آکادمی بیوانفورماتیک محققان ایرانی
1.57K subscribers
1.57K photos
43 videos
423 files
718 links
Iranian Researchers Bioinformatics Academy


Our sister channel:
✅️ https://t.iss.one/apply_for_future

Our Instagram link:
✅️ https://www.instagram.com/irbioinformatics/

📬 Admin: @h3nrasouli
Download Telegram
آشنایی با شاخص کیفیت سنجی Q در مجلات علمی
#آموزش
شاخص Q یا Quartile یکی از معیارهای پرکاربرد در ارزیابی جایگاه علمی مجلات است که بر اساس میزان استنادها و شاخص‌های علم سنجی مانند Impact Factor در Web of Science یا CiteScore در Scopus محاسبه می‌شود. در این روش، مجلات هر حوزه علمی بر اساس رتبه استنادی مرتب می‌شوند و سپس به چهار بخش مساوی تقسیم می‌گردند. به این ترتیب، مجلات برتر در ربع اول (Q1) قرار می‌گیرند و به‌ عنوان معتبرترین نشریات آن حوزه شناخته می‌شوند.
‌。⁠◕⁠‿⁠◕⁠。⁩
◼️◼️◼️◼️◼️◼️◼️◼️◼️◼️◼️◼️◼️
🆔 Instagram | Telegram
3
#فروپتوزیس یک نوع مرگ سلولی غیرآپوپتوتیک وابسته به آهن است که بر اثر عدم تعادل اکسیداسیون-کاهش و پراکسیداسیون لیپیدی رخ می‌دهد. این فرایند در سطوح مختلف مولکولی تنظیم می‌شود؛ به‌طوری‌که NFE2L2 نقش محافظتی ضد فروپتوزیس دارد و اتوفاژی انتخابی می‌تواند آن را تقویت کند. اختلال در فروپتوزیس در بروز سرطان، بیماری‌های نورودژنراتیو، آسیب بافتی، التهاب و عفونت نقش دارد.
‌。⁠◕⁠‿⁠◕⁠。⁩
◼️◼️◼️◼️◼️◼️◼️◼️◼️◼️◼️◼️◼️
🆔 Instagram | Telegram
🔥43
معرفی پایگاه داده PlantFA
پایگاه داده PlantFAdb یک منبع تخصصی برای بررسی اسیدهای چرب گیاهی و مسیرهای بیوسنتزی مرتبط با آن‌هاست. این پایگاه اطلاعاتی شامل داده‌های ساختاری، بیوشیمیایی و فیلوژنتیکی مربوط به ترکیبات لیپیدی در گونه‌های مختلف گیاهی است. کاربران می‌توانند با جستجوی نام گونه، نوع اسید چرب یا مسیر متابولیکی، به اطلاعات دقیق و قابل استناد دسترسی پیدا کنند. هدف اصلی PlantFAdb، تسهیل پژوهش در زمینه زیست‌شناسی گیاهی، مهندسی متابولیک و بیوتکنولوژی کشاورزی است.

یکی از ویژگی‌های برجسته PlantFAdb، نمایش گرافیکی مسیرهای بیوسنتزی و ارتباط آن‌ها با گونه‌های گیاهی مختلف است. این پایگاه همچنین امکان مقایسه فیلوژنتیکی بین گیاهان تولیدکننده ترکیبات خاص را فراهم می‌کند و به پژوهشگران کمک می‌کند تا روند تکاملی تولید لیپیدها را بهتر درک کنند. با توجه به رشد روزافزون مطالعات در زمینه تولید اسیدهای چرب غیرمعمول و کاربردهای صنعتی آن‌ها، PlantFAdb به‌عنوان یک ابزار کلیدی در طراحی مدل‌های متابولیکی و تحلیل داده‌های اُمیکس شناخته می‌شود.
‌。⁠◕⁠‿⁠◕⁠。⁩
◼️◼️◼️◼️◼️◼️◼️◼️◼️◼️◼️◼️◼️
🆔 Instagram | Telegram
8😁1
PlantFAs.pdf
33.6 MB
فایل آموزشی معرفی پایگاه داده PlantFA و شیوه کار با آن
#not_for_sale
‌。⁠◕⁠‿⁠◕⁠。⁩
◼️◼️◼️◼️◼️◼️◼️◼️◼️◼️◼️◼️◼️
🆔 Instagram | Telegram
6👍2
‌آشنایی با طیف سنجی FTIR: بخش اول

