#معرفی_مقاله
امروزه اهمیت میکروRNAها (miRNAها) در عملکرد بیولوژیکی به طور فزاینده‌ای مورد توجه قرار گرفته است، بخصوص اکنون که جایزه نوبل نیز به کاشف این مولکول های زیستی اختصاص یافته است اهمیت آن دو چندان شده است – بسیاری از miRNAها در حال حاضر به عنوان نشانگرهای زیستی بیماری در کارآزمایی‌های بالینی مورد استفاده قرار می گیرند، در حالی که برخی دیگر از پروژه های بالینی به عنوان اهداف درمانی مورد آزمایش قرار می‌گیرند.

این مقاله مروری به بررسی نقش miRNAها در سه جنبه اصلی بیماری‌های انسانی می‌پردازد: سرطان، بیماری‌های التهابی و بیماری‌های عصبی، که به طور فزاینده ای بار قابل توجهی بر سلامت جهانی دارند و چالش‌های بالینی مهم و حل‌نشده‌ای را به همراه دارند.

برای مطالعه این مقاله ارزشمند بر روی این لینک کلیک کنید.
https://t.iss.one/IRBioinformatics/836

#تصویر_اختصاصی_کانال
دوستان همونطور که میدونید تجزیه پروتئوگلیکان‌های ماتریکس خارج سلولی از سیتوزول آغاز می‌شود، جایی که این پروتئوگلیکان‌ها به گلیکوزآمینوگلیکان‌ها (GAGs) مانند هپاران سولفات (HS)، کندرویتین سولفات، درماتان سولفات و کراتان سولفات پروتئولیز می‌شوند. گلیکوزآمینوگلیکان‌های پروتئولیز شده به مسیرهای چند‌آنزیمی خاص گلیکوزآمینوگلیکان در لیزوزوم‌ها وارد شده و به مونوساکاریدها و باقی‌مانده‌های آزاد سولفات تجزیه می‌شوند. نقص در عملکرد آنزیم‌های دخیل در تجزیه GAGها، که اغلب به‌صورت ارثی است، منجر به تجمع غیرطبیعی محصولات تجزیه ناقص درون لیزوزوم‌ها می‌شود و به بروز موکوپلی‌ساکاریدوزها (MPSs) می‌انجامد. این اصطلاح به مجموعه‌ای از اختلالات ذخیره‌ای لیزوزومی نادر با وراثت اتوزومال مغلوب اشاره دارد که با تجمع GAGهای نیمه‌تجزیه‌شده مشخص می‌شود
در اینجا می‌توانید یک ساختار با وضوح بالا از میکروسکوپ الکترونی سرمایشی (cryoEM) مربوط به آنزیم انسانی هپاران-آلفا-گلوکوزامینید N-استیل‌ترانسفراز را مشاهده کنید که در کمپلکس با لیپیدها قرار دارد (PDB: 8JKV).
https://t.iss.one/IRBioinformatics/840

#دانستنی_ها
زمانی که یک نارگیل رسیده از درخت نارگیل می‌افتد و دست‌نخورده باقی می‌ماند، یک تغییر شگفت‌انگیز آغاز می‌شود. درون پوسته سخت آن، آب نارگیل شروع به جذب شدن توسط دانه داخلی می‌کند که منجر به تشکیل ساختاری منحصر به فرد به نام «سیب نارگیل» یا «نارگیل جوانه‌زده» می‌شود. این سیب نارگیل بافتی نرم و پنبه‌ای مانند دارد و طعمی شیرین و آبدار که هم لذیذ است و هم مقوی.

با رشد سیب نارگیل، مواد مغذی ضروری را به جنین در حال رشد درون دانه می‌رساند. این تغذیه برای فرایند جوانه‌زنی بسیار حیاتی است و به جنین امکان می‌دهد که جوانه بزند و در نهایت به یک درخت نارگیل جدید تبدیل شود. نقش سیب نارگیل در این چرخه طبیعی بسیار مهم است، زیرا استمرار درختان نارگیل در مناطق گرمسیری را تضمین می‌کند.

