درحال انجام کشت سلول بنیادی برای انجام پروژه های مرکز هستیم🤓🍃

این مرحله پایه و اساس کیفیت کل خروجی NGS هست. اگر DNA/RNA ورودی به‌درستی تکه‌تکه (fragment) نشه یا آداپتورها در library preparation درست متصل نشن، کل داده‌ی نهایی دچار bias، dropout یا خطا میشه. حتی بهترین آنالیز بیوانفورماتیکی هم نمی‌تونه ضعف این مرحله رو جبران کنه.

b) Cluster generation روی Flow cell
این مرحله اهمیت بالایی داره، چون تراکم زیاد یا کم‌خوشه‌ها (clusters) می‌تونه باعث افت سیگنال یا نویز بشه. ولی اگر library آماده‌سازی سالم باشه، هنوز میشه داده قابل قبول استخراج کرد.

c) Sequencing by synthesis (SBS)
خطاهای ناشی از شیمی یا دستگاه در این مرحله رخ میدن، مثل خطای خواندن بازهای تکراری (homopolymer errors). اما این خطاها معمولا با افزایش دقت دستگاه و الگوریتم‌های جدید کاهش پیدا می‌کنن.

d) Bioinformatics analysis و variant calling
خیلی مهمه برای تفسیر نتایج، اما اصل کیفیت داده به کیفیت library برمی‌گرده. اگر داده‌ی خام مشکل‌دار باشه، بهترین pipeline بیوانفورماتیک هم نمی‌تونه خروجی مطمئن بده.

🔹 اهمیت NGS در تحقیقات و بایولوژی مولکولی:

📊 امکان تحلیل کامل ژنوم‌ها و کشف ژن‌های ناشناخته
🌱 بررسی تنوع ژنتیکی در جمعیت‌ها و مطالعه تکامل گونه‌ها
🧾 مطالعه بیان ژن‌ها در شرایط مختلف (RNA-seq)
🎯 شناسایی جهش‌ها و تغییرات مولکولی در بیماری‌ها، به‌ویژه در سرطان‌شناسی
🦠 تحلیل میکروبیوم‌ها (متاژنومیک) بدون نیاز به کشت آزمایشگاهی

مشابه ترافیک درون سلولی: تیم تحقیقاتی به‌سرپرستی دکتر نیکیل گانداسی، دانشیار گروه زیست‌شناسی تکاملی و ژنتیک، دریافتند که حرکت پروتئین‌های انتقال‌دهنده گلوکز (GLUTs) در سلول‌های بتای پانکراس در بیماران دیابتی به‌شدت مختل شده است. این پروتئین‌ها معمولاً به سطح سلول می‌روند تا گلوکز را وارد کرده و ترشح انسولین را آغاز کنند. در سلول‌های دیابتی، این فرآیند کند شده و تعداد کمتری از این پروتئین‌ها به غشای سلولی می‌رسند، که منجر به اختلال در جذب گلوکز و ترشح انسولین می‌شود.

📚 منبع علمی:

این پژوهش در تاریخ ۲۰ اوت ۲۰۲۵ در مجله Proceedings of the National Academy of Sciences منتشر شده است.

پانکراس نقش حیاتی در هموستاز گلوکز ایفا می‌کنه. سلول‌های β جزایر لانگرهانس انسولین ترشح می‌کنن که ورود گلوکز به سلول‌های عضلانی و چربی را تسهیل می‌کنه و انرژی لازم برای متابولیسم سلولی را فراهم میاره. اختلال در عملکرد این سلول‌ها می‌تونه منجر به دیابت نوع 1 یا نوع 2 بشه و خطر عوارض متابولیک و عروقی را افزایش بده.