معرفی ابزار بیوانفورماتیکی iTOL
ابزارiTOL یا Interactive Tree Of Life یک ابزار آنلاین قدرتمند برای نمایش، ویرایش و تحلیل درختهای فیلوژنتیک است که در حوزههای بیوانفورماتیک، ژنتیک و زیستفناوری کاربرد گستردهای دارد. این پلتفرم به پژوهشگران اجازه میدهد تا درختهای تکاملی را با فرمتهایی مانند Newick بارگذاری کرده و بهصورت تعاملی آنها را بررسی کنند.
یکی از قابلیتهای برجسته iTOL ، امکان افزودن دادههای جانبی مانند ویژگیهای فنوتیپی، اطلاعات متادیتا، یا رنگگذاری انشعابات درخت است که به درک بهتر روابط بین گونهها کمک میکند.
همچنین این ابزار خروجیهای گرافیکی با کیفیت بالا برای استفاده در مقالات علمی، ارائهها و گزارشهای پژوهشی کاربران را نیز فراهم میسازد.
◼️◼️◼️◼️◼️◼️◼️◼️◼️◼️◼️◼️◼️
🆔 Instagram | Telegram
ابزار
یکی از قابلیتهای برجسته
همچنین این ابزار خروجیهای گرافیکی با کیفیت بالا برای استفاده در مقالات علمی، ارائهها و گزارشهای پژوهشی کاربران را نیز فراهم میسازد.
◼️◼️◼️◼️◼️◼️◼️◼️◼️◼️◼️◼️◼️
🆔 Instagram | Telegram
❤6👍2👏1
اطلس جامع فیبروبلاستها منتشر شد
فناوری RNA تکسلولی نشان داده کهفیبروبلاستها از نظر منشأ، عملکرد و فنوتیپ بسیار متنوع هستند. برای درک این تنوع، پژوهشگران ۷۳ مطالعه تکسلولی از ۱۰ نوع بافت را گردآوری کرده و اطلس دقیقی از فیبروبلاستها با نام Fibroblast Atlas ارائه دادهاند که شامل ۱۸ زیرگروه و بیش از ۲۴۹ هزار سلول است. این اطلس اطلاعاتی جامع درباره توزیع، تعاملات سلولی، مقایسهها و ارتباط با پیشآگهی سرطانها فراهم میکند و بستری برای بررسی دقیقتر زیرگروههای فیبروبلاست در انواع سرطانها در اختیار کاربران قرار میدهد.
◼️◼️◼️◼️◼️◼️◼️◼️◼️◼️◼️◼️◼️
🆔 Instagram | Telegram
فناوری RNA تکسلولی نشان داده که
◼️◼️◼️◼️◼️◼️◼️◼️◼️◼️◼️◼️◼️
🆔 Instagram | Telegram
❤3👏3
sciadv.ado0173.pdf
10 MB
اطلس جامع فیبروبلاست ها مقاله منتشر شده در ساینس:
خلاصه مقاله:
پژوهشگران با تحلیل بیش از ۲۴۹ هزار فیبروبلاست از ۷۳ مطالعه در ۱۰ نوع بافت، اطلس تکسلولی جامعی از فیبروبلاستها ارائه دادند و ۱۸ زیرگروه مختلف را شناسایی کردند. در این میان، جمعیتی جدید از سلولها با نام فیبروبلاستهای TSPAN8+ با عملکرد در تغییرات کروماتین کشف شد که با بیان بالای ژنهای مرتبط با اصلاح هیستون شناخته میشوند. این سلولها در دادههای ترانسکریپتوم فضایی و آزمایشهای ایمونوفلورسانس قابل شناسایی بوده و ارتباط نزدیکی با سلولهای اندوتلیال و T دارند. حضور آنها با پیشآگهی ضعیف مرتبط است و این یافتهها گامی مهم در درک تنوع فیبروبلاستها در بافتهای مختلف محسوب میشود.
◼️◼️◼️◼️◼️◼️◼️◼️◼️◼️◼️◼️◼️
🆔 Instagram | Telegram
خلاصه مقاله:
پژوهشگران با تحلیل بیش از ۲۴۹ هزار فیبروبلاست از ۷۳ مطالعه در ۱۰ نوع بافت، اطلس تکسلولی جامعی از فیبروبلاستها ارائه دادند و ۱۸ زیرگروه مختلف را شناسایی کردند. در این میان، جمعیتی جدید از سلولها با نام فیبروبلاستهای TSPAN8+ با عملکرد در تغییرات کروماتین کشف شد که با بیان بالای ژنهای مرتبط با اصلاح هیستون شناخته میشوند. این سلولها در دادههای ترانسکریپتوم فضایی و آزمایشهای ایمونوفلورسانس قابل شناسایی بوده و ارتباط نزدیکی با سلولهای اندوتلیال و T دارند. حضور آنها با پیشآگهی ضعیف مرتبط است و این یافتهها گامی مهم در درک تنوع فیبروبلاستها در بافتهای مختلف محسوب میشود.