طیف‌سنجی FTIR یک تکنیک تحلیلی حیاتی برای محققان است که قابلیت تعیین همزمان اجزای آلی، شامل پیوندهای شیمیایی و محتوای آلی مانند پروتئین، کربوهیدرات، و لیپید را فراهم می‌آورد. این روش تحلیلی به دلیل سرعت، دقت خوب، و حساسیت نسبی، بسیار محبوب است و می‌تواند برای مشخصه‌یابی نمونه‌هایی در حالت‌های مختلف از جمله مایعات، پودرها، فیلم‌ها، الیاف و گازها مورد استفاده قرار گیرد. در تجزیه و تحلیل FTIR، نمونه‌ها در معرض امواج فروسرخ قرار می‌گیرند، این امواج بر ارتعاشات اتمی مولکول‌ها تأثیر گذاشته و جذب یا انتقال انرژی خاصی را ایجاد می‌کنند که برای تعیین ارتعاشات مولکولی نمونه مفید است.

...ادامه این مطلب در پست‌های بعدی...

。⁠◕⁠‿⁠◕⁠。⁩
◼️◼️◼️◼️◼️◼️◼️◼️◼️◼️◼️◼️◼️
🆔 Instagram | Telegram
7👏1
نقش آفلاتوکسین‌ها در شیوع دیابت و آلزایمر
آفلاتوکسین‌ها از جمله توکسین‌های قارچی هستند که با مصرف مواد غذایی آلوده وارد بدن شده و می‌توانند عملکرد متابولیکی را مختل کنند. این ترکیبات با ایجاد استرس اکسیداتیو و آسیب به سلول‌های کبد و پانکراس، در بروز بیماری‌هایی مانند دیابت نوع ۲ و مقاومت به انسولین نقش دارند.

از طرف دیگر، افلاتوکسین‌ها با عبور از سد خونی-مغزی و تحریک التهاب عصبی، ممکن است در تخریب نورون‌ها و تجمع پروتئین‌های آسیب‌زا مؤثر باشند. این فرآیندها می‌توانند حافظه و عملکرد شناختی را تحت تأثیر قرار دهند و خطر ابتلا به آلزایمر را افزایش دهند.بنابراین، کنترل آلودگی‌های غذایی و پایش سطح افلاتوکسین‌ها در زنجیره تأمین مواد غذایی، نه‌تنها برای سلامت عمومی بلکه برای پیشگیری از بیماری‌های مزمن و عصبی اهمیت حیاتی دارد.

...برای مطالعه بیشتر کلیک کنید...
。⁠◕⁠‿⁠◕⁠。⁩
◼️◼️◼️◼️◼️◼️◼️◼️◼️◼️◼️◼️◼️
🆔 Instagram | Telegram
5👏3👍2
چرا در سلول های گیاهی سانتریول غایب است؟

سانتریول یک اندامک استوانه‌ای بدون غشا در سلول‌های جانوری است که از میکروتوبول‌ها ساخته شده و در نزدیکی هسته قرار دارد. این ساختار در تقسیم سلولی نقش کلیدی دارد و با سازماندهی رشته‌های دوک، به جداسازی دقیق کروموزوم‌ها کمک می‌کند. همچنین سانتریول‌ها در تشکیل مژک و تاژک نقش دارند، اما در سلول‌های گیاهی پیشرفته به‌ دلیل تفاوت‌های ساختاری و عملکردی، وجود ندارند.
。⁠◕⁠‿⁠◕⁠。⁩
◼️◼️◼️◼️◼️◼️◼️◼️◼️◼️◼️◼️◼️
🆔 Instagram | Telegram
👍82
در مورد پپتیدهای لگویی چه می دانید؟

