《برگزاری سمینار بیوانفورماتیک 》



موضوع: کشف امضاهای موتاسیونی جدید با استفاده از تخصیص دیریکله پنهان ترکیبی

ارائه دهنده: #مینا_شایگان

زمان: چهارشنبه، ۲ مهرماه ۱۳۹۹، ساعت ۱۸:۳۰

این سمینار به صورت مجازی برگزار خواهد گردید و حضور برای عموم آزاد است.

جهت دریافت اطلاعات بیشتر، کانال CBRC را دنبال نمایید.

@CBRC_aut

#خلاصه_سمینار 🧬🧬

ژنوم یک سلول سرطانی حامل جهش‌های سوماتیک است که در نتیجه عملکرد فرایندهای آسیب و ترمیم دی‌ان‌ای (مانند اشعه فرابنفش، تنباکو و ... ) از بدو تولد تا زمان پیدایش سلول سرطانی به وجود می‌آیند.


این فرایندهای جهش‌زا دارای الگوی جهشی خاصی هستند که به خوبی مشخص نشده‌اند.

تکنیک‌های توالی‌یابی این فرصت را به ما می‌دهند تا با به دست آوردن کاتالوگ‌های جهش‌های سوماتیک از ژنوم کامل افراد سرطانی، امضاهای فرایندهای جهش‌زا را در سرطان انسانی کشف کنیم.

با داشتن این امضاهای جهش، می‌توانیم مکانیسم پاتوژنتیک همه سرطان‌ها را درک و در نتیجه به تشخیص زودهنگام سرطان نیز کمک نماییم.

#مینا_شایگان

@CBRC_aut

سلام و عرض ادب

سمینارهای آزمایشگاه CBRC به صورت برخط برگزار می گردند و شرکت برای عموم رایگان است.
بستر مورد استفاده این مجموعه،Adobe connect می باشد.

📌لینک اتصال ما:

https://meeting.aut.ac.ir/bioinformatic/
جهت حضور می توانید از پانزده دقیقه قبل از شروع اقدام نمایید.
@CBRC_aut

پس از ورود نام خود، روی گزینه Enter room بالا کلیک نمایید. توجه نمایید که حتما نام خود را به صورت کامل بنویسید.
@CBRC_aut

در صورت داشتن نرم افزار، می توانید سمینار را روی سیستم خود و با استفاده از Adobe connect دنبال نمایید. در غیر این صورت روی open in browser کلیک نمایید
@CBRC_aut

جهت دانلود نرم افزار Adobe connect از لینکهای زیر می توانید اقدام نمایید

📌📌📌📌📌📌📌📌📌📌📌📌📌📌


لینک دانلود نرم افزار برای IOS

https://apps.apple.com/us/app/adobe-connect/id430437503


📌📌📌📌📌📌📌📌📌📌📌📌📌📌


لینک دانلود نرم افزار برای Android

https://play.google.com/store/apps/details?id=air.com.adobe.connectpro


📌📌📌📌📌📌📌📌📌📌📌📌📌📌


لینک مستقیم دانلود نرم افزار برای Android


https://dl.tehranserver.ir/adobeconnect/Adobe_Connect_meeting_application/Adobe%20Connect_v2.6.9.apk



📌📌📌📌📌📌📌📌📌📌📌📌📌📌


لینک مستقیم دانلود نرم افزار برای ویندوز


https://dl.tehranserver.ir/adobeconnect/ConnectAppSetup2020_1_5.exe


📌📌📌📌📌📌📌📌📌📌📌📌📌📌


لینک مستقیم دانلود نرم افزار برای مکینتاش


https://dl.tehranserver.ir/adobeconnect/AdobeConnect_2019.1.1.dmg

آغاز اولین جلسه از سمینارهای هفتگی گروه بیوانفورماتیک تا دقایقی دیگر

برای ورود به جلسه از لینک زیر اقدام نمایید:

https://meeting.aut.ac.ir/bioinformatic/

@CBRC_aut

🔸️《برگزاری سمینار بیوانفورماتیک 》



📌موضوع: تحلیل داده‌های بیان ژنی با استفاده از خواص توپولوژیکی شبکه‌های هم بیانی

ارائه دهنده: #مریم_رستگاری

📆 زمان: چهارشنبه، ۹ مهرماه ۱۳۹۹، ساعت ۱۸:۳۰

این سمینار به صورت مجازی برگزار خواهد گردید و حضور برای عموم آزاد است.