◼️◼️◼️◼️◼️◼️◼️◼️◼️◼️◼️◼️◼️
🆔 Instagram | Telegram
❤4👏1
معرفی ابزار تخصصی طراحی اتصال دهنده پروتئینی BindCraft
پژوهشگران با معرفیسامانه متنباز BindCraft ، گام بزرگی در طراحی اتصالدهندههای پروتئینی برداشتهاند. این ابزار با بهرهگیری از مدل AlphaFold2، قادر است بدون نیاز به اطلاعات قبلی از محل اتصال یا آزمایشهای پرهزینه، اتصالدهندههایی با قدرت بالا و دقت نانومولار طراحی کند.
ابزار BindCraft موفق شده است برای اهداف پیچیدهای مانند گیرندههای سطح سلولی، آلرژنها، پروتئینهای طراحیشده و سیستمهای ویرایش ژن مانند CRISPR-Cas9، اتصالدهندههای مؤثر تولید کند .
این اتصالدهندهها توانستهاند عملکردهای درمانی مهمی از جمله کاهش سمیت باکتریایی، تنظیم فعالیت Cas9 و کاهش اتصال IgE به آلرژن در نمونههای بیماران داشته باشند. همچنین، از آنها برای هدایت دقیق کپسیدهای ویروسی AAV در انتقال ژن استفاده شده است که نویدبخش تحول در درمانهای هدفمند و بیوتکنولوژیکی است
....ادامه مطلب را از اینجا بخوانید....
◼️◼️◼️◼️◼️◼️◼️◼️◼️◼️◼️◼️◼️
🆔 Instagram | Telegram
پژوهشگران با معرفی
این
◼️◼️◼️◼️◼️◼️◼️◼️◼️◼️◼️◼️◼️
🆔 Instagram | Telegram
🔥4❤1👍1👏1
FreeBindCraft-master.zip
3.7 MB
فایل پیوست شامل: کدهای مرجع و اسکریپت های مورد نیاز برای نصب ابزار BindCraft است. می توانید پوشه را مستقیما دانلود کرده و سپس از حالت فشرده خارج کنید و در مسیر /home/ قرار دهید و سپس مطابق دستورالعمل نصب که در پست قبلی معرفی شد آن را نصب و اجرا کنید. فرمت ورودی این ابزار .json است.
◼️◼️◼️◼️◼️◼️◼️◼️◼️◼️◼️◼️◼️
🆔 Instagram | Telegram
◼️◼️◼️◼️◼️◼️◼️◼️◼️◼️◼️◼️◼️
🆔 Instagram | Telegram
❤2👏1
🔬 پیشرفت چشمگیر در درمان مسمومیت با مونوکسید کربن
محققان با استفاده ازمهندسی هموپروتئین موفق به طراحی یک عامل جذبکننده مونوکسید کربن با قدرت اتصال بسیار بالا و انتخابپذیری بیسابقه شدند. این مولکول جدید با نام RcoM-HBD-CCC در مدل حیوانی توانست بهطور مؤثر CO را از هموگلوبین پاکسازی کرده و با حداقل فشار خون بالا، از طریق ادرار دفع شود.
برخلافدرمانهای فعلی که محدود به اکسیژندرمانی هستند ، این روش نوین با کاهش عوارض قلبی و عصبی، امید تازهای برای درمان سریع و مؤثر مسمومیت با CO فراهم کرده است .
این دستاورد میتواند مسیر توسعه درمانهای نقطهای و ایمن را برای قربانیان این نوع مسمومیت هموار سازد. نتایج این مطالعه در ژرونال PNAS در تاریخ 5 آگوست 2025 منتشر شده است.
....از اینجا متن کامل این مطالعه را مطالعه کنید....
◼️◼️◼️◼️◼️◼️◼️◼️◼️◼️◼️◼️◼️
🆔 Instagram | Telegram
محققان با استفاده از
برخلاف
این دستاورد میتواند مسیر توسعه درمانهای نقطهای و ایمن را برای قربانیان این نوع مسمومیت هموار سازد. نتایج این مطالعه در ژرونال PNAS در تاریخ 5 آگوست 2025 منتشر شده است.
