آکادمی بیوانفورماتیک محققان ایرانی
1.57K subscribers
1.57K photos
43 videos
423 files
718 links
Iranian Researchers Bioinformatics Academy


Our sister channel:
✅️ https://t.iss.one/apply_for_future

Our Instagram link:
✅️ https://www.instagram.com/irbioinformatics/

📬 Admin: @h3nrasouli
Download Telegram
این صفحه مربوط به بیماران در مجله JAMA، به بررسی پروفیلاکسی پس از مواجهه با داکسی‌سایکلین (doxyPEP) می‌پردازد، که دارویی است که برای پیشگیری از برخی عفونت‌های باکتریایی مقاربتی در افرادی که در معرض خطر بیشتری قرار دارند، تجویز می‌شود
👍4
ماکس بورن برنده جایزه نوبل فیزیک در سال 1954 با بهره‌گیری از دستاوردهای بزرگان پیشین، زمینه مکانیک کوانتومی را به‌طور چشمگیری پیش برد. مشهورترین دستاورد او، «قانون بورن» است که روشی برای محاسبه احتمال وقوع یک نتیجه خاص در یک سیستم کوانتومی ارائه می‌دهد.

قانون بورن برای تفسیر آزمایش‌های مکانیک کوانتومی و همچنین در کاربردهایی مانند رایانش کوانتومی مورد استفاده قرار می‌گیرد. رایانش کوانتومی می‌تواند نویدبخش پیشرفت‌های بزرگی باشد، از جمله:

تسریع کشف داروهای جدید،
شکستن رمزنگاری‌ها،
افزایش سرعت تصمیم‌گیری در معاملات مالی،
بهبود یادگیری ماشینی،
توسعه مواد انقلابی،
مقابله با تغییرات اقلیمی،
و موارد دیگر.
👍4
🔻 اول مرغ بود یا تخم‌مرغ؟

بر اساس مطالعه‌ای که در مجله «نیچر»(Nature) منتشر شد، محققان این معما را بر اساس یک ارگانیسم تک‌سلولی که بسیار پیش از مرغ وجود داشته است، حل کرده و به این نتیجه رسیده‌اند که تخم‌مرغ پیش از مرغ به وجود آمده است.  


لینک خبر

@irbioinformatics
😁4👏2
یکی از بهترین روش های تهیه ورودی های شبیه سازی استفاده از نرم افزار SAMSON هستش که هم کار باهاش راحته هم دارای ماژول های محاسباتی مخلتفی هستش که به صورت رایگان در دسترس هستند و کاربر میتونه به راحتی با یک کانفیگ ساده ویندوزی این ماژول ها رو یاد بگیره. بهتون پیشنهاد میدم این ابزار قدرتمند رو یاد بگیرین و استفاده کنین
👍3
آشنایی با انواع ساختارهای RNA
@irbioinformatics
👍4
آکادمی بیوانفورماتیک محققان ایرانی
آشنایی با انواع ساختارهای RNA @irbioinformatics
RNA یا اسید ریبونوکلئیک، نقش‌های اساسی در فرآیندهای سلولی ایفا می‌کند. هر نوع RNA عملکرد خاصی دارد.



1️⃣ RNA پیام‌رسان (mRNA): دستورالعمل‌های ژنتیکی را از DNA به ریبوزوم‌ها منتقل می‌کند تا برای سنتز پروتئین استفاده شود.

2️⃣ RNA انتقال‌دهنده (tRNA): کدون‌های mRNA را به اسیدهای آمینه‌ی متناظر آن‌ها متصل می‌کند تا پروتئین‌ها ساخته شوند.

3️⃣ RNA ریبوزومی (rRNA): یکی از اجزای ساختاری ریبوزوم است و تولید پروتئین را تسهیل می‌کند.

4️⃣ RNA کوچک هسته‌ای (snRNA): در فرآیند برش و حذف اینترون‌ها از پیش-mRNA شرکت می‌کند تا mRNA بالغ تولید شود.

