آکادمی بیوانفورماتیک محققان ایرانی
1.57K subscribers
1.57K photos
40 videos
423 files
715 links
Iranian Researchers Bioinformatics Academy


Our sister channel:
✅️ https://t.iss.one/apply_for_future

Our Instagram link:
✅️ https://www.instagram.com/irbioinformatics/

📬 Admin: @h3nrasouli
Download Telegram
آکادمی بیوانفورماتیک محققان ایرانی
معرفی ابزار fastP این ابزار یک نرم افزار کلیدی برای انالیز داده های ژنومیکسی و ترانسکریپتومیکسی است که از طریق آن می توانید داده های توالی یابی شده در فرمت fastq را از لحاظ کیفی کنترل نمایید. برای دانلود و اجرا کد زیر را اجرا کنید. # download the latest…
برای ایجاد فایل خروجی کنترل کیفی از داده های ژنومی خود با این ابزار کدهای زیرا را اجرا کنید- با توجه به نوع توالی هایی که دارید.
برای داده های single-end:
fastp -i in.fq -o out.fq

برای داده های paired-end:

fastp -i in.R1.fq.gz -I in.R2.fq.gz -o out.R1.fq.gz -O out.R2.fq.gz
👍4
اینترلوکین-6 (IL-6) یک سایتوکاین چندکاره است که نقش مرکزی در تنظیم پاسخ‌های ایمنی، التهاب و خون‌سازی ایفا می‌کند. IL-6 که ابتدا به‌عنوان یک عامل تمایزی سلول‌های B شناخته شد، از آن زمان در طیف گسترده‌ای از فرآیندهای فیزیولوژیکی و پاتولوژیکی، از جمله واکنش‌های فاز حاد، بیماری‌های التهابی مزمن، سرطان و اختلالات متابولیکی، دخیل شناخته شده است.

اینترلوکین IL-6 یک گلیکوپروتئین کوچک متشکل از 184 اسید آمینه با وزن مولکولی تقریباً 21-30 کیلو دالتون است که بسته به تغییرات پس از ترجمه، مانند گلیکوزیلاسیون، متغیر است. این مولکول به دسته‌ای از سایتوکاین‌ها به نام سایتوکاین‌های چهار مارپیچی تعلق دارد که با ساختار چهار آلفا-هلیکس در یک آرایش بالا-بالا-پایین-پایین مشخص می‌شوند. این پیکربندی ساختاری تعامل IL-6 با کمپلکس گیرنده آن را تسهیل می‌کند که برای انتقال سیگنال حیاتی است.

اینترلوکین IL-6 یک سایتوکاین چندوجهی با اثرات گسترده در سلامت و بیماری‌ها است. توانایی آن در القای دایمر شدن gp130 و فعال‌سازی چندین مسیر سیگنالینگ اهمیت آن را در ارتباطات سلولی برجسته می‌کند. در حالی که IL-6 نقش‌های غیرقابل‌انکاری در حفظ تعادل فیزیولوژیکی ایفا می‌کند، اختلال در تنظیم آن به بسیاری از بیماری‌ها کمک می‌کند و بر اهمیت تنظیم دقیق فعالیت IL-6 در راهبردهای درمانی تأکید دارد.
👍2
در اینجا می‌توانید ساختار کریستالی قطعه Fab از آنتی‌بادی ضد IL-6 به نام I9H را در کمپلکس با یک دایمر IL-6 دارای تبادل دومین (کد PDB: 8YWQ) مشاهده کنید.
👏1🤯1
پوزییش پسداک بیمارستان دانشگاه وورتسبورگ
یک پوزیشن عالی برای اپلای در زمینه مطالعه ژنومیکسی و ترانسکریپتومی مبانی اختلالات مولکولی در کودکان مبتلا به سرطان
https://karriere.ukw.de/en/p/verwaltung/jobs/10802/intro
Your Profile:
PhD in Biochemistry, Biology, Molecular Medicine, or related fields.
Strong background in molecular biology.
Experience in single-cell analysis and next-generation sequencing (NGS) applications.
Experience in establishing novel molecular methods.
Highly motivated, reliable, and able to work independently.
Strong written and oral communication skills in English and German.
Enthusiasm for interdisciplinary collaboration and communication.
👏1🐳1
Here you can see a cryo-EM structure of the IS621 recombinase in complex with bridge RNA, donor DNA, and target DNA (PDB code: 8WT6)
👍2
اخلاق در کشاورزی یکی از موضوعات مهم و چالشهای امروزه جامع کشاورزی است. به نظر بسیار از دوستداران محیط زیست، هدف خوب تولید غذا برای جمعیت جهان، اثرات مخرب فناوری کشاورزی بر انسان و محیط زیست را توجیه نمیکند. در این وبینار حدود 30 دقیقه ای، پروفسور رابرت زیندال، استاد دانشگاه و متخصص کشاورزی تحلیل تازه ای از وضعیت اخلاق کشاورزی را تشریح می کند.

با تشکر ویژه از دکتر جلال شیرازی برای اشتراک این فایل وبینار ارزشمند

https://aparat.com/v/hfo117p
👍5😁2
همانطور که می‌دانیم پراسنجه های جمعیت که به روش جداول زندگی برآورد می شوند را نباید با روش های معمول آماری مقایسه کرد. تکنیک بوت استرپ امکان تکراردار کردن این پراسنجه را فراهم می کند و لذا مقایسه درست آنها را از طریق مقایسه دو به دو یا جفتی فراهم می کند. نرم افزار جدول زندگی که توسط پروفسور سین چی طراحی شده، این آزمون را براحتی امکان‌پذیر کرده است. در این ویدئو تئوری ها و اصول روش بوت استرپ همراه با مثال عملی برای دانشجویان رشته های حشره شناسی و سایر رشته های زیستی توضیح داده می شود.
دکتر جلال شیرازی

https://www.aparat.com/v/gmsr4qu
👍4
لیست ژن های کلیدی دخیل در هر نوع سرطان.
@irbioinformatics
👍5
Should I climb the career ladder as a manager, or will I regret leaving the lab bench behind?
https://www.nature.com/articles/d41586-024-03237-0
👍3
از شهر زیبای اسلو نروژ دعاگوی همه دوستان و همراهان عزیز هستیم.
9😁3
دوستانی که میخان پاورپوینت های حرفه ای و جذابی بسازن میتونن از این هوش مصنوعی استفاده کنن. این هوش مصنوعی یکی از بهترین ابزارهای رایگان می باشد که برای طراحی اسلایدهای پاورپوینت می توان ازش استفاده کنید. تا 15 اسلاید رو به صورت رایگان برای شما میسازه
https://www.popai.pro/
@irbioinformatics

#ai
#هوش_مصنوعی
@irbioinformatics
🔥6
اگه دنبال این هستین که مرور منابع کلیدی و حرفه ای برای مقاله یا پایان نامتون انجام بدین از این هوش مصنوعی استفاده کنین. میتونه هزاران مقاله رو براتون بررسی کنه ارتباط اونا رو گراف کنه و تاپ ترین رفرنس ها رو در اختیارتون قرار بده . این هوش مصنوعی برای استفاده اکادمیک در مقالات مجوز داره و مقالات نیچر رو هم ببینن بیشترشون از این ابزار برای مرور منابع استفاده میکنن.
https://researchrabbitapp.com/

#ai
#هوش_مصنوعی
@irbioinformatics
👍3🔥1