جهت دریافت اطلاعات بیشتر، کانال CBRC را دنبال نمایید.

@CBRC_aut

#خلاصه_سمینار 🧬🧬

داده های بیان ژنی بیانگر میزان بیان ژن ها در نمونه های مختلف می‌باشند. تعداد نمونه‌های این داده‌ها کم و در مقابل تعداد ویژگی‌های آن زیاد است. در این شرایط و باتوجه به روابط پیچیده ی ژن ها با یکدیگر، تحلیل داده‌های بیان ژنی کاری دشوار است.

شبکه های هم بیانی از خانواده شبکه های همبستگی هستند، که برای تحلیل داده‌های بیان ژنی، همبستگی و ارتباطات بین ژن ها را در نظر می‌گیرند. مطالعه ی خواص توپولوژیکی این شبکه ها می تواند در درک بهتر روابط بین ژن ها و شناخت بهتر عوامل تاثیرگذار در بیماری ها موثر واقع شوند.

#مریم_رستگاری

@CBRC_aut

جهت استفاده از سامانه برگزاری سمینارهای هفتگی، فایل راهنمای اتصالات را مطالعه نمایید.
@CBRC_aut

🔸️《برگزاری سمینار بیوانفورماتیک 》



📌موضوع: جایگزینی دارو

ارائه دهنده:#زهرا_قربانعلی

📆 زمان: چهارشنبه، ۱۶ مهرماه ۱۳۹۹، ساعت ۱۸:۳۰

این سمینار به صورت مجازی برگزار خواهد گردید و حضور برای عموم آزاد است.

جهت دریافت اطلاعات بیشتر، کانال CBRC را دنبال نمایید.

@CBRC_aut

#خلاصه_سمینار 🧬🧬

طراحی، کشف و توسعه دارو برای درمان بیماری های جدید یک فرآیند پرهزینه و زمان بر است. تکنیک هایی
مانند جایگزینی دارو، به معنای استفاده از یک داروی از قبل طراحی شده برای یک تشخیص جدید، می توانند
هزینه این فرآیند را کاهش دهند. در این جلسه ابتدا به معرفی مسئله جایگزینی دارو می پردازیم، سپس
پایگاه داده های متداول در این موضوع را بررسی می نماییم، در ادامه چند روش محاسباتی را معرفی می کنیم.

#زهرا_قربانعلی
@CBRC_aut

《برگزاری سمینارهای هفتگی بیوانفورماتیک 》

آزمایشگاه CBRC دانشگاه امیرکبیر در نظر دارد سمینارهای هفتگی با موضوع بیوانفورماتیک برگزار نماید.

جهت رعایت پروتکل های بهداشتی، تمامی جلسات به صورت‌ برخط و در بستر Adobe Connect برگزار خواهد شد.

همچنین حضور برای تمام علاقه مندان رایگان است.

📅 زمان: چهارشنبه ها، ساعت ۱۸:۳۰

🌐 آدرس سایت جهت ثبت نام:
https://bioinformatics.aut.ac.ir/seminars/

اطلاعات بیشتر را در کانال CBRC دنبال نمایید.


@CBRC_aut

#آپارات

در کانال آپارات آزمایشگاه CBRC ویدئوهای زیر را مشاهده و دانلود کنید:

👩🏻‍💻سمینارهای هفتگی ارائه شده

🦠 آشنایی با کرونا ویروس

🖥 به کارگیری روش‌های یادگیری ماشین در بیوانفورماتیک

🧬 اولین ورکشاپ بین المللی IcoBi

🔸و ...