◼️◼️◼️◼️◼️◼️◼️◼️◼️◼️◼️◼️◼️
🆔 Instagram | Telegram
❤5👍1👏1
matthew-r-dent-engineering-a-highly-selective.pdf
3 MB
🔬 پیشرفت چشمگیر در درمان مسمومیت با مونوکسید کربن
محققان با استفاده از مهندسی هموپروتئین موفق به طراحی یک عامل جذبکننده مونوکسید کربن با قدرت اتصال بسیار بالا و انتخابپذیری بیسابقه شدند
لینک خبر | لینک مقاله | اینستاگرام
◼️◼️◼️◼️◼️◼️◼️◼️◼️◼️◼️◼️◼️
🆔 Instagram | Telegram
محققان با استفاده از
لینک خبر | لینک مقاله | اینستاگرام
◼️◼️◼️◼️◼️◼️◼️◼️◼️◼️◼️◼️◼️
🆔 Instagram | Telegram
❤3👏1
#انگیزشی
دانشجویان دکتری!
اگر پژوهشهای امروزتان هنوز کاربرد یا تأثیر فوری ندارند، دلسرد نشوید! علم همیشه به دنبال مد روز نیست، بلکه کنجکاوی و جسارت در کاوش ناشناختههاست که مسیر پیشرفت را میسازد.
بسیاری از دستاوردهای بزرگ علمی، سالها پس از انتشار اولیه شکوفا شدهاند—مثل روش تهیه اکسید گرافیت در سال ۱۹۵۸ که با کشف گرافن در ۲۰۱۰ به نقطهعطفی تبدیل شد، یا پژوهشهای فرضی درباره سیاهچالهها که دههها بعد با کشف امواج گرانشی معنا یافتند.
تأثیر واقعی زمانبر است، اما همین کنجکاویهای امروز میتوانند ستونهای علم فردا باشند. پس با انگیزه ادامه دهید؛ شما در حال ساختن آیندهاید.
◼️◼️◼️◼️◼️◼️◼️◼️◼️◼️◼️◼️◼️
🆔 Instagram | Telegram
دانشجویان دکتری!
اگر پژوهشهای امروزتان هنوز کاربرد یا تأثیر فوری ندارند، دلسرد نشوید! علم همیشه به دنبال مد روز نیست، بلکه کنجکاوی و جسارت در کاوش ناشناختههاست که مسیر پیشرفت را میسازد.
بسیاری از دستاوردهای بزرگ علمی، سالها پس از انتشار اولیه شکوفا شدهاند—مثل روش تهیه اکسید گرافیت در سال ۱۹۵۸ که با کشف گرافن در ۲۰۱۰ به نقطهعطفی تبدیل شد، یا پژوهشهای فرضی درباره سیاهچالهها که دههها بعد با کشف امواج گرانشی معنا یافتند.
تأثیر واقعی زمانبر است، اما همین کنجکاویهای امروز میتوانند ستونهای علم فردا باشند. پس با انگیزه ادامه دهید؛ شما در حال ساختن آیندهاید.
◼️◼️◼️◼️◼️◼️◼️◼️◼️◼️◼️◼️◼️
🆔 Instagram | Telegram
❤7👏5
در مورد آنالیز آماری MANOVA چه می دانید؟
#آموزش_رایگان
آزمون MANOVA یا تحلیل واریانس چندمتغیره ، یکی از روشهای آماری پیشرفته است که برای بررسی تأثیر یک یا چند متغیر مستقل بر چند متغیر وابسته بهصورت همزمان به کار میرود. برخلاف آزمون ANOVA که فقط یک متغیر وابسته را تحلیل میکند، MANOVA به ما اجازه میدهد تا روابط پیچیدهتری را میان متغیرها بررسی کنیم ، بهویژه زمانی که متغیرهای وابسته با یکدیگر همبستگی دارند. این ویژگی باعث میشود که MANOVA در پژوهشهای علوم رفتاری، کشاورزی، بیوتکنولوژی، پزشکی، روانشناسی و مدیریت کاربرد فراوانی داشته باشد.
... توضیحات بیشتر و چگونگی انجام آنالیز MANOVA در نرم افزار R...
