BioTechTalk Podcast EP10🔥

🔻موسسه‌ی آناهید گستر خلیلی هرسال بیشترین رتبه‌های برتر رو به خودش اختصاص میده و الانم کلاس‌های تابستونه‌شون شروع شده!
🔻اگه می‌خوای با برنامه‌ریزی حرفه‌ای جلو بری، مشاوره رایگان هم برات آماده‌ست!

✔ اندازه‌گیری مساحت، طول و قطر سلول‌ها
✔ شمارش ذرات یا سلول‌ها به صورت خودکار
✔ تحلیل شدت فلورسانس در نواحی مختلف
✔ پردازش و فیلتر کردن نویز تصویر

✍🏻 سرفصل‌ها:
● معرفی نرم‌افزار و کاربردهای آن
● آشنایی با فضای نرم‌افزار و آماده سازی
● کاربردهای رایج نرم افزار مثل
آنالیز و شمارش سلولی
تنظیم وضوح تصویر و رنگ
مقیاس زنی
اندازه گیری طول مساحت

● فرآیندهای تخصصی شامل آنالیز تصاویر تست خراش
آنالیز تصاویر نانوذرات
سنجش زبری و ...

➡️ ORF یا Open Reading Frame، یه بخش از DNA هست که می‌تونه به یه پروتئین ترجمه بشه؛ چون:

1. با کدون شروع (مثل ATG) شروع می‌شه

2. با کدون پایان (مثل TAA، TAG، TGA) تموم می‌شه

3. بین این دو، فریم بدون توقف حفظ شده

https://www.linkedin.com/company/exobiogene

🔬✨ وقتی علم زیست‌شناسی به تکنولوژی گره می‌خوره، دنیایی خارق‌العاده از رمزهای حیات آشکار میشه! بیوانفورماتیک یعنی سفر به ژرفای سلول، جایی‌که داده‌ها، ژن‌ها و الگوریتم‌ها با هم می‌رقصن. این فقط علم نیست—یه ماجراجوییه!
💡 با اگزوبایوژن همراه شو تا ابزارها و دانش روز دنیا رو توی ساده‌ترین و کاربردی‌ترین مسیر یاد بگیری. آینده‌ی زیست‌شناسی اینجاست!

📲 @exobiogen

✅ پاسخ صحیح کوئیز:

گزینه ۳: مسیر GPCR وابسته به cAMP تحت تأثیر اختلال در Lipid Raft قرار می‌گیرد.
🔍 بسیاری از گیرنده‌های GPCR، G‌-پروتئین‌ها و آنزیم ادنوزیل سیکلاز بطور دینامیک در raft‌ها کلاستر می‌شوند. وقتی تجمع این ساختار مختل شود، سیگنال‌دهی cAMP با تأخیر یا کاهش مواجه می‌شود.

📌 Lipid Raft به‌عنوان یک پلتفرم‌های غنی از کلسترول و اسفنگولیپید، باعث سرعت و دقت بیشتر در انتقال سیگنال از طریق جا‌به‌جایی مولکولی کلاسترینگ می‌شود

✅ سیگنالینگ سلولی: بسیاری از گیرنده‌های مهم (مثل TCR و BCR) در همین رفت‌ها تجمع می‌کنن تا سیگنال‌دهی سریع‌تر و دقیق‌تری داشته باشن.

✅ ورود ویروس‌ها و پاتوژن‌ها: برخی ویروس‌ها مثل HIV ترجیح می‌دن از طریق این نواحی وارد سلول بشن، چون رفت‌ها سکوی پرتاب خوبی برای اندوسیتوز هستن.

✅ نقش در ترافیک پروتئین‌ها و انتقال بین غشایی

🔍 دنیای بیوانفورماتیک، جایی که داده‌های خام به دانش تبدیل می‌شن...
در قلب هر آنالیز ژنتیکی و مولکولی، هزاران خط داده و هزاران ساعت محاسبه نهفته‌ست. اینجا جاییه که علم، تکنولوژی و خلاقیت در کنار هم قرار می‌گیرن. امروز با نگاهی دقیق‌تر به پشت‌صحنه‌ی این فرآیندها سر می‌زنیم...

