آکادمی بیوانفورماتیک محققان ایرانی
1.56K subscribers
1.57K photos
43 videos
423 files
718 links
Iranian Researchers Bioinformatics Academy


Our sister channel:
✅️ https://t.iss.one/apply_for_future

Our Instagram link:
✅️ https://www.instagram.com/irbioinformatics/

📬 Admin: @h3nrasouli
Download Telegram
آلکالوییدها به عنوان امیدهای تازه در درمان دیابت

دیابت یکی از چالش‌های جدی سلامت در جهان امروز است که آمار آن روندی نگران‌کننده دارد. بر اساس گزارش‌های بین‌المللی، صدها میلیون نفر در سراسر دنیا به این بیماری مبتلا هستند و پیش‌بینی می‌شود در دهه‌های آینده این رقم به شکل چشمگیری افزایش یابد. تغییر سبک زندگی، کم‌تحرکی، تغذیه نامناسب و افزایش چاقی از عوامل اصلی رشد شیوع دیابت به شمار می‌روند. این بیماری نه تنها بار مالی سنگینی بر سیستم‌های بهداشتی وارد می‌کند، بلکه عوارض جدی مانند بیماری‌های قلبی‌عروقی، نارسایی کلیوی و مشکلات بینایی را نیز به همراه دارد.

....برای مشاهده ادامه مطلب اینجا کلیک کنید...
◼️◼️◼️◼️◼️◼️◼️◼️◼️◼️◼️◼️◼️
🆔
Instagram | Telegram
4💊3👍2
اهمیت شاخص B-factor در آنالیز ساختار پروتئین‌ها

شاخص B-factor معمولاً از داده‌های پراش پرتو X در کریستالوگرافی به‌ دست می‌آید، جایی که میزان کاهش شدت پرتوهای پراش یافته نشان‌ دهنده نوسان اتم‌ها در ساختار بلوری است. در این روش با مدل‌سازی ریاضی شدت‌های پراش، فاکتور دمایی محاسبه می‌شود. علاوه بر آن، روش‌های محاسباتی مانند شبیه‌سازی دینامیک مولکولی و تحلیل نوسان‌های ذاتی یا Normal Mode Analysis نیز برای برآورد B-factor به‌ کار می‌روند و امکان مقایسه مستقیم با داده‌های تجربی را فراهم می‌کنند.
منابع:
1-
Chem. Rev. 2019, 119, 3, 1626–1665
2-
J. Phys. Chem. B 2014, 118, 15, 4069–4079


◼️◼️◼️◼️◼️◼️◼️◼️◼️◼️◼️◼️◼️
🆔
Instagram | Telegram
5🔥1
کرم انگلی شیستوزوما مانسونی و تسکین درد!
#دانستنی‌ها
کرم انگلی Schistosoma mansoni که در آب‌های شیرین زندگی می‌کند، می‌تواند بدون جلب توجه وارد پوست انسان شود و با مهار گیرنده‌های عصبی خاص، احساس خارش و درد را خاموش کند! یافته‌های جدید نشان می‌دهند این انگل مولکول‌هایی ترشح می‌کند که گیرنده‌های TPRV1 را غیرفعال می‌سازند—گیرنده‌هایی که معمولاً پیام‌های گرما، درد و خارش را به مغز منتقل می‌کنند.

هرچند این ویژگی در ابتدا ترسناک به نظر می‌رسد، اما دانشمندان امیدوارند با شناسایی دقیق این مولکول‌ها، بتوانند داروهای ضد درد جدیدی بدون وابستگی به مواد مخدر تولید کنند. این کشف می‌تواند دریچه‌ای نو به درمان‌های ایمن‌تر و مؤثرتر باز کند.

...برای مطالعه بیشتر در مورد این دستاورد اینجا کلیک کنید...
منبع:
1- Inclan-Rico et al. The Journal of Immunology, 2025;, vkaf141.
◼️◼️◼️◼️◼️◼️◼️◼️◼️◼️◼️◼️◼️
🆔
Instagram | Telegram
6
#معرفی_کتاب
کتاب A First Course in Systems Biology برای دانشجویان کارشناسی ارشد و دکتری حوزه علوم زیستی طراحی شده و تمرکز اصلی آن بر توسعه مدل‌های محاسباتی و کاربرد آن‌ها در سیستم‌های زیستی متنوع است.

