Defining precancer, Nature Reviews Cancer (2024).pdf
1.8 MB
چالش های تشخیص اولیه سرطان
این مقاله مروری به صورتکلیدی بیانگر اهمیت و چالش های تشخیصاولیه کنسر درمراحل ابتدایی گسترش تومورها می باشد
https://t.iss.one/IRBioinformatics/854
این مقاله مروری به صورتکلیدی بیانگر اهمیت و چالش های تشخیصاولیه کنسر درمراحل ابتدایی گسترش تومورها می باشد
https://t.iss.one/IRBioinformatics/854
👍5
آکادمی بیوانفورماتیک محققان ایرانی
ژنومیکس 4Dچیست و چه کاربردی دارد؟درباره پروژه nucleome چهار بعدی چه می دانید؟ 👇👇👇👇👇
ژنومیکس چهاربعدی (4D Genomics) یک رویکرد نوین در مطالعه ژنوم است که به بررسی ساختار و عملکرد ژنوم در چهار بعد میپردازد. این رویکرد به جای تمرکز صرف بر توالی DNA، به تعاملات فضایی و زمانی بین ژنها و عناصر تنظیمی توجه میکند. در این راستا، ابعاد چهارگانه شامل توالی ژنتیکی، ساختار سهبعدی کروماتین، زمان بیان ژن و شرایط محیطی است که همگی بر فعالیت ژنها تأثیر میگذارند.
یکی از جنبههای کلیدی ژنومیکس چهاربعدی، بررسی ساختار فضایی کروماتین است. درون هسته سلول، DNA به صورت پیچیدهای سازماندهی شده است و این سازماندهی بر نحوه دسترسی پروتئینها به ژنها تأثیر میگذارد. با استفاده از تکنیکهایی مانند Hi-C، پژوهشگران میتوانند نقشههای سهبعدی از کروماتین را ترسیم کرده و بفهمند که چگونه نواحی مختلف ژنوم با یکدیگر تعامل دارند. این اطلاعات به درک بهتر از تنظیم بیان ژن کمک میکند.
علاوه بر این، زمانبندی بیان ژن نیز بخشی از این رویکرد است. ژنها در پاسخ به سیگنالهای مختلف محیطی و در زمانهای خاصی فعال یا غیرفعال میشوند. با استفاده از تکنیکهای پیشرفته مانند RNA-seq، پژوهشگران میتوانند الگوهای بیان ژن را در زمانهای مختلف بررسی کرده و تأثیرات متقابل بین زمان و فضا را شناسایی کنند. این اطلاعات میتواند به توضیح فرآیندهای بیولوژیکی پیچیده مانند توسعه، تمایز سلولی و بیماریها کمک کند.
در نهایت، ژنومیکس چهاربعدی امکانات جدیدی برای تحقیقات پزشکی و بیولوژیکی فراهم میآورد. با درک بهتر از نحوه تعاملات فضایی و زمانی در سطح ژنوم، میتوانیم به شناسایی اهداف درمانی جدید، پیشبینی پاسخهای دارویی و توسعه استراتژیهای درمانی شخصیسازیشده بپردازیم. این رویکرد نه تنها به دانش ما از بیولوژی پایه افزوده، بلکه میتواند به پیشرفتهای قابل توجهی در زمینه پزشکی مولکولی و درمان بیماریها منجر شود.
شبکه هستهنگاری چهاربعدی (4D Nucleome Network) هدف دارد تا روشهایی را برای نقشهبرداری از ساختار و دینامیک ژنومهای انسانی و موشی در فضا و زمان توسعه و بهکار گیرد، با هدف دستیابی به بینشهای مکانیکی عمیقتر درباره چگونگی سازماندهی و عملکرد هسته. این پروژه روشهای تجربی و محاسباتی را برای اندازهگیری حالت ژنوم و سازماندهی هسته توسعه داده و ارزیابی خواهد کرد و بررسی میکند که چگونه این عوامل به تنظیم ژن و سایر عملکردهای ژنومی کمک میکنند.
