این پایگاه، یکی از بزرگ‌ترین و قابل‌اعتمادترین منابع اطلاعات بیولوژیکی در دنیاست که همه‌چیز رو درباره ژن‌ها، توالی‌های نوکلئوتیدی، پروتئین‌ها، ساختارهای مولکولی و مقالات مرتبط کنار هم آورده.

🔹 Gene – اطلاعات کامل درباره هر ژن
🔹 Nucleotide – دسترسی به توالی DNA/RNA
🔹 Protein – توالی و ویژگی‌های ساختاری پروتئین‌ها
🔹 Structure – مشاهده ساختار سه‌بعدی مولکول‌ها
🔹 BLAST – مقایسه توالی‌ها
🔹 GEO – داده‌های بیان ژن
🔹 PubMed – مقاله‌های علمی
🔹 Genome، SNP، Assembly و خیلی بخش‌های دیگه!

🧾 1. شناسنامه ژنتیکی

Gene ID اختصاصی (شناسه عددی خاص برای هر ژن)

Symbol و Full Name (نماد کوتاه و نام کامل ژن)

Synonyms یا اسامی جایگزین که در مقالات یا دیتابیس‌های مختلف استفاده می‌شن

Organism (نام ارگانیسم؛ مثلاً Homo sapiens)

📍 2. موقعیت ژنومیکی

جایگاه دقیق ژن روی کروموزوم به همراه لینک به Genome Data Viewer

امکان مشاهده exon-intron structure و ترتیب نوکلئوتیدی

🧠 3. عملکرد زیستی و مسیرهای مولکولی

توصیف خلاصه عملکرد ژن (از منابعی مثل GeneRIF)

لینک به مسیرهای بیولوژیکی مرتبط از پایگاه‌هایی مثل Reactome و KEGG

ارتباط ژن با شبکه‌های تنظیمی، سیگنالینگ، و عملکردهای سلولی خاص

📊 4. Expression Profile

نمایش الگوهای بیان ژن در بافت‌ها و مراحل مختلف رشد با نمودار

داده‌های حاصل از RNA-seq و microarray (از پایگاه GEO)

🔬 5. لینک‌های عملکردی و بیماری‌محور

اتصال به OMIM برای بررسی ارتباط ژن با بیماری‌های ارثی

اطلاعات از ClinVar و dbSNP برای جهش‌ها و SNPهای گزارش‌شده

ارتباط با داروها و پاسخ‌های دارویی (در برخی موارد)

🔗 6. اتصال به پایگاه‌های تخصصی دیگر

UniProt برای بررسی سطح پروتئینی

RefSeq برای مشاهده توالی‌های مرجع mRNA، DNA، و پروتئین

PubMed برای جدیدترین مقالات مرتبط

BioTechTalk Podcast EP10🔥

🔻موسسه‌ی آناهید گستر خلیلی هرسال بیشترین رتبه‌های برتر رو به خودش اختصاص میده و الانم کلاس‌های تابستونه‌شون شروع شده!
🔻اگه می‌خوای با برنامه‌ریزی حرفه‌ای جلو بری، مشاوره رایگان هم برات آماده‌ست!

✔ اندازه‌گیری مساحت، طول و قطر سلول‌ها
✔ شمارش ذرات یا سلول‌ها به صورت خودکار
✔ تحلیل شدت فلورسانس در نواحی مختلف
✔ پردازش و فیلتر کردن نویز تصویر

✍🏻 سرفصل‌ها:
● معرفی نرم‌افزار و کاربردهای آن
● آشنایی با فضای نرم‌افزار و آماده سازی
● کاربردهای رایج نرم افزار مثل
آنالیز و شمارش سلولی
تنظیم وضوح تصویر و رنگ
مقیاس زنی
اندازه گیری طول مساحت

● فرآیندهای تخصصی شامل آنالیز تصاویر تست خراش
آنالیز تصاویر نانوذرات
سنجش زبری و ...

➡️ ORF یا Open Reading Frame، یه بخش از DNA هست که می‌تونه به یه پروتئین ترجمه بشه؛ چون:

1. با کدون شروع (مثل ATG) شروع می‌شه

2. با کدون پایان (مثل TAA، TAG، TGA) تموم می‌شه

3. بین این دو، فریم بدون توقف حفظ شده

https://www.linkedin.com/company/exobiogene

🔬✨ وقتی علم زیست‌شناسی به تکنولوژی گره می‌خوره، دنیایی خارق‌العاده از رمزهای حیات آشکار میشه! بیوانفورماتیک یعنی سفر به ژرفای سلول، جایی‌که داده‌ها، ژن‌ها و الگوریتم‌ها با هم می‌رقصن. این فقط علم نیست—یه ماجراجوییه!
💡 با اگزوبایوژن همراه شو تا ابزارها و دانش روز دنیا رو توی ساده‌ترین و کاربردی‌ترین مسیر یاد بگیری. آینده‌ی زیست‌شناسی اینجاست!