پپتیدهای لگویی یا پپتیدهای خودتکمیلی یونی دسته‌ای از مولکول‌های کوچک پروتئینی هستند که معمولاً حدود ۵ نانومتر اندازه و ۱۶ اسیدآمینه دارند. این پپتیدها دو سطح مشخص دارند: یک سطح آب‌گریز که باعث خودآرایی آن‌ها در محیط آبی می‌شود و یک سطح آب‌دوست با آرایش منظم اسیدآمینه‌های باردار که الگوهای مختلفی از پیوندهای یونی را ایجاد می‌کند (مانند الگوی +−+− یا ++−−).

چنین آرایشی موجب می‌شود پپتیدها در حضور کاتیون‌های قلیایی یا با افزودن محلول پپتیدی، به نانوالیاف حدود ۱۰ نانومتری خودآرا یا self-assemble شوند.

این نانوالیاف سپس با برقراری تعاملات یونی، ماتریس‌هایی شبیه صفحه شطرنج ایجاد می‌کنند که به شکل یک هیدروژل سه‌بعدی با محتوای آب بسیار بالا (بیش از ۹۹٫۵٪) و منافذی در ابعاد ۱۰ تا ۲۰۰ نانومتر در می‌آید. چنین هیدروژل‌هایی بستری مناسب برای رشد و امتداد نوریت‌ها فراهم کرده و بنابراین کاربرد گسترده‌ای به‌عنوان داربست در مهندسی بافت دارند.

....مطالعه بیشتر...
。⁠◕⁠‿⁠◕⁠。⁩
◼️◼️◼️◼️◼️◼️◼️◼️◼️◼️◼️◼️◼️
🆔 Instagram | Telegram
7👍3
اسامی منتخبین سی و دومین جشنواره دانشجوی نمونه کشوری سال ۱۴۰۳ وزارت علوم، تحقیقات و فناوری و وزارت بهداشت، درمان و آموزش پزشکی در مقاطع تحصیلی کارشناسی، کارشناسی ارشد و دکتری تخصصی منتشر شد./روزنامه مدرس  
 
 
 

لینک دانلود فایل 


。⁠◕⁠‿⁠◕⁠。⁩
◼️◼️◼️◼️◼️◼️◼️◼️◼️◼️◼️◼️◼️
🆔 Instagram | Telegram
2
ابزار انقلابی CRISPR-GPT معرفی شد!

سیستم CRISPR-GPT یک ابزار هوش مصنوعی پیشرفته است که برای کمک به طراحی و تحلیل آزمایش‌های ویرایش ژن با استفاده از فناوری CRISPR توسعه یافته است. این سیستم بر پایه مدل‌های زبانی بزرگ (LLMs) ساخته شده است و با آموزش‌های تخصصی در حوزه بیوتکنولوژی، توانایی انجام وظایف پیچیده را دارد.

برای دانشجویان علوم زیستی یا علاقه مندانی که در حوزه بیوتکنولوژی (در تمام گرایش ها) فعالیت می کنند، ابزار CRISPR-GPT می‌تواند مانند یک دستیار هوشمند عمل کند و پنل مدیریتی یک پروژه زیستی مبتنی بر ویرایش ژن شامل انتخاب نوع سیستم CRISPR (مثل Cas9 یا Cas12a)، طراحی RNA راهنما (gRNA)، انتخاب روش انتقال به سلول، تدوین پروتکل‌های آزمایشگاهی، طراحی سنجش‌های عملکردی، تا تحلیل داده‌های حاصل از آزمایش را در اختیار قرار دهد و پژوهشگر این مراحل پیچیده را می‌تواند با کمک این ابزاربرای بهینه سازی یک پروژه ویرایش ژن یا ژنوم انجام دهد.

....آموزش نصب و راه اندازی ابزار در لینوکس....

。⁠◕⁠‿⁠◕⁠。⁩
◼️◼️◼️◼️◼️◼️◼️◼️◼️◼️◼️◼️◼️
🆔 Instagram | Telegram | Website
9