سازمان غذا و داروی ایالات متحده (FDA) اخیراً تأیید تسریع‌شده‌ای را برای داروی تارلاتاماب (با نام تجاری Imdelltra) صادر کرده است. این دارو برای برخی از بیماران مبتلا به سرطان ریه سلول کوچک (SCLC)، که تهاجمی‌ترین نوع سرطان ریه محسوب می‌شود، تجویز می‌شود.
@irbioinformatics
تارلاتاماب یک مولکول گیرنده دوگانه T-cell (BiTE) است، یک داروی دو بازویی که به طور همزمان به سلول‌های تومور و سلول‌های T متصل می‌شود. این پیوند موجب نزدیکی سلول‌های T و سلول‌های سرطانی شده و به سلول‌های T کمک می‌کند تا سلول‌های سرطانی را شناسایی و تخریب کنند.

آشنایی با پروتئین Cas9
تهیه و تدوین: ح.رسولی دانشجوی دکتری بیوتکنولوژی دانشگاه تربیت مدرس تهران
پروتئین Cas9 پروتئین همراه با CRISPR 9، که قبلاً Cas5، Csn1 یا Csx12 نامیده می‌شد یک پروتئین 160 کیلودالتونی است که نقش حیاتی در دفاع ایمنی برخی باکتری‌ها در برابر ویروس‌های DNA و پلاسمیدها ایفا می‌کند و در حوزه مهندسی ژنتیک به طور گسترده استفاده می‌شود.
@irbioinformatics
عملکرد اصلی این پروتئین برش DNA و در نتیجه تغییر ژنوم سلول است. فناوری ویرایش ژنوم CRISPR-Cas9 نقش کلیدی در اعطای جایزه نوبل شیمی در سال 2020 به امانوئل #شارپنتیه و جنیفر #دودنا داشت. از نظر فنی، Cas9 یک آنزیم اندونوکلئاز RNA-هدایت‌شده است که با سیستم ایمنی تطبیقی CRISPR (تکرارهای کوتاه پالیندرویم با فاصله‌های منظم) در باکتری Streptococcus pyogenes مرتبط است.
@irbioinformatics
این باکتری از CRISPR برای ذخیره حافظه‌ای از DNA خارجی و از Cas9 برای بررسی و برش آن در مراحل بعدی استفاده می‌کند، مانند DNA فاژهای مهاجم. این آنزیم DNA خارجی را باز کرده و محل‌هایی را که با بخش 20 نوکلئوتیدی منطقه راهنمای RNA (gRNA) مکمل هستند بررسی می‌کند. در صورتی که DNA مکمل gRNA باشد، Cas9 DNA مهاجم را برش می‌دهد. این مکانیسم شباهت‌های قابل توجهی با تداخل RNA (RNAi) در یوکاریوت‌ها دارد.

#جزوه_عیب_یابی_HPLC
یک فایل ارزشمند و عالی برای عیب یابی و رفع ایراد دستگاه های HPLC
دستگاه HPLC (کروماتوگرافی مایع با کارایی بالا) یک تکنیک آنالیتیکی پیشرفته است که برای جداسازی، شناسایی و اندازه‌گیری اجزای مختلف یک مخلوط استفاده می‌شود. در این روش، نمونه مورد نظر با فاز متحرک (مایع) وارد ستون کروماتوگرافی می‌شود که حاوی فاز ساکن است. اجزای مختلف نمونه بر اساس برهم‌کنش‌های شیمیایی و فیزیکی با فاز ساکن و فاز متحرک با سرعت‌های متفاوتی از ستون عبور می‌کنند و جدا می‌شوند. HPLC به دلیل دقت بالا، حساسیت زیاد، و توانایی آن در تجزیه مواد پیچیده، در زمینه‌های مختلفی از جمله داروسازی، شیمی تجزیه، صنایع غذایی و زیست‌فناوری کاربرد دارد.
@irbioinformatics

@irbioinformatics
#جزوه_عیب_یابی_HPLC
یک فایل ارزشمند و عالی برای عیب یابی و رفع ایراد دستگاه های HPLC

#معرفی_تکنولوژی_TALEN
تدوین: ح.رسولی دانشجوی دکتری بیوتکنولوژی دانشگاه تربیت مدرس تهران
@irbioinformatics
تکنولوژی TALEN# یا Transcription Activator-Like Effector Nucleases اولین تکنولوژی ویرایش ژنوم آسان برای استفاده در حوزه مهندسی ژنتیک بود که انقلابی در ویرایش ژنوم به راه انداخت. کاربرد این سیستم در گونه‌های مختلف باعث جلب توجه دانشمندان به فرایند جهش‌زایی هدفمند شد. موفقیت‌های چشمگیر در ویرایش ژنوم از آن زمان که برای اولین بار این سیستم معرفی شد می توان به اولین تجاری‌سازی یک گیاه ویرایش‌شده و اولین انسان درمان‌شده از سرطان اشاره کرد.

