Соседи по Грантчестер Орчард

"Однажды утром я налетел на Мейнарда Кейнса, мчащегося куда-то через Большой Двор Тринити Колледжа. Я спросил, что за спешка, и тот ответил, что собирается одолжить у шурина мотоцикл и ехать в Лондон. "Почему не на поезде?" - "Потому что нет времени". Я не догадывался, в чем могло быть дело, но в течение следующих нескольких дней ставка по банковским кредитам, которую паникеры задрали до 10%, опустилась до 5%. За этим стоял Кейнс."
- Бертран Расселл

Я сегодня провожал отслуживших 9 лет в EBI коллег, и прощальные посиделки происходили в фруктовом саду в деревеньке Грантчестер под Кембриджем. Все еще не могу перестать удивляться, что на каждом шагу здесь история и, увидев очередное имя из учебников, бегаю с вытаращенными глазами как ботаник по музею.

Оказывается в этой Грантчестер Орчард с 1909 по 1914 годы (до начала Первой Мировой) распологался кружок, в котором состояли Бертран Расселл, Мейнард Кейнс, Вирджиния Вулф, Людвиг Витгенштейн и другие менее известные деятели.

Они оставили друг о друге замечательные воспоминания, и больше всего меня интересует личность Джона Мейнарда Кейнса, великого экономиста. В парадигме кейнсианства мировая экономическая теория просуществовала с Великой Депрессии 1929-1933 до краха Бреттон-Вудской системы в начале 1970-ых: https://ru.wikiquote.org/wiki/%D0%94%D0%B6%D0%BE%D0%BD_%D0%9C%D0%B5%D0%B9%D0%BD%D0%B0%D1%80%D0%B4_%D0%9A%D0%B5%D0%B9%D0%BD%D1%81.

Кейнсианство стало ответом на Великую Депрессию - вероятно, самую масштабную рецессию в истории - затянувшуюся аж на 4 года, поскольку государства тогда толком не знали, что с ней делать.

Кейнс объяснил, что рецессия происходит оттого, что люди стараются делать накопления, что ведет к выводу денег из экономики и снижению спроса на товары. Падение спроса ведет к тому, что произведенные товары не получается продать, что заставляет капиталистов сокращать сотрудников и снижать им зарплаты, а сотрудников - тратить еще меньше. Так формируется смертельная для экономики спираль дефляции и наступает рецессия.

Как ее побороть? Государство просто должно систематически печатать деньги, компенсируя вывод денег из экономики накопителями вбросом новых и созданием искусственного спроса с помощью госзаказа. Печатая деньги, государство фактически ворует деньги у накопителей, и заставляет тех использовать как средство накопления не наличку, а активы, реинвестируя таким образом свободные средства в экономику и предотвращая новые рецессии.

Любопытно, что Кейнс при этом ехидно отзывался о Карле Марксе, который дал на мой взгляд достаточно полную и глубокую качественную трактовку природы экономического цикла и возникновения рецессий как кризисов перепроизводства. Правда, у Кейнса больше хорошего количественного анализа.

Еще Расселл о Кейнсе:

"Кейнс обладал самым острым и ясным умом из всех людей, кого я встречал. Когда я спорил с ним, мне казалось что я рискую жизнью, и редко я выходил из спора не чувствуя себя в какой-то мере дураком. Временами я был склонен считать, что столько ума не может сочетаться с внутренней глубиной, но не думаю, чтобы это ощущение нашло какое-то подтверждение."

Забавно, что Кейнс женился на русской балерине Лидии Лопуховой. Вирджиния Вулф (писательница и феминистка) о Кейнсе в 1924:

"Мейнард труднопереносим и достаточно напыщен; Мейнард страстно влюблен и жалок, он понимает, что если он женится на ней, его песенка спета, он будет у нее на поводке. В присутствии Лидии невозможно жестко спорить, а поскольку все мы постепенно угасаем, мы предпочитаем здравый смысл веселонравию, так что шутки Лидии выводят нас из себя; и мы отвечаем ей на них ударами под дых, после которых Мейндард вынужден на коленях просить прощения у Лидии - благородное действо, но на самом деле надрывный спектакль".