با توجه به پیچیدگی روزافزون علوم زیستی، دیگر هیچ فردی نمی‌تواند به‌تنهایی دانش کامل در یک حوزه تخصصی داشته باشد. بنابراین، آموزش زیست‌شناسان سامانه‌ای آینده باید بر توانایی بازیابی، بازآرایی، ترکیب و تفسیر اطلاعات پیچیده زیستی تمرکز داشته باشد.

این کتاب زمینه علمی و مهارت‌های لازم برای انجام وظایف استاندارد زیست‌شناسی سامانه‌ای، درک منابع علمی به روز، و ورود به دوره‌ها یا پروژه‌های تخصصی را فراهم می‌کند که با استفاده از روش‌های نظری و محاسباتی به پرسش‌های زیستی می‌پردازند. ساختار کتاب ترکیبی از متن آموزشی و ارجاع به منابع اولیه است و با مجموعه‌ای از تمرین‌های کوچک برای تجربه عملی و پرسش‌های بزرگ‌تر و اغلب باز برای تفکر بیشتر تکمیل می‌شود.
◼️◼️◼️◼️◼️◼️◼️◼️◼️◼️◼️◼️◼️
🆔
Instagram | Telegram
5
آموزش ساختار داده در پایتون
#learn_to_code
#part_1_data_types_in_python
#python
همانطور که می دانید آشنایی با ساختار داده‌ها در پایتون اهمیت زیادی دارد زیرا نوع داده تعیین می‌کند که اطلاعات چگونه ذخیره، پردازش و مدیریت شوند. هر ساختار داده ویژگی‌ها و محدودیت‌های خاص خود را دارد، برای مثال لیست‌ها برای داده‌های پویا و قابل تغییر مناسب‌اند، در حالی که تاپل‌ها برای داده‌های ثابت و تغییرناپذیر استفاده می‌شوند. انتخاب درست نوع داده باعث افزایش کارایی برنامه، کاهش مصرف حافظه و ساده‌تر شدن کدنویسی می‌شود و به برنامه‌نویس کمک می‌کند مسائل پیچیده را با راه‌حل‌های بهینه‌تر و سریع‌تر حل کند.

....برای دسترسی به آموزش اینجا کلیک کنید...
◼️◼️◼️◼️◼️◼️◼️◼️◼️◼️◼️◼️◼️
🆔
Instagram | Telegram
6
بخش دوم آموزش پایتون: اهمیت کامنت و کاربرد آن در برنامه نویسی پایتون
#learn_to_code
#part_2_comments_in_python
#python

در زبان برنامه نویسی پایتون کامنت‌ها نقش بسیار مهمی در خوانایی و درک بهتر کد دارند. با استفاده از کامنت، می‌توان هدف یا منطق بخش‌های مختلف برنامه را توضیح داد تا هم خود برنامه‌نویس در مراجعات بعدی راحت‌تر متوجه شود و هم سایر توسعه‌ دهندگانی که ممکن است روی همان کد کار کنند، سریع‌تر آن را درک کنند. از آنجا که کامپیوتر کامنت‌ها را اجرا نمی‌کند، این توضیحات فقط برای انسان‌ها هستند و به نوعی به مستندسازی درون کد کمک می‌کنند. این موضوع در پروژه‌های بزرگ یا کار گروهی اهمیت بیشتری پیدا می‌کند، چون بدون کامنت، فهمیدن بخش‌های پیچیده کد زمان‌بر و دشوار خواهد بود.