@irbioinformatics
از آن زمان که برای اولین بار این سیستم ویرایش ژنومی معرفی شد، TALEN‌ها عمدتاً با تکنولوژی‌های CRISPR جایگزین شده‌اند که ساخت آن‌ها نسبتاً آسان‌تر، چندگانه‌سازی آن‌ها راحت‌تر است و در نتیجه تکنیک‌های مشتق شده متعددی ایجاد کرده‌اند. با این حال، قابلیت موقعیت‌یابی انعطاف‌پذیر و دقیق TALEN همچنان بی‌نظیر و بی رقیب است و به همین دلیل این تکنولوژی‌ها همچنان در حال تکامل به ویژگی‌های جدید هستند که در حوزه مهندسی ژنتیک کاربردهای فراوانی را از خود نشان می دهند. در این مقاله مروری، حقایق اساسی، دستورالعمل‌های طراحی و همچنین تحولات مهم گذشته و پیشرفت‌های هیجان‌انگیز جدید در رابطه با تکنولوژی TALEN ارائه شده است.

TALE and TALEN genome editing technologies
@irbioinformatics

ذهن آدمی مانند ساعتی است
که مدام از کار می‌افتد
ذهن را باید با اندیشه های خوب کوک کرد...
امروزتون رو پر از اندیشه های بکر و خوب شروع کنید،
ذهنتون رو خالی از هرگونه بدی کنید، زیبایی ها را ببینید...


صبح جمعه‌تون بخیر ❤️

میگن ادم به هرچی فک کنه و براش تلاش کنه بهش میرسه. اینکه مستر ماسک پیش عمو دونالد واساده و مغز متفکر تیم عمو هستش برام جالب نبود ولی چیزی که نظرم‌جلب کرد نوشته ای هستش که روی تیشرت مستر ماسک که عبارت occupy marsهستش که داره این به مخاطب میگه که ایلان ایده استعمار مریخ و گسترش زندگی به اونجا رو داره شدیدا دنبال میکنه شاید فک‌کنین این یه ایده تبلیغاتیه ولی در واقع هدف غایی بیزنس ایلانه که بتونه به صورت انحصاری مریخ در دست بگیره و این دور از انتظار نیست.

معرفی کتاب
در کتاب Biology of Belief، دکتر بروس لیپتون دیدگاه جدیدی درباره حیات ارائه می‌دهد که بر اساس تحقیقات پیشگامانه وی در زمینه سلول‌های بنیادی در دانشگاه استنفورد است. در این کتاب، دکتر لیپتون بیان می‌کند که ژن‌ها کنترل‌کننده اصلی زیست‌شناسی نیستند و درک سلولی از محیط عامل اصلی در فرآیندهای زیستی است.
دکتر لیپتون اشاره می‌کند که امروزه دانشجویان و پزشکان همچنان بر این باورند که ژن‌ها، که به‌عنوان نقشه‌های ساخت پروتئین عمل می‌کنند، عوامل اصلی در فرآیندهای زیستی هستند.
@irbioinformatics
با این حال، وی دیدگاهی متفاوت مطرح می‌کند که بیان می‌کند ژن‌ها تنها دستورالعمل هستند و آنچه در واقع زیست‌شناسی را کنترل می‌کند، نحوه‌ای است که سلول‌ها محیط اطراف خود را درک کرده و به آن پاسخ می‌دهند. این مفهوم، که به نقش اپی‌ژنتیک و تأثیر محیط بر بیان ژن‌ها اشاره دارد، چارچوب جدیدی برای درک فرایندهای زیستی ارائه می‌دهد.

#نکات_تکنیکی
در هنگام انجام Real-Time PCR (یا qPCR)، یکی از مشکلاتی که ممکن است رخ دهد، بخار شدن یا "evaporation#" نمونه‌ها است. این مسئله می‌تواند به دلایل مختلفی اتفاق بیفتد:

تنظیمات نادرست دما یا پروفایل حرارتی: در صورتی که دمای کالیبراسیون دستگاه PCR یا پروفایل حرارتی به درستی تنظیم نشده باشد، ممکن است در طول چرخه‌های PCR، بخار در لوله‌ها یا در نمونه‌ها ایجاد شود. به ویژه در دمای بالای مرحله دناتوراسیون (۹۴-۹۸ درجه سانتی‌گراد) ممکن است رطوبت از محیط خارج شود.

نصب نادرست درپوش دستگاه PCR: در صورتی که درپوش‌ها به طور کامل بسته نشوند یا به درستی مهر و موم نشوند، بخار به راحتی می‌تواند از نمونه‌ها خارج شود و بر نتیجه تاثیر بگذارد.

استفاده از لوله‌های PCR نامناسب یا شکسته: لوله‌های PCR که کیفیت مناسبی ندارند یا ترک خورده‌اند، ممکن است نتوانند به درستی نمونه‌ها را مهر و موم کنند و بخار از آنها خارج شود.

مدت زمان طولانی در دمای بالا: اگر نمونه‌ها مدت زیادی در دمای بالا باقی بمانند، به‌ویژه اگر با سرعت زیاد افزایش دما مواجه شوند، ممکن است بخار شدن در طی مراحل مختلف رخ دهد.