انتشار با ذکر منبع مجاز است
https://t.iss.one/IRBioinformatics/841

#اخبار_بیوتکنولوژی_کشاورزی
اخبار جدید حاکی از اینه که دانشمندان با استفاده از فناوری ویرایش ژن CRISPR/Cas9 پیشرفتی چشمگیر در بیوتک کشاورزی به دست آورده‌اند. آن‌ها موفق به ویرایش ژنوم سیب‌زمینی شدند که نتیجه آن، گیاهانی با مقاومت بیشتر در برابر تنش‌های زیستی و غیرزیستی است. این نوآوری می‌تواند به آغاز عصری جدید در کشاورزی پایدار منجر شود، جایی که محصولات به طور طبیعی در برابر بیماری‌ها و شرایط سخت محیطی تقویت می‌شوند و بدین ترتیب تأمین پایدار غذا در مواجهه با تغییرات اقلیمی و چالش‌های جهانی دیگر تضمین شود.

انتشار با ذکر منبع مجاز است
https://t.iss.one/IRBioinformatics/842

دوستان اگه میخاین برای گرنت های 2025 و 2027 موسسه ملی سرطان و موسسه ملی بهداشت امریکا اقدام کنین و گرنت مشترک با محققان خارجی داشته باشین میتونین از لینک زیر اقدام کنید و شانس خود را برای دریافت این گرنت های اختصاصی امتحان کنید. برای دریافت این گرنت ها حتما باید یک محقق امریکایی همکار شما باشد
https://deais.nci.nih.gov/foastatus/

ای دل چو زمانه می‌ کند غمناکت
ناگه برود ز تن روان پاکت
بر سبزه نشین و خوش بزی روزی چند
زان پیش که سبزه بردمد از خاکت
خیام

📑 Nine quick tips for open meta-analyses

📕Journal: Plos Computational Biology (I.F.=3.8)
🗓Publish year: 2024

🧑‍💻Authors: David Moreau ,Kristina Wiebels
🏢University: University of Auckland, New Zealand

📎 Study the paper

📲Channel: @irBioinformatics
#meta_analysis

MIT - Introduction to Deep Learning

https://www.youtube.com/playlist?list=PLtBw6njQRU-rwp5__7C0oIVt26ZgjG9NI


----------------------------------------

🔰Iranian Researchers Bioinformatics Channel:

https://t.iss.one/IRBioinformatics

Our sister channels:
🆔️ https://t.iss.one/engvidcourses

⭕️What to Do When Your Paper Is Rejected.

Gail M. Sullivan, MD, MPH
J Grad Med Educ (2015)

✅Link



----------------------------------------

🔰Iranian Researchers Bioinformatics Channel:

https://t.iss.one/IRBioinformatics

Our sister channels:
🆔️ https://t.iss.one/engvidcourses

چالش های تشخیص اولیه سرطان

این مقاله مروری به صورت‌کلیدی بیانگر اهمیت و چالش های تشخیص‌اولیه کنسر در‌مراحل ابتدایی گسترش تومورها می باشد
https://t.iss.one/IRBioinformatics/854

ژنومیکس 4Dچیست و چه کاربردی دارد؟درباره پروژه nucleome چهار بعدی چه می دانید؟
👇👇👇👇👇

ژنومیکس چهاربعدی (4D Genomics) یک رویکرد نوین در مطالعه ژنوم است که به بررسی ساختار و عملکرد ژنوم در چهار بعد می‌پردازد. این رویکرد به جای تمرکز صرف بر توالی DNA، به تعاملات فضایی و زمانی بین ژن‌ها و عناصر تنظیمی توجه می‌کند. در این راستا، ابعاد چهارگانه شامل توالی ژنتیکی، ساختار سه‌بعدی کروماتین، زمان بیان ژن و شرایط محیطی است که همگی بر فعالیت ژن‌ها تأثیر می‌گذارند.

