Press, PNAS и др., затем выписываю себе вообще все ссылки, которые нашёл по теме, после чего отмечаю практически полезные публикации, читаю от начала и до конца каждую из них и конспектирую наиболее значимые моменты. Таким образом можно охватить большинство наиболее качественной и полезной информации из имеющейся по теме.
При описанном выше подходе у меня собралось примерно полсотни интересных публикаций по теме оспы обезьян, которые стоит разобрать. Думаю, что лучше всего разобрать каждую тему в отдельном материале, а затем подвести итог всего обновления. Информации по теме оспы обезьян всё больше, но пока мало конкретных данных, на которые можно опереться. Например, какие есть исследования, на основании которых можно сказать, что вакцины от натуральной оспы будут работать и против оспы обезьян? Какие есть данные о том, что для защиты от оспы обезьян достаточно одной прививки вместо плановых двух? Какие исследования показывают риск заражения оспой обезьян для беременных? В каких исследованиях показано в процентном соотношении, кто именно заражается оспой обезьян? И т.д. Обо всём этом я расскажу в следующих материалах. А сейчас начну с тем про текущую статистику заражений и вакцинацию…
👍39❤22😁1
Грабли, на которые мы снова и снова наступаем, — это недооценка экспоненциального роста. Условно говоря, тысяча заражённых сегодня может стать миллионом заражённых и пандемией через полгода. Даже в случае вируса, который обладает меньшей способностью распространяться, чем SARS-СoV-2.
Статистика взята из Our World in Data.
Также отслеживать количество заражений оспой обезьян можно в Google Документах.
Статистика взята из Our World in Data.
Также отслеживать количество заражений оспой обезьян можно в Google Документах.
👍37❤6
Уже не хватает доз вакцины от оспы обезьян. Чтобы решить проблему, учёные предлагают вакцинировать одной вместо двух доз вакцины. При этом имеющиеся данные показывают, что одна доза вакцины MVA от Bavarian Nordic может обеспечить защиту от вируса до двух лет.
В материале разобрано следующее:
1. Какие группы населения уже вакцинируют от оспы обезьян в разных странах?
2. Почему не хватает вакцины? Сравнение двух популярных вакцин от оспы обезьян. Какое количество вакцин есть сейчас?
3. Результаты исследований, которые предполагают защиту от оспы обезьян всего на основе одной дозы.
4. Почему учёные решили, что вакцины от натуральной оспы будут эффективны и против оспы обезьян?
Читать: https://telegra.ph/Uzhe-ne-hvataet-vakcin-ot-ospy-obezyan-Uchyonye-predlagayut-vakcinirovat-odnoj-vmesto-dvuh-doz-vakciny-08-01
Поблагодарить за работу: 5536 9138 3126 6560
В материале разобрано следующее:
1. Какие группы населения уже вакцинируют от оспы обезьян в разных странах?
2. Почему не хватает вакцины? Сравнение двух популярных вакцин от оспы обезьян. Какое количество вакцин есть сейчас?
3. Результаты исследований, которые предполагают защиту от оспы обезьян всего на основе одной дозы.
4. Почему учёные решили, что вакцины от натуральной оспы будут эффективны и против оспы обезьян?
Читать: https://telegra.ph/Uzhe-ne-hvataet-vakcin-ot-ospy-obezyan-Uchyonye-predlagayut-vakcinirovat-odnoj-vmesto-dvuh-doz-vakciny-08-01
Поблагодарить за работу: 5536 9138 3126 6560
Telegraph
Уже не хватает вакцин от оспы обезьян. Учёные предлагают вакцинировать одной вместо двух доз вакцины
Уже не хватает достаточного количества вакцин от оспы обезьян. Чтобы решить проблему, учёные предлагают вакцинировать одной вместо двух доз вакцины. При этом имеющиеся данные показывают, что одна доза вакцины MVA от Bavarian Nordic может обеспечить защиту…
👍44❤2😱1
Оспа обезьян у беременных и кормящих грудью
Чаще всего оспой обезьян в текущей вспышке заражаются мужчины, у которых за последнее время был половой контакт с другими мужчинами. Однако инфекцией могут заражаться в том числе женщины и дети. Инфицирование оспой обезьян у беременных женщин, скорее всего, несёт высокий риск развития внутриутробной инфекции, выкидышей, осложнений для матери, включая повышенную вероятность летального исхода.