5️⃣ RNA کوچک هستک (snoRNA): اصلاح شیمیایی سایر RNA‌ها، از جمله rRNA را هدایت می‌کند.

6️⃣ میکرو RNA (miRNA): با اتصال به mRNA، ترجمه آن را متوقف کرده و بیان ژن را تنظیم می‌کند.

7️⃣ RNA کوچک تداخل‌کننده (siRNA): بیان ژن را با ترویج تخریب mRNA مهار می‌کند.

8️⃣ RNA بلند غیرکدکننده (lncRNA): از طریق تعامل با DNA، RNA یا پروتئین‌ها، بیان ژن را تنظیم کرده و بر ساختار کروماتین و رونویسی تأثیر می‌گذارد.

هر نوع RNA نقش مشخصی در بیان ژن و عملکرد سلولی دارد و به تنظیم زیستی و کاربردهای درمانی بالقوه کمک می‌کند.
🕊2👍1
#خبر
اخیرا محققان گزارش نمودند که پروتئینی که توسط هوش مصنوعی طراحی شده است توانسته است تا 84% در درون یک سلول بیان شود. این به این معناست که در واقع پروتئین های که توسط هوش مصنوعی ساختار انها پردازش و تولید می شود قادر به بیان در سلول های زیستی هستند و می توانند عملکردهای خاصی را در سلول انجام دهند.
👍5
خبر بزرگی امروز منتشر شد ...
تهیه و تدوین: ح. رسولی، دانشجوی دکتری بیوتکنولوژی دانشگاه تربیت مدرس تهران
شرکت NVIDIA چارچوب BioNeMo را متن‌باز یا open-source کرد. این چارچوب مجموعه‌ای از منابع برنامه‌نویسی، کتابخانه‌ها و مدل‌های هوش مصنوعی است که برای کشف دارو طراحی شده‌اند.

این نسخه، ابزارهای پیشرفته‌ای را در اختیار آزمایشگاه‌های دانشگاهی و شرکت‌های زیست‌فناوری قرار می‌دهد، از جمله:

طراحی پروتئین
تولید مولکول‌های کوچک
توسعه مدل‌های سفارشی

همانطور که می دانید BioNeMo با بهینه‌سازی برای پردازنده‌های گرافیکی (GPU) ساخته شده است تا مدل‌سازی پیش‌بینی‌گر بیوشیمیایی را تسریع کند. این گام مهمی در توسعه روش‌های کشف کامپیوتری بیومولکول‌ها محسوب می‌شود و می‌تواند تأثیرات قابل‌توجهی در پیشرفت پژوهش‌های دارویی و زیستی داشته باشد.

نظر شما در مورد متن‌باز شدن چنین ابزارهایی چیست؟

لینک دسترسی به ماژول های توضیح داده شده در سایت شرکت NVIDIA
https://nvidia.github.io/bionemo-framework/
👍4
#خبر
با استفاده از تکنولوژی کریسپر محققان توانستند گوجه فرنگی های بزرگ و واقعا شیرینی تولید کنند. گزارش این دستاورد در مجله تحقیقاتی نیچر به چاپ رسیده است که با استفاده از لینک زیر می توانید این مقاله را مطالعه کنید.
https://doi.org/10.1038/d41586-024-03722-6
3👍1🔥1
وقتی ازم میپرسن بقیه چیکار کردن تو کارت 😂😂😂
🤣6
گامی رو به جلو در درمان بیماری های قلبی مادرزادی

گروهی از محققین با انتشار مقاله ای در مجله Cell Transplantation نشان دادند که سلول های ماهیچه قلبی که از سلول های بنیادی پرتوان انسانی ایجاد شده اند میتوانند با قلب میمون ادغام پیدا بکنند.

