کاربرد آنالیزهای بیوانفورماتیکی در مطالعه آفات گیاهان زراعی

آنالیزهای بیوانفورماتیکی نقش اساسی در مطالعه آفات گیاهان زراعی ایفا می‌کنند زیرا این رویکردها امکان بررسی جامع ژنوم و شناسایی ژن‌های کلیدی مسئول بقا، تولیدمثل، و سازگاری آفات را فراهم می‌سازند. توالی‌یابی ژنوم کامل حشرات و سایر آفات و تحلیل‌های بعدی مانند حاشیه‌نویسی ژنوم، شناسایی خانواده‌های ژنی و بررسی مسیرهای متابولیکی، اطلاعات دقیقی برای درک مکانیسم‌های فیزیولوژیکی و بیوشیمیایی این موجودات ارائه می‌دهد. این داده‌ها می‌توانند مبنای توسعه روش‌های کنترل هدفمند و پایدار باشند.

....برای مطالعه بیشتر در این خصوص از اینجا وارد شوید...

◼️◼️◼️◼️◼️◼️◼️◼️◼️◼️◼️◼️◼️
🆔 @irbioinformatics

کشف منبع جدید آنتی‌بیوتیک در آرکئا با تلفیق هوش مصنوعی و روش‌های بیوانفورماتیک

دو مطالعه جدید در مجلات Nature Microbiology و PLOS Biology نشان می‌دهند که آرکئا، میکروب‌های شاخه کمتر شناخته‌شده حیات، می‌توانند منبع غنی ترکیبات آنتی‌بیوتیکی باشند. تیمی به رهبری سزار دلا فونته با استفاده از هوش مصنوعی بیش از ۱۲,۶۰۰ پپتید بالقوه ضد میکروبی در ۲۳۳ گونه آرکئا شناسایی کرد که ۹۳٪ از ۸۰ پپتید سنتز شده فعالیت ضدباکتریایی داشتند و یکی از آن‌ها در مدل حیوانی به اندازه پلی‌میکسین B مؤثر بود.

در مطالعه‌ای جداگانه، پژوهشگران دانشگاه آکسفورد آنزیم‌های هیدرولازی را در ۵٪ گونه‌های آرکئا یافتند که قادرند دیواره سلولی باکتری‌ها را تخریب و آن‌ها را نابود کنند. دانشمندان تأکید می‌کنند این ترکیبات هنوز تا تبدیل شدن به داروی واقعی فاصله دارند، اما آرکئا می‌توانند افق جدیدی برای کشف آنتی‌بیوتیک‌ها بگشایند.
◼️◼️◼️◼️◼️◼️◼️◼️◼️◼️◼️◼️◼️
🆔 Instagram | Telegram

افزایش استفاده از هوش مصنوعی در نگارش مقالات علمی
#خبر
یک مطالعه جدید در ژورنال Nature Human Behaviour نشان می‌دهد که استفاده از هوش مصنوعی تولیدکننده متن، از جمله ChatGPT، در مقالات علمی از سال ۲۰۲۲ به طور قابل توجهی افزایش یافته است. پژوهشگران با بررسی بیش از یک میلیون مقاله و نسخه Preprint، متوجه شدند که در برخی رشته‌ها مانند علوم کامپیوتر تا ۲۲٪ مقالات نشانه‌هایی از اصلاح توسط مدل‌های زبانی بزرگ (LLM) دارند، در حالی که درصد استفاده در ریاضیات و علوم زیستی کمتر است ولی در حال رشد است.