Мексиканцы несколько дней назад проиграли сборной Бразилии на ЧМ по футболу, но всем пофиг.

Дело в том, что в тот же день 1 июля в Мексике были выборы, и их местная диктаторская партия их проиграла. Мои политизированные мексиканские друзья, хлебнувшие водомётов, нюхнувшие газу и познакомившиеся с другими прелестями антиправительственных демонстраций, в полном восторге.

В Мексике 71 год (до 2000 года) безраздельно правила партия PRI (Partido Revolucionario Institucional), благодаря руководящей и направляющей силе которой в стране процветали наркокартели, нищета и коррупция.

В 2000 году их впервые удалось победить на выборах христианской право-центристской партии PAN (Partido Acción Nacional), и два их президента правили с 2000 по 2006 и с 2006 по 2012.

Второй президент от этой PAN, Фелипе Кальдерон, решил объявить войну картелям и вести ее силами военных. Такая топорная тактика оказалось очень плоха: в стране фактически разразилась гражданская война. Картели стали похищать и убивать людей десятками, при этом устроив своего рода цензуру и запрещая журналистам писать о жертвах (и отправляя отряды боевиков атаковать редакции ослушавшихся газет).

В результате народ решил, что худой мир лучше доброй войны и в 2012 снова выбрал диктаторскую партию PRI с тем, чтобы она продолжила закрывать глаза на деятельность картелей. Стало только хуже: счет погибших за последнее десятилетие превысил 200 тысяч человек, 30 тысяч пропали без вести: https://www.theguardian.com/world/2017/dec/26/mexico-maelstrom-how-the-drug-violence-got-so-bad.

И вот теперь их потеснили левые популисты (даже пишут, что "сталинисты") из MORENA (Movimiento de Regeneración Nacional) в альянсе с PAN. Что ж, посмотрим, чем это кончится: https://en.wikipedia.org/wiki/List_of_political_parties_in_Mexico

Перескажу одну невероятную по своей абсурдности историю, передающую дух времени.

Когда президентом Мексики был Карлос Салинас де Гортари (который, говорят, и по сей день является серым кардиналом PRI), в PRI шли бодрые внутрипартийные разборки, в рамках которых было принято похищать и убивать конкурентов: https://en.wikipedia.org/wiki/Carlos_Salinas_de_Gortari.

В процессе борьбы за власть перед выборами-1994 Карлос Салинас с помощью своего брата Рауля Салинаса, по-видимому, организовал убийства кандидата в президенты от своей собственной партии, Луиса Дональдо Колосио, ее генерального секретаря и будущего лидера большинства в сенате, Хосе Франциско Руиза Массиу (к тому же приходившегося ему свояком: https://www.geni.com/people/Jos%C3%A9-Francisco-Ruiz-Massieu/6000000002090190736) и кардинала церкви Хуана Хесуса Посадаса Окампо.

Уцелевший на тех выборах кандидат от PRI Эрнесто Седильо стал президентом и назначил генпрокурором Антонио Гарсия из PAN, с тем, чтобы тот начал расследование против Карлоса Салинаса и Рауля Салинаса - последнему инкриминировалась организация этих убийств (и последующая "рубка концов").

Генпрокурор поручил вести дело следователю по особым делам Чапа Безанилье. По-видимому, от Чапы требовалось доказать виновность Рауля Салинаса любыми правдами и неправдами.

Чапа всутпил в незирмый бой, и спустя какое-то время нанял для помощи в расследовании... 55-летнюю женщину-экстрасенса, известную как "La Paca", кою Рауль Салинас называл своей "духовной наставницей". La Paca пронзила взглядом время и пространство и узрела, что труп Хосе Франциско Руиза Массиу находится во дворе ранчо Рауля Салинаса.

Полиция обыскала ранчо, нашла труп, и за эту помощь в расследовании La Paca получила от генерального прокурора Гарсия (с личного одобрения президента Седильо) вознаграждение в 1 миллион песо.