یکی از جنبه‌های کلیدی ژنومیکس چهاربعدی، بررسی ساختار فضایی کروماتین است. درون هسته سلول، DNA به صورت پیچیده‌ای سازمان‌دهی شده است و این سازمان‌دهی بر نحوه دسترسی پروتئین‌ها به ژن‌ها تأثیر می‌گذارد. با استفاده از تکنیک‌هایی مانند Hi-C، پژوهشگران می‌توانند نقشه‌های سه‌بعدی از کروماتین را ترسیم کرده و بفهمند که چگونه نواحی مختلف ژنوم با یکدیگر تعامل دارند. این اطلاعات به درک بهتر از تنظیم بیان ژن کمک می‌کند.

علاوه بر این، زمان‌بندی بیان ژن نیز بخشی از این رویکرد است. ژن‌ها در پاسخ به سیگنال‌های مختلف محیطی و در زمان‌های خاصی فعال یا غیرفعال می‌شوند. با استفاده از تکنیک‌های پیشرفته مانند RNA-seq، پژوهشگران می‌توانند الگوهای بیان ژن را در زمان‌های مختلف بررسی کرده و تأثیرات متقابل بین زمان و فضا را شناسایی کنند. این اطلاعات می‌تواند به توضیح فرآیندهای بیولوژیکی پیچیده مانند توسعه، تمایز سلولی و بیماری‌ها کمک کند.

در نهایت، ژنومیکس چهاربعدی امکانات جدیدی برای تحقیقات پزشکی و بیولوژیکی فراهم می‌آورد. با درک بهتر از نحوه تعاملات فضایی و زمانی در سطح ژنوم، می‌توانیم به شناسایی اهداف درمانی جدید، پیش‌بینی پاسخ‌های دارویی و توسعه استراتژی‌های درمانی شخصی‌سازی‌شده بپردازیم. این رویکرد نه تنها به دانش ما از بیولوژی پایه افزوده، بلکه می‌تواند به پیشرفت‌های قابل توجهی در زمینه پزشکی مولکولی و درمان بیماری‌ها منجر شود.

شبکه هسته‌نگاری چهاربعدی (4D Nucleome Network) هدف دارد تا روش‌هایی را برای نقشه‌برداری از ساختار و دینامیک ژنوم‌های انسانی و موشی در فضا و زمان توسعه و به‌کار گیرد، با هدف دستیابی به بینش‌های مکانیکی عمیق‌تر درباره چگونگی سازمان‌دهی و عملکرد هسته. این پروژه روش‌های تجربی و محاسباتی را برای اندازه‌گیری حالت ژنوم و سازمان‌دهی هسته توسعه داده و ارزیابی خواهد کرد و بررسی می‌کند که چگونه این عوامل به تنظیم ژن و سایر عملکردهای ژنومی کمک می‌کنند.
برای کسب اطلاعات بیشتر بر‌روی‌لینک‌زیر کلیک‌ کنید
https://www.nature.com/articles/nature23884
👇
https://t.iss.one/IRBioinformatics/857

پروتئین‌های گیرنده هسته‌ای که بین سیتوپلاسم و هسته یک سلول جابه‌جا می‌شوند، در نقش‌های متنوعی از نظر فیزیولوژیکی و پاتولوژیکی دخالت دارند. این گیرنده‌های هسته‌ای می‌توانند توسط طیف وسیعی از لیگاندها – مانند ویتامین‌ها، هورمون‌ها و اسیدهای چرب – فعال شوند که باعث می‌شود گیرنده، رونویسی برخی از ژن‌ها را افزایش دهد.
به دلیل عملکردهای گسترده بیولوژیکی، گیرنده‌های هسته‌ای هدف اصلی داروها در داروشناسی هستند (سانتوس و همکاران، ۲۰۱۷). این داروها می‌توانند یا گیرنده را فعال کنند (آگونیست‌ها)، فعالیت گیرنده را مهار کنند (آگونیست‌های معکوس) یا فضای اتصال لیگاند را اشغال کنند به‌طوری‌که مولکول‌های دیگر نتوانند به آن دسترسی پیدا کنند (آنتاگونیست‌ها).

https://t.iss.one/IRBioinformatics/858