برای کسب اطلاعات بیشتر بررویلینکزیر کلیک کنید
https://www.nature.com/articles/nature23884
👇
https://t.iss.one/IRBioinformatics/857
یکی از جنبههای کلیدی ژنومیکس چهاربعدی، بررسی ساختار فضایی کروماتین است. درون هسته سلول، DNA به صورت پیچیدهای سازماندهی شده است و این سازماندهی بر نحوه دسترسی پروتئینها به ژنها تأثیر میگذارد. با استفاده از تکنیکهایی مانند Hi-C، پژوهشگران میتوانند نقشههای سهبعدی از کروماتین را ترسیم کرده و بفهمند که چگونه نواحی مختلف ژنوم با یکدیگر تعامل دارند. این اطلاعات به درک بهتر از تنظیم بیان ژن کمک میکند.
علاوه بر این، زمانبندی بیان ژن نیز بخشی از این رویکرد است. ژنها در پاسخ به سیگنالهای مختلف محیطی و در زمانهای خاصی فعال یا غیرفعال میشوند. با استفاده از تکنیکهای پیشرفته مانند RNA-seq، پژوهشگران میتوانند الگوهای بیان ژن را در زمانهای مختلف بررسی کرده و تأثیرات متقابل بین زمان و فضا را شناسایی کنند. این اطلاعات میتواند به توضیح فرآیندهای بیولوژیکی پیچیده مانند توسعه، تمایز سلولی و بیماریها کمک کند.
در نهایت، ژنومیکس چهاربعدی امکانات جدیدی برای تحقیقات پزشکی و بیولوژیکی فراهم میآورد. با درک بهتر از نحوه تعاملات فضایی و زمانی در سطح ژنوم، میتوانیم به شناسایی اهداف درمانی جدید، پیشبینی پاسخهای دارویی و توسعه استراتژیهای درمانی شخصیسازیشده بپردازیم. این رویکرد نه تنها به دانش ما از بیولوژی پایه افزوده، بلکه میتواند به پیشرفتهای قابل توجهی در زمینه پزشکی مولکولی و درمان بیماریها منجر شود.
شبکه هستهنگاری چهاربعدی (4D Nucleome Network) هدف دارد تا روشهایی را برای نقشهبرداری از ساختار و دینامیک ژنومهای انسانی و موشی در فضا و زمان توسعه و بهکار گیرد، با هدف دستیابی به بینشهای مکانیکی عمیقتر درباره چگونگی سازماندهی و عملکرد هسته. این پروژه روشهای تجربی و محاسباتی را برای اندازهگیری حالت ژنوم و سازماندهی هسته توسعه داده و ارزیابی خواهد کرد و بررسی میکند که چگونه این عوامل به تنظیم ژن و سایر عملکردهای ژنومی کمک میکنند.
برای کسب اطلاعات بیشتر بررویلینکزیر کلیک کنید
https://www.nature.com/articles/nature23884
👇
https://t.iss.one/IRBioinformatics/857
👍7
A new mode of inhibitio.pdf
723.3 KB
پروتئینهای گیرنده هستهای که بین سیتوپلاسم و هسته یک سلول جابهجا میشوند، در نقشهای متنوعی از نظر فیزیولوژیکی و پاتولوژیکی دخالت دارند. این گیرندههای هستهای میتوانند توسط طیف وسیعی از لیگاندها – مانند ویتامینها، هورمونها و اسیدهای چرب – فعال شوند که باعث میشود گیرنده، رونویسی برخی از ژنها را افزایش دهد.