🌐جهت دسترسی میتوانید از لینک زیر اقدام فرمایید:

https://www.aparat.com/bioinformatics_aut

@CBRC_aut

🔸️《برگزاری سمینار بیوانفورماتیک 》



📌موضوع: طراحی RNA

ارائه دهنده: #سارا_نوری_زاده

📆 زمان: چهارشنبه، ۲۳ مهرماه ۱۳۹۹ ، ساعت ۱۸:۳۰

این سمینار به صورت مجازی برگزار خواهد گردید و حضور برای عموم آزاد است.

جهت دریافت اطلاعات بیشتر، کانال CBRC را دنبال نمایید.

@CBRC_aut

#خلاصه_سمینار 🧬🧬

بررسی ساختارِ آر ان ای (RNA)، به عنوان یکی از درشت مولکول های اصلی در گونه های زیستی، من جمله مهمترین مسائل زیست محاسباتی است.
به عنوان مثال، فهم ساختار RNA ویروس کرونا و عملکردِ آن میتواند در یافتن روش درمان مناسب و از بین بردنِ بیماری کمک شایانی کند.
در این سمینار ساختار های RNA را شرح میدهیم، مهمترین مسائل این حوزه را بررسی می کنیم، چندی از اصلی ترین ابزارهای ارائه شده درحل این مسائل را مطرح می نماییم و در انتها به معرفی رویکردی جهت بررسی دقیق‌تر مسئله‌ی حل‌نشده "طراحی RNA" میپردازیم.

#سارا_نوری_زاده

@CBRC_aut

راه‌های ارتباطی با ما:

🎥 #آپارات:
https://www.aparat.com/bioinformatics_aut

📸 #اینستاگرام:
https://www.instagram.com/cbrc_aut

🌐 #وبسایت:
https://www.bioinformatics.aut.ac.ir

📧 #پست_الکترونیکی:
[email protected]

@CBRC_aut

📄 #پنجشنبه_و_معرفی_مقاله


#کرونا 🦠 و #بیان_ژن 🧬

ویروس #کرونا سراسر جهان را فرا گرفته است. پاتوژن این بیماری، SARS-Cov-2، از آنزیم تبدیل کننده آنژیوتنسین2(ACE2) به عنوان سلول میزبان خود استفاده میکند.
این آنزیم با تنظیم حجم مایعات بدن، فشار خون را کنترل می‌نماید و از این منظر با ویروس کرونایی که در سال 2003وجود داشت، عملکرد مشابهی دارد.
مطالعات اپیدمیولوژیک نشان میدهد که مردان کمی بیشتر از زنان در معرض این بیماری قرار دارند. همچنین افراد بالای 60 سال یا مبتلایان به بیماری قلبی و عروقی نیز، بیشتر در خطر هستند.
در این مقاله با تجزیه و تحلیل GTEx و سایر داده های زیستی بر روی 30 بافت از هزاران نمونه مختلف، به این نتیجه رسیدند که تغییر بیان ژن ACE2 در بافتهای مختلف، میتواند در نشان دادن حساسیت و عفونت ویروس کرونا متفاوت عمل کند. و این تغییر در زنان و جوانان آسیایی، افراد سالمند و مبتلایان به دیابت نوع دوم بیشتر مشاهده شده است. مسیر متابولیکی عملکرد این عفونت به گونه ای است که بر بیان ACE2 غلبه کند و این کار با قرار گرفتن در پثوی ژنهای سرکوب کننده بیان ACE2 صورت میگیرد.
در این مطالعه مشخص شده است که بین بیان ژن ACE2 و مرگ و میر ناشی از COVID-19 رابطه عکس وجود دارد.

#تهیه_و_تنظیم : #میلاد_بشارتی
@CBRC_aut