📲 @exobiogen

✅ پاسخ صحیح کوئیز:

گزینه ۳: مسیر GPCR وابسته به cAMP تحت تأثیر اختلال در Lipid Raft قرار می‌گیرد.
🔍 بسیاری از گیرنده‌های GPCR، G‌-پروتئین‌ها و آنزیم ادنوزیل سیکلاز بطور دینامیک در raft‌ها کلاستر می‌شوند. وقتی تجمع این ساختار مختل شود، سیگنال‌دهی cAMP با تأخیر یا کاهش مواجه می‌شود.

📌 Lipid Raft به‌عنوان یک پلتفرم‌های غنی از کلسترول و اسفنگولیپید، باعث سرعت و دقت بیشتر در انتقال سیگنال از طریق جا‌به‌جایی مولکولی کلاسترینگ می‌شود

✅ سیگنالینگ سلولی: بسیاری از گیرنده‌های مهم (مثل TCR و BCR) در همین رفت‌ها تجمع می‌کنن تا سیگنال‌دهی سریع‌تر و دقیق‌تری داشته باشن.

✅ ورود ویروس‌ها و پاتوژن‌ها: برخی ویروس‌ها مثل HIV ترجیح می‌دن از طریق این نواحی وارد سلول بشن، چون رفت‌ها سکوی پرتاب خوبی برای اندوسیتوز هستن.

✅ نقش در ترافیک پروتئین‌ها و انتقال بین غشایی

🔍 دنیای بیوانفورماتیک، جایی که داده‌های خام به دانش تبدیل می‌شن...
در قلب هر آنالیز ژنتیکی و مولکولی، هزاران خط داده و هزاران ساعت محاسبه نهفته‌ست. اینجا جاییه که علم، تکنولوژی و خلاقیت در کنار هم قرار می‌گیرن. امروز با نگاهی دقیق‌تر به پشت‌صحنه‌ی این فرآیندها سر می‌زنیم...

🔬 خدمات تخصصی ما شامل:

🧬 تحلیل داده‌های NGS، RNA-seq و miRNA
🧪 مدل‌سازی و پیش‌بینی ساختار پروتئینی، همراه با Docking مولکولی
🧫 طراحی پرایمرهای اختصاصی و بهینه
📊 رسم انواع پلات‌های علمی با Python، R، Biopython و GraphPad
📋 ترسیم و تحلیل جداول آماری، از جمله جداول دموگرافیک و بالینی

📌 چه برای پایان‌نامه باشه، چه مقاله یا پروژه‌های تحقیقاتی، تحلیل‌های ما قابل ارائه، دقیق و قابل اعتماد هستن.

https://www.linkedin.com/company/exobiogene

🔹 طول پرایمر: ایده‌آل بین ۱۸ تا ۲۵ نوکلئوتیده — نه اون‌قدر کوتاه که اختصاصیتش پایین بیاد، نه اون‌قدر بلند که اتصالش سخت بشه.
🔹 Tm یا دمای ذوب: معمولاً بین ۵۵ تا ۶۵ درجه سانتی‌گراد تنظیم می‌شه تا اتصال پایدار باشه و واکنش درست پیش بره.
🔹 GC Content: حدود ۴۰ تا ۶۰٪ باشه تا هم پایداری داشته باشه و هم از ذوب بیش از حد جلوگیری کنه

🔹 ساختار ثانویه: پرایمر نباید با خودش یا با پرایمر دیگه تشکیل Hairpin یا Dimer بده، چون این ساختارها مانع اتصال به رشته هدف می‌شن.
🔹 اختصاصیت: شاید مهم‌ترین نکته! پرایمر باید فقط به ناحیه هدف در ژنوم بچسبه، نه جاهای دیگه. اینو می‌شه با ابزارهایی مثل BLAST بررسی کرد.

❌ و اما چرا بقیه گزینه‌ها درست نیستن؟
1️⃣ کاهش دمای Annealing، ممکنه باعث اتصال غیراختصاصی بشه
3️⃣ حذف G/C از انتهای ۳' اتصال رو ضعیف می‌کنه
4️⃣ پرایمر خیلی کوتاه (کمتر از ۱۵ نوکلئوتید) ممکنه در نواحی مختلف ژنوم اتصال پیدا کنه و باعث نتایج اشتباه بشه

https://www.linkedin.com/company/exobiogene

✨ این یعنی miR-506 فقط یک تنظیم‌کننده ژنی نیست؛ بلکه ابزاری بالقوه برای تغییر فاز سیستم ایمنی علیه توموره — خصوصاً در سرطان‌هایی مثل PDAC (سرطان مجرای پانکراس) که یکی از مقاوم‌ترین انواع سرطانه.

📖 این مقاله با استفاده از آنالیزهای RNA-seq، مدل‌های موشی و بررسی‌های ایمنوهیستوشیمی، به‌وضوح عملکرد ایمونومدولاتوری miR‑506‑3p رو اثبات کرده.

📚 Reference:

Peng, Y., & Croce, C. M. (2016). The role of MicroRNAs in human cancer. Signal Transduction and Targeted Therapy, 1(1), 15004. https://doi.org/10.1038/sigtrans.2015.4

✖️ OncomiR: با سرکوب ژن‌های مهارکننده‌ی تومور، باعث رشد و پیشرفت سرطان می‌شن.

✅ Tumor suppressor miRNA: با سرکوب ژن‌های سرطانی، جلوی پیشرفت سرطان رو می‌گیرن.