به دلیل عملکردهای گسترده بیولوژیکی، گیرندههای هستهای هدف اصلی داروها در داروشناسی هستند (سانتوس و همکاران، ۲۰۱۷). این داروها میتوانند یا گیرنده را فعال کنند (آگونیستها)، فعالیت گیرنده را مهار کنند (آگونیستهای معکوس) یا فضای اتصال لیگاند را اشغال کنند بهطوریکه مولکولهای دیگر نتوانند به آن دسترسی پیدا کنند (آنتاگونیستها).
https://t.iss.one/IRBioinformatics/858
به دلیل عملکردهای گسترده بیولوژیکی، گیرندههای هستهای هدف اصلی داروها در داروشناسی هستند (سانتوس و همکاران، ۲۰۱۷). این داروها میتوانند یا گیرنده را فعال کنند (آگونیستها)، فعالیت گیرنده را مهار کنند (آگونیستهای معکوس) یا فضای اتصال لیگاند را اشغال کنند بهطوریکه مولکولهای دیگر نتوانند به آن دسترسی پیدا کنند (آنتاگونیستها).
https://t.iss.one/IRBioinformatics/858
👍4
Forwarded from EngVid
Please open Telegram to view this post
VIEW IN TELEGRAM
Forwarded from EngVid
Please open Telegram to view this post
VIEW IN TELEGRAM
تعداد شرکتهای اینترنت ماهوارهای داره بیشتر میشه، مثلا استارتاپ فرانسوی Constellation سرمایه اولیه خودشو جذب کرده و میخواد سال ۲۰۲۶ اولین ماهوارههاشو پرتاب کنه.
اینترنت ماهوارهایش بر بستر 5Gهست و روند مشابه استارلینکرو داره پیش میره، قراره با اپراتورها همکاری کنن.
از طرفی به زودی با ۱ گیگابیتی شدن سرعت استارلینک، ارزش نیبرلینک و اشتراکگذاری اینترنت با همسایهها بیشتر میشه.
فکر کن ۱ دونه دیش استارلینک راحت یه ۲۴ واحدی رو اینترنت پرسرعت میده😂🤏🪐
@irbioinformatics
اینترنت ماهوارهایش بر بستر 5Gهست و روند مشابه استارلینکرو داره پیش میره، قراره با اپراتورها همکاری کنن.
از طرفی به زودی با ۱ گیگابیتی شدن سرعت استارلینک، ارزش نیبرلینک و اشتراکگذاری اینترنت با همسایهها بیشتر میشه.
فکر کن ۱ دونه دیش استارلینک راحت یه ۲۴ واحدی رو اینترنت پرسرعت میده😂🤏🪐
@irbioinformatics
😁3👍1
دوستان عزیز سلام
اگر کتاب یا مقاله ای در حوزه بیوتکنولوژی، بیوشیمی، میکروبیولوژی و سایر علوم زیستی با رویکرد مولکولی-محاسباتی چاپ کردین میتونین در زیر اینپست به همراه یکپاراگراف توضیح مقاله یا کتابتون بزارین برامون و یک پاراگراف همراجب زمینه تحقیقاتی که درحال حاضرمشغول انجام اون هستین برای ما قرار بدین تا ما در کانال منتشر کنیم و اینطوری مخاطبان بیشتری کار شما رو ببینن و ازش استفاده کنن در آینده.
برای بخش مقالات، مقاله شما باید شرایط زیر را داشته باشد:
۱- در یکژورنال معتبر چاپ شده باشد ( ایمپکت ۳ به بالا و Q1)
۲- اهمیت انجام کار همراه با لینک مقاله قید گردد
۳- ابسترک گرافیکی مقاله که شامل خلاصه مراحل انجام شده در مقاله باشد با لینکمقاله پیوست شود
برای بخش کتاب، کتاب های شما باید شرایط زیر را داشته باشند:
۱- توسط یکنشر معتبر در داخل یا خارج چاپ شده باشند
۲- مخاطبان کتاب دانشجویان ارشد و دکترا باشند
۳- عکس جلد کتاب و لینک خرید کتاب ارسال شود
۴- سرفصل های کتاب در قابل فایل pdf همراه با توضیحات کتاب برای ما ارسال شود.