В полном материале разберу следующее:
1. Риски при заражении оспой обезьян у беременных.
2. Как обстоят дела с вакцинацией от оспы обезьян беременных и кормящих грудью.
3. Диагностика оспы обезьян у беременных (информация для практикующих врачей) .
4. Препараты против оспы обезьян у беременных (кратко).
Читать: https://telegra.ph/Ospa-obezyan-u-beremennyh-i-kormyashchih-grudyu-08-01
Спасибо Василию за донат несколько часов назад! Поблагодарить за конспект: 5536 9138 3126 6560
Чаще всего оспой обезьян в текущей вспышке заражаются мужчины, у которых за последнее время был половой контакт с другими мужчинами. Однако инфекцией могут заражаться в том числе женщины и дети. Инфицирование оспой обезьян у беременных женщин, скорее всего, несёт высокий риск развития внутриутробной инфекции, выкидышей, осложнений для матери, включая повышенную вероятность летального исхода.
В полном материале разберу следующее:
1. Риски при заражении оспой обезьян у беременных.
2. Как обстоят дела с вакцинацией от оспы обезьян беременных и кормящих грудью.
3. Диагностика оспы обезьян у беременных (информация для практикующих врачей) .
4. Препараты против оспы обезьян у беременных (кратко).
Читать: https://telegra.ph/Ospa-obezyan-u-beremennyh-i-kormyashchih-grudyu-08-01
Спасибо Василию за донат несколько часов назад! Поблагодарить за конспект: 5536 9138 3126 6560
Telegraph
Оспа обезьян у беременных и кормящих грудью
Чаще всего оспой обезьян в текущей вспышке заражаются мужчины, у которых за последнее время был половой контакт с другими мужчинами. Однако инфекцией могут заражаться в том числе женщины и дети. Инфицирование оспой обезьян у беременных женщин, скорее всего…
👍29❤5
Почему объявление ВОЗ чрезвычайной ситуации из-за распространения оспы обезьян так важно?
23 июля глава ВОЗ объявил текущую вспышку оспы обезьян чрезвычайной ситуацией PHEIC. Всего чрезвычайные ситуации объявлялись 7 раз (включая этот раз), но впервые генеральный директор ВОЗ сделал это вопреки мнению комиссии по чрезвычайным ситуациям. Что такое PHEIC и почему это событие так важно для мира и для борьбы с оспой обезьян?
Содержание:
• 1. Что такое чрезвычайная ситуация PHEIC?
• 2. Почему большинство участников комиссии не хотели объявлять чрезвычайную ситуацию PHEIC?
• 3. Из-за каких вирусов ранее объявляли PHEIC?
• 4. Почему PHEIC так важна при вспышке оспы обезьян?
• Резюме.
Читать: https://telegra.ph/Pochemu-obyavlenie-VOZ-chrezvychajnoj-situacii-iz-za-rasprostraneniya-ospy-obezyan-tak-vazhno-08-02
Спасибо за помощь каналу Елене и ещё трём людям, чьё имя не отобразилось при пересылке донатов. Если вы хотите, чтобы я сослался на вас при благодарности, можете написать мне в личку (@eugene_time). Поблагодарить: 5536 9138 3126 6560
***
Из основного по теме оспы обезьян осталось разобрать заражение (здесь интересно несколько моментов, например почему вирусом заражается определённая группа людей, а ещё появились данные про бессимптомное носительство), симптомы (они отличаются от предыдущих вспышек вируса) и геномику (вирус оспы обезьян относительно сильно мутировал), ещё можно рассказать про препараты. После чего можно переходить к разбору тем про COVID-19.