Все было бы прекрасно, только вот труп оказался принадлежащим не Массиу, а тестю самой La Paca - по-видимому, она со своей гоп-компанией сама закопала его во дворе ранчо Рауля Салинаса.

Ясновидящую посадили, а мексиканское государство и правосудие выставили себя насквозь прогнившим сборищем интриганов: https://articles.baltimoresun.com/1997-02-15/news/1997046058_1_la-paca-salinas-de-gortari-massieu

По итогам футбола мне второй раз хотят набить морду, но я все время не за тех болею.

После матча Швеция-Англия, где я вяло болел за англичан, народ высыпал на улицы и принялся орать "Football is coming home!" (https://www.youtube.com/watch?v=RJqimlFcJsM).

Я в этот момент шел из магазина навстречу толпе и был озабочен своими мыслями больше, чем футболом, так что некий гражданин, показавшийся мне достаточно решительным, осведомился у меня, знаю ли я о победе Англии и рад ли ей, и услышав мои довольно безразличные "yep" и "yep", пожелал мне хорошего дня. (UPDATE: коллега-француз говорит, что к нему обращались с точно такой же формулировкой, так что, видимо, это - стандартное предложение подраться)

От малой родины футбола ("coming home" же) в этот момент я находился в 10 метрах.

Ею является газон Parker's Piece в Кембридже, на котором в 1848 году впервые сыграли в футбол по современным правилам участники University Foot Ball Club.

В 1863 году Футбольная Ассоциация в Лондоне приняла эти правила как официальные правила футбола, и они называются кембриджскими: https://en.wikipedia.org/wiki/Cambridge_rules

Поскольку с приездом в Россию на ЧМ у меня не сложилось, а приобщиться к болению за Акинфеева и компанию на прошлой неделе все-таки потянуло, я не нашел более подходящего места для этого, чем паб Grain & Hop Store напротив Parker's Piece. Фотографии паба и газона и видео того, что творилось после Англии-Швеции, привожу ниже.

А сегодня я отправился в паб рядом с домом и приготовился было получать в морду, честно признавшись, что болею за Хорватию, но желавший со мной подраться оказался иммигрантом непонятного происхождения, и драться хотел не то чтобы за Хорватию, но во всяком случае против Англии.

Замечу, что я живу на Chesterton road. Так вот, драка между обитателями деревни Честертон и студентами университета в 1579 году привела к тому, что игра в футбол за пределами колледжей была запрещена.

Видал я книги, основанные на реальных событиях, но чтобы реальные события были основаны на книге?

Знаете, где впервые в истории была опубликована идея квантового компьютера?

В повести братьев Стругацких "За Миллиард Лет До Конца Света": https://en.wikipedia.org/wiki/Definitely_Maybe_(novel)

Spoiler alert: в следующем абзаце я перескажу содержание повести.

Группа ученых во главе с протагонистом Дмитрием Маляновым обнаруживает, что каждый из них близок
к открытию в своей области, но на их пути все время встают какие-то все более сверхъествественные препятствия, отвлекающие их от работы. Сбитые с толку, они обращаются к умнейшему из их знакомых, математику Филиппу Вечеровскому. Тот объясняет, что возможно это сама природа, стремясь к гомеостазу, препятствует людям в познании себя и нарушении равновесия. И когда характер ее чудес перерастает в недвусмысленные угрозы, все кроме Вечеровского решают отказаться от продолжения борьбы. Вечеровский же единственный решается продолжить, заявив, что если понять, по какому принципу природа выбирает чудеса, то, возможно, мы сможем начать эксплуатировать это знание и сами творить противоречащие логике чудеса для своих нужд.

Прообразом Вечеровского является великий математик Юрий Иванович Манин, с которым дружил Аркадий Стругацкий (а Малянов во-многом напоминает Бориса Стругацкого). Рассказывают даже, что как-то на одной кухне встретились Аркадий Стругацкий, Юрий Манин и Владимир Высоцкий - трудно поверить, что эти люди существовали не в параллельных вселенных.