🤏به پژوهشگران ارشد و دکتری که گزارش تاپی در رابطه با کاری که انجام دادن چاپ کردند و کارشون شامل یکنواوری کلیدی باشه به قید قرعه از طرف تیم مدیریت کانال یک جایزه تعلق خواهد گرفت
با تشکر
مدیریت کانال
----------------------------------------
https://t.iss.one/IRBioinformatics
اگر کتاب یا مقاله ای در حوزه بیوتکنولوژی، بیوشیمی، میکروبیولوژی و سایر علوم زیستی با رویکرد مولکولی-محاسباتی چاپ کردین میتونین در زیر اینپست به همراه یکپاراگراف توضیح مقاله یا کتابتون بزارین برامون و یک پاراگراف همراجب زمینه تحقیقاتی که درحال حاضرمشغول انجام اون هستین برای ما قرار بدین تا ما در کانال منتشر کنیم و اینطوری مخاطبان بیشتری کار شما رو ببینن و ازش استفاده کنن در آینده.
برای بخش مقالات، مقاله شما باید شرایط زیر را داشته باشد:
۱- در یکژورنال معتبر چاپ شده باشد ( ایمپکت ۳ به بالا و Q1)
۲- اهمیت انجام کار همراه با لینک مقاله قید گردد
۳- ابسترک گرافیکی مقاله که شامل خلاصه مراحل انجام شده در مقاله باشد با لینکمقاله پیوست شود
برای بخش کتاب، کتاب های شما باید شرایط زیر را داشته باشند:
۱- توسط یکنشر معتبر در داخل یا خارج چاپ شده باشند
۲- مخاطبان کتاب دانشجویان ارشد و دکترا باشند
۳- عکس جلد کتاب و لینک خرید کتاب ارسال شود
۴- سرفصل های کتاب در قابل فایل pdf همراه با توضیحات کتاب برای ما ارسال شود.
🤏به پژوهشگران ارشد و دکتری که گزارش تاپی در رابطه با کاری که انجام دادن چاپ کردند و کارشون شامل یکنواوری کلیدی باشه به قید قرعه از طرف تیم مدیریت کانال یک جایزه تعلق خواهد گرفت
با تشکر
مدیریت کانال
----------------------------------------
🔰Iranian Researchers Bioinformatics Channel:
https://t.iss.one/IRBioinformatics
👍6
آکادمی بیوانفورماتیک محققان ایرانی pinned «دوستان عزیز سلام اگر کتاب یا مقاله ای در حوزه بیوتکنولوژی، بیوشیمی، میکروبیولوژی و سایر علوم زیستی با رویکرد مولکولی-محاسباتی چاپ کردین میتونین در زیر اینپست به همراه یکپاراگراف توضیح مقاله یا کتابتون بزارین برامون و یک پاراگراف همراجب زمینه تحقیقاتی…»
سیستم CRISPR-Cas یک ابزار قدرتمند برای ویرایش دقیق ژن است. این سیستم از یک توالی راهنمای RNA کوچک که یک توالی خاص از DNA را شناسایی میکند و یک آنزیم Cas که DNA را برش میدهد، تشکیل شده است. طبقهبندی سیستمهای CRISPR-Cas برای درک عملکرد و کاربردهای بالقوه آنها بسیار مهم است. پرکاربردترین سیستمهای طبقهبندی، سیستم طبقهبندی زوریخ و سیستم طبقهبندی ملبورن هستند. بررسی طبقهبندی CRISPR-Cas برای دانشگاهیان، پژوهشگران و صنایع فعال در حوزه ویرایش ژن ضروری است. در مقاله پیوست درک جامعی از انواع مختلف سیستمهای CRISPR-Cas و تغییرات آنها در طول زمان ارائه شده است.
