⏳ زمان انکوباسیون — تغییرات حتی در حد چند دقیقه می‌تواند شدت رنگ و در نتیجه مقدار خوانش را تغییر دهد.
💧 دقت در اضافه کردن معرف‌ها — خطای حجم‌دهی در اضافه کردن محلول MTT یا حلال فورمازان به چاهک‌ها، به‌ویژه در پلیت‌های ۹۶ خانه، می‌تواند اختلاف زیادی ایجاد کند.
🧫 شرایط کشت سلولی — تراکم اولیه سلول‌ها، وضعیت سلامت کشت و یکسان نبودن شرایط بین چاهک‌ها، همه در نتیجه نهایی اثر می‌گذارند.
💻 خوانش نوری — کالیبراسیون دستگاه اسپکتروفتومتر و انتخاب طول‌موج مناسب (معمولاً ۵۷۰ نانومتر) در دقت نتایج نقش حیاتی دارد.

💡 راهکار چیست؟
اگرچه تست MTT ذاتاً محدودیت‌هایی دارد، با رعایت نکات زیر می‌توان دقت و قابلیت اعتماد آن را به حداکثر رساند:

آموزش دقیق و استانداردسازی مراحل آزمایش

استفاده از کنترل‌های مثبت و منفی مناسب

تکرار آزمایش برای کاهش خطای آماری

به‌کارگیری تست‌های مکمل مثل ATP assay یا Trypan Blue برای تأیید نتایج

در اگزوبایوژن، ما می‌دونیم که هر پروژه تحقیقاتی به سلول‌هایی با کیفیت، پایدار و قابل‌اعتماد نیاز داره.
❌ به همین دلیل، تیم ما با بهره‌گیری از تجهیزات مدرن، محیط‌های کشت کنترل‌شده و پروتکل‌های بهینه، مجموعه‌ای کامل از خدمات سلولی را ارائه می‌ده تا مسیر تحقیقات شما هموارتر و سریع‌تر بشه.🫰🌱

📈 این یافته‌ها، نگاه تازه‌ای به استراتژی‌های درمانی می‌دهند: تشخیص زودهنگام و مداخله قبل از تشکیل فیبریل‌های تائو. توسعه‌ی بیومارکرهای مرحله‌ی پیش‌بالینی می‌تواند به ما امکان دهد درست زمانی که هنوز مسیر برگشت‌پذیر است، مداخله کنیم.

🔬 چرا این مهمه؟
اینترگرین‌ها پروتئین‌های ترانس‌ممبرانی هستن که مثل یک پل بین اسکلت سلولی و ماتریکس خارج‌سلولی (ECM) عمل می‌کنن. در کشت‌های in vitro، این گیرنده‌ها با اتصال به پروتئین‌هایی مثل فیبرونکتین، کلاژن و لامینین باعث تثبیت سلول روی سطح می‌شن. در بیماری‌های نورودژنریتیو، تغییر در بیان یا سیگنالینگ اینترگرین‌ها می‌تونه به اختلال سیناپسی و کاهش بقا نورون‌ها منجر بشه.

📍 تحلیل سایر گزینه‌ها:

a) Cadherin — پروتئین‌های اتصال سلول به سلول هستن که در اتصالات محکم (adherens junctions) نقش دارن، اما نقش مستقیمی در اتصال به ECM ندارن. تغییر در کادهرین‌ها بیشتر در متاستاز سرطان و تغییرات مورفولوژیک سلول دیده می‌شه.

c) Selectin — بیشتر در اتصال لکوسیت‌ها به سلول‌های اندوتلیال طی پاسخ ایمنی دخیل هستن. نقش‌شون در چسبندگی سلول‌های کشت‌شده به کف فلاسک بسیار محدود و غیرمستقیمه.

d) Connexin — پروتئین‌های سازنده گپ جانکشن‌ها هستن که تبادل مستقیم مولکول‌های کوچک بین سلول‌ها رو ممکن می‌کنن. این‌ها نقشی در اتصال به ECM ندارن و بیشتر در ارتباط سلول-سلول اهمیت دارن.

https://www.linkedin.com/company/exobiogene

روزی که اگزوبایوژن متولد شد، فقط چند میز کار، چند دستگاه ساده و دلی پر از انگیزه داشتیم. ساعت‌های طولانی کار در آزمایشگاه، شکست‌های پیاپی، و بارها و بارها آزمون و خطا، مسیری بود که با امید و پشتکار طی کردیم.