Манин занимался поисками связи между теорией чисел и квантовой физикой (и там, и там на полную катушку работает Фурье-анализ, так что за техническим сходством могло скрываться и сходство по сути). По-видимому, идея квантового компьютера витала в его голове уже в начале 70-ых, но еще не была строго оформлена.

Видимо, Манин поделился со Стругацким своими мыслями про противоречащие логике реальности квантовые явления, которые ведут себя так, словно природа мешает нам познавать себя. И про надежду научиться эксплуатировать их в своих корыстных целях. Стругацкий уловил идею и положил ее в основу повести.

Рукопись "За Миллиард Лет..." датируется 1974-ым годом, в печать повесть вышла в 1976.

В 1979 IBM выпустила IBM PC, в 1980-ом Манин опубликовал монографию "Вычислимое и Невычислимое", где впервые предложил завершенную идею квантовых вычислений. Спустя два года, в 1982, квантовый компьютер независимо придумал Ричард Фейнман.

В детстве я видел у отца на стеллаже рядом с интересными книжками про самолеты переводную книжку
с неинтересной обложкой про спектральные методы в теории чисел. Несколько лет назад я увидел эту книжку снова,
открыл титульный лист и заранее знал, что на нем прочитаю. "Перевод выполнен под руководством Ю.И.Манина", гласил титульный лист этой интересной книжки, стоявшей рядом со скучными книжками про самолеты.

На прошлой неделе все мои околобиологические знакомые только и говорили, что об одной маленькой, очень простой и потрясающе интересной эволюционистской статье Теодора Хилла, которую отозвали из 2 журналов из-за вмешательства феминисток: https://arxiv.org/pdf/1703.04184.pdf.

Суть статьи: есть спорное эмпирическое утверждение, сформулированное Чарльзом Дарвиным, что мужской пол более вариабелен, чем женский, то есть разброс среди самцов по большинству признаков выше, чем среди самок. В статье приведено возможное объяснение механизма, как это могло случиться.

Если допустить, что мужчины действительно вариабельнее женщин, то из этого может следовать, в частности, что разброс в IQ среди мужчин выше, чем среди женщин. Это может объяснять перепредставленность мужчин в требующих высокого интеллекта STEM-специальностях не социальными факторами, а тем что мужчин с сверхвысоким интеллектом просто больше чем женщин, потому что мужчины вариабельнее. Как отлично сформулировала подруга, поглядев на однокурсников, "все девочки - умнички, а мальчики - или гении, или идиоты" (замечу от себя, что нередко и то, и другое).

Из-за опасности такой интерпретации, организация "Women in Mathematics" написала в 2 журнала, куда была подана эта статья, и из одного журнала ее отозвали, а в другом приняли... а потом не напечатали - в номере вместо нее появилась другая!

На орехи досталось не только Хиллу: Сергей Табачников (не тот, что гитарист, а тот что математик - большой любитель математического дивертисмента и ненавистник внешних биллиардов) был соавтором этой статьи, но после всей поднявшейся шумихи самовыпилился и открестился от нее. Саша Панчин написал аккуратный разбор этой статьи, чем в 1001-ый раз смертельно оскорбил Александру Элбакян и ее адептов.

Давайте я на один пост притворюсь сексистом, расистом и вообще нехорошим человеком и объясню суть статьи на заведомо неполиткорректных, но запоминающихся примерах, навешивая ярлыки и используя стереотипы.

Идея очень простая: предположим, среди самцов есть 2 субпопуляции: невариабельная и вариабельная, назовем их "китайцы" (потому что они, конечно, все одинаковые 😒) и "бушмены" (которые разные настолько, что мама бушмена отличается от папы бушмена сильнее, чем француз от немца - я не шучу, так и есть - все генетическое разнообразие человечества так и осталось в его колыбели - Южной Африке - потому что люди, расселившиеся по Евразии, выбирались туда через синайскую пустыню очень маленькими группками порядка десяти человек, а потом эти десять человек яростно плодились, поэтому их потомство очень однообразно).

Давайте посмотрим, кто, "китайцы" или "бушмены", получат эволюционное преимущество в зависимости от поведения самок.