А ещё хочу успевать выкладывать конспекты лекций по темам из топовых мировых ВУЗов. Прямо сейчас прохожу открытый Йельский курс “Introduction to Psychology” (введение в психологию). Что особенно приятно, после первой же лекции в качестве домашнего задания предлагают материал, в котором с иллюстрациями поясняется, какие бывают научные исследования по дизайну, и учат их оценивать. И в целом рассказывают полезные основы. А ещё можно продолжать делать конспект по Стэнфордскому курсу «Биология поведения человека».
23 июля глава ВОЗ объявил текущую вспышку оспы обезьян чрезвычайной ситуацией PHEIC. Всего чрезвычайные ситуации объявлялись 7 раз (включая этот раз), но впервые генеральный директор ВОЗ сделал это вопреки мнению комиссии по чрезвычайным ситуациям. Что такое PHEIC и почему это событие так важно для мира и для борьбы с оспой обезьян?
Содержание:
• 1. Что такое чрезвычайная ситуация PHEIC?
• 2. Почему большинство участников комиссии не хотели объявлять чрезвычайную ситуацию PHEIC?
• 3. Из-за каких вирусов ранее объявляли PHEIC?
• 4. Почему PHEIC так важна при вспышке оспы обезьян?
• Резюме.
Читать: https://telegra.ph/Pochemu-obyavlenie-VOZ-chrezvychajnoj-situacii-iz-za-rasprostraneniya-ospy-obezyan-tak-vazhno-08-02
Спасибо за помощь каналу Елене и ещё трём людям, чьё имя не отобразилось при пересылке донатов. Если вы хотите, чтобы я сослался на вас при благодарности, можете написать мне в личку (@eugene_time). Поблагодарить: 5536 9138 3126 6560
***
Из основного по теме оспы обезьян осталось разобрать заражение (здесь интересно несколько моментов, например почему вирусом заражается определённая группа людей, а ещё появились данные про бессимптомное носительство), симптомы (они отличаются от предыдущих вспышек вируса) и геномику (вирус оспы обезьян относительно сильно мутировал), ещё можно рассказать про препараты. После чего можно переходить к разбору тем про COVID-19.
А ещё хочу успевать выкладывать конспекты лекций по темам из топовых мировых ВУЗов. Прямо сейчас прохожу открытый Йельский курс “Introduction to Psychology” (введение в психологию). Что особенно приятно, после первой же лекции в качестве домашнего задания предлагают материал, в котором с иллюстрациями поясняется, какие бывают научные исследования по дизайну, и учат их оценивать. И в целом рассказывают полезные основы. А ещё можно продолжать делать конспект по Стэнфордскому курсу «Биология поведения человека».
Telegraph
Почему объявление ВОЗ чрезвычайной ситуации из-за распространения оспы обезьян так важно?
23 июля глава ВОЗ объявил текущую вспышку оспы обезьян чрезвычайной ситуацией PHEIC. Всего чрезвычайные ситуации объявлялись 7 раз (включая этот раз), но впервые генеральный директор ВОЗ сделал это вопреки мнению комиссии по чрезвычайным ситуациям. Что такое…
👍43❤6🔥4
Почему оспой обезьян заражаются чаще всего мужчины, у которых был секс с другими мужчинами?
Содержание:
• 1. Оспа обезьян, возможно, передаётся половым путём.
• 2. МСМ чаще диагностируют.
• 3. У МСМ в среднем более частые половые контакты и больше половых партнёров .
• Какая тактика не улучшит ситуацию?
Читать: https://telegra.ph/Pochemu-ospoj-obezyan-zarazhayutsya-chashche-vsego-muzhchiny-u-kotoryh-byl-seks-s-drugimi-muzhchinami-08-03
За помощь спасибо Людмиле и ещё двум людям, чьё имя не отобразилось при пересылке донатов. Поблагодарить за работу: 5536 9138 3126 6560
Содержание:
• 1. Оспа обезьян, возможно, передаётся половым путём.
• 2. МСМ чаще диагностируют.
• 3. У МСМ в среднем более частые половые контакты и больше половых партнёров .
• Какая тактика не улучшит ситуацию?