@irbioinformatics
@irbioinformatics
🔥5
crispr.pdf
2.5 MB
طبقهبندی تکاملی سیستمهای CRISPR-Cas: انفجاری از سیستمهای کلاس ۲ و واریانتهای مشتقشده.
@irbioinformatics
@irbioinformatics
👍2
شیمی دانان داروها را کشف می کنند و داروها جان انسان ها را نجات می دهند.
مولکولهای دارویی محور اصلی درمانهای پزشکی مدرن هستند که تسکین درد، مبارزه با عفونتها و ارائه مجموعهای از اثرات درمانی دیگر را فراهم میکنند. تلاش برای یافتن و بهبود مولکولهای دارویی جدید، محرک پژوهشهای پزشکی است و معرفی یک داروی جدید اغلب به رویدادی خبری تبدیل میشود که توجه رسانهها و عموم مردم را جلب میکند. با این حال، تصورات نادرستی وجود دارد. بسیاری از مردم بر این باورند که مولکولهای دارویی توسط پزشکان طراحی، ساخته و اختراع میشوند، نه شیمیدانان – یک سوء تفاهم که تنها بخشی از کمتوجهی گسترده به نقش شیمی در سلامت و رفاه اجتماعی-اقتصادی بشریت است. علم شیمی به عنوان یک رشته باید این روایت را تغییر دهد.
@irbioinformatics
این مقاله یکی از بهترین مقالات مروری است که در مورد داروها نوشته شده واقعا به دوستانی که توی این فیلد کار میکنن توصیه میکنم بخون این مقاله رو
https://t.iss.one/IRBioinformatics/866
مولکولهای دارویی محور اصلی درمانهای پزشکی مدرن هستند که تسکین درد، مبارزه با عفونتها و ارائه مجموعهای از اثرات درمانی دیگر را فراهم میکنند. تلاش برای یافتن و بهبود مولکولهای دارویی جدید، محرک پژوهشهای پزشکی است و معرفی یک داروی جدید اغلب به رویدادی خبری تبدیل میشود که توجه رسانهها و عموم مردم را جلب میکند. با این حال، تصورات نادرستی وجود دارد. بسیاری از مردم بر این باورند که مولکولهای دارویی توسط پزشکان طراحی، ساخته و اختراع میشوند، نه شیمیدانان – یک سوء تفاهم که تنها بخشی از کمتوجهی گسترده به نقش شیمی در سلامت و رفاه اجتماعی-اقتصادی بشریت است. علم شیمی به عنوان یک رشته باید این روایت را تغییر دهد.
@irbioinformatics
این مقاله یکی از بهترین مقالات مروری است که در مورد داروها نوشته شده واقعا به دوستانی که توی این فیلد کار میکنن توصیه میکنم بخون این مقاله رو
https://t.iss.one/IRBioinformatics/866
👍2
ChemMedChem_2024_Weaver_Chemists_Invent_Drugs_and_Drugs_Save_Lives.pdf
226.6 KB
Chemists Invent Drugs and Drugs Save Lives
https://t.iss.one/IRBioinformatics/867
https://t.iss.one/IRBioinformatics/867
👍3
گوجه فرنگی های غنی از آنتوسیانین ها محصولی مدرن حاصل تلاش محققان حوزه بیوتکنولوژی که در امریکا مجوز مصرف و کشت گسترده دریافت کرد. این محصول که غنی از مواد مغذی و انتی اکسیدانت ها است می تواند به صورت موثری سطح ردوکس بدن را تنظیم کند و منبعی سرشار از مواد مغذی باشد.