Если самки предпочитают иметь "какого ни на есть мужа, только был бы человек самостоятельный и с понятием", то есть отбраковывают лишь наиболее захудалых самцов, а остальных разбирают по одному на самку и производят от них потомство, то в таком виде невариабельная субпопуляция самцов - "китайцы" - оставит больше потомков, чем вариабельная, и со временем все самцы станут невариабельными. Примером такого вида могут служить лебеди, формирующие устойчивые пары.

Если же самки всей гурьбой кидаются только на меньшинство наиболее сильных/красивых/хитрых самцов, и все дружно рождают детенышей именно от этих немногих "красавчиков", то здесь "бушмены" оставляют гораздо больше потомства, чем "китайцы" и выигрывают. Примером такого вида могут служить львы, где самки всего прайда спариваются с одним и тем же самцом, а остальные самцы изгонятся и потомства не оставляют. Условия среды при этом могут постоянно меняться, так что сегодня красавчиком считается самый сильный, завтра - самый быстрый, послезавтра - самый хитрый. Так или иначе, поскольку "бушмены" гораздо вариабельнее "китайцев", то все красавчики будут так или иначе происходить из "бушменов", и именно они победят в эволюции.

В этом смысле я никогда не понимал, как львам удается сохранять разнообразие, если у всех львят один отец. Видимо, в этом и дело: если эта статья отражает действительность, львята, являющиеся потомками одних и тех же родителей, должны различаться между собой гораздо сильнее, чем птенцы лебедей в одной паре.

Поборницы и поборники равенства полов могут здесь на меня "наехать" и попробовать развернуть картину в противоположную сторону. Не выйдет. Самец вроде Чингисхана может иметь 10^3-10^4 детей (так что 2/3 тюркского населения сегодня являются его потомками - у него был характерный крючочек на Y-хромосоме, который сейчас имеет большинство тюрков). Потолок же для самки млекопитающего по числу детей - это все-таки 10^1-10^2. А поскольку для большинства видов самка инвестирует в потомство больше, чем самец, то это самцы вынуждены доказывать свою состоятельность самкам, а не наоборот - самки же вправе выбирать партнера, чем и определяется возможная повышенная вариабельность среди самцов.

Биоинформатики и биоинформатики.

Сегодня с интервалом в полчаса я налетал на пьющих кофе Сару Тейкманн и Севу Макеева, которые в моей голове существовали в таких же параллельных вселенных, как Терминатор и Чапаев.

Сара Тейкманн (https://www.sanger.ac.uk/science/groups/teichmann-group) - это такая молодая суперпрофессорша из Сангера, которая вместе с другой молодой суперпрофессоршей из Гарварда Авив Регев (https://www.broadinstitute.org/regev-lab) возглавляет один из 2 самых масштабных мегапроектов в современной биоинформатике - Human Cell Atlas: https://www.humancellatlas.org/.

Попросту говоря, Human Cell Atlas - это такая карта, которая про каждую клетку человеческого тела скажет, кто ее родители, и откуда она взялась. Всегда хотел такую иметь, когда слушал лекции по гистологии.

Пытаясь замять скандал с Cambridge Analytica (https://cambridgeanalytica.org/), Марк Цукерберг только что отвалил Тейкманн и Регев кучу денег на их проект, наговорив кучу пышных слов о том, как он любит своих детей.

Если на шустренькой умнице Регев просто написано, что она гений, которая живет в 3 раза быстрее простых смертных, жонглируя смесью из самых навороченных методов машинного обучения, омикс и иммунологии, то вот по Тейкманн этого совершенно не видно. Она никуда не спешит. Не знаю, в чем ее суперсила.

А Сева Макеев... Сева Макеев (https://vigg.ru/institute/subdivisions/otdel-vychislitelnoi-sistemnoi-biologii/laboratorija-sistemnoi-biologii/) - это такой физтеховский программист, перебравшийся в биоинформатику.