Читать: https://telegra.ph/Pochemu-ospoj-obezyan-zarazhayutsya-chashche-vsego-muzhchiny-u-kotoryh-byl-seks-s-drugimi-muzhchinami-08-03
За помощь спасибо Людмиле и ещё двум людям, чьё имя не отобразилось при пересылке донатов. Поблагодарить за работу: 5536 9138 3126 6560
Telegraph
Почему оспой обезьян заражаются чаще всего мужчины, у которых был секс с другими мужчинами?
Есть как минимум 3 гипотезы, которые дополняют друг друга: 1. Оспа обезьян, возможно, передаётся половым путём Или же ещё одно объяснение — тесный контакт во время секса способствует наилучшей передаче вируса, который хорошо передаётся в первую очередь через…
👍31😱2❤1
Что вам было бы интересно почитать на канале?
Чем я здесь занимаюсь? Напомню, что суть моей работы в следующем: сперва я нахожу большой массив научных публикаций (чаще всего свежих) в лучших мировых журналах на какую-то актуальную медицинскую тему, затем перевожу английскую информацию в формат конспекта на русском, который удобно и быстро читается. Кроме этого, мне интересно разбирать мифы, писать про когнитивные искажения, конспектировать лекции и книги и др. Многими своими конспектами я сам пользуюсь, поэтому пишу их так, чтобы легко было просканировать глазами текст и найти нужную информацию.
В чём цель канала? Мне нравится помогать людям и вместе с этим развиваться самому. Занимаюсь я этим прежде всего потому, что на английском языке уйма полезной информации, много из которой не доходит до рунета. А если и доходит, то часть из неё искажается, поскольку есть довольно сложные темы, требующие определённых знаний для перевода с английского на русский. Например, иммунология — довольно сложная тема. А рассказ про препараты обычно требует навыка анализа исследований. Без него даже очевидно некачественный метаанализ с кучей ошибок (с пиаром ивермектина, неэффективного против COVID-19) может восприниматься как качественная информация. А если кто-то уже поверил в заведомо ложную информацию, то часто его сложно переубедить. Поэтому гораздо эффективнее изначально давать базу, с помощью которой он сможет самостоятельно не покупаться на мифы сложнее, чем «коронавируса не существует, а в вакцинах чипы».
А если вдруг я чего-то не знаю (например, для меня сложна нейроиммунология, и я всё никак не допишу материал по этой теме), то среди моего окружения и читателей есть талантливые врачи и учёные, которые могут исправить мои ошибки или помочь. Таким образом, получаются интересные материалы на специфичные темы.
Чем я здесь занимаюсь? Напомню, что суть моей работы в следующем: сперва я нахожу большой массив научных публикаций (чаще всего свежих) в лучших мировых журналах на какую-то актуальную медицинскую тему, затем перевожу английскую информацию в формат конспекта на русском, который удобно и быстро читается. Кроме этого, мне интересно разбирать мифы, писать про когнитивные искажения, конспектировать лекции и книги и др. Многими своими конспектами я сам пользуюсь, поэтому пишу их так, чтобы легко было просканировать глазами текст и найти нужную информацию.
В чём цель канала? Мне нравится помогать людям и вместе с этим развиваться самому. Занимаюсь я этим прежде всего потому, что на английском языке уйма полезной информации, много из которой не доходит до рунета. А если и доходит, то часть из неё искажается, поскольку есть довольно сложные темы, требующие определённых знаний для перевода с английского на русский. Например, иммунология — довольно сложная тема. А рассказ про препараты обычно требует навыка анализа исследований. Без него даже очевидно некачественный метаанализ с кучей ошибок (с пиаром ивермектина, неэффективного против COVID-19) может восприниматься как качественная информация. А если кто-то уже поверил в заведомо ложную информацию, то часто его сложно переубедить. Поэтому гораздо эффективнее изначально давать базу, с помощью которой он сможет самостоятельно не покупаться на мифы сложнее, чем «коронавируса не существует, а в вакцинах чипы».
А если вдруг я чего-то не знаю (например, для меня сложна нейроиммунология, и я всё никак не допишу материал по этой теме), то среди моего окружения и читателей есть талантливые врачи и учёные, которые могут исправить мои ошибки или помочь. Таким образом, получаются интересные материалы на специфичные темы.
👍76❤16👏4