🔬 خدمات تخصصی ما شامل:

🧬 تحلیل داده‌های NGS، RNA-seq و miRNA
🧪 مدل‌سازی و پیش‌بینی ساختار پروتئینی، همراه با Docking مولکولی
🧫 طراحی پرایمرهای اختصاصی و بهینه
📊 رسم انواع پلات‌های علمی با Python، R، Biopython و GraphPad
📋 ترسیم و تحلیل جداول آماری، از جمله جداول دموگرافیک و بالینی

📌 چه برای پایان‌نامه باشه، چه مقاله یا پروژه‌های تحقیقاتی، تحلیل‌های ما قابل ارائه، دقیق و قابل اعتماد هستن.

https://www.linkedin.com/company/exobiogene

🔹 طول پرایمر: ایده‌آل بین ۱۸ تا ۲۵ نوکلئوتیده — نه اون‌قدر کوتاه که اختصاصیتش پایین بیاد، نه اون‌قدر بلند که اتصالش سخت بشه.
🔹 Tm یا دمای ذوب: معمولاً بین ۵۵ تا ۶۵ درجه سانتی‌گراد تنظیم می‌شه تا اتصال پایدار باشه و واکنش درست پیش بره.
🔹 GC Content: حدود ۴۰ تا ۶۰٪ باشه تا هم پایداری داشته باشه و هم از ذوب بیش از حد جلوگیری کنه

🔹 ساختار ثانویه: پرایمر نباید با خودش یا با پرایمر دیگه تشکیل Hairpin یا Dimer بده، چون این ساختارها مانع اتصال به رشته هدف می‌شن.
🔹 اختصاصیت: شاید مهم‌ترین نکته! پرایمر باید فقط به ناحیه هدف در ژنوم بچسبه، نه جاهای دیگه. اینو می‌شه با ابزارهایی مثل BLAST بررسی کرد.

❌ و اما چرا بقیه گزینه‌ها درست نیستن؟
1️⃣ کاهش دمای Annealing، ممکنه باعث اتصال غیراختصاصی بشه
3️⃣ حذف G/C از انتهای ۳' اتصال رو ضعیف می‌کنه
4️⃣ پرایمر خیلی کوتاه (کمتر از ۱۵ نوکلئوتید) ممکنه در نواحی مختلف ژنوم اتصال پیدا کنه و باعث نتایج اشتباه بشه

https://www.linkedin.com/company/exobiogene

✨ این یعنی miR-506 فقط یک تنظیم‌کننده ژنی نیست؛ بلکه ابزاری بالقوه برای تغییر فاز سیستم ایمنی علیه توموره — خصوصاً در سرطان‌هایی مثل PDAC (سرطان مجرای پانکراس) که یکی از مقاوم‌ترین انواع سرطانه.

📖 این مقاله با استفاده از آنالیزهای RNA-seq، مدل‌های موشی و بررسی‌های ایمنوهیستوشیمی، به‌وضوح عملکرد ایمونومدولاتوری miR‑506‑3p رو اثبات کرده.

📚 Reference:

Peng, Y., & Croce, C. M. (2016). The role of MicroRNAs in human cancer. Signal Transduction and Targeted Therapy, 1(1), 15004. https://doi.org/10.1038/sigtrans.2015.4

✖️ OncomiR: با سرکوب ژن‌های مهارکننده‌ی تومور، باعث رشد و پیشرفت سرطان می‌شن.

✅ Tumor suppressor miRNA: با سرکوب ژن‌های سرطانی، جلوی پیشرفت سرطان رو می‌گیرن.

۱️⃣ میر ها(miRNAها) به‌عنوان دارو:
امروزه در تحقیقات دارویی، miRNAها یا مهارکننده‌ها و مقلدهای اون‌ها در حال بررسی هستن؛ چون می‌تونن مسیرهای بیماری‌زا رو هدف بگیرن.

۲️⃣ الگوی بیان متفاوت در سرطان‌ها:
در بسیاری از سرطان‌ها، پروفایل بیان miRNA تغییر می‌کنه و همین باعث می‌شه بتونیم ازشون به‌عنوان بیومارکرهای تشخیصی یا پیش‌آگهی استفاده کنیم.

۳️⃣ تنظیم همزمان چندین ژن:
هر miRNA می‌تونه چندین mRNA مختلف رو هدف قرار بده؛ بنابراین با یک miRNA می‌شه شبکه‌های ژنتیکی پیچیده رو تنظیم کرد، که توی سرطان بسیار اهمیت داره.

1. بررسی تفاوت‌ها در miRNA بین نمونه‌ها
یعنی بفهمیم توی سلول‌های بیمار و سالم، کدوم miRNAها بیشتر یا کمتر فعال هستن.

2. پیدا کردن هدف‌های miRNA
هر miRNA می‌تونه روی چندین ژن اثر بذاره. ما بررسی می‌کنیم کدوم ژن‌ها احتمالاً تحت تأثیر این miRNAها هستن.

3. تحلیل عملکرد miRNAها در بدن
مثلا ببینیم این miRNAها در چه فرآیندهایی (مثل سرطان، رشد سلول، مرگ سلول) نقش دارن.

4. ساخت تصویرهای علمی و رسم شبکه‌ها
نتایج رو به صورت گراف‌ها، جدول‌ها و شکل‌های کاربردی برای مقاله یا پایان‌نامه آماده می‌کنیم.

https://www.linkedin.com/company/exobiogene