امروز، اگزوبایوژن فقط یک آزمایشگاه نیست؛ یک همراه مطمئن برای پژوهشگران و دانشجویان است.
از تأمین مواد اولیه و تجهیزات آزمایشگاهی گرفته تا طراحی پروژه، انجام آزمایش‌ها و تحلیل داده‌های دقیق — همه و همه در کنار شماست تا ایده‌هایتان را به واقعیت علمی تبدیل کنید. 🌱❤️

● مروری بر فناوری توالی‌یابی نسل جدید (NGS) و کاربردهای آن در بیوتکنولوژی و پزشکی

● یادگیری اصول جستجو در پایگاه‌های ژنتیکی

● آشنایی و یادگیری کامل مراحل و روش‌های آنالیز داده‌های NGS

● انجام پروژه عملی بر روی داده‌های توالی‌یابی شده یک ارگانیسم خاص

این فرایند زمانی رخ می‌دهد که سلول‌ها پس از تعدادی تقسیم، وارد حالتی پایدار از توقف چرخه سلولی می‌شوند، اما همچنان زنده و متابولیک فعال باقی می‌مانند. این سلول‌ها با ترشح فاکتورهای التهابی و تغییرات شدید در عملکردشان، هم می‌توانند نقش حفاظتی در جلوگیری از تکثیر سلول‌های آسیب‌دیده داشته باشند و هم در صورت تجمع، به پیشرفت بیماری‌ها و پیری بافت‌ها کمک کنند. فهم این پدیده برای تحقیقات ضدپیری، سرطان و بازسازی بافتی حیاتی است.

در مقاله‌ای تازه (Ageing Research Reviews, 2024)، پژوهشگران با استفاده از داده‌های RNA-Seq و الگوریتم‌های یادگیری ماشینی، نشان دادند که می‌توان امضای ترنسکریپتومی (Transcriptomic Signature) سلول‌های پیر را شناسایی و به عنوان بیومارکر معتبر معرفی کرد. ابزارهایی مثل CellAge، SeneQuest و SenMayo به‌طور سیستماتیک الگوهای بیان ژنی را بررسی کرده و قادرند سلول‌های پیر را حتی در بافت‌های پیچیده تشخیص دهند.

📖 منبع:
Developing transcriptomic signatures as a biomarker of cellular senescence
Ageing Research Reviews, 2024. DOI: 10.1016/j.arr.2024.102403

1️⃣ SA-β-gal staining → در نمونه‌های بافتی و کشت سلولی، تجمع رنگ‌آمیزی آبی به وضوح مشاهده شد؛ نشون‌دهنده افزایش فعالیت بتا-گالاکتوزیداز.

2️⃣ p16^INK4a و p21^CIP1 expression → سطح بیان این دو مهارکننده چرخه سلولی چندین برابر سلول‌های جوان بود؛ تأییدکننده توقف تکثیر.

3️⃣ γ-H2AX foci (DNA damage marker) → تجمع فوکوس‌های γ-H2AX به‌عنوان شاخص آسیب DNA دو رشته‌ای مشاهده شد؛ همزمانی پیری با بار ژنوتوکسیک.

4️⃣ RNA-Seq transcriptomic profiling → افزایش بیان ژن‌های التهابی (SASP) و مسیرهای استرس اکسیداتیو آشکار شد؛ مبنایی برای طراحی امضاهای مولکولی اختصاصی پیری سلولی.

📖 رفرنس:
Developing transcriptomic signatures as a biomarker of cellular senescence
Ageing Research Reviews, 2024. DOI: 10.1016/j.arr.2024.102403

با این تکنیک می‌شه:
🔹 بیان ژن‌ها رو به‌صورت جامع و دقیق اندازه‌گیری کرد.
🔹 ایزوفرم‌های مختلف و splice variantها رو شناسایی کرد.
🔹 تغییرات در مسیرهای زیستی و سیگنالینگ رو در شرایط آزمایشی مختلف بررسی کرد.

https://www.linkedin.com/company/exobiogene

با اگزوبایوژن همراه باش تا با روند پروژه های علمی از نزدیک آشنا بشی

امروز قراره با هم به دنیای «تحول دانشجو به محقق» سر بزنیم؛ مسیری که فقط با حفظ کردن جزوه‌ها و پاس کردن امتحان‌ها ساخته نمی‌شه، بلکه با کنجکاوی عمیق، پرسیدن سؤال‌های درست، و تمرین مداوم در پژوهش شکل می‌گیره. 🌱
این موضوع می‌تونه الهام‌بخش همه‌ی کسایی باشه که تازه قدم اول رو گذاشتن و می‌خوان بدونن چطور می‌شه از یک یادگیرنده ساده، به یک جستجوگر واقعی علم تبدیل شد. 🔬✨

اما سؤال کافی نیست. محقق راه پیدا می‌کنه؛ یعنی از بین انبوه روش‌ها، بهترین مسیر علمی رو انتخاب می‌کنه و با صبر و پشتکار دنبال جواب می‌ره. این مسیر همیشه پر از شکست و آزمون و خطاست، ولی برای یک محقق شکست فقط یک داده‌ست، نه بن‌بست.