◼️◼️◼️◼️◼️◼️◼️◼️◼️◼️◼️◼️◼️
🆔 Instagram | Telegram
#آموزش_رایگان
◼️◼️◼️◼️◼️◼️◼️◼️◼️◼️◼️◼️◼️
🆔 Instagram | Telegram
❤5👏3👍2
اهمیت سرور SwissDock: مفاهیم و کاربردها
بخش اول: آموزش مفاهیم و کاربردها
#آموزش_رایگان
#not_for_sale
سرور SwissDock یک پلتفرم محاسباتی آنلاین و رایگان برای انجام داکینگ مولکولی است که توسط گروه Vital-IT در مؤسسه علوم زیستی سوئیس (SIB) توسعه یافته است. این سرور بر پایه موتور داکینگ EADock DSS طراحی شده و هدف آن فراهمسازی محیطی ساده، سریع و قابلدسترس برای پیشبینی نحوه اتصال لیگاندهای کوچک به ساختارهای پروتئینی است. SwissDock بهویژه برای پژوهشگران حوزه طراحی دارو، بیوانفورماتیک، و بیوتکولوژی و سایر علوم زیستی مرتبط کاربرد دارد و امکان انجام داکینگ بدون نیاز به نصب نرمافزارهای پیچیده را فراهم میسازد.
....ادامه مطلب را از اینجا مطالعه نمایید....
◼️◼️◼️◼️◼️◼️◼️◼️◼️◼️◼️◼️◼️
🆔 Instagram | Telegram
بخش اول: آموزش مفاهیم و کاربردها
#آموزش_رایگان
#not_for_sale
◼️◼️◼️◼️◼️◼️◼️◼️◼️◼️◼️◼️◼️
🆔 Instagram | Telegram
❤4👏2
شاخص Lipinski's rule of five چیست؟
قانونپنجگانه لیپینسکی یا Lipinski's rule of five یک معیار تجربی در طراحی دارو است که برای ارزیابی قابلیت جذب خوراکی ترکیبات شیمیایی استفاده میشود. این قانون بیان میکند که یک داروی خوراکی معمولاً نباید بیش از یکی از شرایط زیر را نقض کند: بیش از ۵ دهنده پیوند هیدروژنی، بیش از ۱۰ گیرنده پیوند هیدروژنی، وزن مولکولی بیشتر از ۵۰۰ دالتون، و ضریب logP بیشتر از ۵. رعایت این معیارها احتمال جذب مناسب دارو در بدن را افزایش میدهد و در فرآیند کشف دارو بسیار کاربردی است.
...ادامه مطلب و آموزش محاسبه شاخص 5 گانه را از اینجا بخوانید...
◼️◼️◼️◼️◼️◼️◼️◼️◼️◼️◼️◼️◼️
🆔 Instagram | Telegram
قانون
◼️◼️◼️◼️◼️◼️◼️◼️◼️◼️◼️◼️◼️
🆔 Instagram | Telegram
👏3❤2💊2
بیوانفورماتیک و طراحی آفتکشها: بخش اول
#آموزش_رایگان
#not_for_sale
ادغام ابزارهای بیوانفورماتیک درطراحی آفتکشها ، رویکردی پیشرفته برای شناسایی اهداف زیستی در آفات و طراحی ترکیبات مؤثرتر است. این ابزارها با کمک مدلسازی مولکولی، تحلیل ژنومی و شبیهسازیهای کامپیوتری، امکان پیشبینی برهمکنش ترکیبات با پروتئینهای کلیدی آفات را فراهم میکنند. به این ترتیب میتوان مسیرهای متابولیکی یا پروتئینهای ضروری برای بقای آفت را شناسایی کرده و مولکولهایی را طراحی نمود که بهطور اختصاصی این اهداف را مهار کنند. این فرآیند باعث کاهش وابستگی به آزمونهای پرهزینه و زمانبر آزمایشگاهی و همچنین سرعت بخشیدن به کشف آفتکشهای نوین میشود.
....ادامه این مطلب را از اینجا مطالعه کنید....
◼️◼️◼️◼️◼️◼️◼️◼️◼️◼️◼️◼️◼️
🆔 Instagram | Telegram
#آموزش_رایگان
#not_for_sale
ادغام ابزارهای بیوانفورماتیک در
◼️◼️◼️◼️◼️◼️◼️◼️◼️◼️◼️◼️◼️
🆔 Instagram | Telegram
❤5🔥2
◼️◼️◼️◼️◼️◼️◼️◼️◼️◼️◼️◼️◼️
🆔 Instagram | Telegram
❤4💊3👍2