تنظیمات دستگاه در حالت بدون پوشش (Open system): بعضی از دستگاه‌های Real-Time PCR از یک سیستم "open" برای درپوش‌های لوله‌ها استفاده می‌کنند که می‌تواند باعث تبخیر نمونه‌ها و ایجاد نتایج غیر دقیق شود.

برای جلوگیری از بخار شدن نمونه‌ها در Real-Time PCR:

از لوله‌ها و کلاهک‌های PCR با کیفیت و مناسب استفاده کنید.
از برنامه‌های دمایی دقیق و مناسب برای مرحله‌های مختلف PCR استفاده کنید.
از دستگاه‌های PCR با سیستم مهر و موم خوب استفاده کنید.
در صورت امکان، از سیستم‌های "sealed" استفاده کنید که از تبخیر نمونه‌ها جلوگیری کنند.

#نکات_تکنیکی
در کار با دستگاه #اسپکتروفتومتر، رعایت برخی نکات مهم برای حصول نتایج دقیق و معتبر ضروری است. مهم‌ترین نکاتی که باید به آن‌ها توجه کنید عبارتند از:

1. کالیبراسیون دستگاه:
قبل از هر آزمایش، دستگاه اسپکتروفتومتر باید به درستی کالیبره شود. معمولاً از یک محلول صفر (blank) استفاده می‌شود که هیچ ماده‌ای در آن وجود ندارد یا ماده‌ای که خواص نوری آن شناخته شده است.
کالیبراسیون باید در طول روز و قبل از هر تغییر عمده در تنظیمات دستگاه انجام شود.
2. انتخاب طول موج مناسب:
انتخاب طول موج صحیح برای اندازه‌گیری بستگی به ویژگی‌های جذب ماده نمونه دارد. برای مثال، برخی از مولکول‌ها در طول موج‌های خاصی از نور بیشترین جذب را دارند (مانند جذب پروتئین‌ها در حدود 280 نانومتر).
برای اندازه‌گیری مواد مختلف، از جدول‌های استاندارد یا مقالات علمی استفاده کنید تا طول موج مناسب را انتخاب کنید.
3. استفاده از محلول صفر (Blank):
برای هر نمونه، باید یک محلول صفر (معمولاً حلالی که نمونه در آن حل شده) برای تنظیم دستگاه استفاده شود تا تأثیرات احتمالی حلال‌ها یا سایر مواد جانبی حذف شوند.
محلول صفر باید از همان حلال و شرایط مشابه نمونه باشد.
4. حفظ دقت در رقت‌ها:
رقت‌های نمونه باید به دقت تنظیم و اندازه‌گیری شوند، زیرا غلظت نمونه می‌تواند تأثیر زیادی بر نتیجه نهایی داشته باشد.
در صورتی که غلظت نمونه بسیار بالا باشد، ممکن است دستگاه قادر به اندازه‌گیری آن نباشد یا خطای زیادی در نتایج ایجاد کند.
5. پاکیزگی کووت‌ها (Cuvettes):
کووت‌های استفاده شده برای نمونه‌ها باید کاملاً تمیز باشند. هر گونه آلودگی، لکه یا اثر انگشت روی کووت می‌تواند بر دقت اندازه‌گیری تأثیر بگذارد.
کووت‌ها باید به طور مرتب با محلول مناسب شسته و خشک شوند.
6. تنظیم دمای نمونه:
دمای نمونه‌ها می‌تواند بر خواص جذب نوری آن‌ها تأثیر بگذارد. برخی از اسپکتروفتومترها مجهز به سیستم‌های کنترل دما هستند، اما در غیر این صورت بهتر است دمای نمونه‌ها در محدوده مناسب (معمولاً دمای اتاق) نگه داشته شود.
7. توجه به نوع نمونه:
نوع و ویژگی‌های نمونه (مانند رنگ، غلظت و نوع ترکیب شیمیایی) می‌تواند بر جذب نوری آن اثر بگذارد.
برای نمونه‌های رنگی یا کدر، از رقت‌های مناسب استفاده کنید تا دقت اندازه‌گیری بالا رود.
8. زمان خواندن اندازه‌گیری:
برای هر اندازه‌گیری، زمان خواندن باید به دقت تنظیم شود. معمولاً برخی از اسپکتروفتومترها نیاز به مدت زمانی دارند تا ثبات نسبی در جذب نوری نمونه ایجاد شود.
9. توجه به طیف ورودی و خروجی:
اسپکتروفتومتر معمولاً از نور سفید یا منبع نوری خاصی استفاده می‌کند که باید در طول فرآیند اندازه‌گیری ثابت بماند. تغییرات در نور ورودی می‌تواند نتایج اندازه‌گیری را تحت تأثیر قرار دهد.
10. ثبت و ذخیره نتایج:
پس از انجام اندازه‌گیری، نتایج باید به درستی ثبت و ذخیره شوند. بهتر است داده‌ها همراه با اطلاعات مربوط به شرایط آزمایش (مانند طول موج، دما و نوع محلول) ذخیره شوند.
با رعایت این نکات، می‌توان دقت نتایج اسپکتروفتومتری را افزایش داد و از بروز خطاها جلوگیری کرد.