این تحقیق امکان پذیری و ایمنی استفاده از سلول های بنیادی در یک مدل پریمات غیرانسانی را نشان داد. نمایش ادغام و بلوغ موفقیت آمیز سلول ها در یک قلب آسیب دیده، گامی امیدوارکننده به سوی کاربرد بالینی برای اختلالات مادرزادی قلب است.

اختلالات قلبی مادرزادی موجب ناراحتی های مختلف از جمله افزایش تپش قلب، درد در ناحیه سینه و... می شود و برخی از آن ها اگر درمان نشوند جان فرد بیمار را خواهند گرفت. چنین افرادی باید در صف اهدای عضو قرار بگیرند که محدودیت بسیاری را بهمراه دارد.

این تحقیق سرآغازی از یک روش جایگزین فوق العاده برای درمان چنین بیمارانی باشد. درمان از طریق سلول های بنیادی یکروزی میتواند دریافت عضو رو به تاخیر و یا حتی از آن جلوگیری بکند.

توضیح شکل:
سلول ماهیچه انسانی (سبز رنگ) که با ماهیچه قلبی میمون ادغام شده است.

📝 رفرنس
👍5
«الن دوباتن»:
یه نشونه والدین خوب اینه که بچه‌شون دوست نداره معروف بشه چون معنیش اینه سیستم تایید validation درونیش سالمه و خوب کار میکنه و نیازی نمیبینه که غریبه‌ها بشناسنش و تاییدش کنن
👏8👍32
This media is not supported in your browser
VIEW IN TELEGRAM
اگه کاکتوس دارین لاک‌پشت نگیرید ، یه جور بخاطر کاکتوس حمله کرد انگار جلو بچه ماکارانی گذاشتن 😂
😁4👍1
ریبوزیم Tetrahymena یک مولکول RNA خودبرش‌دهنده است که در یوکاریوت تک‌سلولی Tetrahymena thermophila کشف شد. این ریبوزیم اولین ریبوزیمی است که شناسایی شد و به عنوان RNA کاتالیتیک معرفی گردید. این کشف اهمیت زیادی در زیست‌شناسی مولکولی داشت و شواهدی برای پتانسیل کاتالیتیکی RNA ارائه کرد. ریبوزیم مذکور برش خودبه‌خودی اینترون خود را از RNA پیش‌ساز کاتالیز کرده و اتصال اگزون‌ها را تسهیل می‌کند، که نشان‌دهنده توانایی RNA در انجام عملکردهای آنزیمی است که معمولاً به پروتئین‌ها نسبت داده می‌شود.
@irbioinformatics
کشف ریبوزیم Tetrahymena تأثیرات عمیقی بر درک زیست‌شناسی RNA و تکامل آن داشت. توانایی‌های کاتالیتیکی آن نشان داد که RNA می‌تواند نقش دوگانه‌ای به عنوان ماده ژنتیکی و کاتالیزور در موجودات اولیه ایفا کند، که از فرضیه دنیای RNA پشتیبانی می‌کند. علاوه بر این، مطالعه این ریبوزیم بینش‌هایی در مورد تاخوردگی RNA، شناسایی مولکولی و منشأ عملکردهای آنزیمی فراهم کرده است.
فراتر از اهمیت تکاملی، ریبوزیم Tetrahymena در زیست‌فناوری و زیست‌شناسی سنتزی نیز کاربرد دارد. این ریبوزیم به عنوان یک سیستم مدل برای مهندسی RNA‌های کاتالیتیکی و توسعه ابزارهایی برای اصلاح اختصاصی RNA و مداخلات درمانی استفاده می‌شود. رابطه ساختار-عملکرد آن همچنان موضوع تحقیق علمی است و اصول بنیادی زیست‌شناسی مولکولی و منشأ حیات را روشن می‌کند. در اینجا می‌توانید ساختار کریو-EM ریبوزیم Tetrahymena را مشاهده کنید (کد PDB: 9CBX).
@irbioinformatics
1