Я не знаю, что о нем думать, поскольку разговаривал с ним только один раз: он целую лекцию объяснял, как тренировал конечный автомат Ахо-Корасик, чтобы вычислять вероятность встретить сайт рестрикции в ДНК.

20-летний я тогда попытался сказать ему, что тут не нужен никакой Ахо-Корасик, задача вообще решается аналитически чуть ли не карандашом на бумаге - просто выписываешь матрицу вероятностей переходов между разрешенными состояниями, находишь главное собственное значение и возводишь его в степень длины генома.

Может, я чего-то не понял, но мне тогда показалось, что матерый бородатый дядька "поплыл" и элементарно не чувствовал азов линала. 20-лений я был потрясен так, будто играясь в песочнице, убил бога совочком. Впрочем, коллеги его по лаборатории - весьма достойные и толковые люди, так что не могу уверенно утверждать, что это было не недопонимание.

Но в целом, жизнь - она такая: сидишь всякий ты тут, а в это время Майкл Аттия доказывает гипотезу Римана... и существуя в параллельных вселенных, вы, в то же время, находитесь в километре друг от друга.

Хотя может и не доказывает 🤷‍♂️

Oxford Nanopore гроизтся выпустить новый секвенатор ProemthION c 48 ячейками в первой половине 2019: https://nanoporetech.com/products/promethion.

С точки зрения понимания мира, очень интересно проследить за тем, как эффективность технологии нанопорового секвенирования возрастает на порядки за счет умножения прогресса в каждом из нескольких измерений - усовершенствование идет в разные стороны.

Сейчас PromethION работает на 24 ячейках, а остальные 24 слота пока заменены затычками, но ожидается, что к 2019 они выведут машину на полную мощьность. Ожидается, что к середине 2019 они также увеличат число пор на одну ячейку, так что количество информации с нее утроится. Скорость чтения с одной поры за последнее время удалось увеличить в 4 раза при том же качестве.

Вот и выходит, что за последние несколько лет каждая группа инженеров в компании достигла скромного инкрементального прогресса в своем направлении в 2-4 раза, а в итоге боевая версия PromethION будет превосходить прототип в десятки раз и, такими темпами, выведет нас в совершенно другую эпоху.

Как раз сегодня наткнулся на интервью, где о подобном же умножении, только в области AI, говорит Демис Хассабис из лондонского Deep Mind: https://www.techrepublic.com/article/google-deepmind-founder-demis-hassabis-three-truths-about-ai/. Он считает, что точно так же будут подобраны оптимальные подоходы AI для разных задач, подобно тому, как по-разному устроены разные области нашего мозга, отвечающие за разные функции. Не едиными нейронками и бустингом жива машинка - лично меня, например, интересует область knowledge representation and reasoning, потому что я не верю, что нельзя придумать ничего более умного, чем semantic web, онтологии или фреймы Минского.

Но я отвлекся. Расчетный модуль для PromethION - это шумный горячий ящик с кучей видеокарт. Раньше они собирались апгрейдить его с GPU на FPGA, но сейчас вроде передумали - может, на биткойн посмотрели.

Новая фишка, которую они хотели внедрить - это борьба с контаминацией. Например, если вы знаете, что хотите прочитать человеческую ДНК, а у вас начало секвенироваться что-то, и это похоже на бактериальную - она выплевывается из поры. К сожалению, фирма, у которой они хотели купить эту технологию, предложила им лицензионное соглашение по принципу "мы можем отобрать у вас все, включая первенца, мы вам не должны ничего", так что дело встало за переговорщиками и юристами.

Будут доступны сырые данные. Так что можно смотреть, например, модифированные основания ДНК и эпигенетику. Если не устраивает дефолтный basecaller Guppy, можно использовать альтерантивный Albacore или что-то еще.

Мир Нанопоровского секвенирования совершенно отличается от традиционного Иллюминовского. Посмотрим, кто победит. Пока что секвенирование одного генома человека на PremethION должно будет стоить менее $1000. Как серьезно шутил Панчин-старший, сейчас секвенаторы - это гигантские ящики, а ваши дети будут вынимать из кармана смартфон и секвенировать свой завтрак. =)