....ادامه این آموزش را از اینجا بخوانید....
‌。⁠◕⁠‿⁠◕⁠。⁩
◼️◼️◼️◼️◼️◼️◼️◼️◼️◼️◼️◼️◼️
🆔
Instagram | Telegram
8
آشنایی با شاخص کیفیت سنجی Q در مجلات علمی
#آموزش
شاخص Q یا Quartile یکی از معیارهای پرکاربرد در ارزیابی جایگاه علمی مجلات است که بر اساس میزان استنادها و شاخص‌های علم سنجی مانند Impact Factor در Web of Science یا CiteScore در Scopus محاسبه می‌شود. در این روش، مجلات هر حوزه علمی بر اساس رتبه استنادی مرتب می‌شوند و سپس به چهار بخش مساوی تقسیم می‌گردند. به این ترتیب، مجلات برتر در ربع اول (Q1) قرار می‌گیرند و به‌ عنوان معتبرترین نشریات آن حوزه شناخته می‌شوند.
‌。⁠◕⁠‿⁠◕⁠。⁩
◼️◼️◼️◼️◼️◼️◼️◼️◼️◼️◼️◼️◼️
🆔 Instagram | Telegram
3
#فروپتوزیس یک نوع مرگ سلولی غیرآپوپتوتیک وابسته به آهن است که بر اثر عدم تعادل اکسیداسیون-کاهش و پراکسیداسیون لیپیدی رخ می‌دهد. این فرایند در سطوح مختلف مولکولی تنظیم می‌شود؛ به‌طوری‌که NFE2L2 نقش محافظتی ضد فروپتوزیس دارد و اتوفاژی انتخابی می‌تواند آن را تقویت کند. اختلال در فروپتوزیس در بروز سرطان، بیماری‌های نورودژنراتیو، آسیب بافتی، التهاب و عفونت نقش دارد.
‌。⁠◕⁠‿⁠◕⁠。⁩
◼️◼️◼️◼️◼️◼️◼️◼️◼️◼️◼️◼️◼️
🆔 Instagram | Telegram
🔥43
معرفی پایگاه داده PlantFA
پایگاه داده PlantFAdb یک منبع تخصصی برای بررسی اسیدهای چرب گیاهی و مسیرهای بیوسنتزی مرتبط با آن‌هاست. این پایگاه اطلاعاتی شامل داده‌های ساختاری، بیوشیمیایی و فیلوژنتیکی مربوط به ترکیبات لیپیدی در گونه‌های مختلف گیاهی است. کاربران می‌توانند با جستجوی نام گونه، نوع اسید چرب یا مسیر متابولیکی، به اطلاعات دقیق و قابل استناد دسترسی پیدا کنند. هدف اصلی PlantFAdb، تسهیل پژوهش در زمینه زیست‌شناسی گیاهی، مهندسی متابولیک و بیوتکنولوژی کشاورزی است.

یکی از ویژگی‌های برجسته PlantFAdb، نمایش گرافیکی مسیرهای بیوسنتزی و ارتباط آن‌ها با گونه‌های گیاهی مختلف است. این پایگاه همچنین امکان مقایسه فیلوژنتیکی بین گیاهان تولیدکننده ترکیبات خاص را فراهم می‌کند و به پژوهشگران کمک می‌کند تا روند تکاملی تولید لیپیدها را بهتر درک کنند. با توجه به رشد روزافزون مطالعات در زمینه تولید اسیدهای چرب غیرمعمول و کاربردهای صنعتی آن‌ها، PlantFAdb به‌عنوان یک ابزار کلیدی در طراحی مدل‌های متابولیکی و تحلیل داده‌های اُمیکس شناخته می‌شود.
‌。⁠◕⁠‿⁠◕⁠。⁩
◼️◼️◼️◼️◼️◼️◼️◼️◼️◼️◼️◼️◼️
🆔 Instagram | Telegram
8😁1
PlantFAs.pdf
33.6 MB
فایل آموزشی معرفی پایگاه داده PlantFA و شیوه کار با آن
#not_for_sale
‌。⁠◕⁠‿⁠◕⁠。⁩
◼️◼️◼️◼️◼️◼️◼️◼️◼️◼️◼️◼️◼️
🆔 Instagram | Telegram
6👍2
‌آشنایی با طیف سنجی FTIR: بخش اول

طیف‌سنجی FTIR یک تکنیک تحلیلی حیاتی برای محققان است که قابلیت تعیین همزمان اجزای آلی، شامل پیوندهای شیمیایی و محتوای آلی مانند پروتئین، کربوهیدرات، و لیپید را فراهم می‌آورد. این روش تحلیلی به دلیل سرعت، دقت خوب، و حساسیت نسبی، بسیار محبوب است و می‌تواند برای مشخصه‌یابی نمونه‌هایی در حالت‌های مختلف از جمله مایعات، پودرها، فیلم‌ها، الیاف و گازها مورد استفاده قرار گیرد. در تجزیه و تحلیل FTIR، نمونه‌ها در معرض امواج فروسرخ قرار می‌گیرند، این امواج بر ارتعاشات اتمی مولکول‌ها تأثیر گذاشته و جذب یا انتقال انرژی خاصی را ایجاد می‌کنند که برای تعیین ارتعاشات مولکولی نمونه مفید است.

...ادامه این مطلب در پست‌های بعدی...

。⁠◕⁠‿⁠◕⁠。⁩
◼️◼️◼️◼️◼️◼️◼️◼️◼️◼️◼️◼️◼️
🆔 Instagram | Telegram
7👏1