این ارقام گوجه فرنگی با استفاده از تکنولوژی مولکولی RNAi، مهندسی فاکتورهای رونویسی و مسیر سنتز ژن های کلیدی در ساخت ترکیبات پلی فنولی توسط پرفسور Cathie Martin توسعه داده شده اند
@irbioinformatics
#خبر #بیوتکنولوژی #کشاورزی #گوجه فرنگی
انتشار با ذکر نام کانال مجاز است.
https://t.iss.one/IRBioinformatics/871?single
این ارقام گوجه فرنگی با استفاده از تکنولوژی مولکولی RNAi، مهندسی فاکتورهای رونویسی و مسیر سنتز ژن های کلیدی در ساخت ترکیبات پلی فنولی توسط پرفسور Cathie Martin توسعه داده شده اند
@irbioinformatics
#خبر #بیوتکنولوژی #کشاورزی #گوجه فرنگی
انتشار با ذکر نام کانال مجاز است.
https://t.iss.one/IRBioinformatics/871?single
👍7
این متن با دقت بخونین:
21 years after collecting data during my PhD, we finally published the structure of the RNA-dependent RNA polymerase from bacteriophage
phi8!
I couldn't solve it in 2003 but Kamel El Omari tried molecular replacement using the #AlphaFold2 model and it worked!
Lesson learned: never discard data!
Paula S. Salgado
قابل توجه دانشجوایی که فک میکنن اگه بعد از اتمام تحصیلاتشون و دفاع از تزشون نتونستن مقاله ای چاپ کنن. این خانم 21 سال بعد از اینکه از تز دکتراش دفاع کرده تونسته مقاله ی تزش چاپ کنه و پروژه ای که روش کار کرده رو منتشر کنه. این داستان یک درس اخلاقی داره و اونم اینه که هیچ وقت کاری که انجام میدین رو بی ارزش قلمداد نکنین و پروندش رو نبندین محقق واقعی اینه هر لحظه به داده هاش نگاه کنه و از ابزارهای موجود استفاده کنه تا اگر یه زمانی که محدودیت ابزاری یا تجهیزاتی داشته در تایم مناسب بتونه از امکانات در دسترس برای تکمیل کارش استفاده کنه. جلمه اخرش خیلی جذاب و قشنگ بود....من لذت بردم امیدوارم تجربه ای بشه برای محققان جوان کشورمون... فایل مقالشون هم در ادامه می تونین مطالعه کنین.
21 years after collecting data during my PhD, we finally published the structure of the RNA-dependent RNA polymerase from bacteriophage
phi8!
I couldn't solve it in 2003 but Kamel El Omari tried molecular replacement using the #AlphaFold2 model and it worked!
Lesson learned: never discard data!
Paula S. Salgado
قابل توجه دانشجوایی که فک میکنن اگه بعد از اتمام تحصیلاتشون و دفاع از تزشون نتونستن مقاله ای چاپ کنن. این خانم 21 سال بعد از اینکه از تز دکتراش دفاع کرده تونسته مقاله ی تزش چاپ کنه و پروژه ای که روش کار کرده رو منتشر کنه. این داستان یک درس اخلاقی داره و اونم اینه که هیچ وقت کاری که انجام میدین رو بی ارزش قلمداد نکنین و پروندش رو نبندین محقق واقعی اینه هر لحظه به داده هاش نگاه کنه و از ابزارهای موجود استفاده کنه تا اگر یه زمانی که محدودیت ابزاری یا تجهیزاتی داشته در تایم مناسب بتونه از امکانات در دسترس برای تکمیل کارش استفاده کنه. جلمه اخرش خیلی جذاب و قشنگ بود....من لذت بردم امیدوارم تجربه ای بشه برای محققان جوان کشورمون... فایل مقالشون هم در ادامه می تونین مطالعه کنین.
👍6
s41598-024-75213-7.pdf
2.7 MB
Structure of the RNA-dependent RNA polymerase P2 from the cystovirus φ8
----------------------------------------
https://t.iss.one/IRBioinformatics
----------------------------------------
🔰Iranian Researchers Bioinformatics Channel:
https://t.iss.one/IRBioinformatics
👍4