این روند سریع نگرانی‌هایی درباره دقت و اصالت محتوای علمی ایجاد کرده است، زیرا مدل‌های زبانی ممکن است اطلاعات نادرست یا گمراه‌کننده تولید کنند. پژوهشگران همچنین هشدار می‌دهند که استفاده گسترده از AI می‌تواند بخش‌های مرجع و مقدمه مقالات را مشابه یکدیگر کند و چرخه‌ای ایجاد کند که محتوای بعدی مدل‌ها بر اساس متن‌های تولید شده توسط مدل‌های قبلی شکل گیرد.
◼️◼️◼️◼️◼️◼️◼️◼️◼️◼️◼️◼️◼️
🆔 Instagram | Telegram

#برگی_از_تاریخ

علاقه من به علم احتمالاً از علاقه‌ام به پزشک شدن نشأت گرفت. من تحت تأثیر احترامی که به پزشکان محلی گذاشته می‌شد قرار گرفتم و به‌ویژه پزشک اطفال محله‌مان را تحسین می‌کردم. هر زمان که بیمار می‌شدم، مرا به مطب یا خانه او می‌بردند تا درمان شوم. درس‌های مورد علاقه‌ام در دبیرستان ریاضی، فیزیک، شیمی و زیست‌شناسی بودند؛ زیرا موضوعات آن‌ها بسیار جالب و معلمانشان جذاب بودند. در مقابل، در دروس زبان، ادبیات و نگارش بیشتر مشکل داشتم، اما خوشبختانه معلمی داشتم که اصرار داشت یاد بگیریم خود را در نوشتن بیان کنیم.

در زندگینامه‌اش، برایان کوبیلکا از مسیر علمی خود و علاقه‌اش به علم که از سنین پایین آغاز شد، سخن می‌گوید. او در سال ۲۰۱۲ جایزه نوبل شیمی را برای شناسایی ژنی که مسئول تشکیل گیرنده هورمون آدرنالین است، دریافت کرد.
◼️◼️◼️◼️◼️◼️◼️◼️◼️◼️◼️◼️◼️
🆔 Instagram | Telegram

انا لله و انا الیه راجعون
دکتر بهمن یزدی صمدی، استاد پیشکسوت ژنتیک گیاهی دانشکدگان کشاورزی و منابع طبیعی دانشگاه تهران، عضو پیوسته فرهنگستان علوم و  ٢١مین رییس دانشگاه تهران امروز ۱۰ شهریور ۱۴۰۴ به رحمت ایزدی پیوست. روحش شاد و یادش گرامی باد.

اطلس جامع فیبروبلاست ها مقاله منتشر شده در ساینس:
خلاصه مقاله:
پژوهشگران با تحلیل بیش از ۲۴۹ هزار فیبروبلاست از ۷۳ مطالعه در ۱۰ نوع بافت، اطلس تک‌سلولی جامعی از فیبروبلاست‌ها ارائه دادند و ۱۸ زیرگروه مختلف را شناسایی کردند. در این میان، جمعیتی جدید از سلول‌ها با نام فیبروبلاست‌های TSPAN8+ با عملکرد در تغییرات کروماتین کشف شد که با بیان بالای ژن‌های مرتبط با اصلاح هیستون شناخته می‌شوند. این سلول‌ها در داده‌های ترانسکریپتوم فضایی و آزمایش‌های ایمونوفلورسانس قابل شناسایی بوده و ارتباط نزدیکی با سلول‌های اندوتلیال و T دارند. حضور آن‌ها با پیش‌آگهی ضعیف مرتبط است و این یافته‌ها گامی مهم در درک تنوع فیبروبلاست‌ها در بافت‌های مختلف محسوب می‌شود.
◼️◼️◼️◼️◼️◼️◼️◼️◼️◼️◼️◼️◼️
🆔 Instagram | Telegram

فایل پیوست شامل: کدهای مرجع و اسکریپت های مورد نیاز برای نصب ابزار BindCraft است. می توانید پوشه را مستقیما دانلود کرده و سپس از حالت فشرده خارج کنید و در مسیر /home/ قرار دهید و سپس مطابق دستورالعمل نصب که در پست قبلی معرفی شد آن را نصب و اجرا کنید. فرمت ورودی این ابزار .json است.
◼️◼️◼️◼️◼️◼️◼️◼️◼️◼️◼️◼️◼️
🆔 Instagram | Telegram